Result of FASTA (omim) for
pF1KSDA1200
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA1200, 1364 aa
1>>>pF1KSDA1200 1364 - 1364 aa - 1364 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.0532+/-0.000453; mu= 0.4812+/- 0.028
mean_var=272.6125+/-55.962, 0's: 0 Z-trim(118.2): 62 B-trim: 232 in 1/56
Lambda= 0.077679
statistics sampled from 30863 (30931) to 30863 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.695), E-opt: 0.2 (0.363), width: 16
Scan time: 18.030
The best scores are: opt bits E(85289)
XP_016858840 (OMIM: 612723) PREDICTED: pleckstrin (1452) 3973 460.2 4.9e-128
NP_742066 (OMIM: 612723) pleckstrin homology domai (1493) 3973 460.2 5.1e-128
XP_016858842 (OMIM: 612723) PREDICTED: pleckstrin ( 930) 3739 433.8 2.7e-120
XP_016858841 (OMIM: 612723) PREDICTED: pleckstrin (1013) 584 80.3 8e-14
>>XP_016858840 (OMIM: 612723) PREDICTED: pleckstrin homo (1452 aa)
initn: 3999 init1: 1488 opt: 3973 Z-score: 2419.6 bits: 460.2 E(85289): 4.9e-128
Smith-Waterman score: 4057; 48.7% identity (71.2% similar) in 1418 aa overlap (96-1364:54-1452)
70 80 90 100 110 120
pF1KSD VMEEKVKLSNLKNVDSEGSLHRKYQELLKAIKGKDELISQLEAQLEKQKQMRAEEAKTVQ
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XP_016 VMEDKLKAANIQTSESETRLYNKCQDLESLIQEKDDVIQNLELQLEEQKQIRIQEAKIIE
30 40 50 60 70 80
130 140 150 160 170
pF1KSD EKAAKIKEWVTLKLAKLEMENQHLKSHNQRLVEQVGSLQDALEAIQ-----------IAP
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XP_016 EKAAKIKEWVTVKLNELELENQNLRLINQNQTEEIRTMQSKLQEVQGKKSSTVSTLKLSE
90 100 110 120 130 140
180 190 200
pF1KSD SRKLLVPPYG--------------AAEQDSVPS-EP------GIQPM-------------
...: .: . :.... : :: .. :
XP_016 GQRLSSLTFGCFLSRARSPPQVVKSEEMSKISSKEPEFTEGKDMEEMEIPEKSVDNQVLE
150 160 170 180 190 200
210 220 230 240
pF1KSD ---GQDS------GSQAQGLKAAVLAPSPGALQSKDS-VSEAASPLEDSS--------SS
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XP_016 NNRGQRTLHQTPCGSEQNRKTRTSFATDGGISQNSGAPVSDWSSDEEDGSKGRSKSRCTS
210 220 230 240 250 260
250 260 270 280
pF1KSD TV--HSGET-VEAKPLQPHL-----------------GRESPPHQPCMKLLTFRCSSASW
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XP_016 TLSSHTSEEGVQCSRMGSEMYLTASDDSSSIFEEETFGIKRPEHK---KLYSWQ-QEAQW
270 280 290 300 310
290
pF1KSD -------GEG------------------LVTAQR-------------------GMLPGTK
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XP_016 KALNSPLGKGNSELSKKEQDSSSDELNKKFQSQRLDYSSSSSEANTPSPILTPALMPKHP
320 330 340 350 360 370
300 310 320 330 340 350
