Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA0977
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0977, 1166 aa
1>>>pF1KSDA0977 1166 - 1166 aa - 1166 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.7970+/-0.00103; mu= -3.1308+/- 0.062
mean_var=233.1301+/-47.283, 0's: 0 Z-trim(110.7): 25 B-trim: 0 in 0/53
Lambda= 0.083999
statistics sampled from 11787 (11801) to 11787 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.683), E-opt: 0.2 (0.363), width: 16
Scan time: 4.260
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS2223.2 COBLL1 gene_id:22837|Hs108|chr2 (1166) 7642 939.9 0
CCDS63046.1 COBLL1 gene_id:22837|Hs108|chr2 (1233) 6194 764.4 0
CCDS63045.1 COBLL1 gene_id:22837|Hs108|chr2 (1128) 4693 582.5 1.9e-165
CCDS75602.1 COBL gene_id:23242|Hs108|chr7 (1271) 764 106.4 4.5e-22
CCDS75601.1 COBL gene_id:23242|Hs108|chr7 ( 379) 712 99.9 1.2e-20
CCDS34637.1 COBL gene_id:23242|Hs108|chr7 (1261) 712 100.1 3.5e-20
>>CCDS2223.2 COBLL1 gene_id:22837|Hs108|chr2 (1166 aa)
initn: 7642 init1: 7642 opt: 7642 Z-score: 5015.1 bits: 939.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 7642; 100.0% identity (100.0% similar) in 1166 aa overlap (1-1166:1-1166)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MDGRTPRPQDAPARRKPKAKAPLPPAETKYTDVSSAADSVESTAFIMEQKENMIDKDVEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 MDGRTPRPQDAPARRKPKAKAPLPPAETKYTDVSSAADSVESTAFIMEQKENMIDKDVEL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD SVVLPGDIIKSTTVHGSKPMMDLLIFLCAQYHLNPSSYTIDLLSAEQNHIKFKPNTPIGM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 SVVLPGDIIKSTTVHGSKPMMDLLIFLCAQYHLNPSSYTIDLLSAEQNHIKFKPNTPIGM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD LEVEKVILKPKMLDKKKPTPIIPEKTVRVVINFKKTQKTIVRVSPHASLQELAPIICSKC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 LEVEKVILKPKMLDKKKPTPIIPEKTVRVVINFKKTQKTIVRVSPHASLQELAPIICSKC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD EFDPLHTLLLKDYQSQEPLDLTKSLNDLGLRELYAMDVNRESCQISQNLDIMKEKENKGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 EFDPLHTLLLKDYQSQEPLDLTKSLNDLGLRELYAMDVNRESCQISQNLDIMKEKENKGF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD FSFFQRSKKKRDQTASAPATPLVNKHRPTFTRSNTISKPYISNTLPSDAPKKRRAPLPPM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 FSFFQRSKKKRDQTASAPATPLVNKHRPTFTRSNTISKPYISNTLPSDAPKKRRAPLPPM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD PASQSVPQDLAHIQERPASCIVKSMSVDETDKSPCEAGRVRAGSLQLSSMSAGNSSLRRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 PASQSVPQDLAHIQERPASCIVKSMSVDETDKSPCEAGRVRAGSLQLSSMSAGNSSLRRT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD KRKAPSPPSKIPPHQSDENSRVTALQPVDGVPPDSASEANSPEELSSPETFHPGLSSQEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 KRKAPSPPSKIPPHQSDENSRVTALQPVDGVPPDSASEANSPEELSSPETFHPGLSSQEQ
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD CTAPKLMEETSVFECPGTPEAAITSLTSGISSDYSLEEIDEKEELSEVPKVEAENISPKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 CTAPKLMEETSVFECPGTPEAAITSLTSGISSDYSLEEIDEKEELSEVPKVEAENISPKS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD QDIPFVSTDIINTLKNDPDSALGNGSGEFSQNSMEEKQETKSTDGQEPHSVVYDTSNGKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 QDIPFVSTDIINTLKNDPDSALGNGSGEFSQNSMEEKQETKSTDGQEPHSVVYDTSNGKK
