Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA1027
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA1027, 2541 aa
1>>>pF1KSDA1027 2541 - 2541 aa - 2541 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.4309+/-0.00123; mu= 15.9819+/- 0.074
mean_var=120.4486+/-23.837, 0's: 0 Z-trim(103.8): 66 B-trim: 3 in 1/51
Lambda= 0.116862
statistics sampled from 7542 (7607) to 7542 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.564), E-opt: 0.2 (0.234), width: 16
Scan time: 6.620
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS35009.1 TLN1 gene_id:7094|Hs108|chr9 (2541) 16015 2713.1 0
CCDS32261.1 TLN2 gene_id:83660|Hs108|chr15 (2542) 12507 2121.7 0
CCDS34669.1 HIP1 gene_id:3092|Hs108|chr7 (1037) 382 77.3 4.7e-13
CCDS31922.1 HIP1R gene_id:9026|Hs108|chr12 (1068) 372 75.6 1.6e-12
CCDS10316.1 MESDC1 gene_id:59274|Hs108|chr15 ( 362) 362 73.7 2e-12
>>CCDS35009.1 TLN1 gene_id:7094|Hs108|chr9 (2541 aa)
initn: 16015 init1: 16015 opt: 16015 Z-score: 14586.1 bits: 2713.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 16015; 100.0% identity (100.0% similar) in 2541 aa overlap (1-2541:1-2541)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MVALSLKISIGNVVKTMQFEPSTMVYDACRIIRERIPEAPAGPPSDFGLFLSDDDPKKGI
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CCDS35 MVALSLKISIGNVVKTMQFEPSTMVYDACRIIRERIPEAPAGPPSDFGLFLSDDDPKKGI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD WLEAGKALDYYMLRNGDTMEYRKKQRPLKIRMLDGTVKTIMVDDSKTVTDMLMTICARIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 WLEAGKALDYYMLRNGDTMEYRKKQRPLKIRMLDGTVKTIMVDDSKTVTDMLMTICARIG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD ITNHDEYSLVRELMEEKKEEITGTLRKDKTLLRDEKKMEKLKQKLHTDDELNWLDHGRTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 ITNHDEYSLVRELMEEKKEEITGTLRKDKTLLRDEKKMEKLKQKLHTDDELNWLDHGRTL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD REQGVEEHETLLLRRKFFYSDQNVDSRDPVQLNLLYVQARDDILNGSHPVSFDKACEFAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 REQGVEEHETLLLRRKFFYSDQNVDSRDPVQLNLLYVQARDDILNGSHPVSFDKACEFAG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD FQCQIQFGPHNEQKHKAGFLDLKDFLPKEYVKQKGERKIFQAHKNCGQMSEIEAKVRYVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 FQCQIQFGPHNEQKHKAGFLDLKDFLPKEYVKQKGERKIFQAHKNCGQMSEIEAKVRYVK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD LARSLKTYGVSFFLVKEKMKGKNKLVPRLLGITKECVMRVDEKTKEVIQEWNLTNIKRWA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 LARSLKTYGVSFFLVKEKMKGKNKLVPRLLGITKECVMRVDEKTKEVIQEWNLTNIKRWA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD ASPKSFTLDFGDYQDGYYSVQTTEGEQIAQLIAGYIDIILKKKKSKDHFGLEGDEESTML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 ASPKSFTLDFGDYQDGYYSVQTTEGEQIAQLIAGYIDIILKKKKSKDHFGLEGDEESTML
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD EDSVSPKKSTVLQQQYNRVGKVEHGSVALPAIMRSGASGPENFQVGSMPPAQQQITSGQM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 EDSVSPKKSTVLQQQYNRVGKVEHGSVALPAIMRSGASGPENFQVGSMPPAQQQITSGQM
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD HRGHMPPLTSAQQALTGTINSSMQAVQAAQATLDDFDTLPPLGQDAASKAWRKNKMDESK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 HRGHMPPLTSAQQALTGTINSSMQAVQAAQATLDDFDTLPPLGQDAASKAWRKNKMDESK
