Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA1095
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA1095, 1066 aa
1>>>pF1KSDA1095 1066 - 1066 aa - 1066 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.9359+/-0.00131; mu= 5.4526+/- 0.078
mean_var=246.9306+/-51.994, 0's: 0 Z-trim(108.9): 104 B-trim: 687 in 2/50
Lambda= 0.081618
statistics sampled from 10417 (10511) to 10417 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.675), E-opt: 0.2 (0.323), width: 16
Scan time: 4.450
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS33789.1 PDZRN3 gene_id:23024|Hs108|chr3 (1066) 7161 857.8 0
CCDS77771.1 PDZRN3 gene_id:23024|Hs108|chr3 ( 783) 5044 608.4 1.9e-173
CCDS77770.1 PDZRN3 gene_id:23024|Hs108|chr3 ( 723) 4807 580.5 4.6e-165
CCDS53777.1 PDZRN4 gene_id:29951|Hs108|chr12 (1036) 2366 293.2 2e-78
CCDS78518.1 PDZD4 gene_id:57595|Hs108|chrX ( 775) 2108 262.7 2.2e-69
CCDS8739.1 PDZRN4 gene_id:29951|Hs108|chr12 ( 778) 1969 246.3 1.9e-64
CCDS14732.1 PDZD4 gene_id:57595|Hs108|chrX ( 769) 1812 227.8 6.9e-59
CCDS78517.1 PDZD4 gene_id:57595|Hs108|chrX ( 660) 1711 215.9 2.4e-55
>>CCDS33789.1 PDZRN3 gene_id:23024|Hs108|chr3 (1066 aa)
initn: 7161 init1: 7161 opt: 7161 Z-score: 4572.8 bits: 857.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 7161; 100.0% identity (100.0% similar) in 1066 aa overlap (1-1066:1-1066)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MGFELDRFDGDVDPDLKCALCHKVLEDPLTTPCGHVFCAGCVLPWVVQEGSCPARCRGRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MGFELDRFDGDVDPDLKCALCHKVLEDPLTTPCGHVFCAGCVLPWVVQEGSCPARCRGRL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD SAKELNHVLPLKRLILKLDIKCAYATRGCGRVVKLQQLPEHLERCDFAPARCRHAGCGQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SAKELNHVLPLKRLILKLDIKCAYATRGCGRVVKLQQLPEHLERCDFAPARCRHAGCGQV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD LLRRDVEAHMRDACDARPVGRCQEGCGLPLTHGEQRAGGHCCARALRAHNGALQARLGAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LLRRDVEAHMRDACDARPVGRCQEGCGLPLTHGEQRAGGHCCARALRAHNGALQARLGAL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD HKALKKEALRAGKREKSLVAQLAAAQLELQMTALRYQKKFTEYSARLDSLSRCVAAPPGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 HKALKKEALRAGKREKSLVAQLAAAQLELQMTALRYQKKFTEYSARLDSLSRCVAAPPGG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD KGEETKSLTLVLHRDSGSLGFNIIGGRPSVDNHDGSSSEGIFVSKIVDSGPAAKEGGLQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 KGEETKSLTLVLHRDSGSLGFNIIGGRPSVDNHDGSSSEGIFVSKIVDSGPAAKEGGLQI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD HDRIIEVNGRDLSRATHDQAVEAFKTAKEPIVVQVLRRTPRTKMFTPPSESQLVDTGTQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 HDRIIEVNGRDLSRATHDQAVEAFKTAKEPIVVQVLRRTPRTKMFTPPSESQLVDTGTQT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD DITFEHIMALTKMSSPSPPVLDPYLLPEEHPSAHEYYDPNDYIGDIHQEMDREELELEEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 DITFEHIMALTKMSSPSPPVLDPYLLPEEHPSAHEYYDPNDYIGDIHQEMDREELELEEV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD DLYRMNSQDKLGLTVCYRTDDEDDIGIYISEIDPNSIAAKDGRIREGDRIIQINGIEVQN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 DLYRMNSQDKLGLTVCYRTDDEDDIGIYISEIDPNSIAAKDGRIREGDRIIQINGIEVQN
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD REEAVALLTSEENKNFSLLIARPELQLDEGWMDDDRNDFLDDLHMDMLEEQHHQAMQFTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 REEAVALLTSEENKNFSLLIARPELQLDEGWMDDDRNDFLDDLHMDMLEEQHHQAMQFTA
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD SVLQQKKHDEDGGTTDTATILSNQHEKDSGVGRTDESTRNDESSEQENNGDDATASSNPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SVLQQKKHDEDGGTTDTATILSNQHEKDSGVGRTDESTRNDESSEQENNGDDATASSNPL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD AGQRKLTCSQDTLGSGDLPFSNESFISADCTDADYLGIPVDECERFRELLELKCQVKSAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 AGQRKLTCSQDTLGSGDLPFSNESFISADCTDADYLGIPVDECERFRELLELKCQVKSAT
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD PYGLYYPSGPLDAGKSDPESVDKELELLNEELRSIELECLSIVRAHKMQQLKEQYRESWM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 PYGLYYPSGPLDAGKSDPESVDKELELLNEELRSIELECLSIVRAHKMQQLKEQYRESWM
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD LHNSGFRNYNTSIDVRRHELSDITELPEKSDKDSSSAYNTGESCRSTPLTLEISPDNSLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LHNSGFRNYNTSIDVRRHELSDITELPEKSDKDSSSAYNTGESCRSTPLTLEISPDNSLR
