Result of FASTA (omim) for
pF1KSDA0921
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0921, 1642 aa
1>>>pF1KSDA0921 1642 - 1642 aa - 1642 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.2220+/-0.000546; mu= 2.7506+/- 0.034
mean_var=411.5080+/-85.463, 0's: 0 Z-trim(118.3): 176 B-trim: 802 in 2/54
Lambda= 0.063224
statistics sampled from 30934 (31113) to 30934 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.67), E-opt: 0.2 (0.365), width: 16
Scan time: 16.280
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_620060 (OMIM: 600566) neurexin-2-beta isoform a (1642) 11111 1030.0 0
XP_016874062 (OMIM: 600566) PREDICTED: neurexin-2- (1479) 7302 682.5 7.4e-195
XP_016874054 (OMIM: 600566) PREDICTED: neurexin-2- (1703) 6491 608.6 1.5e-172
XP_016877290 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3 (1544) 6361 596.7 5.2e-169
NP_001317012 (OMIM: 600565,614325,614332) neurexin (1452) 6222 584.0 3.3e-165
NP_001317024 (OMIM: 600565,614325,614332) neurexin (1460) 6199 581.9 1.4e-164
NP_001317017 (OMIM: 600565,614325,614332) neurexin (1447) 6185 580.6 3.4e-164
XP_016877288 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3 (1654) 5948 559.0 1.2e-157
XP_016874056 (OMIM: 600566) PREDICTED: neurexin-2- (1685) 5940 558.3 2e-157
XP_016874057 (OMIM: 600566) PREDICTED: neurexin-2- (1682) 5936 558.0 2.6e-157
XP_016877282 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3 (1678) 5854 550.5 4.6e-155
XP_016877293 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3 (1467) 5843 549.4 8.5e-155
XP_016860813 (OMIM: 600565,614325,614332) PREDICTE (1475) 5739 539.9 6.1e-152
XP_016860814 (OMIM: 600565,614325,614332) PREDICTE (1472) 5723 538.5 1.7e-151
NP_001317013 (OMIM: 600565,614325,614332) neurexin (1485) 5670 533.6 4.8e-150
NP_001317016 (OMIM: 600565,614325,614332) neurexin (1440) 5668 533.4 5.3e-150
NP_001317025 (OMIM: 600565,614325,614332) neurexin (1437) 5652 532.0 1.5e-149
XP_011535669 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3 (1657) 5652 532.0 1.6e-149
XP_011531480 (OMIM: 600565,614325,614332) PREDICTE (1484) 5626 529.6 7.7e-149
XP_016877291 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3 (1541) 5405 509.5 9.3e-143
XP_016860809 (OMIM: 600565,614325,614332) PREDICTE (1495) 5333 502.9 8.6e-141
NP_001317014 (OMIM: 600565,614325,614332) neurexin (1498) 5333 502.9 8.6e-141
XP_016877296 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3 (1449) 5307 500.5 4.4e-140
XP_016877289 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3 (1553) 5301 500.0 6.7e-140
XP_011535675 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3 (1446) 5299 499.8 7.2e-140
XP_016860804 (OMIM: 600565,614325,614332) PREDICTE (1502) 5171 488.1 2.4e-136
XP_011531474 (OMIM: 600565,614325,614332) PREDICTE (1505) 5171 488.1 2.4e-136
XP_011531485 (OMIM: 600565,614325,614332) PREDICTE (1225) 5091 480.7 3.3e-134
XP_016877281 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3 (1683) 4978 470.6 5.2e-131
XP_006720385 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3 (1683) 4978 470.6 5.2e-131
XP_016877284 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3 (1675) 4898 463.3 8.2e-129
XP_016877283 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3 (1675) 4898 463.3 8.2e-129
NP_001317124 (OMIM: 600567) neurexin 3 isoform 5 [ (1571) 4889 462.4 1.4e-128
XP_016877294 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3 (1464) 4887 462.2 1.5e-128
XP_011535668 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3 (1679) 4888 462.4 1.5e-128
XP_011535672 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3 (1575) 4879 461.5 2.6e-128
XP_016877292 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3 (1468) 4877 461.3 2.8e-128
XP_005268275 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3 (1684) 4794 453.8 5.9e-126
XP_011535666 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3 (1687) 4794 453.8 5.9e-126
XP_016877279 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3 (1687) 4794 453.8 5.9e-126
XP_016877280 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3 (1687) 4794 453.8 5.9e-126
XP_011535665 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3 (1687) 4794 453.8 5.9e-126
XP_011535667 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3 (1687) 4794 453.8 5.9e-126
XP_011535671 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3 (1583) 4785 452.9 1e-125
XP_011535674 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3 (1476) 4783 452.7 1.1e-125
XP_011535673 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3 (1479) 4783 452.7 1.1e-125
XP_011535670 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3 (1586) 4783 452.8 1.1e-125
XP_016860807 (OMIM: 600565,614325,614332) PREDICTE (1499) 4652 440.8 4.3e-122
XP_016877285 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3 (1667) 4612 437.2 5.8e-121
XP_016877295 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3 (1462) 4601 436.1 1.1e-120
>>NP_620060 (OMIM: 600566) neurexin-2-beta isoform alpha (1642 aa)
initn: 11111 init1: 11111 opt: 11111 Z-score: 5496.5 bits: 1030.0 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 11111; 100.0% identity (100.0% similar) in 1642 aa overlap (1-1642:1-1642)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MASGSRWRPTPPPLLLLLLLALAARADGLEFGGGPGQWARYARWAGAASSGELSFSLRTN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_620 MASGSRWRPTPPPLLLLLLLALAARADGLEFGGGPGQWARYARWAGAASSGELSFSLRTN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD ATRALLLYLDDGGDCDFLELLLVDGRLRLRFTLSCAEPATLQLDTPVADDRWHMVLLTRD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_620 ATRALLLYLDDGGDCDFLELLLVDGRLRLRFTLSCAEPATLQLDTPVADDRWHMVLLTRD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD ARRTALAVDGEARAAEVRSKRREMQVASDLFVGGIPPDVRLSALTLSTVKYEPPFRGLLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_620 ARRTALAVDGEARAAEVRSKRREMQVASDLFVGGIPPDVRLSALTLSTVKYEPPFRGLLA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD NLKLGERPPALLGSQGLRGATADPLCAPARNPCANGGLCTVLAPGEVGCDCSHTGFGGKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_620 NLKLGERPPALLGSQGLRGATADPLCAPARNPCANGGLCTVLAPGEVGCDCSHTGFGGKF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD CSEEEHPMEGPAHLTLNSEGKEEFVATFKGNEFFCYDLSHNPIQSSTDEITLAFRTLQRN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_620 CSEEEHPMEGPAHLTLNSEGKEEFVATFKGNEFFCYDLSHNPIQSSTDEITLAFRTLQRN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD GLMLHTGKSADYVNLSLKSGAVWLVINLGSGAFEALVEPVNGKFNDNAWHDVRVTRNLRQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_620 GLMLHTGKSADYVNLSLKSGAVWLVINLGSGAFEALVEPVNGKFNDNAWHDVRVTRNLRQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD HAGIGHAMVTISVDGILTTTGYTQEDYTMLGSDDFFYIGGSPNTADLPGSPVSNNFMGCL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_620 HAGIGHAMVTISVDGILTTTGYTQEDYTMLGSDDFFYIGGSPNTADLPGSPVSNNFMGCL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD KDVVYKNNDFKLELSRLAKEGDPKMKLQGDLSFRCEDVAALDPVTFESPEAFVALPRWSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_620 KDVVYKNNDFKLELSRLAKEGDPKMKLQGDLSFRCEDVAALDPVTFESPEAFVALPRWSA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD KRTGSISLDFRTTEPNGLLLFSQGRRAGGGAGSHSSAQRADYFAMELLDGHLYLLLDMGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_620 KRTGSISLDFRTTEPNGLLLFSQGRRAGGGAGSHSSAQRADYFAMELLDGHLYLLLDMGS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD GGIKLRASSRKVNDGEWCHVDFQRDGRKGSISVNSRSTPFLATGDSEILDLESELYLGGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_620 GGIKLRASSRKVNDGEWCHVDFQRDGRKGSISVNSRSTPFLATGDSEILDLESELYLGGL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD PEGGRVDLPLPPEVWTAALRAGYVGCVRDLFIDGRSRDLRGLAEAQGAVGVAPFCSRETL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_620 PEGGRVDLPLPPEVWTAALRAGYVGCVRDLFIDGRSRDLRGLAEAQGAVGVAPFCSRETL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD KQCASAPCRNGGVCREGWNRFICDCIGTGFLGRVCEREATVLSYDGSMYMKIMLPNAMHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_620 KQCASAPCRNGGVCREGWNRFICDCIGTGFLGRVCEREATVLSYDGSMYMKIMLPNAMHT
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD EAEDVSLRFMSQRAYGLMMATTSRESADTLRLELDGGQMKLTVNLGKGPETLFAGHKLND
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_620 EAEDVSLRFMSQRAYGLMMATTSRESADTLRLELDGGQMKLTVNLGKGPETLFAGHKLND
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790 800 810 820 830 840
pF1KSD NEWHTVRVVRRGKSLQLSVDNVTVEGQMAGAHMRLEFHNIETGIMTERRFISVVPSNFIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_620 NEWHTVRVVRRGKSLQLSVDNVTVEGQMAGAHMRLEFHNIETGIMTERRFISVVPSNFIG
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD HLSGLVFNGQPYMDQCKDGDITYCELNARFGLRAIVADPVTFKSRSSYLALATLQAYASM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_620 HLSGLVFNGQPYMDQCKDGDITYCELNARFGLRAIVADPVTFKSRSSYLALATLQAYASM
