Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA1129
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA1129, 587 aa
1>>>pF1KSDA1129 587 - 587 aa - 587 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8063+/-0.00112; mu= 15.5591+/- 0.067
mean_var=70.7880+/-14.480, 0's: 0 Z-trim(101.6): 172 B-trim: 246 in 1/49
Lambda= 0.152438
statistics sampled from 6409 (6592) to 6409 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.562), E-opt: 0.2 (0.202), width: 16
Scan time: 3.300
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS4192.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5 ( 587) 3878 862.8 0
CCDS58970.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5 ( 555) 3677 818.6 0
CCDS58969.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5 ( 505) 3343 745.1 4.7e-215
CCDS34094.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4 ( 593) 3078 686.9 1.9e-197
CCDS54815.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4 ( 597) 3078 686.9 1.9e-197
CCDS54816.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4 ( 505) 2758 616.5 2.5e-176
CCDS82974.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4 ( 496) 2587 578.9 5.2e-165
CCDS82975.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4 ( 427) 2346 525.9 4.1e-149
CCDS30550.1 KLHL17 gene_id:339451|Hs108|chr1 ( 642) 1753 395.5 1.1e-109
CCDS1310.1 KLHL20 gene_id:27252|Hs108|chr1 ( 609) 1606 363.2 5.5e-100
CCDS54756.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4 ( 568) 1513 342.7 7.4e-94
CCDS33975.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4 ( 709) 1513 342.7 9e-94
CCDS33974.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4 ( 755) 1513 342.8 9.6e-94
CCDS1429.1 KLHL12 gene_id:59349|Hs108|chr1 ( 568) 1505 340.9 2.5e-93
CCDS9445.1 KLHL1 gene_id:57626|Hs108|chr13 ( 748) 1467 332.6 1.1e-90
CCDS33749.1 KLHL18 gene_id:23276|Hs108|chr3 ( 574) 1426 323.6 4.3e-88
CCDS3449.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4 ( 694) 1416 321.4 2.3e-87
CCDS14457.1 KLHL4 gene_id:56062|Hs108|chrX ( 718) 1406 319.2 1.1e-86
CCDS73582.1 KLHL1 gene_id:57626|Hs108|chr13 ( 687) 1391 315.9 1e-85
CCDS14456.1 KLHL4 gene_id:56062|Hs108|chrX ( 720) 1387 315.0 2e-85
CCDS76675.1 KLHL28 gene_id:54813|Hs108|chr14 ( 585) 1342 305.1 1.6e-82
CCDS9680.1 KLHL28 gene_id:54813|Hs108|chr14 ( 571) 1338 304.2 2.9e-82
CCDS3617.1 KLHL8 gene_id:57563|Hs108|chr4 ( 620) 1313 298.7 1.4e-80
CCDS12239.1 KEAP1 gene_id:9817|Hs108|chr19 ( 624) 1204 274.8 2.3e-73
CCDS77937.1 KLHL8 gene_id:57563|Hs108|chr4 ( 544) 1093 250.3 4.6e-66
CCDS34609.1 KLHL7 gene_id:55975|Hs108|chr7 ( 586) 1078 247.0 4.8e-65
CCDS54335.1 KLHL29 gene_id:114818|Hs108|chr2 ( 875) 1017 233.7 7.5e-61
CCDS5378.2 KLHL7 gene_id:55975|Hs108|chr7 ( 538) 1010 232.1 1.4e-60
CCDS3246.1 KLHL24 gene_id:54800|Hs108|chr3 ( 600) 1006 231.2 2.9e-60
CCDS10339.1 KLHL25 gene_id:64410|Hs108|chr15 ( 589) 928 214.1 4.1e-55
CCDS55479.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX ( 613) 909 209.9 7.7e-54
CCDS55481.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX ( 639) 909 209.9 8e-54
CCDS14571.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX ( 655) 909 209.9 8.2e-54
CCDS55480.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX ( 658) 909 209.9 8.2e-54
CCDS3245.2 KLHL6 gene_id:89857|Hs108|chr3 ( 621) 908 209.7 9.1e-54
CCDS4021.1 ENC1 gene_id:8507|Hs108|chr5 ( 589) 897 207.2 4.6e-53
CCDS6503.1 KLHL9 gene_id:55958|Hs108|chr9 ( 617) 894 206.6 7.6e-53
CCDS43766.1 KLHL38 gene_id:340359|Hs108|chr8 ( 581) 837 194.0 4.3e-49
CCDS58958.1 ENC1 gene_id:8507|Hs108|chr5 ( 516) 788 183.2 6.8e-46
CCDS46555.2 KLHL30 gene_id:377007|Hs108|chr2 ( 578) 781 181.7 2.2e-45
CCDS30575.1 KLHL21 gene_id:9903|Hs108|chr1 ( 597) 781 181.7 2.2e-45
CCDS10935.1 GAN gene_id:8139|Hs108|chr16 ( 597) 781 181.7 2.2e-45
CCDS12384.1 KLHL26 gene_id:55295|Hs108|chr19 ( 615) 779 181.3 3.1e-45
CCDS10948.1 KLHL36 gene_id:79786|Hs108|chr16 ( 616) 742 173.2 8.8e-43
CCDS13780.1 KLHL22 gene_id:84861|Hs108|chr22 ( 634) 740 172.7 1.2e-42
CCDS76909.1 KLHL36 gene_id:79786|Hs108|chr16 ( 553) 687 161.0 3.5e-39
