Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA0939
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0939, 581 aa
1>>>pF1KSDA0939 581 - 581 aa - 581 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5710+/-0.0012; mu= 17.2268+/- 0.072
mean_var=67.9398+/-13.905, 0's: 0 Z-trim(100.9): 25 B-trim: 0 in 0/48
Lambda= 0.155601
statistics sampled from 6285 (6302) to 6285 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.54), E-opt: 0.2 (0.194), width: 16
Scan time: 3.230
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS13421.1 SLC9A8 gene_id:23315|Hs108|chr20 ( 581) 3764 854.7 0
CCDS58774.1 SLC9A8 gene_id:23315|Hs108|chr20 ( 597) 2630 600.1 2.5e-171
CCDS33872.1 SLC9A9 gene_id:285195|Hs108|chr3 ( 645) 931 218.8 1.7e-56
CCDS75967.1 SLC9A7 gene_id:84679|Hs108|chrX ( 726) 913 214.7 3.1e-55
CCDS14269.1 SLC9A7 gene_id:84679|Hs108|chrX ( 725) 890 209.6 1.1e-53
CCDS83492.1 SLC9A6 gene_id:10479|Hs108|chrX ( 617) 889 209.3 1.1e-53
CCDS14654.1 SLC9A6 gene_id:10479|Hs108|chrX ( 669) 889 209.3 1.2e-53
CCDS55504.1 SLC9A6 gene_id:10479|Hs108|chrX ( 649) 881 207.5 4.1e-53
CCDS44003.1 SLC9A6 gene_id:10479|Hs108|chrX ( 701) 881 207.5 4.4e-53
CCDS295.1 SLC9A1 gene_id:6548|Hs108|chr1 ( 815) 782 185.4 2.5e-46
CCDS42178.1 SLC9A5 gene_id:6553|Hs108|chr16 ( 896) 780 184.9 3.7e-46
CCDS33264.1 SLC9A4 gene_id:389015|Hs108|chr2 ( 798) 758 180.0 1e-44
CCDS3855.1 SLC9A3 gene_id:6550|Hs108|chr5 ( 834) 757 179.7 1.2e-44
CCDS2062.1 SLC9A2 gene_id:6549|Hs108|chr2 ( 812) 754 179.1 1.9e-44
CCDS64116.1 SLC9A3 gene_id:6550|Hs108|chr5 ( 825) 724 172.3 2.1e-42
>>CCDS13421.1 SLC9A8 gene_id:23315|Hs108|chr20 (581 aa)
initn: 3764 init1: 3764 opt: 3764 Z-score: 4565.4 bits: 854.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3764; 100.0% identity (100.0% similar) in 581 aa overlap (1-581:1-581)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MGEKMAEEERFPNTTHEGFNVTLHTTLVVTTKLVLPTPGKPILPVQTGEQAQQEEQSSGM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MGEKMAEEERFPNTTHEGFNVTLHTTLVVTTKLVLPTPGKPILPVQTGEQAQQEEQSSGM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD TIFFSLLVLAICIILVHLLIRYRLHFLPESVAVVSLGILMGAVIKIIEFKKLANWKEEEM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 TIFFSLLVLAICIILVHLLIRYRLHFLPESVAVVSLGILMGAVIKIIEFKKLANWKEEEM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD FRPNMFFLLLLPPIIFESGYSLHKGNFFQNIGSITLFAVFGTAISAFVVGGGIYFLGQAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 FRPNMFFLLLLPPIIFESGYSLHKGNFFQNIGSITLFAVFGTAISAFVVGGGIYFLGQAD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD VISKLNMTDSFAFGSLISAVDPVATIAIFNALHVDPVLNMLVFGESILNDAVSIVLTNTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 VISKLNMTDSFAFGSLISAVDPVATIAIFNALHVDPVLNMLVFGESILNDAVSIVLTNTA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD