Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA0833
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0833, 1673 aa
1>>>pF1KSDA0833 1673 - 1673 aa - 1673 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.8268+/-0.00113; mu= 13.6097+/- 0.069
mean_var=155.5849+/-30.494, 0's: 0 Z-trim(107.9): 31 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.102823
statistics sampled from 9840 (9857) to 9840 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.647), E-opt: 0.2 (0.303), width: 16
Scan time: 5.540
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS30576.1 CAMTA1 gene_id:23261|Hs108|chr1 (1673) 11153 1667.8 0
CCDS54073.1 CAMTA2 gene_id:23125|Hs108|chr17 (1197) 1485 233.5 3.3e-60
CCDS11063.1 CAMTA2 gene_id:23125|Hs108|chr17 (1202) 1485 233.5 3.3e-60
CCDS54072.1 CAMTA2 gene_id:23125|Hs108|chr17 (1241) 1485 233.5 3.4e-60
CCDS54071.1 CAMTA2 gene_id:23125|Hs108|chr17 (1201) 696 116.5 5.6e-25
CCDS55575.1 CAMTA1 gene_id:23261|Hs108|chr1 ( 101) 564 96.2 6e-20
CCDS55574.1 CAMTA1 gene_id:23261|Hs108|chr1 ( 80) 556 95.0 1.1e-19
>>CCDS30576.1 CAMTA1 gene_id:23261|Hs108|chr1 (1673 aa)
initn: 11153 init1: 11153 opt: 11153 Z-score: 8943.3 bits: 1667.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 11153; 100.0% identity (100.0% similar) in 1673 aa overlap (1-1673:1-1673)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MWRAEGKWLPKTSRKSVSQSVFCGTSTYCVLNTVPPIEDDHGNSNSSHVKIFLPKKLLEC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 MWRAEGKWLPKTSRKSVSQSVFCGTSTYCVLNTVPPIEDDHGNSNSSHVKIFLPKKLLEC
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD LPKCSSLPKERHRWNTNEEIAAYLITFEKHEEWLTTSPKTRPQNGSMILYNRKKVKYRKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 LPKCSSLPKERHRWNTNEEIAAYLITFEKHEEWLTTSPKTRPQNGSMILYNRKKVKYRKD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD GYCWKKRKDGKTTREDHMKLKVQGVECLYGCYVHSSIIPTFHRRCYWLLQNPDIVLVHYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 GYCWKKRKDGKTTREDHMKLKVQGVECLYGCYVHSSIIPTFHRRCYWLLQNPDIVLVHYL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD NVPAIEDCGKPCGPILCSINTDKKEWAKWTKEELIGQLKPMFHGIKWTCSNGNSSSGFSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 NVPAIEDCGKPCGPILCSINTDKKEWAKWTKEELIGQLKPMFHGIKWTCSNGNSSSGFSV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD EQLVQQILDSHQTKPQPRTHNCLCTGSLGAGGSVHHKCNSAKHRIISPKVEPRTGGYGSH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 EQLVQQILDSHQTKPQPRTHNCLCTGSLGAGGSVHHKCNSAKHRIISPKVEPRTGGYGSH
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD SEVQHNDVSEGKHEHSHSKGSSREKRNGKVAKPVLLHQSSTEVSSTNQVEVPDTTQSSPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 SEVQHNDVSEGKHEHSHSKGSSREKRNGKVAKPVLLHQSSTEVSSTNQVEVPDTTQSSPV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD SISSGLNSDPDMVDSPVVTGVSGMAVASVMGSLSQSATVFMSEVTNEAVYTMSPTAGPNH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 SISSGLNSDPDMVDSPVVTGVSGMAVASVMGSLSQSATVFMSEVTNEAVYTMSPTAGPNH
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD HLLSPDASQGLVLAVSSDGHKFAFPTTGSSESLSMLPTNVSEELVLSTTLDGGRKIPETT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 HLLSPDASQGLVLAVSSDGHKFAFPTTGSSESLSMLPTNVSEELVLSTTLDGGRKIPETT
