Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA0963
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0963, 1366 aa
1>>>pF1KSDA0963 1366 - 1366 aa - 1366 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.6232+/-0.000948; mu= 9.5892+/- 0.057
mean_var=187.2889+/-38.391, 0's: 0 Z-trim(112.2): 15 B-trim: 122 in 1/49
Lambda= 0.093717
statistics sampled from 12999 (13007) to 12999 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.717), E-opt: 0.2 (0.4), width: 16
Scan time: 5.340
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS45894.1 SBNO2 gene_id:22904|Hs108|chr19 (1366) 9188 1255.5 0
CCDS45895.1 SBNO2 gene_id:22904|Hs108|chr19 (1309) 8519 1165.1 0
CCDS9246.1 SBNO1 gene_id:55206|Hs108|chr12 (1392) 1918 272.6 5.4e-72
CCDS53844.1 SBNO1 gene_id:55206|Hs108|chr12 (1393) 1918 272.6 5.4e-72
>>CCDS45894.1 SBNO2 gene_id:22904|Hs108|chr19 (1366 aa)
initn: 9188 init1: 9188 opt: 9188 Z-score: 6718.4 bits: 1255.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 9188; 99.9% identity (99.9% similar) in 1366 aa overlap (1-1366:1-1366)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MLAVGPAMDRDYPQHEPPPAGSLLYSPPPLQSAMLHCPYWNTFSLPPYPAFSSDSRPFMS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MLAVGPAMDRDYPQHEPPPAGSLLYSPPPLQSAMLHCPYWNTFSLPPYPAFSSDSRPFMS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD SASFLGSQPCPDTSYAPVATASSLPPKTCDFAQDSSYFEDFSNISIFSSSVDSLSDIVDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 SASFLGSQPCPDTSYAPVATASSLPPKTCDFAQDSSYFEDFSNISIFSSSVDSLSDIVDT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD PDFLPADSLNQVSTIWDDNPAPSTHDKLFQLSRPFAGFEDFLPSHSTPLLVSYQEQSVQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 PDFLPADSLNQVSTIWDDNPAPSTHDKLFQLSRPFAGFEDFLPSHSTPLLVSYQEQSVQS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD QPEEEDEAEEEEAEELGHTETYADYVPSKSKIGKQHPDRVVETSTLSSVPPPDITYTLAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 QPEEEDEAEEEEAEELGHTETYADYVPSKSKIGKQHPDRVVETSTLSSVPPPDITYTLAL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD PSDSGALSALQLEAITYACQQHEVLLPSGQRAGFLIGDGAGVGKGRTVAGVILENHLRGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 PSDSGALSALQLEAITYACQQHEVLLPSGQRAGFLIGDGAGVGKGRTVAGVILENHLRGR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD KKALWFSVSNDLKYDAERDLRDIEATGIAVHALSKIKYGDTTTSEGVLFATYSALIGESQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KKALWFSVSNDLKYDAERDLRDIEATGIAVHALSKIKYGDTTTSEGVLFATYSALIGESQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD AGGQHRTRLRQILDWCGEAFEGVIVFDECHKAKNAGSTKMGKAVLDLQNKLPLARVVYAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 AGGQHRTRLRQILDWCGEAFEGVIVFDECHKAKNAGSTKMGKAVLDLQNKLPLARVVYAS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD ATGASEPRNMIYMSRLGIWGEGTPFRNFEEFLHAIEKRGVGAMEIVAMDMKVSGMYIARQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 ATGASEPRNMIYMSRLGIWGEGTPFRNFEEFLHAIEKRGVGAMEIVAMDMKVSGMYIARQ
