Result of FASTA (omim) for
pF1KSDA0963
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0963, 1366 aa
1>>>pF1KSDA0963 1366 - 1366 aa - 1366 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.5840+/-0.00038; mu= 9.4702+/- 0.024
mean_var=200.2588+/-41.472, 0's: 0 Z-trim(119.6): 22 B-trim: 590 in 1/55
Lambda= 0.090631
statistics sampled from 33849 (33871) to 33849 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.715), E-opt: 0.2 (0.397), width: 16
Scan time: 19.140
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_055778 (OMIM: 615729) protein strawberry notch (1366) 9188 1215.0 0
NP_001093592 (OMIM: 615729) protein strawberry not (1309) 8519 1127.5 0
XP_011526106 (OMIM: 615729) PREDICTED: protein str (1221) 8045 1065.5 0
XP_011536837 (OMIM: 614274) PREDICTED: protein str (1357) 1918 264.4 3.9e-69
XP_016875048 (OMIM: 614274) PREDICTED: protein str (1358) 1918 264.4 3.9e-69
XP_011536836 (OMIM: 614274) PREDICTED: protein str (1358) 1918 264.4 3.9e-69
XP_016875047 (OMIM: 614274) PREDICTED: protein str (1390) 1918 264.4 4e-69
XP_016875046 (OMIM: 614274) PREDICTED: protein str (1390) 1918 264.4 4e-69
XP_016875045 (OMIM: 614274) PREDICTED: protein str (1391) 1918 264.4 4e-69
XP_011536835 (OMIM: 614274) PREDICTED: protein str (1392) 1918 264.4 4e-69
XP_005253633 (OMIM: 614274) PREDICTED: protein str (1392) 1918 264.4 4e-69
XP_005253632 (OMIM: 614274) PREDICTED: protein str (1392) 1918 264.4 4e-69
NP_060653 (OMIM: 614274) protein strawberry notch (1392) 1918 264.4 4e-69
XP_006719536 (OMIM: 614274) PREDICTED: protein str (1393) 1918 264.4 4e-69
XP_005253630 (OMIM: 614274) PREDICTED: protein str (1393) 1918 264.4 4e-69
XP_006719537 (OMIM: 614274) PREDICTED: protein str (1393) 1918 264.4 4e-69
NP_001161328 (OMIM: 614274) protein strawberry not (1393) 1918 264.4 4e-69
XP_005253629 (OMIM: 614274) PREDICTED: protein str (1393) 1918 264.4 4e-69
>>NP_055778 (OMIM: 615729) protein strawberry notch homo (1366 aa)
initn: 9188 init1: 9188 opt: 9188 Z-score: 6499.4 bits: 1215.0 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 9188; 99.9% identity (99.9% similar) in 1366 aa overlap (1-1366:1-1366)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MLAVGPAMDRDYPQHEPPPAGSLLYSPPPLQSAMLHCPYWNTFSLPPYPAFSSDSRPFMS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 MLAVGPAMDRDYPQHEPPPAGSLLYSPPPLQSAMLHCPYWNTFSLPPYPAFSSDSRPFMS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD SASFLGSQPCPDTSYAPVATASSLPPKTCDFAQDSSYFEDFSNISIFSSSVDSLSDIVDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 SASFLGSQPCPDTSYAPVATASSLPPKTCDFAQDSSYFEDFSNISIFSSSVDSLSDIVDT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD PDFLPADSLNQVSTIWDDNPAPSTHDKLFQLSRPFAGFEDFLPSHSTPLLVSYQEQSVQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 PDFLPADSLNQVSTIWDDNPAPSTHDKLFQLSRPFAGFEDFLPSHSTPLLVSYQEQSVQS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD QPEEEDEAEEEEAEELGHTETYADYVPSKSKIGKQHPDRVVETSTLSSVPPPDITYTLAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 QPEEEDEAEEEEAEELGHTETYADYVPSKSKIGKQHPDRVVETSTLSSVPPPDITYTLAL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD PSDSGALSALQLEAITYACQQHEVLLPSGQRAGFLIGDGAGVGKGRTVAGVILENHLRGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 PSDSGALSALQLEAITYACQQHEVLLPSGQRAGFLIGDGAGVGKGRTVAGVILENHLRGR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD KKALWFSVSNDLKYDAERDLRDIEATGIAVHALSKIKYGDTTTSEGVLFATYSALIGESQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 KKALWFSVSNDLKYDAERDLRDIEATGIAVHALSKIKYGDTTTSEGVLFATYSALIGESQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD AGGQHRTRLRQILDWCGEAFEGVIVFDECHKAKNAGSTKMGKAVLDLQNKLPLARVVYAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 AGGQHRTRLRQILDWCGEAFEGVIVFDECHKAKNAGSTKMGKAVLDLQNKLPLARVVYAS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD ATGASEPRNMIYMSRLGIWGEGTPFRNFEEFLHAIEKRGVGAMEIVAMDMKVSGMYIARQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 ATGASEPRNMIYMSRLGIWGEGTPFRNFEEFLHAIEKRGVGAMEIVAMDMKVSGMYIARQ