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD MNFDPDCFLNNPKQGQTYGGGGLKAEMVSSNIRHSPPGERSFSFTTVLTKEIKTEDTSFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 MNFDPDCFLNNPKQGQTYGGGGLKAEMVSSNIRHSPPGERSFSFTTVLTKEIKTEDTSFE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD QQMAKEAYSSSAAAVAASSLTLTAGSSLLPSGGGLSPSTTLEQMDFSAIDSNKDYTSSFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 QQMAKEAYSSSAAAVAASSLTLTAGSSLLPSGGGLSPSTTLEQMDFSAIDSNKDYTSSFS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD QTGHSPHIHQTPSPSFFLQDASKPLPVEQNTHSSLSDSGGTFVMPTVKTEASSQTSSCSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 QTGHSPHIHQTPSPSFFLQDASKPLPVEQNTHSSLSDSGGTFVMPTVKTEASSQTSSCSG
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD HVETRIESTSSLHLMQFQANFQAMTAEGEVTMETSQAAEGSEVLLKSGELQACSSEHYLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 HVETRIESTSSLHLMQFQANFQAMTAEGEVTMETSQAAEGSEVLLKSGELQACSSEHYLQ
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD PETNGVIRSAGGVPILPGNVVQGLYPVAQPSLGNASNMELSLDHFDISFSNQFSDLINDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 PETNGVIRSAGGVPILPGNVVQGLYPVAQPSLGNASNMELSLDHFDISFSNQFSDLINDF
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD ISVEGGSSTIYGHQLVSGDSTALSQSEDGARAPFTQAEMCLPCCSPQQGSLQLSSSEGGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 ISVEGGSSTIYGHQLVSGDSTALSQSEDGARAPFTQAEMCLPCCSPQQGSLQLSSSEGGA
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD STMAYMHVAEVVSAASAQGTLGMLQQSGRVFMVTDYSPEWSYPEGGVKVLITGPWQEASN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 STMAYMHVAEVVSAASAQGTLGMLQQSGRVFMVTDYSPEWSYPEGGVKVLITGPWQEASN
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD NYSCLFDQISVPASLIQPGVLRCYCPAHDTGLVTLQVAFNNQIISNSVVFEYKARALPTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 NYSCLFDQISVPASLIQPGVLRCYCPAHDTGLVTLQVAFNNQIISNSVVFEYKARALPTL
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD PSSQHDWLSLDDNQFRMSILERLEQMERRMAEMTGSQQHKQASGGGSSGGGSGSGNGGSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 PSSQHDWLSLDDNQFRMSILERLEQMERRMAEMTGSQQHKQASGGGSSGGGSGSGNGGSQ
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD AQCASGTGALGSCFESRVVVVCEKMMSRACWAKSKHLIHSKTFRGMTLLHLAAAQGYATL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 AQCASGTGALGSCFESRVVVVCEKMMSRACWAKSKHLIHSKTFRGMTLLHLAAAQGYATL
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD IQTLIKWRTKHADSIDLELEVDPLNVDHFSCTPLMWACALGHLEAAVVLYKWDRRAISIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 IQTLIKWRTKHADSIDLELEVDPLNVDHFSCTPLMWACALGHLEAAVVLYKWDRRAISIP
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD DSLGRLPLGIARSRGHVKLAECLEHLQRDEQAQLGQNPRIHCPASEEPSTESWMAQWHSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 DSLGRLPLGIARSRGHVKLAECLEHLQRDEQAQLGQNPRIHCPASEEPSTESWMAQWHSE
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KSD AISSPEIPKGVTVIASTNPELRRPRSEPSNYYSSESHKDYPAPKKHKLNPEYFQTRQEKL
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CCDS30 AISSPEIPKGVTVIASTNPELRRPRSEPSNYYSSESHKDYPAPKKHKLNPEYFQTRQEKL
