Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA1130
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA1130, 542 aa
1>>>pF1KSDA1130 542 - 542 aa - 542 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4773+/-0.000865; mu= 17.8228+/- 0.052
mean_var=73.8378+/-14.999, 0's: 0 Z-trim(106.7): 32 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.149257
statistics sampled from 9113 (9144) to 9113 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.652), E-opt: 0.2 (0.281), width: 16
Scan time: 3.340
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS32107.1 GALNT16 gene_id:57452|Hs108|chr14 ( 558) 3489 760.9 0
CCDS58705.1 GALNT14 gene_id:79623|Hs108|chr2 ( 532) 1996 439.4 5.1e-123
CCDS1773.2 GALNT14 gene_id:79623|Hs108|chr2 ( 552) 1996 439.4 5.3e-123
CCDS58706.1 GALNT14 gene_id:79623|Hs108|chr2 ( 557) 1822 401.9 1e-111
CCDS1582.1 GALNT2 gene_id:2590|Hs108|chr1 ( 571) 1775 391.8 1.2e-108
CCDS5930.1 GALNT11 gene_id:63917|Hs108|chr7 ( 608) 1300 289.5 7.5e-78
CCDS2199.1 GALNT13 gene_id:114805|Hs108|chr2 ( 556) 1253 279.4 7.7e-75
CCDS77472.1 GALNT13 gene_id:114805|Hs108|chr2 ( 561) 1253 279.4 7.8e-75
CCDS4325.1 GALNT10 gene_id:55568|Hs108|chr5 ( 603) 1231 274.7 2.2e-73
CCDS11915.1 GALNT1 gene_id:2589|Hs108|chr18 ( 559) 1230 274.4 2.4e-73
CCDS34104.1 GALNTL6 gene_id:442117|Hs108|chr4 ( 601) 1218 271.9 1.5e-72
CCDS53817.1 GALNT4 gene_id:8693|Hs108|chr12 ( 578) 1204 268.8 1.2e-71
CCDS55860.1 GALNT4 gene_id:100528030|Hs108|chr12 ( 575) 1197 267.3 3.4e-71
CCDS6737.1 GALNT12 gene_id:79695|Hs108|chr9 ( 581) 1184 264.5 2.4e-70
CCDS8813.1 GALNT6 gene_id:11226|Hs108|chr12 ( 622) 1140 255.1 1.8e-67
CCDS2203.1 GALNT5 gene_id:11227|Hs108|chr2 ( 940) 1136 254.3 4.6e-67
CCDS2226.1 GALNT3 gene_id:2591|Hs108|chr2 ( 633) 1133 253.6 5.2e-67
CCDS81755.1 GALNT9 gene_id:50614|Hs108|chr12 ( 603) 1040 233.5 5.3e-61
CCDS5929.1 GALNTL5 gene_id:168391|Hs108|chr7 ( 443) 1005 225.9 7.6e-59
CCDS82742.1 GALNT15 gene_id:117248|Hs108|chr3 ( 617) 966 217.6 3.4e-56
CCDS33711.1 GALNT15 gene_id:117248|Hs108|chr3 ( 639) 966 217.6 3.5e-56
CCDS5540.1 WBSCR17 gene_id:64409|Hs108|chr7 ( 598) 955 215.2 1.7e-55
CCDS7807.1 GALNT18 gene_id:374378|Hs108|chr11 ( 607) 938 211.6 2.2e-54
CCDS3815.1 GALNT7 gene_id:51809|Hs108|chr4 ( 657) 751 171.3 3.1e-42
CCDS8533.1 GALNT8 gene_id:26290|Hs108|chr12 ( 637) 728 166.4 9.3e-41
CCDS41866.1 GALNT9 gene_id:50614|Hs108|chr12 ( 237) 335 81.5 1.2e-15
>>CCDS32107.1 GALNT16 gene_id:57452|Hs108|chr14 (558 aa)
