FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA1186, 403 aa
1>>>pF1KSDA1186 403 - 403 aa - 403 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5751+/-0.000833; mu= 15.2573+/- 0.050
mean_var=66.1864+/-13.215, 0's: 0 Z-trim(106.6): 26 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.157648
statistics sampled from 9045 (9071) to 9045 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.657), E-opt: 0.2 (0.279), width: 16
Scan time: 2.920
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS13876.1 SEC14L2 gene_id:23541|Hs108|chr22 ( 403) 2761 636.9 1e-182
CCDS46685.1 SEC14L2 gene_id:23541|Hs108|chr22 ( 392) 2485 574.1 7.8e-164
CCDS13877.1 SEC14L3 gene_id:266629|Hs108|chr22 ( 400) 2224 514.7 5.9e-146
CCDS13878.1 SEC14L4 gene_id:284904|Hs108|chr22 ( 406) 2063 478.1 6.3e-135
CCDS54518.1 SEC14L6 gene_id:730005|Hs108|chr22 ( 397) 1932 448.3 5.7e-126
CCDS54517.1 SEC14L4 gene_id:284904|Hs108|chr22 ( 360) 1870 434.2 9.3e-122
CCDS58801.1 SEC14L3 gene_id:266629|Hs108|chr22 ( 341) 1858 431.5 5.9e-121
CCDS56228.1 SEC14L2 gene_id:23541|Hs108|chr22 ( 320) 1801 418.5 4.4e-117
CCDS58800.1 SEC14L3 gene_id:266629|Hs108|chr22 ( 323) 1756 408.3 5.4e-114
CCDS45403.1 SEC14L5 gene_id:9717|Hs108|chr16 ( 696) 684 164.6 2.6e-40
CCDS45789.1 SEC14L1 gene_id:6397|Hs108|chr17 ( 681) 633 153.0 8e-37
CCDS11752.1 SEC14L1 gene_id:6397|Hs108|chr17 ( 715) 633 153.0 8.3e-37
CCDS42385.1 SEC14L1 gene_id:6397|Hs108|chr17 ( 719) 633 153.0 8.4e-37
>>CCDS13876.1 SEC14L2 gene_id:23541|Hs108|chr22 (403 aa)
initn: 2761 init1: 2761 opt: 2761 Z-score: 3393.9 bits: 636.9 E(32554): 1e-182
Smith-Waterman score: 2761; 100.0% identity (100.0% similar) in 403 aa overlap (1-403:1-403)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MSGRVGDLSPRQKEALAKFRENVQDVLPALPNPDDYFLLRWLRARSFDLQKSEAMLRKHV
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CCDS13 MSGRVGDLSPRQKEALAKFRENVQDVLPALPNPDDYFLLRWLRARSFDLQKSEAMLRKHV
10 20 30 40 50 60
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pF1KSD EFRKQKDIDNIISWQPPEVIQQYLSGGMCGYDLDGCPVWYDIIGPLDAKGLLFSASKQDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 EFRKQKDIDNIISWQPPEVIQQYLSGGMCGYDLDGCPVWYDIIGPLDAKGLLFSASKQDL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD LRTKMRECELLLQECAHQTTKLGRKVETITIIYDCEGLGLKHLWKPAVEAYGEFLCMFEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LRTKMRECELLLQECAHQTTKLGRKVETITIIYDCEGLGLKHLWKPAVEAYGEFLCMFEE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD NYPETLKRLFVVKAPKLFPVAYNLIKPFLSEDTRKKIMVLGANWKEVLLKHISPDQVPVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 NYPETLKRLFVVKAPKLFPVAYNLIKPFLSEDTRKKIMVLGANWKEVLLKHISPDQVPVE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD YGGTMTDPDGNPKCKSKINYGGDIPRKYYVRDQVKQQYEHSVQISRGSSHQVEYEILFPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 YGGTMTDPDGNPKCKSKINYGGDIPRKYYVRDQVKQQYEHSVQISRGSSHQVEYEILFPG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD CVLRWQFMSDGADVGFGIFLKTKMGERQRAGEMTEVLPNQRYNSHLVPEDGTLTCSDPGI