pF1KSD TSAREGG----PGSSLTLPKVRAPGTPRDSIQLAKRHHSQPQVGHGHFGRVVNIETEAFS
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XP_016 NSLSGKGTQLVPSSHLPPPKLRIPNVFSISVALAKRHLSQPQLSS---DRMFGTNRNAIS
380 390 400 410 420 430
360 370 380 390 400
pF1KSD ALHPSGLPELESRARSREEPEKME-MEEPPPAG--KNEERESPKALGAE----LEEVELG
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XP_016 MIRPLRPQETDLDLVDGDSTEVLENMDTSCDDGLFSYDSLDSPNSDDQEHCDSAKKVAY-
440 450 460 470 480 490
410 420 430 440 450 460
pF1KSD NKPPTPPLHQFSSWESRIYAVATSGMRLSDMSPRSNTACCASSPPALVSPGSFSGLVYKN
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XP_016 SKPPTPPLHRFPSWESRIYAVAKSGIRMSEAFNMESVNKNSAATLSYTTSGLYTSLIYKN
500 510 520 530 540 550
470 480 490 500 510 520
pF1KSD VTVPVYTALKGRATQISNMPFMDESSGSDDDCSSQASFRISVPSSESRKTSGLGSPRAIK
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XP_016 MTTPVYTTLKGKATQISSSPFLDDSSGSEEEDSSRSSSRTS--ESDSRSRSGPGSPRAMK
560 570 580 590 600 610
530 540 550 560 570 580
pF1KSD RGVSMSSLSSEGDYAIPPDACSLDSDYSEPEHKLQRTSSYSTDGLGLGGESLEKSGYLLK
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XP_016 RGVSLSSVASESDYAIPPDAYSTDTEYSQPEQKLPKTCSSSSDN-G-KNEPLEKSGYLLK
620 630 640 650 660 670
590 600 610 620 630 640
pF1KSD MGSQVKTWKRRWFVLRQGQIMYYKSPSDVIRKPQGQVDLNSRCQIVRGEGSQTFQLISEK
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XP_016 MSGKVKSWKRRWFVLKGGELLYYKSPSDVIRKPQGHIELSASCSILRGDNKQTVQLTTEK
680 690 700 710 720 730
650 660 670 680 690 700
pF1KSD KTYYLTADSPSLLEEWIRVLQSLLKVQATGPPALLRGGTKPTVKGWLTKVKHGHSKVVWC
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XP_016 HTYYLTADSPNILEEWIKVLQNVLRVQAANPLSLQPEG-KPTMKGLLTKVKHGYSKRVWC
740 750 760 770 780 790
710 720 730 740 750 760
pF1KSD ALVGKIFYYYRSHEDKRPLGCLPVRDAHIEEVDRSCDSDEDYEAGGTRRLLSSHCTLVIH
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XP_016 TLIGKTLYYFRSQEDKFPLGQIKLWEAKVEEVDRSCDSDEDYEASG-RSLLSTHYTIVIH
800 810 820 830 840
770 780 790 800 810 820
pF1KSD PTEHSPTYLLIGTKHEKDTWLYHLTVAAGGSSAKVGTAYEQLIGKLMDGEGDPDSPLWRH
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XP_016 PKDQGPTYLLIGSKHEKDTWLYHLTVAAGSNNVNVGSEFEQLVCKLLNIDGEPSSQIWRH
850 860 870 880 890 900
830 840 850 860 870 880
pF1KSD PMLCYSKDGLYASLTTLPSEALQTEALKLFKSCQLFINVPVEAASVDYHVSLAQTALQVC
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XP_016 PTLCHSKEGIISPLTTLPSEALQTEAIKLFKTCQLFINAAVDSPAIDYHISLAQSALQIC
910 920 930 940 950 960
890 900 910 920 930 940
pF1KSD LVHPELQSEIYCQLMKQTSCRPPQKY-SLMQCWQLLALCAPLFLPQHHFLWYVKQQLQRH
