Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA1073
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA1073, 643 aa
1>>>pF1KSDA1073 643 - 643 aa - 643 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1834+/-0.00097; mu= 15.1444+/- 0.058
mean_var=82.0910+/-16.495, 0's: 0 Z-trim(106.3): 27 B-trim: 232 in 1/50
Lambda= 0.141555
statistics sampled from 8897 (8922) to 8897 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.639), E-opt: 0.2 (0.274), width: 16
Scan time: 3.350
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS8305.1 MTMR2 gene_id:8898|Hs108|chr11 ( 643) 4286 885.4 0
CCDS8306.1 MTMR2 gene_id:8898|Hs108|chr11 ( 571) 3853 796.9 0
CCDS14695.1 MTMR1 gene_id:8776|Hs108|chrX ( 665) 3076 638.3 1e-182
CCDS78512.1 MTMR1 gene_id:8776|Hs108|chrX ( 673) 3073 637.7 1.5e-182
CCDS14694.1 MTM1 gene_id:4534|Hs108|chrX ( 603) 2687 558.8 7.5e-159
CCDS78513.1 MTMR1 gene_id:8776|Hs108|chrX ( 363) 1367 289.2 6.8e-78
CCDS14379.1 MTMR8 gene_id:55613|Hs108|chrX ( 704) 1305 276.6 7.9e-74
CCDS9313.1 MTMR6 gene_id:9107|Hs108|chr13 ( 621) 1279 271.3 2.8e-72
CCDS34851.1 MTMR7 gene_id:9108|Hs108|chr8 ( 660) 1260 267.4 4.3e-71
CCDS5979.1 MTMR9 gene_id:66036|Hs108|chr8 ( 549) 1149 244.7 2.5e-64
CCDS46682.1 MTMR3 gene_id:8897|Hs108|chr22 (1161) 966 207.5 8.5e-53
CCDS13871.1 MTMR3 gene_id:8897|Hs108|chr22 (1170) 966 207.5 8.5e-53
CCDS13870.1 MTMR3 gene_id:8897|Hs108|chr22 (1198) 966 207.5 8.7e-53
CCDS11608.1 MTMR4 gene_id:9110|Hs108|chr17 (1195) 909 195.8 2.8e-49
CCDS14091.2 SBF1 gene_id:6305|Hs108|chr22 (1893) 470 106.3 4e-22
CCDS31427.1 SBF2 gene_id:81846|Hs108|chr11 (1849) 468 105.9 5.2e-22
CCDS45204.1 MTMR10 gene_id:54893|Hs108|chr15 ( 777) 448 101.6 4.2e-21
CCDS77998.1 MTMR12 gene_id:54545|Hs108|chr5 ( 693) 405 92.8 1.7e-18
CCDS34138.1 MTMR12 gene_id:54545|Hs108|chr5 ( 747) 392 90.2 1.1e-17
CCDS72901.1 MTMR11 gene_id:10903|Hs108|chr1 ( 640) 384 88.5 3e-17
CCDS72902.1 MTMR11 gene_id:10903|Hs108|chr1 ( 709) 384 88.5 3.3e-17
>>CCDS8305.1 MTMR2 gene_id:8898|Hs108|chr11 (643 aa)
initn: 4286 init1: 4286 opt: 4286 Z-score: 4729.7 bits: 885.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4286; 99.8% identity (99.8% similar) in 643 aa overlap (1-643:1-643)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD METSSSCESLGSQPAAARPPSVDSLSSASTSHSENSVHTKSASVVSSDSISTSADNFSPD
:: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 MEKSSSCESLGSQPAAARPPSVDSLSSASTSHSENSVHTKSASVVSSDSISTSADNFSPD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD LRVLRESNKLAEMEEPPLLPGENIKDMAKDVTYICPFTGAVRGTLTVTNYRLYFKSMERD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 LRVLRESNKLAEMEEPPLLPGENIKDMAKDVTYICPFTGAVRGTLTVTNYRLYFKSMERD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD PPFVLDASLGVINRVEKIGGASSRGENSYGLETVCKDIRNLRFAHKPEGRTRRSIFENLM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 PPFVLDASLGVINRVEKIGGASSRGENSYGLETVCKDIRNLRFAHKPEGRTRRSIFENLM
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD KYAFPVSNNLPLFAFEYKEVFPENGWKLYDPLLEYRRQGIPNESWRITKINERYELCDTY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 KYAFPVSNNLPLFAFEYKEVFPENGWKLYDPLLEYRRQGIPNESWRITKINERYELCDTY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD PALLVVPANIPDEELKRVASFRSRGRIPVLSWIHPESQATITRCSQPMVGVSGKRSKEDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 PALLVVPANIPDEELKRVASFRSRGRIPVLSWIHPESQATITRCSQPMVGVSGKRSKEDE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD KYLQAIMDSNAQSHKIFIFDARPSVNAVANKAKGGGYESEDAYQNAELVFLDIHNIHVMR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 KYLQAIMDSNAQSHKIFIFDARPSVNAVANKAKGGGYESEDAYQNAELVFLDIHNIHVMR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD ESLRKLKEIVYPNIEETHWLSNLESTHWLEHIKLILAGALRIADKVESGKTSVVVHCSDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 ESLRKLKEIVYPNIEETHWLSNLESTHWLEHIKLILAGALRIADKVESGKTSVVVHCSDG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD WDRTAQLTSLAMLMLDGYYRTIRGFEVLVEKEWLSFGHRFQLRVGHGDKNHADADRSPVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 WDRTAQLTSLAMLMLDGYYRTIRGFEVLVEKEWLSFGHRFQLRVGHGDKNHADADRSPVF
