Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA1142
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA1142, 438 aa
1>>>pF1KSDA1142 438 - 438 aa - 438 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.8820+/-0.0012; mu= -9.7177+/- 0.072
mean_var=443.5021+/-92.813, 0's: 0 Z-trim(115.4): 596 B-trim: 229 in 1/52
Lambda= 0.060901
statistics sampled from 15300 (15951) to 15300 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.786), E-opt: 0.2 (0.49), width: 16
Scan time: 3.120
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS33019.1 PAK4 gene_id:10298|Hs108|chr19 ( 438) 2972 275.0 1e-73
CCDS12528.1 PAK4 gene_id:10298|Hs108|chr19 ( 591) 2503 234.0 3.2e-61
CCDS13107.1 PAK5 gene_id:57144|Hs108|chr20 ( 719) 1730 166.1 1e-40
CCDS10054.1 PAK6 gene_id:56924|Hs108|chr15 ( 681) 1537 149.1 1.2e-35
CCDS61590.1 PAK6 gene_id:56924|Hs108|chr15 ( 636) 1099 110.6 4.5e-24
CCDS3321.1 PAK2 gene_id:5062|Hs108|chr3 ( 524) 1088 109.6 7.7e-24
CCDS14554.1 PAK3 gene_id:5063|Hs108|chrX ( 544) 1085 109.3 9.5e-24
CCDS48153.1 PAK3 gene_id:5063|Hs108|chrX ( 559) 1085 109.3 9.7e-24
CCDS48152.1 PAK3 gene_id:5063|Hs108|chrX ( 565) 1085 109.3 9.8e-24
CCDS48151.1 PAK3 gene_id:5063|Hs108|chrX ( 580) 1085 109.4 9.9e-24
CCDS8250.1 PAK1 gene_id:5058|Hs108|chr11 ( 545) 1073 108.3 2e-23
CCDS44687.1 PAK1 gene_id:5058|Hs108|chr11 ( 553) 1021 103.7 4.7e-22
CCDS47900.1 STK3 gene_id:6788|Hs108|chr8 ( 491) 676 73.4 5.8e-13
CCDS59108.1 STK3 gene_id:6788|Hs108|chr8 ( 519) 676 73.4 6e-13
CCDS58707.1 MAP4K3 gene_id:8491|Hs108|chr2 ( 873) 679 73.8 7.3e-13
CCDS1803.1 MAP4K3 gene_id:8491|Hs108|chr2 ( 894) 679 73.9 7.4e-13
CCDS13341.1 STK4 gene_id:6789|Hs108|chr20 ( 487) 668 72.6 9.4e-13
CCDS42564.1 MAP4K1 gene_id:11184|Hs108|chr19 ( 821) 658 72.0 2.5e-12
CCDS59385.1 MAP4K1 gene_id:11184|Hs108|chr19 ( 833) 658 72.0 2.5e-12
CCDS81582.1 MAP4K2 gene_id:5871|Hs108|chr11 ( 812) 655 71.7 3e-12
CCDS8082.1 MAP4K2 gene_id:5871|Hs108|chr11 ( 820) 655 71.7 3e-12
CCDS14631.1 STK26 gene_id:51765|Hs108|chrX ( 416) 646 70.7 3.2e-12
CCDS32001.1 STK24 gene_id:8428|Hs108|chr13 ( 431) 641 70.2 4.4e-12
CCDS9488.1 STK24 gene_id:8428|Hs108|chr13 ( 443) 641 70.2 4.5e-12
CCDS2549.1 STK25 gene_id:10494|Hs108|chr2 ( 426) 617 68.1 1.9e-11
CCDS76334.1 SLK gene_id:9748|Hs108|chr10 (1204) 616 68.4 4.3e-11
CCDS7553.1 SLK gene_id:9748|Hs108|chr10 (1235) 616 68.5 4.4e-11
CCDS34290.1 STK10 gene_id:6793|Hs108|chr5 ( 968) 603 67.2 8.1e-11
CCDS9188.1 TAOK3 gene_id:51347|Hs108|chr12 ( 898) 600 66.9 9.2e-11
>>CCDS33019.1 PAK4 gene_id:10298|Hs108|chr19 (438 aa)
initn: 2972 init1: 2972 opt: 2972 Z-score: 1437.1 bits: 275.0 E(32554): 1e-73
