FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0865, 1858 aa
1>>>pF1KSDA0865 1858 - 1858 aa - 1858 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 15.8773+/-0.00147; mu= -21.8022+/- 0.089
mean_var=733.4486+/-148.540, 0's: 0 Z-trim(113.6): 108 B-trim: 0 in 0/55
Lambda= 0.047358
statistics sampled from 14091 (14176) to 14091 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.719), E-opt: 0.2 (0.435), width: 16
Scan time: 8.200
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS32008.1 MYO16 gene_id:23026|Hs108|chr13 (1858) 12436 866.7 0
CCDS73598.1 MYO16 gene_id:23026|Hs108|chr13 (1880) 12436 866.7 0
CCDS46446.1 MYO3B gene_id:140469|Hs108|chr2 (1314) 1040 88.0 2.6e-16
CCDS42773.1 MYO3B gene_id:140469|Hs108|chr2 (1341) 1040 88.0 2.6e-16
CCDS7148.1 MYO3A gene_id:53904|Hs108|chr10 (1616) 1042 88.2 2.7e-16
CCDS46529.1 NYAP2 gene_id:57624|Hs108|chr2 ( 653) 1013 85.9 5.4e-16
CCDS76991.1 MYO1D gene_id:4642|Hs108|chr17 ( 961) 984 84.1 2.9e-15
CCDS32615.1 MYO1D gene_id:4642|Hs108|chr17 (1006) 984 84.1 3e-15
CCDS46010.1 MYO9B gene_id:4650|Hs108|chr19 (2022) 901 78.7 2.6e-13
CCDS13927.1 MYH9 gene_id:4627|Hs108|chr22 (1960) 894 78.2 3.5e-13
CCDS11144.1 MYH10 gene_id:4628|Hs108|chr17 (1976) 894 78.2 3.5e-13
CCDS8929.1 MYO1A gene_id:4640|Hs108|chr12 (1043) 863 75.8 9.4e-13
CCDS32254.1 MYO1E gene_id:4643|Hs108|chr15 (1108) 844 74.6 2.4e-12
CCDS76992.1 MYO1D gene_id:4642|Hs108|chr17 ( 436) 828 73.1 2.6e-12
CCDS42494.1 MYO1F gene_id:4542|Hs108|chr19 (1098) 837 74.1 3.3e-12
CCDS59411.1 MYH14 gene_id:79784|Hs108|chr19 (1995) 787 70.9 5.6e-11
CCDS54295.1 MYH14 gene_id:79784|Hs108|chr19 (2036) 785 70.7 6.2e-11
CCDS46151.1 MYH14 gene_id:79784|Hs108|chr19 (2003) 781 70.5 7.4e-11
>>CCDS32008.1 MYO16 gene_id:23026|Hs108|chr13 (1858 aa)
initn: 12436 init1: 12436 opt: 12436 Z-score: 4612.3 bits: 866.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 12436; 99.9% identity (99.9% similar) in 1858 aa overlap (1-1858:1-1858)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MEIDQCLLESLPLGQRQRLVKRMRCEQIKAYYEREKAFQKQEGFLKRLKHAKNPKVHFNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MEIDQCLLESLPLGQRQRLVKRMRCEQIKAYYEREKAFQKQEGFLKRLKHAKNPKVHFNL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD TDMLQDAIIHHNDKEVLRLLKEGADPHTLVSSGGSLLHLCARYDNAFIAEILIDRGVNVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 TDMLQDAIIHHNDKEVLRLLKEGADPHTLVSSGGSLLHLCARYDNAFIAEILIDRGVNVN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD HQDEDFWTPMHIACACDNPDIVLLLVLAGANVLLQDVNGNIPLDYAVEGTESSSILLTYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 HQDEDFWTPMHIACACDNPDIVLLLVLAGANVLLQDVNGNIPLDYAVEGTESSSILLTYL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD DENGVDLTSLRQMKLQRPMSMLTDVKHFLSSGGNVNEKNDEGVTLLHMACASGYKEVVSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DENGVDLTSLRQMKLQRPMSMLTDVKHFLSSGGNVNEKNDEGVTLLHMACASGYKEVVSL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD ILEHGGDLNIVDDQYWTPLHLAAKYGQTNLVKLLLMHQANPHLVNCNEEKASDIAASEFI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ILEHGGDLNIVDDQYWTPLHLAAKYGQTNLVKLLLMHQANPHLVNCNEEKASDIAASEFI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD EEMLLKAEIAWEEKMKEPLSASTLAQEEPYEEIIHDLPVLSSKLSPLVLPIAKQDSLLEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 EEMLLKAEIAWEEKMKEPLSASTLAQEEPYEEIIHDLPVLSSKLSPLVLPIAKQDSLLEK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD DIMFKDATKGLCKQQSQDSIPENPMMSGSTKPEQVKLMPPAPNDDLATLSELNDGSLLYE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DIMFKDATKGLCKQQSQDSIPENPMMSGSTKPEQVKLMPPAPNDDLATLSELNDGSLLYE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD IQKRFGNNQIYTFIGDILLLVNPYKELPIYSSMVSQLYFSSSGKLCSSLPPHLFSCVERA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 IQKRFGNNQIYTFIGDILLLVNPYKELPIYSSMVSQLYFSSSGKLCSSLPPHLFSCVERA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD FHQLFREQRPQCFILSGERGSGKSEASKQIIRHLTCRAGASRATLDSRFKHVVCILEAFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 FHQLFREQRPQCFILSGERGSGKSEASKQIIRHLTCRAGASRATLDSRFKHVVCILEAFG