EGLTRKNMSDVSGWQTFLQALDYFLKMFFGSAALGTLTGLISALVLKHIDLRKTPSLEFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 EGLTRKNMSDVSGWQTFLQALDYFLKMFFGSAALGTLTGLISALVLKHIDLRKTPSLEFG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD MMIIFAYLPYGLAEGISLSGIMAILFSGIVMSHYTHHNLSPVTQILMQQTLRTVAFLCET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MMIIFAYLPYGLAEGISLSGIMAILFSGIVMSHYTHHNLSPVTQILMQQTLRTVAFLCET
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD CVFAFLGLSIFSFPHKFEISFVIWCIVLVLFGRAVNIFPLSYLLNFFRDHKITPKMMFIM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 CVFAFLGLSIFSFPHKFEISFVIWCIVLVLFGRAVNIFPLSYLLNFFRDHKITPKMMFIM
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD WFSGLRGAIPYALSLHLDLEPMEKRQLIGTTTIVIVLFTILLLGGSTMPLIRLMDIEDAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 WFSGLRGAIPYALSLHLDLEPMEKRQLIGTTTIVIVLFTILLLGGSTMPLIRLMDIEDAK
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD AHRRNKKDVNLSKTEKMGNTVESEHLSELTEEEYEAHYIRRQDLKGFVWLDAKYLNPFFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 AHRRNKKDVNLSKTEKMGNTVESEHLSELTEEEYEAHYIRRQDLKGFVWLDAKYLNPFFT
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580
pF1KSD RRLTQEDLHHGRIQMKTLTNKWYEEVRQGPSGSEDDEQELL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 RRLTQEDLHHGRIQMKTLTNKWYEEVRQGPSGSEDDEQELL
550 560 570 580
>>CCDS58774.1 SLC9A8 gene_id:23315|Hs108|chr20 (597 aa)
initn: 2630 init1: 2630 opt: 2630 Z-score: 3189.5 bits: 600.1 E(32554): 2.5e-171
Smith-Waterman score: 3722; 97.3% identity (97.3% similar) in 597 aa overlap (1-581:1-597)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MGEKMAEEERFPNTTHEGFNVTLHTTLVVTTKLVLPTPGKPILPVQTGEQAQQEEQSSGM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MGEKMAEEERFPNTTHEGFNVTLHTTLVVTTKLVLPTPGKPILPVQTGEQAQQEEQSSGM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD TIFFSLLVLAICIILVHLLIRYRLHFLPESVAVVSLGILMGAVIKIIEFKKLANWKEEEM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 TIFFSLLVLAICIILVHLLIRYRLHFLPESVAVVSLGILMGAVIKIIEFKKLANWKEEEM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KSD FRPNMFFLLLLPPIIFESGYSLHKGNFFQNIGSITLFAVFGTAISAFVVGGGIYFLGQ--
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 FRPNMFFLLLLPPIIFESGYSLHKGNFFQNIGSITLFAVFGTAISAFVVGGGIYFLGQGF
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220
pF1KSD --------------ADVISKLNMTDSFAFGSLISAVDPVATIAIFNALHVDPVLNMLVFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 FFVCVCVFVCFILQADVISKLNMTDSFAFGSLISAVDPVATIAIFNALHVDPVLNMLVFG
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KSD ESILNDAVSIVLTNTAEGLTRKNMSDVSGWQTFLQALDYFLKMFFGSAALGTLTGLISAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 ESILNDAVSIVLTNTAEGLTRKNMSDVSGWQTFLQALDYFLKMFFGSAALGTLTGLISAL