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD VVDSIRNLKSLGPNQENVQNEIIVYPENTEDNMKNGVKKTEINVEGVAKNNNIDMEVERP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 VVDSIRNLKSLGPNQENVQNEIIVYPENTEDNMKNGVKKTEINVEGVAKNNNIDMEVERP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD SNSEAHETDTAISYKENHLAASSVPDQKLNQPSAEKTKDAAIQTTPSCNSFDGKHQDHNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 SNSEAHETDTAISYKENHLAASSVPDQKLNQPSAEKTKDAAIQTTPSCNSFDGKHQDHNL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD SDSKVEECVQTSNNNISTQHSCLSSQDSVNTSREFRSQGTLIIHSEDPLTVKDPICAHGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 SDSKVEECVQTSNNNISTQHSCLSSQDSVNTSREFRSQGTLIIHSEDPLTVKDPICAHGN
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD DDLLPPVDRIDKNSTASYLKNYPLYRQDYNPKPKPSNEITREYIPKIGMTTYKIVPPKSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 DDLLPPVDRIDKNSTASYLKNYPLYRQDYNPKPKPSNEITREYIPKIGMTTYKIVPPKSL
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD EISKDWQSETIEYKDDQDMHALGKKHTHENVKETAIQTEDSAISESPEEPLPNLKPKPNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 EISKDWQSETIEYKDDQDMHALGKKHTHENVKETAIQTEDSAISESPEEPLPNLKPKPNL
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD RTEHQVPSSVSSPDDAMVSPLKPAPKMTRDTGTAPFAPNLEEINNILESKFKSRASNAQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 RTEHQVPSSVSSPDDAMVSPLKPAPKMTRDTGTAPFAPNLEEINNILESKFKSRASNAQA
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD KPSSFFLQMQKRVSGHYVTSAAAKSVHAAPNPAPKELTNKEAERDMLPSPEQTLSPLSKM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 KPSSFFLQMQKRVSGHYVTSAAAKSVHAAPNPAPKELTNKEAERDMLPSPEQTLSPLSKM
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD PHSVPQPLVEKTDDDVIGQAPAEASPPPIAPKPVTIPASQVSTQNLKTLKTFGAPRPYSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 PHSVPQPLVEKTDDDVIGQAPAEASPPPIAPKPVTIPASQVSTQNLKTLKTFGAPRPYSS
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD SGPSPFALAVVKRSQSFSKERTESPSASALVQPPANTEEGKTHSVNKFVDIPQLGVSDKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 SGPSPFALAVVKRSQSFSKERTESPSASALVQPPANTEEGKTHSVNKFVDIPQLGVSDKE
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD NNSAHNEQNSQIPTPTDGPSFTVMRQSSLTFQSSDPEQMRQSLLTAIRSGEAAAKLKRVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 NNSAHNEQNSQIPTPTDGPSFTVMRQSSLTFQSSDPEQMRQSLLTAIRSGEAAAKLKRVT
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160
pF1KSD IPSNTISVNGRSRLSHSMSPDAQDGH
::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 IPSNTISVNGRSRLSHSMSPDAQDGH
1150 1160
>>CCDS63046.1 COBLL1 gene_id:22837|Hs108|chr2 (1233 aa)
initn: 5350 init1: 3995 opt: 6194 Z-score: 4066.3 bits: 764.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 7570; 98.2% identity (98.2% similar) in 1187 aa overlap (1-1166:47-1233)
10 20
pF1KSD MDGRTPRPQDAPARR-------KPKAKAPL
::::::::::::::: ::::::::
CCDS63 AASSRTPGREMGQAVTRRLGAGARAAPRRAMDGRTPRPQDAPARREIAGSWRKPKAKAPL
20 30 40 50 60 70
30 40 50 60 70 80
pF1KSD PPAETKYTDVSSAADSVESTAFIMEQKENMIDKDVELSVVLPGDIIKSTTVHGSKPMMDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 PPAETKYTDVSSAADSVESTAFIMEQKENMIDKDVELSVVLPGDIIKSTTVHGSKPMMDL
80 90 100 110 120 130
90 100 110 120 130 140
pF1KSD LIFLCAQYHLNPSSYTIDLLSAEQNHIKFKPNTPIGMLEVEKVILKPKMLDKKKPTPIIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 LIFLCAQYHLNPSSYTIDLLSAEQNHIKFKPNTPIGMLEVEKVILKPKMLDKKKPTPIIP
140 150 160 170 180 190
150 160 170 180 190 200
pF1KSD EKTVRVVINFKKTQKTIVRVSPHASLQELAPIICSKCEFDPLHTLLLKDYQSQEPLDLTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 EKTVRVVINFKKTQKTIVRVSPHASLQELAPIICSKCEFDPLHTLLLKDYQSQEPLDLTK
200 210 220 230 240 250
210 220 230 240 250