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CCDS13 CVLRWQFMSDGADVGFGIFLKTKMGERQRAGEMTEVLPNQRYNSHLVPEDGTLTCSDPGI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400
pF1KSD YVLRFDNTYSFIHAKKVNFTVEVLLPDKASEEKMKQLGAGTPK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 YVLRFDNTYSFIHAKKVNFTVEVLLPDKASEEKMKQLGAGTPK
370 380 390 400
>>CCDS46685.1 SEC14L2 gene_id:23541|Hs108|chr22 (392 aa)
initn: 2485 init1: 2485 opt: 2485 Z-score: 3054.8 bits: 574.1 E(32554): 7.8e-164
Smith-Waterman score: 2485; 100.0% identity (100.0% similar) in 360 aa overlap (1-360:1-360)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MSGRVGDLSPRQKEALAKFRENVQDVLPALPNPDDYFLLRWLRARSFDLQKSEAMLRKHV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MSGRVGDLSPRQKEALAKFRENVQDVLPALPNPDDYFLLRWLRARSFDLQKSEAMLRKHV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD EFRKQKDIDNIISWQPPEVIQQYLSGGMCGYDLDGCPVWYDIIGPLDAKGLLFSASKQDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 EFRKQKDIDNIISWQPPEVIQQYLSGGMCGYDLDGCPVWYDIIGPLDAKGLLFSASKQDL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD LRTKMRECELLLQECAHQTTKLGRKVETITIIYDCEGLGLKHLWKPAVEAYGEFLCMFEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LRTKMRECELLLQECAHQTTKLGRKVETITIIYDCEGLGLKHLWKPAVEAYGEFLCMFEE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD NYPETLKRLFVVKAPKLFPVAYNLIKPFLSEDTRKKIMVLGANWKEVLLKHISPDQVPVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 NYPETLKRLFVVKAPKLFPVAYNLIKPFLSEDTRKKIMVLGANWKEVLLKHISPDQVPVE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD YGGTMTDPDGNPKCKSKINYGGDIPRKYYVRDQVKQQYEHSVQISRGSSHQVEYEILFPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 YGGTMTDPDGNPKCKSKINYGGDIPRKYYVRDQVKQQYEHSVQISRGSSHQVEYEILFPG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD CVLRWQFMSDGADVGFGIFLKTKMGERQRAGEMTEVLPNQRYNSHLVPEDGTLTCSDPGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 CVLRWQFMSDGADVGFGIFLKTKMGERQRAGEMTEVLPNQRYNSHLVPEDGTLTCSDPGI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400
pF1KSD YVLRFDNTYSFIHAKKVNFTVEVLLPDKASEEKMKQLGAGTPK
CCDS46 CKYLCLGNALKPHVQLSACEVPLPPWIFGSEC
370 380 390
>>CCDS13877.1 SEC14L3 gene_id:266629|Hs108|chr22 (400 aa)
initn: 2217 init1: 2217 opt: 2224 Z-score: 2733.8 bits: 514.7 E(32554): 5.9e-146
Smith-Waterman score: 2224; 77.3% identity (93.7% similar) in 397 aa overlap (1-397:1-397)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MSGRVGDLSPRQKEALAKFRENVQDVLPALPNPDDYFLLRWLRARSFDLQKSEAMLRKHV
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CCDS13 MSGRVGDLSPKQAETLAKFRENVQDVLPALPNPDDYFLLRWLRARNFDLQKSEALLRKYM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD EFRKQKDIDNIISWQPPEVIQQYLSGGMCGYDLDGCPVWYDIIGPLDAKGLLFSASKQDL