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD LQFIDCVWQMTRQFPTAFEFNEYFLITILDHLYSCLFGTFLCNSEQQRGKENLPKRTVSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 LQFIDCVWQMTRQFPTAFEFNEYFLITILDHLYSCLFGTFLCNSEQQRGKENLPKRTVSL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD WSYINSQLEDFTNPLYGSYSNHVLYPVASMRHLELWVGYYIRWNPRMKPQEPIHNRYKEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 WSYINSQLEDFTNPLYGSYSNHVLYPVASMRHLELWVGYYIRWNPRMKPQEPIHNRYKEL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640
pF1KSD LAKRAELQKKVEELQREISNRSTSSSERASSPAQCVTPVQTVV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 LAKRAELQKKVEELQREISNRSTSSSERASSPAQCVTPVQTVV
610 620 630 640
>>CCDS8306.1 MTMR2 gene_id:8898|Hs108|chr11 (571 aa)
initn: 3853 init1: 3853 opt: 3853 Z-score: 4252.6 bits: 796.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3853; 100.0% identity (100.0% similar) in 571 aa overlap (73-643:1-571)
50 60 70 80 90 100
pF1KSD SVVSSDSISTSADNFSPDLRVLRESNKLAEMEEPPLLPGENIKDMAKDVTYICPFTGAVR
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 MEEPPLLPGENIKDMAKDVTYICPFTGAVR
10 20 30
110 120 130 140 150 160
pF1KSD GTLTVTNYRLYFKSMERDPPFVLDASLGVINRVEKIGGASSRGENSYGLETVCKDIRNLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 GTLTVTNYRLYFKSMERDPPFVLDASLGVINRVEKIGGASSRGENSYGLETVCKDIRNLR
40 50 60 70 80 90
170 180 190 200 210 220
pF1KSD FAHKPEGRTRRSIFENLMKYAFPVSNNLPLFAFEYKEVFPENGWKLYDPLLEYRRQGIPN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 FAHKPEGRTRRSIFENLMKYAFPVSNNLPLFAFEYKEVFPENGWKLYDPLLEYRRQGIPN
100 110 120 130 140 150
230 240 250 260 270 280
pF1KSD ESWRITKINERYELCDTYPALLVVPANIPDEELKRVASFRSRGRIPVLSWIHPESQATIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 ESWRITKINERYELCDTYPALLVVPANIPDEELKRVASFRSRGRIPVLSWIHPESQATIT
160 170 180 190 200 210
290 300 310 320 330 340
pF1KSD RCSQPMVGVSGKRSKEDEKYLQAIMDSNAQSHKIFIFDARPSVNAVANKAKGGGYESEDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 RCSQPMVGVSGKRSKEDEKYLQAIMDSNAQSHKIFIFDARPSVNAVANKAKGGGYESEDA
220 230 240 250 260 270
350 360 370 380 390 400
pF1KSD YQNAELVFLDIHNIHVMRESLRKLKEIVYPNIEETHWLSNLESTHWLEHIKLILAGALRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 YQNAELVFLDIHNIHVMRESLRKLKEIVYPNIEETHWLSNLESTHWLEHIKLILAGALRI
280 290 300 310 320 330
410 420 430 440 450 460
pF1KSD ADKVESGKTSVVVHCSDGWDRTAQLTSLAMLMLDGYYRTIRGFEVLVEKEWLSFGHRFQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 ADKVESGKTSVVVHCSDGWDRTAQLTSLAMLMLDGYYRTIRGFEVLVEKEWLSFGHRFQL
340 350 360 370 380 390
470 480 490 500 510 520
pF1KSD RVGHGDKNHADADRSPVFLQFIDCVWQMTRQFPTAFEFNEYFLITILDHLYSCLFGTFLC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 RVGHGDKNHADADRSPVFLQFIDCVWQMTRQFPTAFEFNEYFLITILDHLYSCLFGTFLC
400 410 420 430 440 450
530 540 550 560 570 580
pF1KSD NSEQQRGKENLPKRTVSLWSYINSQLEDFTNPLYGSYSNHVLYPVASMRHLELWVGYYIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 NSEQQRGKENLPKRTVSLWSYINSQLEDFTNPLYGSYSNHVLYPVASMRHLELWVGYYIR
460 470 480 490 500 510
590 600 610 620 630 640
pF1KSD WNPRMKPQEPIHNRYKELLAKRAELQKKVEELQREISNRSTSSSERASSPAQCVTPVQTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 WNPRMKPQEPIHNRYKELLAKRAELQKKVEELQREISNRSTSSSERASSPAQCVTPVQTV
520 530 540 550 560 570
pF1KSD V
:
CCDS83 V
>>CCDS14695.1 MTMR1 gene_id:8776|Hs108|chrX (665 aa)
initn: 3077 init1: 2585 opt: 3076 Z-score: 3394.0 bits: 638.3 E(32554): 1e-182
Smith-Waterman score: 3076; 69.7% identity (89.4% similar) in 634 aa overlap (11-643:33-665)
10 20 30 40
pF1KSD METSSSCESLGSQPAAARPPSVDSLSSASTSHSENSVHTK
:. :..: :::..:.: . :: : .