CCDS1368.1 IVNS1ABP gene_id:10625|Hs108|chr1 ( 642) 642 151.2 3.8e-36
CCDS44132.1 IPP gene_id:3652|Hs108|chr1 ( 582) 616 145.4 1.8e-34
CCDS30702.1 IPP gene_id:3652|Hs108|chr1 ( 584) 613 144.8 2.9e-34
CCDS44685.2 KLHL35 gene_id:283212|Hs108|chr11 ( 583) 605 143.0 9.8e-34
>>CCDS4192.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5 (587 aa)
initn: 3878 init1: 3878 opt: 3878 Z-score: 4609.2 bits: 862.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3878; 100.0% identity (100.0% similar) in 587 aa overlap (1-587:1-587)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MEGESVKLSSQTLIQAGDDEKNQRTITVNPAHMGKAFKVMNELRSKQLLCDVMIVAEDVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 MEGESVKLSSQTLIQAGDDEKNQRTITVNPAHMGKAFKVMNELRSKQLLCDVMIVAEDVE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD IEAHRVVLAACSPYFCAMFTGDMSESKAKKIEIKDVDGQTLSKLIDYIYTAEIEVTEENV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 IEAHRVVLAACSPYFCAMFTGDMSESKAKKIEIKDVDGQTLSKLIDYIYTAEIEVTEENV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD QVLLPAASLLQLMDVRQNCCDFLQSQLHPTNCLGIRAFADVHTCTDLLQQANAYAEQHFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 QVLLPAASLLQLMDVRQNCCDFLQSQLHPTNCLGIRAFADVHTCTDLLQQANAYAEQHFP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD EVMLGEEFLSLSLDQVCSLISSDKLTVSSEEKVFEAVISWINYEKETRLEHMAKLMEHVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 EVMLGEEFLSLSLDQVCSLISSDKLTVSSEEKVFEAVISWINYEKETRLEHMAKLMEHVR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD LPLLPRDYLVQTVEEEALIKNNNTCKDFLIEAMKYHLLPLDQRLLIKNPRTKPRTPVSLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LPLLPRDYLVQTVEEEALIKNNNTCKDFLIEAMKYHLLPLDQRLLIKNPRTKPRTPVSLP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD KVMIVVGGQAPKAIRSVECYDFEEDRWDQIAELPSRRCRAGVVFMAGHVYAVGGFNGSLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 KVMIVVGGQAPKAIRSVECYDFEEDRWDQIAELPSRRCRAGVVFMAGHVYAVGGFNGSLR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD VRTVDVYDGVKDQWTSIASMQERRSTLGAAVLNDLLYAVGGFDGSTGLASVEAYSYKTNE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 VRTVDVYDGVKDQWTSIASMQERRSTLGAAVLNDLLYAVGGFDGSTGLASVEAYSYKTNE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD WFFVAPMNTRRSSVGVGVVEGKLYAVGGYDGASRQCLSTVEQYNPATNEWIYVADMSTRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 WFFVAPMNTRRSSVGVGVVEGKLYAVGGYDGASRQCLSTVEQYNPATNEWIYVADMSTRR
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD SGAGVGVLSGQLYATGGHDGPLVRKSVEVYDPGTNTWKQVADMNMCRRNAGVCAVNGLLY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 SGAGVGVLSGQLYATGGHDGPLVRKSVEVYDPGTNTWKQVADMNMCRRNAGVCAVNGLLY
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580
pF1KSD VVGGDDGSCNLASVEYYNPVTDKWTLLPTNMSTGRSYAGVAVIHKSL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 VVGGDDGSCNLASVEYYNPVTDKWTLLPTNMSTGRSYAGVAVIHKSL
550 560 570 580
>>CCDS58970.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5 (555 aa)
initn: 3677 init1: 3677 opt: 3677 Z-score: 4370.7 bits: 818.6 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3677; 100.0% identity (100.0% similar) in 555 aa overlap (33-587:1-555)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD GESVKLSSQTLIQAGDDEKNQRTITVNPAHMGKAFKVMNELRSKQLLCDVMIVAEDVEIE
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MGKAFKVMNELRSKQLLCDVMIVAEDVEIE
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KSD AHRVVLAACSPYFCAMFTGDMSESKAKKIEIKDVDGQTLSKLIDYIYTAEIEVTEENVQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 AHRVVLAACSPYFCAMFTGDMSESKAKKIEIKDVDGQTLSKLIDYIYTAEIEVTEENVQV
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KSD LLPAASLLQLMDVRQNCCDFLQSQLHPTNCLGIRAFADVHTCTDLLQQANAYAEQHFPEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LLPAASLLQLMDVRQNCCDFLQSQLHPTNCLGIRAFADVHTCTDLLQQANAYAEQHFPEV
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KSD MLGEEFLSLSLDQVCSLISSDKLTVSSEEKVFEAVISWINYEKETRLEHMAKLMEHVRLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MLGEEFLSLSLDQVCSLISSDKLTVSSEEKVFEAVISWINYEKETRLEHMAKLMEHVRLP
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KSD LLPRDYLVQTVEEEALIKNNNTCKDFLIEAMKYHLLPLDQRLLIKNPRTKPRTPVSLPKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LLPRDYLVQTVEEEALIKNNNTCKDFLIEAMKYHLLPLDQRLLIKNPRTKPRTPVSLPKV