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KSD VLKHIDLRKTPSLEFGMMIIFAYLPYGLAEGISLSGIMAILFSGIVMSHYTHHNLSPVTQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 VLKHIDLRKTPSLEFGMMIIFAYLPYGLAEGISLSGIMAILFSGIVMSHYTHHNLSPVTQ
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KSD ILMQQTLRTVAFLCETCVFAFLGLSIFSFPHKFEISFVIWCIVLVLFGRAVNIFPLSYLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 ILMQQTLRTVAFLCETCVFAFLGLSIFSFPHKFEISFVIWCIVLVLFGRAVNIFPLSYLL
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KSD NFFRDHKITPKMMFIMWFSGLRGAIPYALSLHLDLEPMEKRQLIGTTTIVIVLFTILLLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 NFFRDHKITPKMMFIMWFSGLRGAIPYALSLHLDLEPMEKRQLIGTTTIVIVLFTILLLG
430 440 450 460 470 480
470 480 490 500 510 520
pF1KSD GSTMPLIRLMDIEDAKAHRRNKKDVNLSKTEKMGNTVESEHLSELTEEEYEAHYIRRQDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 GSTMPLIRLMDIEDAKAHRRNKKDVNLSKTEKMGNTVESEHLSELTEEEYEAHYIRRQDL
490 500 510 520 530 540
530 540 550 560 570 580
pF1KSD KGFVWLDAKYLNPFFTRRLTQEDLHHGRIQMKTLTNKWYEEVRQGPSGSEDDEQELL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 KGFVWLDAKYLNPFFTRRLTQEDLHHGRIQMKTLTNKWYEEVRQGPSGSEDDEQELL
550 560 570 580 590
>>CCDS33872.1 SLC9A9 gene_id:285195|Hs108|chr3 (645 aa)
initn: 914 init1: 504 opt: 931 Z-score: 1127.7 bits: 218.8 E(32554): 1.7e-56
Smith-Waterman score: 945; 38.3% identity (70.3% similar) in 431 aa overlap (117-540:125-542)
90 100 110 120 130 140
pF1KSD LPESVAVVSLGILMGAVIKIIEFKKLANWKEEEMFRPNMFFLLLLPPIIFESGYSLHKGN
:. : :..:: .:::::::..::::.: .
CCDS33 VNITDQVYEYKYKREISQHNINPHQGNAILEKMTFDPEIFFNVLLPPIIFHAGYSLKKRH
100 110 120 130 140 150
150 160 170 180 190 200
pF1KSD FFQNIGSITLFAVFGTAISAFVVGGGIYFLGQADVIS------KLNMTDSFAFGSLISAV
::::.::: .: .::::: .:.: .: . .: . . ...:: . ::::.::.
CCDS33 FFQNLGSILTYAFLGTAISCIVIGLIMYGFVKAMIHAGQLKNGDFHFTDCLFFGSLMSAT
160 170 180 190 200 210
210 220 230 240 250 260
pF1KSD DPVATIAIFNALHVDPVLNMLVFGESILNDAVSIVLTNTAEGLTRKNMSDVSGWQTFLQA
:::...:::. ::::: : :.::::.:::::.:::: . . :. .. .:.:.
CCDS33 DPVTVLAIFHELHVDPDLYTLLFGESVLNDAVAIVLTYSISIYSPKENPNAFDAAAFFQS
220 230 240 250 260 270
270 280 290 300 310 320
pF1KSD LDYFLKMFFGSAALGTLTGLISALVLKHIDLRKTPSLEFGMMIIFAYLPYGLAEGISLSG
. :: .: :: :.:. ..:.::. : : . : :: :....... . ::. .:.:
CCDS33 VGNFLGIFAGSFAMGSAYAIITALLTKFTKLCEFPMLETGLFFLLSWSAFLSAEAAGLTG
280 290 300 310 320 330
330 340 350 360 370
pF1KSD IMAILFSGIVMSHYTHHNLSPVTQILMQQTLRTVAFLCETCVFAFLGLSIFSFP-HKFEI
:.:.:: :....:::..::: ..: .: .. . :: :. .: ..::..:.: : :.
CCDS33 IVAVLFCGVTQAHYTYNNLSSDSKIRTKQLFEFMNFLAENVIFCYMGLALFTFQNHIFNA
340 350 360 370 380 390
380 390 400 410 420 430
pF1KSD SFVIWCIVLVLFGRAVNIFPLSYLLNFFRDHKITPKMMFIMWFSGLRGAIPYALSLHLDL
:.. .. .. .:: ::.:::.:::. : .:: ... .: :::::::: .::... .