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD LSFSGVTFRIEEIPLAPAFECVYNRAALLWAEALNVFQQAADWIGLESRKSLWGQFWSAH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 LSFSGVTFRIEEIPLAPAFECVYNRAALLWAEALNVFQQAADWIGLESRKSLWGQFWSAH
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD QRFFKYLCIAAKVRRLVELAREELARDKCVVIGLQSTGEARTREVLGENDGHLNCFVSAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 QRFFKYLCIAAKVRRLVELAREELARDKCVVIGLQSTGEARTREVLGENDGHLNCFVSAA
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD EGVFLSLIQKHFPSTKRKRDRGAGSKRKRRPRGRGAKAPRLACETAGVIRISDDSSTESD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 EGVFLSLIQKHFPSTKRKRDRGAGSKRKRRPRGRGAKAPRLACETAGVIRISDDSSTESD
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD PGLDSDFNSSPESLVDDDVVIVDAVGLPSDDRGSLCLLQRDPHGPGVLERVERLKQDLLD
::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::
NP_055 PGLDSDFNSSPESLVDDDVVIVDAVGLPSDDRGPLCLLQRDPHGPGVLERVERLKQDLLD
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD KVRRLGRELPVNTLDELIDQLGGPQRVAEMTGRKGRVVSRPDGTVAFESRAEQGLSIDHV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 KVRRLGRELPVNTLDELIDQLGGPQRVAEMTGRKGRVVSRPDGTVAFESRAEQGLSIDHV
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD NLREKQRFMSGEKLVAIISEASSSGVSLQADRRVQNQRRRVHMTLELPWSADRAIQQFGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 NLREKQRFMSGEKLVAIISEASSSGVSLQADRRVQNQRRRVHMTLELPWSADRAIQQFGR
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD THRSNQVSAPEYVFLISELAGERRFASIVAKRLESLGALTHGDRRATESRDLSKYNFENK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 THRSNQVSAPEYVFLISELAGERRFASIVAKRLESLGALTHGDRRATESRDLSKYNFENK
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD YGTRALHCVLTTILSQTENKVPVPQGYPGGVPTFFRDMKQGLLSVGIGGRESRNGCLDVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 YGTRALHCVLTTILSQTENKVPVPQGYPGGVPTFFRDMKQGLLSVGIGGRESRNGCLDVE
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD KDCSITKFLNRILGLEVHKQNALFQYFSDTFDHLIEMDKREGKYDMGILDLAPGIEEIYE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 KDCSITKFLNRILGLEVHKQNALFQYFSDTFDHLIEMDKREGKYDMGILDLAPGIEEIYE
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD ESQQVFLAPGHPQDGQVVFYKISVDRGLKWEDAFAKSLALTGPYDGFYLSYKVRGNKPSC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 ESQQVFLAPGHPQDGQVVFYKISVDRGLKWEDAFAKSLALTGPYDGFYLSYKVRGNKPSC
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD LLAEQNRGQFFTVYKPNIGRQSQLEALDSLRRKFHRVTAEEAKEPWESGYALSLTHCSHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 LLAEQNRGQFFTVYKPNIGRQSQLEALDSLRRKFHRVTAEEAKEPWESGYALSLTHCSHS
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD AWNRHCRLAQEGKDCLQGLRLRHHYMLCGALLRVWGRIAAVMADVSSSSYLQIVRLKTKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 AWNRHCRLAQEGKDCLQGLRLRHHYMLCGALLRVWGRIAAVMADVSSSSYLQIVRLKTKD
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KSD RKKQVGIKIPEGCVRRVLQELRLMDADVKRRQAPALGCPAPPAPRPLALPCGPGEVLDLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 RKKQVGIKIPEGCVRRVLQELRLMDADVKRRQAPALGCPAPPAPRPLALPCGPGEVLDLT
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KSD YSPPAEAFPPPPHFSFPAPLSLDAGPGVVPLGTPDAQADPAALAHQGCDINFKEVLEDML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 YSPPAEAFPPPPHFSFPAPLSLDAGPGVVPLGTPDAQADPAALAHQGCDINFKEVLEDML
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360
pF1KSD RSLHAGPPSEGALGEGAGAGGAAGGGPERQSVIQFSPPFPGAQAPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 RSLHAGPPSEGALGEGAGAGGAAGGGPERQSVIQFSPPFPGAQAPL
1330 1340 1350 1360
>>NP_001093592 (OMIM: 615729) protein strawberry notch h (1309 aa)
initn: 8513 init1: 8513 opt: 8519 Z-score: 6026.9 bits: 1127.5 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 8519; 97.8% identity (98.6% similar) in 1310 aa overlap (57-1366:4-1309)
30 40 50 60 70 80
pF1KSD PPPLQSAMLHCPYWNTFSLPPYPAFSSDSRPFMSSASFLGSQPCPDTSYAPVATASSLPP