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD LSFSGVTFRIEEIPLAPAFECVYNRAALLWAEALNVFQQAADWIGLESRKSLWGQFWSAH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LSFSGVTFRIEEIPLAPAFECVYNRAALLWAEALNVFQQAADWIGLESRKSLWGQFWSAH
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD QRFFKYLCIAAKVRRLVELAREELARDKCVVIGLQSTGEARTREVLGENDGHLNCFVSAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 QRFFKYLCIAAKVRRLVELAREELARDKCVVIGLQSTGEARTREVLGENDGHLNCFVSAA
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD EGVFLSLIQKHFPSTKRKRDRGAGSKRKRRPRGRGAKAPRLACETAGVIRISDDSSTESD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 EGVFLSLIQKHFPSTKRKRDRGAGSKRKRRPRGRGAKAPRLACETAGVIRISDDSSTESD
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD PGLDSDFNSSPESLVDDDVVIVDAVGLPSDDRGSLCLLQRDPHGPGVLERVERLKQDLLD
::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 PGLDSDFNSSPESLVDDDVVIVDAVGLPSDDRGPLCLLQRDPHGPGVLERVERLKQDLLD
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD KVRRLGRELPVNTLDELIDQLGGPQRVAEMTGRKGRVVSRPDGTVAFESRAEQGLSIDHV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KVRRLGRELPVNTLDELIDQLGGPQRVAEMTGRKGRVVSRPDGTVAFESRAEQGLSIDHV
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD NLREKQRFMSGEKLVAIISEASSSGVSLQADRRVQNQRRRVHMTLELPWSADRAIQQFGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 NLREKQRFMSGEKLVAIISEASSSGVSLQADRRVQNQRRRVHMTLELPWSADRAIQQFGR
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD THRSNQVSAPEYVFLISELAGERRFASIVAKRLESLGALTHGDRRATESRDLSKYNFENK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 THRSNQVSAPEYVFLISELAGERRFASIVAKRLESLGALTHGDRRATESRDLSKYNFENK
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD YGTRALHCVLTTILSQTENKVPVPQGYPGGVPTFFRDMKQGLLSVGIGGRESRNGCLDVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 YGTRALHCVLTTILSQTENKVPVPQGYPGGVPTFFRDMKQGLLSVGIGGRESRNGCLDVE
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD KDCSITKFLNRILGLEVHKQNALFQYFSDTFDHLIEMDKREGKYDMGILDLAPGIEEIYE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KDCSITKFLNRILGLEVHKQNALFQYFSDTFDHLIEMDKREGKYDMGILDLAPGIEEIYE
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD ESQQVFLAPGHPQDGQVVFYKISVDRGLKWEDAFAKSLALTGPYDGFYLSYKVRGNKPSC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 ESQQVFLAPGHPQDGQVVFYKISVDRGLKWEDAFAKSLALTGPYDGFYLSYKVRGNKPSC
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD LLAEQNRGQFFTVYKPNIGRQSQLEALDSLRRKFHRVTAEEAKEPWESGYALSLTHCSHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LLAEQNRGQFFTVYKPNIGRQSQLEALDSLRRKFHRVTAEEAKEPWESGYALSLTHCSHS
