Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA0854
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0854, 837 aa
1>>>pF1KSDA0854 837 - 837 aa - 837 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.8814+/-0.000975; mu= 11.7255+/- 0.059
mean_var=205.0377+/-41.974, 0's: 0 Z-trim(111.0): 12 B-trim: 0 in 0/55
Lambda= 0.089569
statistics sampled from 12000 (12007) to 12000 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.703), E-opt: 0.2 (0.369), width: 16
Scan time: 4.310
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS6336.1 ZHX2 gene_id:22882|Hs108|chr8 ( 837) 5541 729.3 6.4e-210
CCDS6342.1 ZHX1 gene_id:11244|Hs108|chr8 ( 873) 600 90.9 1.1e-17
CCDS13315.1 ZHX3 gene_id:23051|Hs108|chr20 ( 956) 521 80.7 1.3e-14
>>CCDS6336.1 ZHX2 gene_id:22882|Hs108|chr8 (837 aa)
initn: 5541 init1: 5541 opt: 5541 Z-score: 3882.2 bits: 729.3 E(32554): 6.4e-210
Smith-Waterman score: 5541; 100.0% identity (100.0% similar) in 837 aa overlap (1-837:1-837)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MASKRKSTTPCMVRTSQVVEQDVPEEVDRAKEKGIGTPQPDVAKDSWAAELENSSKENEV
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CCDS63 MASKRKSTTPCMVRTSQVVEQDVPEEVDRAKEKGIGTPQPDVAKDSWAAELENSSKENEV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD IEVKSMGESQSKKLQGGYECKYCPYSTQNLNEFTEHVDMQHPNVILNPLYVCAECNFTTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 IEVKSMGESQSKKLQGGYECKYCPYSTQNLNEFTEHVDMQHPNVILNPLYVCAECNFTTK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD KYDSLSDHNSKFHPGEANFKLKLIKRNNQTVLEQSIETTNHVVSITTSGPGTGDSDSGIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 KYDSLSDHNSKFHPGEANFKLKLIKRNNQTVLEQSIETTNHVVSITTSGPGTGDSDSGIS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD VSKTPIMKPGKPKADAKKVPKKPEEITPENHVEGTARLVTDTAEILSRLGGVELLQDTLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 VSKTPIMKPGKPKADAKKVPKKPEEITPENHVEGTARLVTDTAEILSRLGGVELLQDTLG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD HVMPSVQLPPNINLVPKVPVPLNTTKYNSALDTNATMINSFNKFPYPTQAELSWLTAASK
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CCDS63 HVMPSVQLPPNINLVPKVPVPLNTTKYNSALDTNATMINSFNKFPYPTQAELSWLTAASK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD HPEEHIRIWFATQRLKHGISWSPEEVEEARKKMFNGTIQSVPPTITVLPAQLAPTKVTQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 HPEEHIRIWFATQRLKHGISWSPEEVEEARKKMFNGTIQSVPPTITVLPAQLAPTKVTQP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD ILQTALPCQILGQTSLVLTQVTSGSTTVSCSPITLAVAGVTNHGQKRPLVTPQAAPEPKR
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CCDS63 ILQTALPCQILGQTSLVLTQVTSGSTTVSCSPITLAVAGVTNHGQKRPLVTPQAAPEPKR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD PHIAQVPEPPPKVANPPLTPASDRKKTKEQIAHLKASFLQSQFPDDAEVYRLIEVTGLAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 PHIAQVPEPPPKVANPPLTPASDRKKTKEQIAHLKASFLQSQFPDDAEVYRLIEVTGLAR
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD SEIKKWFSDHRYRCQRGIVHITSESLAKDQLAIAASRHGRTYHAYPDFAPQKFKEKTQGQ
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CCDS63 SEIKKWFSDHRYRCQRGIVHITSESLAKDQLAIAASRHGRTYHAYPDFAPQKFKEKTQGQ
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD VKILEDSFLKSSFPTQAELDRLRVETKLSRREIDSWFSERRKLRDSMEQAVLDSMGSGKK
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CCDS63 VKILEDSFLKSSFPTQAELDRLRVETKLSRREIDSWFSERRKLRDSMEQAVLDSMGSGKK
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD GQDVGAPNGALSRLDQLSGAQLTSSLPSPSPAIAKSQEQVHLLRSTFARTQWPTPQEYDQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 GQDVGAPNGALSRLDQLSGAQLTSSLPSPSPAIAKSQEQVHLLRSTFARTQWPTPQEYDQ
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD LAAKTGLVRTEIVRWFKENRCLLKTGTVKWMEQYQHQPMADDHGYDAVARKATKPMAESP
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CCDS63 LAAKTGLVRTEIVRWFKENRCLLKTGTVKWMEQYQHQPMADDHGYDAVARKATKPMAESP