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD HAKTTLNDLSSCFIKYFELQFCERKQQLTGARIYTYLLEKSRLVSQPLGQSNFLIFYLLM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 HAKTTLNDLSSCFIKYFELQFCERKQQLTGARIYTYLLEKSRLVSQPLGQSNFLIFYLLM
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD DGLSAEEKYGLHLNNLCAHRYLNQTIQDDASTGERSLNREKLAVLKRALNVVGFSSLEVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DGLSAEEKYGLHLNNLCAHRYLNQTIQDDASTGERSLNREKLAVLKRALNVVGFSSLEVE
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD NLFVILAAILHLGDIRFTALNEGNSAFVSDLQLLEQVAGMLQVSTDELASALTTDIQYFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 NLFVILAAILHLGDIRFTALNEGNSAFVSDLQLLEQVAGMLQVSTDELASALTTDIQYFK
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD GDMIIRRHTIQIAEFFRDLLAKSLYSRLFSFLVNTMNSCLHSQDEQKSMQTLDIGILDIF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GDMIIRRHTIQIAEFFRDLLAKSLYSRLFSFLVNTMNSCLHSQDEQKSMQTLDIGILDIF
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD GFEEFQKNEFEQLCVNMTNEKMHHYINEVLFLHEQVECVQEGVTMETAYSAGNQNGVLDF
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::
CCDS32 GFEEFQKNEFEQLCVNMTNEKMHHYINEVLFLHEQVECVQEGVTMETAYSPGNQNGVLDF
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD FFQKPSGFLTLLDEESQMIWSVESNFPKKLQSLLESSNTNAVYSPMKDGNGNVALKDHGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 FFQKPSGFLTLLDEESQMIWSVESNFPKKLQSLLESSNTNAVYSPMKDGNGNVALKDHGT
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD AFTIMHYAGRVMYDVVGAIEKNKDSLSQNLLFVMKTSENVVINHLFQSKLSQTGSLVSAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 AFTIMHYAGRVMYDVVGAIEKNKDSLSQNLLFVMKTSENVVINHLFQSKLSQTGSLVSAY
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD PSFKFRGHKSALLSKKMTASSIIGENKNYLELSKLLKKKGTSTFLQRLERGDPVTIASQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PSFKFRGHKSALLSKKMTASSIIGENKNYLELSKLLKKKGTSTFLQRLERGDPVTIASQL
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD RKSLMDIIGKLQKCTPHFIHCIRPNNSKLPDTFDNFYVSAQLQYIGVLEMVKIFRYGYPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 RKSLMDIIGKLQKCTPHFIHCIRPNNSKLPDTFDNFYVSAQLQYIGVLEMVKIFRYGYPV
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD RLSFSDFLSRYKPLADTFLREKKEQSAAERCRLVLQQCKLQGWQMGVRKVFLKYWHADQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 RLSFSDFLSRYKPLADTFLREKKEQSAAERCRLVLQQCKLQGWQMGVRKVFLKYWHADQL
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD NDLCLQLQRKIITCQKVIRGFLARQHLLQRISIRQQEVTSINSFLQNTEDMGLKTYDALV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 NDLCLQLQRKIITCQKVIRGFLARQHLLQRISIRQQEVTSINSFLQNTEDMGLKTYDALV
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KSD IQNASDIARENDRLRSEMNAPYHKEKLEVRNMQEEGSKRTDDKSGPRHFHPSSMSVCAAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 IQNASDIARENDRLRSEMNAPYHKEKLEVRNMQEEGSKRTDDKSGPRHFHPSSMSVCAAV
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KSD DGLGQCLVGPSIWSPSLHSVFSMDDSSSLPSPRKQPPPKPKRDPNTRLSASYEAVSACLS
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CCDS32 DGLGQCLVGPSIWSPSLHSVFSMDDSSSLPSPRKQPPPKPKRDPNTRLSASYEAVSACLS
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KSD AAREAANEALARPRPHSDDYSTMKKIPPRKPKRSPNTKLSGSYEEISGSRPGDARPAGAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 AAREAANEALARPRPHSDDYSTMKKIPPRKPKRSPNTKLSGSYEEISGSRPGDARPAGAP