Smith-Waterman score: 2972; 100.0% identity (100.0% similar) in 438 aa overlap (1-438:1-438)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MFGKRKKRVEISAPSNFEHRVHTGFDQHEQKFTGLPRQWQSLIEESARRPKPLVDPACIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MFGKRKKRVEISAPSNFEHRVHTGFDQHEQKFTGLPRQWQSLIEESARRPKPLVDPACIT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD SIQPGAPKGEPHDVAPNGPSAGGLAIPQSSSSSSRPPTRARGAPSPGVLGPHASEPQLAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SIQPGAPKGEPHDVAPNGPSAGGLAIPQSSSSSSRPPTRARGAPSPGVLGPHASEPQLAP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD PACTPAAPAVPGPPGPRSPQREPQRVSHEQFRAALQLVVDPGDPRSYLDNFIKIGEGSTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 PACTPAAPAVPGPPGPRSPQREPQRVSHEQFRAALQLVVDPGDPRSYLDNFIKIGEGSTG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD IVCIATVRSSGKLVAVKKMDLRKQQRRELLFNEVVIMRDYQHENVVEMYNSYLVGDELWV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 IVCIATVRSSGKLVAVKKMDLRKQQRRELLFNEVVIMRDYQHENVVEMYNSYLVGDELWV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD VMEFLEGGALTDIVTHTRMNEEQIAAVCLAVLQALSVLHAQGVIHRDIKSDSILLTHDGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 VMEFLEGGALTDIVTHTRMNEEQIAAVCLAVLQALSVLHAQGVIHRDIKSDSILLTHDGR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD VKLSDFGFCAQVSKEVPRRKSLVGTPYWMAPELISRLPYGPEVDIWSLGIMVIEMVDGEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 VKLSDFGFCAQVSKEVPRRKSLVGTPYWMAPELISRLPYGPEVDIWSLGIMVIEMVDGEP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD PYFNEPPLKAMKMIRDNLPPRLKNLHKVSPSLKGFLDRLLVRDPAQRATAAELLKHPFLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 PYFNEPPLKAMKMIRDNLPPRLKNLHKVSPSLKGFLDRLLVRDPAQRATAAELLKHPFLA
370 380 390 400 410 420
430
pF1KSD KAGPPASIVPLMRQNRTR
::::::::::::::::::
CCDS33 KAGPPASIVPLMRQNRTR
430
>>CCDS12528.1 PAK4 gene_id:10298|Hs108|chr19 (591 aa)
initn: 2499 init1: 2499 opt: 2503 Z-score: 1212.7 bits: 234.0 E(32554): 3.2e-61
Smith-Waterman score: 2503; 90.3% identity (92.7% similar) in 424 aa overlap (15-438:173-591)
10 20 30 40
pF1KSD MFGKRKKRVEISAPSNFEHRVHTGFDQHEQKFTGLPRQWQSLIE
:. ..: .: : . .:: : .
CCDS12 EAGGGSGDRRRAGPEKRPKSSREGSGGPQESSRDKRPLSGPDVGTPQPAGLA----SGAK
150 160 170 180 190
50 60 70 80 90 100
pF1KSD ESARRPKPLVDPACITSIQPGAPKGEPHDVAPNGPSAGGLAIPQSSSSSSRPPTRARGAP
.: :: : . :: .::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LAAGRPFNTYPRADTDHPSRGA-QGEPHDVAPNGPSAGGLAIPQSSSSSSRPPTRARGAP
200 210 220 230 240 250
110 120 130 140 150 160
pF1KSD SPGVLGPHASEPQLAPPACTPAAPAVPGPPGPRSPQREPQRVSHEQFRAALQLVVDPGDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 SPGVLGPHASEPQLAPPACTPAAPAVPGPPGPRSPQREPQRVSHEQFRAALQLVVDPGDP
260 270 280 290 300 310
170 180 190 200 210 220
pF1KSD RSYLDNFIKIGEGSTGIVCIATVRSSGKLVAVKKMDLRKQQRRELLFNEVVIMRDYQHEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 RSYLDNFIKIGEGSTGIVCIATVRSSGKLVAVKKMDLRKQQRRELLFNEVVIMRDYQHEN
320 330 340 350 360 370
230 240 250 260 270 280
pF1KSD VVEMYNSYLVGDELWVVMEFLEGGALTDIVTHTRMNEEQIAAVCLAVLQALSVLHAQGVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 VVEMYNSYLVGDELWVVMEFLEGGALTDIVTHTRMNEEQIAAVCLAVLQALSVLHAQGVI
380 390 400 410 420 430
290 300 310 320 330 340
pF1KSD HRDIKSDSILLTHDGRVKLSDFGFCAQVSKEVPRRKSLVGTPYWMAPELISRLPYGPEVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 HRDIKSDSILLTHDGRVKLSDFGFCAQVSKEVPRRKSLVGTPYWMAPELISRLPYGPEVD