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XP_016 LTHPELQNEICCQLIKQTRRRQPQNQPGPLQGWQLLALCVGLFLPHHPFLWLLRLHLKRN
970 980 990 1000 1010 1020
950 960 970 980 990 1000
pF1KSD ADPRSETGQYATYCQRAVERTLRTGEREARPSRMEVVSILLRNPFHHSLPFSIPVHFTNG
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XP_016 ADSRTEFGKYAIYCQRCVERTQQNGDREARPSRMEILSTLLRNPYHHSLPFSIPVHFMNG
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KSD TYHVVGFDGSSTVDEFLQRLNQEIGMRKPSHSGFALFTDDPSGRDLEHCLQGSVKICDAI
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XP_016 IYQVVGFDASTTVEEFLNTLNQDTGMRKPAQSGFALFTDDPSGRDLEHCLQGNIKICDII
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1070 1080 1090 1100 1110 1120
pF1KSD SKWEQAMKELHPGKSEGGTRVVKLMYKNRLYFRSQVKGETDRERLLLASQTSREIVAGRF
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XP_016 SKWEQASKEQQPGKCEG-TRTVRLTYKNRLYFSVQARGETDREKLLLMYQTNDQIINGLF
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1130 1140 1150 1160 1170 1180
pF1KSD PINKELALEMAALMAQVEYGDLEKPALPGPGG--TSPAKAQHLLQQVLDRFHPRRYRHGA
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XP_016 PLNKDLALEMAALLSQVEIGDFERP-FSTPAGHVTNQCKVNQTLKQVIEKFYPKRYRDGC
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1190 1200 1210 1220 1230 1240
pF1KSD PAEQLRHLADMLTTKWATLQGCSPPECIRIYLTVARKWPFFGAKLFAAQPAQLSSKENAL
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XP_016 SEEQLRQLCQRLSTRWMALRGHSAADCVRIYLTVARKWPFFGAKLFLAKPITPSSLGSTF
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1250 1260 1270 1280 1290 1300
pF1KSD VWIAVNEDGVSILDHNTMQVHITYPYSSVTTFGGCRDDFMLVIRSIPDKSSGKSHIEKLI
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XP_016 LWLAVHEDGLSLLEYNSMRLIVSYVYKSLMTFGGYQDDFMVVINNTHSKDKP---TEKLL
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1310 1320 1330 1340 1350
pF1KSD FRMAAPKIAEATFIMASYMN--HCTTTVNPPTNPPGACQLW------ELDGRQFFSSVSC
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XP_016 FAMAKPKILEITLLIASYINNFHQQKAAFHHLSAPALLSAQTRGPQARMMGSQPLLSSSR
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1360
pF1KSD ATKGPTLL
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XP_016 PTKGPTLL
1450
>>NP_742066 (OMIM: 612723) pleckstrin homology domain-co (1493 aa)
initn: 4162 init1: 1488 opt: 3973 Z-score: 2419.4 bits: 460.2 E(85289): 5.1e-128
Smith-Waterman score: 4057; 48.7% identity (71.2% similar) in 1418 aa overlap (96-1364:95-1493)
70 80 90 100 110 120
pF1KSD VMEEKVKLSNLKNVDSEGSLHRKYQELLKAIKGKDELISQLEAQLEKQKQMRAEEAKTVQ
:. ::..:..:: :::.:::.: .::: ..