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910 920 930 940 950 960
pF1KSD HLFFQFKTTAPDGLLLFNSGNGNDFIVIELVKGYIHYVFDLGNGPSLMKGNSDKPVNDNQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_620 HLFFQFKTTAPDGLLLFNSGNGNDFIVIELVKGYIHYVFDLGNGPSLMKGNSDKPVNDNQ
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pF1KSD WHNVVVSRDPGNVHTLKIDSRTVTQHSNGARNLDLKGELYIGGLSKNMFSNLPKLVASRD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_620 WHNVVVSRDPGNVHTLKIDSRTVTQHSNGARNLDLKGELYIGGLSKNMFSNLPKLVASRD
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD GFQGCLASVDLNGRLPDLIADALHRIGQVERGCDGPSTTCTEESCANQGVCLQQWDGFTC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_620 GFQGCLASVDLNGRLPDLIADALHRIGQVERGCDGPSTTCTEESCANQGVCLQQWDGFTC
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pF1KSD DCTMTSYGGPVCNDPGTTYIFGKGGALITYTWPPNDRPSTRMDRLAVGFSTHQRSAVLVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_620 DCTMTSYGGPVCNDPGTTYIFGKGGALITYTWPPNDRPSTRMDRLAVGFSTHQRSAVLVR
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pF1KSD VDSASGLGDYLQLHIDQGTVGVIFNVGTDDITIDEPNAIVSDGKYHVVRFTRSGGNATLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_620 VDSASGLGDYLQLHIDQGTVGVIFNVGTDDITIDEPNAIVSDGKYHVVRFTRSGGNATLQ
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pF1KSD VDSWPVNERYPAGRQLTIFNSQAAIKIGGRDQGRPFQGQVSGLYYNGLKVLALAAESDPN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_620 VDSWPVNERYPAGRQLTIFNSQAAIKIGGRDQGRPFQGQVSGLYYNGLKVLALAAESDPN
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pF1KSD VRTEGHLRLVGEGPSVLLSAETTATTLLADMATTIMETTTTMATTTTRRGRSPTLRDSTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_620 VRTEGHLRLVGEGPSVLLSAETTATTLLADMATTIMETTTTMATTTTRRGRSPTLRDSTT
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1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KSD QNTDDLLVASAECPSDDEDLEECEPSTGGELILPIITEDSLDPPPVATRSPFVPPPPTFY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_620 QNTDDLLVASAECPSDDEDLEECEPSTGGELILPIITEDSLDPPPVATRSPFVPPPPTFY
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pF1KSD PFLTGVGATQDTLPPPAARRPPSGGPCQAERDDSDCEEPIEASGFASGEVFDSSLPPTDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_620 PFLTGVGATQDTLPPPAARRPPSGGPCQAERDDSDCEEPIEASGFASGEVFDSSLPPTDD
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KSD EDFYTTFPLVTDRTTLLSPRKPAPRPNLRTDGATGAPGVLFAPSAPAPNLPAGKMNHRDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_620 EDFYTTFPLVTDRTTLLSPRKPAPRPNLRTDGATGAPGVLFAPSAPAPNLPAGKMNHRDP
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KSD LQPLLENPPLGPGAPTSFEPRRPPPLRPGVTSAPGFPHLPTANPTGPGERGPPGAVEVIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_620 LQPLLENPPLGPGAPTSFEPRRPPPLRPGVTSAPGFPHLPTANPTGPGERGPPGAVEVIR
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KSD ESSSTTGMVVGIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDEGSYQVDQSRNYISNSAQSNGAVVKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_620 ESSSTTGMVVGIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDEGSYQVDQSRNYISNSAQSNGAVVKE
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1630 1640
pF1KSD KAPAAPKTPSKAKKNKDKEYYV
::::::::::::::::::::::
NP_620 KAPAAPKTPSKAKKNKDKEYYV
1630 1640
>>XP_016874062 (OMIM: 600566) PREDICTED: neurexin-2-beta (1479 aa)
initn: 8344 init1: 6594 opt: 7302 Z-score: 3619.3 bits: 682.5 E(85289): 7.4e-195
Smith-Waterman score: 9245; 86.6% identity (86.6% similar) in 1673 aa overlap (1-1642:1-1479)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MASGSRWRPTPPPLLLLLLLALAARADGLEFGGGPGQWARYARWAGAASSGELSFSLRTN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MASGSRWRPTPPPLLLLLLLALAARADGLEFGGGPGQWARYARWAGAASSGELSFSLRTN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD ATRALLLYLDDGGDCDFLELLLVDGRLRLRFTLSCAEPATLQLDTPVADDRWHMVLLTRD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ATRALLLYLDDGGDCDFLELLLVDGRLRLRFTLSCAEPATLQLDTPVADDRWHMVLLTRD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD ARRTALAVDGEARAAEVRSKRREMQVASDLFVGGIPPDVRLSALTLSTVKYEPPFRGLLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ARRTALAVDGEARAAEVRSKRREMQVASDLFVGGIPPDVRLSALTLSTVKYEPPFRGLLA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD NLKLGERPPALLGSQGLRGATADPLCAPARNPCANGGLCTVLAPGEVGCDCSHTGFGGKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NLKLGERPPALLGSQGLRGATADPLCAPARNPCANGGLCTVLAPGEVGCDCSHTGFGGKF
190 200 210 220 230 240
250 260 270
pF1KSD CSEEEHPMEGPAHLTLNSE------------------------GKEEFVATFKGNEFFCY
::::::::::::::::::: :::::::::::::::::
XP_016 CSEEEHPMEGPAHLTLNSEVGSLLFSEGGAGRGGAGDVHQPTKGKEEFVATFKGNEFFCY
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DLSHNPIQSSTDEITLAFRTLQRNGLMLHTGKSADYVNLSLKSGAVWLVINLGSGAFEAL
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340 350 360 370 380
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::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DITIDEPNAIVSDGKYHVVRFTRSGGNATLQVDSWPVNERYPAGRQLTIFNSQAAIKIGG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DMATTIMETTTTMATTTTRRGRSPTLRDSTTQNTDDLLVASAECPSDDEDLEECEPST--
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XP_016 ------------------------------------------------------------
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XP_016 ------------------------------------------------------------
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XP_016 YRNRDEGSYQVDQSRNYISNSAQSNGAVVKEKAPAAPKTPSKAKKNKDKEYYV
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XP_016 MASGSRWRPTPPPLLLLLLLALAARADGLEFGGGPGQWARYARWAGAASSGELSFSLRTN
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pF1KSD CSEEEHPMEGPAHLTLNSE------------------------GKEEFVATFKGNEFFCY
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XP_016 CSEEEHPMEGPAHLTLNSEVGSLLFSEGGAGRGGAGDVHQPTKGKEEFVATFKGNEFFCY
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pF1KSD DLSHNPIQSSTDEITLAFRTLQRNGLMLHTGKSADYVNLSLKSGAVWLVINLGSGAFEAL
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XP_016 DLSHNPIQSSTDEITLAFRTLQRNGLMLHTGKSADYVNLSLKSGAVWLVINLGSGAFEAL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KSD DITIDEPNAIVSDGKYHVVRFTRSGGNATLQVDSWPVNERYPAG----------------
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DITIDEPNAIVSDGKYHVVRFTRSGGNATLQVDSWPVNERYPAGNFDNERLAIARQRIPY
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KSD NVRTEGHLRLVGEGPSVLLSAETTATTLLADMATTIMETTTTMATTTTRRGRSPTLRDST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NVRTEGHLRLVGEGPSVLLSAETTATTLLADMATTIMETTTTMATTTTRRGRSPTLRDST
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pF1KSD TQNTDDLLVASAECPSDDEDLEECEPSTGGELILPIITEDSLDPPPVATRSPFVPPPPTF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TQNTDDLLVASAECPSDDEDLEECEPSTGGELILPIITEDSLDPPPVATRSPFVPPPPTF
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pF1KSD YPFLTGVGATQDTLPPPAARRPPSGGPCQAERDDSDCEEPIEASGFASGEVFDSSLPPTD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 YPFLTGVGATQDTLPPPAARRPPSGGPCQAERDDSDCEEPIEASGFASGEVFDSSLPPTD
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pF1KSD DEDFYTTFPLVTDRTTLLSPRKPAPRPNLRTDGATGAPGVLFAPSAPAPNLPAGKMNHRD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DEDFYTTFPLVTDRTTLLSPRKPAPRPNLRTDGATGAPGVLFAPSAPAPNLPAGKMNHRD
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pF1KSD PLQPLLENPPLGPGAPTSFEPRRPPPLRPGVTSAPGFPHLPTANPTGPGERGPPGAVEVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PLQPLLENPPLGPGAPTSFEPRRPPPLRPGVTSAPGFPHLPTANPTGPGERGPPGAVEVI
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pF1KSD RESSSTTGMVVGIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDEGSYQVDQSRNYISNSAQSNGAVVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RESSSTTGMVVGIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDEGSYQVDQSRNYISNSAQSNGAVVK
1630 1640 1650 1660 1670 1680
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pF1KSD EKAPAAPKTPSKAKKNKDKEYYV
:::::::::::::::::::::::
XP_016 EKAPAAPKTPSKAKKNKDKEYYV
1690 1700
>>XP_016877290 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3 isof (1544 aa)
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pF1KSD MASGSRWRPTPPPLLLLLLLALAARADGLEFGGGPGQWARYARWAGAASSGELSFSLRTN
.:: .: . :::: : :.::::: :: :.. ..:::...::
XP_016 MSSTLHSVFFTLKVSILLGSLLGLCLGLEFMGLPNQWARYLRW-DASTRSDLSFQFKTN
10 20 30 40 50
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pF1KSD ATRALLLYLDDGGDCDFLELLLVDGRLRLRFTLSCAEPATLQLDTPVADDRWHMVLLTRD
.. .::::::::: :::: : :::::..:::...::: :.:. . : :. ::.....::
XP_016 VSTGLLLYLDDGGVCDFLCLSLVDGRVQLRFSMDCAETAVLS-NKQVNDSSWHFLMVSRD
60 70 80 90 100 110
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pF1KSD ARRTALAVDGEARAAEVRSKRREMQVASDLFVGGIPPDVRLSALTLSTVKYEPPFRGLLA
::.: .:::....:.. .: :.:.::::.::.: :.: :::::. :. : :.::.