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KSD MIVVGGQAPKAIRSVECYDFEEDRWDQIAELPSRRCRAGVVFMAGHVYAVGGFNGSLRVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MIVVGGQAPKAIRSVECYDFEEDRWDQIAELPSRRCRAGVVFMAGHVYAVGGFNGSLRVR
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KSD TVDVYDGVKDQWTSIASMQERRSTLGAAVLNDLLYAVGGFDGSTGLASVEAYSYKTNEWF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 TVDVYDGVKDQWTSIASMQERRSTLGAAVLNDLLYAVGGFDGSTGLASVEAYSYKTNEWF
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KSD FVAPMNTRRSSVGVGVVEGKLYAVGGYDGASRQCLSTVEQYNPATNEWIYVADMSTRRSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 FVAPMNTRRSSVGVGVVEGKLYAVGGYDGASRQCLSTVEQYNPATNEWIYVADMSTRRSG
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530 540
pF1KSD AGVGVLSGQLYATGGHDGPLVRKSVEVYDPGTNTWKQVADMNMCRRNAGVCAVNGLLYVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 AGVGVLSGQLYATGGHDGPLVRKSVEVYDPGTNTWKQVADMNMCRRNAGVCAVNGLLYVV
460 470 480 490 500 510
550 560 570 580
pF1KSD GGDDGSCNLASVEYYNPVTDKWTLLPTNMSTGRSYAGVAVIHKSL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 GGDDGSCNLASVEYYNPVTDKWTLLPTNMSTGRSYAGVAVIHKSL
520 530 540 550
>>CCDS58969.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5 (505 aa)
initn: 3343 init1: 3343 opt: 3343 Z-score: 3974.4 bits: 745.1 E(32554): 4.7e-215
Smith-Waterman score: 3343; 100.0% identity (100.0% similar) in 505 aa overlap (83-587:1-505)
60 70 80 90 100 110
pF1KSD MIVAEDVEIEAHRVVLAACSPYFCAMFTGDMSESKAKKIEIKDVDGQTLSKLIDYIYTAE
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MSESKAKKIEIKDVDGQTLSKLIDYIYTAE
10 20 30
120 130 140 150 160 170
pF1KSD IEVTEENVQVLLPAASLLQLMDVRQNCCDFLQSQLHPTNCLGIRAFADVHTCTDLLQQAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 IEVTEENVQVLLPAASLLQLMDVRQNCCDFLQSQLHPTNCLGIRAFADVHTCTDLLQQAN
40 50 60 70 80 90
180 190 200 210 220 230
pF1KSD AYAEQHFPEVMLGEEFLSLSLDQVCSLISSDKLTVSSEEKVFEAVISWINYEKETRLEHM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 AYAEQHFPEVMLGEEFLSLSLDQVCSLISSDKLTVSSEEKVFEAVISWINYEKETRLEHM
100 110 120 130 140 150
240 250 260 270 280 290
pF1KSD AKLMEHVRLPLLPRDYLVQTVEEEALIKNNNTCKDFLIEAMKYHLLPLDQRLLIKNPRTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 AKLMEHVRLPLLPRDYLVQTVEEEALIKNNNTCKDFLIEAMKYHLLPLDQRLLIKNPRTK
160 170 180 190 200 210
300 310 320 330 340 350
pF1KSD PRTPVSLPKVMIVVGGQAPKAIRSVECYDFEEDRWDQIAELPSRRCRAGVVFMAGHVYAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PRTPVSLPKVMIVVGGQAPKAIRSVECYDFEEDRWDQIAELPSRRCRAGVVFMAGHVYAV
220 230 240 250 260 270
360 370 380 390 400 410
pF1KSD GGFNGSLRVRTVDVYDGVKDQWTSIASMQERRSTLGAAVLNDLLYAVGGFDGSTGLASVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 GGFNGSLRVRTVDVYDGVKDQWTSIASMQERRSTLGAAVLNDLLYAVGGFDGSTGLASVE
280 290 300 310 320 330
420 430 440 450 460 470
pF1KSD AYSYKTNEWFFVAPMNTRRSSVGVGVVEGKLYAVGGYDGASRQCLSTVEQYNPATNEWIY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 AYSYKTNEWFFVAPMNTRRSSVGVGVVEGKLYAVGGYDGASRQCLSTVEQYNPATNEWIY
340 350 360 370 380 390
480 490 500 510 520 530
pF1KSD VADMSTRRSGAGVGVLSGQLYATGGHDGPLVRKSVEVYDPGTNTWKQVADMNMCRRNAGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 VADMSTRRSGAGVGVLSGQLYATGGHDGPLVRKSVEVYDPGTNTWKQVADMNMCRRNAGV
400 410 420 430 440 450
540 550 560 570 580
pF1KSD CAVNGLLYVVGGDDGSCNLASVEYYNPVTDKWTLLPTNMSTGRSYAGVAVIHKSL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 CAVNGLLYVVGGDDGSCNLASVEYYNPVTDKWTLLPTNMSTGRSYAGVAVIHKSL
460 470 480 490 500
>>CCDS34094.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4 (593 aa)
initn: 3459 init1: 3064 opt: 3078 Z-score: 3658.3 bits: 686.9 E(32554): 1.9e-197
Smith-Waterman score: 3078; 77.7% identity (93.0% similar) in 582 aa overlap (7-587:12-593)
10 20 30 40 50
pF1KSD MEGESVKLSSQTLIQAGDDEKNQRT-ITVNPAHMGKAFKVMNELRSKQLLCDVMI
: . : ... ::. ... .:::: :: :::::::::::..::::: :
CCDS34 METPPLPPACTKQGHQKPLDSKDDNTEKHCPVTVNPWHMKKAFKVMNELRSQNLLCDVTI
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KSD VAEDVEIEAHRVVLAACSPYFCAMFTGDMSESKAKKIEIKDVDGQTLSKLIDYIYTAEIE
::::.:: ::::::::::::: :::::.::::.::...::.::: :: ::::.:::::.