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD RAAEGISCPSSEGAVGTTEAYGPASKNLLSITEDPEVGTPTYSPSLKELDPNQPLESKER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 RAAEGISCPSSEGAVGTTEAYGPASKNLLSITEDPEVGTPTYSPSLKELDPNQPLESKER
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD RASDGSRSPTPSQKLGSAYLPSYHHSPYKHAHIPAHAQHYQSYMQLIQQKSAVEYAQSQM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 RASDGSRSPTPSQKLGSAYLPSYHHSPYKHAHIPAHAQHYQSYMQLIQQKSAVEYAQSQM
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD SLVSMCKDLSSPTPSEPRMEWKVKIRSDGTRYITKRPVRDRLLRERALKIREERSGMTTD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SLVSMCKDLSSPTPSEPRMEWKVKIRSDGTRYITKRPVRDRLLRERALKIREERSGMTTD
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD DDAVSEMKMGRYWSKEERKQHLVKAKEQRRRREFMMQSRLDCLKEQQAADDRKEMNILEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 DDAVSEMKMGRYWSKEERKQHLVKAKEQRRRREFMMQSRLDCLKEQQAADDRKEMNILEL
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060
pF1KSD SHKKMMKKRNKKIFDNWMTIQELLTHGTKSPDGTRVYNSFLSVTTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SHKKMMKKRNKKIFDNWMTIQELLTHGTKSPDGTRVYNSFLSVTTV
1030 1040 1050 1060
>>CCDS77771.1 PDZRN3 gene_id:23024|Hs108|chr3 (783 aa)
initn: 5044 init1: 5044 opt: 5044 Z-score: 3227.3 bits: 608.4 E(32554): 1.9e-173
Smith-Waterman score: 5044; 99.6% identity (99.9% similar) in 763 aa overlap (304-1066:21-783)
280 290 300 310 320 330
pF1KSD DGSSSEGIFVSKIVDSGPAAKEGGLQIHDRIIEVNGRDLSRATHDQAVEAFKTAKEPIVV
. .:::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 MGCSLCSLQKQEEQYKLLYEVCQVNGRDLSRATHDQAVEAFKTAKEPIVV
10 20 30 40 50
340 350 360 370 380 390
pF1KSD QVLRRTPRTKMFTPPSESQLVDTGTQTDITFEHIMALTKMSSPSPPVLDPYLLPEEHPSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 QVLRRTPRTKMFTPPSESQLVDTGTQTDITFEHIMALTKMSSPSPPVLDPYLLPEEHPSA
60 70 80 90 100 110
400 410 420 430 440 450
pF1KSD HEYYDPNDYIGDIHQEMDREELELEEVDLYRMNSQDKLGLTVCYRTDDEDDIGIYISEID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 HEYYDPNDYIGDIHQEMDREELELEEVDLYRMNSQDKLGLTVCYRTDDEDDIGIYISEID
120 130 140 150 160 170
460 470 480 490 500 510
pF1KSD PNSIAAKDGRIREGDRIIQINGIEVQNREEAVALLTSEENKNFSLLIARPELQLDEGWMD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 PNSIAAKDGRIREGDRIIQINGIEVQNREEAVALLTSEENKNFSLLIARPELQLDEGWMD
180 190 200 210 220 230
520 530 540 550 560 570
pF1KSD DDRNDFLDDLHMDMLEEQHHQAMQFTASVLQQKKHDEDGGTTDTATILSNQHEKDSGVGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 DDRNDFLDDLHMDMLEEQHHQAMQFTASVLQQKKHDEDGGTTDTATILSNQHEKDSGVGR
240 250 260 270 280 290
580 590 600 610 620 630
pF1KSD TDESTRNDESSEQENNGDDATASSNPLAGQRKLTCSQDTLGSGDLPFSNESFISADCTDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 TDESTRNDESSEQENNGDDATASSNPLAGQRKLTCSQDTLGSGDLPFSNESFISADCTDA
300 310 320 330 340 350
640 650 660 670 680 690
pF1KSD DYLGIPVDECERFRELLELKCQVKSATPYGLYYPSGPLDAGKSDPESVDKELELLNEELR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 DYLGIPVDECERFRELLELKCQVKSATPYGLYYPSGPLDAGKSDPESVDKELELLNEELR
360 370 380 390 400 410
700 710 720 730 740 750
pF1KSD SIELECLSIVRAHKMQQLKEQYRESWMLHNSGFRNYNTSIDVRRHELSDITELPEKSDKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 SIELECLSIVRAHKMQQLKEQYRESWMLHNSGFRNYNTSIDVRRHELSDITELPEKSDKD
420 430 440 450 460 470
760 770 780 790 800 810
pF1KSD SSSAYNTGESCRSTPLTLEISPDNSLRRAAEGISCPSSEGAVGTTEAYGPASKNLLSITE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 SSSAYNTGESCRSTPLTLEISPDNSLRRAAEGISCPSSEGAVGTTEAYGPASKNLLSITE
480 490 500 510 520 530
820 830 840 850 860 870
pF1KSD DPEVGTPTYSPSLKELDPNQPLESKERRASDGSRSPTPSQKLGSAYLPSYHHSPYKHAHI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 DPEVGTPTYSPSLKELDPNQPLESKERRASDGSRSPTPSQKLGSAYLPSYHHSPYKHAHI
540 550 560 570 580 590
880 890 900 910 920 930
pF1KSD PAHAQHYQSYMQLIQQKSAVEYAQSQMSLVSMCKDLSSPTPSEPRMEWKVKIRSDGTRYI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 PAHAQHYQSYMQLIQQKSAVEYAQSQMSLVSMCKDLSSPTPSEPRMEWKVKIRSDGTRYI
600 610 620 630 640 650
940 950 960 970 980 990
pF1KSD TKRPVRDRLLRERALKIREERSGMTTDDDAVSEMKMGRYWSKEERKQHLVKAKEQRRRRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 TKRPVRDRLLRERALKIREERSGMTTDDDAVSEMKMGRYWSKEERKQHLVKAKEQRRRRE
660 670 680 690 700 710
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KSD FMMQSRLDCLKEQQAADDRKEMNILELSHKKMMKKRNKKIFDNWMTIQELLTHGTKSPDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 FMMQSRLDCLKEQQAADDRKEMNILELSHKKMMKKRNKKIFDNWMTIQELLTHGTKSPDG
