Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA1200
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA1200, 1364 aa
1>>>pF1KSDA1200 1364 - 1364 aa - 1364 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.4114+/-0.00109; mu= 4.0959+/- 0.065
mean_var=223.2552+/-44.868, 0's: 0 Z-trim(110.4): 43 B-trim: 43 in 1/51
Lambda= 0.085837
statistics sampled from 11587 (11617) to 11587 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.692), E-opt: 0.2 (0.357), width: 16
Scan time: 4.940
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS45128.1 PLEKHH1 gene_id:57475|Hs108|chr14 (1364) 9143 1146.5 0
CCDS1812.1 PLEKHH2 gene_id:130271|Hs108|chr2 (1493) 3973 506.3 2.7e-142
>>CCDS45128.1 PLEKHH1 gene_id:57475|Hs108|chr14 (1364 aa)
initn: 9143 init1: 9143 opt: 9143 Z-score: 6128.9 bits: 1146.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 9143; 100.0% identity (100.0% similar) in 1364 aa overlap (1-1364:1-1364)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MAELKVEAPASVDWQKRCLTLETQLFRFRLQASKIRELLADKMQELEQRLLEAEQRAENA
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CCDS45 MAELKVEAPASVDWQKRCLTLETQLFRFRLQASKIRELLADKMQELEQRLLEAEQRAENA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD ETQVGVMEEKVKLSNLKNVDSEGSLHRKYQELLKAIKGKDELISQLEAQLEKQKQMRAEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 ETQVGVMEEKVKLSNLKNVDSEGSLHRKYQELLKAIKGKDELISQLEAQLEKQKQMRAEE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD AKTVQEKAAKIKEWVTLKLAKLEMENQHLKSHNQRLVEQVGSLQDALEAIQIAPSRKLLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 AKTVQEKAAKIKEWVTLKLAKLEMENQHLKSHNQRLVEQVGSLQDALEAIQIAPSRKLLV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD PPYGAAEQDSVPSEPGIQPMGQDSGSQAQGLKAAVLAPSPGALQSKDSVSEAASPLEDSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 PPYGAAEQDSVPSEPGIQPMGQDSGSQAQGLKAAVLAPSPGALQSKDSVSEAASPLEDSS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD SSTVHSGETVEAKPLQPHLGRESPPHQPCMKLLTFRCSSASWGEGLVTAQRGMLPGTKTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 SSTVHSGETVEAKPLQPHLGRESPPHQPCMKLLTFRCSSASWGEGLVTAQRGMLPGTKTS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD AREGGPGSSLTLPKVRAPGTPRDSIQLAKRHHSQPQVGHGHFGRVVNIETEAFSALHPSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 AREGGPGSSLTLPKVRAPGTPRDSIQLAKRHHSQPQVGHGHFGRVVNIETEAFSALHPSG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD LPELESRARSREEPEKMEMEEPPPAGKNEERESPKALGAELEEVELGNKPPTPPLHQFSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LPELESRARSREEPEKMEMEEPPPAGKNEERESPKALGAELEEVELGNKPPTPPLHQFSS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD WESRIYAVATSGMRLSDMSPRSNTACCASSPPALVSPGSFSGLVYKNVTVPVYTALKGRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 WESRIYAVATSGMRLSDMSPRSNTACCASSPPALVSPGSFSGLVYKNVTVPVYTALKGRA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD TQISNMPFMDESSGSDDDCSSQASFRISVPSSESRKTSGLGSPRAIKRGVSMSSLSSEGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 TQISNMPFMDESSGSDDDCSSQASFRISVPSSESRKTSGLGSPRAIKRGVSMSSLSSEGD
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD YAIPPDACSLDSDYSEPEHKLQRTSSYSTDGLGLGGESLEKSGYLLKMGSQVKTWKRRWF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 YAIPPDACSLDSDYSEPEHKLQRTSSYSTDGLGLGGESLEKSGYLLKMGSQVKTWKRRWF