CCDS33 LFILGAFLAIFVARACNIYPLSFLLNLGRKQKIPWNFQHMMMFSGLRGAIAFALAIR-NT
400 410 420 430 440 450
440 450 460 470 480 490
pF1KSD EPMEKRQLIGTTTIVIVLFTILLLGGSTMPLIRLMDIEDAKAHRRNKKDVNLSKTEKMGN
: . : :.. :::...:.::. ..::.: :.. ..: . :.:... :
CCDS33 ESQPK-QMMFTTTLLLVFFTVWVFGGGTTPMLTWLQI---------RVGVDLDENLKEDP
460 470 480 490 500
500 510 520 530 540 550
pF1KSD TVESEHLSELTEEEYEAHYIRRQDLKGFVWLDAKYLNPFFTRRLTQEDLHHGRIQMKTLT
. . .. ..: .. .:. : .. . .: :::.:..:
CCDS33 SSQHQEANNLDKNMTKAESARL--FRMWYSFDHKYLKPILTHSGPPLTTTLPEWCGPISR
510 520 530 540 550 560
560 570 580
pF1KSD NKWYEEVRQGPSGSEDDEQELL
CCDS33 LLTSPQAYGEQLKEDDVECIVNQDELAINYQEQASSPCSPPARLGLDQKASPQTPGKENI
570 580 590 600 610 620
>>CCDS75967.1 SLC9A7 gene_id:84679|Hs108|chrX (726 aa)
initn: 839 init1: 284 opt: 913 Z-score: 1105.0 bits: 214.7 E(32554): 3.1e-55
Smith-Waterman score: 913; 40.5% identity (74.8% similar) in 365 aa overlap (121-476:178-538)
100 110 120 130 140 150
pF1KSD VAVVSLGILMGAVIKIIEFKKLANWKEEEMFRPNMFFLLLLPPIIFESGYSLHKGNFFQN
: :..:: .:::::::..::::.: .::.:
CCDS75 GKFFEYTLKGEISPGKINSVEQNDMLRKVTFDPEVFFNILLPPIIFHAGYSLKKRHFFRN
150 160 170 180 190 200
160 170 180 190 200
pF1KSD IGSITLFAVFGTAISAFVVGGGIY-------FLGQADVISKLNMTDSFAFGSLISAVDPV
.::: .: .:::.: :..:. .: ..:: . .:. .:: . ::..:::.:::
CCDS75 LGSILAYAFLGTAVSCFIIGNLMYGVVKLMKIMGQLS--DKFYYTDCLFFGAIISATDPV
210 220 230 240 250 260
210 220 230 240 250 260
pF1KSD ATIAIFNALHVDPVLNMLVFGESILNDAVSIVLTNTAEGLTRKNM-SDVSGWQTFLQALD
...:::: ::.: : :.::::.:::::.:::... . .. . . .:....
CCDS75 TVLAIFNELHADVDLYALLFGESVLNDAVAIVLSSSIVAYQPAGLNTHAFDAAAFFKSVG
270 280 290 300 310 320
270 280 290 300 310 320
pF1KSD YFLKMFFGSAALGTLTGLISALVLKHIDLRKTPSLEFGMMIIFAYLPYGLAEGISLSGIM
:: .: :: ..:..::...::: : :. : :: ........ . :::. ...:..