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KSD GAAARVLTPGTPQCALPPAAPPGDEDDSEPVYIEMLGHAARPDSPDPGESVYEEMKCCLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GAAARVLTPGTPQCALPPAAPPGDEDDSEPVYIEMLGHAARPDSPDPGESVYEEMKCCLP
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KSD DDGGPGAGSFLLHGASPPLLHRAPEDEAAGPPGDACDIPPPFPNLLPHRPPLLVFPPTPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DDGGPGAGSFLLHGASPPLLHRAPEDEAAGPPGDACDIPPPFPNLLPHRPPLLVFPPTPV
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KSD TCSPASDESPLTPLEVKKLPVLETNLKYPVQPEGSSPLSPQYSKSQKGDGDRPASPGLAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 TCSPASDESPLTPLEVKKLPVLETNLKYPVQPEGSSPLSPQYSKSQKGDGDRPASPGLAL
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KSD FNGSGRASPPSTPPPPPPPPGPPPAPYRPCAHLAFPPEPAPVNAGKAGPSAEAPKVHPKP
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CCDS32 FNGSGRASPPSTPPPPPPPPGPPPAPYRPCAHLAFPPEPAPVNAGKAGPSAEAPKVHPKP
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KSD NSAPVAGPCSSFPKIPYSPVKATRADARKAGSSASPPAPYSPPSSRPLSSPLDELASLFN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 NSAPVAGPCSSFPKIPYSPVKATRADARKAGSSASPPAPYSPPSSRPLSSPLDELASLFN
1630 1640 1650 1660 1670 1680
1690 1700 1710 1720 1730 1740
pF1KSD SGRSVLRKSAAGRKIREAEGFETNMNISSRDDPSTSEITSETQDRNANNHGIQLSNSLSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SGRSVLRKSAAGRKIREAEGFETNMNISSRDDPSTSEITSETQDRNANNHGIQLSNSLSS
1690 1700 1710 1720 1730 1740
1750 1760 1770 1780 1790 1800
pF1KSD AITAENGNSISNGLPEEDGYSRLSISGTGTSTFQRHRDSHTTQVIHQLRLSENESVALQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 AITAENGNSISNGLPEEDGYSRLSISGTGTSTFQRHRDSHTTQVIHQLRLSENESVALQE
1750 1760 1770 1780 1790 1800
1810 1820 1830 1840 1850
pF1KSD LLDWRRKLCEEGQDWQQILHHAEPRVPPPPPCKKPSLLKKPEGASCNRLPSELWDTTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LLDWRRKLCEEGQDWQQILHHAEPRVPPPPPCKKPSLLKKPEGASCNRLPSELWDTTI
1810 1820 1830 1840 1850
>>CCDS73598.1 MYO16 gene_id:23026|Hs108|chr13 (1880 aa)
initn: 12436 init1: 12436 opt: 12436 Z-score: 4612.3 bits: 866.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 12436; 99.9% identity (99.9% similar) in 1858 aa overlap (1-1858:23-1880)
10 20 30
pF1KSD MEIDQCLLESLPLGQRQRLVKRMRCEQIKAYYEREKAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 MSHYHFIKCCCFQLCNVFRSHEMEIDQCLLESLPLGQRQRLVKRMRCEQIKAYYEREKAF
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KSD QKQEGFLKRLKHAKNPKVHFNLTDMLQDAIIHHNDKEVLRLLKEGADPHTLVSSGGSLLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 QKQEGFLKRLKHAKNPKVHFNLTDMLQDAIIHHNDKEVLRLLKEGADPHTLVSSGGSLLH
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KSD LCARYDNAFIAEILIDRGVNVNHQDEDFWTPMHIACACDNPDIVLLLVLAGANVLLQDVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 LCARYDNAFIAEILIDRGVNVNHQDEDFWTPMHIACACDNPDIVLLLVLAGANVLLQDVN
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KSD GNIPLDYAVEGTESSSILLTYLDENGVDLTSLRQMKLQRPMSMLTDVKHFLSSGGNVNEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 GNIPLDYAVEGTESSSILLTYLDENGVDLTSLRQMKLQRPMSMLTDVKHFLSSGGNVNEK
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KSD NDEGVTLLHMACASGYKEVVSLILEHGGDLNIVDDQYWTPLHLAAKYGQTNLVKLLLMHQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 NDEGVTLLHMACASGYKEVVSLILEHGGDLNIVDDQYWTPLHLAAKYGQTNLVKLLLMHQ
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KSD ANPHLVNCNEEKASDIAASEFIEEMLLKAEIAWEEKMKEPLSASTLAQEEPYEEIIHDLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 ANPHLVNCNEEKASDIAASEFIEEMLLKAEIAWEEKMKEPLSASTLAQEEPYEEIIHDLP