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD VLRQGQIMYYKSPSDVIRKPQGQVDLNSRCQIVRGEGSQTFQLISEKKTYYLTADSPSLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 VLRQGQIMYYKSPSDVIRKPQGQVDLNSRCQIVRGEGSQTFQLISEKKTYYLTADSPSLL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD EEWIRVLQSLLKVQATGPPALLRGGTKPTVKGWLTKVKHGHSKVVWCALVGKIFYYYRSH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 EEWIRVLQSLLKVQATGPPALLRGGTKPTVKGWLTKVKHGHSKVVWCALVGKIFYYYRSH
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD EDKRPLGCLPVRDAHIEEVDRSCDSDEDYEAGGTRRLLSSHCTLVIHPTEHSPTYLLIGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 EDKRPLGCLPVRDAHIEEVDRSCDSDEDYEAGGTRRLLSSHCTLVIHPTEHSPTYLLIGT
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD KHEKDTWLYHLTVAAGGSSAKVGTAYEQLIGKLMDGEGDPDSPLWRHPMLCYSKDGLYAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KHEKDTWLYHLTVAAGGSSAKVGTAYEQLIGKLMDGEGDPDSPLWRHPMLCYSKDGLYAS
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD LTTLPSEALQTEALKLFKSCQLFINVPVEAASVDYHVSLAQTALQVCLVHPELQSEIYCQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LTTLPSEALQTEALKLFKSCQLFINVPVEAASVDYHVSLAQTALQVCLVHPELQSEIYCQ
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD LMKQTSCRPPQKYSLMQCWQLLALCAPLFLPQHHFLWYVKQQLQRHADPRSETGQYATYC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LMKQTSCRPPQKYSLMQCWQLLALCAPLFLPQHHFLWYVKQQLQRHADPRSETGQYATYC
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD QRAVERTLRTGEREARPSRMEVVSILLRNPFHHSLPFSIPVHFTNGTYHVVGFDGSSTVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 QRAVERTLRTGEREARPSRMEVVSILLRNPFHHSLPFSIPVHFTNGTYHVVGFDGSSTVD
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD EFLQRLNQEIGMRKPSHSGFALFTDDPSGRDLEHCLQGSVKICDAISKWEQAMKELHPGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 EFLQRLNQEIGMRKPSHSGFALFTDDPSGRDLEHCLQGSVKICDAISKWEQAMKELHPGK
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD SEGGTRVVKLMYKNRLYFRSQVKGETDRERLLLASQTSREIVAGRFPINKELALEMAALM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 SEGGTRVVKLMYKNRLYFRSQVKGETDRERLLLASQTSREIVAGRFPINKELALEMAALM
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD AQVEYGDLEKPALPGPGGTSPAKAQHLLQQVLDRFHPRRYRHGAPAEQLRHLADMLTTKW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 AQVEYGDLEKPALPGPGGTSPAKAQHLLQQVLDRFHPRRYRHGAPAEQLRHLADMLTTKW
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KSD ATLQGCSPPECIRIYLTVARKWPFFGAKLFAAQPAQLSSKENALVWIAVNEDGVSILDHN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 ATLQGCSPPECIRIYLTVARKWPFFGAKLFAAQPAQLSSKENALVWIAVNEDGVSILDHN
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KSD TMQVHITYPYSSVTTFGGCRDDFMLVIRSIPDKSSGKSHIEKLIFRMAAPKIAEATFIMA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 TMQVHITYPYSSVTTFGGCRDDFMLVIRSIPDKSSGKSHIEKLIFRMAAPKIAEATFIMA
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360
pF1KSD SYMNHCTTTVNPPTNPPGACQLWELDGRQFFSSVSCATKGPTLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 SYMNHCTTTVNPPTNPPGACQLWELDGRQFFSSVSCATKGPTLL
1330 1340 1350 1360
>>CCDS1812.1 PLEKHH2 gene_id:130271|Hs108|chr2 (1493 aa)
initn: 4162 init1: 1488 opt: 3973 Z-score: 2668.3 bits: 506.3 E(32554): 2.7e-142
Smith-Waterman score: 4057; 48.7% identity (71.2% similar) in 1418 aa overlap (96-1364:95-1493)
70 80 90 100 110 120
pF1KSD VMEEKVKLSNLKNVDSEGSLHRKYQELLKAIKGKDELISQLEAQLEKQKQMRAEEAKTVQ
:. ::..:..:: :::.:::.: .::: ..
CCDS18 VMEDKLKAANIQTSESETRLYNKCQDLESLIQEKDDVIQNLELQLEEQKQIRIQEAKIIE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KSD EKAAKIKEWVTLKLAKLEMENQHLKSHNQRLVEQVGSLQDALEAIQ-----------IAP
:::::::::::.:: .::.:::.:. :: .:.. ..:. :. .: ..