CCDS14 RPAAAAAAGCEGGGGPNPGPAGGRRPPRAAGGATAGSRQPSVETLDSPTGSHVEWCKQLI
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KSD SASVVSSDSISTSADNFSPDLRVLRESNKLAEMEEPPLLPGENIKDMAKDVTYICPFTGA
.:.. :. : :....: : : ..::..::::.::: ::.:::.:: ..::: ::::: ::
CCDS14 AATISSQISGSVTSENVSRDYKALRDGNKLAQMEEAPLFPGESIKAIVKDVMYICPFMGA
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KSD VRGTLTVTNYRLYFKSMERDPPFVLDASLGVINRVEKIGGASSRGENSYGLETVCKDIRN
: ::::::...::::..:::: :.::. ::::.:::::: :.:.:.:: :.: ::::.::
CCDS14 VSGTLTVTDFKLYFKNVERDPHFILDVPLGVISRVEKIG-AQSHGDNSCGIEIVCKDMRN
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KSD LRFAHKPEGRTRRSIFENLMKYAFPVSNNLPLFAFEYKEVFPENGWKLYDPLLEYRRQGI
::.:.: : ... .::::: :.:::.::. :::: ::: :: ::::.:::. ::.:::.
CCDS14 LRLAYKQEEQSKLGIFENLNKHAFPLSNGQALFAFSYKEKFPINGWKVYDPVSEYKRQGL
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KSD PNESWRITKINERYELCDTYPALLVVPANIPDEELKRVASFRSRGRIPVLSWIHPESQAT
:::::.:.::: ::.::::::..:::... :..:..::.::..::.:::::::::::::
CCDS14 PNESWKISKINSNYEFCDTYPAIIVVPTSVKDDDLSKVAAFRAKGRVPVLSWIHPESQAT
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KSD ITRCSQPMVGVSGKRSKEDEKYLQAIMDSNAQSHKIFIFDARPSVNAVANKAKGGGYESE
:::::::.:: . :: ::::::::.:::.::::::..::::: . : .::.::::::::
CCDS14 ITRCSQPLVGPNDKRCKEDEKYLQTIMDANAQSHKLIIFDARQNSVADTNKTKGGGYESE
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KSD DAYQNAELVFLDIHNIHVMRESLRKLKEIVYPNIEETHWLSNLESTHWLEHIKLILAGAL
.:: :::::::.::::::::::::::::::::.:.:..::::...:::::.:...::::.
CCDS14 SAYPNAELVFLEIHNIHVMRESLRKLKEIVYPSIDEARWLSNVDGTHWLEYIRMLLAGAV
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KSD RIADKVESGKTSVVVHCSDGWDRTAQLTSLAMLMLDGYYRTIRGFEVLVEKEWLSFGHRF
:::::.::::::::::::::::::::::::::::::.:::::.:::.::::::.::::::
CCDS14 RIADKIESGKTSVVVHCSDGWDRTAQLTSLAMLMLDSYYRTIKGFETLVEKEWISFGHRF
430 440 450 460 470 480
470 480 490 500 510 520
pF1KSD QLRVGHGDKNHADADRSPVFLQFIDCVWQMTRQFPTAFEFNEYFLITILDHLYSCLFGTF
::::::. :::::::::.::::.:::::::::::.:::::: :::::::::::::::::
CCDS14 ALRVGHGNDNHADADRSPIFLQFVDCVWQMTRQFPSAFEFNELFLITILDHLYSCLFGTF
490 500 510 520 530 540
530 540 550 560 570 580
pF1KSD LCNSEQQRGKENLPKRTVSLWSYINSQLEDFTNPLYGSYSNHVLYPVASMRHLELWVGYY
::: :::: ::.. .:.::::::::::..:.::.. .: :::::::::. ::::::.::
CCDS14 LCNCEQQRFKEDVYTKTISLWSYINSQLDEFSNPFFVNYENHVLYPVASLSHLELWVNYY
550 560 570 580 590 600
590 600 610 620 630
pF1KSD IRWNPRMKPQEPIHNRYKELLAKRAELQKKVEELQREISNRS-TSSSERASSPAQCVTPV
.::::::.:: :::. ::::: ::::::.:: ::::...:. .:::::.:::.. .: :
CCDS14 VRWNPRMRPQMPIHQNLKELLAVRAELQKRVEGLQREVATRAVSSSSERGSSPSHSATSV
610 620 630 640 650 660
640
pF1KSD QTVV
.: :
CCDS14 HTSV
>>CCDS78512.1 MTMR1 gene_id:8776|Hs108|chrX (673 aa)
initn: 3046 init1: 2585 opt: 3073 Z-score: 3390.6 bits: 637.7 E(32554): 1.5e-182
Smith-Waterman score: 3073; 69.3% identity (88.6% similar) in 642 aa overlap (11-643:33-673)
10 20 30 40
pF1KSD METSSSCESLGSQPAAARPPSVDSLSSASTSHSENSVHTK
:. :..: :::..:.: . :: : .