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KSD VLSSKLSPLVLPIAKQDSLLEKDIMFKDATKGLCKQQSQDSIPENPMMSGSTKPEQVKLM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 VLSSKLSPLVLPIAKQDSLLEKDIMFKDATKGLCKQQSQDSIPENPMMSGSTKPEQVKLM
370 380 390 400 410 420
400 410 420 430 440 450
pF1KSD PPAPNDDLATLSELNDGSLLYEIQKRFGNNQIYTFIGDILLLVNPYKELPIYSSMVSQLY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 PPAPNDDLATLSELNDGSLLYEIQKRFGNNQIYTFIGDILLLVNPYKELPIYSSMVSQLY
430 440 450 460 470 480
460 470 480 490 500 510
pF1KSD FSSSGKLCSSLPPHLFSCVERAFHQLFREQRPQCFILSGERGSGKSEASKQIIRHLTCRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 FSSSGKLCSSLPPHLFSCVERAFHQLFREQRPQCFILSGERGSGKSEASKQIIRHLTCRA
490 500 510 520 530 540
520 530 540 550 560 570
pF1KSD GASRATLDSRFKHVVCILEAFGHAKTTLNDLSSCFIKYFELQFCERKQQLTGARIYTYLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 GASRATLDSRFKHVVCILEAFGHAKTTLNDLSSCFIKYFELQFCERKQQLTGARIYTYLL
550 560 570 580 590 600
580 590 600 610 620 630
pF1KSD EKSRLVSQPLGQSNFLIFYLLMDGLSAEEKYGLHLNNLCAHRYLNQTIQDDASTGERSLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 EKSRLVSQPLGQSNFLIFYLLMDGLSAEEKYGLHLNNLCAHRYLNQTIQDDASTGERSLN
610 620 630 640 650 660
640 650 660 670 680 690
pF1KSD REKLAVLKRALNVVGFSSLEVENLFVILAAILHLGDIRFTALNEGNSAFVSDLQLLEQVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 REKLAVLKRALNVVGFSSLEVENLFVILAAILHLGDIRFTALNEGNSAFVSDLQLLEQVA
670 680 690 700 710 720
700 710 720 730 740 750
pF1KSD GMLQVSTDELASALTTDIQYFKGDMIIRRHTIQIAEFFRDLLAKSLYSRLFSFLVNTMNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 GMLQVSTDELASALTTDIQYFKGDMIIRRHTIQIAEFFRDLLAKSLYSRLFSFLVNTMNS
730 740 750 760 770 780
760 770 780 790 800 810
pF1KSD CLHSQDEQKSMQTLDIGILDIFGFEEFQKNEFEQLCVNMTNEKMHHYINEVLFLHEQVEC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 CLHSQDEQKSMQTLDIGILDIFGFEEFQKNEFEQLCVNMTNEKMHHYINEVLFLHEQVEC
790 800 810 820 830 840
820 830 840 850 860 870
pF1KSD VQEGVTMETAYSAGNQNGVLDFFFQKPSGFLTLLDEESQMIWSVESNFPKKLQSLLESSN
:::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 VQEGVTMETAYSPGNQNGVLDFFFQKPSGFLTLLDEESQMIWSVESNFPKKLQSLLESSN
850 860 870 880 890 900
880 890 900 910 920 930
pF1KSD TNAVYSPMKDGNGNVALKDHGTAFTIMHYAGRVMYDVVGAIEKNKDSLSQNLLFVMKTSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 TNAVYSPMKDGNGNVALKDHGTAFTIMHYAGRVMYDVVGAIEKNKDSLSQNLLFVMKTSE
910 920 930 940 950 960
940 950 960 970 980 990
pF1KSD NVVINHLFQSKLSQTGSLVSAYPSFKFRGHKSALLSKKMTASSIIGENKNYLELSKLLKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 NVVINHLFQSKLSQTGSLVSAYPSFKFRGHKSALLSKKMTASSIIGENKNYLELSKLLKK
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CCDS73 KGTSTFLQRLERGDPVTIASQLRKSLMDIIGKLQKCTPHFIHCIRPNNSKLPDTFDNFYV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 SAQLQYIGVLEMVKIFRYGYPVRLSFSDFLSRYKPLADTFLREKKEQSAAERCRLVLQQC
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 KLQGWQMGVRKVFLKYWHADQLNDLCLQLQRKIITCQKVIRGFLARQHLLQRISIRQQEV
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pF1KSD TSINSFLQNTEDMGLKTYDALVIQNASDIARENDRLRSEMNAPYHKEKLEVRNMQEEGSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 TSINSFLQNTEDMGLKTYDALVIQNASDIARENDRLRSEMNAPYHKEKLEVRNMQEEGSK
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 RTDDKSGPRHFHPSSMSVCAAVDGLGQCLVGPSIWSPSLHSVFSMDDSSSLPSPRKQPPP
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 KPKRDPNTRLSASYEAVSACLSAAREAANEALARPRPHSDDYSTMKKIPPRKPKRSPNTK
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 LSGSYEEISGSRPGDARPAGAPGAAARVLTPGTPQCALPPAAPPGDEDDSEPVYIEMLGH
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 AARPDSPDPGESVYEEMKCCLPDDGGPGAGSFLLHGASPPLLHRAPEDEAAGPPGDACDI