XP_016 RLRTVLMLDGEGQSGELQPQRPYMDVVSDLFLGGVPTDIRPSALTLDGVQAMPGFKGLIL
120 130 140 150 160 170
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pF1KSD NLKLGERPPALLGSQGLRGATADPLCAPARNPCANGGLCTVLAPGEVGCDCSHTGFGGKF
.:: :. : ::::.:.. . : :. . :: :::.: .: :. :::: ::.:::.
XP_016 DLKYGNSEPRLLGSRGVQMDAEGP-CG--ERPCENGGICFLL-DGHPTCDCSTTGYGGKL
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290
pF1KSD CSEEEHPMEGPAHLTLNSEGK----EEFVATFKGNEFFCYDLSHNPIQSSTDEITLAFRT
:::. : .:: .. .:. :: ::::.:.:..:::::.::::::.:::::.:.:
XP_016 CSEDVSQDPGLSHLMMSEQGRSKAREENVATFRGSEYLCYDLSQNPIQSSSDEITLSFKT
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KSD LQRNGLMLHTGKSADYVNLSLKSGAVWLVINLGSGAFEALVEPVNGKFNDNAWHDVRVTR
:::::.::::::::::::.::.::: ::::::::::::.::::::::::::::::.:::
XP_016 WQRNGLILHTGKSADYVNLALKDGAVSLVINLGSGAFEAIVEPVNGKFNDNAWHDVKVTR
300 310 320 330 340 350
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pF1KSD NLRQHAGIGHAMVTISVDGILTTTGYTQEDYTMLGSDDFFYIGGSPNTADLPGSPVSNNF
:::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::.:::::::::::::
XP_016 NLRQHSGIGHAMVTISVDGILTTTGYTQEDYTMLGSDDFFYVGGSPSTADLPGSPVSNNF
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KSD MGCLKDVVYKNNDFKLELSRLAKEGDPKMKLQGDLSFRCEDVAALDPVTFESPEAFVALP
:::::.:::::::..:::::::. .: :::. :.. :.::.::.:::..::.:::...::
XP_016 MGCLKEVVYKNNDIRLELSRLARIADTKMKIYGEVVFKCENVATLDPINFETPEAYISLP
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KSD RWSAKRTGSISLDFRTTEPNGLLLFSQGRRAGGGAGSHSSAQRADYFAMELLDGHLYLLL
.:..:: ::::.::::::::::.::..:. . .. ..:.::.:::::.:::::
XP_016 KWNTKRMGSISFDFRTTEPNGLILFTHGKPQERKDARSQKNTKVDFFAVELLDGNLYLLL
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KSD DMGSGGIKLRASSRKVNDGEWCHVDFQRDGRKGSISVNSRSTPFLATGDSEILDLESELY
::::: ::..:...:.::::: :::.:::::.:.:::::: ::: :.:.:::::::...:
XP_016 DMGSGTIKVKATQKKANDGEWYHVDIQRDGRSGTISVNSRRTPFTASGESEILDLEGDMY
540 550 560 570 580 590
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pF1KSD LGGLPEGGRVDLPLPPEVWTAALRAGYVGCVRDLFIDGRSRDLRGLAEAQGAVGVAPFCS
::::::. :. : :: :.::: : :::::.:::::::::...: ::: :.:.:: ::
XP_016 LGGLPEN-RAGLILPTELWTAMLNYGYVGCIRDLFIDGRSKNIRQLAEMQNAAGVKSSCS
600 610 620 630 640 650
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pF1KSD RETLKQCASAPCRNGGVCREGWNRFICDCIGTGFLGRVCEREATVLSYDGSMYMKIMLPN
: . ::: : ::.:..::..::::::::: :::. ::.:::::..:::::::::::..:
XP_016 RMSAKQCDSYPCKNNAVCKDGWNRFICDCTGTGYWGRTCEREASILSYDGSMYMKIIMPM
660 670 680 690 700 710
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pF1KSD AMHTEAEDVSLRFMSQRAYGLMMATTSRESADTLRLELDGGQMKLTVNLGKGPETLFAGH
.:::::::::.::::::::::..:::::.::::::::::::..:: ::::::::::.::.
XP_016 VMHTEAEDVSFRFMSQRAYGLLVATTSRDSADTLRLELDGGRVKLMVNLGKGPETLYAGQ
720 730 740 750 760 770
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pF1KSD KLNDNEWHTVRVVRRGKSLQLSVDNVTVEGQMAGAHMRLEFHNIETGIMTERRFISVVPS
:::::::::::::::::::.:.::. ..:: :.: : ::::::::::::::.:.::::::
XP_016 KLNDNEWHTVRVVRRGKSLKLTVDDDVAEGTMVGDHTRLEFHNIETGIMTEKRYISVVPS
780 790 800 810 820 830
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pF1KSD NFIGHLSGLVFNGQPYMDQCKDGDITYCELNARFGLRAIVADPVTFKSRSSYLALATLQA
.:::::..:.::: :.: ::.::: ::::.:::::: :.:::::::..::::.::::::
XP_016 SFIGHLQSLMFNGLLYIDLCKNGDIDYCELKARFGLRNIIADPVTFKTKSSYLSLATLQA
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pF1KSD YASMHLFFQFKTTAPDGLLLFNSGNGNDFIVIELVKGYIHYVFDLGNGPSLMKGNSDKPV
:.:::::::::::.:::..:::::.:::::..:::::::::::::::::...:::::.:.
XP_016 YTSMHLFFQFKTTSPDGFILFNSGDGNDFIAVELVKGYIHYVFDLGNGPNVIKGNSDRPL
900 910 920 930 940 950
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pF1KSD NDNQWHNVVVSRDPGNVHTLKIDSRTVTQHSNGARNLDLKGELYIGGLSKNMFSNLPKLV
:::::::::..:: .:.:.::.:...::: :::.::::::.::..::...:.:::::::
XP_016 NDNQWHNVVITRDNSNTHSLKVDTKVVTQVINGAKNLDLKGDLYMAGLAQGMYSNLPKLV
960 970 980 990 1000 1010
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KSD ASRDGFQGCLASVDLNGRLPDLIADALHRIGQVERGCDGPSTTCTEESCANQGVCLQQWD
::::::::::::::::::::::: ::::: ::.::::.:::::: :.::::::::.:::.
XP_016 ASRDGFQGCLASVDLNGRLPDLINDALHRSGQIERGCEGPSTTCQEDSCANQGVCMQQWE
1020 1030 1040 1050 1060 1070
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pF1KSD GFTCDCTMTSYGGPVCNDPGTTYIFGKGGALITYTWPPNDRPSTRMDRLAVGFSTHQRSA
::::::.::::.: :::::.::::::.:.:: :::: ::::::: ::::::::: ...