CCDS78 RPAAAAAAGCEGGGGPNPGPAGGRRPPRAAGGATAGSRQPSVETLDSPTGSHVEWCKQLI
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90
pF1KSD SASVVSSDSISTSADNFS--------PDLRVLRESNKLAEMEEPPLLPGENIKDMAKDVT
.:.. :. : :....: : ::::.::..::::.::: ::.:::.:: ..:::
CCDS78 AATISSQISGSVTSENVSRDYKVFRRPDLRALRDGNKLAQMEEAPLFPGESIKAIVKDVM
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KSD YICPFTGAVRGTLTVTNYRLYFKSMERDPPFVLDASLGVINRVEKIGGASSRGENSYGLE
::::: ::: ::::::...::::..:::: :.::. ::::.:::::: :.:.:.:: :.:
CCDS78 YICPFMGAVSGTLTVTDFKLYFKNVERDPHFILDVPLGVISRVEKIG-AQSHGDNSCGIE
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KSD TVCKDIRNLRFAHKPEGRTRRSIFENLMKYAFPVSNNLPLFAFEYKEVFPENGWKLYDPL
::::.::::.:.: : ... .::::: :.:::.::. :::: ::: :: ::::.:::.
CCDS78 IVCKDMRNLRLAYKQEEQSKLGIFENLNKHAFPLSNGQALFAFSYKEKFPINGWKVYDPV
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KSD LEYRRQGIPNESWRITKINERYELCDTYPALLVVPANIPDEELKRVASFRSRGRIPVLSW
::.:::.:::::.:.::: ::.::::::..:::... :..:..::.::..::.:::::
CCDS78 SEYKRQGLPNESWKISKINSNYEFCDTYPAIIVVPTSVKDDDLSKVAAFRAKGRVPVLSW
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KSD IHPESQATITRCSQPMVGVSGKRSKEDEKYLQAIMDSNAQSHKIFIFDARPSVNAVANKA
:::::::::::::::.:: . :: ::::::::.:::.::::::..::::: . : .::.
CCDS78 IHPESQATITRCSQPLVGPNDKRCKEDEKYLQTIMDANAQSHKLIIFDARQNSVADTNKT
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KSD KGGGYESEDAYQNAELVFLDIHNIHVMRESLRKLKEIVYPNIEETHWLSNLESTHWLEHI
::::::::.:: :::::::.::::::::::::::::::::.:.:..::::...:::::.:
CCDS78 KGGGYESESAYPNAELVFLEIHNIHVMRESLRKLKEIVYPSIDEARWLSNVDGTHWLEYI
370 380 390 400 410 420
400 410 420 430 440 450
pF1KSD KLILAGALRIADKVESGKTSVVVHCSDGWDRTAQLTSLAMLMLDGYYRTIRGFEVLVEKE
...::::.:::::.::::::::::::::::::::::::::::::.:::::.:::.:::::
CCDS78 RMLLAGAVRIADKIESGKTSVVVHCSDGWDRTAQLTSLAMLMLDSYYRTIKGFETLVEKE
430 440 450 460 470 480
460 470 480 490 500 510
pF1KSD WLSFGHRFQLRVGHGDKNHADADRSPVFLQFIDCVWQMTRQFPTAFEFNEYFLITILDHL
:.:::::: ::::::. :::::::::.::::.:::::::::::.:::::: :::::::::
CCDS78 WISFGHRFALRVGHGNDNHADADRSPIFLQFVDCVWQMTRQFPSAFEFNELFLITILDHL
490 500 510 520 530 540
520 530 540 550 560 570
pF1KSD YSCLFGTFLCNSEQQRGKENLPKRTVSLWSYINSQLEDFTNPLYGSYSNHVLYPVASMRH
::::::::::: :::: ::.. .:.::::::::::..:.::.. .: :::::::::. :
CCDS78 YSCLFGTFLCNCEQQRFKEDVYTKTISLWSYINSQLDEFSNPFFVNYENHVLYPVASLSH
550 560 570 580 590 600
580 590 600 610 620 630
pF1KSD LELWVGYYIRWNPRMKPQEPIHNRYKELLAKRAELQKKVEELQREISNRS-TSSSERASS
:::::.::.::::::.:: :::. ::::: ::::::.:: ::::...:. .:::::.::
CCDS78 LELWVNYYVRWNPRMRPQMPIHQNLKELLAVRAELQKRVEGLQREVATRAVSSSSERGSS
610 620 630 640 650 660
640
pF1KSD PAQCVTPVQTVV
:.. .: :.: :
CCDS78 PSHSATSVHTSV
670
>>CCDS14694.1 MTM1 gene_id:4534|Hs108|chrX (603 aa)
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Smith-Waterman score: 2687; 65.0% identity (84.1% similar) in 603 aa overlap (42-641:2-601)
20 30 40 50 60 70
pF1KSD SQPAAARPPSVDSLSSASTSHSENSVHTKSASVVSSDSISTSADNFSPDLRVLRESNKLA
::. .: : : .: : :. :.. .
