FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0881, 1049 aa
1>>>pF1KSDA0881 1049 - 1049 aa - 1049 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 15.1529+/-0.0012; mu= -20.2121+/- 0.072
mean_var=659.5315+/-136.464, 0's: 0 Z-trim(116.0): 496 B-trim: 0 in 0/54
Lambda= 0.049941
statistics sampled from 16098 (16626) to 16098 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.769), E-opt: 0.2 (0.511), width: 16
Scan time: 5.180
The best scores are: opt bits E(32554)
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CCDS32001.1 STK24 gene_id:8428|Hs108|chr13 ( 431) 780 71.6 4.1e-12
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CCDS59108.1 STK3 gene_id:6788|Hs108|chr8 ( 519) 771 71.0 7.3e-12
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CCDS13341.1 STK4 gene_id:6789|Hs108|chr20 ( 487) 767 70.7 8.5e-12
CCDS34290.1 STK10 gene_id:6793|Hs108|chr5 ( 968) 774 71.5 1e-11
CCDS14631.1 STK26 gene_id:51765|Hs108|chrX ( 416) 749 69.4 1.9e-11
CCDS81582.1 MAP4K2 gene_id:5871|Hs108|chr11 ( 812) 731 68.3 7.6e-11
>>CCDS10662.1 TAOK2 gene_id:9344|Hs108|chr16 (1049 aa)
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Smith-Waterman score: 6921; 100.0% identity (100.0% similar) in 1049 aa overlap (1-1049:1-1049)
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GMPPPAWRQPSLLAPPGPPNWLGPPTQSGTPRGGALLLLRNSPQPLRRAASGGSGSENVG
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1030 1040
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:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 PPAAAVPGPLSRSTSVASHILNGSSHFYS
1030 1040
>>CCDS58448.1 TAOK2 gene_id:9344|Hs108|chr16 (1122 aa)
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10 20 30 40 50 60
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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>>CCDS10663.1 TAOK2 gene_id:9344|Hs108|chr16 (1235 aa)
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CCDS10 YSGKQSNEKWQDIIKEVRFLQKLRHPNTIQYRGCYLREHTAWLVMEYCLGSASDLLEVHK
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CCDS10 KPLQEVEIAAVTHGALQGLAYLHSHNMIHRDVKAGNILLSEPGLVKLGDFGSASIMAPAN
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pF1KSD LLREDLNKKQTQKDLECALLLRQHEATRELELRQLQAVQRTRAELTRLQHQTELGNQLEY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LLREDLNKKQTQKDLECALLLRQHEATRELELRQLQAVQRTRAELTRLQHQTELGNQLEY
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pF1KSD NKRREQELRQKHAAQVRQQPKSLKSKELQIKKQFQETCKIQTRQYKALRAHLLETTP--K
:::::::::::::::::::::::: . : . : . .: :
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pF1KSD AQHKSLLKRLKEEQTRKLAILAEQYDQSISEMLSSQALRLDETQEAEFQALRQQLQQELE
.:. : .:. :.:. .....: :. . : .. .:.. :
CCDS10 GQEAVLDQRM----------LGEE-EEAVGER------RILGKEGATLEPKQQRILGE--
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pF1KSD LLNAYQSKIKIRTESQHERELRELEQRVALRRALLEQRVEEELLALQTGRSERIRSLLER
.: . ..: . :. .: . . : :: . .. ... .