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD HEIHSQVDAITAGTASVVNLTAGDPAETDYTAVGCAVTTISSNLTEMSRGVKLLAALLED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 HEIHSQVDAITAGTASVVNLTAGDPAETDYTAVGCAVTTISSNLTEMSRGVKLLAALLED
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD EGGSGRPLLQAAKGLAGAVSELLRSAQPASAEPRQNLLQAAGNVGQASGELLQQIGESDT
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CCDS35 EGGSGRPLLQAAKGLAGAVSELLRSAQPASAEPRQNLLQAAGNVGQASGELLQQIGESDT
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD DPHFQDALMQLAKAVASAAAALVLKAKSVAQRTEDSGLQTQVIAAATQCALSTSQLVACT
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CCDS35 DPHFQDALMQLAKAVASAAAALVLKAKSVAQRTEDSGLQTQVIAAATQCALSTSQLVACT
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD KVVAPTISSPVCQEQLVEAGRLVAKAVEGCVSASQAATEDGQLLRGVGAAATAVTQALNE
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CCDS35 KVVAPTISSPVCQEQLVEAGRLVAKAVEGCVSASQAATEDGQLLRGVGAAATAVTQALNE
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD LLQHVKAHATGAGPAGRYDQATDTILTVTENIFSSMGDAGEMVRQARILAQATSDLVNAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 LLQHVKAHATGAGPAGRYDQATDTILTVTENIFSSMGDAGEMVRQARILAQATSDLVNAI
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD KADAEGESDLENSRKLLSAAKILADATAKMVEAAKGAAAHPDSEEQQQRLREAAEGLRMA
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CCDS35 KADAEGESDLENSRKLLSAAKILADATAKMVEAAKGAAAHPDSEEQQQRLREAAEGLRMA
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD TNAAAQNAIKKKLVQRLEHAAKQAAASATQTIAAAQHAASTPKASAGPQPLLVQSCKAVA
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CCDS35 TNAAAQNAIKKKLVQRLEHAAKQAAASATQTIAAAQHAASTPKASAGPQPLLVQSCKAVA
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD EQIPLLVQGVRGSQAQPDSPSAQLALIAASQSFLQPGGKMVAAAKASVPTIQDQASAMQL
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CCDS35 EQIPLLVQGVRGSQAQPDSPSAQLALIAASQSFLQPGGKMVAAAKASVPTIQDQASAMQL
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD SQCAKNLGTALAELRTAAQKAQEACGPLEMDSALSVVQNLEKDLQEVKAAARDGKLKPLP
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CCDS35 SQCAKNLGTALAELRTAAQKAQEACGPLEMDSALSVVQNLEKDLQEVKAAARDGKLKPLP
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD GETMEKCTQDLGNSTKAVSSAIAQLLGEVAQGNENYAGIAARDVAGGLRSLAQAARGVAA
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CCDS35 GETMEKCTQDLGNSTKAVSSAIAQLLGEVAQGNENYAGIAARDVAGGLRSLAQAARGVAA
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD LTSDPAVQAIVLDTASDVLDKASSLIEEAKKAAGHPGDPESQQRLAQVAKAVTQALNRCV
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CCDS35 LTSDPAVQAIVLDTASDVLDKASSLIEEAKKAAGHPGDPESQQRLAQVAKAVTQALNRCV
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KSD SCLPGQRDVDNALRAVGDASKRLLSDSLPPSTGTFQEAQSRLNEAAAGLNQAATELVQAS
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CCDS35 SCLPGQRDVDNALRAVGDASKRLLSDSLPPSTGTFQEAQSRLNEAAAGLNQAATELVQAS
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KSD RGTPQDLARASGRFGQDFSTFLEAGVEMAGQAPSQEDRAQVVSNLKGISMSSSKLLLAAK
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CCDS35 RGTPQDLARASGRFGQDFSTFLEAGVEMAGQAPSQEDRAQVVSNLKGISMSSSKLLLAAK