CCDS34 VAEDMEISAHRVVLAACSPYFHAMFTGEMSESRAKRVRIKEVDGWTLRMLIDYVYTAEIQ
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KSD VTEENVQVLLPAASLLQLMDVRQNCCDFLQSQLHPTNCLGIRAFADVHTCTDLLQQANAY
:::::::::::::.::::.::...::.::.:::::.::::::::::.:.:::::..::.:
CCDS34 VTEENVQVLLPAAGLLQLQDVKKTCCEFLESQLHPVNCLGIRAFADMHACTDLLNKANTY
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KSD AEQHFPEVMLGEEFLSLSLDQVCSLISSDKLTVSSEEKVFEAVISWINYEKETRLEHMAK
::::: .:.:.::::.:...::::::::::::.:::::::::::.:.:..:..: : ::.
CCDS34 AEQHFADVVLSEEFLNLGIEQVCSLISSDKLTISSEEKVFEAVIAWVNHDKDVRQEFMAR
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KSD LMEHVRLPLLPRDYLVQTVEEEALIKNNNTCKDFLIEAMKYHLLPLDQRLLIKNPRTKPR
::::::::::::.:::: ::::::.::...:::.::::::::::: .::.:.:. ::. :
CCDS34 LMEHVRLPLLPREYLVQRVEEEALVKNSSACKDYLIEAMKYHLLPTEQRILMKSVRTRLR
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KSD TPVSLPKVMIVVGGQAPKAIRSVECYDFEEDRWDQIAELPSRRCRAGVVFMAGHVYAVGG
::..:::.:.::::::::::::::::::.:.:: :.:::::::::::.:.::: :.::::
CCDS34 TPMNLPKLMVVVGGQAPKAIRSVECYDFKEERWHQVAELPSRRCRAGMVYMAGLVFAVGG
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KSD FNGSLRVRTVDVYDGVKDQWTSIASMQERRSTLGAAVLNDLLYAVGGFDGSTGLASVEAY
::::::::::: :: :::::::.:.:..::::::::::: ::::::::::::::.:::::
CCDS34 FNGSLRVRTVDSYDPVKDQWTSVANMRDRRSTLGAAVLNGLLYAVGGFDGSTGLSSVEAY
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KSD SYKTNEWFFVAPMNTRRSSVGVGVVEGKLYAVGGYDGASRQCLSTVEQYNPATNEWIYVA
. :.:::: :::::::::::::::: : ::::::::::::::::::: :: .:::: :.:
CCDS34 NIKSNEWFHVAPMNTRRSSVGVGVVGGLLYAVGGYDGASRQCLSTVECYNATTNEWTYIA
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KSD DMSTRRSGAGVGVLSGQLYATGGHDGPLVRKSVEVYDPGTNTWKQVADMNMCRRNAGVCA
.:::::::::::::.. :::.::::::::::::::::: ::.:.::::::::::::::::
CCDS34 EMSTRRSGAGVGVLNNLLYAVGGHDGPLVRKSVEVYDPTTNAWRQVADMNMCRRNAGVCA
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580
pF1KSD VNGLLYVVGGDDGSCNLASVEYYNPVTDKWTLLPTNMSTGRSYAGVAVIHKSL
:::::::::::::::::::::::::.:::::.. . ::::::::::.:: : :
CCDS34 VNGLLYVVGGDDGSCNLASVEYYNPTTDKWTVVSSCMSTGRSYAGVTVIDKPL
550 560 570 580 590
>>CCDS54815.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4 (597 aa)
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Smith-Waterman score: 3078; 77.7% identity (93.0% similar) in 582 aa overlap (7-587:16-597)
10 20 30 40 50
pF1KSD MEGESVKLSSQTLIQAGDDEKNQRT-ITVNPAHMGKAFKVMNELRSKQLLC
: . : ... ::. ... .:::: :: :::::::::::..:::
CCDS54 MVWLEARPQILFVCTKQGHQKPLDSKDDNTEKHCPVTVNPWHMKKAFKVMNELRSQNLLC
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KSD DVMIVAEDVEIEAHRVVLAACSPYFCAMFTGDMSESKAKKIEIKDVDGQTLSKLIDYIYT
:: :::::.:: ::::::::::::: :::::.::::.::...::.::: :: ::::.::
CCDS54 DVTIVAEDMEISAHRVVLAACSPYFHAMFTGEMSESRAKRVRIKEVDGWTLRMLIDYVYT
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KSD AEIEVTEENVQVLLPAASLLQLMDVRQNCCDFLQSQLHPTNCLGIRAFADVHTCTDLLQQ
:::.:::::::::::::.::::.::...::.::.:::::.::::::::::.:.:::::..