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 PPPFPNLLPHRPPLLVFPPTPVTCSPASDESPLTPLEVKKLPVLETNLKYPVQPEGSSPL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 SPQYSKSQKGDGDRPASPGLALFNGSGRASPPSTPPPPPPPPGPPPAPYRPCAHLAFPPE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 PAPVNAGKAGPSAEAPKVHPKPNSAPVAGPCSSFPKIPYSPVKATRADARKAGSSASPPA
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pF1KSD PYSPPSSRPLSSPLDELASLFNSGRSVLRKSAAGRKIREAEGFETNMNISSRDDPSTSEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 PYSPPSSRPLSSPLDELASLFNSGRSVLRKSAAGRKIREAEGFETNMNISSRDDPSTSEI
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 TSETQDRNANNHGIQLSNSLSSAITAENGNSISNGLPEEDGYSRLSISGTGTSTFQRHRD
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CCDS73 SHTTQVIHQLRLSENESVALQELLDWRRKLCEEGQDWQQILHHAEPRVPPPPPCKKPSLL
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1840 1850
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::::::::::::::::::::
CCDS73 KKPEGASCNRLPSELWDTTI
1870 1880
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: .. : :... .... . ..::.. ::.... :::.::..:.:.:.:.. . .
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.. : . . :...:..: .: .:: :::. .:. ::: .:.. : :: ..:.:
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pF1KSD HYINEVLFLHEQVECVQEGVTMETAYSAGNQNGVLDFFFQKPSGFLTLLDEESQMIWSVE
.:.:. .: ::.: .::. . :. .::.:.::: :.:.::::::.
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pF1KSD SNFPKKL-QSLLESSNTNAVYSPMKDGNGNVALKDHGTAFTIMHYAGRVMYDVVGAIEKN
::. :.:... . : . . .: : : : :.::::.:.::. :..:::
CCDS46 --FPQATDQTLVDKFEDNLRCKYFWRPKG-VEL-----CFGIQHYAGKVLYDASGVLEKN
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pF1KSD KDSLSQNLLFVMKTSENVVINHLFQSKLSQTGSLVSAYPSFKFRGHKSALLSKKMTASSI
.:.: ... :..:::: ....::. :..::.:... . :. : ...:
CCDS46 RDTLPADVVVVLRTSENKLLQQLFSIPLTKTGNLAQTRARITV---ASSSLPPHFSA---
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:. : .. ..... .: ..: :.:: .: ::::...:. :::..::
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.::... :. : :::. :.:: :.: : :: :. : .:..:: :: : ..
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.. : : .:.. .:. : .: ::::::.:..::: : .. .... : .:.:
CCDS46 TPLASKESCVAILEKSRLDHWVLGKTKVFLKYYHVEQLNLLLREVIGRVVVLQAYTKGWL
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pF1KSD -ARQHLLQRIS-IRQQEVTSINSFLQNTEDMGLKTYDALVIQNASDI---ARENDR--LR
::.. .:. :.. . .:.: .... : .. : ...... .. .:. ::
CCDS46 GARRY--KRVREKREKGAIAIQSGDTSNQSSGPHSPVAAGTRGSAEVQDCSEPGDHKVLR
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. .. :. :. . :.. .: . .:.: . . :: . : :
CCDS46 GSVHRRSHSQAESNNGRTQTSSNSPAVTEKNGHSQAQ-SSPKGCDIFAG-----------
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pF1KSD SPSLHSVFSMDDSSSL---PSPRKQ------PPPKPKRDPNTRLSASYEAVSACLSAARE
. ::: . : :: :.: .: : ::
CCDS46 HANKHSVSGTDLLSSRICHPAPDQQGLSLWGAPQKPGSENGLAQKHRTPRRRCQQPKMLS
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pF1KSD AANEALARPRPHSDDYSTMKKIPPRKPKRSPNTKLSGSYEEISGSRPGDARPAGAPGAAA
CCDS46 SPEDTMYYNQLNGTLEYQGSKRKPRKLGQIKVLDGEDEYYKSLSPVDCIPEENNSAHPSF
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CCDS42 AIELGDGDPPLFDMHPVKTLFKIPRNPPPTLLHPE-KWCEEFNHFISQCLIKDFERRPSV
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CCDS42 THLLD------HPFIKGVHGKVLFLQKQL-----AKVLQDQKHQNPVAKTRHERMHTRRP
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pF1KSD EQVKLMPP-APNDDLATLSELNDGSLLYEIQKRFGNNQIYTFIGDILLLVNPYKELPIYS
.:. .:::..: :.. ......:::... :::..::::. .::...: :::
CCDS42 YHVEDAEKYCLEDDLVNLEVLDEDTIIHQLQKRYADLLIYTYVGDILIALNPFQNLSIYS
340 350 360 370 380 390
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pF1KSD SMVSQLYFSSSGKLCSSLPPHLFSCVERAFHQLFREQRPQCFILSGERGSGKSEASKQII
. :.:: : .: :::.:. .. :.. . .. ::...::: ::::.:... :.