XP_016 GFTCDCSMTSYSGNQCNDPGATYIFGKSGGLILYTWPANDRPSTRSDRLAVGFSTTVKDG
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pF1KSD VLVRVDSASGLGDYLQLHIDQGTVGVIFNVGTDDITIDEPNAIVSDGKYHVVRFTRSGGN
.:::.::: ::::.:::::.:: .::.::.:: ::.: : . :.:::::::::::.:::
XP_016 ILVRIDSAPGLGDFLQLHIEQGKIGVVFNIGTVDISIKEERTPVNDGKYHVVRFTRNGGN
1140 1150 1160 1170 1180 1190
1200 1210 1220 1230 1240 1250
pF1KSD ATLQVDSWPVNERYPAGRQLTIFNSQAAIKIGGRDQGRPFQGQVSGLYYNGLKVLALAAE
::::::.:::::.::.::::::::.:: : :::.:.:: ::::.:::::.::::: .:::
XP_016 ATLQVDNWPVNEHYPTGRQLTIFNTQAQIAIGGKDKGRLFQGQLSGLYYDGLKVLNMAAE
1200 1210 1220 1230 1240 1250
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pF1KSD SDPNVRTEGHLRLVGEGPSVLLSAETTATTLLADMATTIMETTTTMATTTTRRGRSPTLR
..::.. .: .::::: ::.: ...:: .. .:.::.:::::::::::::..::
XP_016 NNPNIKINGSVRLVGEVPSILGTTQTT--SMPPEMSTTVMETTTTMATTTTRKNRS----
1260 1270 1280 1290 1300
1320 1330 1340 1350 1360 1370
pF1KSD DSTTQNTDDLLVASAECPSDDEDLEECEPSTGGELILPIITEDSLDPPPVATRSPFVPPP
.. : :.: ::.:::: :::::. ::::::
XP_016 TASIQPTSDDLVSSAECSSDDEDFVECEPST-----------------------------
1310 1320 1330
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pF1KSD PTFYPFLTGVGATQDTLPPPAARRPPSGGPCQAERDDSDCEEPIEASGFASGEVFDSSLP
: : . .: : .: . . :
XP_016 -----------------------------------DKS-----LSTSIFEGG--YKAHAP
1340 1350
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pF1KSD PTDDEDFYTTFPLVTDRTTLLSPRKPAPRPNLRTDGATGAPGVLFAPSAPAPNLPAGKMN
...:: . :.::: : :.: :... :.. :.:::::::
XP_016 KWESKDFRPNKVSETSRTTTTS-----LSPELIRFTASSSSGMV-------PKLPAGKMN
1360 1370 1380 1390 1400
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pF1KSD HRD--PLQPLLENPPLGPGAPTSFEPRRPPPLRPGVTSAPGFPHLPTANPTGPGERGPPG
.:: : :: . :: ::..: : .:: : : ..:::::: :: : ::
XP_016 NRDLKP-QPDIVLLPL----PTAYELDSTKLKSPLITS-PMFRNVPTANPTEPGIRRVPG
1410 1420 1430 1440 1450
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pF1KSD AVEVIRESSSTTGMVVGIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDEGSYQVDQSRNYISNSAQSN
: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::..:::::::::::
XP_016 ASEVIRESSSTTGMVVGIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDEGSYQVDETRNYISNSAQSN
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pF1KSD GAVVKEKAPAAPKTPSKAKKNKDKEYYV
:...::: .. :. : .::::.::::
XP_016 GTLMKEKQQSS-KSGHKKQKNKDREYYV
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>>NP_001317012 (OMIM: 600565,614325,614332) neurexin-1 i (1452 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KSD MASGSRWRPTPPPLLLLLLLALAARADGLEFGGGPGQWARYARWAGAASSGELSFSLR
: :::: : ..:::: :. :::.:. .: .: .:.::.:.
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10 20 30 40 50
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pF1KSD TNATRALLLYLDDGGDCDFLELLLV-DGRLRLRFTLSCAEPATLQLDTPVADDRWHMVLL
: ..:.:.::.:: : ::::::.:. :::.: :.. ::::::: :::: : :: : .
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60 70 80 90 100 110
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pF1KSD TRDARRTALAVDG-EARAAEVRSKRREMQVASDLFVGGIPPDVRLSAL--TLSTVKYEPP
:. : :.: .: ::. .::.::::.: : : :::::.::..: .:: ::..:. . :
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:.: . ..... :. : : .. ..: : .. : :::.:.:.
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: ::::.::: :: ::. ::::..:::::.:.::::::.::::
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::.:::::.:.::::::::::::::::::::.::.::: :::::::::::::::::::::
NP_001 SSSDEITLSFKTLQRNGLMLHTGKSADYVNLALKNGAVSLVINLGSGAFEALVEPVNGKF
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.::::.::::::::::::::::::.::::::: .::::::::.::::::..: ..:.::.
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pF1KSD VAALDPVTFESPEAFVALPRWSAKRTGSISLDFRTTEPNGLLLFSQGRRAGGGAGSHSSA
::.:::.:::.::.:..::.:.::.:::::.::::::::::.:::.:. ..: .
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pF1KSD QRADYFAMELLDGHLYLLLDMGSGGIKLRASSRKVNDGEWCHVDFQRDGRKGSISVNSRS
..:.::.:.:::::::::::::: ::..: .::::::: :::::::::.:.::::.
NP_001 IKVDFFAIEMLDGHLYLLLDMGSGTIKIKALLKKVNDGEWYHVDFQRDGRSGTISVNTLR
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pF1KSD TPFLATGDSEILDLESELYLGGLPEGGRVDLPLPPEVWTAALRAGYVGCVRDLFIDGRSR
::. : :.::::::..:::::::::. .. : .: ::::: : :::::.:::::::.:.
NP_001 TPYTAPGESEILDLDDELYLGGLPEN-KAGLVFPTEVWTALLNYGYVGCIRDLFIDGQSK
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pF1KSD DLRGLAEAQGAVGVAPFCSRETLKQCASAPCRNGGVCREGWNRFICDCIGTGFLGRVCER
:.: .::.:...:: : ::.:: : : : ::.:.:.::.::::..::: :::.::: :::
NP_001 DIRQMAEVQSTAGVKPSCSKETAKPCLSNPCKNNGMCRDGWNRYVCDCSGTGYLGRSCER
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pF1KSD EATVLSYDGSMYMKIMLPNAMHTEAEDVSLRFMSQRAYGLMMATTSRESADTLRLELDGG
:::::::::::.:::.:: .:::::::::::: ::::::..::::::.::::::::::.:
NP_001 EATVLSYDGSMFMKIQLPVVMHTEAEDVSLRFRSQRAYGILMATTSRDSADTLRLELDAG
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pF1KSD QMKLTVNLGKGPETLFAGHKLNDNEWHTVRVVRRGKSLQLSVDNV-TVEGQMAGAHMRLE
..::::::::::::::::..::::::::::::::::::.:.::. .. ::::: : :::
NP_001 RVKLTVNLGKGPETLFAGYNLNDNEWHTVRVVRRGKSLKLTVDDQQAMTGQMAGDHTRLE
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::::::::.::::..: :::::::::..:.:::. :.: ::.::: :::::::::.: :.
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pF1KSD ADPVTFKSRSSYLALATLQAYASMHLFFQFKTTAPDGLLLFNSGNGNDFIVIELVKGYIH
:::::::..:::.::::::::.:::::::::::. :::.:.:::.::::::.::::::.:
NP_001 ADPVTFKTKSSYVALATLQAYTSMHLFFQFKTTSLDGLILYNSGDGNDFIVVELVKGYLH
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pF1KSD YVFDLGNGPSLMKGNSDKPVNDNQWHNVVVSRDPGNVHTLKIDSRTVTQHSNGARNLDLK
:::::::: .:.::.:.::.::::::::..::: .:.::.:::.. .:: . ::::::::
NP_001 YVFDLGNGANLIKGSSNKPLNDNQWHNVMISRDTSNLHTVKIDTKITTQITAGARNLDLK
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pF1KSD GELYIGGLSKNMFSNLPKLVASRDGFQGCLASVDLNGRLPDLIADALHRIGQVERGCDGP
..:::::..:. ...::::: ...:::::::::::::::::::.::: ::.::::.::
NP_001 SDLYIGGVAKETYKSLPKLVHAKEGFQGCLASVDLNGRLPDLISDALFCNGQIERGCEGP
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:::: :.::.::::::::::::.:::.:::..::.::::::::::.:::. ::: :::::
NP_001 STTCQEDSCSNQGVCLQQWDGFSCDCSMTSFSGPLCNDPGTTYIFSKGGGQITYKWPPND
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pF1KSD RPSTRMDRLAVGFSTHQRSAVLVRVDSASGLGDYLQLHIDQGTVGVIFNVGTDDITIDEP
::::: ::::.:::: :. ::::::::.:::::::.::: :: .:: ::::::::.:.:
NP_001 RPSTRADRLAIGFSTVQKEAVLVRVDSSSGLGDYLELHIHQGKIGVKFNVGTDDIAIEES
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pF1KSD NAIVSDGKYHVVRFTRSGGNATLQVDSWPVNERYPAGRQLTIFNSQAAIKIGGRDQGRPF
:::..::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::.: :::..::.::
NP_001 NAIINDGKYHVVRFTRSGGNATLQVDSWPVIERYPAGRQLTIFNSQATIIIGGKEQGQPF
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pF1KSD QGQVSGLYYNGLKVLALAAESDPNVRTEGHLRLVGEGPSVLLSAETTATTLLADMATTIM
:::.::::::::::: .:::.: :. :..::::: :: . ..:.:::.. ..:.:.::
NP_001 QGQLSGLYYNGLKVLNMAAENDANIAIVGNVRLVGEVPSSM-TTESTATAMQSEMSTSIM
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pF1KSD ETTTTMATTTTRRGRSPTLRDSTTQNTDDLLVASAECPSDDEDLEECEPSTGGELILPII
:::::.::.:.:::. :: .. .:.:::.:::::::::::::.. ::::.