pF1KSD SLNDLGLRELYAMDVNR-------------ESCQISQNLDIMKEKENKGFFSFFQRSKKK
::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 SLNDLGLRELYAMDVNRATSVTVFSKSSLQESCQISQNLDIMKEKENKGFFSFFQRSKKK
260 270 280 290 300 310
260 270 280 290 300 310
pF1KSD RDQTASAPATPLVNKHRPTFTRSNTISKPYISNTLPSDAPKKRRAPLPPMPASQSVPQDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 RDQTASAPATPLVNKHRPTFTRSNTISKPYISNTLPSDAPKKRRAPLPPMPASQSVPQDL
320 330 340 350 360 370
320 330 340 350 360 370
pF1KSD AHIQERPASCIVKSMSVDETDKSPCEAGRVRAGSLQLSSMSAGNSSLRRTKRKAPSPPSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 AHIQERPASCIVKSMSVDETDKSPCEAGRVRAGSLQLSSMSAGNSSLRRTKRKAPSPPSK
380 390 400 410 420 430
380 390 400 410 420 430
pF1KSD IPPHQSDENSRVTALQPVDGVPPDSASEANSPEELSSPETFHPGLSSQEQCTAPKLMEET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 IPPHQSDENSRVTALQPVDGVPPDSASEANSPEELSSPETFHPGLSSQEQCTAPKLMEET
440 450 460 470 480 490
440 450 460 470 480 490
pF1KSD SVFECPGTPEAAITSLTSGISSDYSLEEIDEKEELSEVPKVEAENISPKSQDIPFVSTDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 SVFECPGTPEAAITSLTSGISSDYSLEEIDEKEELSEVPKVEAENISPKSQDIPFVSTDI
500 510 520 530 540 550
500 510 520 530 540 550
pF1KSD INTLKNDPDSALGNGSGEFSQNSMEEKQETKSTDGQEPHSVVYDTSNGKKVVDSIRNLKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 INTLKNDPDSALGNGSGEFSQNSMEEKQETKSTDGQEPHSVVYDTSNGKKVVDSIRNLKS
560 570 580 590 600 610
560 570 580 590 600
pF1KSD LGPNQENV-QNEIIVYPENTEDNMKNGVKKTEINVEGVAKNNNIDMEVERPSNSEAHETD
:::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 LGPNQENVVQNEIIVYPENTEDNMKNGVKKTEINVEGVAKNNNIDMEVERPSNSEAHETD
620 630 640 650 660 670
610 620 630 640 650 660
pF1KSD TAISYKENHLAASSVPDQKLNQPSAEKTKDAAIQTTPSCNSFDGKHQDHNLSDSKVEECV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 TAISYKENHLAASSVPDQKLNQPSAEKTKDAAIQTTPSCNSFDGKHQDHNLSDSKVEECV
680 690 700 710 720 730
670 680 690 700 710 720
pF1KSD QTSNNNISTQHSCLSSQDSVNTSREFRSQGTLIIHSEDPLTVKDPICAHGNDDLLPPVDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 QTSNNNISTQHSCLSSQDSVNTSREFRSQGTLIIHSEDPLTVKDPICAHGNDDLLPPVDR
740 750 760 770 780 790
730 740 750 760 770 780
pF1KSD IDKNSTASYLKNYPLYRQDYNPKPKPSNEITREYIPKIGMTTYKIVPPKSLEISKDWQSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 IDKNSTASYLKNYPLYRQDYNPKPKPSNEITREYIPKIGMTTYKIVPPKSLEISKDWQSE
800 810 820 830 840 850
790 800 810 820 830 840
pF1KSD TIEYKDDQDMHALGKKHTHENVKETAIQTEDSAISESPEEPLPNLKPKPNLRTEHQVPSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 TIEYKDDQDMHALGKKHTHENVKETAIQTEDSAISESPEEPLPNLKPKPNLRTEHQVPSS
860 870 880 890 900 910
850 860 870 880 890 900
pF1KSD VSSPDDAMVSPLKPAPKMTRDTGTAPFAPNLEEINNILESKFKSRASNAQAKPSSFFLQM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 VSSPDDAMVSPLKPAPKMTRDTGTAPFAPNLEEINNILESKFKSRASNAQAKPSSFFLQM
920 930 940 950 960 970
910 920 930 940 950 960
pF1KSD QKRVSGHYVTSAAAKSVHAAPNPAPKELTNKEAERDMLPSPEQTLSPLSKMPHSVPQPLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 QKRVSGHYVTSAAAKSVHAAPNPAPKELTNKEAERDMLPSPEQTLSPLSKMPHSVPQPLV
980 990 1000 1010 1020 1030
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD EKTDDDVIGQAPAEASPPPIAPKPVTIPASQVSTQNLKTLKTFGAPRPYSSSGPSPFALA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 EKTDDDVIGQAPAEASPPPIAPKPVTIPASQVSTQNLKTLKTFGAPRPYSSSGPSPFALA
1040 1050 1060 1070 1080 1090
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD VVKRSQSFSKERTESPSASALVQPPANTEEGKTHSVNKFVDIPQLGVSDKENNSAHNEQN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 VVKRSQSFSKERTESPSASALVQPPANTEEGKTHSVNKFVDIPQLGVSDKENNSAHNEQN