720 730 740 750 760 770
1060
pF1KSD TRVYNSFLSVTTV
:::::::::::::
CCDS77 TRVYNSFLSVTTV
780
>>CCDS77770.1 PDZRN3 gene_id:23024|Hs108|chr3 (723 aa)
initn: 4807 init1: 4807 opt: 4807 Z-score: 3077.0 bits: 580.5 E(32554): 4.6e-165
Smith-Waterman score: 4807; 100.0% identity (100.0% similar) in 723 aa overlap (344-1066:1-723)
320 330 340 350 360 370
pF1KSD RATHDQAVEAFKTAKEPIVVQVLRRTPRTKMFTPPSESQLVDTGTQTDITFEHIMALTKM
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 MFTPPSESQLVDTGTQTDITFEHIMALTKM
10 20 30
380 390 400 410 420 430
pF1KSD SSPSPPVLDPYLLPEEHPSAHEYYDPNDYIGDIHQEMDREELELEEVDLYRMNSQDKLGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 SSPSPPVLDPYLLPEEHPSAHEYYDPNDYIGDIHQEMDREELELEEVDLYRMNSQDKLGL
40 50 60 70 80 90
440 450 460 470 480 490
pF1KSD TVCYRTDDEDDIGIYISEIDPNSIAAKDGRIREGDRIIQINGIEVQNREEAVALLTSEEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 TVCYRTDDEDDIGIYISEIDPNSIAAKDGRIREGDRIIQINGIEVQNREEAVALLTSEEN
100 110 120 130 140 150
500 510 520 530 540 550
pF1KSD KNFSLLIARPELQLDEGWMDDDRNDFLDDLHMDMLEEQHHQAMQFTASVLQQKKHDEDGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 KNFSLLIARPELQLDEGWMDDDRNDFLDDLHMDMLEEQHHQAMQFTASVLQQKKHDEDGG
160 170 180 190 200 210
560 570 580 590 600 610
pF1KSD TTDTATILSNQHEKDSGVGRTDESTRNDESSEQENNGDDATASSNPLAGQRKLTCSQDTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 TTDTATILSNQHEKDSGVGRTDESTRNDESSEQENNGDDATASSNPLAGQRKLTCSQDTL
220 230 240 250 260 270
620 630 640 650 660 670
pF1KSD GSGDLPFSNESFISADCTDADYLGIPVDECERFRELLELKCQVKSATPYGLYYPSGPLDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 GSGDLPFSNESFISADCTDADYLGIPVDECERFRELLELKCQVKSATPYGLYYPSGPLDA
280 290 300 310 320 330
680 690 700 710 720 730
pF1KSD GKSDPESVDKELELLNEELRSIELECLSIVRAHKMQQLKEQYRESWMLHNSGFRNYNTSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 GKSDPESVDKELELLNEELRSIELECLSIVRAHKMQQLKEQYRESWMLHNSGFRNYNTSI
340 350 360 370 380 390
740 750 760 770 780 790
pF1KSD DVRRHELSDITELPEKSDKDSSSAYNTGESCRSTPLTLEISPDNSLRRAAEGISCPSSEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 DVRRHELSDITELPEKSDKDSSSAYNTGESCRSTPLTLEISPDNSLRRAAEGISCPSSEG
400 410 420 430 440 450
800 810 820 830 840 850
pF1KSD AVGTTEAYGPASKNLLSITEDPEVGTPTYSPSLKELDPNQPLESKERRASDGSRSPTPSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 AVGTTEAYGPASKNLLSITEDPEVGTPTYSPSLKELDPNQPLESKERRASDGSRSPTPSQ
460 470 480 490 500 510
860 870 880 890 900 910
pF1KSD KLGSAYLPSYHHSPYKHAHIPAHAQHYQSYMQLIQQKSAVEYAQSQMSLVSMCKDLSSPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 KLGSAYLPSYHHSPYKHAHIPAHAQHYQSYMQLIQQKSAVEYAQSQMSLVSMCKDLSSPT
520 530 540 550 560 570
920 930 940 950 960 970
pF1KSD PSEPRMEWKVKIRSDGTRYITKRPVRDRLLRERALKIREERSGMTTDDDAVSEMKMGRYW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 PSEPRMEWKVKIRSDGTRYITKRPVRDRLLRERALKIREERSGMTTDDDAVSEMKMGRYW
580 590 600 610 620 630
980 990 1000 1010 1020 1030
pF1KSD SKEERKQHLVKAKEQRRRREFMMQSRLDCLKEQQAADDRKEMNILELSHKKMMKKRNKKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 SKEERKQHLVKAKEQRRRREFMMQSRLDCLKEQQAADDRKEMNILELSHKKMMKKRNKKI
640 650 660 670 680 690
1040 1050 1060
pF1KSD FDNWMTIQELLTHGTKSPDGTRVYNSFLSVTTV
:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 FDNWMTIQELLTHGTKSPDGTRVYNSFLSVTTV
700 710 720
>>CCDS53777.1 PDZRN4 gene_id:29951|Hs108|chr12 (1036 aa)
initn: 2915 init1: 661 opt: 2366 Z-score: 1521.5 bits: 293.2 E(32554): 2e-78
Smith-Waterman score: 3877; 57.5% identity (79.2% similar) in 1084 aa overlap (1-1066:1-1036)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MGFELDRFDGDVDPDLKCALCHKVLEDPLTTPCGHVFCAGCVLPWVVQEGSCPARCRGRL
::: :.:: ::: :.: :: .:::.:: :::::::::.:.:::.:.. :: .:. :
CCDS53 MGFALERFAEAVDPALECKLCGQVLEEPLCTPCGHVFCASCLLPWAVRRRRCPLQCQP-L
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KSD SAKELNHVLPLKRLILKLDIKCAYATRGCGRVVKLQQLPEHLERCDFAPAR-CR-HAGCG
. :: .::::. :: :: ..: : .::::. :.:..: :.:.:::.::: : ..::.
CCDS53 APGELYRVLPLRSLIQKLRVQCDYRARGCGHSVRLHELEAHVEHCDFGPARRLRSRGGCA
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KSD QVLLRRDVEAHMRDACDARPVGRCQEGCGLPLTHGEQRAGGHCCARALRAHNGALQARLG
. : .: : : .: : . : :.:: :..: .: :
CCDS53 SGLGGGEVPA--RGGCGPTP----RAG----------RGGG--------ARGGPPGGRWG
120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KSD ALHKALKKEALRAGKREKSLVAQLAAAQLELQMTALRYQKKFTEYSARLDSLSRCVAAPP
.. ..: .:::.:.::: : : :.:.:: :::.:::.: :.. .. :.