NP_001 ETTTTLATSTARRGKPPT-KEPISQTTDDILVASAECPSDDEDIDPCEPSS---------
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pF1KSD TEDSLDPPPVATRSPFVPPPPTFYPFLTGVGATQDTLPPPAARRPPSGGPCQAERDDSDC
NP_001 ------------------------------------------------------------
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pF1KSD EEPIEASGFASGEVFDSSLPPTDDEDFYTTFPLVTDRTTLLSPRKPAPRPNLRTDGATGA
NP_001 ------------------------------------------------------------
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pF1KSD PGVLFAPSAPAPNLPAGKMNHRDPLQPLLENPPLGPGAPTSFEPRRPPPLRPGVTSAPGF
NP_001 ------------------------------------------------------------
1540 1550 1560 1570 1580 1590
pF1KSD PHLPTANPTGPGERGP-PGAVEVIRESSSTTGMVVGIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDE
:::: : : : ::..:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 -----ANPTRAGGREPYPGSAEVIRESSSTTGMVVGIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDE
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pF1KSD GSYQVDQSRNYISNSAQSNGAVVKEKAPAAPKTPSKAKKNKDKEYYV
:::.::.::::::::::::::::::: :.. :. .: ::::::::::
NP_001 GSYHVDESRNYISNSAQSNGAVVKEKQPSSAKSSNKNKKNKDKEYYV
1410 1420 1430 1440 1450
>>NP_001317024 (OMIM: 600565,614325,614332) neurexin-1 i (1460 aa)
initn: 5985 init1: 3507 opt: 6199 Z-score: 3075.6 bits: 581.9 E(85289): 1.4e-164
Smith-Waterman score: 6451; 61.4% identity (77.1% similar) in 1649 aa overlap (14-1642:16-1460)
10 20 30 40 50
pF1KSD MASGSRWRPTPPPLLLLLLLALAARADGLEFGGGPGQWARYARWAGAASSGELSFSLR
: :::: : ..:::: :. :::.:. .: .: .:.::.:.
NP_001 MGTALLQRGGCFLLCLSLLLLGCWAELGSGLEFPGAEGQWTRFPKW-NACCESEMSFQLK
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KSD TNATRALLLYLDDGGDCDFLELLLV-DGRLRLRFTLSCAEPATLQLDTPVADDRWHMVLL
: ..:.:.::.:: : ::::::.:. :::.: :.. ::::::: :::: : :: : .
NP_001 TRSARGLVLYFDDEGFCDFLELILTRGGRLQLSFSIFCAEPATLLADTPVNDGAWHSVRI
60 70 80 90 100 110
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pF1KSD TRDARRTALAVDG-EARAAEVRSKRREMQVASDLFVGGIPPDVRLSAL--TLSTVKYEPP
:. : :.: .: ::. .::.::::.: : : :::::.::..: .:: ::..:. . :
NP_001 RRQFRNTTLFIDQVEAKWVEVKSKRRDMTVFSGLFVGGLPPELRAAALKLTLASVREREP
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220
pF1KSD FRGLLANLKLGERP--PALLGSQGL-----RGATADPLCAPARNP---CANGGLCTVLAP
:.: . ..... :. : : .. ..: : .. : :::.:.:.
NP_001 FKGWIRDVRVNSSQVLPVDSGEVKLDDEPPNSGGGSPCEAGEEGEGGVCLNGGVCSVVDD
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KSD GEVGCDCSHTGFGGKFCSEEEHPMEGPAHLTLN----SEGKEEFVATFKGNEFFCYDLSH
: ::::.::: :: ::.:.. .:: ::: .. :.::::..:::::.:.::::::.
NP_001 QAV-CDCSRTGFRGKDCSQEDNNVEGLAHLMMGDQGKSKGKEEYIATFKGSEYFCYDLSQ
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KSD NPIQSSTDEITLAFRTLQRNGLMLHTGKSADYVNLSLKSGAVWLVINLGSGAFEALVEPV
::::::.:::::.:.::::::::::::::::::::.::.::: :::::::::::::::::
NP_001 NPIQSSSDEITLSFKTLQRNGLMLHTGKSADYVNLALKNGAVSLVINLGSGAFEALVEPV
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KSD NGKFNDNAWHDVRVTRNLRQHAGIGHAMVTISVDGILTTTGYTQEDYTMLGSDDFFYIGG
::::::::::::.::::::: :::::::::::::::::::::::::::::.::
NP_001 NGKFNDNAWHDVKVTRNLRQ--------VTISVDGILTTTGYTQEDYTMLGSDDFFYVGG
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KSD SPNTADLPGSPVSNNFMGCLKDVVYKNNDFKLELSRLAKEGDPKMKLQGDLSFRCEDVAA
::.::::::::::::::::::.::::::: .::::::::.::::::..: ..:.::.::.
NP_001 SPSTADLPGSPVSNNFMGCLKEVVYKNNDVRLELSRLAKQGDPKMKIHGVVAFKCENVAT
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KSD LDPVTFESPEAFVALPRWSAKRTGSISLDFRTTEPNGLLLFSQGRRAGGGAGSHSSAQRA
:::.:::.::.:..::.:.::.:::::.::::::::::.:::.:. ..: . ..
NP_001 LDPITFETPESFISLPKWNAKKTGSISFDFRTTEPNGLILFSHGKPRHQKDAKHPQMIKV
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570 580
pF1KSD DYFAMELLDGHLYLLLDMGSGGIKLRASSRKVNDGEWCHVDFQRDGRKGSISVNSRSTPF
:.::.:.:::::::::::::: ::..: .::::::: :::::::::.:.::::. ::.
NP_001 DFFAIEMLDGHLYLLLDMGSGTIKIKALLKKVNDGEWYHVDFQRDGRSGTISVNTLRTPY
540 550 560 570 580 590
590 600 610 620 630 640
pF1KSD LATGDSEILDLESELYLGGLPEGGRVDLPLPPEVWTAALRAGYVGCVRDLFIDGRSRDLR
: :.::::::..:::::::::. .. : .: ::::: : :::::.:::::::.:.:.:
NP_001 TAPGESEILDLDDELYLGGLPEN-KAGLVFPTEVWTALLNYGYVGCIRDLFIDGQSKDIR
600 610 620 630 640
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pF1KSD GLAEAQGAVGVAPFCSRETLKQCASAPCRNGGVCREGWNRFICDCIGTGFLGRVCEREAT
.::.:...:: : ::.:: : : : ::.:.:.::.::::..::: :::.::: ::::::
NP_001 QMAEVQSTAGVKPSCSKETAKPCLSNPCKNNGMCRDGWNRYVCDCSGTGYLGRSCEREAT
650 660 670 680 690 700
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pF1KSD VLSYDGSMYMKIMLPNAMHTEAEDVSLRFMSQRAYGLMMATTSRESADTLRLELDGGQMK
::::::::.:::.:: .:::::::::::: ::::::..::::::.::::::::::.:..:
NP_001 VLSYDGSMFMKIQLPVVMHTEAEDVSLRFRSQRAYGILMATTSRDSADTLRLELDAGRVK
710 720 730 740 750 760
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pF1KSD LTVNLGKGPETLFAGHKLNDNEWHTVRVVRRGKSLQLSVDNV-TVEGQMAGAHMRLEFHN
:::::::::::::::..::::::::::::::::::.:.::. .. ::::: : ::::::
NP_001 LTVNLGKGPETLFAGYNLNDNEWHTVRVVRRGKSLKLTVDDQQAMTGQMAGDHTRLEFHN
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pF1KSD IETGIMTERRFISVVPSNFIGHLSGLVFNGQPYMDQCKDGDITYCELNARFGLRAIVADP
:::::.::::..: :::::::::..:.:::. :.: ::.::: :::::::::.: :.:::
NP_001 IETGIITERRYLSSVPSNFIGHLQSLTFNGMAYIDLCKNGDIDYCELNARFGFRNIIADP
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pF1KSD VTFKSRSSYLALATLQAYASMHLFFQFKTTAPDGLLLFNSGNGNDFIVIELVKGYIHYVF
::::..:::.::::::::.:::::::::::. :::.:.:::.::::::.::::::.::::
NP_001 VTFKTKSSYVALATLQAYTSMHLFFQFKTTSLDGLILYNSGDGNDFIVVELVKGYLHYVF
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pF1KSD DLGNGPSLMKGNSDKPVNDNQWHNVVVSRDPGNVHTLKIDSRTVTQHSNGARNLDLKGEL
::::: .:.::.:.::.::::::::..::: .:.::.:::.. .:: . ::::::::..:
NP_001 DLGNGANLIKGSSNKPLNDNQWHNVMISRDTSNLHTVKIDTKITTQITAGARNLDLKSDL
950 960 970 980 990 1000
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KSD YIGGLSKNMFSNLPKLVASRDGFQGCLASVDLNGRLPDLIADALHRIGQVERGCDGPSTT
::::..:. ...::::: ...:::::::::::::::::::.::: ::.::::.:::::
NP_001 YIGGVAKETYKSLPKLVHAKEGFQGCLASVDLNGRLPDLISDALFCNGQIERGCEGPSTT
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pF1KSD CTEESCANQGVCLQQWDGFTCDCTMTSYGGPVCNDPGTTYIFGKGGALITYTWPPNDRPS
: :.::.::::::::::::.:::.:::..::.::::::::::.:::. ::: ::::::::
NP_001 CQEDSCSNQGVCLQQWDGFSCDCSMTSFSGPLCNDPGTTYIFSKGGGQITYKWPPNDRPS
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1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KSD TRMDRLAVGFSTHQRSAVLVRVDSASGLGDYLQLHIDQGTVGVIFNVGTDDITIDEPNAI
:: ::::.:::: :. ::::::::.:::::::.::: :: .:: ::::::::.:.: :::
NP_001 TRADRLAIGFSTVQKEAVLVRVDSSSGLGDYLELHIHQGKIGVKFNVGTDDIAIEESNAI
1130 1140 1150 1160 1170 1180
1180 1190 1200 1210 1220 1230
pF1KSD VSDGKYHVVRFTRSGGNATLQVDSWPVNERYPAGRQLTIFNSQAAIKIGGRDQGRPFQGQ