440 450 460 470 480 490
350 360 370 380 390 400
pF1KSD IWSLGIMVIEMVDGEPPYFNEPPLKAMKMIRDNLPPRLKNLHKVSPSLKGFLDRLLVRDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 IWSLGIMVIEMVDGEPPYFNEPPLKAMKMIRDNLPPRLKNLHKVSPSLKGFLDRLLVRDP
500 510 520 530 540 550
410 420 430
pF1KSD AQRATAAELLKHPFLAKAGPPASIVPLMRQNRTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 AQRATAAELLKHPFLAKAGPPASIVPLMRQNRTR
560 570 580 590
>>CCDS13107.1 PAK5 gene_id:57144|Hs108|chr20 (719 aa)
initn: 2085 init1: 1681 opt: 1730 Z-score: 844.5 bits: 166.1 E(32554): 1e-40
Smith-Waterman score: 1732; 65.6% identity (77.6% similar) in 425 aa overlap (23-436:302-717)
10 20 30 40 50
pF1KSD MFGKRKKRVEISAPSNFEHRVHTGFDQHEQKFTGLPRQWQSLIEESARRPKP
..: : : . . : : . ::
CCDS13 YLNQTSPQPTMRQRSRSGSGLQEPMMPFGASAFKTHPQGHSYNSYTYPRLSEPTMCIPKV
280 290 300 310 320 330
60 70 80 90 100
pF1KSD LVDPACITSIQPGAPKGEPHDVAPNGPSAGGLAIPQSSSSSSRPPTRARGAPS---PGVL
: : .. .: :. : ::. .:::.:.:. . .. :: ..:
CCDS13 DYDRAQMVL----SPPLSGSDTYPRGPAK----LPQSQSKSGYS-SSSHQYPSGYHKATL
340 350 360 370 380
110 120 130 140 150 160
pF1KSD GPHAS---EPQLAPPAC-----TPAAPAVPGPPGPRSPQREPQRVSHEQFRAALQLVVDP
: : : : . .. . : : : ...:.:::::::::::::::.:
CCDS13 YHHPSLQSSSQYISTASYLSSLSLSSSTYPPPSWGSSSDQQPSRVSHEQFRAALQLVVSP
390 400 410 420 430 440
170 180 190 200 210 220
pF1KSD GDPRSYLDNFIKIGEGSTGIVCIATVRSSGKLVAVKKMDLRKQQRRELLFNEVVIMRDYQ
:::: :: ::::::::::::::::: . .:: :::::::::::::::::::::::::::.
CCDS13 GDPREYLANFIKIGEGSTGIVCIATEKHTGKQVAVKKMDLRKQQRRELLFNEVVIMRDYH
450 460 470 480 490 500
230 240 250 260 270 280
pF1KSD HENVVEMYNSYLVGDELWVVMEFLEGGALTDIVTHTRMNEEQIAAVCLAVLQALSVLHAQ
:.:::.::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.::.::: :: :
CCDS13 HDNVVDMYSSYLVGDELWVVMEFLEGGALTDIVTHTRMNEEQIATVCLSVLRALSYLHNQ
510 520 530 540 550 560
290 300 310 320 330 340
pF1KSD GVIHRDIKSDSILLTHDGRVKLSDFGFCAQVSKEVPRRKSLVGTPYWMAPELISRLPYGP
::::::::::::::: :::.::::::::::::::::.::::::::::::::.:::::::
CCDS13 GVIHRDIKSDSILLTSDGRIKLSDFGFCAQVSKEVPKRKSLVGTPYWMAPEVISRLPYGT
570 580 590 600 610 620
350 360 370 380 390 400
pF1KSD EVDIWSLGIMVIEMVDGEPPYFNEPPLKAMKMIRDNLPPRLKNLHKVSPSLKGFLDRLLV
::::::::::::::.::::::::::::.::. :::.::::.:.::::: :.:::: .::
CCDS13 EVDIWSLGIMVIEMIDGEPPYFNEPPLQAMRRIRDSLPPRVKDLHKVSSVLRGFLDLMLV
630 640 650 660 670 680
410 420 430
pF1KSD RDPAQRATAAELLKHPFLAKAGPPASIVPLMRQNRTR
:.:.::::: ::: :::: ::::. ::::::: :
CCDS13 REPSQRATAQELLGHPFLKLAGPPSCIVPLMRQYRHH
690 700 710
>>CCDS10054.1 PAK6 gene_id:56924|Hs108|chr15 (681 aa)
initn: 1750 init1: 1487 opt: 1537 Z-score: 753.2 bits: 149.1 E(32554): 1.2e-35
Smith-Waterman score: 1550; 60.8% identity (76.9% similar) in 403 aa overlap (46-436:275-675)
20 30 40 50 60 70
pF1KSD NFEHRVHTGFDQHEQKFTGLPRQWQSLIEESARRPKPLVDPACITSIQPGAPKGEPHDVA
:. .: : . .:..: . : ::
CCDS10 GSPSPKTRESSLKRRLFRSMFLSTAATAPPSSSKPGPPPQSKPNSSFRPPQKDNPPSLVA
250 260 270 280 290 300
80 90 100 110 120
pF1KSD -----PNGPSAGGLAIPQSSSSSSRPPTRARGAPSPGVLGPHASEPQLAPPA--CTPAAP
:. .: .. : ..:..: : : ::. : : : : : .: . ..