CCDS10 -----ESGAPSPSPQKHGSLVD--EEVWGLPEEIEELRVPSLVPQERSIVGQEEAGTWSL
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pF1KSD QAREIEAFDAESMRLGF-SSMALGGIPAEAAAQGYPAPPPAPAWPSRPVPRSGAHWSHGP
..: :.. : ..::. .. :: .: : . :: .: :. : :
CCDS10 WGKEDESLLDEEFELGWVQGPALTPVPEEEEEEEEGAPIGTPRDPGDGCPSPDI--PPEP
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pF1KSD PPPGMPP-PAWRQPSLLAPPGPPNWLGPPTQSGTPRGGALLLLRNSPQPLRRAASGGSGS
:: . : :: . :.::. : :. . :.. :::: :: ::.::.:
CCDS10 PPTHLRPCPASQLPGLLSH-GLLAGLSFAVGSSSGLLPLLLLLL---LPLL-AAQGGGGL
940 950 960 970 980
1020 1030 1040
pF1KSD ENVGPPAAAVPGPLSRSTSVASHILNGSSHFYS
CCDS10 QAALLALEVGLVGLGASYLLLCTALHLPSSLFLLLAQGTALGAVLGLSWRRGLMGVPLGL
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>>CCDS32601.1 TAOK1 gene_id:57551|Hs108|chr17 (1001 aa)
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10 20 30 40 50 60
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CCDS32 MPSTNRAGSLKDPEIAELFFKEDPEKLFTDLREIGHGSFGAVYFARDVRTNEVVAIKKMS
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::::::.::::::::::.:::...:::.:.:.::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 YSGKQSTEKWQDIIKEVKFLQRIKHPNSIEYKGCYLREHTAWLVMEYCLGSASDLLEVHK
70 80 90 100 110 120
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::::::::::.::::::::::::::.:::::.:::::::.::: :::.::::::. .:::
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130 140 150 160 170 180
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CCDS32 SFVGTPYWMAPEVILAMDEGQYDGKVDVWSLGITCIELAERKPPLFNMNAMSALYHIAQN
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::::::::::::::.::::: :::..:: ::::: . . :.::..:. :..:.::::::
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::::::::::: :.::.. : . :.::.::: :.::.:: :
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.: : . .:. : : .:: . .:.... :::.:::::::::::.::.
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::::::: ::::.::::::::::::::..::..:..: .:: ::...::.:: .:.::
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::: ..::: ::::.. . ::.:::::: .:::::: ..::.::: ::::::::::::.
CCDS32 EKLIKKHQAAMEKEAKVMSNEEKKFQQHIQAQQKKELNSFLESQKREYKLRKEQLKEELN
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:: ::::.:: ::: .:::..:. ::::::.::::::::.::.::..::.:::.::.:.:
CCDS32 ENQSTPKKEKQEWLSKQKENIQHFQAEEEANLLRRQRQYLELECRRFKRRMLLGRHNLEQ
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::.::.:::.::::::: :.::::::. .:::.:.:...:. : :: :::::::: ::::
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pF1KSD YNKRREQELRQKHAAQVRQQPKSLKSKELQIKKQFQETCKIQTRQYKALRAHLLETTPKA
::::::.:::.::. .::::::::::::::::::::.::::::::::::: ::::::::.
CCDS32 YNKRRERELRRKHVMEVRQQPKSLKSKELQIKKQFQDTCKIQTRQYKALRNHLLETTPKS
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CCDS32 EHKAVLKRLKEEQTRKLAILAEQYDHSINEMLSTQALRLDEAQEAECQVLKMQLQQELEL
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pF1KSD LNAYQSKIKIRTESQHERELRELEQRVALRRALLEQRVEEELLALQTGRSERIRSLLERQ
:::::::::...:.::.::::::::::.::::::::..:::.::::. :.::::::::::
CCDS32 LNAYQSKIKMQAEAQHDRELRELEQRVSLRRALLEQKIEEEMLALQNERTERIRSLLERQ
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::::::::.::::::::.:.:... :: ...::. : .: :. : ::.: :
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: :: :: .: :: : : : : :.:::... . ::::: :::.:::: .
CCDS32 MGGPPQAWGHP---MQGGPQPWGHPSGPMQ-GVPRGSSMGV-RNSPQALRRTASGGRTEQ
930 940 950 960 970 980
1020 1030 1040
pF1KSD NVGPPAAAVPGPLSRSTSVASHILNGSSHFYS
. .::::::.:.: ::: :.