CCDS14 MASASTSKYNSHSLENESIK-RTSRDGVNRD
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KSD EMEEPPLLPGEN-IKDMAKDVTYICPFTGAVRGTLTVTNYRLYFKSMERDPPFVLDASLG
: : ::::. : : :.: :::::.: ..: . .::::::..:.: : ..::. ::
CCDS14 LTEAVPRLPGETLITD--KEVIYICPFNGPIKGRVYITNYRLYLRSLETDSSLILDVPLG
40 50 60 70 80
140 150 160 170 180 190
pF1KSD VINRVEKIGGASSRGENSYGLETVCKDIRNLRFAHKPEGRTRRSIFENLMKYAFPVSNNL
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CCDS14 VISRIEKMGGATSRGENSYGLDITCKDMRNLRFALKQEGHSRRDMFEILTRYAFPLAHSL
90 100 110 120 130 140
200 210 220 230 240 250
pF1KSD PLFAFEYKEVFPENGWKLYDPLLEYRRQGIPNESWRITKINERYELCDTYPALLVVPANI
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CCDS14 PLFAFLNEEKFNVDGWTVYNPVEEYRRQGLPNHHWRITFINKCYELCDTYPALLVVPYRA
150 160 170 180 190 200
260 270 280 290 300 310
pF1KSD PDEELKRVASFRSRGRIPVLSWIHPESQATITRCSQPMVGVSGKRSKEDEKYLQAIMDSN
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CCDS14 SDDDLRRVATFRSRNRIPVLSWIHPENKTVIVRCSQPLVGMSGKRNKDDEKYLDVIRETN
210 220 230 240 250 260
320 330 340 350 360 370
pF1KSD AQSHKIFIFDARPSVNAVANKAKGGGYESEDAYQNAELVFLDIHNIHVMRESLRKLKEIV
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CCDS14 KQISKLTIYDARPSVNAVANKATGGGYESDDAYHNAELFFLDIHNIHVMRESLKKVKDIV
270 280 290 300 310 320
380 390 400 410 420 430
pF1KSD YPNIEETHWLSNLESTHWLEHIKLILAGALRIADKVESGKTSVVVHCSDGWDRTAQLTSL
:::.::.::::.::::::::::::.:.::...:::: :::.::.::::::::::::::::
CCDS14 YPNVEESHWLSSLESTHWLEHIKLVLTGAIQVADKVSSGKSSVLVHCSDGWDRTAQLTSL
330 340 350 360 370 380
440 450 460 470 480 490
pF1KSD AMLMLDGYYRTIRGFEVLVEKEWLSFGHRFQLRVGHGDKNHADADRSPVFLQFIDCVWQM
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CCDS14 AMLMLDSFYRSIEGFEILVQKEWISFGHKFASRIGHGDKNHTDADRSPIFLQFIDCVWQM
390 400 410 420 430 440
500 510 520 530 540 550
pF1KSD TRQFPTAFEFNEYFLITILDHLYSCLFGTFLCNSEQQRGKENLPKRTVSLWSYINSQLED
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CCDS14 SKQFPTAFEFNEQFLIIILDHLYSCRFGTFLFNCESARERQKVTERTVSLWSLINSNKEK
450 460 470 480 490 500
560 570 580 590 600
pF1KSD FTNPLYGSYSNHVLYPVASMRHLELWVGYYIRWNPRMKPQEP--IHNRYKELLAKRAELQ
: ::.: . :.:::::::::::::::.::::::::.: :.: ...:: :::: : :
CCDS14 FKNPFYTKEINRVLYPVASMRHLELWVNYYIRWNPRIKQQQPNPVEQRYMELLALRDEYI
510 520 530 540 550 560
610 620 630 640
pF1KSD KKVEELQREISNRSTSSSERASSPAQCVTPVQTVV
:..:::: : . .. :::.: . :::
CCDS14 KRLEELQLANSAKLSDPPTSPSSPSQMMPHVQTHF
570 580 590 600
>>CCDS78513.1 MTMR1 gene_id:8776|Hs108|chrX (363 aa)
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Smith-Waterman score: 1367; 62.0% identity (85.4% similar) in 321 aa overlap (11-331:33-352)
10 20 30 40
pF1KSD METSSSCESLGSQPAAARPPSVDSLSSASTSHSENSVHTK
:. :..: :::..:.: . :: : .
CCDS78 RPAAAAAAGCEGGGGPNPGPAGGRRPPRAAGGATAGSRQPSVETLDSPTGSHVEWCKQLI
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KSD SASVVSSDSISTSADNFSPDLRVLRESNKLAEMEEPPLLPGENIKDMAKDVTYICPFTGA
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CCDS78 AATISSQISGSVTSENVSRDYKALRDGNKLAQMEEAPLFPGESIKAIVKDVMYICPFMGA
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KSD VRGTLTVTNYRLYFKSMERDPPFVLDASLGVINRVEKIGGASSRGENSYGLETVCKDIRN
: ::::::...::::..:::: :.::. ::::.:::::: :.:.:.:: :.: ::::.::
CCDS78 VSGTLTVTDFKLYFKNVERDPHFILDVPLGVISRVEKIG-AQSHGDNSCGIEIVCKDMRN
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KSD LRFAHKPEGRTRRSIFENLMKYAFPVSNNLPLFAFEYKEVFPENGWKLYDPLLEYRRQGI
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CCDS78 LRLAYKQEEQSKLGIFENLNKHAFPLSNGQALFAFSYKEKFPINGWKVYDPVSEYKRQGL
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KSD PNESWRITKINERYELCDTYPALLVVPANIPDEELKRVASFRSRGRIPVLSWIHPESQAT
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CCDS78 PNESWKISKINSNYEFCDTYPAIIVVPTSVKDDDLSKVAAFRAKGRVPVLSWIHPESQAT
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KSD ITRCSQPMVGVSGKRSKEDEKYLQAIMDSNAQSHKIFIFDARPSVNAVANKAKGGGYESE
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CCDS78 ITRCSQPLVGPNDKRCKEDEKYLQTIMDANAQSHKLIIFDARQNSVADTNKLWYQDTASL
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KSD DAYQNAELVFLDIHNIHVMRESLRKLKEIVYPNIEETHWLSNLESTHWLEHIKLILAGAL
CCDS78 ME
>>CCDS14379.1 MTMR8 gene_id:55613|Hs108|chrX (704 aa)
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130 140 150 160 170 180
pF1KSD LDASLGVINRVEKIGGASSRGENSYGLETVCKDIRNLRFAHKPEGRTRRSIFENLMKYAF
::..: .:. . . . .. .:.: .