initn: 3489 init1: 3489 opt: 3489 Z-score: 4059.2 bits: 760.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3489; 100.0% identity (100.0% similar) in 513 aa overlap (1-513:1-513)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MRKIRANAIAILTVAWILGTFYYLWQDNRAHAASSGGRGAQRAGRRSEQLREDRTIPLIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MRKIRANAIAILTVAWILGTFYYLWQDNRAHAASSGGRGAQRAGRRSEQLREDRTIPLIV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD TGTPSKGFDEKAYLSAKQLKAGEDPYRQHAFNQLESDKLSPDRPIRDTRHYSCPSVSYSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 TGTPSKGFDEKAYLSAKQLKAGEDPYRQHAFNQLESDKLSPDRPIRDTRHYSCPSVSYSS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD DLPATSVIITFHNEARSTLLRTVKSVLNRTPANLIQEIILVDDFSSDPEDCLLLTRIPKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DLPATSVIITFHNEARSTLLRTVKSVLNRTPANLIQEIILVDDFSSDPEDCLLLTRIPKV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD KCLRNDRREGLIRSRVRGADVAAATVLTFLDSHCEVNTEWLPPMLQRVKEDHTRVVSPII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KCLRNDRREGLIRSRVRGADVAAATVLTFLDSHCEVNTEWLPPMLQRVKEDHTRVVSPII
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD DVISLDNFAYLAASADLRGGFDWSLHFKWEQIPLEQKMTRTDPTRPIRTPVIAGGIFVID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DVISLDNFAYLAASADLRGGFDWSLHFKWEQIPLEQKMTRTDPTRPIRTPVIAGGIFVID
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD KSWFNHLGKYDAQMDIWGGENFELSFRVWMCGGSLEIVPCSRVGHVFRKRHPYNFPEGNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KSWFNHLGKYDAQMDIWGGENFELSFRVWMCGGSLEIVPCSRVGHVFRKRHPYNFPEGNA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD LTYIRNTKRTAEVWMDEYKQYYYEARPSAIGKAFGSVATRIEQRKKMNCKSFRWYLENVY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LTYIRNTKRTAEVWMDEYKQYYYEARPSAIGKAFGSVATRIEQRKKMNCKSFRWYLENVY
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD PELTVPVKEALPGIIKQGVNCLESQGQNTAGDFLLGMGICRGSAKNPQPAQAWLFSDHLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PELTVPVKEALPGIIKQGVNCLESQGQNTAGDFLLGMGICRGSAKNPQPAQAWLFSDHLI
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD QQQGKCLAATSTLMSSPGSPVILQMCNPREGKQVSLLASGPEAQQPEGPCLRVADLGRRA
:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 QQQGKCLAATSTLMSSPGSPVILQMCNPREGKQKWRRKGSFIQHSVSGLCLETKPAQLVT
490 500 510 520 530 540
pF1KSD PD
CCDS32 SKCQADAQAQQWQLLPHT
550
>>CCDS58705.1 GALNT14 gene_id:79623|Hs108|chr2 (532 aa)
initn: 1971 init1: 1868 opt: 1996 Z-score: 2322.0 bits: 439.4 E(32554): 5.1e-123
Smith-Waterman score: 1996; 61.6% identity (83.0% similar) in 448 aa overlap (68-513:36-480)
40 50 60 70 80 90
pF1KSD RGAQRAGRRSEQLREDRTIPLIVTGTPSKGFDEKAYLSAKQLKAGEDPYRQHAFNQLESD