:. .:::. :. : : . : . . .:
NP_001 MREPLPGSASW-GT-PGPPS--AGTMSQLQLWL
10 20
90 100 110 120 130 140
pF1KSD KTCDFAQDSSYFEDFSNISIFSSSVDSLSDIVDTPDFLPADSLNQVSTIWDDNPAPSTHD
. . .:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QFEALNKDSSYFEDFSNISIFSSSVDSLSDIVDTPDFLPADSLNQVSTIWDDNPAPSTHD
30 40 50 60 70 80
150 160 170 180 190 200
pF1KSD KLFQLSRPFAGFEDFLPSHSTPLLVSYQEQSVQSQPEEEDEAEEEEAEELGHTETYADYV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KLFQLSRPFAGFEDFLPSHSTPLLVSYQEQSVQSQPEEEDEAEEEEAEELGHTETYADYV
90 100 110 120 130 140
210 220 230 240 250 260
pF1KSD PSKSKIGKQHPDRVVETSTLSSVPPPDITYTLALPSDSGALSALQLEAITYACQQHEVLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PSKSKIGKQHPDRVVETSTLSSVPPPDITYTLALPSDSGALSALQLEAITYACQQHEVLL
150 160 170 180 190 200
270 280 290 300 310 320
pF1KSD PSGQRAGFLIGDGAGVGKGRTVAGVILENHLRGRKKALWFSVSNDLKYDAERDLRDIEAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PSGQRAGFLIGDGAGVGKGRTVAGVILENHLRGRKKALWFSVSNDLKYDAERDLRDIEAT
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pF1KSD GIAVHALSKIKYGDTTTSEGVLFATYSALIGESQAGGQHRTRLRQILDWCGEAFEGVIVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GIAVHALSKIKYGDTTTSEGVLFATYSALIGESQAGGQHRTRLRQILDWCGEAFEGVIVF
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pF1KSD DECHKAKNAGSTKMGKAVLDLQNKLPLARVVYASATGASEPRNMIYMSRLGIWGEGTPFR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DECHKAKNAGSTKMGKAVLDLQNKLPLARVVYASATGASEPRNMIYMSRLGIWGEGTPFR
330 340 350 360 370 380
450 460 470 480 490 500
pF1KSD NFEEFLHAIEKRGVGAMEIVAMDMKVSGMYIARQLSFSGVTFRIEEIPLAPAFECVYNRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NFEEFLHAIEKRGVGAMEIVAMDMKVSGMYIARQLSFSGVTFRIEEIPLAPAFECVYNRA
390 400 410 420 430 440
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pF1KSD ALLWAEALNVFQQAADWIGLESRKSLWGQFWSAHQRFFKYLCIAAKVRRLVELAREELAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ALLWAEALNVFQQAADWIGLESRKSLWGQFWSAHQRFFKYLCIAAKVRRLVELAREELAR
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pF1KSD DKCVVIGLQSTGEARTREVLGENDGHLNCFVSAAEGVFLSLIQKHFPSTKRKRDRGAGSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DKCVVIGLQSTGEARTREVLGENDGHLNCFVSAAEGVFLSLIQKHFPSTKRKRDRGAGSK
510 520 530 540 550 560
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pF1KSD RKRRPRGRGAKAPRLACETAGVIRISDDSSTESDPGLDSDFNSSPESLVDDDVVIVDAVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RKRRPRGRGAKAPRLACETAGVIRISDDSSTESDPGLDSDFNSSPESLVDDDVVIVDAVG
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pF1KSD LPSDDRGSLCLLQRDPHGPGVLERVERLKQDLLDKVRRLGRELPVNTLDELIDQLGGPQR
::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LPSDDRGPLCLLQRDPHGPGVLERVERLKQDLLDKVRRLGRELPVNTLDELIDQLGGPQR
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pF1KSD VAEMTGRKGRVVSRPDGTVAFESRAEQGLSIDHVNLREKQRFMSGEKLVAIISEASSSGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VAEMTGRKGRVVSRPDGTVAFESRAEQGLSIDHVNLREKQRFMSGEKLVAIISEASSSGV
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pF1KSD SLQADRRVQNQRRRVHMTLELPWSADRAIQQFGRTHRSNQVSAPEYVFLISELAGERRFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SLQADRRVQNQRRRVHMTLELPWSADRAIQQFGRTHRSNQVSAPEYVFLISELAGERRFA
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pF1KSD SIVAKRLESLGALTHGDRRATESRDLSKYNFENKYGTRALHCVLTTILSQTENKVPVPQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SIVAKRLESLGALTHGDRRATESRDLSKYNFENKYGTRALHCVLTTILSQTENKVPVPQG
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pF1KSD YPGGVPTFFRDMKQGLLSVGIGGRESRNGCLDVEKDCSITKFLNRILGLEVHKQNALFQY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YPGGVPTFFRDMKQGLLSVGIGGRESRNGCLDVEKDCSITKFLNRILGLEVHKQNALFQY
870 880 890 900 910 920
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pF1KSD FSDTFDHLIEMDKREGKYDMGILDLAPGIEEIYEESQQVFLAPGHPQDGQVVFYKISVDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FSDTFDHLIEMDKREGKYDMGILDLAPGIEEIYEESQQVFLAPGHPQDGQVVFYKISVDR