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KSD ALSTDPAAPNLKSQLAAAARAVTDSINQLITMCTQQAPGQKECDNALRELETVRELLENP
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CCDS35 ALSTDPAAPNLKSQLAAAARAVTDSINQLITMCTQQAPGQKECDNALRELETVRELLENP
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KSD VQPINDMSYFGCLDSVMENSKVLGEAMTGISQNAKNGNLPEFGDAISTASKALCGFTEAA
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CCDS35 VQPINDMSYFGCLDSVMENSKVLGEAMTGISQNAKNGNLPEFGDAISTASKALCGFTEAA
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KSD AQAAYLVGVSDPNSQAGQQGLVEPTQFARANQAIQMACQSLGEPGCTQAQVLSAATIVAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 AQAAYLVGVSDPNSQAGQQGLVEPTQFARANQAIQMACQSLGEPGCTQAQVLSAATIVAK
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KSD HTSALCNSCRLASARTTNPTAKRQFVQSAKEVANSTANLVKTIKALDGAFTEENRAQCRA
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CCDS35 HTSALCNSCRLASARTTNPTAKRQFVQSAKEVANSTANLVKTIKALDGAFTEENRAQCRA
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KSD ATAPLLEAVDNLSAFASNPEFSSIPAQISPEGRAAMEPIVISAKTMLESAGGLIQTARAL
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CCDS35 ATAPLLEAVDNLSAFASNPEFSSIPAQISPEGRAAMEPIVISAKTMLESAGGLIQTARAL
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KSD AVNPRDPPSWSVLAGHSRTVSDSIKKLITSMRDKAPGQLECETAIAALNSCLRDLDQASL
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CCDS35 AVNPRDPPSWSVLAGHSRTVSDSIKKLITSMRDKAPGQLECETAIAALNSCLRDLDQASL
1630 1640 1650 1660 1670 1680
1690 1700 1710 1720 1730 1740
pF1KSD AAVSQQLAPREGISQEALHTQMLTAVQEISHLIEPLANAARAEASQLGHKVSQMAQYFEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 AAVSQQLAPREGISQEALHTQMLTAVQEISHLIEPLANAARAEASQLGHKVSQMAQYFEP
1690 1700 1710 1720 1730 1740
1750 1760 1770 1780 1790 1800
pF1KSD LTLAAVGAASKTLSHPQQMALLDQTKTLAESALQLLYTAKEAGGNPKQAAHTQEALEEAV
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CCDS35 LTLAAVGAASKTLSHPQQMALLDQTKTLAESALQLLYTAKEAGGNPKQAAHTQEALEEAV
1750 1760 1770 1780 1790 1800
1810 1820 1830 1840 1850 1860
pF1KSD QMMTEAVEDLTTTLNEAASAAGVVGGMVDSITQAINQLDEGPMGEPEGSFVDYQTTMVRT
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CCDS35 QMMTEAVEDLTTTLNEAASAAGVVGGMVDSITQAINQLDEGPMGEPEGSFVDYQTTMVRT
1810 1820 1830 1840 1850 1860
1870 1880 1890 1900 1910 1920
pF1KSD AKAIAVTVQEMVTKSNTSPEELGPLANQLTSDYGRLASEAKPAAVAAENEEIGSHIKHRV
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CCDS35 AKAIAVTVQEMVTKSNTSPEELGPLANQLTSDYGRLASEAKPAAVAAENEEIGSHIKHRV
1870 1880 1890 1900 1910 1920
1930 1940 1950 1960 1970 1980
pF1KSD QELGHGCAALVTKAGALQCSPSDAYTKKELIECARRVSEKVSHVLAALQAGNRGTQACIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 QELGHGCAALVTKAGALQCSPSDAYTKKELIECARRVSEKVSHVLAALQAGNRGTQACIT
1930 1940 1950 1960 1970 1980
1990 2000 2010 2020 2030 2040
pF1KSD AASAVSGIIADLDTTIMFATAGTLNREGTETFADHREGILKTAKVLVEDTKVLVQNAAGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 AASAVSGIIADLDTTIMFATAGTLNREGTETFADHREGILKTAKVLVEDTKVLVQNAAGS
1990 2000 2010 2020 2030 2040
2050 2060 2070 2080 2090 2100
pF1KSD QEKLAQAAQSSVATITRLADVVKLGAASLGAEDPETQVVLINAVKDVAKALGDLISATKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 QEKLAQAAQSSVATITRLADVVKLGAASLGAEDPETQVVLINAVKDVAKALGDLISATKA
2050 2060 2070 2080 2090 2100
2110 2120 2130 2140 2150 2160