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KSD LPTALSLEEPNIRKQSPSSKQSVPETLSPSEGVRDFSRELSPPTPETAAFQASGSQPVGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 LPTALSLEEPNIRKQSPSSKQSVPETLSPSEGVRDFSRELSPPTPETAAFQASGSQPVGK
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KSD WNSKDLYIGVSTVQVTGNPKGTSVGKEAAPSQVRPREPMSVLMMANREVVNTELGSYRDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 WNSKDLYIGVSTVQVTGNPKGTSVGKEAAPSQVRPREPMSVLMMANREVVNTELGSYRDS
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KSD AENEECGQPMDDIQVNMMTLAEHIIEATPDRIKQENFVPMESSGLERTDPATISSTMSWL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 AENEECGQPMDDIQVNMMTLAEHIIEATPDRIKQENFVPMESSGLERTDPATISSTMSWL
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KSD ASYLADADCLPSAAQIRSAYNEPLTPSSNTSLSPVGSPVSEIAFEKPNLPSAADWSEFLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 ASYLADADCLPSAAQIRSAYNEPLTPSSNTSLSPVGSPVSEIAFEKPNLPSAADWSEFLS
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KSD ASTSEKVENEFAQLTLSDHEQRELYEAARLVQTAFRKYKGRPLREQQEVAAAVIQRCYRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 ASTSEKVENEFAQLTLSDHEQRELYEAARLVQTAFRKYKGRPLREQQEVAAAVIQRCYRK
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KSD YKQYALYKKMTQAAILIQSKFRSYYEQKKFQQSRRAAVLIQKYYRSYKKCGKRRQARRTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 YKQYALYKKMTQAAILIQSKFRSYYEQKKFQQSRRAAVLIQKYYRSYKKCGKRRQARRTA
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1630 1640 1650 1660 1670
pF1KSD VIVQQKLRSSLLTKKQDQAARKIMRFLRRCRHSPLVDHRLYKRSERIEKGQGT
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 VIVQQKLRSSLLTKKQDQAARKIMRFLRRCRHSPLVDHRLYKRSERIEKGQGT
1630 1640 1650 1660 1670
>>CCDS54073.1 CAMTA2 gene_id:23125|Hs108|chr17 (1197 aa)
initn: 3617 init1: 1197 opt: 1485 Z-score: 1194.5 bits: 233.5 E(32554): 3.3e-60
Smith-Waterman score: 3336; 42.4% identity (57.9% similar) in 1630 aa overlap (45-1668:14-1188)
20 30 40 50 60 70
pF1KSD KSVSQSVFCGTSTYCVLNTVPPIEDDHGNSNSSHVKIFLPKKLLECLPKCSSLPKERHRW
:: :.:::::::::::::.: :: :: ::
CCDS54 MAAAAVTRGTPGENSHHLKIFLPKKLLECLPRCPLLPPERLRW
10 20 30 40
80 90 100 110 120 130
pF1KSD NTNEEIAAYLITFEKHEEWLTTSPKTRPQNGSMILYNRKKVKYRKDGYCWKKRKDGKTTR
:::::::.::::::::.:::. .:::::::::.::::::::::::::: :::::::::::
CCDS54 NTNEEIASYLITFEKHDEWLSCAPKTRPQNGSIILYNRKKVKYRKDGYLWKKRKDGKTTR
50 60 70 80 90 100
140 150 160 170 180 190
pF1KSD EDHMKLKVQGVECLYGCYVHSSIIPTFHRRCYWLLQNPDIVLVHYLNVPAIEDCGKPCGP
::::::::::.::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::.::::: :.:
CCDS54 EDHMKLKVQGMECLYGCYVHSSIVPTFHRRCYWLLQNPDIVLVHYLNVPALEDCGKGCSP
110 120 130 140 150 160
200 210 220 230 240 250
pF1KSD ILCSINTDKKEWAKWTKEELIGQLKPMFHGIKWTCSNGNSSSGFSVEQLVQQILDSHQTK
:.:::..:..:: ::..:::.::::::::::::.: ::.. ::::.:::::::.: ::
CCDS54 IFCSISSDRREWLKWSREELLGQLKPMFHGIKWSC--GNGTEEFSVEHLVQQILDTHPTK
170 180 190 200 210 220
260 270 280 290 300 310
pF1KSD PQPRTHNCLCTGSLGAGGSVHHKCNSAKHRIISPKVEPRTGGYGSHSEVQHNDVSEGKHE
: :::: :::.:.::.: :. :::.:.::::::::::::. .. .
CCDS54 PAPRTHACLCSGGLGSG-SLTHKCSSTKHRIISPKVEPRA-------------LTLTSIP
230 240 250 260
320 330 340 350 360 370
pF1KSD HSHSKGSSREKRNGKVAKPVLLHQSSTEVSSTNQVEVPDTTQSSPVSISSGLNSDPDMVD
:.: : :. :. ... :....:: :::. ..