CCDS18 EKAAKIKEWVTVKLNELELENQNLRLINQNQTEEIRTMQSKLQEVQGKKSSTVSTLKLSE
130 140 150 160 170 180
180 190 200
pF1KSD SRKLLVPPYG--------------AAEQDSVPS-EP------GIQPM-------------
...: .: . :.... : :: .. :
CCDS18 GQRLSSLTFGCFLSRARSPPQVVKSEEMSKISSKEPEFTEGKDMEEMEIPEKSVDNQVLE
190 200 210 220 230 240
210 220 230 240
pF1KSD ---GQDS------GSQAQGLKAAVLAPSPGALQSKDS-VSEAASPLEDSS--------SS
:: . ::. . . .: . : :.. . ::. .: ::.: .:
CCDS18 NNRGQRTLHQTPCGSEQNRKTRTSFATDGGISQNSGAPVSDWSSDEEDGSKGRSKSRCTS
250 260 270 280 290 300
250 260 270 280
pF1KSD TV--HSGET-VEAKPLQPHL-----------------GRESPPHQPCMKLLTFRCSSASW
:. :..: :. . . .. : . : :. :: ... . :.:
CCDS18 TLSSHTSEEGVQCSRMGSEMYLTASDDSSSIFEEETFGIKRPEHK---KLYSWQ-QEAQW
310 320 330 340 350 360
290
pF1KSD -------GEG------------------LVTAQR-------------------GMLPGTK
:.: .:: ...:
CCDS18 KALNSPLGKGNSELSKKEQDSSSDELNKKFQSQRLDYSSSSSEANTPSPILTPALMPKHP
370 380 390 400 410 420
300 310 320 330 340 350
pF1KSD TSAREGG----PGSSLTLPKVRAPGTPRDSIQLAKRHHSQPQVGHGHFGRVVNIETEAFS
.: : :.: : ::.: :.. :. ::::: ::::.. :. . . .:.:
CCDS18 NSLSGKGTQLVPSSHLPPPKLRIPNVFSISVALAKRHLSQPQLSS---DRMFGTNRNAIS
430 440 450 460 470
360 370 380 390 400
pF1KSD ALHPSGLPELESRARSREEPEKME-MEEPPPAG--KNEERESPKALGAE----LEEVELG
..: : . . . : .: :. : . . .::.. : ..:
CCDS18 MIRPLRPQETDLDLVDGDSTEVLENMDTSCDDGLFSYDSLDSPNSDDQEHCDSAKKVAY-
480 490 500 510 520 530
410 420 430 440 450 460
pF1KSD NKPPTPPLHQFSSWESRIYAVATSGMRLSDMSPRSNTACCASSPPALVSPGSFSGLVYKN
.::::::::.: :::::::::: ::.:.:. .. ... . .. : ...:.:::
CCDS18 SKPPTPPLHRFPSWESRIYAVAKSGIRMSEAFNMESVNKNSAATLSYTTSGLYTSLIYKN
540 550 560 570 580 590
470 480 490 500 510 520
pF1KSD VTVPVYTALKGRATQISNMPFMDESSGSDDDCSSQASFRISVPSSESRKTSGLGSPRAIK
.:.::::.:::.:::::. ::.:.::::... ::..: : : :.::. :: :::::.:
CCDS18 MTTPVYTTLKGKATQISSSPFLDDSSGSEEEDSSRSSSRTS--ESDSRSRSGPGSPRAMK
600 610 620 630 640 650
530 540 550 560 570 580
pF1KSD RGVSMSSLSSEGDYAIPPDACSLDSDYSEPEHKLQRTSSYSTDGLGLGGESLEKSGYLLK
::::.::..::.:::::::: : :..::.::.:: .: : :.:. : .: :::::::::
CCDS18 RGVSLSSVASESDYAIPPDAYSTDTEYSQPEQKLPKTCSSSSDN-G-KNEPLEKSGYLLK
660 670 680 690 700 710
590 600 610 620 630 640
pF1KSD MGSQVKTWKRRWFVLRQGQIMYYKSPSDVIRKPQGQVDLNSRCQIVRGEGSQTFQLISEK
:...::.::::::::. :...::::::::::::::...:.. :.:.::...:: :: .::
CCDS18 MSGKVKSWKRRWFVLKGGELLYYKSPSDVIRKPQGHIELSASCSILRGDNKQTVQLTTEK
720 730 740 750 760 770
650 660 670 680 690 700
pF1KSD KTYYLTADSPSLLEEWIRVLQSLLKVQATGPPALLRGGTKPTVKGWLTKVKHGHSKVVWC
.:::::::::..:::::.:::..:.:::..: .: : :::.:: :::::::.:: :::
CCDS18 HTYYLTADSPNILEEWIKVLQNVLRVQAANPLSLQPEG-KPTMKGLLTKVKHGYSKRVWC
780 790 800 810 820 830
710 720 730 740 750 760
pF1KSD ALVGKIFYYYRSHEDKRPLGCLPVRDAHIEEVDRSCDSDEDYEAGGTRRLLSSHCTLVIH
.:.:: .::.::.::: ::: . . .:..:::::::::::::::.: : :::.: :.:::
CCDS18 TLIGKTLYYFRSQEDKFPLGQIKLWEAKVEEVDRSCDSDEDYEASG-RSLLSTHYTIVIH
840 850 860 870 880 890
770 780 790 800 810 820
pF1KSD PTEHSPTYLLIGTKHEKDTWLYHLTVAAGGSSAKVGTAYEQLIGKLMDGEGDPDSPLWRH
: ...:::::::.::::::::::::::::.....::. .:::. ::.. .:.:.: .:::
CCDS18 PKDQGPTYLLIGSKHEKDTWLYHLTVAAGSNNVNVGSEFEQLVCKLLNIDGEPSSQIWRH
900 910 920 930 940 950
830 840 850 860 870 880
pF1KSD PMLCYSKDGLYASLTTLPSEALQTEALKLFKSCQLFINVPVEAASVDYHVSLAQTALQVC
: ::.::.:. . :::::::::::::.::::.::::::. :.. ..:::.::::.:::.:
CCDS18 PTLCHSKEGIISPLTTLPSEALQTEAIKLFKTCQLFINAAVDSPAIDYHISLAQSALQIC
960 970 980 990 1000 1010
890 900 910 920 930 940
pF1KSD LVHPELQSEIYCQLMKQTSCRPPQKY-SLMQCWQLLALCAPLFLPQHHFLWYVKQQLQRH
:.:::::.:: :::.::: : ::. . .: :::::::. ::::.: ::: .. .:.:.