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD AWNRHCRLAQEGKDCLQGLRLRHHYMLCGALLRVWGRIAAVMADVSSSSYLQIVRLKTKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 AWNRHCRLAQEGKDCLQGLRLRHHYMLCGALLRVWGRIAAVMADVSSSSYLQIVRLKTKD
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KSD RKKQVGIKIPEGCVRRVLQELRLMDADVKRRQAPALGCPAPPAPRPLALPCGPGEVLDLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 RKKQVGIKIPEGCVRRVLQELRLMDADVKRRQAPALGCPAPPAPRPLALPCGPGEVLDLT
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KSD YSPPAEAFPPPPHFSFPAPLSLDAGPGVVPLGTPDAQADPAALAHQGCDINFKEVLEDML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 YSPPAEAFPPPPHFSFPAPLSLDAGPGVVPLGTPDAQADPAALAHQGCDINFKEVLEDML
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360
pF1KSD RSLHAGPPSEGALGEGAGAGGAAGGGPERQSVIQFSPPFPGAQAPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 RSLHAGPPSEGALGEGAGAGGAAGGGPERQSVIQFSPPFPGAQAPL
1330 1340 1350 1360
>>CCDS45895.1 SBNO2 gene_id:22904|Hs108|chr19 (1309 aa)
initn: 8513 init1: 8513 opt: 8519 Z-score: 6229.8 bits: 1165.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 8519; 97.8% identity (98.6% similar) in 1310 aa overlap (57-1366:4-1309)
30 40 50 60 70 80
pF1KSD PPPLQSAMLHCPYWNTFSLPPYPAFSSDSRPFMSSASFLGSQPCPDTSYAPVATASSLPP
:. .:::. :. : : . : . . .:
CCDS45 MREPLPGSASW-GT-PGPPS--AGTMSQLQLWL
10 20
90 100 110 120 130 140
pF1KSD KTCDFAQDSSYFEDFSNISIFSSSVDSLSDIVDTPDFLPADSLNQVSTIWDDNPAPSTHD
. . .:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 QFEALNKDSSYFEDFSNISIFSSSVDSLSDIVDTPDFLPADSLNQVSTIWDDNPAPSTHD
30 40 50 60 70 80
150 160 170 180 190 200
pF1KSD KLFQLSRPFAGFEDFLPSHSTPLLVSYQEQSVQSQPEEEDEAEEEEAEELGHTETYADYV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KLFQLSRPFAGFEDFLPSHSTPLLVSYQEQSVQSQPEEEDEAEEEEAEELGHTETYADYV
90 100 110 120 130 140
210 220 230 240 250 260
pF1KSD PSKSKIGKQHPDRVVETSTLSSVPPPDITYTLALPSDSGALSALQLEAITYACQQHEVLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 PSKSKIGKQHPDRVVETSTLSSVPPPDITYTLALPSDSGALSALQLEAITYACQQHEVLL
150 160 170 180 190 200
270 280 290 300 310 320
pF1KSD PSGQRAGFLIGDGAGVGKGRTVAGVILENHLRGRKKALWFSVSNDLKYDAERDLRDIEAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 PSGQRAGFLIGDGAGVGKGRTVAGVILENHLRGRKKALWFSVSNDLKYDAERDLRDIEAT
210 220 230 240 250 260
330 340 350 360 370 380
pF1KSD GIAVHALSKIKYGDTTTSEGVLFATYSALIGESQAGGQHRTRLRQILDWCGEAFEGVIVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GIAVHALSKIKYGDTTTSEGVLFATYSALIGESQAGGQHRTRLRQILDWCGEAFEGVIVF
270 280 290 300 310 320
390 400 410 420 430 440
pF1KSD DECHKAKNAGSTKMGKAVLDLQNKLPLARVVYASATGASEPRNMIYMSRLGIWGEGTPFR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 DECHKAKNAGSTKMGKAVLDLQNKLPLARVVYASATGASEPRNMIYMSRLGIWGEGTPFR
330 340 350 360 370 380
450 460 470 480 490 500