CCDS54 HAHPP-----------EPPPLIAPLPPELPKAHT--SPSSSSSSS---SSGFAEPLEIRP
270 280 290 300 310
380 390 400 410 420 430
pF1KSD SPVVTGVSGMAVASVMGSLSQSATVFMSEVTNEAVYTMSPTAGPNHHLLSPDASQGLVLA
:: .: :: ...... .. . ..:: : . : .. ::
CCDS54 SP---------PTSRGGSSRGGTAILLLTGLEQRAGGLTPT---RHLAPQADPRPSMSLA
320 330 340 350
440 450 460 470 480 490
pF1KSD VSSDGHKFAFPTTGSSESLSMLPTNVSEELVLSTTLDGGRKIPETTMNFDPDCFLNNPKQ
: ..:. : : . : :::: :::.:..
CCDS54 V----------VVGTEPSAPPAPPS-----------------P----AFDPDRFLNSPQR
360 370 380
500 510 520 530 540 550
pF1KSD GQTYGGG-GLKAEMVSSNIRHSPPGERSFSFTTVLTKEIKTEDTSFEQQMAKEAYSSSAA
::::::: :.. .. .. :.: ..: ...: : : : .
CCDS54 GQTYGGGQGVSPDFPEAEAAHTP--------CSALEPA-----AALEPQAA--ARGPPPQ
390 400 410 420 430
560 570 580 590 600 610
pF1KSD AVAASSLTLTAGSSLLPSGGGLSPSTTLEQMDFSAIDSNKDYTSSFSQTGHSPHIHQTPS
.:: :: . . : : ::... .. : .: : .:
CCDS54 SVA----------------GGRRGNCFFIQDD----DSGEE----LKGHGAAPPI-PSPP
440 450 460
620 630 640 650 660 670
pF1KSD PSFFLQDASKPLPVEQNTHSSLSDSGGTFVMPTVKTEASSQTSSCSGHVETRIESTSSLH
:: .: :.: :.
CCDS54 PS----PPPSPAPLE----------------PS---------------------------
470 480
680 690 700 710 720 730
pF1KSD LMQFQANFQAMTAEGEVTMETSQAAEGSEVLLKSGELQACSSEHYLQPETNGVIRSAGGV
:....: :.:. ::
CCDS54 ---------------------SRVGRG-EALF-------------------------GG-
490
740 750 760 770 780 790
pF1KSD PILPGNVVQGLYPVAQPSLGNASNMELSLDHFDISFSNQFSDLINDFISVEGGSSTIYGH
::. ::..: :..: .: ::....:: :
CCDS54 ------------PVG------ASELE----PFSLS---SFPDLMGELISDE---------
500 510
800 810 820 830 840 850
pF1KSD QLVSGDSTALSQSEDGARAPFTQAEMCLPCCSPQQGSLQLSSSEGGASTMAYMHVAEVVS
:: .: .:: : ::.
CCDS54 ------------------AP------SIPAPTPQL-SPALST------------------
520 530
860 870 880 890 900 910
pF1KSD AASAQGTLGMLQQSGRVFMVTDYSPEWSYPEGGVKVLITGPWQEASNNYSCLFDQISVPA
.::.::::::::::::::::::: ::...:::.::.:.:::
CCDS54 -------------------ITDFSPEWSYPEGGVKVLITGPWTEAAEHYSCVFDHIAVPA
540 550 560 570
920 930 940 950 960 970
pF1KSD SLIQPGVLRCYCPAHDTGLVTLQVAFNNQIISNSVVFEYKARALPTLPSSQHDWLSLDDN
::.::::::::::::..:::.:::: . .: ::.:::.:: . .:::.: ::::::::
CCDS54 SLVQPGVLRCYCPAHEVGLVSLQVAGREGPLSASVLFEYRARRFLSLPSTQLDWLSLDDN
580 590 600 610 620 630
980 990 1000 1010 1020 1030
pF1KSD QFRMSILERLEQMERRMAEMTGSQQHKQASGGGSSGGGSGSGNGGSQAQCASGTGALGSC
::::::::::::::.::::.... : . . :.: :
CCDS54 QFRMSILERLEQMEKRMAEIAAAGQVPCQGPDAPPVQDEGQGPG----------------
640 650 660 670 680
1040 1050 1060 1070 1080 1090
pF1KSD FESRVVVVCEKMMSRACWAKSKHLIHSKTFRGMTLLHLAAAQGYATLIQTLIKWRTKHAD
::.::::. :.:. :. : ..: :.. ::::.::::::::::: ::.:: .::. ..