CCDS10 KAQSLPSDQPVGTFS-PLTTSDTSSPQKSLRTAPATGQL-PGRSSPAGSPRTWHAQISTS
310 320 330 340 350 360
130 140 150 160 170 180
pF1KSD AVPGPPGPRSPQ-----REPQRVSHEQFRAALQLVVDPGDPRSYLDNFIKIGEGSTGIVC
. : : . .. :.::::.:::..::: :::: ::...:::::::::::
CCDS10 NLYLPQDPTVAKGALAGEDTGVVTHEQFKAALRMVVDQGDPRLLLDSYVKIGEGSTGIVC
370 380 390 400 410 420
190 200 210 220 230 240
pF1KSD IATVRSSGKLVAVKKMDLRKQQRRELLFNEVVIMRDYQHENVVEMYNSYLVGDELWVVME
.: . ::. :::: :::::::::::::::::::::::: ::::::.:::::.::::.::
CCDS10 LAREKHSGRQVAVKMMDLRKQQRRELLFNEVVIMRDYQHFNVVEMYKSYLVGEELWVLME
430 440 450 460 470 480
250 260 270 280 290 300
pF1KSD FLEGGALTDIVTHTRMNEEQIAAVCLAVLQALSVLHAQGVIHRDIKSDSILLTHDGRVKL
::.::::::::...:.::::::.:: ::::::. ::::::::::::::::::: ::::::
CCDS10 FLQGGALTDIVSQVRLNEEQIATVCEAVLQALAYLHAQGVIHRDIKSDSILLTLDGRVKL
490 500 510 520 530 540
310 320 330 340 350 360
pF1KSD SDFGFCAQVSKEVPRRKSLVGTPYWMAPELISRLPYGPEVDIWSLGIMVIEMVDGEPPYF
::::::::.::.::.::::::::::::::.::: :. ::::::::::::::::::::::
CCDS10 SDFGFCAQISKDVPKRKSLVGTPYWMAPEVISRSLYATEVDIWSLGIMVIEMVDGEPPYF
550 560 570 580 590 600
370 380 390 400 410 420
pF1KSD NEPPLKAMKMIRDNLPPRLKNLHKVSPSLKGFLDRLLVRDPAQRATAAELLKHPFLAKAG
.. :..::: .::. ::.::: ::::: :. ::.:.::::: .:::: ::: :::: ..:
CCDS10 SDSPVQAMKRLRDSPPPKLKNSHKVSPVLRDFLERMLVRDPQERATAQELLDHPFLLQTG
610 620 630 640 650 660
430
pF1KSD PPASIVPLMRQNRTR
: .:::.. :
CCDS10 LPECLVPLIQLYRKQTSTC
670 680
>>CCDS61590.1 PAK6 gene_id:56924|Hs108|chr15 (636 aa)
initn: 1458 init1: 1056 opt: 1099 Z-score: 545.6 bits: 110.6 E(32554): 4.5e-24
Smith-Waterman score: 1202; 52.4% identity (66.7% similar) in 403 aa overlap (46-436:275-630)
20 30 40 50 60 70
pF1KSD NFEHRVHTGFDQHEQKFTGLPRQWQSLIEESARRPKPLVDPACITSIQPGAPKGEPHDVA
:. .: : . .:..: . : ::
CCDS61 GSPSPKTRESSLKRRLFRSMFLSTAATAPPSSSKPGPPPQSKPNSSFRPPQKDNPPSLVA
250 260 270 280 290 300
80 90 100 110 120
pF1KSD -----PNGPSAGGLAIPQSSSSSSRPPTRARGAPSPGVLGPHASEPQLAPPA--CTPAAP
:. .: .. : ..:..: : : ::. : : : : : .: . ..