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD KNGGDVVPQYYKDPKKLCEEDLEKLVTRVKVGSEPAKDCLPAKPSEATSDRSEGSSRDGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 KNGGDVVPQYYKDPKKLCEEDLEKLVTRVKVGSEPAKDCLPAKPSEATSDRSEGSSRDGQ
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830
pF1KSD GSDENEESSVVDYVEVTVGEEDAISDRSDSWSQAAAEGVSELAESDSDCVPAEAGQA
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CCDS63 GSDENEESSVVDYVEVTVGEEDAISDRSDSWSQAAAEGVSELAESDSDCVPAEAGQA
790 800 810 820 830
>>CCDS6342.1 ZHX1 gene_id:11244|Hs108|chr8 (873 aa)
initn: 1730 init1: 464 opt: 600 Z-score: 431.3 bits: 90.9 E(32554): 1.1e-17
Smith-Waterman score: 1887; 39.8% identity (66.5% similar) in 890 aa overlap (1-811:1-858)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MASKRKSTTPCMVRTSQVVEQDVPEEVDRAKEKGIGTPQPDVAKDSWAAELENSSKENEV
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CCDS63 MASRRKSTTPCMVLAS---EQDPDLELISDLDEG-----PPVLTPVENTRAESISSDEEV
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KSD IEVKSMGESQSKKLQGGYECKYCPYSTQNLNEFTEHVDMQHPNVILNPLYVCAECNFTTK
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CCDS63 HESVDSDNQQNKKVEGGYECKYCTFQTPDLNMFTFHVDSEHPNVVLNSSYVCVECNFLTK
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KSD KYDSLSDHNSKFHPGEANFKLKLIKRNNQTVLEQSIETTNHVVSITT-----SGPGTGDS
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CCDS63 RYDALSEHNLKYHPGEENFKLTMVKRNNQTIFEQTINDLTFDGSFVKEENAEQAESTEVS
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220
pF1KSD DSGISVSKTPIMKPGKPKADAKK----------VPKKPE-EITP--ENHVEGTARLVTDT
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CCDS63 SSGISISKTPIMKMMKNKVENKRIAVHHNSVEDVPEEKENEIKPDREEIVENPSSSASES
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270
pF1KSD ---AEILSRLGGVEL--------LQDTLGHVMPSVQLPPNINLVPKVPVPLNTTK-YNSA
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CCDS63 NTSTSIVNRIHPSTASTVVTPAAVLPGLAQVITAVSAQQNSNLIPKVLIPVNSIPTYNAA
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KSD LDTNATMINSFNKFPYPTQAELSWLTAASKHPEEHIRIWFATQRLKHGISWSPEEVEEAR
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CCDS63 LDNNPLLLNTYNKFPYPTMSEITVLSAQAKYTEEQIKIWFSAQRLKHGVSWTPEEVEEAR
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380
pF1KSD KKMFNGTIQSVPPTITVLPAQLAPTKVTQP-ILQTALPCQILGQTSLVLTQVTSGSTTVS
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CCDS63 RKQFNGTVHTVPQTITVIPTHISTGSNGLPSILQT---CQIVGQPGLVLTQVAGTNTLPV
360 370 380 390 400
390 400 410 420 430 440
pF1KSD CSPITLAVAGVTNHGQKRPLVTPQAAPEPK-RPHIAQVPEPPP-KVANPPLTPAS---DR
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CCDS63 TAPIALTVAGVPSQNNIQKSQVPAAQPTAETKPATAAVPTSQSVKHETALVNPDSFGIRA
410 420 430 440 450 460
450 460 470 480 490
pF1KSD KKTKEQIAHLKASFLQSQFPDDAEVYRLIEVTGLARSEIKKWFSDHRYRCQRG-----IV
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CCDS63 KKTKEQLAELKVSYLKNQFPHDSEIIRLMKITGLTKGEIKKWFSDTRYN-QRNSKSNQCL
470 480 490 500 510 520
500 510 520 530 540
pF1KSD HITSESL------AKDQLA----IAASRHGRTYHAYPDFAPQKFKEKTQGQVKILEDSFL
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CCDS63 HLNNDSSTTIIIDSSDETTESPTVGTAQPKQSWNPFPDFTPQKFKEKTAEQLRVLQASFL
530 540 550 560 570 580
550 560 570 580 590 600
pF1KSD KSSFPTQAELDRLRVETKLSRREIDSWFSERRKLRDSMEQAV-LDSMGSGKKGQDVGAPN
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CCDS63 NSSVLTDEELNRLRAQTKLTRREIDAWFTEKKKSKALKEEKMEIDESNAGSSKEEAGETS
590 600 610 620 630 640
610 620 630 640 650 660
pF1KSD GALSRLDQLSGAQLTSSLPSPSPAIAKSQEQVHLLRSTFARTQWPTPQEYDQLAAKTGLV
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CCDS63 PA----DE-SGAPKSGST---GKICKKTPEQLHMLKSAFVRTQWPSPEEYDKLAKESGLA
650 660 670 680 690 700
670 680 690 700 710 720
pF1KSD RTEIVRWFKENRCLLKTGTVKWMEQYQHQPMADDHGYDAVARKAT-KPMAES---P----
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CCDS63 RTDIVSWFGDTRYAWKNGNLKWYYYYQSANSSSMNGLSSLRKRGRGRPKGRGRGRPRGRP
710 720 730 740 750 760
730 740 750 760
pF1KSD ------------------KNGGDVVPQYYKDPKKLCEEDLEKLVTRVKVGSEPAKDCLPA
:.: .. .:: : : :.::..::.. ..: : ..