CCDS54 FEARVVVLVESMIPRSTWKGPERLAHGSPFRGMSLLHLAAAQGYARLIETLSQWRSVETG
690 700 710 720 730 740
1100 1110 1120 1130 1140 1150
pF1KSD SIDLELEVDPLNVDHFSCTPLMWACALGHLEAAVVLYKWDRRAISIPDSLGRLPLGIARS
:.::: ::::::::::::::::::::::::::::.:..:.:.:.:::::::::::..:.:
CCDS54 SLDLEQEVDPLNVDHFSCTPLMWACALGHLEAAVLLFRWNRQALSIPDSLGRLPLSVAHS
750 760 770 780 790 800
1160 1170 1180 1190 1200 1210
pF1KSD RGHVKLAECLEHLQRDEQAQLGQNPRIHCPASEEPSTESWMAQWHSEAISSPEIPKGVTV
::::.::.:::.::: :.: .. : . : . :::. :..
CCDS54 RGHVRLARCLEELQR-------QEPSVEPPFALSPPS------------SSPDT--GLSS
810 820 830 840
1220 1230 1240 1250 1260 1270
pF1KSD IASTNPELRRPRSEPSNYYSSESHKDYPAPKKHKLNPEYFQTRQEKLLPTALSLEEPNIR
..: . : : : :. . . :::
CCDS54 VSSPSELSDGTFSVTSAYSSAPDGSPPPAPL-----------------------------
850 860 870
1280 1290 1300 1310 1320 1330
pF1KSD KQSPSSKQSVPETLSPSEGVRDFSRELSPPTPETAAFQASGSQPVGKWNSKDLYIGVSTV
:.:.... : ..:.. :: .::. :. : . ..
CCDS54 ---PASEMTM-EDMAPGQ--------LSSGVPEA---------PL-------LLMDYEAT
880 890 900
1340 1350 1360 1370 1380 1390
pF1KSD QVTGNPKGTSVGKEAAPSQVRPREPMSVLMMANREVVNTELGSYRDSAENEECGQPMDDI
: :: . : : : : . :. . :. . : .: :
CCDS54 ----NSKGPLSSLPALP-------PAS------------DDGA---APEDADSPQAVDVI
910 920 930
1400 1410 1420 1430 1440 1450
pF1KSD QVNMMTLAEHIIEATPDRIKQENFVPMESSGL---ERTDPATISSTMSWLASYLADADCL
:.:..::..::::::.:::.:.:: . .: ::: . .: ::::::::: ..: .
CCDS54 PVDMISLAKQIIEATPERIKREDFVGLPEAGASMRERTGAVGLSETMSWLASYLENVDHF
940 950 960 970 980 990
1460 1470 1480 1490 1500
pF1KSD PSAAQIRSAYNEPLTPSSNTSLSPVGSPVSEIAFEKPNL--PSAADWSEFLSASTSEKVE
::. .: ::. ::. : ::: .:.:::::::: :.:
CCDS54 PSS-----------------------TPPSELPFERGRLAVPSAPSWAEFLSASTSGKME
1000 1010 1020 1030
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KSD NEFAQLTLSDHEQRELYEAARLVQTAFRKYKGRPLREQQEVAAAVIQRCYRKYKQYALYK
..:: ::::::::::::::::..:::::::::: :.:::::::::::::::::::.::::
CCDS54 SDFALLTLSDHEQRELYEAARVIQTAFRKYKGRRLKEQQEVAAAVIQRCYRKYKQFALYK
1040 1050 1060 1070 1080 1090
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KSD KMTQAAILIQSKFRSYYEQKKFQQSRRAAVLIQKYYRSYKKCGKRRQARRTAVIVQQKLR
::::::::::::::::::::.::::::::::::..::::.. . .::.. . . .