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pF1KSD GLKWEDAFAKSLALTGPYDGFYLSYKVRGNKPSCLLAEQNRGQFFTVYKPNIGRQSQLEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GLKWEDAFAKSLALTGPYDGFYLSYKVRGNKPSCLLAEQNRGQFFTVYKPNIGRQSQLEA
990 1000 1010 1020 1030 1040
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pF1KSD LDSLRRKFHRVTAEEAKEPWESGYALSLTHCSHSAWNRHCRLAQEGKDCLQGLRLRHHYM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LDSLRRKFHRVTAEEAKEPWESGYALSLTHCSHSAWNRHCRLAQEGKDCLQGLRLRHHYM
1050 1060 1070 1080 1090 1100
1170 1180 1190 1200 1210 1220
pF1KSD LCGALLRVWGRIAAVMADVSSSSYLQIVRLKTKDRKKQVGIKIPEGCVRRVLQELRLMDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LCGALLRVWGRIAAVMADVSSSSYLQIVRLKTKDRKKQVGIKIPEGCVRRVLQELRLMDA
1110 1120 1130 1140 1150 1160
1230 1240 1250 1260 1270 1280
pF1KSD DVKRRQAPALGCPAPPAPRPLALPCGPGEVLDLTYSPPAEAFPPPPHFSFPAPLSLDAGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DVKRRQAPALGCPAPPAPRPLALPCGPGEVLDLTYSPPAEAFPPPPHFSFPAPLSLDAGP
1170 1180 1190 1200 1210 1220
1290 1300 1310 1320 1330 1340
pF1KSD GVVPLGTPDAQADPAALAHQGCDINFKEVLEDMLRSLHAGPPSEGALGEGAGAGGAAGGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GVVPLGTPDAQADPAALAHQGCDINFKEVLEDMLRSLHAGPPSEGALGEGAGAGGAAGGG
1230 1240 1250 1260 1270 1280
1350 1360
pF1KSD PERQSVIQFSPPFPGAQAPL
::::::::::::::::::::
NP_001 PERQSVIQFSPPFPGAQAPL
1290 1300
>>XP_011526106 (OMIM: 615729) PREDICTED: protein strawbe (1221 aa)
initn: 8038 init1: 8038 opt: 8045 Z-score: 5692.4 bits: 1065.5 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 8045; 99.0% identity (99.3% similar) in 1219 aa overlap (1-1215:1-1218)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MLAVGPAMDRDYPQHEPPPAGSLLYSPPPLQSAMLHCPYWNTFSLPPYPAFSSDSRPFMS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MLAVGPAMDRDYPQHEPPPAGSLLYSPPPLQSAMLHCPYWNTFSLPPYPAFSSDSRPFMS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD SASFLGSQPCPDTSYAPVATASSLPPKTCDFAQDSSYFEDFSNISIFSSSVDSLSDIVDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SASFLGSQPCPDTSYAPVATASSLPPKTCDFAQDSSYFEDFSNISIFSSSVDSLSDIVDT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD PDFLPADSLNQVSTIWDDNPAPSTHDKLFQLSRPFAGFEDFLPSHSTPLLVSYQEQSVQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PDFLPADSLNQVSTIWDDNPAPSTHDKLFQLSRPFAGFEDFLPSHSTPLLVSYQEQSVQS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD QPEEEDEAEEEEAEELGHTETYADYVPSKSKIGKQHPDRVVETSTLSSVPPPDITYTLAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QPEEEDEAEEEEAEELGHTETYADYVPSKSKIGKQHPDRVVETSTLSSVPPPDITYTLAL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD PSDSGALSALQLEAITYACQQHEVLLPSGQRAGFLIGDGAGVGKGRTVAGVILENHLRGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PSDSGALSALQLEAITYACQQHEVLLPSGQRAGFLIGDGAGVGKGRTVAGVILENHLRGR
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310 320 330 340 350 360
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KKALWFSVSNDLKYDAERDLRDIEATGIAVHALSKIKYGDTTTSEGVLFATYSALIGESQ
310 320 330 340 350 360
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pF1KSD AGGQHRTRLRQILDWCGEAFEGVIVFDECHKAKNAGSTKMGKAVLDLQNKLPLARVVYAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AGGQHRTRLRQILDWCGEAFEGVIVFDECHKAKNAGSTKMGKAVLDLQNKLPLARVVYAS
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pF1KSD ATGASEPRNMIYMSRLGIWGEGTPFRNFEEFLHAIEKRGVGAMEIVAMDMKVSGMYIARQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ATGASEPRNMIYMSRLGIWGEGTPFRNFEEFLHAIEKRGVGAMEIVAMDMKVSGMYIARQ
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LSFSGVTFRIEEIPLAPAFECVYNRAALLWAEALNVFQQAADWIGLESRKSLWGQFWSAH
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pF1KSD QRFFKYLCIAAKVRRLVELAREELARDKCVVIGLQSTGEARTREVLGENDGHLNCFVSAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QRFFKYLCIAAKVRRLVELAREELARDKCVVIGLQSTGEARTREVLGENDGHLNCFVSAA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EGVFLSLIQKHFPSTKRKRDRGAGSKRKRRPRGRGAKAPRLACETAGVIRISDDSSTESD