CCDS75 IFLGIFSGSFTMGAVTGVVTALVTKFTKLHCFPLLETALFFLMSWSTFLLAEACGFTGVV
330 340 350 360 370 380
330 340 350 360 370 380
pF1KSD AILFSGIVMSHYTHHNLSPVTQILMQQTLRTVAFLCETCVFAFLGLSIFSFP-HKFEISF
:.:: ::...:::..::: .. .: .... :: :. .:...::..:.: : : :
CCDS75 AVLFCGITQAHYTYNNLSVESRSRTKQLFEVLHFLAENFIFSYMGLALFTFQKHVFSPIF
390 400 410 420 430 440
390 400 410 420 430 440
pF1KSD VIWCIVLVLFGRAVNIFPLSYLLNFFRDHKITPKMMFIMWFSGLRGAIPYALSLHLDLEP
.: .: ...:::..:.:::..::. : ::: ... .: :::::::. .::... :
CCDS75 IIGAFVAIFLGRAAHIYPLSFFLNLGRRHKIGWNFQHMMMFSGLRGAMAFALAIR-DTAS
450 460 470 480 490 500
450 460 470 480 490 500
pF1KSD MEKRQLIGTTTIVIVLFTILLLGGSTMPLIRLMDIEDAKAHRRNKKDVNLSKTEKMGNTV
. ::.. :::..::.::. ..::.: :.. ..:
CCDS75 YA-RQMMFTTTLLIVFFTVWIIGGGTTPMLSWLNIRVGVEEPSEEDQNEHHWQYFRVGVD
510 520 530 540 550 560
510 520 530 540 550 560
pF1KSD ESEHLSELTEEEYEAHYIRRQDLKGFVWLDAKYLNPFFTRRLTQEDLHHGRIQMKTLTNK
CCDS75 PDQDPPPNNDSFQVLQGDGPDSARGNRTKQESAWIFRLWYSFDHNYLKPILTHSGPPLTT
570 580 590 600 610 620
>>CCDS14269.1 SLC9A7 gene_id:84679|Hs108|chrX (725 aa)
initn: 819 init1: 363 opt: 890 Z-score: 1077.1 bits: 209.6 E(32554): 1.1e-53
Smith-Waterman score: 890; 40.3% identity (74.2% similar) in 365 aa overlap (121-476:178-537)
100 110 120 130 140 150
pF1KSD VAVVSLGILMGAVIKIIEFKKLANWKEEEMFRPNMFFLLLLPPIIFESGYSLHKGNFFQN
: :..:: .:::::::..::::.: .::.:
CCDS14 GKFFEYTLKGEISPGKINSVEQNDMLRKVTFDPEVFFNILLPPIIFHAGYSLKKRHFFRN
150 160 170 180 190 200
160 170 180 190 200
pF1KSD IGSITLFAVFGTAISAFVVGGGIY-------FLGQADVISKLNMTDSFAFGSLISAVDPV
.::: .: .:::.: :..:. .: ..:: . .:. .:: . ::..:::.:::
CCDS14 LGSILAYAFLGTAVSCFIIGNLMYGVVKLMKIMGQLS--DKFYYTDCLFFGAIISATDPV
210 220 230 240 250 260
210 220 230 240 250 260
pF1KSD ATIAIFNALHVDPVLNMLVFGESILNDAVSIVLTNTAEGLTRKNM-SDVSGWQTFLQALD
...:::: ::.: : :.::::.:::::.:::... . .. . . .:....
CCDS14 TVLAIFNELHADVDLYALLFGESVLNDAVAIVLSSSIVAYQPAGLNTHAFDAAAFFKSVG
270 280 290 300 310 320
270 280 290 300 310 320
pF1KSD YFLKMFFGSAALGTLTGLISALVLKHIDLRKTPSLEFGMMIIFAYLPYGLAEGISLSGIM
:: .: :: ..:..:: ..: : : :. : :: ........ . :::. ...:..
CCDS14 IFLGIFSGSFTMGAVTG-VNANVTKFTKLHCFPLLETALFFLMSWSTFLLAEACGFTGVV
330 340 350 360 370 380
330 340 350 360 370 380
pF1KSD AILFSGIVMSHYTHHNLSPVTQILMQQTLRTVAFLCETCVFAFLGLSIFSFP-HKFEISF
:.:: ::...:::..::: .. .: .... :: :. .:...::..:.: : : :
CCDS14 AVLFCGITQAHYTYNNLSVESRSRTKQLFEVLHFLAENFIFSYMGLALFTFQKHVFSPIF
390 400 410 420 430 440
390 400 410 420 430 440
pF1KSD VIWCIVLVLFGRAVNIFPLSYLLNFFRDHKITPKMMFIMWFSGLRGAIPYALSLHLDLEP
.: .: ...:::..:.:::..::. : ::: ... .: :::::::. .::... :
CCDS14 IIGAFVAIFLGRAAHIYPLSFFLNLGRRHKIGWNFQHMMMFSGLRGAMAFALAIR-DTAS
450 460 470 480 490 500
450 460 470 480 490 500
pF1KSD MEKRQLIGTTTIVIVLFTILLLGGSTMPLIRLMDIEDAKAHRRNKKDVNLSKTEKMGNTV
. ::.. :::..::.::. ..::.: :.. ..:
CCDS14 YA-RQMMFTTTLLIVFFTVWIIGGGTTPMLSWLNIRVGVEEPSEEDQNEHHWQYFRVGVD
510 520 530 540 550 560
510 520 530 540 550 560
pF1KSD ESEHLSELTEEEYEAHYIRRQDLKGFVWLDAKYLNPFFTRRLTQEDLHHGRIQMKTLTNK
CCDS14 PDQDPPPNNDSFQVLQGDGPDSARGNRTKQESAWIFRLWYSFDHNYLKPILTHSGPPLTT
570 580 590 600 610 620
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: .:: . ::...::.:::...:::. :.:: : :.::::.:::::.:::...