CCDS54 AEIQVTEENVQVLLPAAGLLQLQDVKKTCCEFLESQLHPVNCLGIRAFADMHACTDLLNK
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KSD ANAYAEQHFPEVMLGEEFLSLSLDQVCSLISSDKLTVSSEEKVFEAVISWINYEKETRLE
::.:::::: .:.:.::::.:...::::::::::::.:::::::::::.:.:..:..: :
CCDS54 ANTYAEQHFADVVLSEEFLNLGIEQVCSLISSDKLTISSEEKVFEAVIAWVNHDKDVRQE
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KSD HMAKLMEHVRLPLLPRDYLVQTVEEEALIKNNNTCKDFLIEAMKYHLLPLDQRLLIKNPR
::.::::::::::::.:::: ::::::.::...:::.::::::::::: .::.:.:. :
CCDS54 FMARLMEHVRLPLLPREYLVQRVEEEALVKNSSACKDYLIEAMKYHLLPTEQRILMKSVR
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KSD TKPRTPVSLPKVMIVVGGQAPKAIRSVECYDFEEDRWDQIAELPSRRCRAGVVFMAGHVY
:. :::..:::.:.::::::::::::::::::.:.:: :.:::::::::::.:.::: :.
CCDS54 TRLRTPMNLPKLMVVVGGQAPKAIRSVECYDFKEERWHQVAELPSRRCRAGMVYMAGLVF
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KSD AVGGFNGSLRVRTVDVYDGVKDQWTSIASMQERRSTLGAAVLNDLLYAVGGFDGSTGLAS
::::::::::::::: :: :::::::.:.:..::::::::::: ::::::::::::::.:
CCDS54 AVGGFNGSLRVRTVDSYDPVKDQWTSVANMRDRRSTLGAAVLNGLLYAVGGFDGSTGLSS
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KSD VEAYSYKTNEWFFVAPMNTRRSSVGVGVVEGKLYAVGGYDGASRQCLSTVEQYNPATNEW
::::. :.:::: :::::::::::::::: : ::::::::::::::::::: :: .::::
CCDS54 VEAYNIKSNEWFHVAPMNTRRSSVGVGVVGGLLYAVGGYDGASRQCLSTVECYNATTNEW
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KSD IYVADMSTRRSGAGVGVLSGQLYATGGHDGPLVRKSVEVYDPGTNTWKQVADMNMCRRNA
:.:.:::::::::::::.. :::.::::::::::::::::: ::.:.::::::::::::
CCDS54 TYIAEMSTRRSGAGVGVLNNLLYAVGGHDGPLVRKSVEVYDPTTNAWRQVADMNMCRRNA
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580
pF1KSD GVCAVNGLLYVVGGDDGSCNLASVEYYNPVTDKWTLLPTNMSTGRSYAGVAVIHKSL
:::::::::::::::::::::::::::::.:::::.. . ::::::::::.:: : :
CCDS54 GVCAVNGLLYVVGGDDGSCNLASVEYYNPTTDKWTVVSSCMSTGRSYAGVTVIDKPL
550 560 570 580 590
>>CCDS54816.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4 (505 aa)
initn: 3449 init1: 2758 opt: 2758 Z-score: 3279.0 bits: 616.5 E(32554): 2.5e-176
Smith-Waterman score: 2758; 79.4% identity (94.5% similar) in 505 aa overlap (83-587:1-505)
60 70 80 90 100 110
pF1KSD MIVAEDVEIEAHRVVLAACSPYFCAMFTGDMSESKAKKIEIKDVDGQTLSKLIDYIYTAE
::::.::...::.::: :: ::::.::::
CCDS54 MSESRAKRVRIKEVDGWTLRMLIDYVYTAE
10 20 30
120 130 140 150 160 170
pF1KSD IEVTEENVQVLLPAASLLQLMDVRQNCCDFLQSQLHPTNCLGIRAFADVHTCTDLLQQAN
:.:::::::::::::.::::.::...::.::.:::::.::::::::::.:.:::::..::
CCDS54 IQVTEENVQVLLPAAGLLQLQDVKKTCCEFLESQLHPVNCLGIRAFADMHACTDLLNKAN
40 50 60 70 80 90
180 190 200 210 220 230
pF1KSD AYAEQHFPEVMLGEEFLSLSLDQVCSLISSDKLTVSSEEKVFEAVISWINYEKETRLEHM
.:::::: .:.:.::::.:...::::::::::::.:::::::::::.:.:..:..: : :
CCDS54 TYAEQHFADVVLSEEFLNLGIEQVCSLISSDKLTISSEEKVFEAVIAWVNHDKDVRQEFM
100 110 120 130 140 150
240 250 260 270 280 290
pF1KSD AKLMEHVRLPLLPRDYLVQTVEEEALIKNNNTCKDFLIEAMKYHLLPLDQRLLIKNPRTK
:.::::::::::::.:::: ::::::.::...:::.::::::::::: .::.:.:. ::.