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pF1KSD PGLDSDFNSSPESLVDDDVVIVDAVGLPSDDRGSLCLLQRDPHGPGVLERVERLKQDLLD
::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PGLDSDFNSSPESLVDDDVVIVDAVGLPSDDRGPLCLLQRDPHGPGVLERVERLKQDLLD
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pF1KSD KVRRLGRELPVNTLDELIDQLGGPQRVAEMTGRKGRVVSRPDGTVAFESRAEQGLSIDHV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KVRRLGRELPVNTLDELIDQLGGPQRVAEMTGRKGRVVSRPDGTVAFESRAEQGLSIDHV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NLREKQRFMSGEKLVAIISEASSSGVSLQADRRVQNQRRRVHMTLELPWSADRAIQQFGR
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pF1KSD THRSNQVSAPEYVFLISELAGERRFASIVAKRLESLGALTHGDRRATESRDLSKYNFENK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 THRSNQVSAPEYVFLISELAGERRFASIVAKRLESLGALTHGDRRATESRDLSKYNFENK
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pF1KSD YGTRALHCVLTTILSQTENKVPVPQGYPGGVPTFFRDMKQGLLSVGIGGRESRNGCLDVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 YGTRALHCVLTTILSQTENKVPVPQGYPGGVPTFFRDMKQGLLSVGIGGRESRNGCLDVE
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pF1KSD KDCSITKFLNRILGLEVHKQNALFQYFSDTFDHLIEMDKREGKYDMGILDLAPGIEEIYE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KDCSITKFLNRILGLEVHKQNALFQYFSDTFDHLIEMDKREGKYDMGILDLAPGIEEIYE
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pF1KSD ESQQVFLAPGHPQDGQVVFYKISVDRGLKWEDAFAKSLALTGPYDGFYLSYKVRGNKPSC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ESQQVFLAPGHPQDGQVVFYKISVDRGLKWEDAFAKSLALTGPYDGFYLSYKVRGNKPSC
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pF1KSD LLAEQNRGQFFTVYKPNIGRQSQLEALDSLRRKFHRVTAEEAKEPWESGYALSLTHCSHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LLAEQNRGQFFTVYKPNIGRQSQLEALDSLRRKFHRVTAEEAKEPWESGYALSLTHCSHS
1090 1100 1110 1120 1130 1140
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pF1KSD AWNRHCRLAQEGKDCLQGLRLRHHYMLCGALLRVWGRIAAVMADVSSSSYLQIVRLKTKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AWNRHCRLAQEGKDCLQGLRLRHHYMLCGALLRVWGRIAAVMADVSSSSYLQIVRLKTKD
1150 1160 1170 1180 1190 1200
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pF1KSD RKKQVGIKIPE----GCVRRVLQELRLMDADVKRRQAPALGCPAPPAPRPLALPCGPGEV
::::.. . :. :: :
XP_011 RKKQAS-RSPRAACAGCCRSCG
1210 1220
>>XP_011536837 (OMIM: 614274) PREDICTED: protein strawbe (1357 aa)
initn: 2852 init1: 1162 opt: 1918 Z-score: 1362.1 bits: 264.4 E(85289): 3.9e-69
Smith-Waterman score: 3833; 54.3% identity (75.2% similar) in 1147 aa overlap (183-1225:187-1330)
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pF1KSD RPFAGFEDFLPSHSTPLLVSYQEQSVQSQPEEEDEAEEEEAEELGHTETYADYVPSKSKI
.:.:: :::. ::.::.::::.:.: : ::
XP_011 KESSNKEGARMWINDMKMRSFSPTMKVPVVKEDDEPEEEDEEEMGHAETYAEYMPIKLKI
160 170 180 190 200 210
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pF1KSD GKQHPDRVVETSTLSSVPPPDITYTLALPS---DSGALSALQLEAITYACQQHEVLLPSG
: .::: :::::.:::: :::. : .. :.: :::::::::::: ::::..::.:
XP_011 GLRHPDAVVETSSLSSVTPPDVWYKTSISEETIDNGWLSALQLEAITYAAQQHETFLPNG
220 230 240 250 260 270
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pF1KSD QRAGFLIGDGAGVGKGRTVAGVILENHLRGRKKALWFSVSNDLKYDAERDLRDIEATGIA
.:::::::::::::::::.::.: ::.: .::.::::::::::::::::::::: : .:
XP_011 DRAGFLIGDGAGVGKGRTIAGIIYENYLLSRKRALWFSVSNDLKYDAERDLRDIGAKNIL
280 290 300 310 320 330
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pF1KSD VHALSKIKYGDTTTS------EGVLFATYSALIGESQAGGQHRTRLRQILDWCGEAFEGV
::.:.:.::: ... .::.:::::.::::::.::...:::.:.: :::. :.::
XP_011 VHSLNKFKYGKISSKHNGSVKKGVIFATYSSLIGESQSGGKYKTRLKQLLHWCGDDFDGV
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390 400 410 420 430
pF1KSD IVFDECHKAKN---AGS---TKMGKAVLDLQNKLPLARVVYASATGASEPRNMIYMSRLG
::::::::::: .:: :: : :::.:::::: ::::::::::::::::: ::.:::
XP_011 IVFDECHKAKNLCPVGSSKPTKTGLAVLELQNKLPKARVVYASATGASEPRNMAYMNRLG
400 410 420 430 440 450
440 450 460 470 480 490
pF1KSD IWGEGTPFRNFEEFLHAIEKRGVGAMEIVAMDMKVSGMYIARQLSFSGVTFRIEEIPLAP
:::::::::.: .:..:.:.::::::::::::::. ::::::::::.::::.:::. :.