CCDS63 RGSKRINNWDRGPSLIKFKTGTAILKDYYLKHKFLNEQDLDELVNKSHMGYEQVR-----
770 780 790 800 810
770 780 790 800 810 820
pF1KSD KPSEATSDRSEGSSRDGQGSDENEESS-VVDYVEVTVGEEDAISDRSDSWSQAAAEGVSE
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CCDS63 ---EWFAERQRRSELGIELFEENEEEDEVIDDQE----EDEEETDDSDTWEPPRHVKRKL
820 830 840 850 860
830
pF1KSD LAESDSDCVPAEAGQA
CCDS63 SKSDD
870
>>CCDS13315.1 ZHX3 gene_id:23051|Hs108|chr20 (956 aa)
initn: 1261 init1: 377 opt: 521 Z-score: 375.7 bits: 80.7 E(32554): 1.3e-14
Smith-Waterman score: 1384; 33.1% identity (59.7% similar) in 913 aa overlap (11-784:11-908)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MASKRKSTTPCMVRTSQVVEQDVPEEVDRAKEKGIGTPQPDVAKDSWAAELENSSKENEV
::. .. :: ::. :.. :. : :: :. .. :: : ... . .
CCDS13 MASKRKSTTPCMIPVKTVVLQDASMEAQPAETLPEG-PQQDLPPEASAASSEAAQNPSST
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KSD IEVKSMGESQSKKLQGG-YECKYCPYSTQNLNEFTEHVDMQHPNVILNPLYVCAECNFTT
. ....... . :.: : :::: . ......:. :.. .: . .: .::. :.: .
CCDS13 -DGSTLANGHRSTLDGYLYSCKYCDFRSHDMTQFVGHMNSEHTDFNKDPTFVCSGCSFLA
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KSD KKYDSLSDHNSKFHPGEANFKLKLIKRNNQTVLEQSIETTNHVVSITTSGPGTG-DSDSG
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CCDS13 KTPEGLSLHNATCHSGEASFVWNVAKPDNHVVVEQSIPESTSTPDLAGEPSAEGADGQAE
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220
pF1KSD ISVSKTPIMKPGKPKADAKK-------VPKKPE-EITP-----ENHV-EGTARLVTDTAE
: ..:::::: : ::.::: ::..: : : : .: :: ... ..