NP_742 VMEDKLKAANIQTSESETRLYNKCQDLESLIQEKDDVIQNLELQLEEQKQIRIQEAKIIE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KSD EKAAKIKEWVTLKLAKLEMENQHLKSHNQRLVEQVGSLQDALEAIQ-----------IAP
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NP_742 EKAAKIKEWVTVKLNELELENQNLRLINQNQTEEIRTMQSKLQEVQGKKSSTVSTLKLSE
130 140 150 160 170 180
180 190 200
pF1KSD SRKLLVPPYG--------------AAEQDSVPS-EP------GIQPM-------------
...: .: . :.... : :: .. :
NP_742 GQRLSSLTFGCFLSRARSPPQVVKSEEMSKISSKEPEFTEGKDMEEMEIPEKSVDNQVLE
190 200 210 220 230 240
210 220 230 240
pF1KSD ---GQDS------GSQAQGLKAAVLAPSPGALQSKDS-VSEAASPLEDSS--------SS
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NP_742 NNRGQRTLHQTPCGSEQNRKTRTSFATDGGISQNSGAPVSDWSSDEEDGSKGRSKSRCTS
250 260 270 280 290 300
250 260 270 280
pF1KSD TV--HSGET-VEAKPLQPHL-----------------GRESPPHQPCMKLLTFRCSSASW
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NP_742 TLSSHTSEEGVQCSRMGSEMYLTASDDSSSIFEEETFGIKRPEHK---KLYSWQ-QEAQW
310 320 330 340 350 360
290
pF1KSD -------GEG------------------LVTAQR-------------------GMLPGTK
:.: .:: ...:
NP_742 KALNSPLGKGNSELSKKEQDSSSDELNKKFQSQRLDYSSSSSEANTPSPILTPALMPKHP
370 380 390 400 410 420
300 310 320 330 340 350
pF1KSD TSAREGG----PGSSLTLPKVRAPGTPRDSIQLAKRHHSQPQVGHGHFGRVVNIETEAFS
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NP_742 NSLSGKGTQLVPSSHLPPPKLRIPNVFSISVALAKRHLSQPQLSS---DRMFGTNRNAIS
430 440 450 460 470
360 370 380 390 400
pF1KSD ALHPSGLPELESRARSREEPEKME-MEEPPPAG--KNEERESPKALGAE----LEEVELG
..: : . . . : .: :. : . . .::.. : ..:
NP_742 MIRPLRPQETDLDLVDGDSTEVLENMDTSCDDGLFSYDSLDSPNSDDQEHCDSAKKVAY-
480 490 500 510 520 530
410 420 430 440 450 460
pF1KSD NKPPTPPLHQFSSWESRIYAVATSGMRLSDMSPRSNTACCASSPPALVSPGSFSGLVYKN
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NP_742 SKPPTPPLHRFPSWESRIYAVAKSGIRMSEAFNMESVNKNSAATLSYTTSGLYTSLIYKN
540 550 560 570 580 590
470 480 490 500 510 520
pF1KSD VTVPVYTALKGRATQISNMPFMDESSGSDDDCSSQASFRISVPSSESRKTSGLGSPRAIK
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NP_742 MTTPVYTTLKGKATQISSSPFLDDSSGSEEEDSSRSSSRTS--ESDSRSRSGPGSPRAMK
600 610 620 630 640 650
530 540 550 560 570 580
pF1KSD RGVSMSSLSSEGDYAIPPDACSLDSDYSEPEHKLQRTSSYSTDGLGLGGESLEKSGYLLK
::::.::..::.:::::::: : :..::.::.:: .: : :.:. : .: :::::::::
NP_742 RGVSLSSVASESDYAIPPDAYSTDTEYSQPEQKLPKTCSSSSDN-G-KNEPLEKSGYLLK
660 670 680 690 700 710
590 600 610 620 630 640
pF1KSD MGSQVKTWKRRWFVLRQGQIMYYKSPSDVIRKPQGQVDLNSRCQIVRGEGSQTFQLISEK
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NP_742 MSGKVKSWKRRWFVLKGGELLYYKSPSDVIRKPQGHIELSASCSILRGDNKQTVQLTTEK
720 730 740 750 760 770
650 660 670 680 690 700