CCDS53 R-GRGPGPRVLAWRRREKALLAQLWALQGEVQLTARRYQEKFTQYMAHVRNF---VGDLG
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KSD GG--KGEETKSLTLVLHRDSGSLGFNIIGGRPSVDNHDGSSSEGIFVSKIVDSGPAAKEG
:: . : : .:.::.:.. .::::::::::. .:..:.:.:::.::::...::: .
CCDS53 GGHRRDGEHKPFTIVLERENDTLGFNIIGGRPNQNNQEGTSTEGIYVSKILENGPADRAD
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KSD GLQIHDRIIEVNGRDLSRATHDQAVEAFKTAKEPIVVQVLRRTPRTK-MFTPPSESQLVD
::.:::.:.::::.:::.:::..:::::..:::::::::::::: .. . :: ::..
CCDS53 GLEIHDKIMEVNGKDLSKATHEEAVEAFRNAKEPIVVQVLRRTPLSRPAYGMASEVQLMN
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400
pF1KSD TGTQTDITFEHIMALTKMSSPSPPVLD--PYLLPEE----HPSAHEYYDPNDYIGDIHQE
..:::::::::::::.:. :.::: : :.:: . :: ::.:. :.::... .
CCDS53 ASTQTDITFEHIMALAKLRPPTPPVPDICPFLLSDSCHSLHPMEHEFYEDNEYISSLPAD
340 350 360 370 380 390
410 420 430 440 450 460
pF1KSD MDR-EELELEEVDLYRMNSQDKLGLTVCYRTDDEDDIGIYISEIDPNSIAAKDGRIREGD
:: :..: :::.: :..::.:::::::::::::.: :::.::.::::::::::::::::
CCDS53 ADRTEDFEYEEVELCRVSSQEKLGLTVCYRTDDEEDTGIYVSEVDPNSIAAKDGRIREGD
400 410 420 430 440 450
470 480 490 500 510 520
pF1KSD RIIQINGIEVQNREEAVALLTSEENKNFSLLIARPELQLDEGWMDDDRNDFLDDLHMDML
::.:::: .:::::::::::...: : . ::.::::.::::::..:.::.::..:...::
CCDS53 RILQINGEDVQNREEAVALLSNDECKRIVLLVARPEIQLDEGWLEDERNEFLEELNLEML
460 470 480 490 500 510
530 540 550 560 570 580
pF1KSD EEQHHQAMQFTAS-VLQQKKHDEDGGTTDTATILSNQHEKDSGVGRTDESTRNDESSEQE
::.:..::: ::. : : ::..:. ::::::: ::.::::::::::::: :::::::::
CCDS53 EEEHNEAMQPTANEVEQPKKQEEEEGTTDTATSSSNNHEKDSGVGRTDESLRNDESSEQE
520 530 540 550 560 570
590 600 610 620 630 640
pF1KSD NNGDDATASSNPLAGQRKLTCSQDTLGSGDLPFSNESFISADCTDADYLGIPVDECERFR
: ..: ...: : ..: : ::::::: .: . :::..:.. :.: .: : ..:::::
CCDS53 NAAEDPNSTS--LKSKRDLGQSQDTLGSVELQY-NESLVSGEYIDSDCIGNPDEDCERFR
580 590 600 610 620
650 660 670 680 690 700
pF1KSD ELLELKCQVKSATPYGLYYPSGPLDAGKSDPESVDKELELLNEELRSIELECLSIVRAHK
.::::::.... : ::: :. .. .... :.:..::.:::::::.::::: .:..::.
CCDS53 QLLELKCKIRNHGEYDLYYSSSTIECNQGEQEGVEHELQLLNEELRNIELECQNIMQAHR
630 640 650 660 670 680
710 720 730 740 750 760
pF1KSD MQQLKEQYRESWMLHNSGFRNYNTSIDVRRHELSDITELPEKSDKDSSSAYNTGESCRST
.:.. .:: . : ::..::::::::::..: .:.:: : ::::::::::::::.::::::
CCDS53 LQKVTDQYGDIWTLHDGGFRNYNTSIDMQRGKLDDIMEHPEKSDKDSSSAYNTAESCRST
690 700 710 720 730 740
770 780 790 800 810 820
pF1KSD PLTLEISPDNSLRRAAEGISCPSSEGAVGTTEAY-GPASKNLLSITEDPEVGTPTYSPSL
:::.. :::.:: :. . . . ......:.. : .::. . : .
CCDS53 PLTVDRSPDSSLPRVINLTNKKNLRSTMAATQSSSGQSSKE-------------STSTKA
750 760 770 780 790
830 840 850 860 870 880
pF1KSD KELDPNQPLESKERRASDGSRSPTPSQKLGS--AYLPSYHHSPYKHAHIPAHAQHYQSYM
: . . ::::. . .::. : . .. :: :: : :..:.:::::.::::::
CCDS53 KTTEQGCSAESKEK-VLEGSKLPDQEKAVSEHIPYLSPYHSSSYRYANIPAHARHYQSYM
800 810 820 830 840 850
890 900 910 920 930 940
pF1KSD QLIQQKSAVEYAQSQMSLVSMCKDLSSPTPSEPRMEWKVKIRSDGTRYITKRPVRDRLLR
:::::::::::::::.:::::::. : :::.:::::::::::::::::::::::.:.
CCDS53 QLIQQKSAVEYAQSQLSLVSMCKE--SQKCSEPKMEWKVKIRSDGTRYITKRPVRDRILK
860 870 880 890 900 910
950 960 970 980 990 1000
pF1KSD ERALKIREERSGMTTDDDAVSEMKMGRYWSKEERKQHLVKAKEQRRRREFMMQSRLDCLK
::::::.:::::::::::..:::::::::::::::::::.::::::::::::.:::.:::
CCDS53 ERALKIKEERSGMTTDDDTMSEMKMGRYWSKEERKQHLVRAKEQRRRREFMMRSRLECLK
920 930 940 950 960 970
1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KSD E--QQAADDRKEMNILELSHKKMMKKRNKKIFDNWMTIQELLTHGTKSPDGTRVYNSFLS
: :.... .::.::.:::::::::::::::.:::::::::.:::.::::::::.:.:::
CCDS53 ESPQSGSEGKKEINIIELSHKKMMKKRNKKILDNWMTIQELMTHGAKSPDGTRVHNAFLS
980 990 1000 1010 1020 1030
pF1KSD VTTV
::::
CCDS53 VTTV
>>CCDS78518.1 PDZD4 gene_id:57595|Hs108|chrX (775 aa)
initn: 2054 init1: 842 opt: 2108 Z-score: 1359.0 bits: 262.7 E(32554): 2.2e-69
Smith-Waterman score: 2499; 51.9% identity (76.4% similar) in 777 aa overlap (304-1066:18-775)
280 290 300 310 320 330
pF1KSD DGSSSEGIFVSKIVDSGPAAKEGGLQIHDRIIEVNGRDLSRATHDQAVEAFKTAKEPIVV
...:::..::. ...:...:....:::.:.