CCDS14 ARKETWIALHHIATVEKLPITSLGCPLTLRCKNFRVAHFVLDSD-LVCHEVYISLLKLSQ
50 60 70 80 90 100
190 200 210 220 230
pF1KSD PVSNNLP--LFAFEY-----KEVFPENGWKLYDPLLEYRRQGIPNESWRITKINERYELC
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CCDS14 PA---LPEDLYAFSYNPKSSKEMR-ESGWKLIDPISDFGRMGIPNRNWTITDANRNYEIC
110 120 130 140 150
240 250 260 270 280 290
pF1KSD DTYPALLVVPANIPDEELKRVASFRSRGRIPVLSWIHPESQATITRCSQPMVGVSGKRSK
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CCDS14 STYPPEIVVPKSVTLGTVVGSSKFRSKERVPVLSYLYKENNAAICRCSQPLSGFY-TRCV
160 170 180 190 200 210
300 310 320 330 340 350
pF1KSD EDEKYLQAIMDSNAQSHKIFIFDARPSVNAVANKAKGGGYESEDAYQNAELVFLDIHNIH
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CCDS14 DDELLLEAISQTNPGSQFMYVVDTRPKLNAMANRAAGKGYENEDNYANIRFRFMGIENIH
220 230 240 250 260 270
360 370 380 390 400 410
pF1KSD VMRESLRKLKEIVY---PNIEETHWLSNLESTHWLEHIKLILAGALRIADKVESGKTSVV
::: ::.:: :. :.. : .::.:::. ::.::: :. ... :. :. :.::.
CCDS14 VMRSSLQKLLEVCELKTPTMSE--FLSGLESSGWLRHIKAIMDAGIFITKAVKVEKASVL
280 290 300 310 320 330
420 430 440 450 460 470
pF1KSD VHCSDGWDRTAQLTSLAMLMLDGYYRTIRGFEVLVEKEWLSFGHRFQLRVGHGDKNHADA
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CCDS14 VHCSDGWDRTAQVCSVASILLDPFYRTFKGLMILIEKEWISMGHKFSQRCGHLDGDSKEV
340 350 360 370 380 390
480 490 500 510 520 530
pF1KSD DRSPVFLQFIDCVWQMTRQFPTAFEFNEYFLITILDHLYSCLFGTFLCNSEQQRGKENLP
::.: ::.::.::. .::: :::::: ::. : ::..:: ::.:: : ...: .
CCDS14 --SPIFTQFLDCIWQLMEQFPCAFEFNENFLLEIHDHVFSCQFGNFLGNCQKDREDLRVY
400 410 420 430 440 450
540 550 560 570 580 590
pF1KSD KRTVSLWSYINSQLEDFTNPLYGSYSNH-VLYPVASMRHLELWVGYYIRWNPRMKPQEPI
..: :.: .. .. :: :::: ... . :: : . ....: :.: :.. ..:.. .
CCDS14 EKTHSVWPFLVQRKPDFRNPLYKGFTMYGVLNPSTVPYNIQFWCGMYNRFDKGLQPKQSM
460 470 480 490 500 510
600 610 620 630 640
pF1KSD HNRYKELLAKRAELQKKVEELQREISNRSTSSSERASSPAQCVTPVQTVV
. :. .:: :. :.::..... :. :
CCDS14 LESLLEIKKQRAMLETDVHELEKKLKVRDEPPEEICTCSQLGNILSQHLGSPLTNPLGFM
520 530 540 550 560 570
CCDS14 GINGDLNTLMENGTLSREGGLRAQMDQVKSQGADLHHNCCEIVGSLRAINISGDVGISEA
580 590 600 610 620 630
>>CCDS9313.1 MTMR6 gene_id:9107|Hs108|chr13 (621 aa)
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70 80 90 100 110 120
pF1KSD LAEMEEPPLLPGENIKDMAKDVTYICPFTGAVRGTLTVTNYRLYFKSMERDPPFVLDASL
.. ::: .: .: : . .. ..:
CCDS93 MEHIRTTKVEQVKLLDRFSTSNKSLTGTLYLTATHLLFIDSHQKETWILHHH-
10 20 30 40 50
130 140 150 160 170 180
pF1KSD GVINRVEKIGGASSRGENSYGLETVCKDIRNLRFAHKPEGRTRRSIFENLMKYAFPVSNN
: :::.. ..: . : ::..:...: :. : ..:...:.. . .. .