..::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::.: :::..::.:::::
NP_001 INDGKYHVVRFTRSGGNATLQVDSWPVIERYPAGRQLTIFNSQATIIIGGKEQGQPFQGQ
1190 1200 1210 1220 1230 1240
1240 1250 1260 1270 1280 1290
pF1KSD VSGLYYNGLKVLALAAESDPNVRTEGHLRLVGEGPSVLLSAETTATTLLADMATTIMETT
.::::::::::: .:::.: :. :..::::: :: . ..:.:::.. ..:.:.:::::
NP_001 LSGLYYNGLKVLNMAAENDANIAIVGNVRLVGEVPSSM-TTESTATAMQSEMSTSIMETT
1250 1260 1270 1280 1290 1300
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pF1KSD TTMATTTTRRGRSPTLRDSTTQNTDDLLVASAECPSDDEDLEECEPSTGGELILPIITED
::.::.:.:::. :: .. .:.:::.:::::::::::::.. ::::.::
NP_001 TTLATSTARRGKPPT-KEPISQTTDDILVASAECPSDDEDIDPCEPSSGG----------
1310 1320 1330 1340 1350
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pF1KSD SLDPPPVATRSPFVPPPPTFYPFLTGVGATQDTLPPPAARRPPSGGPCQAERDDSDCEEP
NP_001 ------------------------------------------------------------
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pF1KSD IEASGFASGEVFDSSLPPTDDEDFYTTFPLVTDRTTLLSPRKPAPRPNLRTDGATGAPGV
NP_001 ------------------------------------------------------------
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pF1KSD LFAPSAPAPNLPAGKMNHRDPLQPLLENPPLGPGAPTSFEPRRPPPLRPGVTSAPGFPHL
NP_001 ------------------------------------------------------------
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pF1KSD PTANPTGPGERGP-PGAVEVIRESSSTTGMVVGIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDEGSY
:::: : : : ::..::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 -LANPTRAGGREPYPGSAEVIRESSSTTGMVVGIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDEGSY
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pF1KSD QVDQSRNYISNSAQSNGAVVKEKAPAAPKTPSKAKKNKDKEYYV
.::.::::::::::::::::::: :.. :. .: ::::::::::
NP_001 HVDESRNYISNSAQSNGAVVKEKQPSSAKSSNKNKKNKDKEYYV
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pF1KSD MASGSRWRPTPPPLLLLLLLALAARADGLEFGGGPGQWARYARWAGAASSGELSFSLR
: :::: : ..:::: :. :::.:. .: .: .:.::.:.
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10 20 30 40 50
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pF1KSD TNATRALLLYLDDGGDCDFLELLLV-DGRLRLRFTLSCAEPATLQLDTPVADDRWHMVLL
: ..:.:.::.:: : ::::::.:. :::.: :.. ::::::: :::: : :: : .
NP_001 TRSARGLVLYFDDEGFCDFLELILTRGGRLQLSFSIFCAEPATLLADTPVNDGAWHSVRI
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pF1KSD TRDARRTALAVDG-EARAAEVRSKRREMQVASDLFVGGIPPDVRLSAL--TLSTVKYEPP
:. : :.: .: ::. .::.::::.: : : :::::.::..: .:: ::..:. . :
NP_001 RRQFRNTTLFIDQVEAKWVEVKSKRRDMTVFSGLFVGGLPPELRAAALKLTLASVREREP
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pF1KSD FRGLLANLKLGERP--PALLGSQGL-----RGATADPLCAPARNP---CANGGLCTVLAP
:.: . ..... :. : : .. ..: : .. : :::.:.:.
NP_001 FKGWIRDVRVNSSQVLPVDSGEVKLDDEPPNSGGGSPCEAGEEGEGGVCLNGGVCSVVDD
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: ::::.::: :: ::. : ::: ....::::..:::::.:.::::::.::::
NP_001 QAV-CDCSRTGFRGKDCSQ------GLAHLMMGDQGKEEYIATFKGSEYFCYDLSQNPIQ
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::.:::::.:.::::::::::::::::::::.::.::: :::::::::::::::::::::
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::::::::.::::::: :::::::::::::::::::::::::::::.::::.:
NP_001 NDNAWHDVKVTRNLRQ--------VTISVDGILTTTGYTQEDYTMLGSDDFFYVGGSPST
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:::::::::::::::::.::::::: .::::::::.::::::..: ..:.::.::.:::.
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pF1KSD TFESPEAFVALPRWSAKRTGSISLDFRTTEPNGLLLFSQGRRAGGGAGSHSSAQRADYFA
:::.::.:..::.:.::.:::::.::::::::::.:::.:. ..: . ..:.::
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pF1KSD MELLDGHLYLLLDMGSGGIKLRASSRKVNDGEWCHVDFQRDGRKGSISVNSRSTPFLATG
.:.:::::::::::::: ::..: .::::::: :::::::::.:.::::. ::. : :
NP_001 IEMLDGHLYLLLDMGSGTIKIKALLKKVNDGEWYHVDFQRDGRSGTISVNTLRTPYTAPG
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pF1KSD DSEILDLESELYLGGLPEGGRVDLPLPPEVWTAALRAGYVGCVRDLFIDGRSRDLRGLAE
.::::::..:::::::::. .. : .: ::::: : :::::.:::::::.:.:.: .::
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pF1KSD AQGAVGVAPFCSRETLKQCASAPCRNGGVCREGWNRFICDCIGTGFLGRVCEREATVLSY
.:...:: : ::.:: : : : ::.:.:.::.::::..::: :::.::: ::::::::::
NP_001 VQSTAGVKPSCSKETAKPCLSNPCKNNGMCRDGWNRYVCDCSGTGYLGRSCEREATVLSY
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pF1KSD DGSMYMKIMLPNAMHTEAEDVSLRFMSQRAYGLMMATTSRESADTLRLELDGGQMKLTVN
::::.:::.:: .:::::::::::: ::::::..::::::.::::::::::.:..:::::
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:::::::::::..::::::::::::::::::.:.::. .. ::::: : ::::::::::
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pF1KSD IMTERRFISVVPSNFIGHLSGLVFNGQPYMDQCKDGDITYCELNARFGLRAIVADPVTFK
:.::::..: :::::::::..:.:::. :.: ::.::: :::::::::.: :.:::::::
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pF1KSD SRSSYLALATLQAYASMHLFFQFKTTAPDGLLLFNSGNGNDFIVIELVKGYIHYVFDLGN
..:::.::::::::.:::::::::::. :::.:.:::.::::::.::::::.::::::::
NP_001 TKSSYVALATLQAYTSMHLFFQFKTTSLDGLILYNSGDGNDFIVVELVKGYLHYVFDLGN
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pF1KSD GPSLMKGNSDKPVNDNQWHNVVVSRDPGNVHTLKIDSRTVTQHSNGARNLDLKGELYIGG
: .:.::.:.::.::::::::..::: .:.::.:::.. .:: . ::::::::..:::::
NP_001 GANLIKGSSNKPLNDNQWHNVMISRDTSNLHTVKIDTKITTQITAGARNLDLKSDLYIGG
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..:. ...::::: ...:::::::::::::::::::.::: ::.::::.:::::: :.
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NP_001 SCSNQGVCLQQWDGFSCDCSMTSFSGPLCNDPGTTYIFSKGGGQITYKWPPNDRPSTRAD
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pF1KSD YYNGLKVLALAAESDPNVRTEGHLRLVGEGPSVLLSAETTATTLLADMATTIMETTTTMA
:::::::: .:::.: :. :..::::: :: . ..:.:::.. ..:.:.:::::::.:
NP_001 YYNGLKVLNMAAENDANIAIVGNVRLVGEVPSSM-TTESTATAMQSEMSTSIMETTTTLA
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pF1KSD TTTTRRGRSPTLRDSTTQNTDDLLVASAECPSDDEDLEECEPSTGGELILPIITEDSLDP
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NP_001 TSTARRGKPPT-KEPISQTTDDILVASAECPSDDEDIDPCEPSS----------------
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pF1KSD PPVATRSPFVPPPPTFYPFLTGVGATQDTLPPPAARRPPSGGPCQAERDDSDCEEPIEAS
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pF1KSD GFASGEVFDSSLPPTDDEDFYTTFPLVTDRTTLLSPRKPAPRPNLRTDGATGAPGVLFAP
NP_001 ------------------------------------------------------------
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pF1KSD SAPAPNLPAGKMNHRDPLQPLLENPPLGPGAPTSFEPRRPPPLRPGVTSAPGFPHLPTAN
::
NP_001 ----------------------------------------------------------AN
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pF1KSD PTGPGERGP-PGAVEVIRESSSTTGMVVGIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDEGSYQVDQ
:: : : : ::..::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::.