CCDS78 MGCNMCVVQKPEEQYKVMLQVNGKELSKLSQEQTLQALRSSKEPLVI
10 20 30 40
340 350 360 370 380 390
pF1KSD QVLRRTPRTKMFTPPSESQLVDTGTQTDITFEHIMALTKMSSPSPP--VLDPYLLPEEHP
:::::.:: . . . ::::.:::::::::::::: :. :.:: .:.::.: : :
CCDS78 QVLRRSPRLRGDSSCHDLQLVDSGTQTDITFEHIMALGKLRPPTPPMVILEPYVLSELPP
50 60 70 80 90 100
400 410 420 430 440 450
pF1KSD SAHEYYDPNDYIGDIHQEMDR-EELELEEVDLYRMNSQDKLGLTVCYRTDDEDDIGIYIS
.:::::: ... :: :: .::: :::.::. . .::::: ::::::::.:.:::..
CCDS78 ISHEYYDPAEFMEGGPQEADRLDELEYEEVELYKSSHRDKLGLMVCYRTDDEEDLGIYVG
110 120 130 140 150 160
460 470 480 490 500 510
pF1KSD EIDPNSIAAKDGRIREGDRIIQINGIEVQNREEAVALLTSEENKNFSLLIARPELQLDEG
:..::::::::::::::::::::::..:::::::::.:..::: :.:::.:::: :: .
CCDS78 EVNPNSIAAKDGRIREGDRIIQINGVDVQNREEAVAILSQEENTNISLLVARPESQLAKR
170 180 190 200 210 220
520 530 540 550 560 570
pF1KSD WMDDDRNDFLDDLHMDMLEEQHHQAMQFTASVLQQKKHDEDGGTTDTATILSNQHEKDSG
: :.::.:::::. . .: . .: .. . :: ..:. :. :.. :::..: :::
CCDS78 WKDSDRDDFLDDFGSE--NEGELRARKLKSPPAQQPGNEEEKGAPDAGPGLSNSQELDSG
230 240 250 260 270 280
580 590 600 610 620
pF1KSD VGRTDESTRNDESSEQENNGDDATASSNPLAGQRKLTCSQDTLGSGDLPFSNESFIS--A
::::::::::.::::.. ::. .:.: .. ::. . :.: : :. :: .:... :
CCDS78 VGRTDESTRNEESSEHDLLGDEPPSSTNTPGSLRKFGLQGDALQSRDFHFSMDSLLAEGA
290 300 310 320 330 340
630 640 650 660 670 680
pF1KSD DCTDADYLGIPVDECERFRELLELKCQVKSATPYGLYYP--SG---PLDAGKSDPESVDK
.: :. .: ::.:::::.::...... :: .: :: ::.... ::. .
CCDS78 GLGGGDVPGLTDEEYERYRELLEIKCHLENGNQLGLLFPRASGGNSALDVNRN--ESLGH
350 360 370 380 390 400
690 700 710 720 730 740
pF1KSD ELELLNEELRSIELECLSIVRAHKMQQLKEQYRESWMLHNSGFRNYNTSIDVRRHELSDI
:. .:.:::: .:..: .:.::.:::::.:. ..:.:.. .. . .: . ..::::::
CCDS78 EMAMLEEELRHLEFKCRNILRAQKMQQLRERCMKAWLLEEESLYDLAAS-EPKKHELSDI
410 420 430 440 450 460
750 760 770 780 790 800
pF1KSD TELPEKSDKDSSSAYNTGESCRSTPLTLEISPDNSLRRAAEGISCPSSEGAVGTTEAYGP
.::::::::::.:::::::::::::: .: :.. :::: : : .. : ::
CCDS78 SELPEKSDKDSTSAYNTGESCRSTPLLVEPLPESPLRRAMAGNS------NLNRTPP-GP
470 480 490 500 510
810 820 830 840 850 860
pF1KSD ASKNLLSITEDPEVGTPTYSPSLKELDPNQPLESKERRASD--GSRSPTPSQKLGSAYLP
: . . . : :.:. ::.. :: :. .:. .. : :.: . : .