CCDS54 KMTQAAILIQSKFRSYYEQKRFQQSRRAAVLIQQHYRSYRR--RPGPPHRTSATLPARNK
1100 1110 1120 1130 1140 1150
1630 1640 1650 1660 1670
pF1KSD SSLLTKKQDQAARKIMRFLRRCRHSPLVDHRLYKRSERIEKGQGT
.:.::::::::::::::::::::: : :.....:
CCDS54 GSFLTKKQDQAARKIMRFLRRCRHR----MRELKQNQELEGLPQPGLAT
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:: :.:::::::::::::.: :: :: ::
CCDS11 MNTKDTTEVAENSHHLKIFLPKKLLECLPRCPLLPPERLRW
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:::::::.::::::::.:::. .:::::::::.::::::::::::::: :::::::::::
CCDS11 NTNEEIASYLITFEKHDEWLSCAPKTRPQNGSIILYNRKKVKYRKDGYLWKKRKDGKTTR
50 60 70 80 90 100
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pF1KSD EDHMKLKVQGVECLYGCYVHSSIIPTFHRRCYWLLQNPDIVLVHYLNVPAIEDCGKPCGP
::::::::::.::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::.::::: :.:
CCDS11 EDHMKLKVQGMECLYGCYVHSSIVPTFHRRCYWLLQNPDIVLVHYLNVPALEDCGKGCSP
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pF1KSD ILCSINTDKKEWAKWTKEELIGQLKPMFHGIKWTCSNGNSSSGFSVEQLVQQILDSHQTK
:.:::..:..:: ::..:::.::::::::::::.: ::.. ::::.:::::::.: ::
CCDS11 IFCSISSDRREWLKWSREELLGQLKPMFHGIKWSC--GNGTEEFSVEHLVQQILDTHPTK
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CCDS11 PAPRTHACLCSGGLGSG-SLTHKCSSTKHRIISPKVEPRA-------------LTLTSIP
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:.: : :. :. ... :....:: :::. ..
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:: .: :: ...... .. . ..:: : . : .. ::
CCDS11 SP---------PTSRGGSSRGGTAILLLTGLEQRAGGLTPT---RHLAPQADPRPSMSLA
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pF1KSD VSSDGHKFAFPTTGSSESLSMLPTNVSEELVLSTTLDGGRKIPETTMNFDPDCFLNNPKQ
: ..:. : : . : :::: :::.:..
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::::::: :.. .. .. :.: ..: ...: : : : .
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pF1KSD AVAASSLTLTAGSSLLPSGGGLSPSTTLEQMDFSAIDSNKDYTSSFSQTGHSPHIHQTPS
.:: :: . . : : ::... .. : .: : .:
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:: .: :.: :.
CCDS11 PS----PPPSPAPLE----------------PS---------------------------
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pF1KSD LMQFQANFQAMTAEGEVTMETSQAAEGSEVLLKSGELQACSSEHYLQPETNGVIRSAGGV
:....: :.:. ::
CCDS11 ---------------------SRVGRG-EALF-------------------------GG-
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::. ::..: :..: .: ::....:: :
CCDS11 ------------PVG------ASELE----PFSLS---SFPDLMGELISDE---------
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800 810 820 830 840 850
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:: .: .:: : ::.
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860 870 880 890 900 910
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.::.::::::::::::::::::: ::...:::.::.:.:::
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::.::::::::::::..:::.:::: . .: ::.:::.:: . .:::.: ::::::::
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::::::::::::::.::::.... : . . :.: :
CCDS11 QFRMSILERLEQMEKRMAEIAAAGQVPCQGPDAPPVQDEGQGPG----------------
640 650 660 670
1040 1050 1060 1070 1080 1090
pF1KSD FESRVVVVCEKMMSRACWAKSKHLIHSKTFRGMTLLHLAAAQGYATLIQTLIKWRTKHAD
::.::::. :.:. :. : ..: :.. ::::.::::::::::: ::.:: .::. ..