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CCDS58 SLARSSVPFADSGLSSSQPSDADWDDLWDQFDERRYLNAKKWRVGDDPYKLYAFNQRESE
10 20 30 40 50 60
100 110 120 130 140 150
pF1KSD KLSPDRPIRDTRHYSCPSVSYSSDLPATSVIITFHNEARSTLLRTVKSVLNRTPANLIQE
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CCDS58 RISSNRAIPDTRHLRCTLLVYCTDLPPTSIIITFHNEARSTLLRTIRSVLNRTPTHLIRE
70 80 90 100 110 120
160 170 180 190 200 210
pF1KSD IILVDDFSSDPEDCLLLTRIPKVKCLRNDRREGLIRSRVRGADVAAATVLTFLDSHCEVN
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CCDS58 IILVDDFSNDPDDCKQLIKLPKVKCLRNNERQGLVRSRIRGADIAQGTTLTFLDSHCEVN
130 140 150 160 170 180
220 230 240 250 260 270
pF1KSD TEWLPPMLQRVKEDHTRVVSPIIDVISLDNFAYLAASADLRGGFDWSLHFKWEQIPLEQK
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CCDS58 RDWLQPLLHRVKEDYTRVVCPVIDIINLDTFTYIESASELRGGFDWSLHFQWEQLSPEQK
190 200 210 220 230 240
280 290 300 310 320 330
pF1KSD MTRTDPTRPIRTPVIAGGIFVIDKSWFNHLGKYDAQMDIWGGENFELSFRVWMCGGSLEI
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CCDS58 ARRLDPTEPIRTPIIAGGLFVIDKAWFDYLGKYDMDMDIWGGENFEISFRVWMCGGSLEI
250 260 270 280 290 300
340 350 360 370 380 390
pF1KSD VPCSRVGHVFRKRHPYNFPEGNALTYIRNTKRTAEVWMDEYKQYYYEARPSAIGKAFGSV
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CCDS58 VPCSRVGHVFRKKHPYVFPDGNANTYIKNTKRTAEVWMDEYKQYYYAARPFALERPFGNV
310 320 330 340 350 360
400 410 420 430 440 450
pF1KSD ATRIEQRKKMNCKSFRWYLENVYPELTVPVKEALP-GIIKQGVNCLESQGQNTAGDFLLG
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CCDS58 ESRLDLRKNLRCQSFKWYLENIYPELSIPKESSIQKGNIRQRQKCLESQRQNNQETPNLK
370 380 390 400 410 420
460 470 480 490 500 510
pF1KSD MGICRGSAKNPQPAQAWLFS-DHLIQQQGKCLAATSTLMSSPGSPVILQMCNPREGKQVS
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CCDS58 LSPCAKVKGEDAKSQVWAFTYTQQILQEELCLSVITLF---PGAPVVLVLCKNGDDRQQW
430 440 450 460 470 480
520 530 540
pF1KSD LLASGPEAQQPEGPCLRVADLGRRAPD
CCDS58 TKTGSHIEHIASHLCLDTDMFGDGTENGKEIVVNPCESSLMSQHWDMVSS
490 500 510 520 530
>>CCDS1773.2 GALNT14 gene_id:79623|Hs108|chr2 (552 aa)
initn: 1971 init1: 1868 opt: 1996 Z-score: 2321.8 bits: 439.4 E(32554): 5.3e-123
Smith-Waterman score: 1996; 61.6% identity (83.0% similar) in 448 aa overlap (68-513:56-500)
40 50 60 70 80 90
pF1KSD RGAQRAGRRSEQLREDRTIPLIVTGTPSKGFDEKAYLSAKQLKAGEDPYRQHAFNQLESD
:::. ::.::. ..:.:::. .:::: ::.
CCDS17 VTKRKLEVPTGPEVQTPKPSDADWDDLWDQFDERRYLNAKKWRVGDDPYKLYAFNQRESE
30 40 50 60 70 80
100 110 120 130 140 150
pF1KSD KLSPDRPIRDTRHYSCPSVSYSSDLPATSVIITFHNEARSTLLRTVKSVLNRTPANLIQE