pF1KSD KTYYLTADSPSLLEEWIRVLQSLLKVQATGPPALLRGGTKPTVKGWLTKVKHGHSKVVWC
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NP_742 HTYYLTADSPNILEEWIKVLQNVLRVQAANPLSLQPEG-KPTMKGLLTKVKHGYSKRVWC
780 790 800 810 820 830
710 720 730 740 750 760
pF1KSD ALVGKIFYYYRSHEDKRPLGCLPVRDAHIEEVDRSCDSDEDYEAGGTRRLLSSHCTLVIH
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NP_742 TLIGKTLYYFRSQEDKFPLGQIKLWEAKVEEVDRSCDSDEDYEASG-RSLLSTHYTIVIH
840 850 860 870 880 890
770 780 790 800 810 820
pF1KSD PTEHSPTYLLIGTKHEKDTWLYHLTVAAGGSSAKVGTAYEQLIGKLMDGEGDPDSPLWRH
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NP_742 PKDQGPTYLLIGSKHEKDTWLYHLTVAAGSNNVNVGSEFEQLVCKLLNIDGEPSSQIWRH
900 910 920 930 940 950
830 840 850 860 870 880
pF1KSD PMLCYSKDGLYASLTTLPSEALQTEALKLFKSCQLFINVPVEAASVDYHVSLAQTALQVC
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NP_742 PTLCHSKEGIISPLTTLPSEALQTEAIKLFKTCQLFINAAVDSPAIDYHISLAQSALQIC
960 970 980 990 1000 1010
890 900 910 920 930 940
pF1KSD LVHPELQSEIYCQLMKQTSCRPPQKY-SLMQCWQLLALCAPLFLPQHHFLWYVKQQLQRH
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NP_742 LTHPELQNEICCQLIKQTRRRQPQNQPGPLQGWQLLALCVGLFLPHHPFLWLLRLHLKRN
1020 1030 1040 1050 1060 1070
950 960 970 980 990 1000
pF1KSD ADPRSETGQYATYCQRAVERTLRTGEREARPSRMEVVSILLRNPFHHSLPFSIPVHFTNG
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NP_742 ADSRTEFGKYAIYCQRCVERTQQNGDREARPSRMEILSTLLRNPYHHSLPFSIPVHFMNG
1080 1090 1100 1110 1120 1130
1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KSD TYHVVGFDGSSTVDEFLQRLNQEIGMRKPSHSGFALFTDDPSGRDLEHCLQGSVKICDAI
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NP_742 IYQVVGFDASTTVEEFLNTLNQDTGMRKPAQSGFALFTDDPSGRDLEHCLQGNIKICDII
1140 1150 1160 1170 1180 1190
1070 1080 1090 1100 1110 1120
pF1KSD SKWEQAMKELHPGKSEGGTRVVKLMYKNRLYFRSQVKGETDRERLLLASQTSREIVAGRF
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NP_742 SKWEQASKEQQPGKCEG-TRTVRLTYKNRLYFSVQARGETDREKLLLMYQTNDQIINGLF
1200 1210 1220 1230 1240
1130 1140 1150 1160 1170 1180
pF1KSD PINKELALEMAALMAQVEYGDLEKPALPGPGG--TSPAKAQHLLQQVLDRFHPRRYRHGA
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NP_742 PLNKDLALEMAALLSQVEIGDFERP-FSTPAGHVTNQCKVNQTLKQVIEKFYPKRYRDGC
1250 1260 1270 1280 1290 1300
1190 1200 1210 1220 1230 1240
pF1KSD PAEQLRHLADMLTTKWATLQGCSPPECIRIYLTVARKWPFFGAKLFAAQPAQLSSKENAL
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NP_742 SEEQLRQLCQRLSTRWMALRGHSAADCVRIYLTVARKWPFFGAKLFLAKPITPSSLGSTF
1310 1320 1330 1340 1350 1360
1250 1260 1270 1280 1290 1300
pF1KSD VWIAVNEDGVSILDHNTMQVHITYPYSSVTTFGGCRDDFMLVIRSIPDKSSGKSHIEKLI
.:.::.:::.:.:..:.:.. ..: :.:. :::: .::::.:: . .:.. :::.