CCDS61 KAQSLPSDQPVGTFS-PLTTSDTSSPQKSLRTAPATGQL-PGRSSPAGSPRTWHAQISTS
310 320 330 340 350 360
130 140 150 160 170 180
pF1KSD AVPGPPGPRSPQ-----REPQRVSHEQFRAALQLVVDPGDPRSYLDNFIKIGEGSTGIVC
. : : . .. :.::::.:::..::: :::: ::...:::::::::::
CCDS61 NLYLPQDPTVAKGALAGEDTGVVTHEQFKAALRMVVDQGDPRLLLDSYVKIGEGSTGIVC
370 380 390 400 410 420
190 200 210 220 230 240
pF1KSD IATVRSSGKLVAVKKMDLRKQQRRELLFNEVVIMRDYQHENVVEMYNSYLVGDELWVVME
.: . ::. :::: :::::::::::::::::::::::: ::::::.:::::.::::.::
CCDS61 LAREKHSGRQVAVKMMDLRKQQRRELLFNEVVIMRDYQHFNVVEMYKSYLVGEELWVLME
430 440 450 460 470 480
250 260 270 280 290 300
pF1KSD FLEGGALTDIVTHTRMNEEQIAAVCLAVLQALSVLHAQGVIHRDIKSDSILLTHDGRVKL
::.::::::::...:.::::::.:: ::::::. ::::::::::::::::::: ::::::
CCDS61 FLQGGALTDIVSQVRLNEEQIATVCEAVLQALAYLHAQGVIHRDIKSDSILLTLDGRVKL
490 500 510 520 530 540
310 320 330 340 350 360
pF1KSD SDFGFCAQVSKEVPRRKSLVGTPYWMAPELISRLPYGPEVDIWSLGIMVIEMVDGEPPYF
::::::::.::.::.::::::::::::::.::: :. :
CCDS61 SDFGFCAQISKDVPKRKSLVGTPYWMAPEVISRSLYATE---------------------
550 560 570 580
370 380 390 400 410 420
pF1KSD NEPPLKAMKMIRDNLPPRLKNLHKVSPSLKGFLDRLLVRDPAQRATAAELLKHPFLAKAG
::: :. ::.:.::::: .:::: ::: :::: ..:
CCDS61 ------------------------VSPVLRDFLERMLVRDPQERATAQELLDHPFLLQTG
590 600 610
430
pF1KSD PPASIVPLMRQNRTR
: .:::.. :
CCDS61 LPECLVPLIQLYRKQTSTC
620 630
>>CCDS3321.1 PAK2 gene_id:5062|Hs108|chr3 (524 aa)
initn: 1240 init1: 1035 opt: 1088 Z-score: 541.5 bits: 109.6 E(32554): 7.7e-24
Smith-Waterman score: 1222; 43.0% identity (68.8% similar) in 458 aa overlap (4-432:67-513)
10 20 30
pF1KSD MFGKRKKRVEISAPSNFEHRVHTGFDQHEQKFT
:.:.: ::: ::.::: .:.::: .::
CCDS33 LKPLPSVPEEKKPRHKIISIFSGTEKGSKKKEKERPEISPPSDFEHTIHVGFDAVTGEFT
40 50 60 70 80 90
40 50 60 70 80
pF1KSD GLPRQWQSLIE-------ESARRPKPLVDPACITSIQPGAPKGEPHDVAPNGPSAGGLAI
:.:.:: :.. :. . :. ..: . . .. : . . .: : :.
CCDS33 GMPEQWARLLQTSNITKLEQKKNPQAVLD--VLKFYDSNTVKQKYLSFTP--PEKDGF--
100 110 120 130 140 150
90 100 110 120 130
pF1KSD PQSSSSSSRPPTRARGAPSPGVLGPHASEPQ-LAPPACTP------------AAPAVPGP
: :. : :.:. .:.:. . .. . :::. .: . ::.:
CCDS33 P-----SGTPALNAKGTEAPAVVTEEEDDDEETAPPVIAPRPDHTKSIYTRSVIDPVPAP
160 170 180 190 200
140 150 160 170 180
pF1KSD PGPR---------SPQREPQRVSHEQFRAALQLVVDPGDPRSYLDNFIKIGEGSTGIVCI
: . :.. ... :.. :. .:. :::.. . :::.:..: :
CCDS33 VGDSHVDGAAKSLDKQKKKTKMTDEEIMEKLRTIVSIGDPKKKYTRYEKIGQGASGTVFT
210 220 230 240 250 260
190 200 210 220 230 240
pF1KSD ATVRSSGKLVAVKKMDLRKQQRRELLFNEVVIMRDYQHENVVEMYNSYLVGDELWVVMEF
:: . :. ::.:...:.:: ..::..::...:.. .. :.:.. .::::::::.::::.
CCDS33 ATDVALGQEVAIKQINLQKQPKKELIINEILVMKELKNPNIVNFLDSYLVGDELFVVMEY
270 280 290 300 310 320
250 260 270 280 290 300
pF1KSD LEGGALTDIVTHTRMNEEQIAAVCLAVLQALSVLHAQGVIHRDIKSDSILLTHDGRVKLS
: ::.:::.::.: :.: :::::: :::: :::. :::::::::..:: .: :::.
CCDS33 LAGGSLTDVVTETCMDEAQIAAVCRECLQALEFLHANQVIHRDIKSDNVLLGMEGSVKLT
330 340 350 360 370 380
310 320 330 340 350 360
pF1KSD DFGFCAQVSKEVPRRKSLVGTPYWMAPELISRLPYGPEVDIWSLGIMVIEMVDGEPPYFN
:::::::.. : .:...::::::::::...: :::.:::::::::.::::.:::::.:
CCDS33 DFGFCAQITPEQSKRSTMVGTPYWMAPEVVTRKAYGPKVDIWSLGIMAIEMVEGEPPYLN
390 400 410 420 430 440
370 380 390 400 410 420
pF1KSD EPPLKAMKMIRDNLPPRLKNLHKVSPSLKGFLDRLLVRDPAQRATAAELLKHPFLAKAGP
: ::.:. .: : :.:.: .:.:: .. ::.: : : .:..: :::.:::: : :
CCDS33 ENPLRALYLIATNGTPELQNPEKLSPIFRDFLNRCLEMDVEKRGSAKELLQHPFLKLAKP
450 460 470 480 490 500
430
pF1KSD PASIVPLMRQNRTR
.:..::.