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CCDS17 RISSNRAIPDTRHLRCTLLVYCTDLPPTSIIITFHNEARSTLLRTIRSVLNRTPTHLIRE
90 100 110 120 130 140
160 170 180 190 200 210
pF1KSD IILVDDFSSDPEDCLLLTRIPKVKCLRNDRREGLIRSRVRGADVAAATVLTFLDSHCEVN
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CCDS17 IILVDDFSNDPDDCKQLIKLPKVKCLRNNERQGLVRSRIRGADIAQGTTLTFLDSHCEVN
150 160 170 180 190 200
220 230 240 250 260 270
pF1KSD TEWLPPMLQRVKEDHTRVVSPIIDVISLDNFAYLAASADLRGGFDWSLHFKWEQIPLEQK
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CCDS17 RDWLQPLLHRVKEDYTRVVCPVIDIINLDTFTYIESASELRGGFDWSLHFQWEQLSPEQK
210 220 230 240 250 260
280 290 300 310 320 330
pF1KSD MTRTDPTRPIRTPVIAGGIFVIDKSWFNHLGKYDAQMDIWGGENFELSFRVWMCGGSLEI
: :::.:::::.::::.:::::.::..::::: .::::::::::.:::::::::::::
CCDS17 ARRLDPTEPIRTPIIAGGLFVIDKAWFDYLGKYDMDMDIWGGENFEISFRVWMCGGSLEI
270 280 290 300 310 320
340 350 360 370 380 390
pF1KSD VPCSRVGHVFRKRHPYNFPEGNALTYIRNTKRTAEVWMDEYKQYYYEARPSAIGKAFGSV
::::::::::::.::: ::.::: :::.:::::::::::::::::: ::: :. . ::.:
CCDS17 VPCSRVGHVFRKKHPYVFPDGNANTYIKNTKRTAEVWMDEYKQYYYAARPFALERPFGNV
330 340 350 360 370 380
400 410 420 430 440 450
pF1KSD ATRIEQRKKMNCKSFRWYLENVYPELTVPVKEALP-GIIKQGVNCLESQGQNTAGDFLLG
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CCDS17 ESRLDLRKNLRCQSFKWYLENIYPELSIPKESSIQKGNIRQRQKCLESQRQNNQETPNLK
390 400 410 420 430 440
460 470 480 490 500 510
pF1KSD MGICRGSAKNPQPAQAWLFS-DHLIQQQGKCLAATSTLMSSPGSPVILQMCNPREGKQVS
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CCDS17 LSPCAKVKGEDAKSQVWAFTYTQQILQEELCLSVITLF---PGAPVVLVLCKNGDDRQQW
450 460 470 480 490 500
520 530 540
pF1KSD LLASGPEAQQPEGPCLRVADLGRRAPD
CCDS17 TKTGSHIEHIASHLCLDTDMFGDGTENGKEIVVNPCESSLMSQHWDMVSS
510 520 530 540 550
>>CCDS58706.1 GALNT14 gene_id:79623|Hs108|chr2 (557 aa)
initn: 1804 init1: 1677 opt: 1822 Z-score: 2119.2 bits: 401.9 E(32554): 1e-111
Smith-Waterman score: 1822; 62.5% identity (83.4% similar) in 403 aa overlap (113-513:106-505)
90 100 110 120 130 140
pF1KSD EDPYRQHAFNQLESDKLSPDRPIRDTRHYSCPSVSYSSDLPATSVIITFHNEARSTLLRT
: . : .::: ::.:::::::::::::::
CCDS58 TGGHLAVCHFPCLLQEAQFHLQTQVFLQVRCTLLVYCTDLPPTSIIITFHNEARSTLLRT
80 90 100 110 120 130
150 160 170 180 190 200
pF1KSD VKSVLNRTPANLIQEIILVDDFSSDPEDCLLLTRIPKVKCLRNDRREGLIRSRVRGADVA
..:::::::..::.:::::::::.::.:: : ..::::::::..:.::.:::.::::.:
CCDS58 IRSVLNRTPTHLIREIILVDDFSNDPDDCKQLIKLPKVKCLRNNERQGLVRSRIRGADIA
140 150 160 170 180 190
210 220 230 240 250 260
pF1KSD AATVLTFLDSHCEVNTEWLPPMLQRVKEDHTRVVSPIIDVISLDNFAYLAASADLRGGFD
.:.::::::::::: .:: :.:.:::::.:::: :.::.:.::.:.:. ....::::::