CCDS78 AVATPAKAAPPP--GSPAKFRSLSR-DP----EAGRRQHAEERGRRNPKTGLTLERVGPE
520 530 540 550 560
870 880 890 900 910
pF1KSD SYHHSPYKHAHIPAHAQHYQSYMQLIQQKSAVEYAQSQMSLVSMCK--DLSSPTPSEPRM
: . .: ...::.: .:: .. : ... .::.. . ... . :::
CCDS78 SSPYLSRRHRGQGQEGEHYHSCVQLAPTRGLEELGHGPLSLAGGPRVGGVAAAATEAPRM
570 580 590 600 610 620
920 930 940 950 960 970
pF1KSD EWKVKIRSDGTRYITKRPVRDRLLRERALKIREERSGMTTDDDAVSEMKMGRYWSKEERK
:::::.:::::::..:::::::::. ::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 EWKVKVRSDGTRYVAKRPVRDRLLKARALKIREERSGMTTDDDAVSEMKMGRYWSKEERK
630 640 650 660 670 680
980 990 1000 1010 1020 1030
pF1KSD QHLVKAKEQRRRREFMMQSRLDCLKEQQAADDRKEMNILELSHKKMMKKRNKKIFDNWMT
:::..:.:::.::::::::::.::.::: .:.. :.::. :::.: ::::::::.:::.:
CCDS78 QHLIRAREQRKRREFMMQSRLECLREQQNGDSKPELNIIALSHRKTMKKRNKKILDNWIT
690 700 710 720 730 740
1040 1050 1060
pF1KSD IQELLTHGTKSPDGTRVYNSFLSVTTV
:::.:.::..: :: :::: .::::::
CCDS78 IQEMLAHGARSADGKRVYNPLLSVTTV
750 760 770
>>CCDS8739.1 PDZRN4 gene_id:29951|Hs108|chr12 (778 aa)
initn: 2280 init1: 661 opt: 1969 Z-score: 1270.5 bits: 246.3 E(32554): 1.9e-64
Smith-Waterman score: 3070; 61.4% identity (83.0% similar) in 787 aa overlap (294-1066:11-778)
270 280 290 300 310 320
pF1KSD IGGRPSVDNHDGSSSEGIFVSKIVDSGPAAKEGGLQIHDRIIEVNGRDLSRATHDQAVEA
.: .. .. .:::.:::.:::..::::
CCDS87 MGCNLCTFQKREEHYKLLYEVSQVNGKDLSKATHEEAVEA
10 20 30 40
330 340 350 360 370 380
pF1KSD FKTAKEPIVVQVLRRTPRTK-MFTPPSESQLVDTGTQTDITFEHIMALTKMSSPSPPVLD
:..:::::::::::::: .. . :: ::....:::::::::::::.:. :.::: :
CCDS87 FRNAKEPIVVQVLRRTPLSRPAYGMASEVQLMNASTQTDITFEHIMALAKLRPPTPPVPD
50 60 70 80 90 100
390 400 410 420 430
pF1KSD --PYLLPEE----HPSAHEYYDPNDYIGDIHQEMDR-EELELEEVDLYRMNSQDKLGLTV
:.:: . :: ::.:. :.::... . :: :..: :::.: :..::.::::::
CCDS87 ICPFLLSDSCHSLHPMEHEFYEDNEYISSLPADADRTEDFEYEEVELCRVSSQEKLGLTV
110 120 130 140 150 160
440 450 460 470 480 490
pF1KSD CYRTDDEDDIGIYISEIDPNSIAAKDGRIREGDRIIQINGIEVQNREEAVALLTSEENKN
:::::::.: :::.::.::::::::::::::::::.:::: .:::::::::::...: :
CCDS87 CYRTDDEEDTGIYVSEVDPNSIAAKDGRIREGDRILQINGEDVQNREEAVALLSNDECKR
170 180 190 200 210 220
500 510 520 530 540 550
pF1KSD FSLLIARPELQLDEGWMDDDRNDFLDDLHMDMLEEQHHQAMQFTAS-VLQQKKHDEDGGT
. ::.::::.::::::..:.::.::..:...::::.:..::: ::. : : ::..:. ::
CCDS87 IVLLVARPEIQLDEGWLEDERNEFLEELNLEMLEEEHNEAMQPTANEVEQPKKQEEEEGT
230 240 250 260 270 280
560 570 580 590 600 610
pF1KSD TDTATILSNQHEKDSGVGRTDESTRNDESSEQENNGDDATASSNPLAGQRKLTCSQDTLG
::::: ::.::::::::::::: :::::::::: ..: ...: : ..: : ::::::
CCDS87 TDTATSSSNNHEKDSGVGRTDESLRNDESSEQENAAEDPNSTS--LKSKRDLGQSQDTLG
290 300 310 320 330
620 630 640 650 660 670
pF1KSD SGDLPFSNESFISADCTDADYLGIPVDECERFRELLELKCQVKSATPYGLYYPSGPLDAG
: .: . :::..:.. :.: .: : ..:::::.::::::.... : ::: :. .. .
CCDS87 SVELQY-NESLVSGEYIDSDCIGNPDEDCERFRQLLELKCKIRNHGEYDLYYSSSTIECN
340 350 360 370 380 390
680 690 700 710 720 730
pF1KSD KSDPESVDKELELLNEELRSIELECLSIVRAHKMQQLKEQYRESWMLHNSGFRNYNTSID
... :.:..::.:::::::.::::: .:..::..:.. .:: . : ::..::::::::::
CCDS87 QGEQEGVEHELQLLNEELRNIELECQNIMQAHRLQKVTDQYGDIWTLHDGGFRNYNTSID
400 410 420 430 440 450
740 750 760 770 780 790
pF1KSD VRRHELSDITELPEKSDKDSSSAYNTGESCRSTPLTLEISPDNSLRRAAEGISCPSSEGA
..: .:.:: : ::::::::::::::.:::::::::.. :::.:: :. . . . ...
CCDS87 MQRGKLDDIMEHPEKSDKDSSSAYNTAESCRSTPLTVDRSPDSSLPRVINLTNKKNLRST
460 470 480 490 500 510
800 810 820 830 840 850
pF1KSD VGTTEAY-GPASKNLLSITEDPEVGTPTYSPSLKELDPNQPLESKERRASDGSRSPTPSQ
...:.. : .::. . : . : . . ::::. . .::. : .
CCDS87 MAATQSSSGQSSKE-------------STSTKAKTTEQGCSAESKEK-VLEGSKLPDQEK
520 530 540 550 560
860 870 880 890 900 910
pF1KSD KLGS--AYLPSYHHSPYKHAHIPAHAQHYQSYMQLIQQKSAVEYAQSQMSLVSMCKDLSS
.. :: :: : :..:.:::::.:::::::::::::::::::::.:::::::. :
CCDS87 AVSEHIPYLSPYHSSSYRYANIPAHARHYQSYMQLIQQKSAVEYAQSQLSLVSMCKE--S
570 580 590 600 610 620
920 930 940 950 960 970
pF1KSD PTPSEPRMEWKVKIRSDGTRYITKRPVRDRLLRERALKIREERSGMTTDDDAVSEMKMGR
:::.:::::::::::::::::::::::.:.::::::.:::::::::::..:::::::
CCDS87 QKCSEPKMEWKVKIRSDGTRYITKRPVRDRILKERALKIKEERSGMTTDDDTMSEMKMGR
630 640 650 660 670 680
980 990 1000 1010 1020
pF1KSD YWSKEERKQHLVKAKEQRRRREFMMQSRLDCLKE--QQAADDRKEMNILELSHKKMMKKR
::::::::::::.::::::::::::.:::.:::: :.... .::.::.:::::::::::
CCDS87 YWSKEERKQHLVRAKEQRRRREFMMRSRLECLKESPQSGSEGKKEINIIELSHKKMMKKR
690 700 710 720 730 740
1030 1040 1050 1060
pF1KSD NKKIFDNWMTIQELLTHGTKSPDGTRVYNSFLSVTTV
::::.:::::::::.:::.::::::::.:.:::::::
CCDS87 NKKILDNWMTIQELMTHGAKSPDGTRVHNAFLSVTTV
750 760 770
>>CCDS14732.1 PDZD4 gene_id:57595|Hs108|chrX (769 aa)
initn: 1656 init1: 842 opt: 1812 Z-score: 1170.7 bits: 227.8 E(32554): 6.9e-59
Smith-Waterman score: 2463; 51.5% identity (76.1% similar) in 775 aa overlap (304-1066:18-769)
280 290 300 310 320 330
pF1KSD DGSSSEGIFVSKIVDSGPAAKEGGLQIHDRIIEVNGRDLSRATHDQAVEAFKTAKEPIVV
...:::..::. ...:...:....:::.:.