CCDS33 LSSLTPLIMAAKEAMKSNR
510 520
>>CCDS14554.1 PAK3 gene_id:5063|Hs108|chrX (544 aa)
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10 20 30
pF1KSD MFGKRKKRVEISAPSNFEHRVHTGFDQHEQKFTGLPRQW
::: ::.::: .:.::: .:::.:.::
CCDS14 PEEKNKKARLRSIFPGGGDKTNKKKEKERPEISLPSDFEHTIHVGFDAVTGEFTGIPEQW
40 50 60 70 80 90
40 50 60 70 80 90
pF1KSD QSLIE-------ESARRPKPLVDPACITSIQPGAPKGEPHDVAPNGPSAGGL--AIPQSS
:.. :. . :. ..: . . . . . . . . . :: : : :.:.
CCDS14 ARLLQTSNITKLEQKKNPQAVLDVLKFYDSKETVNNQKYMSFTSGDKSAHGYIAAHPSST
100 110 120 130 140 150
100 110 120 130
pF1KSD SSSSRPPT---------------RARGAPSPGVLGP---HASEPQLAPPACTPAAPAVPG
...:.:: . .. : : :..: :.. . . :.::::.
CCDS14 KTASEPPLAPPVSEEEDEEEEEEEDENEPPP-VIAPRPEHTKSIYTRSVVESIASPAVPN
160 170 180 190 200 210
140 150 160 170
pF1KSD ----PPGPRSP-----------QREPQRVSHEQFRAALQLVVDPGDPRSYLDNFIKIGEG
::. .. ::. .... :.. :. .:. :::.. : :::.:
CCDS14 KEVTPPSAENANSSTLYRNTDRQRKKSKMTDEEILEKLRSIVSVGDPKKKYTRFEKIGQG
220 230 240 250 260 270
180 190 200 210 220 230
pF1KSD STGIVCIATVRSSGKLVAVKKMDLRKQQRRELLFNEVVIMRDYQHENVVEMYNSYLVGDE
..: : : ..:. ::.:.:.:..: ..::..::...::. .. :.:.. .:::::::
CCDS14 ASGTVYTALDIATGQEVAIKQMNLQQQPKKELIINEILVMRENKNPNIVNYLDSYLVGDE
280 290 300 310 320 330
240 250 260 270 280 290
pF1KSD LWVVMEFLEGGALTDIVTHTRMNEEQIAAVCLAVLQALSVLHAQGVIHRDIKSDSILLTH
::::::.: ::.:::.::.: :.: :::::: ::::. ::.. :::::::::.:::
CCDS14 LWVVMEYLAGGSLTDVVTETCMDEGQIAAVCRECLQALDFLHSNQVIHRDIKSDNILLGM
340 350 360 370 380 390
300 310 320 330 340 350
pF1KSD DGRVKLSDFGFCAQVSKEVPRRKSLVGTPYWMAPELISRLPYGPEVDIWSLGIMVIEMVD
:: :::.:::::::.. : .:...::::::::::...: :::.:::::::::.::::.
CCDS14 DGSVKLTDFGFCAQITPEQSKRSTMVGTPYWMAPEVVTRKAYGPKVDIWSLGIMAIEMVE
400 410 420 430 440 450
360 370 380 390 400 410
pF1KSD GEPPYFNEPPLKAMKMIRDNLPPRLKNLHKVSPSLKGFLDRLLVRDPAQRATAAELLKHP
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CCDS14 GEPPYLNENPLRALYLIATNGTPELQNPERLSAVFRDFLNRCLEMDVDRRGSAKELLQHP
460 470 480 490 500 510
420 430
pF1KSD FLAKAGPPASIVPLMRQNRTR
:: : : .:..::.
CCDS14 FLKLAKPLSSLTPLIIAAKEAIKNSSR
520 530 540
>>CCDS48153.1 PAK3 gene_id:5063|Hs108|chrX (559 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KSD KRKKRVEISAPSNFEHRVHTGFDQHEQKFTGLPRQWQSLIE-------ESARRPKPLVDP
:.:.:: :.. :. . :. ..:
CCDS48 HTIHVGFDAVTGEFTPDLYGSQMCPGKLPEGIPEQWARLLQTSNITKLEQKKNPQAVLDV
80 90 100 110 120 130
60 70 80 90
pF1KSD ACITSIQPGAPKGEPHDVAPNGPSAGGL--AIPQSSSSSSRPPT---------------R
. . . . . . . . . :: : : :.:....:.:: .