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CCDS13 EFRKTMDIDHILDWQPPEVIQKYMPGGLCGYDRDGCPVWYDIIGPLDPKGLLFSVTKQDL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD LRTKMRECELLLQECAHQTTKLGRKVETITIIYDCEGLGLKHLWKPAVEAYGEFLCMFEE
:.::::.:: .:.:: :: .::.:.:::..:.:::::::::.::: ::.: ::. ..::
CCDS13 LKTKMRDCERILHECDLQTERLGKKIETIVMIFDCEGLGLKHFWKPLVEVYQEFFGLLEE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD NYPETLKRLFVVKAPKLFPVAYNLIKPFLSEDTRKKIMVLGANWKEVLLKHISPDQVPVE
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CCDS13 NYPETLKFMLIVKATKLFPVGYNLMKPFLSEDTRRKIIVLGNNWKEGLLKLISPEELPAQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD YGGTMTDPDGNPKCKSKINYGGDIPRKYYVRDQVKQQYEHSVQISRGSSHQVEYEILFPG
.:::.::::::::: .::::::.::...::::::: ::::::::.:::::::::::::::
CCDS13 FGGTLTDPDGNPKCLTKINYGGEIPKSMYVRDQVKTQYEHSVQINRGSSHQVEYEILFPG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD CVLRWQFMSDGADVGFGIFLKTKMGERQRAGEMTEVLPNQRYNSHLVPEDGTLTCSDPGI
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CCDS13 CVLRWQFSSDGADIGFGVFLKTKMGERQRAGEMTDVLPSQRYNAHMVPEDGNLTCSEAGV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400
pF1KSD YVLRFDNTYSFIHAKKVNFTVEVLLPDKASEEKMKQLGAGTPK
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CCDS13 YVLRFDNTYSFVHAKKVSFTVEVLLPDEGMQKYDKELTPV
370 380 390 400
>>CCDS13878.1 SEC14L4 gene_id:284904|Hs108|chr22 (406 aa)
initn: 2084 init1: 2063 opt: 2063 Z-score: 2535.8 bits: 478.1 E(32554): 6.3e-135
Smith-Waterman score: 2063; 70.4% identity (89.6% similar) in 402 aa overlap (1-402:1-402)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MSGRVGDLSPRQKEALAKFRENVQDVLPALPNPDDYFLLRWLRARSFDLQKSEAMLRKHV
::.:::::::.:.::::.::::.::.:: ::: ::::::::::::.::::::: :::.:.
CCDS13 MSSRVGDLSPQQQEALARFRENLQDLLPILPNADDYFLLRWLRARNFDLQKSEDMLRRHM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD EFRKQKDIDNIISWQPPEVIQQYLSGGMCGYDLDGCPVWYDIIGPLDAKGLLFSASKQDL
:::::.:.:::..:::::::: : :::.:::: .::::...::: :: ::::.::::::.
CCDS13 EFRKQQDLDNIVTWQPPEVIQLYDSGGLCGYDYEGCPVYFNIIGSLDPKGLLLSASKQDM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD LRTKMRECELLLQECAHQTTKLGRKVETITIIYDCEGLGLKHLWKPAVEAYGEFLCMFEE
.: ... :::::.:: :: :::::.: ...: :::.::::::::::.: .:. ..:
CCDS13 IRKRIKVCELLLHECELQTQKLGRKIEMALMVFDMEGLSLKHLWKPAVEVYQQFFSILEA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD NYPETLKRLFVVKAPKLFPVAYNLIKPFLSEDTRKKIMVLGANWKEVLLKHISPDQVPVE
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CCDS13 NYPETLKNLIVIRAPKLFPVAFNLVKSFMSEETRRKIVILGDNWKQELTKFISPDQLPVE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD YGGTMTDPDGNPKCKSKINYGGDIPRKYYVRDQVKQQYEHSVQISRGSSHQVEYEILFPG
.::::::::::::: .::::::..:..::. .::. ::::. ...:::: ::: ::::::
CCDS13 FGGTMTDPDGNPKCLTKINYGGEVPKSYYLCEQVRLQYEHTRSVGRGSSLQVENEILFPG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD CVLRWQFMSDGADVGFGIFLKTKMGERQRAGEMTEVLPNQRYNSHLVPEDGTLTCSDPGI
::::::: :::.:.:::.::::::::.: : :::::::.::::.:.:::::.::: . :.