CCDS32 G-----------MSRSTSVTSQISNGSHMSYT
990 1000
>>CCDS56024.1 TAOK1 gene_id:57551|Hs108|chr17 (853 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KSD MPAGGRAGSLKDPDVAELFFKDDPEKLFSDLREIGHGSFGAVYFARDVRNSEVVAIKKMS
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CCDS56 MPSTNRAGSLKDPEIAELFFKEDPEKLFTDLREIGHGSFGAVYFARDVRTNEVVAIKKMS
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70 80 90 100 110 120
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CCDS56 YSGKQSTEKWQDIIKEVKFLQRIKHPNSIEYKGCYLREHTAWLVMEYCLGSASDLLEVHK
70 80 90 100 110 120
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pF1KSD KPLQEVEIAAVTHGALQGLAYLHSHNMIHRDVKAGNILLSEPGLVKLGDFGSASIMAPAN
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CCDS56 KPLQEVEIAAITHGALQGLAYLHSHTMIHRDIKAGNILLTEPGQVKLADFGSASMASPAN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 SFVGTPYWMAPEVILAMDEGQYDGKVDVWSLGITCIELAERKPPLFNMNAMSALYHIAQN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD ESPVLQSGHWSEYFRNFVDSCLQKIPQDRPTSEVLLKHRFVLRERPPTVIMDLIQRTKDA
:::.:::..::.::::::::::::::::::::: :::: ::::::: ::..:::::::::
CCDS56 ESPTLQSNEWSDYFRNFVDSCLQKIPQDRPTSEELLKHIFVLRERPETVLIDLIQRTKDA
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310 320 330 340 350 360
pF1KSD VRELDNLQYRKMKKILFQEAPNGPGAEAPEEEEEAEPYMHRAGTLTSLESSHSVPSMSIS
::::::::::::::.::::: :::..:: ::::: . . :.::..:. :..:.::::::
CCDS56 VRELDNLQYRKMKKLLFQEAHNGPAVEAQEEEEEQDHGVGRTGTVNSVGSNQSIPSMSIS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD ASSQSSSVNSLADASDNEEEEEEEEEEEEEEEGPEAREMAMMQEGEHTVTSHSSIIHRLP
::::::::::: :.::.. : . :.::.::: :.::.:: :
CCDS56 ASSQSSSVNSLPDVSDDKSELD-------------------MMEGDHTVMSNSSVIHLKP
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pF1KSD GSDNLYDDPYQPEITPS-PLQPPAAPAPTSTTSSARRRAYCRNRDHFATIRTASLVSRQI
.: : . .:. : : .:: . .:.... :::.:::::::::::.::.
CCDS56 EEEN-YREEGDPRTRASDPQSPPQV---------SRHKSHYRNREHFATIRTASLVTRQM
410 420 430 440 450
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CCDS56 QEHEQDSELREQMSGYKRMRRQHQKQLMTLENKLKAEMDEHRLRLDKDLETQRNNFAAEM
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pF1KSD EKLARRHQAIGEKEARAAQAEERKFQQHILGQQKKELAALLEAQKRTYKLRKEQLKEELQ
::: ..::: ::::.. . ::.:::::: .:::::: ..::.::: ::::::::::
CCDS56 EKLIKKHQAAMEKEAKVMSNEEKKFQQHIQAQQKKELNSFLESQKREYKLRKEQLKE---
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CCDS56 EHKAVLKRLKEEQTRKLAILAEQYDHSINEMLSTQALRLDEAQEAECQVLKMQLQQELEL
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CCDS56 LNAYQSKIKMQAEAQHDRELRELEQRVSLRRALLEQKIEEEMLALQNERTERIRSLLERQ
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pF1KSD AREIEAFDAESMRLGFSSMALGGIPAEAAAQGYPAPPPAPAWPSRPVPRSGAHWSHGPPP
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CCDS56 AREIEAFDSESMRLGFSNMVLSNLSPEAFSHSYPG---ASGWSHNPTGGPGPHWGH---P
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pF1KSD PGMPPPAWRQPSLLAPPGPPNWLGP--PTQSGTPRGGALLLLRNSPQPLRRAASGGSGSE
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CCDS56 MGGPPQAWGHP---MQGGPQPWGHPSGPMQ-GVPRGSSMGV-RNSPQALRRTASGGRTEQ
780 790 800 810 820 830
1020 1030 1040
pF1KSD NVGPPAAAVPGPLSRSTSVASHILNGSSHFYS
. .::::::.:.: ::: :.