CCDS93 --IASVEKLALTTS----GCPLVIQCKNFRTVHFI-VPRERDCHDIYNSLLQLSKQAKYE
60 70 80 90 100
190 200 210 220 230 240
pF1KSD LPLFAFEY--KEVFPE--NGWKLYDPLLEYRRQGIPNESWRITKINERYELCDTYPALLV
:.:: : :. : .::.: : ::.:.:.:: :... :. :..:.::: :
CCDS93 -DLYAFSYNPKQNDSERLQGWQLIDLAEEYKRMGVPNSHWQLSDANRDYKICETYPRELY
110 120 130 140 150 160
250 260 270 280 290 300
pF1KSD VPANIPDEELKRVASFRSRGRIPVLSWIHPESQATITRCSQPMVGVSGKRSKEDEKYLQA
:: . ..:::.::.::::. : ...:.: :::::. : :. : :::. :::
CCDS93 VPRIASKPIIVGSSKFRSKGRFPVLSYYHQDKEAAICRCSQPLSGFSA-RCLEDEHLLQA
170 180 190 200 210 220
310 320 330 340 350 360
pF1KSD IMDSNAQSHKIFIFDARPSVNAVANKAKGGGYESEDAYQNAELVFLDIHNIHVMRESLRK
: .: .. ....:.::..::.::.: : :::.:: :.: .. :. :.:::::: ::.:
CCDS93 ISKANPVNRYMYVMDTRPKLNAMANRAAGKGYENEDNYSNIRFQFVGIENIHVMRSSLQK
230 240 250 260 270 280
370 380 390 400 410 420
pF1KSD LKEIV-YPNIEETHWLSNLESTHWLEHIKLILAGALRIADKVESGKTSVVVHCSDGWDRT
: :. .. . . :.:::. ::.::: .. .:. .: . ..::.::::::::::
CCDS93 LLEVNGTKGLSVNDFYSGLESSGWLRHIKAVMDAAIFLAKAITVENASVLVHCSDGWDRT
290 300 310 320 330 340
430 440 450 460 470 480
pF1KSD AQLTSLAMLMLDGYYRTIRGFEVLVEKEWLSFGHRFQLRVGHGDKNHADADRSPVFLQFI
.:. ::. :.::.:::::.:: ::.::.:.::::.:. : :. : . .. :::: ::.
CCDS93 SQVCSLGSLLLDSYYRTIKGFMVLIEKDWISFGHKFSERCGQLDGDPKEV--SPVFTQFL
350 360 370 380 390 400
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pF1KSD DCVWQMTRQFPTAFEFNEYFLITILDHLYSCLFGTFLCNSEQQRGKENLPKRTVSLWSYI
.:::..:.::: ::::.: ::. : .:..:: ::.:: : ...: . .: ..: ::: ..
CCDS93 ECVWHLTEQFPQAFEFSEAFLLQIHEHIHSCQFGNFLGNCQKEREELKLKEKTYSLWPFL
410 420 430 440 450 460
550 560 570 580 590 600
pF1KSD NSQLEDFTNPLYGSYSNH--VLYPVASMRHLELWVGYYIRWNPRMKPQEPIHNRYKELLA
. . . ::::.: :.. :: : . ....: ..: ... ..:.. . : ..
CCDS93 LEDQKKYLNPLYSSESHRFTVLEPNTVSFNFKFWRNMYHQFDRTLHPRQSVFNIIMNMNE
470 480 490 500 510 520
610 620 630 640
pF1KSD KRAELQKKVEELQREISNRSTSSSERASSPAQCVTPVQTVV
. .:.: ...:. .:..:......
CCDS93 QNKQLEKDIKDLESKIKQRKNKQTDGILTKELLHSVHPESPNLKTSLCFKEQTLLPVNDA
530 540 550 560 570 580
>>CCDS34851.1 MTMR7 gene_id:9108|Hs108|chr8 (660 aa)
initn: 846 init1: 529 opt: 1260 Z-score: 1389.7 bits: 267.4 E(32554): 4.3e-71
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70 80 90 100 110 120
pF1KSD LRVLRESNKLAEMEEPPLLPGENIKDMAKDVTYICPFTGAVRGTLTVTNYRLYFKSMERD
: . : .:. ::: .: .. : :
CCDS34 MEHIRTPKVENVRLVDRVSPKKAAL-GTLYLTATHVIFVENSPD
10 20 30 40
130 140 150 160 170
pF1KSD P---PFVLDASLGVINRVEKIGGASSRGENSYGLETVCKDIRNLRFAHKPEGRTRRSIFE
: ..: .. :. .:: .... : : ::... ... :. : ....
CCDS34 PRKETWILHSQ---ISTIEK-QATTATGCP---LLIRCKNFQIIQLI-IPQERDCHDVYI
50 60 70 80 90
180 190 200 210 220 230
pF1KSD NLMKYAFPVSNNLPLFAFEYKEVFP----ENGWKLYDPLLEYRRQGIPNESWRITKINER
.:.. : ::. . :. : .. .. :.:: : : :: :.:.::. :... .:.