CCDS14 MGCNMCVVQKPEEQYKVMLQVNGKELSKLSQEQTLQALRSSKEPLVI
10 20 30 40
340 350 360 370 380 390
pF1KSD QVLRRTPRTKMFTPPSESQLVDTGTQTDITFEHIMALTKMSSPSPPVLDPYLLPEEHPSA
:::::.:: . . . ::::.:::::::::::::: :. :.::.. . : : .
CCDS14 QVLRRSPRLRGDSSCHDLQLVDSGTQTDITFEHIMALGKLRPPTPPMV----ILEPPPIS
50 60 70 80 90 100
400 410 420 430 440 450
pF1KSD HEYYDPNDYIGDIHQEMDR-EELELEEVDLYRMNSQDKLGLTVCYRTDDEDDIGIYISEI
:::::: ... :: :: .::: :::.::. . .::::: ::::::::.:.:::..:.
CCDS14 HEYYDPAEFMEGGPQEADRLDELEYEEVELYKSSHRDKLGLMVCYRTDDEEDLGIYVGEV
110 120 130 140 150 160
460 470 480 490 500 510
pF1KSD DPNSIAAKDGRIREGDRIIQINGIEVQNREEAVALLTSEENKNFSLLIARPELQLDEGWM
.::::::::::::::::::::::..:::::::::.:..::: :.:::.:::: :: . :
CCDS14 NPNSIAAKDGRIREGDRIIQINGVDVQNREEAVAILSQEENTNISLLVARPESQLAKRWK
170 180 190 200 210 220
520 530 540 550 560 570
pF1KSD DDDRNDFLDDLHMDMLEEQHHQAMQFTASVLQQKKHDEDGGTTDTATILSNQHEKDSGVG
:.::.:::::. . .: . .: .. . :: ..:. :. :.. :::..: :::::
CCDS14 DSDRDDFLDDFGSE--NEGELRARKLKSPPAQQPGNEEEKGAPDAGPGLSNSQELDSGVG
230 240 250 260 270 280
580 590 600 610 620 630
pF1KSD RTDESTRNDESSEQENNGDDATASSNPLAGQRKLTCSQDTLGSGDLPFSNESFIS--ADC
::::::::.::::.. ::. .:.: .. ::. . :.: : :. :: .:... :
CCDS14 RTDESTRNEESSEHDLLGDEPPSSTNTPGSLRKFGLQGDALQSRDFHFSMDSLLAEGAGL
290 300 310 320 330 340
640 650 660 670 680
pF1KSD TDADYLGIPVDECERFRELLELKCQVKSATPYGLYYP--SG---PLDAGKSDPESVDKEL
.: :. .: ::.:::::.::...... :: .: :: ::.... ::. .:.
CCDS14 GGGDVPGLTDEEYERYRELLEIKCHLENGNQLGLLFPRASGGNSALDVNRN--ESLGHEM
350 360 370 380 390
690 700 710 720 730 740
pF1KSD ELLNEELRSIELECLSIVRAHKMQQLKEQYRESWMLHNSGFRNYNTSIDVRRHELSDITE
.:.:::: .:..: .:.::.:::::.:. ..:.:.. .. . .: . ..::::::.:
CCDS14 AMLEEELRHLEFKCRNILRAQKMQQLRERCMKAWLLEEESLYDLAAS-EPKKHELSDISE
400 410 420 430 440 450
750 760 770 780 790 800
pF1KSD LPEKSDKDSSSAYNTGESCRSTPLTLEISPDNSLRRAAEGISCPSSEGAVGTTEAYGPAS
:::::::::.:::::::::::::: .: :.. :::: : : .. : :::
CCDS14 LPEKSDKDSTSAYNTGESCRSTPLLVEPLPESPLRRAMAGNS------NLNRTPP-GPAV
460 470 480 490 500 510
810 820 830 840 850 860
pF1KSD KNLLSITEDPEVGTPTYSPSLKELDPNQPLESKERRASD--GSRSPTPSQKLGSAYLPSY
. . . : :.:. ::.. :: :. .:. .. : :.: . : . :
CCDS14 ATPAKAAPPP--GSPAKFRSLSR-DP----EAGRRQHAEERGRRNPKTGLTLERVGPESS
520 530 540 550 560
870 880 890 900 910 920
pF1KSD HHSPYKHAHIPAHAQHYQSYMQLIQQKSAVEYAQSQMSLVSMCK--DLSSPTPSEPRMEW
. .: ...::.: .:: .. : ... .::.. . ... . :::::
CCDS14 PYLSRRHRGQGQEGEHYHSCVQLAPTRGLEELGHGPLSLAGGPRVGGVAAAATEAPRMEW
570 580 590 600 610 620
930 940 950 960 970 980
pF1KSD KVKIRSDGTRYITKRPVRDRLLRERALKIREERSGMTTDDDAVSEMKMGRYWSKEERKQH
:::.:::::::..:::::::::. ::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 KVKVRSDGTRYVAKRPVRDRLLKARALKIREERSGMTTDDDAVSEMKMGRYWSKEERKQH
630 640 650 660 670 680
990 1000 1010 1020 1030 1040
pF1KSD LVKAKEQRRRREFMMQSRLDCLKEQQAADDRKEMNILELSHKKMMKKRNKKIFDNWMTIQ
:..:.:::.::::::::::.::.::: .:.. :.::. :::.: ::::::::.:::.:::
CCDS14 LIRAREQRKRREFMMQSRLECLREQQNGDSKPELNIIALSHRKTMKKRNKKILDNWITIQ
690 700 710 720 730 740
1050 1060
pF1KSD ELLTHGTKSPDGTRVYNSFLSVTTV
:.:.::..: :: :::: .::::::
CCDS14 EMLAHGARSADGKRVYNPLLSVTTV
750 760
>>CCDS78517.1 PDZD4 gene_id:57595|Hs108|chrX (660 aa)