NP_742 LWLAVHEDGLSLLEYNSMRLIVSYVYKSLMTFGGYQDDFMVVINNTHSKDKP---TEKLL
1370 1380 1390 1400 1410 1420
1310 1320 1330 1340 1350
pF1KSD FRMAAPKIAEATFIMASYMN--HCTTTVNPPTNPPGACQLW------ELDGRQFFSSVSC
: :: ::: : :...:::.: : .. . :. . .. : : . : :
NP_742 FAMAKPKILEITLLIASYINNFHQQKAAFHHLSAPALLSAQTRGPQARMMGSQPLLSSSR
1430 1440 1450 1460 1470 1480
1360
pF1KSD ATKGPTLL
:::::::
NP_742 PTKGPTLL
1490
>--
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10 20 30 40 50 60
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::::. : . :::..::..::.::..::.::::::::::.:::.::.....::..::.:
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10 20 30 40 50
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:: :::.:.: .:... .:: :. : :.:
NP_742 FQQVQVMEDKLKAANIQTSESETRLYNKCQDLESLIQEKDDVIQNLELQLEEQKQIRIQE
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NP_742 AKIIEEKAAKIKEWVTVKLNELELENQNLRLINQNQTEEIRTMQSKLQEVQGKKSSTVST
120 130 140 150 160 170
>>XP_016858842 (OMIM: 612723) PREDICTED: pleckstrin homo (930 aa)
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:: . . .:..:::::::::::::::.: : :::.: :.:::: ...:::::::.:::::
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:::::::::::.....::. .:::. ::.. .:.:.: .:::: ::.::.:. . :::::
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XP_016 SEALQTEAIKLFKTCQLFINAAVDSPAIDYHISLAQSALQICLTHPELQNEICCQLIKQT
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XP_016 RRRQPQNQPGPLQGWQLLALCVGLFLPHHPFLWLLRLHLKRNADSRTEFGKYAIYCQRCV
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pF1KSD ERTLRTGEREARPSRMEVVSILLRNPFHHSLPFSIPVHFTNGTYHVVGFDGSSTVDEFLQ
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XP_016 ERTQQNGDREARPSRMEILSTLLRNPYHHSLPFSIPVHFMNGIYQVVGFDASTTVEEFLN
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pF1KSD RLNQEIGMRKPSHSGFALFTDDPSGRDLEHCLQGSVKICDAISKWEQAMKELHPGKSEGG
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XP_016 TLNQDTGMRKPAQSGFALFTDDPSGRDLEHCLQGNIKICDIISKWEQASKEQQPGKCEG-
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XP_016 TRTVRLTYKNRLYFSVQARGETDREKLLLMYQTNDQIINGLFPLNKDLALEMAALLSQVE
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pF1KSD YGDLEKPALPGPGG--TSPAKAQHLLQQVLDRFHPRRYRHGAPAEQLRHLADMLTTKWAT
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XP_016 IGDFERP-FSTPAGHVTNQCKVNQTLKQVIEKFYPKRYRDGCSEEQLRQLCQRLSTRWMA
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XP_016 RLIVSYVYKSLMTFGGYQDDFMVVINNTHSKDKP---TEKLLFAMAKPKILEITLLIASY
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XP_016 INNFHQQKAAFHHLSAPALLSAQTRGPQARMMGSQPLLSSSRPTKGPTLL
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>>XP_016858841 (OMIM: 612723) PREDICTED: pleckstrin homo (1013 aa)
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10 20 30 40 50 60
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XP_016 MAELS-EPEGPVDWKERCVALESQLMKFRVQASKIRELLAEKMQQLERQVIDAERQAEKA
10 20 30 40 50
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pF1KSD ETQVGVMEEKVKLSNLKNVDSEGSLHRKYQELLKAIKGKDELISQLEAQLEKQKQMRAEE
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XP_016 AKIIEEKAAKIKEWVTVKLNELELENQNLRLINQNQTEEIRTMQSKLQEVQGKKSSTVST
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XP_016 LKLSEGQRLSSLTFGCFLSRARSPPQVVKSEEMSKISSKEPEFTEGKDMEEMEIPEKSVD
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210 220 230 240
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250 260 270
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.::. :..: :. . . .. : . : :. :: ...
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1010
1364 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
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start: Thu Nov 3 05:20:14 2016 done: Thu Nov 3 05:20:16 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]