CCDS42 PQFSRLYH---GVKRASNPPHIFASADAAYQCMVTLSKDQCIVISGESGSGKTESAHLIV
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pF1KSD RHLTCRAGASRATLDSRFKHVVCILEAFGHAKTTLNDLSSCFIKYFELQFCERKQQLTGA
.::: . :. :: .. .: ..::::.. :..:: :: : ::.:..: . ::
CCDS42 QHLTFLGKANNQTLREKILQVNSLVEAFGNSCTAINDNSSRFGKYLEMMFTPTGV-VMGA
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:: :::::::...: ..:: ::: .. :: ..: . ..: . ::. ..: ..
CCDS42 RISEYLLEKSRVIKQAAREKNFHIFYYIYAGLHHQKKLSDFRLPEEKPPRYIADETGRVM
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: .. : :... .... . ..::.. ::.... :::.::..:.:.:.:.. . .
CCDS42 HDITSKES--YRRQFEAIQHCFRIIGFTDKEVHSVYRILAGILNIGNIEFAAISSQHQTD
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pF1KSD SAFVSDLQLLEQVAGMLQVSTDELASALTTDIQYFKGDMIIRRHTIQIAEFFRDLLAKSL
.. : . . :...:..: .: .:: :::. .:. ::: .:.. : :: ..:.:
CCDS42 KSEVPNAEALQNAASVLCISPEELQEALTSHCVVTRGETIIRANTVDRAADVRDAMSKAL
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pF1KSD YSRLFSFLVNTMNSCLHSQDEQKSMQT-LDIGILDIFGFEEFQKNEFEQLCVNMTNEKMH
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CCDS42 YGRLFSWIVNRINTLLQPDENICSAGGGMNVGILDIFGFENFQRNSFEQLCINIANEQIQ
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pF1KSD HYINEVLFLHEQVECVQEGVTMETAYSAGNQNGVLDFFFQKPSGFLTLLDEESQMIWSVE
.:.:. .: ::.: .::. . :. .::.:.::: :.:.::::::.
CCDS42 YYFNQHVFALEQMEYQNEGIDAVPVEYEDNRP-LLDMFLQKPLGLLALLDEESR------
750 760 770 780 790 800
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pF1KSD SNFPKKL-QSLLESSNTNAVYSPMKDGNGNVALKDHGTAFTIMHYAGRVMYDVVGAIEKN
::. :.:... . : . . .: : : : :.::::.:.::. :..:::
CCDS42 --FPQATDQTLVDKFEDNLRCKYFWRPKG-VEL-----CFGIQHYAGKVLYDASGVLEKN
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pF1KSD KDSLSQNLLFVMKTSENVVINHLFQSKLSQTGSLVSAYPSFKFRGHKSALLSKKMTASSI
.:.: ... :..:::: ....::. :..::.:... . :. : ...:
CCDS42 RDTLPADVVVVLRTSENKLLQQLFSIPLTKTGNLAQTRARITV---ASSSLPPHFSA---
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pF1KSD IGENKNYLELSKLLKKKGTSTFLQRLERGDPVTIASQLRKSLMDIIGKLQKCTPHFIHCI
:. : .. ..... .: ..: :.:: .: ::::...:. :::..::
CCDS42 -GKAK--VDTLEVIRHPEETTNMKRQ------TVASYFRYSLMDLLSKMVVGQPHFVRCI
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pF1KSD RPNNSKLPDTFDNFYVSAQLQYIGVLEMVKIFRYGYPVRLSFSDFLSRYKPLADTFLREK
.::... :. : :::. :.:: :.: : :: :. : .:..:: :: : ..
CCDS42 KPNDDREALQFSRERVLAQLRSTGILETVSIRRQGYSHRILFEEFVKRYYYLA--FTAHQ
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1110 1120 1130 1140 1150 1160
pF1KSD KEQSAAERCRLVLQQCKLQGWQMGVRKVFLKYWHADQLNDLCLQLQRKIITCQKVIRGFL
.. : : .:.. .:. : .: ::::::.:..::: : .. .... : .:.:
CCDS42 TPLASKESCVAILEKSRLDHWVLGKTKVFLKYYHVEQLNLLLREVIGRVVVLQAYTKGWL
1020 1030 1040 1050 1060 1070
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pF1KSD -ARQHLLQRIS-IRQQEVTSINSFLQNTE------DMGLKTYDALVIQNASDIARENDRL
::.. .:. :.. . .:.: .. . .. . .. . ..:.: . ...