NP_001 PTRAGGREPYPGSAEVIRESSSTTGMVVGIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDEGSYHVDE
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pF1KSD SRNYISNSAQSNGAVVKEKAPAAPKTPSKAKKNKDKEYYV
::::::::::::::::::: :.. :. .: ::::::::::
NP_001 SRNYISNSAQSNGAVVKEKQPSSAKSSNKNKKNKDKEYYV
1410 1420 1430 1440
>>XP_016877288 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3 isof (1654 aa)
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Smith-Waterman score: 7264; 65.2% identity (84.3% similar) in 1663 aa overlap (17-1642:16-1654)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MASGSRWRPTPPPLLLLLLLALAARADGLEFGGGPGQWARYARWAGAASSGELSFSLRTN
.:: .: . :::: : :.::::: :: :.. ..:::...::
XP_016 MSSTLHSVFFTLKVSILLGSLLGLCLGLEFMGLPNQWARYLRW-DASTRSDLSFQFKTN
10 20 30 40 50
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pF1KSD ATRALLLYLDDGGDCDFLELLLVDGRLRLRFTLSCAEPATLQLDTPVADDRWHMVLLTRD
.. .::::::::: :::: : :::::..:::...::: :.:. . : :. ::.....::
XP_016 VSTGLLLYLDDGGVCDFLCLSLVDGRVQLRFSMDCAETAVLS-NKQVNDSSWHFLMVSRD
60 70 80 90 100 110
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pF1KSD ARRTALAVDGEARAAEVRSKRREMQVASDLFVGGIPPDVRLSALTLSTVKYEPPFRGLLA
::.: .:::....:.. .: :.:.::::.::.: :.: :::::. :. : :.::.
XP_016 RLRTVLMLDGEGQSGELQPQRPYMDVVSDLFLGGVPTDIRPSALTLDGVQAMPGFKGLIL
120 130 140 150 160 170
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pF1KSD NLKLGERPPALLGSQGLRGATADPLCAPARNPCANGGLCTVLAPGEVGCDCSHTGFGGKF
.:: :. : ::::.:.. . : :. . :: :::.: .: :. :::: ::.:::.
XP_016 DLKYGNSEPRLLGSRGVQMDAEGP-CG--ERPCENGGICFLL-DGHPTCDCSTTGYGGKL
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290
pF1KSD CSEEEHPMEGPAHLTLNSEGK----EEFVATFKGNEFFCYDLSHNPIQSSTDEITLAFRT
:::. : .:: .. .:. :: ::::.:.:..:::::.::::::.:::::.:.:
XP_016 CSEDVSQDPGLSHLMMSEQGRSKAREENVATFRGSEYLCYDLSQNPIQSSSDEITLSFKT
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KSD LQRNGLMLHTGKSADYVNLSLKSGAVWLVINLGSGAFEALVEPVNGKFNDNAWHDVRVTR
:::::.::::::::::::.::.::: ::::::::::::.::::::::::::::::.:::
XP_016 WQRNGLILHTGKSADYVNLALKDGAVSLVINLGSGAFEAIVEPVNGKFNDNAWHDVKVTR
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KSD NLRQHAGIGHAMVTISVDGILTTTGYTQEDYTMLGSDDFFYIGGSPNTADLPGSPVSNNF
:::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::.:::::::::::::
XP_016 NLRQHSGIGHAMVTISVDGILTTTGYTQEDYTMLGSDDFFYVGGSPSTADLPGSPVSNNF
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KSD MGCLKDVVYKNNDFKLELSRLAKEGDPKMKLQGDLSFRCEDVAALDPVTFESPEAFVALP
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XP_016 MGCLKEVVYKNNDIRLELSRLARIADTKMKIYGEVVFKCENVATLDPINFETPEAYISLP
420 430 440 450 460 470
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pF1KSD RWSAKRTGSISLDFRTTEPNGLLLFSQGRRAGGGAGSHSSAQRADYFAMELLDGHLYLLL
.:..:: ::::.::::::::::.::..:. . .. ..:.::.:::::.:::::
XP_016 KWNTKRMGSISFDFRTTEPNGLILFTHGKPQERKDARSQKNTKVDFFAVELLDGNLYLLL
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pF1KSD DMGSGGIKLRASSRKVNDGEWCHVDFQRDGRKGSISVNSRSTPFLATGDSEILDLESELY
::::: ::..:...:.::::: :::.:::::.:.:::::: ::: :.:.:::::::...:
XP_016 DMGSGTIKVKATQKKANDGEWYHVDIQRDGRSGTISVNSRRTPFTASGESEILDLEGDMY
540 550 560 570 580 590
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pF1KSD LGGLPEGGRVDLPLPPEVWTAALRAGYVGCVRDLFIDGRSRDLRGLAEAQGAVGVAPFCS
::::::. :. : :: :.::: : :::::.:::::::::...: ::: :.:.:: ::
XP_016 LGGLPEN-RAGLILPTELWTAMLNYGYVGCIRDLFIDGRSKNIRQLAEMQNAAGVKSSCS
600 610 620 630 640 650
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pF1KSD RETLKQCASAPCRNGGVCREGWNRFICDCIGTGFLGRVCEREATVLSYDGSMYMKIMLPN
: . ::: : ::.:..::..::::::::: :::. ::.:::::..:::::::::::..:
XP_016 RMSAKQCDSYPCKNNAVCKDGWNRFICDCTGTGYWGRTCEREASILSYDGSMYMKIIMPM
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pF1KSD AMHTEAEDVSLRFMSQRAYGLMMATTSRESADTLRLELDGGQMKLTVNL---------GK
.:::::::::.::::::::::..:::::.::::::::::::..:: ::: .:
XP_016 VMHTEAEDVSFRFMSQRAYGLLVATTSRDSADTLRLELDGGRVKLMVNLDCIRINCNSSK
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pF1KSD GPETLFAGHKLNDNEWHTVRVVRRGKSLQLSVDNVTVEGQMAGAHMRLEFHNIETGIMTE
:::::.::.:::::::::::::::::::.:.::. ..:: :.: : ::::::::::::::
XP_016 GPETLYAGQKLNDNEWHTVRVVRRGKSLKLTVDDDVAEGTMVGDHTRLEFHNIETGIMTE
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.:.::::::.:::::..:.::: :.: ::.::: ::::.:::::: :.:::::::..::
XP_016 KRYISVVPSSFIGHLQSLMFNGLLYIDLCKNGDIDYCELKARFGLRNIIADPVTFKTKSS
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pF1KSD YLALATLQAYASMHLFFQFKTTAPDGLLLFNSGNGNDFIVIELVKGYIHYVFDLGNGPSL
::.:::::::.:::::::::::.:::..:::::.:::::..:::::::::::::::::..
XP_016 YLSLATLQAYTSMHLFFQFKTTSPDGFILFNSGDGNDFIAVELVKGYIHYVFDLGNGPNV
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pF1KSD MKGNSDKPVNDNQWHNVVVSRDPGNVHTLKIDSRTVTQHSNGARNLDLKGELYIGGLSKN
.:::::.:.:::::::::..:: .:.:.::.:...::: :::.::::::.::..::...
XP_016 IKGNSDRPLNDNQWHNVVITRDNSNTHSLKVDTKVVTQVINGAKNLDLKGDLYMAGLAQG
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:.:::::::::::::::::::::::::::::: ::::: ::.::::.:::::: :.::::
XP_016 MYSNLPKLVASRDGFQGCLASVDLNGRLPDLINDALHRSGQIERGCEGPSTTCQEDSCAN
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pF1KSD QGVCLQQWDGFTCDCTMTSYGGPVCNDPGTTYIFGKGGALITYTWPPNDRPSTRMDRLAV
::::.:::.::::::.::::.: :::::.::::::.:.:: :::: ::::::: :::::
XP_016 QGVCMQQWEGFTCDCSMTSYSGNQCNDPGATYIFGKSGGLILYTWPANDRPSTRSDRLAV
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:::: ....:::.::: ::::.:::::.:: .::.::.:: ::.: : . :.::::::
XP_016 GFSTTVKDGILVRIDSAPGLGDFLQLHIEQGKIGVVFNIGTVDISIKEERTPVNDGKYHV
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pF1KSD VRFTRSGGNATLQVDSWPVNERYPAGRQLTIFNSQAAIKIGGRDQGRPFQGQVSGLYYNG
:::::.:::::::::.:::::.::.::::::::.:: : :::.:.:: ::::.:::::.:
XP_016 VRFTRNGGNATLQVDNWPVNEHYPTGRQLTIFNTQAQIAIGGKDKGRLFQGQLSGLYYDG
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pF1KSD LKVLALAAESDPNVRTEGHLRLVGEGPSVLLSAETTATTLLADMATTIMETTTTMATTTT
:::: .:::..::.. .: .::::: ::.: ...:: .. .:.::.::::::::::::
XP_016 LKVLNMAAENNPNIKINGSVRLVGEVPSILGTTQTT--SMPPEMSTTVMETTTTMATTTT
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pF1KSD RRGRSPTLRDSTTQNTDDLLVASAECPSDDEDLEECEPSTGGELILPIITEDSLDPPPVA
:..:: .. : :.: ::.:::: :::::. ::::::::::..:...:: : ::.:
XP_016 RKNRS----TASIQPTSDDLVSSAECSSDDEDFVECEPSTGGELVIPLLVEDPLATPPIA
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pF1KSD TRSPFVPPPPTFYPFLTGVGATQDTLPPPAARRPPSGGPCQAERDDSDCEEP-IEASGFA
::.: . :::: :.:: . .:.:.: . .: :: ... .. :.. . ::..