CCDS18 LTHPELQNEICCQLIKQTRRRQPQNQPGPLQGWQLLALCVGLFLPHHPFLWLLRLHLKRN
1020 1030 1040 1050 1060 1070
950 960 970 980 990 1000
pF1KSD ADPRSETGQYATYCQRAVERTLRTGEREARPSRMEVVSILLRNPFHHSLPFSIPVHFTNG
:: :.: :.:: :::: :::: ..:.:::::::::..: :::::.:::::::::::: ::
CCDS18 ADSRTEFGKYAIYCQRCVERTQQNGDREARPSRMEILSTLLRNPYHHSLPFSIPVHFMNG
1080 1090 1100 1110 1120 1130
1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KSD TYHVVGFDGSSTVDEFLQRLNQEIGMRKPSHSGFALFTDDPSGRDLEHCLQGSVKICDAI
:.:::::.:.::.:::. :::. :::::..:::::::::::::::::::::..:::: :
CCDS18 IYQVVGFDASTTVEEFLNTLNQDTGMRKPAQSGFALFTDDPSGRDLEHCLQGNIKICDII
1140 1150 1160 1170 1180 1190
1070 1080 1090 1100 1110 1120
pF1KSD SKWEQAMKELHPGKSEGGTRVVKLMYKNRLYFRSQVKGETDRERLLLASQTSREIVAGRF
:::::: :: .::: :: ::.:.: ::::::: :..::::::.::: ::. .:. : :
CCDS18 SKWEQASKEQQPGKCEG-TRTVRLTYKNRLYFSVQARGETDREKLLLMYQTNDQIINGLF
1200 1210 1220 1230 1240
1130 1140 1150 1160 1170 1180
pF1KSD PINKELALEMAALMAQVEYGDLEKPALPGPGG--TSPAKAQHLLQQVLDRFHPRRYRHGA
:.::.::::::::..::: ::.:.: . :.: :. :... :.::...:.:.::: :
CCDS18 PLNKDLALEMAALLSQVEIGDFERP-FSTPAGHVTNQCKVNQTLKQVIEKFYPKRYRDGC
1250 1260 1270 1280 1290 1300
1190 1200 1210 1220 1230 1240
pF1KSD PAEQLRHLADMLTTKWATLQGCSPPECIRIYLTVARKWPFFGAKLFAAQPAQLSSKENAL
::::.: . :.:.: .:.: : .:.:::::::::::::::::: :.: :: ...
CCDS18 SEEQLRQLCQRLSTRWMALRGHSAADCVRIYLTVARKWPFFGAKLFLAKPITPSSLGSTF
1310 1320 1330 1340 1350 1360
1250 1260 1270 1280 1290 1300
pF1KSD VWIAVNEDGVSILDHNTMQVHITYPYSSVTTFGGCRDDFMLVIRSIPDKSSGKSHIEKLI
.:.::.:::.:.:..:.:.. ..: :.:. :::: .::::.:: . .:.. :::.
CCDS18 LWLAVHEDGLSLLEYNSMRLIVSYVYKSLMTFGGYQDDFMVVINNTHSKDKP---TEKLL
1370 1380 1390 1400 1410 1420
1310 1320 1330 1340 1350
pF1KSD FRMAAPKIAEATFIMASYMN--HCTTTVNPPTNPPGACQLW------ELDGRQFFSSVSC
: :: ::: : :...:::.: : .. . :. . .. : : . : :
CCDS18 FAMAKPKILEITLLIASYINNFHQQKAAFHHLSAPALLSAQTRGPQARMMGSQPLLSSSR
1430 1440 1450 1460 1470 1480
1360
pF1KSD ATKGPTLL
:::::::
CCDS18 PTKGPTLL
1490
1364 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 05:20:13 2016 done: Thu Nov 3 05:20:13 2016
Total Scan time: 4.940 Total Display time: 0.150
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]