CCDS58 QGTTLTFLDSHCEVNRDWLQPLLHRVKEDYTRVVCPVIDIINLDTFTYIESASELRGGFD
200 210 220 230 240 250
270 280 290 300 310 320
pF1KSD WSLHFKWEQIPLEQKMTRTDPTRPIRTPVIAGGIFVIDKSWFNHLGKYDAQMDIWGGENF
:::::.:::. ::: : :::.:::::.::::.:::::.::..::::: .:::::::::
CCDS58 WSLHFQWEQLSPEQKARRLDPTEPIRTPIIAGGLFVIDKAWFDYLGKYDMDMDIWGGENF
260 270 280 290 300 310
330 340 350 360 370 380
pF1KSD ELSFRVWMCGGSLEIVPCSRVGHVFRKRHPYNFPEGNALTYIRNTKRTAEVWMDEYKQYY
:.:::::::::::::::::::::::::.::: ::.::: :::.:::::::::::::::::
CCDS58 EISFRVWMCGGSLEIVPCSRVGHVFRKKHPYVFPDGNANTYIKNTKRTAEVWMDEYKQYY
320 330 340 350 360 370
390 400 410 420 430 440
pF1KSD YEARPSAIGKAFGSVATRIEQRKKMNCKSFRWYLENVYPELTVPVKEALP-GIIKQGVNC
: ::: :. . ::.: .:.. ::.. :.::.:::::.::::..: . .. : :.: .:
CCDS58 YAARPFALERPFGNVESRLDLRKNLRCQSFKWYLENIYPELSIPKESSIQKGNIRQRQKC
380 390 400 410 420 430
450 460 470 480 490 500
pF1KSD LESQGQNTAGDFLLGMGICRGSAKNPQPAQAWLFS-DHLIQQQGKCLAATSTLMSSPGSP
:::: ::. : .. : . .:.: :. . : :. ::.. . . ::.:
CCDS58 LESQRQNNQETPNLKLSPCAKVKGEDAKSQVWAFTYTQQILQEELCLSVITLF---PGAP
440 450 460 470 480 490
510 520 530 540
pF1KSD VILQMCNPREGKQVSLLASGPEAQQPEGPCLRVADLGRRAPD
:.: .:. . .:
CCDS58 VVLVLCKNGDDRQQWTKTGSHIEHIASHLCLDTDMFGDGTENGKEIVVNPCESSLMSQHW
500 510 520 530 540 550
>>CCDS1582.1 GALNT2 gene_id:2590|Hs108|chr1 (571 aa)
initn: 1067 init1: 921 opt: 1775 Z-score: 2064.4 bits: 391.8 E(32554): 1.2e-108
Smith-Waterman score: 1807; 51.5% identity (76.6% similar) in 530 aa overlap (1-513:1-520)
10 20 30 40 50
pF1KSD MRKIRANAIAILTVAWILGTFYYLWQDNRAHAASSGGRGAQRAGRRSE--QLRE------
::. :. . .. :.:: ::... . . :...: :: : .: ...
CCDS15 MRR-RSRMLLCFAFLWVLGIAYYMYSGGGSALAGGAGGGAGRKEDWNEIDPIKKKDLHHS
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100
pF1KSD --DRTIPLIVTGTPSK----GFDEKAYLSAKQLKAGEDPYRQHAFNQLESDKLSPDRPIR
.. . : :.: :...::... ....:.::: .. :::.::::: :: :
CCDS15 NGEEKAQSMETLPPGKVRWPDFNQEAYVGGTMVRSGQDPYARNKFNQVESDKLRMDRAIP
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KSD DTRHYSCPSVSYSSDLPATSVIITFHNEARSTLLRTVKSVLNRTPANLIQEIILVDDFSS
:::: .: .. :::::::.:::::::::.::::: :::...: .::.:::::::.:.
CCDS15 DTRHDQCQRKQWRVDLPATSVVITFHNEARSALLRTVVSVLKKSPPHLIKEIILVDDYSN
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KSD DPEDCLLLTRIPKVKCLRNDRREGLIRSRVRGADVAAATVLTFLDSHCEVNTEWLPPMLQ
:::: :: .: ::. :::::::::.::::::::.: : :::::::::: : .:: :.:.
CCDS15 DPEDGALLGKIEKVRVLRNDRREGLMRSRVRGADAAQAKVLTFLDSHCECNEHWLEPLLE
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KSD RVKEDHTRVVSPIIDVISLDNFAYLAASADLRGGFDWSLHFKWEQIPLEQKMTRT-DPTR
:: ::.:::::::::::..::: :..:::::.:::::.: :::. . ::. .: .:.