CCDS13 CVLRWQFASDGGDIGFGVFLKTKMGEQQSAREMTEVLPSQRYNAHMVPEDGSLTCLQAGV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400
pF1KSD YVLRFDNTYSFIHAKKVNFTVEVLLPDKASEEKMKQLGAGTPK
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CCDS13 YVLRFDNTYSRMHAKKLSYTVEVLLPDKASEETLQSLKAMRPSPTQ
370 380 390 400
>>CCDS54518.1 SEC14L6 gene_id:730005|Hs108|chr22 (397 aa)
initn: 1958 init1: 1932 opt: 1932 Z-score: 2375.0 bits: 448.3 E(32554): 5.7e-126
Smith-Waterman score: 1932; 67.3% identity (86.9% similar) in 397 aa overlap (1-397:1-397)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MSGRVGDLSPRQKEALAKFRENVQDVLPALPNPDDYFLLRWLRARSFDLQKSEAMLRKHV
:::.:::::: :...::.::::.:::: ::::::::::::::.:::::::::: :::::.
CCDS54 MSGQVGDLSPSQEKSLAQFRENIQDVLSALPNPDDYFLLRWLQARSFDLQKSEDMLRKHM
10 20 30 40 50 60
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pF1KSD EFRKQKDIDNIISWQPPEVIQQYLSGGMCGYDLDGCPVWYDIIGPLDAKGLLFSASKQDL
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CCDS54 EFRKQQDLANILAWQPPEVVRLYNANGICGHDGEGSPVWYHIVGSLDPKGLLLSASKQEL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD LRTKMRECELLLQECAHQTTKLGRKVETITIIYDCEGLGLKHLWKPAVEAYGEFLCMFEE
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CCDS54 LRDSFRSCELLLRECELQSQKLGKRVEKIIAIFGLEGLGLRDLWKPGIELLQEFFSALEA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD NYPETLKRLFVVKAPKLFPVAYNLIKPFLSEDTRKKIMVLGANWKEVLLKHISPDQVPVE
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CCDS54 NYPEILKSLIVVRAPKLFAVAFNLVKSYMSEETRRKVVILGDNWKQELTKFISPDQLPVE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD YGGTMTDPDGNPKCKSKINYGGDIPRKYYVRDQVKQQYEHSVQISRGSSHQVEYEILFPG
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CCDS54 FGGTMTDPDGNPKCLTKINYGGEVPKSYYLCKQVRLQYEHTRSVGRGSSLQVENEILFPG
250 260 270 280 290 300
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pF1KSD CVLRWQFMSDGADVGFGIFLKTKMGERQRAGEMTEVLPNQRYNSHLVPEDGTLTCSDPGI
::::::: :::.:.:::.:::::::::::: :::::::.::::.:.::::: ::: . :
CCDS54 CVLRWQFASDGGDIGFGVFLKTKMGERQRAREMTEVLPSQRYNAHMVPEDGILTCLQAGS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400
pF1KSD YVLRFDNTYSFIHAKKVNFTVEVLLPDKASEEKMKQLGAGTPK
::::: ::::..:.:....::::::::.. :::...
CCDS54 YVLRFYNTYSLVHSKRISYTVEVLLPDQTFMEKMEKF
370 380 390
>>CCDS54517.1 SEC14L4 gene_id:284904|Hs108|chr22 (360 aa)
initn: 1891 init1: 1870 opt: 1870 Z-score: 2299.4 bits: 434.2 E(32554): 9.3e-122
Smith-Waterman score: 1870; 70.3% identity (89.7% similar) in 360 aa overlap (1-360:1-360)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MSGRVGDLSPRQKEALAKFRENVQDVLPALPNPDDYFLLRWLRARSFDLQKSEAMLRKHV
::.:::::::.:.::::.::::.::.:: ::: ::::::::::::.::::::: :::.:.