pF1KSD AAGKVGDDPAVWQLKNSAKVMVTNVTSLLKTVKAVEDEATKGTRALEATTEHIRQELAVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 AAGKVGDDPAVWQLKNSAKVMVTNVTSLLKTVKAVEDEATKGTRALEATTEHIRQELAVF
2110 2120 2130 2140 2150 2160
2170 2180 2190 2200 2210 2220
pF1KSD CSPEPPAKTSTPEDFIRMTKGITMATAKAVAAGNSCRQEDVIATANLSRRAIADMLRACK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 CSPEPPAKTSTPEDFIRMTKGITMATAKAVAAGNSCRQEDVIATANLSRRAIADMLRACK
2170 2180 2190 2200 2210 2220
2230 2240 2250 2260 2270 2280
pF1KSD EAAYHPEVAPDVRLRALHYGRECANGYLELLDHVLLTLQKPSPELKQQLTGHSKRVAGSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 EAAYHPEVAPDVRLRALHYGRECANGYLELLDHVLLTLQKPSPELKQQLTGHSKRVAGSV
2230 2240 2250 2260 2270 2280
2290 2300 2310 2320 2330 2340
pF1KSD TELIQAAEAMKGTEWVDPEDPTVIAENELLGAAAAIEAAAKKLEQLKPRAKPKEADESLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 TELIQAAEAMKGTEWVDPEDPTVIAENELLGAAAAIEAAAKKLEQLKPRAKPKEADESLN
2290 2300 2310 2320 2330 2340
2350 2360 2370 2380 2390 2400
pF1KSD FEEQILEAAKSIAAATSALVKAASAAQRELVAQGKVGAIPANALDDGQWSQGLISAARMV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 FEEQILEAAKSIAAATSALVKAASAAQRELVAQGKVGAIPANALDDGQWSQGLISAARMV
2350 2360 2370 2380 2390 2400
2410 2420 2430 2440 2450 2460
pF1KSD AAATNNLCEAANAAVQGHASQEKLISSAKQVAASTAQLLVACKVKADQDSEAMKRLQAAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 AAATNNLCEAANAAVQGHASQEKLISSAKQVAASTAQLLVACKVKADQDSEAMKRLQAAG
2410 2420 2430 2440 2450 2460
2470 2480 2490 2500 2510 2520
pF1KSD NAVKRASDNLVKAAQKAAAFEEQENETVVVKEKMVGGIAQIIAAQEEMLRKERELEEARK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 NAVKRASDNLVKAAQKAAAFEEQENETVVVKEKMVGGIAQIIAAQEEMLRKERELEEARK
2470 2480 2490 2500 2510 2520
2530 2540
pF1KSD KLAQIRQQQYKFLPSELRDEH
:::::::::::::::::::::
CCDS35 KLAQIRQQQYKFLPSELRDEH
2530 2540
>>CCDS32261.1 TLN2 gene_id:83660|Hs108|chr15 (2542 aa)
initn: 5388 init1: 5087 opt: 12507 Z-score: 11389.7 bits: 2121.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 12507; 76.1% identity (93.2% similar) in 2543 aa overlap (1-2540:1-2540)
10 20 30 40 50
pF1KSD MVALSLKISIG--NVVKTMQFEPSTMVYDACRIIRERIPEAPAGPPSDFGLFLSDDDPKK
:::::::: . :::::::::::: ::::::.::::.::: .: ::.::::::.::.:
CCDS32 MVALSLKICVRHCNVVKTMQFEPSTAVYDACRVIRERVPEAQTGQASDYGLFLSDEDPRK
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KSD GIWLEAGKALDYYMLRNGDTMEYRKKQRPLKIRMLDGTVKTIMVDDSKTVTDMLMTICAR
:::::::..:::::::::: .::.::::: :::::::.:::.:::::::: ..:.:::.:
CCDS32 GIWLEAGRTLDYYMLRNGDILEYKKKQRPQKIRMLDGSVKTVMVDDSKTVGELLVTICSR
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KSD IGITNHDEYSLVRELMEEKKEEITGTLRKDKTLLRDEKKMEKLKQKLHTDDELNWLDHGR
:::::..::::..: .:::::: ::::.::.::::::.:::::: ::::::.::::::.:
CCDS32 IGITNYEEYSLIQETIEEKKEEGTGTLKKDRTLLRDERKMEKLKAKLHTDDDLNWLDHSR
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KSD TLREQGVEEHETLLLRRKFFYSDQNVDSRDPVQLNLLYVQARDDILNGSHPVSFDKACEF
:.:::::.:.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::
CCDS32 TFREQGVDENETLLLRRKFFYSDQNVDSRDPVQLNLLYVQARDDILNGSHPVSFEKACEF
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KSD AGFQCQIQFGPHNEQKHKAGFLDLKDFLPKEYVKQKG-ERKIFQAHKNCGQMSEIEAKVR
.::: ::::::: :.::: ::::::.::::::.::.: :..::: :::::.::::::::.