CCDS56 G-----------MSRSTSVTSQISNGSHMSYT
840 850
>>CCDS9188.1 TAOK3 gene_id:51347|Hs108|chr12 (898 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KSD MPAGGRAGSLKDPDVAELFFKDDPEKLFSDLREIGHGSFGAVYFARDVRNSEVVAIKKMS
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CCDS91 MRKGVLKDPEIADLFYKDDPEELFIGLHEIGHGSFGAVYFATNAHTSEVVAIKKMS
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pF1KSD YSGKQSNEKWQDIIKEVRFLQKLRHPNTIQYRGCYLREHTAWLVMEYCLGSASDLLEVHK
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CCDS91 YSGKQTHEKWQDILKEVKFLRQLKHPNTIEYKGCYLKEHTAWLVMEYCLGSASDLLEVHK
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pF1KSD KPLQEVEIAAVTHGALQGLAYLHSHNMIHRDVKAGNILLSEPGLVKLGDFGSASIMAPAN
::::::::::.:::::.:::::::: .::::.:::::::.::: :::.::::::. .:::
CCDS91 KPLQEVEIAAITHGALHGLAYLHSHALIHRDIKAGNILLTEPGQVKLADFGSASMASPAN
120 130 140 150 160 170
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pF1KSD SFVGTPYWMAPEVILAMDEGQYDGKVDVWSLGITCIELAERKPPLFNMNAMSALYHIAQN
:::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 SFVGTPYWMAPEVILAMDEGQYDGKVDIWSLGITCIELAERKPPLFNMNAMSALYHIAQN
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pF1KSD ESPVLQSGHWSEYFRNFVDSCLQKIPQDRPTSEVLLKHRFVLRERPPTVIMDLIQRTKDA
.::.:::..:.. :: ::: :::::::.:::: ::.: :: :.:: :..:::::::::
CCDS91 DSPTLQSNEWTDSFRRFVDYCLQKIPQERPTSAELLRHDFVRRDRPLRVLIDLIQRTKDA
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pF1KSD VRELDNLQYRKMKKILFQEAPNGPGAEAPEEEEEAEPYMHRAGTLTSLESSHSVPSMSIS
:::::::::::::::::::. ::: :. :.::..: . :: :.::.::::.:
CCDS91 VRELDNLQYRKMKKILFQETRNGPLNESQEDEEDSEHGTSLNREMDSLGSNHSIPSMSVS
300 310 320 330 340 350
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pF1KSD ASSQSSSVNSLADASDNEEEEEEEEEEEEEEEGPEAREMAMMQEGEHTVTSHSSIIHRLP
..::::::::. .. :. . :..::.. : :..: ::..:.
CCDS91 TGSQSSSVNSMQEVMDES-----------------SSELVMMHDDESTINSSSSVVHK--
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pF1KSD GSDNLYDDPYQPEITPSPLQPPAAPAPTSTTSSARRRAYCRNRDHFATIRTASLVSRQIQ
.:... . : : : ::....: . . :::..::::..::::.:::.
CCDS91 -KDHVFIRDEAGHGDPRP-----EPRPTQSVQS--QALHYRNRERFATIKSASLVTRQIH
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pF1KSD EHEQDSALREQLSGYKRMRRQHQKQLLALESRLRGEREEHSARLQRELEAQRAGFGAEAE
::::.. ::::.::::::::::::::.:::..:..: .:: .::.:.:.. . . : :
CCDS91 EHEQENELREQMSGYKRMRRQHQKQLIALENKLKAEMDEHRLKLQKEVETHANNSSIELE
450 460 470 480 490 500
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pF1KSD KLARRHQAIGEKEARAAQAEERKFQQHILGQQKKELAALLEAQKRTYKLRKEQLKEELQE
:::... :: ::::..: :.:.::::.::.::::.:...::.::. ::. ::..:::..:
CCDS91 KLAKKQVAIIEKEAKVAAADEKKFQQQILAQQKKDLTTFLESQKKQYKICKEKIKEEMNE
510 520 530 540 550 560
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pF1KSD NPSTPKREKAEWLLRQKEQLQQCQAEEEAGLLRRQRQYFELQCRQYKRKMLLARHSLDQD
. ::::.:: : . ..::.::. :::::: :: .:: :.. .:: .:::... :: ..:.