CCDS54 ARLMEHVRLPLLPREYLVQRVEEEALVKNSSACKDYLIEAMKYHLLPTEQRILMKSVRTR
160 170 180 190 200 210
300 310 320 330 340 350
pF1KSD PRTPVSLPKVMIVVGGQAPKAIRSVECYDFEEDRWDQIAELPSRRCRAGVVFMAGHVYAV
:::..:::.:.::::::::::::::::::.:.:: :.:::::::::::.:.::: :.::
CCDS54 LRTPMNLPKLMVVVGGQAPKAIRSVECYDFKEERWHQVAELPSRRCRAGMVYMAGLVFAV
220 230 240 250 260 270
360 370 380 390 400 410
pF1KSD GGFNGSLRVRTVDVYDGVKDQWTSIASMQERRSTLGAAVLNDLLYAVGGFDGSTGLASVE
::::::::::::: :: :::::::.:.:..::::::::::: ::::::::::::::.:::
CCDS54 GGFNGSLRVRTVDSYDPVKDQWTSVANMRDRRSTLGAAVLNGLLYAVGGFDGSTGLSSVE
280 290 300 310 320 330
420 430 440 450 460 470
pF1KSD AYSYKTNEWFFVAPMNTRRSSVGVGVVEGKLYAVGGYDGASRQCLSTVEQYNPATNEWIY
::. :.:::: :::::::::::::::: : ::::::::::::::::::: :: .:::: :
CCDS54 AYNIKSNEWFHVAPMNTRRSSVGVGVVGGLLYAVGGYDGASRQCLSTVECYNATTNEWTY
340 350 360 370 380 390
480 490 500 510 520 530
pF1KSD VADMSTRRSGAGVGVLSGQLYATGGHDGPLVRKSVEVYDPGTNTWKQVADMNMCRRNAGV
.:.:::::::::::::.. :::.::::::::::::::::: ::.:.::::::::::::::
CCDS54 IAEMSTRRSGAGVGVLNNLLYAVGGHDGPLVRKSVEVYDPTTNAWRQVADMNMCRRNAGV
400 410 420 430 440 450
540 550 560 570 580
pF1KSD CAVNGLLYVVGGDDGSCNLASVEYYNPVTDKWTLLPTNMSTGRSYAGVAVIHKSL
:::::::::::::::::::::::::::.:::::.. . ::::::::::.:: : :
CCDS54 CAVNGLLYVVGGDDGSCNLASVEYYNPTTDKWTVVSSCMSTGRSYAGVTVIDKPL
460 470 480 490 500
>>CCDS82974.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4 (496 aa)
initn: 3278 init1: 2587 opt: 2587 Z-score: 3075.9 bits: 578.9 E(32554): 5.2e-165
Smith-Waterman score: 2587; 77.5% identity (93.0% similar) in 484 aa overlap (104-587:13-496)
80 90 100 110 120 130
pF1KSD YFCAMFTGDMSESKAKKIEIKDVDGQTLSKLIDYIYTAEIEVTEENVQVLLPAASLLQLM
::.. . . . .:::::::.::::.
CCDS82 MSQLWQKTWKFLLIEWCWPPVVLIFMPCLQVLLPAAGLLQLQ
10 20 30 40
140 150 160 170 180 190
pF1KSD DVRQNCCDFLQSQLHPTNCLGIRAFADVHTCTDLLQQANAYAEQHFPEVMLGEEFLSLSL
::...::.::.:::::.::::::::::.:.:::::..::.:::::: .:.:.::::.:..
CCDS82 DVKKTCCEFLESQLHPVNCLGIRAFADMHACTDLLNKANTYAEQHFADVVLSEEFLNLGI
50 60 70 80 90 100
200 210 220 230 240 250
pF1KSD DQVCSLISSDKLTVSSEEKVFEAVISWINYEKETRLEHMAKLMEHVRLPLLPRDYLVQTV
.::::::::::::.:::::::::::.:.:..:..: : ::.::::::::::::.:::: :
CCDS82 EQVCSLISSDKLTISSEEKVFEAVIAWVNHDKDVRQEFMARLMEHVRLPLLPREYLVQRV
110 120 130 140 150 160
260 270 280 290 300 310
pF1KSD EEEALIKNNNTCKDFLIEAMKYHLLPLDQRLLIKNPRTKPRTPVSLPKVMIVVGGQAPKA
:::::.::...:::.::::::::::: .::.:.:. ::. :::..:::.:.:::::::::
CCDS82 EEEALVKNSSACKDYLIEAMKYHLLPTEQRILMKSVRTRLRTPMNLPKLMVVVGGQAPKA
170 180 190 200 210 220
320 330 340 350 360 370
pF1KSD IRSVECYDFEEDRWDQIAELPSRRCRAGVVFMAGHVYAVGGFNGSLRVRTVDVYDGVKDQ