CCDS15 RVAEDRTRVVSPIIDVINMDNFQYVGASADLKGGFDWNLVFKWDYMTPEQRRSRQGNPVA
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KSD PIRTPVIAGGIFVIDKSWFNHLGKYDAQMDIWGGENFELSFRVWMCGGSLEIVPCSRVGH
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CCDS15 PIKTPMIAGGLFVMDKFYFEELGKYDMMMDVWGGENLEISFRVWQCGGSLEIIPCSRVGH
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KSD VFRKRHPYNFPEGNALTYIRNTKRTAEVWMDEYKQYYYEARPSAIGKAFGSVATRIEQRK
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CCDS15 VFRKQHPYTFPGGSGTVFARNTRRAAEVWMDEYKNFYYAAVPSARNVPYGNIQSRLELRK
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KSD KMNCKSFRWYLENVYPELTVPVKEALP-GIIKQGVNCLESQGQNTAGDFLLGMGICRGSA
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CCDS15 KLSCKPFKWYLENVYPELRVPDHQDIAFGALQQGTNCLDTLGHFADG--VVGVYECHNAG
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470 480 490 500 510 520
pF1KSD KNPQPAQAW-LFSDHLIQQQGKCLAATSTLMSSPGSPVILQMCNPREGKQVSLLASGPEA
: : : : ... .... ::.... .::: . :: : ...:
CCDS15 GN----QEWALTKEKSVKHMDLCLTVVDR---APGSLIKLQGCRENDSRQKWEQIEGNSK
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530 540
pF1KSD QQPEGPCLRVADLGRRAPD
CCDS15 LRHVGSNLCLDSRTAKSGGLSVEVCGPALSQQWKFTLNLQQ
540 550 560 570
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: ::::.::.: :.::: :.:::::.::..::::.:..::::::: .:: .:
CCDS59 KFYPPDLPAASVVICFYNEAFSALLRTVHSVIDRTPAHLLHEIILVDD-DSDFDDLKGEL
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180 190 200 210 220
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CCDS59 DEYVQKYLPGKIKVIRNTKREGLIRGRMIGAAHATGEVLVFLDSHCEVNVMWLQPLLAAI
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CCDS59 REDRHTVVCPVIDIISADTLAY-SSSPVVRGGFNWGLHFKWDLVPLSELGRAEGATAPIK
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290 300 310 320 330 340
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CCDS59 SPTMAGGLFAMNRQYFHELGQYDSGMDIWGGENLEISFRIWMCGGKLFIIPCSRVGHIFR
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350 360 370 380 390 400
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CCDS59 KRRPYGSPEGQD-TMTHNSLRLAHVWLDEYKEQYFSLRPDLKTKSYGNISERVELRKKLG
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410 420 430 440
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CCDS59 CKSFKWYLDNVYPEMQISGSHAKPQQPIFVNRGPKRPKVLQRGRLYHLQTNKCLVAQGRP
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450 460 470 480 490 500
pF1KSD TAGDFLLGMGICRGSAKNPQPAQAWLFSDH--LIQQQGKCLAATSTLMSSPGSPVILQMC
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CCDS59 SQKGGLVVLKACDYS----DPNQIWIYNEEHELVLNSLLCLDMSETRSSDP--PRLMK-C
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510 520 530 540
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. :.: .... . : : :::..: ::..
CCDS59 HGSGGSQQWTFGKNNRLYQVSVGQCLRAVDPLGQKGSVAMAICDGSSSQQWHLEG
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. .. .: .: . : . ..: : :
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: : : : : : .. . :: . :: .. .: . :.: .: . : ..:: :::.:
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CCDS21 VFHNEAWSTLLRTVYSVINRSPHYLLSEVILVDDAS--ERDFLKLTLENYVKNLEVP-VK
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::: :.: :.:.: :::.:.:.:.: .: ...: : : : :.:::..:::.: :
CCDS21 VISDDTFEYMAGSDMTYGGFNWKLNFRWYPVP-QREMDRRKGDRTLPVRTPTMAGGLFSI
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pF1KSD DKSWFNHLGKYDAQMDIWGGENFELSFRVWMCGGSLEIVPCSRVGHVFRKRHPYNFPEGN
:...:...: ::: ::::::::.:.:::.:.:::::::: ::.::::::: ::.:: :.