CCDS42 GARRY--KRVREKREKGAIAIQSAWRGYDARRKFKKISNRRNESAAHNQAGDTSNQSSGP
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.: . : . . ::.. .: :.... : :. : .. : .: : . :..
CCDS42 HSPVAAGT-RGSAEVQDCSEPGDHKVLRGSVHRRSHSQAES----NNGRTQTSSNSPAVT
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pF1KSD SPSLHSVFSMDDSSSLPSPRKQPPPKPKRDPNTRLSASYEAVSACLSAAREAANEALARP
. : :.. ::. . . .. ... . : : . . . :
CCDS42 EKNGH-------SQAQSSPKGCDIFAGHANKHSVSGTDLLSSRICHPAPDQQGLSLWGAP
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pF1KSD -RPHSDDYSTMKKIPPRK----PKRSPNTKLSGSYEEISGSRPGDARPAGAPGAAARVLT
.: :.. ..:. ::. :: . . . :....:.
CCDS42 QKPGSENGLAQKHRTPRRRCQQPKMLSSPEDTMYYNQLNGTLEYQGSKRKPRKLGQIKVL
1250 1260 1270 1280 1290 1300
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CCDS42 DGEDEYYKSLSPVDCIPEENNSAHPSFFSSSSKGDSFAQH
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: .. ... .: .: .. ..:.: : .: : . . :.:: .:
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::::...:. :::..::.::. . .:. : ::.: :.:: ..: : :. :
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CCDS71 ILFANFIKRYYLLC--YKSSEEPRMSPDTCATILEKAGLDNWALGKTKVFLKYYHVEQLN
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. . :.: : .:.:: :: ::. :: : ...
CCDS71 LMRKEAIDKLILIQACVRAFLCSRRYQKIQEKRKESAIIIQSAARGHLVRKQRKEIVDMK
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:..... . ... : : ...: ..: . :.:. ..:: .: .. :
CCDS71 NTAVTTIQTSDQEFDYKKNFENTRESFVKKQAENAISANERF---ISAPNNKGSVSVVKT
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... : . .:. : .. :..:. . . :::: . ::. .:: .....:
CCDS71 STFKPEEETTNAVESNNRVYQTPKKMNNVYEEEVKQEFYLVGPEV-SPKQKSVKDLEENS
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pF1KSD SLPSPRKQPPP-KPKRDPNTRLSASYEAVSACLSAAREAANEALARPRPH-SDDYSTMKK
.: . .:. . . :. :. .: : :.: .: . : : ... ...::
CCDS71 NLRKVEKEEAMIQSYYQRYTEERNCEESKAAYLE--RKAISERPSYPVPWLAENETSFKK
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. : .:: . .. .: . : . : . . .:. . . . :..
CCDS71 TLEPTLSQRSIYQNANSMEKEKKTSVVTQRAPICSQEEGRGRLRHETVKERQVEPVTQAQ
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CCDS71 EEEDKAAVFIQSKYRGYKRRQQLRKDKMSSFKHQRIVTTPTEVARNTHNLYSYPTKHEEI
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CCDS46 IARENDRLRNETNLAYLKEKNEKRRRQEEAIKRIGGEVGRGHEGSYVGKHFRMGFMTMPA
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CCDS46 PQDRLPHPCSSGFSVRSQSLHSVGGTDDDSSCGS-RRQPPPKPKRDPSTKLSTSSETVSS
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CCDS46 TAASKSGKTPERTEASAKPRPHSDEYS--KKIPPPKPKRNPNTQLSTSFDETYIKKHGPR
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CCDS46 RTSLPRDSSLSQM-----------GSPAGDPEEEEPVYIEMVGNILRDFRKEDDDQSEAV
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CCDS46 NLLSHRPPLLVFPPAPVHCSPNSDESPLTPLEVTKLPVLE-NVSYMKQPAGASPSTLPSH
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CCDS46 V---PGHAKLEKEQAAAL--GPASATPALSSSPPPPSTLYRTQSPHGYPKSH---STSPS
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CCDS46 PVSMGRSLTPLSLKR--PPPYDAVHSGSLSRSSPSVPHSTPRPVSQDGAKMVNAAVNTYG
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CCDS46 AAPGGSRSRTPTSPLEELTSLFSSGRSLLRKSSSGRRSKEPAEKSTEELKVRSH----ST
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: . .... ..:: . :
CCDS46 EPLPKLDNKERGHHGASSSREPVKAQEWDGTPGTPVVTSRLGRCSVSPTLLAGNHSSEPK
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CCDS76 MAEQESLEFGKADFVLMDTVSMPEFMANLRLRFEKGRIYTFI
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CCDS76 SRFGKYMDINF-DFKGDPIGGHINNYLLEKSRVIVQQPGERSFHSFYQLLQGGSEQMLRS
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CCDS76 LHLGNLKFVV--DGDTPLIENGKVVSIIAELLSTKTDMVEKALLYRTVATGRDIIDKQHT
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CCDS76 EQEASYGRDAFAKAIYERLFCWIVTRINDIIEVKNYDTTIHGKNTVIGVLDIYGFEIFDN