XP_011 IWGEGTPFREFSDFIQAVERRGVGAMEIVAMDMKLRGMYIARQLSFTGVTFKIEEVLLSQ
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pF1KSD AFECVYNRAALLWAEALNVFQQAADWIGLESR--KSLWGQFWSAHQRFFKYLCIAAKVRR
.. .::.:. ::. : . :::::: : :.: ::.::::::::::::::::::.::.:
XP_011 SYVKMYNKAVKLWVIARERFQQAADLIDAEQRMKKSMWGQFWSAHQRFFKYLCIASKVKR
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560 570 580 590 600 610
pF1KSD LVELAREELARDKCVVIGLQSTGEARTREVLGENDGHLNCFVSAAEGVFLSLIQKHFPST
.:.:::::. ::::::::::::::: :.: :. :.:: :::.:.::. :::.::::.
XP_011 VVQLAREEIKNGKCVVIGLQSTGEARTLEALEEGGGELNDFVSTAKGVLQSLIEKHFPAP
580 590 600 610 620 630
620 630 640 650
pF1KSD KRKR-----------------DRGAGSKRKRRPRGRGAKAPRLACETAGVIRI----SDD
::. : . :... . .: . : : .. : . :::
XP_011 DRKKLYSLLGIDLTAPSNNSSPRDSPCKENKIKKRKGEEITREAKKARKVGGLTGSSSDD
640 650 660 670 680 690
660 670
pF1KSD SSTESDP----------------GLDSDFN-----------SSP---------------E
:..::: : :.::: ..: .
XP_011 SGSESDASDNEESDYESSKNMSSGDDDDFNPFLDESNEDDENDPWLIRKDHKKNKEKKKK
700 710 720 730 740 750
680 690 700 710
pF1KSD SLVDDDVV----IVDAVGLPSDDRGSLCLLQRDPHG-PG---------------VLERVE
. .: : . .....: . .: ... :.. :. ..::..
XP_011 KSIDPDSIQSALLASGLGSKRPSFSSTPVISPAPNSTPANSNTNSNSSLITSQDAVERAQ
760 770 780 790 800 810
720 730 740 750 760 770
pF1KSD RLKQDLLDKVRRLGRELPVNTLDELIDQLGGPQRVAEMTGRKGRVVSRPDGTVAFESRAE
..:.:::::...:...:: ::::::::.::::. ::::::::::::: ::....:::.:
XP_011 QMKKDLLDKLEKLAEDLPPNTLDELIDELGGPENVAEMTGRKGRVVSNDDGSISYESRSE
820 830 840 850 860 870
780 790 800 810 820 830
pF1KSD QGLSIDHVNLREKQRFMSGEKLVAIISEASSSGVSLQADRRVQNQRRRVHMTLELPWSAD
. .. .:. ::::::.:.: .::::::.:::.:::::::..:::::::::::::::::
XP_011 LDVPVEILNITEKQRFMDGDKNIAIISEAASSGISLQADRRAKNQRRRVHMTLELPWSAD
880 890 900 910 920 930
840 850 860 870 880 890
pF1KSD RAIQQFGRTHRSNQVSAPEYVFLISELAGERRFASIVAKRLESLGALTHGDRRATESRDL
:::::::::::::::.::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RAIQQFGRTHRSNQVTAPEYVFLISELAGEQRFASIVAKRLESLGALTHGDRRATESRDL
940 950 960 970 980 990
900 910 920 930 940 950
pF1KSD SKYNFENKYGTRALHCVLTTILSQTENKVPVPQGYPGGVPTFFRDMKQGLLSVGIGGRES
:..::.:::: ::. :. .:.. : : ::: ::.:..:::..::. . :.