CCDS21 DRNYFEEIGTYDAGMDIWGGENLEMSFRIWQCGGSLEIVTCSHVGHVFRKATPYTFPGGT
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CCDS21 GHVINKNNRRLAEVWMDEFKDFFYIISPGVVKVDYGDVSVRKTLRENLKCKPFSWYLENI
360 370 380 390 400 410
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CCDS21 YPDSQIPRRYYSLGEIRNVETNQCLDNMGRKE--NEKVGIFNCHGMGGN----QVFSYTA
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CCDS21 DKEIRTDDLCLD-----VSRLNGPVIMLKCHHMRGNQLWEYDAERLTLRHVNSNQCLDEP
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540
pF1KSD GRRAPD
CCDS21 SEEDKMVPTMQDCSGSRSQQWLLRNMTLGT
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CCDS77 AVLIPKDDQEKMKEL-FKINQFNLMASDLIALNRSLPDVRLEGCKTKVYPDELPNTSVVI
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pF1KSD TFHNEARSTLLRTVKSVLNRTPANLIQEIILVDDFSSDPEDCLLLT--------RIPKVK
.::::: ::::::: ::.::.: :..:.::::: : .: : :: ..: ::
CCDS77 VFHNEAWSTLLRTVYSVINRSPHYLLSEVILVDDAS--ERDFLKLTLENYVKNLEVP-VK
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.: ..: ::::.:.::: .. . :.::::.::: . :: :.: :.:::. :: ::::
CCDS77 IIRMEERSGLIRARLRGAAASKGQVITFLDAHCECTLGWLEPLLARIKEDRKTVVCPIID
180 190 200 210 220 230
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pF1KSD VISLDNFAYLAASADLRGGFDWSLHFKWEQIPLEQKMTRT--DPTRPIRTPVIAGGIFVI
::: :.: :.:.: :::.:.:.:.: .: ...: : : : :.:::..:::.: :
CCDS77 VISDDTFEYMAGSDMTYGGFNWKLNFRWYPVP-QREMDRRKGDRTLPVRTPTMAGGLFSI
240 250 260 270 280 290
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:...:...: ::: ::::::::.:.:::.:.:::::::: ::.::::::: ::.:: :.
CCDS77 DRNYFEEIGTYDAGMDIWGGENLEMSFRIWQCGGSLEIVTCSHVGHVFRKATPYTFPGGT
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CCDS77 GHVINKNNRRLAEVWMDEFKDFFYIISPGVVKVDYGDVSVRKTLRENLKCKPFSWYLENI
360 370 380 390 400 410
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::. .: . : :. . .::...:.. . .:. :.: . : :.. ..
CCDS77 YPDSQIPRRYYSLGEIRNVETNQCLDNMGRKE--NEKVGIFNCHGMGGN----QVFSYTA
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:. :. . :: .: ..:::. :. .:.:.
CCDS77 DKEIRTDDLCLD-----VSRLNGPVIMLKCHHMRGNQLWEYDAESCLSVNKVADGSQHPT
480 490 500 510 520
540
pF1KSD GRRAPD
CCDS77 VETCNDSTLQKWLLRNYTRMEIFRNIFGNSTDYIL
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.:. .. : : . .: . .:... ::. :: :...:: :
CCDS43 KKTF-FLGDGQKLKDWHDKEAIRRDAQRVGNGEQGRPYPMTDAERVDQAYRENGFNIYVS
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pF1KSD DKLSPDRPIRDTRHYSCPSVSYSSDLPATSVIITFHNEARSTLLRTVKSVLNRTPANLIQ
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CCDS43 DKISLNRSLPDIRHPNCNSKRYLETLPNTSIIIPFHNEGWSSLLRTVHSVLNRSPPELVA
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::.::::::. : :: . : .:.:. ::. .::::::.:. ::.::.. :.:::
CCDS43 EIVLVDDFSDREHLKKPLEDYMAL--FPSVRILRTKKREGLIRTRMLGASVATGDVITFL
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CCDS43 DSHCEANVNWLPPLLDRIARNRKTIVCPMIDVIDHDDFRYETQAGDAMRGAFDWEMYYK-
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CCDS43 -RIPIPPELQKADPSDPFESPVMAGGLFAVDRKWFWELGGYDPGLEIWGGEQYEISFKVW