initn: 1760 init1: 842 opt: 1711 Z-score: 1107.3 bits: 215.9 E(32554): 2.4e-55
Smith-Waterman score: 2102; 51.2% identity (75.9% similar) in 672 aa overlap (406-1066:8-660)
380 390 400 410 420 430
pF1KSD PSPPVLDPYLLPEEHPSAHEYYDPNDYIGDIHQEMDREELELEEVDLYRMNSQDKLGLTV
... .. .. :.::.::. . .::::: :
CCDS78 MGCNMCVVQKPEEQYKVMLQEVELYKSSHRDKLGLMV
10 20 30
440 450 460 470 480 490
pF1KSD CYRTDDEDDIGIYISEIDPNSIAAKDGRIREGDRIIQINGIEVQNREEAVALLTSEENKN
:::::::.:.:::..:..::::::::::::::::::::::..:::::::::.:..::: :
CCDS78 CYRTDDEEDLGIYVGEVNPNSIAAKDGRIREGDRIIQINGVDVQNREEAVAILSQEENTN
40 50 60 70 80 90
500 510 520 530 540 550
pF1KSD FSLLIARPELQLDEGWMDDDRNDFLDDLHMDMLEEQHHQAMQFTASVLQQKKHDEDGGTT
.:::.:::: :: . : :.::.:::::. . .: . .: .. . :: ..:. :.
CCDS78 ISLLVARPESQLAKRWKDSDRDDFLDDFGSE--NEGELRARKLKSPPAQQPGNEEEKGAP
100 110 120 130 140 150
560 570 580 590 600 610
pF1KSD DTATILSNQHEKDSGVGRTDESTRNDESSEQENNGDDATASSNPLAGQRKLTCSQDTLGS
:.. :::..: :::::::::::::.::::.. ::. .:.: .. ::. . :.: :
CCDS78 DAGPGLSNSQELDSGVGRTDESTRNEESSEHDLLGDEPPSSTNTPGSLRKFGLQGDALQS
160 170 180 190 200 210
620 630 640 650 660
pF1KSD GDLPFSNESFIS--ADCTDADYLGIPVDECERFRELLELKCQVKSATPYGLYYP--SG--
:. :: .:... : .: :. .: ::.:::::.::...... :: .: ::
CCDS78 RDFHFSMDSLLAEGAGLGGGDVPGLTDEEYERYRELLEIKCHLENGNQLGLLFPRASGGN
220 230 240 250 260 270
670 680 690 700 710 720
pF1KSD -PLDAGKSDPESVDKELELLNEELRSIELECLSIVRAHKMQQLKEQYRESWMLHNSGFRN
::.... ::. .:. .:.:::: .:..: .:.::.:::::.:. ..:.:.. .. .
CCDS78 SALDVNRN--ESLGHEMAMLEEELRHLEFKCRNILRAQKMQQLRERCMKAWLLEEESLYD
280 290 300 310 320 330
730 740 750 760 770 780
pF1KSD YNTSIDVRRHELSDITELPEKSDKDSSSAYNTGESCRSTPLTLEISPDNSLRRAAEGISC
.: . ..::::::.::::::::::.:::::::::::::: .: :.. :::: : :
CCDS78 LAAS-EPKKHELSDISELPEKSDKDSTSAYNTGESCRSTPLLVEPLPESPLRRAMAGNS-
340 350 360 370 380 390
790 800 810 820 830 840
pF1KSD PSSEGAVGTTEAYGPASKNLLSITEDPEVGTPTYSPSLKELDPNQPLESKERRASD--GS
.. : ::: . . . : :.:. ::.. :: :. .:. .. :
CCDS78 -----NLNRTPP-GPAVATPAKAAPPP--GSPAKFRSLSR-DP----EAGRRQHAEERGR
400 410 420 430
850 860 870 880 890 900
pF1KSD RSPTPSQKLGSAYLPSYHHSPYKHAHIPAHAQHYQSYMQLIQQKSAVEYAQSQMSLVSMC
:.: . : . : . .: ...::.: .:: .. : ... .::..
CCDS78 RNPKTGLTLERVGPESSPYLSRRHRGQGQEGEHYHSCVQLAPTRGLEELGHGPLSLAGGP
440 450 460 470 480 490
910 920 930 940 950 960
pF1KSD K--DLSSPTPSEPRMEWKVKIRSDGTRYITKRPVRDRLLRERALKIREERSGMTTDDDAV
. ... . ::::::::.:::::::..:::::::::. :::::::::::::::::::
CCDS78 RVGGVAAAATEAPRMEWKVKVRSDGTRYVAKRPVRDRLLKARALKIREERSGMTTDDDAV
500 510 520 530 540 550
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD SEMKMGRYWSKEERKQHLVKAKEQRRRREFMMQSRLDCLKEQQAADDRKEMNILELSHKK
::::::::::::::::::..:.:::.::::::::::.::.::: .:.. :.::. :::.:
CCDS78 SEMKMGRYWSKEERKQHLIRAREQRKRREFMMQSRLECLREQQNGDSKPELNIIALSHRK
560 570 580 590 600 610
1030 1040 1050 1060
pF1KSD MMKKRNKKIFDNWMTIQELLTHGTKSPDGTRVYNSFLSVTTV
::::::::.:::.::::.:.::..: :: :::: .::::::
CCDS78 TMKKRNKKILDNWITIQEMLAHGARSADGKRVYNPLLSVTTV
620 630 640 650 660
1066 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 05:00:36 2016 done: Thu Nov 3 05:00:36 2016
Total Scan time: 4.450 Total Display time: 0.270
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]