XP_011 SRFNFDNKYGRNALEIVMKSIVNLDSPMVSPPPDYPG---EFFKDVRQGLIGVGLINVED
1000 1010 1020 1030 1040 1050
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pF1KSD RNGCLDVEKD-CSITKFLNRILGLEVHKQNALFQYFSDTFDHLIEMDKREGKYDMGILDL
:.: : ..:: .: ::::::::.:::.::::::::.::. ... :..:.::::::::
XP_011 RSGILTLDKDYNNIGKFLNRILGMEVHQQNALFQYFADTLTAVVQNAKKNGRYDMGILDL
1060 1070 1080 1090 1100 1110
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KSD APGIEEIYEESQQVFLAPGHPQDGQVVFYKISVDRGLKWEDAFAKSLALTGPYDGFYLSY
. : :.. . . . ::.::. .:.: .: :::.::..::.: :::: ::::::
XP_011 GSGDEKVRKSDVKKFLTPGYSTSGHVELYTISVERGMSWEEATKIWAELTGPDDGFYLSL
1120 1130 1140 1150 1160 1170
1080 1090 1100 1110 1120
pF1KSD KVRGNKPSCLLAEQ--NRGQFFTVYKPNIGRQSQLEALDSLRRKFHRVTAEEAKEPWESG
..:.:: . .:... . ..: ::.:: :.: .:: .:..:...:....: : .
XP_011 QIRNNKKTAILVKEVNPKKKLFLVYRPNTGKQLKLEIYADLKKKYKKVVSDDALMHWLDQ
1180 1190 1200 1210 1220 1230
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pF1KSD YALSLTHCSHSAWNRHCRLAQEGKDCLQGLRLRHHYMLCGALLRVWGRIAAVMADVSSSS
: : :.:. : .:. :. : : ::: : .:.:::..: :: .. .:.:.::...
XP_011 YNSSADTCTHAYWRGNCKKASLGLVCEIGLRCRTYYVLCGSVLSVWTKVEGVLASVSGTN
1240 1250 1260 1270 1280 1290
1190 1200 1210 1220 1230 1240
pF1KSD Y-LQIVRLKTKDRKKQVGIKIPEGCVRRVLQELRLMDADVKRRQAPALGCPAPPAPRPLA
.:::::.:.: .. ::. :: .:: ... : :
XP_011 VKMQIVRLRTEDGQRIVGLIIPANCVSPLVNLLSTSDQSQQLAVQQKQLWQQHHPQSITN
1300 1310 1320 1330 1340 1350
1250 1260 1270 1280 1290 1300
pF1KSD LPCGPGEVLDLTYSPPAEAFPPPPHFSFPAPLSLDAGPGVVPLGTPDAQADPAALAHQGC
XP_011 LSNA
>>XP_016875048 (OMIM: 614274) PREDICTED: protein strawbe (1358 aa)
initn: 2852 init1: 1162 opt: 1918 Z-score: 1362.1 bits: 264.4 E(85289): 3.9e-69
Smith-Waterman score: 3833; 54.3% identity (75.2% similar) in 1147 aa overlap (183-1225:188-1331)
160 170 180 190 200 210
pF1KSD RPFAGFEDFLPSHSTPLLVSYQEQSVQSQPEEEDEAEEEEAEELGHTETYADYVPSKSKI
.:.:: :::. ::.::.::::.:.: : ::
XP_016 KESSNKEGARMWINDMKMRSFSPTMKVPVVKEDDEPEEEDEEEMGHAETYAEYMPIKLKI
160 170 180 190 200 210
220 230 240 250 260
pF1KSD GKQHPDRVVETSTLSSVPPPDITYTLALPS---DSGALSALQLEAITYACQQHEVLLPSG
: .::: :::::.:::: :::. : .. :.: :::::::::::: ::::..::.:
XP_016 GLRHPDAVVETSSLSSVTPPDVWYKTSISEETIDNGWLSALQLEAITYAAQQHETFLPNG
220 230 240 250 260 270
270 280 290 300 310 320
pF1KSD QRAGFLIGDGAGVGKGRTVAGVILENHLRGRKKALWFSVSNDLKYDAERDLRDIEATGIA
.:::::::::::::::::.::.: ::.: .::.::::::::::::::::::::: : .:
XP_016 DRAGFLIGDGAGVGKGRTIAGIIYENYLLSRKRALWFSVSNDLKYDAERDLRDIGAKNIL
280 290 300 310 320 330
330 340 350 360 370 380
pF1KSD VHALSKIKYGDTTTS------EGVLFATYSALIGESQAGGQHRTRLRQILDWCGEAFEGV
::.:.:.::: ... .::.:::::.::::::.::...:::.:.: :::. :.::
XP_016 VHSLNKFKYGKISSKHNGSVKKGVIFATYSSLIGESQSGGKYKTRLKQLLHWCGDDFDGV
340 350 360 370 380 390
390 400 410 420 430
pF1KSD IVFDECHKAKN---AGS---TKMGKAVLDLQNKLPLARVVYASATGASEPRNMIYMSRLG
::::::::::: .:: :: : :::.:::::: ::::::::::::::::: ::.:::
XP_016 IVFDECHKAKNLCPVGSSKPTKTGLAVLELQNKLPKARVVYASATGASEPRNMAYMNRLG
400 410 420 430 440 450
440 450 460 470 480 490
pF1KSD IWGEGTPFRNFEEFLHAIEKRGVGAMEIVAMDMKVSGMYIARQLSFSGVTFRIEEIPLAP
:::::::::.: .:..:.:.::::::::::::::. ::::::::::.::::.:::. :.