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CCDS43 MCGGRMEDIPCSRVGHIYRKYVPYKVPAGVSLA--RNLKRVAEVWMDEYAEYIYQRRPEY
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. :.::.. . :...:::::.:.. .. :.. ::. : : :.. :.. :
CCDS43 RHLSAGDVAVQKKLRSSLNCKSFKWFMTKIAWDLPKFYPPVEPPAAAWGEIRNVGTGLCA
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pF1KSD ESQGQNTAGDFLLGMGICRGSAKNP-QPAQAWLFSDHLIQQQGKCLAATSTLMS--SPGS
... ... :. : : :: .. . :.. :. . . : . . .. : :
CCDS43 DTK-HGALGSPLRLEGCVRGRGEAAWNNMQVFTFTWREDIRPGDPQHTKKFCFDAISHTS
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pF1KSD PVILQMCNPREGKQVSLLASGPEAQQP-EGPCLRVADLGRRAPD
:: : :. .:.:. . .: : :. .. .:
CCDS43 PVTLYDCHSMKGNQLWKYRKDKTLYHPVSGSCMDCSESDHRIFMNTCNPSSLTQQWLFEH
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CCDS43 TNSTVLEKFNRN
600
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CCDS11 MRKFAYCKVVLATSLIWVLLDMFLLLYFSECNKCDEKKERGLPAGDVLEPVQKPHEGPGE
10 20 30 40 50 60
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pF1KSD VTGTPSKGFDEKAYLSAKQLKAGEDPYRQHAFNQLESDKLSPDRPIRDTRHYSCPSVSYS
. : : . . .. . .. .. . :: . :. .. .: . :.: .: . :
CCDS11 M-GKP-------VVIPKEDQEKMKEMFKINQFNLMASEMIALNRSLPDVRLEGCKTKVYP
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pF1KSD SDLPATSVIITFHNEARSTLLRTVKSVLNRTPANLIQEIILVDD-----FSSDP-EDCLL
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CCDS11 DNLPTTSVVIVFHNEAWSTLLRTVHSVINRSPRHMIEEIVLVDDASERDFLKRPLESYVK
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pF1KSD LTRIPKVKCLRNDRREGLIRSRVRGADVAAATVLTFLDSHCEVNTEWLPPMLQRVKEDHT
..: :. .: ..: ::::.:..:: :. . :.::::.::: .. :: :.: :.:.:.
CCDS11 KLKVP-VHVIRMEQRSGLIRARLKGAAVSKGQVITFLDAHCECTVGWLEPLLARIKHDRR
180 190 200 210 220 230
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pF1KSD RVVSPIIDVISLDNFAYLAASADLRGGFDWSLHFKWEQIPLEQKMTRT--DPTRPIRTPV
:: ::::::: :.: :.:.: :::.:.:.:.: .: ...: : : : :.:::.
CCDS11 TVVCPIIDVISDDTFEYMAGSDMTYGGFNWKLNFRWYPVP-QREMDRRKGDRTLPVRTPT
240 250 260 270 280 290
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pF1KSD IAGGIFVIDKSWFNHLGKYDAQMDIWGGENFELSFRVWMCGGSLEIVPCSRVGHVFRKRH
.:::.: ::...:...: ::: ::::::::.:.:::.:.:::.:::: ::.:::::::
CCDS11 MAGGLFSIDRDYFQEIGTYDAGMDIWGGENLEISFRIWQCGGTLEIVTCSHVGHVFRKAT
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KSD PYNFPEGNALTYIRNTKRTAEVWMDEYKQYYYEARPSAIGKAFGSVATRIEQRKKMNCKS
::.:: :.. .:..: :::::::.:...: :.. .:....:. :.:..::
CCDS11 PYTFPGGTGQIINKNNRRLAEVWMDEFKNFFYIISPGVTKVDYGDISSRVGLRHKLQCKP
360 370 380 390 400 410
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pF1KSD FRWYLENVYPELTVPVKEALPGIIK--QGVNCLESQGQNTAGDFLLGMGICRGSAKNPQP
: :::::.::. .: . : :. . .::...... . .:. :.: . :
CCDS11 FSWYLENIYPDSQIPRHYFSLGEIRNVETNQCLDNMARKE--NEKVGIFNCHGMGGN---
420 430 440 450 460
470 480 490 500 510 520
pF1KSD AQAWLFS-DHLIQQQGKCLAATSTLMSSPGSPVILQMCNPREGKQVSLLASGPEAQQPEG
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CCDS11 -QVFSYTANKEIRTDDLCLD-----VSKLNGPVTMLKCHHLKGNQLWEYDPVKLTLQHVN
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