CCDS54 MSSRVGDLSPQQQEALARFRENLQDLLPILPNADDYFLLRWLRARNFDLQKSEDMLRRHM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD EFRKQKDIDNIISWQPPEVIQQYLSGGMCGYDLDGCPVWYDIIGPLDAKGLLFSASKQDL
:::::.:.:::..:::::::: : :::.:::: .::::...::: :: ::::.::::::.
CCDS54 EFRKQQDLDNIVTWQPPEVIQLYDSGGLCGYDYEGCPVYFNIIGSLDPKGLLLSASKQDM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD LRTKMRECELLLQECAHQTTKLGRKVETITIIYDCEGLGLKHLWKPAVEAYGEFLCMFEE
.: ... :::::.:: :: :::::.: ...: :::.::::::::::.: .:. ..:
CCDS54 IRKRIKVCELLLHECELQTQKLGRKIEMALMVFDMEGLSLKHLWKPAVEVYQQFFSILEA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD NYPETLKRLFVVKAPKLFPVAYNLIKPFLSEDTRKKIMVLGANWKEVLLKHISPDQVPVE
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CCDS54 NYPETLKNLIVIRAPKLFPVAFNLVKSFMSEETRRKIVILGDNWKQELTKFISPDQLPVE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD YGGTMTDPDGNPKCKSKINYGGDIPRKYYVRDQVKQQYEHSVQISRGSSHQVEYEILFPG
.::::::::::::: .::::::..:..::. .::. ::::. ...:::: ::: ::::::
CCDS54 FGGTMTDPDGNPKCLTKINYGGEVPKSYYLCEQVRLQYEHTRSVGRGSSLQVENEILFPG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD CVLRWQFMSDGADVGFGIFLKTKMGERQRAGEMTEVLPNQRYNSHLVPEDGTLTCSDPGI
::::::: :::.:.:::.::::::::.: : :::::::.::::.:.:::::.::: . :.
CCDS54 CVLRWQFASDGGDIGFGVFLKTKMGEQQSAREMTEVLPSQRYNAHMVPEDGSLTCLQAGV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400
pF1KSD YVLRFDNTYSFIHAKKVNFTVEVLLPDKASEEKMKQLGAGTPK
>>CCDS58801.1 SEC14L3 gene_id:266629|Hs108|chr22 (341 aa)
initn: 1850 init1: 1850 opt: 1858 Z-score: 2285.1 bits: 431.5 E(32554): 5.9e-121
Smith-Waterman score: 1858; 75.1% identity (92.9% similar) in 338 aa overlap (60-397:1-338)
30 40 50 60 70 80
pF1KSD LPNPDDYFLLRWLRARSFDLQKSEAMLRKHVEFRKQKDIDNIISWQPPEVIQQYLSGGMC
.:::: :::.:..::::::::.:. ::.:
CCDS58 MEFRKTMDIDHILDWQPPEVIQKYMPGGLC
10 20 30
90 100 110 120 130 140
pF1KSD GYDLDGCPVWYDIIGPLDAKGLLFSASKQDLLRTKMRECELLLQECAHQTTKLGRKVETI
::: :::::::::::::: ::::::..:::::.::::.:: .:.:: :: .::.:.:::
CCDS58 GYDRDGCPVWYDIIGPLDPKGLLFSVTKQDLLKTKMRDCERILHECDLQTERLGKKIETI
40 50 60 70 80 90
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..:.:::::::::.::: ::.: ::. ..::::::::: ...::: :::::.:::.::::
CCDS58 VMIFDCEGLGLKHFWKPLVEVYQEFFGLLEENYPETLKFMLIVKATKLFPVGYNLMKPFL
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210 220 230 240 250 260
pF1KSD SEDTRKKIMVLGANWKEVLLKHISPDQVPVEYGGTMTDPDGNPKCKSKINYGGDIPRKYY
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CCDS58 SEDTRRKIIVLGNNWKEGLLKLISPEELPAQFGGTLTDPDGNPKCLTKINYGGEIPKSMY
160 170 180 190 200 210
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:::::: ::::::::.:::::::::::::::::::::: :::::.:::.:::::::::::
CCDS58 VRDQVKTQYEHSVQINRGSSHQVEYEILFPGCVLRWQFSSDGADIGFGVFLKTKMGERQR
220 230 240 250 260 270
330 340 350 360 370 380
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CCDS58 AGEMTDVLPSQRYNAHMVPEDGNLTCSEAGVYVLRFDNTYSFVHAKKVSFTVEVLLPDEG
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390 400