XP_016 IWGEGTPFREFSDFIQAVERRGVGAMEIVAMDMKLRGMYIARQLSFTGVTFKIEEVLLSQ
460 470 480 490 500 510
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pF1KSD AFECVYNRAALLWAEALNVFQQAADWIGLESR--KSLWGQFWSAHQRFFKYLCIAAKVRR
.. .::.:. ::. : . :::::: : :.: ::.::::::::::::::::::.::.:
XP_016 SYVKMYNKAVKLWVIARERFQQAADLIDAEQRMKKSMWGQFWSAHQRFFKYLCIASKVKR
520 530 540 550 560 570
560 570 580 590 600 610
pF1KSD LVELAREELARDKCVVIGLQSTGEARTREVLGENDGHLNCFVSAAEGVFLSLIQKHFPST
.:.:::::. ::::::::::::::: :.: :. :.:: :::.:.::. :::.::::.
XP_016 VVQLAREEIKNGKCVVIGLQSTGEARTLEALEEGGGELNDFVSTAKGVLQSLIEKHFPAP
580 590 600 610 620 630
620 630 640 650
pF1KSD KRKR-----------------DRGAGSKRKRRPRGRGAKAPRLACETAGVIRI----SDD
::. : . :... . .: . : : .. : . :::
XP_016 DRKKLYSLLGIDLTAPSNNSSPRDSPCKENKIKKRKGEEITREAKKARKVGGLTGSSSDD
640 650 660 670 680 690
660 670
pF1KSD SSTESDP----------------GLDSDFN-----------SSP---------------E
:..::: : :.::: ..: .
XP_016 SGSESDASDNEESDYESSKNMSSGDDDDFNPFLDESNEDDENDPWLIRKDHKKNKEKKKK
700 710 720 730 740 750
680 690 700 710
pF1KSD SLVDDDVV----IVDAVGLPSDDRGSLCLLQRDPHG-PG---------------VLERVE
. .: : . .....: . .: ... :.. :. ..::..
XP_016 KSIDPDSIQSALLASGLGSKRPSFSSTPVISPAPNSTPANSNTNSNSSLITSQDAVERAQ
760 770 780 790 800 810
720 730 740 750 760 770
pF1KSD RLKQDLLDKVRRLGRELPVNTLDELIDQLGGPQRVAEMTGRKGRVVSRPDGTVAFESRAE
..:.:::::...:...:: ::::::::.::::. ::::::::::::: ::....:::.:
XP_016 QMKKDLLDKLEKLAEDLPPNTLDELIDELGGPENVAEMTGRKGRVVSNDDGSISYESRSE
820 830 840 850 860 870
780 790 800 810 820 830
pF1KSD QGLSIDHVNLREKQRFMSGEKLVAIISEASSSGVSLQADRRVQNQRRRVHMTLELPWSAD
. .. .:. ::::::.:.: .::::::.:::.:::::::..:::::::::::::::::
XP_016 LDVPVEILNITEKQRFMDGDKNIAIISEAASSGISLQADRRAKNQRRRVHMTLELPWSAD
880 890 900 910 920 930
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pF1KSD RAIQQFGRTHRSNQVSAPEYVFLISELAGERRFASIVAKRLESLGALTHGDRRATESRDL
:::::::::::::::.::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RAIQQFGRTHRSNQVTAPEYVFLISELAGEQRFASIVAKRLESLGALTHGDRRATESRDL
940 950 960 970 980 990
900 910 920 930 940 950
pF1KSD SKYNFENKYGTRALHCVLTTILSQTENKVPVPQGYPGGVPTFFRDMKQGLLSVGIGGRES
:..::.:::: ::. :. .:.. : : ::: ::.:..:::..::. . :.
XP_016 SRFNFDNKYGRNALEIVMKSIVNLDSPMVSPPPDYPG---EFFKDVRQGLIGVGLINVED
1000 1010 1020 1030 1040 1050
960 970 980 990 1000 1010
pF1KSD RNGCLDVEKD-CSITKFLNRILGLEVHKQNALFQYFSDTFDHLIEMDKREGKYDMGILDL
:.: : ..:: .: ::::::::.:::.::::::::.::. ... :..:.::::::::
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.. .::.:. ::. : . :::::: : :.: ::.::::::::::::::::::.::.:
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560 570 580 590 600 610
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.:.:::::. ::::::::::::::: :.: :. :.:: :::.:.::. :::.::::.
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:..::: : :.::: ..: .
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. .: : . .....: . .: ... :.. :. ..::..
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..:.:::::...:...:: ::::::::.::::. ::::::::::::: ::....:::.:
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XP_016 YNSSADTCTHAYWRGNCKKASLGLVCEIGLRCRTYYVLCGSVLSVWTKVEGVLASVSGTN
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XP_011 GLRHPDAVVETSSLSSVTPPDVWYKTSISEETIDNGWLSALQLEAITYAAQQHETFLPNG
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