pF1KSD NFEEFLHAIEKRGVGAMEIVAMDMKVSGMYIARQLSFSGVTFRIEEIPLAPAFECVYNRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 NFEEFLHAIEKRGVGAMEIVAMDMKVSGMYIARQLSFSGVTFRIEEIPLAPAFECVYNRA
390 400 410 420 430 440
510 520 530 540 550 560
pF1KSD ALLWAEALNVFQQAADWIGLESRKSLWGQFWSAHQRFFKYLCIAAKVRRLVELAREELAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 ALLWAEALNVFQQAADWIGLESRKSLWGQFWSAHQRFFKYLCIAAKVRRLVELAREELAR
450 460 470 480 490 500
570 580 590 600 610 620
pF1KSD DKCVVIGLQSTGEARTREVLGENDGHLNCFVSAAEGVFLSLIQKHFPSTKRKRDRGAGSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 DKCVVIGLQSTGEARTREVLGENDGHLNCFVSAAEGVFLSLIQKHFPSTKRKRDRGAGSK
510 520 530 540 550 560
630 640 650 660 670 680
pF1KSD RKRRPRGRGAKAPRLACETAGVIRISDDSSTESDPGLDSDFNSSPESLVDDDVVIVDAVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 RKRRPRGRGAKAPRLACETAGVIRISDDSSTESDPGLDSDFNSSPESLVDDDVVIVDAVG
570 580 590 600 610 620
690 700 710 720 730 740
pF1KSD LPSDDRGSLCLLQRDPHGPGVLERVERLKQDLLDKVRRLGRELPVNTLDELIDQLGGPQR
::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LPSDDRGPLCLLQRDPHGPGVLERVERLKQDLLDKVRRLGRELPVNTLDELIDQLGGPQR
630 640 650 660 670 680
750 760 770 780 790 800
pF1KSD VAEMTGRKGRVVSRPDGTVAFESRAEQGLSIDHVNLREKQRFMSGEKLVAIISEASSSGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 VAEMTGRKGRVVSRPDGTVAFESRAEQGLSIDHVNLREKQRFMSGEKLVAIISEASSSGV
690 700 710 720 730 740
810 820 830 840 850 860
pF1KSD SLQADRRVQNQRRRVHMTLELPWSADRAIQQFGRTHRSNQVSAPEYVFLISELAGERRFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 SLQADRRVQNQRRRVHMTLELPWSADRAIQQFGRTHRSNQVSAPEYVFLISELAGERRFA
750 760 770 780 790 800
870 880 890 900 910 920
pF1KSD SIVAKRLESLGALTHGDRRATESRDLSKYNFENKYGTRALHCVLTTILSQTENKVPVPQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 SIVAKRLESLGALTHGDRRATESRDLSKYNFENKYGTRALHCVLTTILSQTENKVPVPQG
810 820 830 840 850 860
930 940 950 960 970 980
pF1KSD YPGGVPTFFRDMKQGLLSVGIGGRESRNGCLDVEKDCSITKFLNRILGLEVHKQNALFQY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 YPGGVPTFFRDMKQGLLSVGIGGRESRNGCLDVEKDCSITKFLNRILGLEVHKQNALFQY
870 880 890 900 910 920
990 1000 1010 1020 1030 1040
pF1KSD FSDTFDHLIEMDKREGKYDMGILDLAPGIEEIYEESQQVFLAPGHPQDGQVVFYKISVDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 FSDTFDHLIEMDKREGKYDMGILDLAPGIEEIYEESQQVFLAPGHPQDGQVVFYKISVDR
930 940 950 960 970 980
1050 1060 1070 1080 1090 1100
pF1KSD GLKWEDAFAKSLALTGPYDGFYLSYKVRGNKPSCLLAEQNRGQFFTVYKPNIGRQSQLEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GLKWEDAFAKSLALTGPYDGFYLSYKVRGNKPSCLLAEQNRGQFFTVYKPNIGRQSQLEA
990 1000 1010 1020 1030 1040
1110 1120 1130 1140 1150 1160
pF1KSD LDSLRRKFHRVTAEEAKEPWESGYALSLTHCSHSAWNRHCRLAQEGKDCLQGLRLRHHYM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LDSLRRKFHRVTAEEAKEPWESGYALSLTHCSHSAWNRHCRLAQEGKDCLQGLRLRHHYM
1050 1060 1070 1080 1090 1100