CCDS48 LKFYDSKETVNNQKYMSFTSGDKSAHGYIAAHPSSTKTASEPPLAPPVSEEEDEEEEEEE
140 150 160 170 180 190
100 110 120 130 140
pF1KSD ARGAPSPGVLGP---HASEPQLAPPACTPAAPAVPG----PPGPRSP-----------QR
.. : : :..: :.. . . :.::::. ::. .. ::
CCDS48 DENEPPP-VIAPRPEHTKSIYTRSVVESIASPAVPNKEVTPPSAENANSSTLYRNTDRQR
200 210 220 230 240 250
150 160 170 180 190 200
pF1KSD EPQRVSHEQFRAALQLVVDPGDPRSYLDNFIKIGEGSTGIVCIATVRSSGKLVAVKKMDL
. .... :.. :. .:. :::.. : :::.:..: : : ..:. ::.:.:.:
CCDS48 KKSKMTDEEILEKLRSIVSVGDPKKKYTRFEKIGQGASGTVYTALDIATGQEVAIKQMNL
260 270 280 290 300 310
210 220 230 240 250 260
pF1KSD RKQQRRELLFNEVVIMRDYQHENVVEMYNSYLVGDELWVVMEFLEGGALTDIVTHTRMNE
..: ..::..::...::. .. :.:.. .:::::::::::::.: ::.:::.::.: :.:
CCDS48 QQQPKKELIINEILVMRENKNPNIVNYLDSYLVGDELWVVMEYLAGGSLTDVVTETCMDE
320 330 340 350 360 370
270 280 290 300 310 320
pF1KSD EQIAAVCLAVLQALSVLHAQGVIHRDIKSDSILLTHDGRVKLSDFGFCAQVSKEVPRRKS
:::::: ::::. ::.. :::::::::.::: :: :::.:::::::.. : .:..
CCDS48 GQIAAVCRECLQALDFLHSNQVIHRDIKSDNILLGMDGSVKLTDFGFCAQITPEQSKRST
380 390 400 410 420 430
330 340 350 360 370 380
pF1KSD LVGTPYWMAPELISRLPYGPEVDIWSLGIMVIEMVDGEPPYFNEPPLKAMKMIRDNLPPR
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CCDS48 MVGTPYWMAPEVVTRKAYGPKVDIWSLGIMAIEMVEGEPPYLNENPLRALYLIATNGTPE
440 450 460 470 480 490
390 400 410 420 430
pF1KSD LKNLHKVSPSLKGFLDRLLVRDPAQRATAAELLKHPFLAKAGPPASIVPLMRQNRTR
:.: ...: .. ::.: : : .:..: :::.:::: : : .:..::.
CCDS48 LQNPERLSAVFRDFLNRCLEMDVDRRGSAKELLQHPFLKLAKPLSSLTPLIIAAKEAIKN
500 510 520 530 540 550
CCDS48 SSR
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10 20 30 40
pF1KSD MFGKRKKRVEISAPSNFEHRVHTGFDQHEQKFTGLPRQWQS
..: . . : .. .: : :. :.:.::
CCDS48 KEKERPEISLPSDFEHTIHVGFDAVTGEFTNSPFQTSRPVTVASSQSEGKM-GIPEQWAR
70 80 90 100 110 120
50 60 70 80 90
pF1KSD LIE-------ESARRPKPLVDPACITSIQPGAPKGEPHDVAPNGPSAGGL--AIPQSSSS
:.. :. . :. ..: . . . . . . . . . :: : : :.:...
CCDS48 LLQTSNITKLEQKKNPQAVLDVLKFYDSKETVNNQKYMSFTSGDKSAHGYIAAHPSSTKT
130 140 150 160 170 180
100 110 120 130
pF1KSD SSRPPT---------------RARGAPSPGVLGP---HASEPQLAPPACTPAAPAVPG--
.:.:: . .. : : :..: :.. . . :.::::.
CCDS48 ASEPPLAPPVSEEEDEEEEEEEDENEPPP-VIAPRPEHTKSIYTRSVVESIASPAVPNKE
190 200 210 220 230 240
140 150 160 170
pF1KSD --PPGPRSP-----------QREPQRVSHEQFRAALQLVVDPGDPRSYLDNFIKIGEGST
::. .. ::. .... :.. :. .:. :::.. : :::.:..