CCDS13 IIITKTPIMKIMKGKAEAKKIHTLKENVPSQPVGEALPKLSTGEMEVREGDHSFINGAVP
180 190 200 210 220 230
230 240 250
pF1KSD ILSR---------------LGGVELL-----------QDTLGHVMPSVQLP-PNINLVPK
. . .: : .: :. :.. :. : :. . .::
CCDS13 VSQASASSAKNPHAANGPLIGTVPVLPAGIAQFLSLQQQPPVHAQHHVHQPLPTAKALPK
240 250 260 270 280 290
260 270 280 290 300 310
pF1KSD VPVPLNTTK-YNSALDTNATMINSFNKFPYPTQAELSWLTAASKHPEEHIRIWFATQRLK
: .::.. ::.:.:.:. . :::.::::::.::: .::...:.:::...:::..::::
CCDS13 VMIPLSSIPTYNAAMDSNSFLKNSFHKFPYPTKAELCYLTVVTKYPEEQLKIWFTAQRLK
300 310 320 330 340 350
320 330 340 350 360 370
pF1KSD HGISWSPEEVEEARKKMFNGTIQSVP-PTITVLPAQL-APTKVTQPILQTALPCQILGQT
.::::::::.:.::::::: .::::: :::::: . : : . .: ..:.::: ...::
CCDS13 QGISWSPEEIEDARKKMFNTVIQSVPQPTITVLNTPLVASAGNVQHLIQAALPGHVVGQP
360 370 380 390 400 410
380 390 400 410 420
pF1KSD -----SLVLTQ-VTSGSTTVSCSPITLAVAGVTNHGQKRPL--VTPQAAPEPKRPHIAQ-
.:..:: . ... .. ::. :.:..: .. :. : ... : . ::
CCDS13 EGTGGGLLVTQPLMANGLQATSSPLPLTVTSVPKQPGVAPINTVCSNTTSAVKVVNAAQS
420 430 440 450 460 470
430 440 450 460 470 480
pF1KSD VPEPPPKVANPPLTPAS--DRKKTKEQIAHLKASFLQSQFPDDAEVYRLIEVTGLARSEI
. :.... . :: ::..::.. ::.:: ..::: ..:: .: .::::. :.
CCDS13 LLTACPSITSQAFLDASIYKNKKSHEQLSALKGSFCRNQFPGQSEVEHLTKVTGLSTREV
480 490 500 510 520 530
490 500 510
pF1KSD KKWFSDHRYRCQ-----RGIVHITSESLAKDQ-----------------------LAIAA
.:::::.::.:. :... :. :. ::
CCDS13 RKWFSDRRYHCRNLKGSRAMIPGDHSSIIIDSVPEVSFSPSSKVPEVTCIPTTATLATHP
540 550 560 570 580 590
520 530 540 550 560 570
pF1KSD SRHGRTYHAYPDFAPQKFKEKTQGQVKILEDSFLKSSFPTQAELDRLRVETKLSRREIDS
: . ...: :::.: :.::.. :.. ::.:: .. .: . :::::: :::..::::::
CCDS13 SAKRQSWHQTPDFTPTKYKERAPEQLRALESSFAQNPLPLDEELDRLRSETKMTRREIDS
600 610 620 630 640 650
580 590 600 610
pF1KSD WFSERRKLRDSME-------------QAVLDSMGSGKKGQD--VGAPNGALS--------
::::::: .. : .:. : : ... :.. ::.:
CCDS13 WFSERRKKVNAEETKKAEENASQEEEEAAEDEGGEEDLASELRVSGENGSLEMPSSHILA
660 670 680 690 700 710
620 630 640
pF1KSD --------------RLDQLSGAQLTSSLPSPSP----------------AIAKSQEQVHL
:. . .: . .: . .: . :. .: ::
CCDS13 ERKVSPIKINLKNLRVTEANGRNEIPGLGACDPEDDESNKLAEQLPGKVSCKKTAQQRHL
720 730 740 750 760 770
650 660 670 680 690 700
pF1KSD LRSTFARTQWPTPQEYDQLAAKTGLVRTEIVRWFKENRCLLKTGTVKWMEQYQHQPMADD
::. :..::::. :.::.. :.::: : :.:::: ..: ::.: .::.:.:.. .
CCDS13 LRQLFVQTQWPSNQDYDSIMAQTGLPRPEVVRWFGDSRYALKNGQLKWYEDYKRGNFPP-
780 790 800 810 820 830
710 720 730 740 750 760
pF1KSD HGYDAVARKATKPMAESPKNGGDVVPQYYKDPKKLCEEDLEKLVTRVKVGSEPAKDCLPA
: ..: : : ... .:: : : ::::..: .....:. .:. .
CCDS13 -GLLVIA----------PGNR-ELLQDYYMTHKMLYEEDLQNLCDKTQMSSQQVKQWFAE
840 850 860 870 880
770 780 790 800 810 820
pF1KSD KPSEATSDRSEGSSRD-GQGSDENEESSVVDYVEVTVGEEDAISDRSDSWSQAAAEGVSE
: .: : .. .:.: : :. :
CCDS13 KMGEETRAVADTGSEDQGPGTGELTAVHKGMGDTYSEVSENSESWEPRVPEASSEPFDTS
890 900 910 920 930 940
837 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 03:46:02 2016 done: Thu Nov 3 03:46:02 2016
Total Scan time: 4.310 Total Display time: 0.100
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]