1170 1180 1190 1200 1210 1220
pF1KSD LCGALLRVWGRIAAVMADVSSSSYLQIVRLKTKDRKKQVGIKIPEGCVRRVLQELRLMDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LCGALLRVWGRIAAVMADVSSSSYLQIVRLKTKDRKKQVGIKIPEGCVRRVLQELRLMDA
1110 1120 1130 1140 1150 1160
1230 1240 1250 1260 1270 1280
pF1KSD DVKRRQAPALGCPAPPAPRPLALPCGPGEVLDLTYSPPAEAFPPPPHFSFPAPLSLDAGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 DVKRRQAPALGCPAPPAPRPLALPCGPGEVLDLTYSPPAEAFPPPPHFSFPAPLSLDAGP
1170 1180 1190 1200 1210 1220
1290 1300 1310 1320 1330 1340
pF1KSD GVVPLGTPDAQADPAALAHQGCDINFKEVLEDMLRSLHAGPPSEGALGEGAGAGGAAGGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GVVPLGTPDAQADPAALAHQGCDINFKEVLEDMLRSLHAGPPSEGALGEGAGAGGAAGGG
1230 1240 1250 1260 1270 1280
1350 1360
pF1KSD PERQSVIQFSPPFPGAQAPL
::::::::::::::::::::
CCDS45 PERQSVIQFSPPFPGAQAPL
1290 1300
>>CCDS9246.1 SBNO1 gene_id:55206|Hs108|chr12 (1392 aa)
initn: 2852 init1: 1162 opt: 1918 Z-score: 1406.0 bits: 272.6 E(32554): 5.4e-72
Smith-Waterman score: 3833; 54.3% identity (75.2% similar) in 1147 aa overlap (183-1225:222-1365)
160 170 180 190 200 210
pF1KSD RPFAGFEDFLPSHSTPLLVSYQEQSVQSQPEEEDEAEEEEAEELGHTETYADYVPSKSKI
.:.:: :::. ::.::.::::.:.: : ::
CCDS92 KESSNKEGARMWINDMKMRSFSPTMKVPVVKEDDEPEEEDEEEMGHAETYAEYMPIKLKI
200 210 220 230 240 250
220 230 240 250 260
pF1KSD GKQHPDRVVETSTLSSVPPPDITYTLALPS---DSGALSALQLEAITYACQQHEVLLPSG
: .::: :::::.:::: :::. : .. :.: :::::::::::: ::::..::.:
CCDS92 GLRHPDAVVETSSLSSVTPPDVWYKTSISEETIDNGWLSALQLEAITYAAQQHETFLPNG
260 270 280 290 300 310
270 280 290 300 310 320
pF1KSD QRAGFLIGDGAGVGKGRTVAGVILENHLRGRKKALWFSVSNDLKYDAERDLRDIEATGIA
.:::::::::::::::::.::.: ::.: .::.::::::::::::::::::::: : .:
CCDS92 DRAGFLIGDGAGVGKGRTIAGIIYENYLLSRKRALWFSVSNDLKYDAERDLRDIGAKNIL
320 330 340 350 360 370
330 340 350 360 370 380
pF1KSD VHALSKIKYGDTTTS------EGVLFATYSALIGESQAGGQHRTRLRQILDWCGEAFEGV
::.:.:.::: ... .::.:::::.::::::.::...:::.:.: :::. :.::
CCDS92 VHSLNKFKYGKISSKHNGSVKKGVIFATYSSLIGESQSGGKYKTRLKQLLHWCGDDFDGV
380 390 400 410 420 430
390 400 410 420 430
pF1KSD IVFDECHKAKN---AGS---TKMGKAVLDLQNKLPLARVVYASATGASEPRNMIYMSRLG
::::::::::: .:: :: : :::.:::::: ::::::::::::::::: ::.:::
CCDS92 IVFDECHKAKNLCPVGSSKPTKTGLAVLELQNKLPKARVVYASATGASEPRNMAYMNRLG
440 450 460 470 480 490
440 450 460 470 480 490
pF1KSD IWGEGTPFRNFEEFLHAIEKRGVGAMEIVAMDMKVSGMYIARQLSFSGVTFRIEEIPLAP
:::::::::.: .:..:.:.::::::::::::::. ::::::::::.::::.:::. :.
CCDS92 IWGEGTPFREFSDFIQAVERRGVGAMEIVAMDMKLRGMYIARQLSFTGVTFKIEEVLLSQ
500 510 520 530 540 550
500 510 520 530 540 550
pF1KSD AFECVYNRAALLWAEALNVFQQAADWIGLESR--KSLWGQFWSAHQRFFKYLCIAAKVRR
.. .::.:. ::. : . :::::: : :.: ::.::::::::::::::::::.::.:
CCDS92 SYVKMYNKAVKLWVIARERFQQAADLIDAEQRMKKSMWGQFWSAHQRFFKYLCIASKVKR
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]