:::::::::.:.:: :.:::::::::::.:.::: :.::::::::::::::: :: ::::
CCDS82 IRSVECYDFKEERWHQVAELPSRRCRAGMVYMAGLVFAVGGFNGSLRVRTVDSYDPVKDQ
230 240 250 260 270 280
380 390 400 410 420 430
pF1KSD WTSIASMQERRSTLGAAVLNDLLYAVGGFDGSTGLASVEAYSYKTNEWFFVAPMNTRRSS
:::.:.:..::::::::::: ::::::::::::::.:::::. :.:::: ::::::::::
CCDS82 WTSVANMRDRRSTLGAAVLNGLLYAVGGFDGSTGLSSVEAYNIKSNEWFHVAPMNTRRSS
290 300 310 320 330 340
440 450 460 470 480 490
pF1KSD VGVGVVEGKLYAVGGYDGASRQCLSTVEQYNPATNEWIYVADMSTRRSGAGVGVLSGQLY
:::::: : ::::::::::::::::::: :: .:::: :.:.:::::::::::::.. ::
CCDS82 VGVGVVGGLLYAVGGYDGASRQCLSTVECYNATTNEWTYIAEMSTRRSGAGVGVLNNLLY
350 360 370 380 390 400
500 510 520 530 540 550
pF1KSD ATGGHDGPLVRKSVEVYDPGTNTWKQVADMNMCRRNAGVCAVNGLLYVVGGDDGSCNLAS
:.::::::::::::::::: ::.:.:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 AVGGHDGPLVRKSVEVYDPTTNAWRQVADMNMCRRNAGVCAVNGLLYVVGGDDGSCNLAS
410 420 430 440 450 460
560 570 580
pF1KSD VEYYNPVTDKWTLLPTNMSTGRSYAGVAVIHKSL
::::::.:::::.. . ::::::::::.:: : :
CCDS82 VEYYNPTTDKWTVVSSCMSTGRSYAGVTVIDKPL
470 480 490
>>CCDS82975.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4 (427 aa)
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Smith-Waterman score: 2346; 79.9% identity (94.1% similar) in 427 aa overlap (161-587:1-427)
140 150 160 170 180 190
pF1KSD QLMDVRQNCCDFLQSQLHPTNCLGIRAFADVHTCTDLLQQANAYAEQHFPEVMLGEEFLS
.:.:::::..::.:::::: .:.:.::::.
CCDS82 MHACTDLLNKANTYAEQHFADVVLSEEFLN
10 20 30
200 210 220 230 240 250
pF1KSD LSLDQVCSLISSDKLTVSSEEKVFEAVISWINYEKETRLEHMAKLMEHVRLPLLPRDYLV
:...::::::::::::.:::::::::::.:.:..:..: : ::.::::::::::::.:::
CCDS82 LGIEQVCSLISSDKLTISSEEKVFEAVIAWVNHDKDVRQEFMARLMEHVRLPLLPREYLV
40 50 60 70 80 90
260 270 280 290 300 310
pF1KSD QTVEEEALIKNNNTCKDFLIEAMKYHLLPLDQRLLIKNPRTKPRTPVSLPKVMIVVGGQA
: ::::::.::...:::.::::::::::: .::.:.:. ::. :::..:::.:.::::::
CCDS82 QRVEEEALVKNSSACKDYLIEAMKYHLLPTEQRILMKSVRTRLRTPMNLPKLMVVVGGQA
100 110 120 130 140 150
320 330 340 350 360 370
pF1KSD PKAIRSVECYDFEEDRWDQIAELPSRRCRAGVVFMAGHVYAVGGFNGSLRVRTVDVYDGV
::::::::::::.:.:: :.:::::::::::.:.::: :.::::::::::::::: :: :
CCDS82 PKAIRSVECYDFKEERWHQVAELPSRRCRAGMVYMAGLVFAVGGFNGSLRVRTVDSYDPV
160 170 180 190 200 210
380 390 400 410 420 430
pF1KSD KDQWTSIASMQERRSTLGAAVLNDLLYAVGGFDGSTGLASVEAYSYKTNEWFFVAPMNTR
::::::.:.:..::::::::::: ::::::::::::::.:::::. :.:::: :::::::
CCDS82 KDQWTSVANMRDRRSTLGAAVLNGLLYAVGGFDGSTGLSSVEAYNIKSNEWFHVAPMNTR
220 230 240 250 260 270
440 450 460 470 480 490
pF1KSD RSSVGVGVVEGKLYAVGGYDGASRQCLSTVEQYNPATNEWIYVADMSTRRSGAGVGVLSG
::::::::: : ::::::::::::::::::: :: .:::: :.:.:::::::::::::..