XP_016 TRAPSITLPPTFRPLLTIIETTKDSL----SMTSEAGLPCLSDQGSDGCDDDGLVISGYG
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:::.:::.::::::::::::: ::::.. : . :: ::: :
XP_016 SGETFDSNLPPTDDEDFYTTFSLVTDKSLSTSIFEGGYKAHAPKWESKDFRPNKVSETSR
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pF1KSD TDGATGAPGVL-FAPSAPA---PNLPAGKMNHRD--PLQPLLENPPLGPGAPTSFEPRRP
: .. .: .. :. :. . :.:::::::.:: : :: . :: ::..:
XP_016 TTTTSLSPELIRFTASSSSGMVPKLPAGKMNNRDLKP-QPDIVLLPL----PTAYELDST
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: .:: : : ..:::::: :: : ::: :::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KLKSPLITS-PMFRNVPTANPTEPGIRRVPGASEVIRESSSTTGMVVGIVAAAALCILIL
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::::::::::::::::::..::::::::::::...::: .. :. : .::::.::::
XP_016 LYAMYKYRNRDEGSYQVDETRNYISNSAQSNGTLMKEKQQSS-KSGHKKQKNKDREYYV
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XP_016 MASGSRWRPTPPPLLLLLLLALAARADGLEFGGGPGQWARYARWAGAASSGELSFSLRTN
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XP_016 ATRALLLYLDDGGDCDFLELLLVDGRLRLRFTLSCAEPATLQLDTPVADDRWHMVLLTRD
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XP_016 ARRTALAVDGEARAAEVRSKRREMQVASDLFVGGIPPDVRLSALTLSTVKYEPPFRGLLA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NLKLGERPPALLGSQGLRGATADPLCAPARNPCANGGLCTVLAPGEVGCDCSHTGFGGKF
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XP_016 CSEEEHPMEGPAHLTLNSEVGSLLFSEGGAGRGGAGDVHQPTKGKEEFVATFKGNEFFCY
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DLSHNPIQSSTDEITLAFRTLQRNGLMLHTGKSADYVNLSLKSGAVWLVINLGSGAFEAL
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XP_016 VEPVNGKFNDNAWHDVRVTRNLRQHAGIGHAMVNKLHYLVTISVDGILTTTGYTQEDYTM
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LGSDDFFYIGGSPNTADLPGSPVSNNFMGCLKDVVYKNNDFKLELSRLAKEGDPKMKLQG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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XP_016 GAGSHSSAQRADYFAMELLDGHLYLLLDMGSGGIKLRASSRKVNDGEWCHVDFQRDGRKG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SISVNSRSTPFLATGDSEILDLESELYLGGLPEGGRVDLPLPPEVWTAALRAGYVGCVRD
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LFIDGRSRDLRGLAEAQGAVGVAPFCSRETLKQCASAPCRNGGVCREGWNRFICDCIGTG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FLGRVCEREATVLSYDGSMYMKIMLPNAMHTEAEDVSLRFMSQRAYGLMMATTSRESADT
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:::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LRLELDGGQMKLTVNLDCLRVGCAPSAAGKGPETLFAGHKLNDNEWHTVRVVRRGKSLQL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SVDNVTVEGQMAGAHMRLEFHNIETGIMTERRFISVVPSNFIGHLSGLVFNGQPYMDQCK
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pF1KSD DGDITYCELNARFGLRAIVADPVTFKSRSSYLALATLQAYASMHLFFQFKTTAPDGLLLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DGDITYCELNARFGLRAIVADPVTFKSRSSYLALATLQAYASMHLFFQFKTTAPDGLLLF
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NSGNGNDFIVIELVKGYIHYVFDLGNGPSLMKGNSDKPVNDNQWHNVVVSRDPGNVHTLK
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 IDSRTVTQHSNGARNLDLKGELYIGGLSKNMFSNLPKLVASRDGFQGCLASVDLNGRLPD
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LIADALHRIGQVERGCDGPSTTCTEESCANQGVCLQQWDGFTCDCTMTSYGGPVCNDPGT
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TYIFGKGGALITYTWPPNDRPSTRMDRLAVGFSTHQRSAVLVRVDSASGLGDYLQLHIDQ
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GTVGVIFNVGTDDITIDEPNAIVSDGKYHVVRFTRSGGNATLQVDSWPVNERYPAGRQLT
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XP_016 IFNSQAAIKIGGRDQGRPFQGQVSGLYYNGLKVLALAAESDPNVRTEGHLRLVGEGPSVL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LSAETTATTLLADMATTIMETTTTMATTTTRRGRSPTLRDSTTQNTDDLLVASAECPSDD
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EDLEECEPSTGGELILPIITEDSLDPPPVATRSPFVPPPPTFYPFLTGVGATQDTLPPPA
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pF1KSD ARRPPSGGPCQAERDDSDCEEPIEASGFASGEVFDSSLPPTDDEDFYTTFPLVTDRTTLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ARRPPSGGPCQAERDDSDCEEPIEASGFASGEVFDSSLPPTDDEDFYTTFPLVTDRTTLL
1450 1460 1470 1480 1490 1500
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pF1KSD SPRKPAPRPNLRTDGATGAPGVLFAPSAPAPNLPAGKMNHRDPLQPLLENPPLGPGAPTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SPRKPAPRPNLRTDGATGAPGVLFAPSAPAPNLPAGKMNHRDPLQPLLENPPLGPGAPTS
1510 1520 1530 1540 1550 1560
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pF1KSD FEPRRPPPLRPGVTSAPGFPHLPTANPTGPGERGPPGAVEVIRESSSTTGMVVGIVAAAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FEPRRPPPLRPGVTSAPGFPHLPTANPTGPGERGPPGAVEVIRESSSTTGMVVGIVAAAA
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pF1KSD LCILILLYAMYKYRNRDEGSYQVDQSRNYISNSAQSNGAVVKEKAPAAPKTPSKAKKNKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LCILILLYAMYKYRNRDEGSYQVDQSRNYISNSAQSNGAVVKEKAPAAPKTPSKAKKNKD
1630 1640 1650 1660 1670 1680
1640
pF1KSD KEYYV
:::::
XP_016 KEYYV
>>XP_016874057 (OMIM: 600566) PREDICTED: neurexin-2-beta (1682 aa)
initn: 10357 init1: 5932 opt: 5936 Z-score: 2945.3 bits: 558.0 E(85289): 2.6e-157
Smith-Waterman score: 10934; 97.6% identity (97.6% similar) in 1674 aa overlap (9-1642:9-1682)
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pF1KSD MASGSRWRPTPPPLLLLLLLALAARADGLEFGGGPGQWARYARWAGAASSGELSFSLRTN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MASGSRWRPTPPPLLLLLLLALAARADGLEFGGGPGQWARYARWAGAASSGELSFSLRTN
10 20 30 40 50 60
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pF1KSD ATRALLLYLDDGGDCDFLELLLVDGRLRLRFTLSCAEPATLQLDTPVADDRWHMVLLTRD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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XP_016 ARRTALAVDGEARAAEVRSKRREMQVASDLFVGGIPPDVRLSALTLSTVKYEPPFRGLLA
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XP_016 NLKLGERPPALLGSQGLRGATADPLCAPARNPCANGGLCTVLAPGEVGCDCSHTGFGGKF
190 200 210 220 230 240
250 260 270
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::::::::::::::::::: :::::::::::::::::
XP_016 CSEEEHPMEGPAHLTLNSEVGSLLFSEGGAGRGGAGDVHQPTKGKEEFVATFKGNEFFCY
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XP_016 DLSHNPIQSSTDEITLAFRTLQRNGLMLHTGKSADYVNLSLKSGAVWLVINLGSGAFEAL
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::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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XP_016 PPSGGPCQAERDDSDCEEPIEASGFASGEVFDSSLPPTDDEDFYTTFPLVTDRTTLLSPR
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XP_016 KPAPRPNLRTDGATGAPGVLFAPSAPAPNLPAGKMNHRDPLQPLLENPPLGPGAPTSFEP
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XP_016 RRPPPLRPGVTSAPGFPHLPTANPTGPGERGPPGAVEVIRESSSTTGMVVGIVAAAALCI
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pF1KSD YV
::
XP_016 YV
1642 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 04:13:14 2016 done: Thu Nov 3 04:13:16 2016
Total Scan time: 16.280 Total Display time: 0.860
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]