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CCDS76 NSFEQFCINYCNEKLQQLFIQLVLKQEQEEYQREGIPWKHIDYFNNQI-IVDLVEQQHKG
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CCDS76 IIAILDDACMNVGKVTDEMFLEALNSKL---GKHAHFSSRKLCASDKIL-EFDRDFRIRH
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CCDS76 YAGDVVYSVIGFIDKNKDTLFQDFKRLMYNSSNPVLKNM--------------WP-----
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CCDS76 ------------------EGK--LSITEVTKR--------------PLTAATLFKNSMIA
550 560 570
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CCDS76 LVDNLASKEPYYVRCIKPNDKKSPQIFDDERCRHQVEYLGLLENVRVRRAGFAFRQTYEK
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pF1KSD FLSRYKPLADTFLREKKEQSAAERCRLVLQQCKLQG-WQMGVRKVFLKYWHAD-QLNDLC
:: ::: ... .. : : . ....: .: .: :.:.. .. :..:
CCDS76 FLHRYKMISEFTWPNHDLPSDKEAVKKLIERCGFQDDVAYGKTKIFIRTPRTLFTLEELR
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pF1KSD LQ-LQRKIITCQKVIRGFLARQHLLQRISIRQQEVTSINSFLQNTEDMGLKTYDALVIQN
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CCDS76 AQMLIRIVLFLQKVWRGTLARMRYKRTKAALTIIRYYRRYKVKSYIHEVARRFHGVKTMR
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CCDS32 MAEQESLEFGKADFVLMDTVSMPEFMANLRLRFEKGRIYTFI
10 20 30 40
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pF1KSD GDILLLVNPYKELPIYSSMVSQLYFSSSGKLCSSLPPHLFSCVERAFHQLFREQRPQCFI
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CCDS32 GEVVVSVNPYKLLNIYGRDTIEQY---KGRELYERPPHLFAIADAAYKAMKRRSKDTCIV
50 60 70 80 90
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pF1KSD LSGERGSGKSEASKQIIRHLTCRAGASRATLDSRFKHVV----CILEAFGHAKTTLNDLS
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CCDS32 ISGESGAGKTEASKYIMQYIAAITNPSQRAEVERVKNMLLKSNCVLEAFGNAKTNRNDNS
100 110 120 130 140 150
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pF1KSD SCFIKYFELQFCERKQQLTGARIYTYLLEKSRLVSQPLGQSNFLIFYLLMDGLSAEEKYG
: : ::....: . : . :..: .:::::::.. : :. .: :: :..: : . .
CCDS32 SRFGKYMDINF-DFKGDPIGGHINNYLLEKSRVIVQQPGERSFHSFYQLLQGGSEQMLRS
160 170 180 190 200 210
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pF1KSD LHLN-NLCAHRYLNQTIQDDASTGERSLNREKLAVLKRALNVVGFSSLEVENLFVILAAI
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CCDS32 LHLQKSLSSYNYIHVGAQLKSSINDAA----EFRVVADAMKVIGFKPEEIQTVYKILAAI
220 230 240 250 260 270
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pF1KSD LHLGDIRFTALNEGNSAFVSDLQLLEQVAGMLQVSTDELASALTTDIQYFKGDMIIRRHT
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CCDS32 LHLGNLKFVV--DGDTPLIENGKVVSIIAELLSTKTDMVEKALLYRTVATGRDIIDKQHT
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pF1KSD IQIAEFFRDLLAKSLYSRLFSFLVNTMNSCLHSQDEQKSMQTLD--IGILDIFGFEEFQK
: : . :: .::..: ::: ..:. .:. .. .. . ... . ::.:::.::: :..
CCDS32 EQEASYGRDAFAKAIYERLFCWIVTRINDIIEVKNYDTTIHGKNTVIGVLDIYGFEIFDN
340 350 360 370 380 390
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....::. . . .: .. : . :.: : . .: .: : .. : . : : :
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.. .: . :....::.::..: :. ::. :..:.:.:: :.. : :. : ..
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.. .:. : : : . . .:: ..: ::. . .:. . . .: . : ::
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CCDS13 IYTYSGLFCVVINPYKNLPIYSEEIVEMY---KGKKRHEMPPHIYAITDTAYRSMMQDRE
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.....:.::.: : . ..: . : ..:. .: .. :: . :: :. . :.
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CCDS13 VQKAQTKEQADFAIEALAKATYERMFRWLVLRINKAL---DKTKRQGASFIGILDIAGFE
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CCDS13 -----------VDRIIGLDQVAGMSETALP----------GAFKTR--KGMFRTVGQLYK
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]