1100 1110 1120 1130 1140 1150
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD SQIPTPTDGPSFTVMRQSSLTFQSSDPEQMRQSLLTAIRSGEAAAKLKRVTIPSNTISVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 SQIPTPTDGPSFTVMRQSSLTFQSSDPEQMRQSLLTAIRSGEAAAKLKRVTIPSNTISVN
1160 1170 1180 1190 1200 1210
1150 1160
pF1KSD GRSRLSHSMSPDAQDGH
:::::::::::::::::
CCDS63 GRSRLSHSMSPDAQDGH
1220 1230
>>CCDS63045.1 COBLL1 gene_id:22837|Hs108|chr2 (1128 aa)
initn: 6672 init1: 3995 opt: 4693 Z-score: 3083.9 bits: 582.5 E(32554): 1.9e-165
Smith-Waterman score: 7277; 96.5% identity (96.6% similar) in 1167 aa overlap (1-1166:1-1128)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MDGRTPRPQDAPARRKPKAKAPLPPAETKYTDVSSAADSVESTAFIMEQKENMIDKDVEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 MDGRTPRPQDAPARRKPKAKAPLPPAETKYTDVSSAADSVESTAFIMEQKENMIDKDVEL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD SVVLPGDIIKSTTVHGSKPMMDLLIFLCAQYHLNPSSYTIDLLSAEQNHIKFKPNTPIGM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 SVVLPGDIIKSTTVHGSKPMMDLLIFLCAQYHLNPSSYTIDLLSAEQNHIKFKPNTPIGM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD LEVEKVILKPKMLDKKKPTPIIPEKTVRVVINFKKTQKTIVRVSPHASLQELAPIICSKC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 LEVEKVILKPKMLDKKKPTPIIPEKTVRVVINFKKTQKTIVRVSPHASLQELAPIICSKC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD EFDPLHTLLLKDYQSQEPLDLTKSLNDLGLRELYAMDVNRESCQISQNLDIMKEKENKGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 EFDPLHTLLLKDYQSQEPLDLTKSLNDLGLRELYAMDVNRESCQISQNLDIMKEKENKGF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD FSFFQRSKKKRDQTASAPATPLVNKHRPTFTRSNTISKPYISNTLPSDAPKKRRAPLPPM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 FSFFQRSKKKRDQTASAPATPLVNKHRPTFTRSNTISKPYISNTLPSDAPKKRRAPLPPM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD PASQSVPQDLAHIQERPASCIVKSMSVDETDKSPCEAGRVRAGSLQLSSMSAGNSSLRRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 PASQSVPQDLAHIQERPASCIVKSMSVDETDKSPCEAGRVRAGSLQLSSMSAGNSSLRRT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD KRKAPSPPSKIPPHQSDENSRVTALQPVDGVPPDSASEANSPEELSSPETFHPGLSSQEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 KRKAPSPPSKIPPHQSDENSRVTALQPVDGVPPDSASEANSPEELSSP------------
370 380 390 400
430 440 450 460 470 480
pF1KSD CTAPKLMEETSVFECPGTPEAAITSLTSGISSDYSLEEIDEKEELSEVPKVEAENISPKS
.::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 ---------------------------AGISSDYSLEEIDEKEELSEVPKVEAENISPKS
410 420 430 440
490 500 510 520 530 540
pF1KSD QDIPFVSTDIINTLKNDPDSALGNGSGEFSQNSMEEKQETKSTDGQEPHSVVYDTSNGKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 QDIPFVSTDIINTLKNDPDSALGNGSGEFSQNSMEEKQETKSTDGQEPHSVVYDTSNGKK
450 460 470 480 490 500
550 560 570 580 590
pF1KSD VVDSIRNLKSLGPNQENV-QNEIIVYPENTEDNMKNGVKKTEINVEGVAKNNNIDMEVER
:::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 VVDSIRNLKSLGPNQENVVQNEIIVYPENTEDNMKNGVKKTEINVEGVAKNNNIDMEVER
510 520 530 540 550 560
600 610 620 630 640 650
pF1KSD PSNSEAHETDTAISYKENHLAASSVPDQKLNQPSAEKTKDAAIQTTPSCNSFDGKHQDHN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 PSNSEAHETDTAISYKENHLAASSVPDQKLNQPSAEKTKDAAIQTTPSCNSFDGKHQDHN
570 580 590 600 610 620
660 670 680 690 700 710
pF1KSD LSDSKVEECVQTSNNNISTQHSCLSSQDSVNTSREFRSQGTLIIHSEDPLTVKDPICAHG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 LSDSKVEECVQTSNNNISTQHSCLSSQDSVNTSREFRSQGTLIIHSEDPLTVKDPICAHG