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.. :.:
CCDS58 MQKYDKELTPV
340
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CCDS56 MSGRVGDLSPRQKEALAKFRENVQDVLPALPNPDDYFLLRWLRARSFDLQKSEAMLRK--
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CCDS56 NYPETLKRLFVVKAPKLFPVAYNLIKPFLSEDTRKKIMVLGANWKEVLLKHISPDQVPVE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 YGGTMTDPDGNPKCKSKINYGGDIPRKYYVRDQVKQQYEHSVQISRGSSHQVEYEILFPG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 CVLRWQFMSDGADVGFGIFLKTKMGERQRAGEMTEVLPNQRYNSHLVPEDGTLTCSDPGI
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CCDS56 YVLRFDNTYSFIHAKKVNFTVEVLLPDKASEEKMKQLGAGTPK
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CCDS58 MVIQKYMPGGLCGYDRDGCPVWYDIIGPLDP
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CCDS58 KGLLFSVTKQDLLKTKMRDCERILHECDLQTERLGKKIETIVMIFDCEGLGLKHFWKPLV
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:.: ::. ..::::::::: ...::: :::::.:::.:::::::::.::.::: :::: :
CCDS58 EVYQEFFGLLEENYPETLKFMLIVKATKLFPVGYNLMKPFLSEDTRRKIIVLGNNWKEGL
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:: :::...:...:::.::::::::: .::::::.::...::::::: ::::::::.:::
CCDS58 LKLISPEELPAQFGGTLTDPDGNPKCLTKINYGGEIPKSMYVRDQVKTQYEHSVQINRGS
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::::::::::::::::::: :::::.:::.::::::::::::::::.:::.::::.:.::
CCDS58 SHQVEYEILFPGCVLRWQFSSDGADIGFGVFLKTKMGERQRAGEMTDVLPSQRYNAHMVP
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:::.::::. :.:::::::::::.:::::.:::::::::.. .. :.:
CCDS58 EDGNLTCSEAGVYVLRFDNTYSFVHAKKVSFTVEVLLPDEGMQKYDKELTPV
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10 20 30
pF1KSD MSGRVGDLSPRQKEALAKFRENVQDVLPALPNPD
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CCDS45 AHGPRSTLGPALEAVSMDGDKLDADYIERCLGHLTPMQESCLIQLRHWLQETHKG-KIPK
210 220 230 240 250 260
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pF1KSD DYFLLRWLRARSFDLQKSEAMLRKHVEFRKQKDIDNII-SWQPPEVIQQYLSGGMCGYDL
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CCDS45 DEHILRFLRAHDFHLDKAREMLRQSLSWRKQHQVDLLLQTWQPPALLEEFYAGGWHYQDI
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CCDS45 DGRPLYILRLGQMDTKGLMKAVGEEALLRHVLSVNEEGQKRCEGSTRQLGRPISSWTCLL
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CCDS45 DLEGLNMRHLWRPGVKALLRMIEVVEDNYPETLGRLLIVRAPRVFPVLWTLISPFINENT
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CCDS45 RRKFLIYSGSNYQ-------GPGGL-VDYLDREVIPDFLGGESVC--NVPEGGLVPKSLY
450 460 470 480 490
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CCDS45 MTEEEQEHTDQLWQWSETYHSASVLRGAPHEVAVEILEGESVITWDFDILRGDVVFSLY-
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CCDS45 PGVYLLQWQMHSPPSSVACSLPGVDDVLTALHSPGPKCKLLYYCEVLASEDFRGSMSSLE
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18511270 residues in 32554 library sequences
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start: Thu Nov 3 05:14:45 2016 done: Thu Nov 3 05:14:46 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]