CCDS82 RSSVGVGVVGGLLYAVGGYDGASRQCLSTVECYNATTNEWTYIAEMSTRRSGAGVGVLNN
280 290 300 310 320 330
500 510 520 530 540 550
pF1KSD QLYATGGHDGPLVRKSVEVYDPGTNTWKQVADMNMCRRNAGVCAVNGLLYVVGGDDGSCN
:::.::::::::::::::::: ::.:.::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 LLYAVGGHDGPLVRKSVEVYDPTTNAWRQVADMNMCRRNAGVCAVNGLLYVVGGDDGSCN
340 350 360 370 380 390
560 570 580
pF1KSD LASVEYYNPVTDKWTLLPTNMSTGRSYAGVAVIHKSL
:::::::::.:::::.. . ::::::::::.:: : :
CCDS82 LASVEYYNPTTDKWTVVSSCMSTGRSYAGVTVIDKPL
400 410 420
>>CCDS30550.1 KLHL17 gene_id:339451|Hs108|chr1 (642 aa)
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Smith-Waterman score: 1753; 49.5% identity (76.7% similar) in 553 aa overlap (32-583:74-622)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD EGESVKLSSQTLIQAGDDEKNQRTITVNPAHMGKAFKVMNELRSKQLLCDVMIVAEDVEI
:. :: .:...:.. ::::... . ::
CCDS30 PRQARPAAPMEGAVQLLSREGHSVAHNSKRHYHDAFVAMSRMRQRGLLCDIVLHVAAKEI
50 60 70 80 90 100
70 80 90 100 110 120
pF1KSD EAHRVVLAACSPYFCAMFTGDMSESKAKKIEIKDVDGQTLSKLIDYIYTAEIEVTEENVQ
.::.::::.::::: ::::..::::. .. ..:.: :.:..:... ::::: : : :::
CCDS30 RAHKVVLASCSPYFHAMFTNEMSESRQTHVTLHDIDPQALDQLVQFAYTAEIVVGEGNVQ
110 120 130 140 150 160
130 140 150 160 170 180
pF1KSD VLLPAASLLQLMDVRQNCCDFLQSQLHPTNCLGIRAFADVHTCTDLLQQANAYAEQHFPE
.:::::::::: ::. :: :: ::: :.::::::.:::.:.:.:::. :. :. ::: .
CCDS30 TLLPAASLLQLNGVRDACCKFLLSQLDPSNCLGIRGFADAHSCSDLLKAAHRYVLQHFVD
170 180 190 200 210 220
190 200 210 220 230 240
pF1KSD VMLGEEFLSLSLDQVCSLISSDKLTVSSEEKVFEAVISWINYEKETRLEHMAKLMEHVRL
: :::. : : :: :.:::.:.: :::.:..::.::.... ..: .:. .::. :::
CCDS30 VAKTEEFMLLPLKQVLELVSSDSLNVPSEEEVYRAVLSWVKHDVDARRQHVPRLMKCVRL
230 240 250 260 270 280
250 260 270 280 290 300
pF1KSD PLLPRDYLVQTVEEEALIKNNNTCKDFLIEAMKYHLLPLDQRLLIKNPRTKPRTPVSLPK
::: ::.:. :. :.:.... :::.::::.:.:::: .:: .. . ::.:: .
CCDS30 PLLSRDFLLGHVDAESLVRHHPDCKDLLIEALKFHLLP-EQRGVLGTSRTRPRRCEGAGP
290 300 310 320 330 340
310 320 330 340 350 360
pF1KSD VMIVVGGQAPKAIRS-VECYDFEEDRWDQIAELPSRRCRAGVVFMAGHVYAVGGFNGSLR
:...::: . ::.. : :: . ::: .: . .:: :.::. .....:::::..:.
CCDS30 VLFAVGGGSLFAIHGDCEAYDTRTDRWHVVASMSTRRARVGVAAVGNRLYAVGGYDGTSD
350 360 370 380 390 400
370 380 390 400 410 420
pF1KSD VRTVDVYDGVKDQWTSIASMQERRSTLGAAVLNDLLYAVGGFDGSTGLASVEAYSYKTNE
. ::. :: : . : .:: ::: ::.:.:. :::..::.::.. : :.: :. :.
CCDS30 LATVESYDPVTNTWQPEVSMGTRRSCLGVAALHGLLYSAGGYDGASCLNSAERYDPLTGT
410 420 430 440 450 460
430 440 450 460 470 480
pF1KSD WFFVAPMNTRRSSVGVGVVEGKLYAVGGYDGASRQCLSTVEQYNPATNEWIYVADMSTRR
: :: :.::: : :....:.::::::::..:. :.:::.:.: .: : ::.: .::
CCDS30 WTSVAAMSTRRRYVRVATLDGNLYAVGGYDSSSH--LATVEKYEPQVNVWSPVASMLSRR
470 480 490 500 510 520
490 500 510 520 530 540
pF1KSD SGAGVGVLSGQLYATGGHDGPLVRKSVEVYDPGTNTWKQVADMNMCRRNAGVCAVNGLLY
:.:::.:: : ::..::.:: .::: :.: ...:..:: ::. : . . :..: ::
CCDS30 SSAGVAVLEGALYVAGGNDGTSCLNSVERYSPKAGAWESVAPMNIRRSTHDLVAMDGWLY
530 540 550 560 570 580
550 560 570 580
pF1KSD VVGGDDGSCNLASVEYYNPVTDKWTLLPTNMSTGRSYAGVAVIHKSL
.:::.::: .: :.: ::: :.:: . . : : :: .::::.
CCDS30 AVGGNDGSSSLNSIEKYNPRTNKW-VAASCMFTRRSSVGVAVLELLNFPPPSSPTLSVSS
590 600 610 620 630
CCDS30 TSL
640
>>CCDS1310.1 KLHL20 gene_id:27252|Hs108|chr1 (609 aa)
initn: 1590 init1: 994 opt: 1606 Z-score: 1908.5 bits: 363.2 E(32554): 5.5e-100
Smith-Waterman score: 1606; 45.0% identity (73.1% similar) in 562 aa overlap (24-583:42-599)
10 20 30 40 50
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