630 640 650 660 670 680
720 730 740 750 760 770
pF1KSD NDDLLPPVDRIDKNSTASYLKNYPLYRQDYNPKPKPSNEITREYIPKIGMTTYKIVPPKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 NDDLLPPVDRIDKNSTASYLKNYPLYRQDYNPKPKPSNEITREYIPKIGMTTYKIVPPKS
690 700 710 720 730 740
780 790 800 810 820 830
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 LEISKDWQSETIEYKDDQDMHALGKKHTHENVKETAIQTEDSAISESPEEPLPNLKPKPN
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 LRTEHQVPSSVSSPDDAMVSPLKPAPKMTRDTGTAPFAPNLEEINNILESKFKSRASNAQ
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 AKPSSFFLQMQKRVSGHYVTSAAAKSVHAAPNPAPKELTNKEAERDMLPSPEQTLSPLSK
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 MPHSVPQPLVEKTDDDVIGQAPAEASPPPIAPKPVTIPASQVSTQNLKTLKTFGAPRPYS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 SSGPSPFALAVVKRSQSFSKERTESPSASALVQPPANTEEGKTHSVNKFVDIPQLGVSDK
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 ENNSAHNEQNSQIPTPTDGPSFTVMRQSSLTFQSSDPEQMRQSLLTAIRSGEAAAKLKRV
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:::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 TIPSNTISVNGRSRLSHSMSPDAQDGH
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. ....::::. . : ....::. :::::. :: : ::::: ..... :.: :. ..:
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.. :.::.::: .: :..::.: . : :.:.::::.::..:::: : ::. . :. .
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.::.: :..::. .:.. .. ..: .: . : ..: . ..: ::.. ..
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:::::: :: : ::..: :: . ..: : : .. . . :
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. .. : :. :. . : : : :. :: :: ..: .
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..:.. : ..: :::..: .:: : :.: .:. ::... ::: :: :
CCDS75 VEPLS-FPGEGAGSEASDPIPKLSLP------LGSGSHCSPDGAPQVLSEAEETVSVGSC
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.. . :. ::. :: .. .: ... .. : ... . ..::. ..: ..
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: : : . .: ... :: : :.: :. .... . ... :: .
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. .:: . ....:. :... . .: . .. : .... .: . :..
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: :. ... ... :: : : .. ::... . :. .:.
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: . .... .::: . . . . :.. : :. .:... ::: . :: :.
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.:::: :. ..: . : : :. . : . :. ... : . .:.. :. .:.
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... .:. . . ::.....:.. . . :..: : ..
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: :.. . .. .. .. :. :.. .: :. :.:.:..::.:: :: . :
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: . ::. .: .: :.. .. ::: : : : ..
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:. : ..:: : : ..:::. . .. .: : . : .: .
CCDS75 -GEDLAVGAPPR---GEVIGPHRKLSTQDRPA--AIHRSSCFSLVQSSQRDRVSVGQSCG
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CCDS75 FSGKQSTSSQEASSASEPRRAPDGTDPPPPHTSDTQACSRELVNGSVRAPGHGEPSHPPG
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CCDS75 GSGTESHILLEREEKPSVFSTDGNETDSIWPPSIFGPKKKFKPVVQRPVPKDTSLHSALM
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CCDS75 RASTMDVTVVLPSGLEKRSVLNGSHAMMDLLVELCLQNHLNPSHHALEIRSSETQQPLSF
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CCDS75 NILPVICAKCEVSPEHVVLLRDNIAGEELELSKSLNELGIKELYAWDNRRETFRKSSLGN
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.::.: :..::. .:.. .. ..: .: . : ..: . ..: ::.. ..