CCDS34 SLIRLARPVKYE-ELYCFSFNPMLDKEEREQGWVLIDLSEEYTRMGLPNHYWQLSDVNRD
100 110 120 130 140 150
240 250 260 270 280 290
pF1KSD YELCDTYPALLVVPANIPDEELKRVASFRSRGRIPVLSWIHPESQATITRCSQPMVGVSG
:..::.::. : :: . . . ..:::: :.::::. . ...:.: : :::. : :.
CCDS34 YRVCDSYPTELYVPKSATAHIIVGSSKFRSRRRFPVLSYYYKDNHASICRSSQPLSGFSA
160 170 180 190 200 210
300 310 320 330 340 350
pF1KSD KRSKEDEKYLQAIMDSNAQSHKIFIFDARPSVNAVANKAKGGGYESEDAYQNAELVFLDI
: :::..:::: .: : ... :.::..::.::.: : :::.:: :.: .. :. :
CCDS34 -RCLEDEQMLQAIRKANPGSDFVYVVDTRPKLNAMANRAAGKGYENEDNYSNIKFQFIGI
220 230 240 250 260 270
360 370 380 390 400 410
pF1KSD HNIHVMRESLRKLKEIVY---PNIEETHWLSNLESTHWLEHIKLILAGALRIADKVESGK
.::::::.::.:. :. :.. . : .::.. ::.::: :. ... :: :
CCDS34 ENIHVMRNSLQKMLEVCELKSPSMSDFLW--GLENSGWLRHIKAIMDAGIFIAKAVSEEG
280 290 300 310 320 330
420 430 440 450 460 470
pF1KSD TSVVVHCSDGWDRTAQLTSLAMLMLDGYYRTIRGFEVLVEKEWLSFGHRFQLRVGHGDKN
.::.::::::::::::. :.: :.:: .:::..:: ::.::.:.::::.:. : :. : .
CCDS34 ASVLVHCSDGWDRTAQVCSVASLLLDPHYRTLKGFMVLIEKDWISFGHKFNHRYGNLDGD
340 350 360 370 380 390
480 490 500 510 520 530
pF1KSD HADADRSPVFLQFIDCVWQMTRQFPTAFEFNEYFLITILDHLYSCLFGTFLCNSEQQRGK
. :::. :::.::::. .::: :::::: ::: : :.::: ::.:::::...: .
CCDS34 PKEI--SPVIDQFIECVWQLMEQFPCAFEFNERFLIHIQHHIYSCQFGNFLCNSQKERRE
400 410 420 430 440
540 550 560 570 580
pF1KSD ENLPKRTVSLWSYINSQLEDFTNPLY---GSYSNHVLY-PVASMRHL-ELWVGYYIRWNP
.. .:: :::... .. :. :::. : .. .:. :.. . ..: :.: :..
CCDS34 LKIQERTYSLWAHLWKNRADYLNPLFRADHSQTQGTLHLPTTPCNFMYKFWSGMYNRFEK
450 460 470 480 490 500
590 600 610 620 630 640
pF1KSD RMKPQEPIHNRYKELLAKRAELQKKVEELQREISNRSTSSSERASSPAQCVTPVQTVV
:.:.. . . :.: . : :. :::.
CCDS34 GMQPRQSVTDY---LMAVKEETQQLEEELEALEERLEKIQKVQLNCTKVKSKQSEPSKHS
510 520 530 540 550 560
>>CCDS5979.1 MTMR9 gene_id:66036|Hs108|chr8 (549 aa)
initn: 1035 init1: 321 opt: 1149 Z-score: 1268.5 bits: 244.7 E(32554): 2.5e-64
Smith-Waterman score: 1149; 36.4% identity (66.2% similar) in 547 aa overlap (96-630:20-548)
70 80 90 100 110 120
pF1KSD ESNKLAEMEEPPLLPGENIKDMAKDVTYICPFTGAVRGTLTVTNYRLYFKSMERDPP--F
:: ::.::: .:...: ..: . . .
CCDS59 MEFAELIKTPRVDNVVLHRPFYPAVEGTLCLTGHHLILSSRQDNTEELW
10 20 30 40
130 140 150 160 170 180
pF1KSD VLDASLGVINRVEKIGGASSRGENSYGLETV-CKDIRNLRFAHKPEGRTRRSIFENLMKY
.: ... .:.. : .: : . :::.: ... : . .: ..
CCDS59 LLHSNIDAIDK---------RFVGSLGTIIIKCKDFRIIQL-DIPGMEECLNIASSIEAL
50 60 70 80 90
190 200 210 220 230 240
pF1KSD AFPVSNNLPLFAFEYKEVFP--ENGWKLYDPLLEYRRQGIPNESWRITKINERYELCDTY
. : .: .. : :. .: :.::. . : :.. . . ::.. .:... .: .:
CCDS59 STLDSITL-MYPFFYRPMFEVIEDGWHSFLPEQEFELYSSATSEWRLSYVNKEFAVCPSY
100 110 120 130 140 150
250 260 270 280 290 300
pF1KSD PALLVVPANIPDEELKRVASFRSRGRIPVLSWIHPESQATITRCSQPMVGVSGKRSKEDE
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CCDS59 PPIVTVPKSIDDEALRKVATFRHGGRFPVLSYYHKKNGMVIMRSGQPLTGTNGRRCKEDE
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