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.. . .: : .:: .... :: .: :: :.:. ::...::: : ::.
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:
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20 30 40 50 60 70
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: .:: . ::...::.:::...:::. :.:: : :.::::.:::::.:::...
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250 260 270 280 290
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:
CCDS14 HIRVGVDSDQEHLGVPENERRTTKAESAWLFRMWYNFDHNYLKPLLTHSGPPLTTTLPAC
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CCDS44 PTTLLVNVSGKFYEYMLKGEISSHELNNVQDNEMLRKVTFDPEVFFNILLPPIIFYAGYS
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150 160 170 180 190
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CCDS44 LKRRHFFRNLGSILAYAFLGTAISCFVIGSIMYGCVTLMKVTGQLAGDFYFTDCLLFGAI
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260 270 280 290 300 310
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CCDS44 FDVTAMFKSIGIFLGIFSGSFAMGAATGVVTALVTKFTKLREFQLLETGLFFLMSWSTFL
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320 330 340 350 360 370
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380 390 400 410 420 430
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CCDS44 TFQNHVFNPTFVVGAFVAIFLGRAANIYPLSLLLNLGRRSKIGSNFQHMMMFAGLRGAMA
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CCDS44 FALAIR-DTATYA-RQMMFSTTLLIVFFTVWVFGGGTTAMLSCLHIRVGVDSDQEHLGVP
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CCDS29 HSVTDHGMKPRKAFPVLGIDYTHVRTPFEISLWILLACLMKIGFHVIPTISSIVPESCLL
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CCDS29 IVVGLLVGGLIKGVG-------ETPPFLQSDVFFLFLLPPIILDAGYFLPLRQFTENLGT
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CCDS29 ILIFAVVGTLWNAFFLGGLMYAVCLVGGEQINNIGLLDNLLFGSIISAVDPVAVLAVFEE
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CCDS29 IHINELLHILVFGESLLNDAVTVVLYHLFEEFA--NYEHVGIVDIFLGFLSFFV-VALGG
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pF1KSD AALGTLTGLISALVLKHIDLRKTPSLEFGMMIIFAYLPYGLAEGISLSGIMAILFSGIVM
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CCDS29 VLVGVVYGVIAAFTSRFTSHIRV--IEPLFVFLYSYMAYLSAELFHLSGIMALIASGVVM
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CCDS29 RPYVEANISHKSHTTIKYFLKMWSSVSETLIFIFLGVSTVAGSHHWNWTFVISTLLFCLI
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CCDS29 ARVLGVLGLTWFINKFRIVKLTPKDQFIIAYGGLRGAIAFSLGYLLDKKHFPMCDLFLTA
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pF1KSD TIVIVLFTILLLGGSTMPLIRLMDIEDAKAHRRNKKDVNLSKTEKMGNTVESEHLSELTE
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CCDS29 IITVIFFTVFVQGMTIRPLVDLLAV---KKKQETKRSINEEIHTQFLDHLLTGIEDICGH
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CCDS29 YGHHHWKDKLNRFNKKYVKKCLIAGERSKEPQLIAFYHKMEMKQAIELVESGGMGKIPSA
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581 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 04:19:04 2016 done: Thu Nov 3 04:19:05 2016
Total Scan time: 3.230 Total Display time: 0.090
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]