CCDS75 DETDKEKKKFLGFFKVNKRSNSKGCLTTPNSP--SMHSRSLTLGPSLSLGSISGVSVKSE
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:::::: :: :.: :: : . .: :: :..
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CCDS75 -------LQKKKRRAPAPPPPQPPPPSPLIPNRTEDKEENRKSTMVYCCASFPTQAKRF
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CCDS34 MD--APRASAAKPPTGRKMKARAPPPPGKAATLHVHSDQKPPHDGALGSQQNLVRMKEAL
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. ....::::. . : ....::. :::::. :: : ::::: ..... :.: :. ..:
CCDS34 RASTMDVTVVLPSGLEKRSVLNGSHAMMDLLVELCLQNHLNPSHHALEIRSSETQQPLSF
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CCDS34 KPNTLIGTLNVHTVFLKEKVPEEKVKPGPPKVPEKSVRLVVNYLRTQKAVVRVSPEVPLQ
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.. :.::.::: .: :..::.: . : :.:.::::.::..:::: : ::. . :. .
CCDS34 NILPVICAKCEVSPEHVVLLRDNIAGEELELSKSLNELGIKELYAWDNRRETFRKSSLGN
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.::.: :..::. .:.. .. ..: .: . : ..: . ..: ::.. ..
CCDS34 DETDKEKKKFLGFFKVNKRSNSKGCLTTPNSP--SMHSRSLTLGPSLSLGSISGVSVKSE
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:.. ::.::.:: :: : :... . . . ..: :.:. .
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.:. :: . :: : .: : . :...:. : . :.:: : .: :. .
CCDS34 APQVLSEAEETVSVG-----SCFASEDTTEDSGVMSSP----SDIVSLDSQQDSMKYKDK
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CCDS34 WATDQEDCSDQDLAGTPDLGPQKSPLWEKNGSENSHLRTEKAVTASNDEEDLL--IAGEF
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.. : .. . . : :::. ...::.. .. : :. .: :..
CCDS34 RKTLAELDEDLEEMED----SYETDTSS---LTSSIHGASNHCP-----QDAMI--PHGD
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pF1KSD EDNMKNGVKKTEINVEGVAKNNNIDMEVERPSNSEAHETDT-AISYKENHLAASSVPDQK
: . .. : .... .: . :..: :. ... ... :: : :
CCDS34 TDAIP-------VTFIGEVSDDPVDSGLFSNRNNNAGSFDSEGVASRRDSLA----PLQA
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.. ::... . :. .:. : . .... .::: . . . .
CCDS34 EHSQPHEKAREEVPALHPA---------SHD-----VGKGIRVALSNISKDGNLMETAPR
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:.. : :. .:... ::: . :: :. ::.. :.:. . :
CCDS34 VTS---FASN----LHTDNLNAKVKDKVYGCADGERTQATERVNSQPVNEKDSNDKNAAL
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CCDS34 APTSWHQRGQNPG--------KSYRLKHGLTTYKIIPPKS-EMRCYDRDVSLSTGAIKID
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CCDS34 E-LGNLVSPHA-TGIR---IISLSSSVPEAESQPIGKVREFWRCNSVEKHLGRPSESSAR
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pF1KSD -----QVPSSVSSPDDAMVS---PLKPAPKMTRDTGTAPFAPNLEEINNILESKFKSRAS
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CCDS34 GPPSTPVPTQTQNPESRLQADPKPISPQQKSAHHEGRNPLGEGRNQPPTMGMGHV--RVP
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CCDS34 AAHTTEVTF-LKPQRRTSSQYVASAIAKRIGAPKVHADVVRPHGYAEKGYAGKAPVLAAP
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CCDS34 PVTVKDDRTSSPHSETQGWKDGAQWPCVTPPNNH--GEDLAVGAPPR---GEVIGPHRKL
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:::. . .. .: : . : .: .:: :. : : ::. .: : .:
CCDS34 STQDRPA--AIHRSSCFSLVQSSQRDRVSVGQSCGFSGKQSTSSQEASSASEPRRAPDGT
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. :.
CCDS34 DPPPPHTSDTQACSRELVNGSVRAPGHGEPSHPPGGSGTESHILLEREEKPSVFSTDGNE
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1166 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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start: Thu Nov 3 04:31:08 2016 done: Thu Nov 3 04:31:09 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]