CCDS32 GGFQAQIQFGPHVEHKHKPGFLDLKEFLPKEYIKQRGAEKRIFQEHKNCGEMSEIEAKVK
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KSD YVKLARSLKTYGVSFFLVKEKMKGKNKLVPRLLGITKECVMRVDEKTKEVIQEWNLTNIK
::::::::.::::::::::::::::::::::::::::. :::::::::::.::: ::..:
CCDS32 YVKLARSLRTYGVSFFLVKEKMKGKNKLVPRLLGITKDSVMRVDEKTKEVLQEWPLTTVK
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KSD RWAASPKSFTLDFGDYQDGYYSVQTTEGEQIAQLIAGYIDIILKKKKSKDHFGLEGDEES
::::::::::::::.::..::::::::::::.::::::::::::::.:::.:::::::::
CCDS32 RWAASPKSFTLDFGEYQESYYSVQTTEGEQISQLIAGYIDIILKKKQSKDRFGLEGDEES
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KSD TMLEDSVSPKKSTVLQQQYNRVGKVEHGSVALPAIMRSGASGPENFQVGSMPPAQQQITS
::::.::::::::.::::.::.::.:::::::::.::::.::::.:.::::: :::.
CCDS32 TMLEESVSPKKSTILQQQFNRTGKAEHGSVALPAVMRSGSSGPETFNVGSMPSPQQQVMV
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KSD GQMHRGHMPPLTSAQQALTGTINSSMQAVQAAQATLDDFDTLPPLGQDAASKAWRKNKMD
:::::::::::::::::: ::::.::.::: :: :...:.::::::: ::..: .::.:
CCDS32 GQMHRGHMPPLTSAQQALMGTINTSMHAVQQAQDDLSELDSLPPLGQDMASRVWVQNKVD
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CCDS32 ESKHEIHSQVDAITAGTASVVNLTAGDPADTDYTAVGCAITTISSNLTEMSKGVKLLAAL
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CCDS32 ARKKLAQIRQQQYKFLPTELREDEG
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. .:.... ..: .:.:: : :. . : . .: . . :: : :: : .
CCDS34 ENMKTESQRVVLQLKGHVSELE---ADLAEQQHLRQQAADDCEFLRAELDEL-RRQREDT
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.. .:. .: .:: : .. ..: . : : : :. . :..
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:. : .::. .. :. .::.: .. .. .:: : .:.. :. .:.
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....:. ...::::.:. ..:.. ... .. .:. .:.:: :. : ..:. :.
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CCDS34 KDLQREIVESGRGTASPKEFYAKNSRWTEGLISASKAVGWGATVMVDAADLVVQGRGKFE
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. .. . .. : . .: ..:. : ::.. :.::...:...:..
CCDS34 ETDNMDFSSMTLTQIKRQEMDSQVRVLELENELQKERQKLGELRKKHYELAGVAEGWEEG
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CCDS34 TEASPPTLQEVVTEKE
1030
>>CCDS31922.1 HIP1R gene_id:9026|Hs108|chr12 (1068 aa)
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: .. .: .:.:. : :::: .::: . :. : :. .:.
CCDS31 ELKLS--ESVFRQLNTA--IAVSQMSSGQCRLAPLIQVIQDCSHLYHYTV-----KLLFK
190 200 210 220 230
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: . :.. : ::. ... . :. : :: : . : : : :. ..
CCDS31 LHSCLPADTLQ-GHR-DRFHEQFHSLR-NFFRRASDMLYFKR----LIQIPRLPEGPPNF
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pF1KSD LYTAKEAGGNPKQAAHTQEALEEAVQMMTEAVEDLTTTLNEAASAAGVVGGMVDSITQAI
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CCDS31 L-----------RASALAEHIKPVVVIPEEAPED-----EEPENLIEISTGPPAGEPVVV
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