CCDS48 VTPPSAENANSSTLYRNTDRQRKKSKMTDEEILEKLRSIVSVGDPKKKYTRFEKIGQGAS
250 260 270 280 290 300
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pF1KSD GIVCIATVRSSGKLVAVKKMDLRKQQRRELLFNEVVIMRDYQHENVVEMYNSYLVGDELW
: : : ..:. ::.:.:.:..: ..::..::...::. .. :.:.. .:::::::::
CCDS48 GTVYTALDIATGQEVAIKQMNLQQQPKKELIINEILVMRENKNPNIVNYLDSYLVGDELW
310 320 330 340 350 360
240 250 260 270 280 290
pF1KSD VVMEFLEGGALTDIVTHTRMNEEQIAAVCLAVLQALSVLHAQGVIHRDIKSDSILLTHDG
::::.: ::.:::.::.: :.: :::::: ::::. ::.. :::::::::.::: ::
CCDS48 VVMEYLAGGSLTDVVTETCMDEGQIAAVCRECLQALDFLHSNQVIHRDIKSDNILLGMDG
370 380 390 400 410 420
300 310 320 330 340 350
pF1KSD RVKLSDFGFCAQVSKEVPRRKSLVGTPYWMAPELISRLPYGPEVDIWSLGIMVIEMVDGE
:::.:::::::.. : .:...::::::::::...: :::.:::::::::.::::.::
CCDS48 SVKLTDFGFCAQITPEQSKRSTMVGTPYWMAPEVVTRKAYGPKVDIWSLGIMAIEMVEGE
430 440 450 460 470 480
360 370 380 390 400 410
pF1KSD PPYFNEPPLKAMKMIRDNLPPRLKNLHKVSPSLKGFLDRLLVRDPAQRATAAELLKHPFL
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CCDS48 PPYLNENPLRALYLIATNGTPELQNPERLSAVFRDFLNRCLEMDVDRRGSAKELLQHPFL
490 500 510 520 530 540
420 430
pF1KSD AKAGPPASIVPLMRQNRTR
: : .:..::.
CCDS48 KLAKPLSSLTPLIIAAKEAIKNSSR
550 560
>>CCDS48151.1 PAK3 gene_id:5063|Hs108|chrX (580 aa)
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Smith-Waterman score: 1110; 41.7% identity (68.3% similar) in 441 aa overlap (34-432:129-568)
10 20 30 40 50
pF1KSD KRKKRVEISAPSNFEHRVHTGFDQHEQKFTGLPRQWQSLIE-------ESARRPKPLVDP
:.:.:: :.. :. . :. ..:
CCDS48 SRPVTVASSQSEGKMPDLYGSQMCPGKLPEGIPEQWARLLQTSNITKLEQKKNPQAVLDV
100 110 120 130 140 150
60 70 80 90
pF1KSD ACITSIQPGAPKGEPHDVAPNGPSAGGL--AIPQSSSSSSRPPT---------------R
. . . . . . . . . :: : : :.:....:.:: .
CCDS48 LKFYDSKETVNNQKYMSFTSGDKSAHGYIAAHPSSTKTASEPPLAPPVSEEEDEEEEEEE
160 170 180 190 200 210
100 110 120 130 140
pF1KSD ARGAPSPGVLGP---HASEPQLAPPACTPAAPAVPG----PPGPRSP-----------QR
.. : : :..: :.. . . :.::::. ::. .. ::
CCDS48 DENEPPP-VIAPRPEHTKSIYTRSVVESIASPAVPNKEVTPPSAENANSSTLYRNTDRQR
220 230 240 250 260 270
150 160 170 180 190 200
pF1KSD EPQRVSHEQFRAALQLVVDPGDPRSYLDNFIKIGEGSTGIVCIATVRSSGKLVAVKKMDL
. .... :.. :. .:. :::.. : :::.:..: : : ..:. ::.:.:.:
CCDS48 KKSKMTDEEILEKLRSIVSVGDPKKKYTRFEKIGQGASGTVYTALDIATGQEVAIKQMNL
280 290 300 310 320 330
210 220 230 240 250 260
pF1KSD RKQQRRELLFNEVVIMRDYQHENVVEMYNSYLVGDELWVVMEFLEGGALTDIVTHTRMNE
..: ..::..::...::. .. :.:.. .:::::::::::::.: ::.:::.::.: :.:
CCDS48 QQQPKKELIINEILVMRENKNPNIVNYLDSYLVGDELWVVMEYLAGGSLTDVVTETCMDE
340 350 360 370 380 390
270 280 290 300 310 320
pF1KSD EQIAAVCLAVLQALSVLHAQGVIHRDIKSDSILLTHDGRVKLSDFGFCAQVSKEVPRRKS
:::::: ::::. ::.. :::::::::.::: :: :::.:::::::.. : .:..
CCDS48 GQIAAVCRECLQALDFLHSNQVIHRDIKSDNILLGMDGSVKLTDFGFCAQITPEQSKRST
400 410 420 430 440 450
330 340 350 360 370 380
pF1KSD LVGTPYWMAPELISRLPYGPEVDIWSLGIMVIEMVDGEPPYFNEPPLKAMKMIRDNLPPR
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CCDS48 MVGTPYWMAPEVVTRKAYGPKVDIWSLGIMAIEMVEGEPPYLNENPLRALYLIATNGTPE
460 470 480 490 500 510
390 400 410 420 430
pF1KSD LKNLHKVSPSLKGFLDRLLVRDPAQRATAAELLKHPFLAKAGPPASIVPLMRQNRTR
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CCDS48 LQNPERLSAVFRDFLNRCLEMDVDRRGSAKELLQHPFLKLAKPLSSLTPLIIAAKEAIKN
520 530 540 550 560 570
CCDS48 SSR
580
438 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 05:08:42 2016 done: Thu Nov 3 05:08:43 2016
Total Scan time: 3.120 Total Display time: 0.050
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]