CCDS91 DHSTPKKEKQERISKHKENLQHTQAEEEAHLLTQQRLYYDKNCRFFKRKIMIKRHEVEQQ
570 580 590 600 610 620
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pF1KSD LLREDLNKKQTQKDLECALLLRQHEATRELELRQLQAVQRTRAELTRLQHQTELGNQLEY
.::.::::.:::..: :.:.:. :.::::: :::...:. : .: :::::::: :::::
CCDS91 NIREELNKKRTQKEMEHAMLIRHDESTRELEYRQLHTLQKLRMDLIRLQHQTELENQLEY
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pF1KSD NKRREQELRQKHAAQVRQQPKSLKSKELQIKKQFQETCKIQTRQYKALRAHLLETTPKAQ
:::::.::..::. ..:::::.::. :.:::::::.:::.::.:::::. : ::.::: .
CCDS91 NKRRERELHRKHVMELRQQPKNLKAMEMQIKKQFQDTCKVQTKQYKALKNHQLEVTPKNE
690 700 710 720 730 740
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pF1KSD HKSLLKRLKEEQTRKLAILAEQYDQSISEMLSSQALRLDETQEAEFQALRQQLQQELELL
::..:: ::.:::::::::::::.:::.::..::::::::.:::: :::: :::::.:::
CCDS91 HKTILKTLKDEQTRKLAILAEQYEQSINEMMASQALRLDEAQEAECQALRLQLQQEMELL
750 760 770 780 790 800
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pF1KSD NAYQSKIKIRTESQHERELRELEQRVALRRALLEQRVEEELLALQTGRSERIRSLLERQA
::::::::..::.::::::..:::::.:::: :::..:::: ::: :::::..:::::
CCDS91 NAYQSKIKMQTEAQHERELQKLEQRVSLRRAHLEQKIEEELAALQKERSERIKNLLERQE
810 820 830 840 850 860
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pF1KSD REIEAFDAESMRLGFSSMALGGIPAEAAAQGYPAPPPAPAWPSRPVPRSGAHWSHGPPPP
::::.:: ::.:.::.... .: :
CCDS91 REIETFDMESLRMGFGNLVTLDFPKEDYR
870 880 890
>>CCDS9488.1 STK24 gene_id:8428|Hs108|chr13 (443 aa)
initn: 619 init1: 266 opt: 781 Z-score: 331.3 bits: 71.7 E(32554): 3.9e-12
Smith-Waterman score: 781; 44.1% identity (73.9% similar) in 299 aa overlap (6-298:15-304)
10 20 30 40 50
pF1KSD MPAGGRAGSLKDPDVAELFFKDDPEKLFSDLREIGHGSFGAVYFARDVRNS
: ..: : . .: :::.::. :..::.:::: :. . : :..
CCDS94 MDSRAQLWGLALNKRRATLPHPG-GSTNLKADPEELFTKLEKIGKGSFGEVFKGIDNRTQ
10 20 30 40 50
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pF1KSD EVVAIKKMSYSGKQSNEKWQDIIKEVRFLQKLRHPNTIQYRGCYLREHTAWLVMEYCLG-
.::::: .. ...... .:: .:. :.. : . .: : ::.. :..::: :
CCDS94 KVVAIKIIDL--EEAEDEIEDIQQEITVLSQCDSPYVTKYYGSYLKDTKLWIIMEYLGGG
60 70 80 90 100 110
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pF1KSD SASDLLEVHKKPLQEVEIAAVTHGALQGLAYLHSHNMIHRDVKAGNILLSEPGLVKLGDF
:: :::: ::.:..::.. . :.:: ::::.. ::::.::.:.:::: : :::.::
CCDS94 SALDLLE--PGPLDETQIATILREILKGLDYLHSEKKIHRDIKAANVLLSEHGEVKLADF
120 130 140 150 160 170
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CCDS94 KTSYLTELIDRYKRWKAEQSHDDSSSEDSDAETDGQASGGSDSGDWIFTIREKDPKNLEN
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CCDS47 DFKNKSHENCNQNMHEPFPMSKNVFPDNWKVPQDGDFDFLKNLSLEELQMRLKALDPMME
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CCDS59 AGQLTDTMAKRNTVIGTPFWMAPEVI---QEIGYNCVADIWSLGITSIEMAEGKPPYADI
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]