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pF1KSD SIDLELEVDPLNVDHFSCTPLMWACALGHLEAAVVLYKWDRRAISIPDSLGRLPLGIARS
:.::: ::::::::::::::::::::::::::::.:..:.:.:.:::::::::::..:.:
CCDS11 SLDLEQEVDPLNVDHFSCTPLMWACALGHLEAAVLLFRWNRQALSIPDSLGRLPLSVAHS
740 750 760 770 780 790
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pF1KSD RGHVKLAECLEHLQRDEQAQLGQNPRIHCPASEEPSTESWMAQWHSEAISSPEIPKGVTV
::::.::.:::.::: :.: .. : . : . :::. :..
CCDS11 RGHVRLARCLEELQR-------QEPSVEPPFALSPPS------------SSPDT--GLSS
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1220 1230 1240 1250 1260 1270
pF1KSD IASTNPELRRPRSEPSNYYSSESHKDYPAPKKHKLNPEYFQTRQEKLLPTALSLEEPNIR
..: . : : : :. . . :::
CCDS11 VSSPSELSDGTFSVTSAYSSAPDGSPPPAPL-----------------------------
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:.:.... : ..:.. :: .::. :. : . ..
CCDS11 ---PASEMTM-EDMAPGQ--------LSSGVPEA---------PL-------LLMDYEAT
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1340 1350 1360 1370 1380 1390
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: :: . : : : : . :. . :. . : .: :
CCDS11 ----NSKGPLSSLPALP-------PAS------------DDGA---APEDADSPQAVDVI
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:.:..::..::::::.:::.:.:: . .: ::: . .: ::::::::: ..: .
CCDS11 PVDMISLAKQIIEATPERIKREDFVGLPEAGASMRERTGAVGLSETMSWLASYLENVDHF
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pF1KSD PSAAQIRSAYNEPLTPSSNTSLSPVGSPVSEIAFEKPNL--PSAADWSEFLSASTSEKVE
::. .: ::. ::. : ::: .:.:::::::: :.:
CCDS11 PSS-----------------------TPPSELPFERGRLAVPSAPSWAEFLSASTSGKME
1000 1010 1020 1030
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KSD NEFAQLTLSDHEQRELYEAARLVQTAFRKYKGRPLREQQEVAAAVIQRCYRKYKQ-----
..:: ::::::::::::::::..:::::::::: :.:::::::::::::::::::
CCDS11 SDFALLTLSDHEQRELYEAARVIQTAFRKYKGRRLKEQQEVAAAVIQRCYRKYKQLTWIA
1040 1050 1060 1070 1080 1090
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KSD --YALYKKMTQAAILIQSKFRSYYEQKKFQQSRRAAVLIQKYYRSYKKCGKRRQARRTAV
.::::::::::::::::::::::::.::::::::::::..::::.. . .::..
CCDS11 LKFALYKKMTQAAILIQSKFRSYYEQKRFQQSRRAAVLIQQHYRSYRR--RPGPPHRTSA
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1630 1640 1650 1660 1670
pF1KSD IVQQKLRSSLLTKKQDQAARKIMRFLRRCRHSPLVDHRLYKRSERIEKGQGT
. . ..:.::::::::::::::::::::: : :.....:
CCDS11 TLPARNKGSFLTKKQDQAARKIMRFLRRCRHR----MRELKQNQELEGLPQPGLAT
1160 1170 1180 1190 1200
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CCDS54 SPSPRPLRPGVTLPPGALTMNTKDTTEVAENSHHLKIFLPKKLLECLPRCPLLPPERLRW
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pF1KSD NTNEEIAAYLITFEKHEEWLTTSPKTRPQNGSMILYNRKKVKYRKDGYCWKKRKDGKTTR
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CCDS54 NTNEEIASYLITFEKHDEWLSCAPKTRPQNGSIILYNRKKVKYRKDGYLWKKRKDGKTTR
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pF1KSD EDHMKLKVQGVECLYGCYVHSSIIPTFHRRCYWLLQNPDIVLVHYLNVPAIEDCGKPCGP
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CCDS54 EDHMKLKVQGMECLYGCYVHSSIVPTFHRRCYWLLQNPDIVLVHYLNVPALEDCGKGCSP
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pF1KSD ILCSINTDKKEWAKWTKEELIGQLKPMFHGIKWTCSNGNSSSGFSVEQLVQQILDSHQTK
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CCDS54 IFCSISSDRREWLKWSREELLGQLKPMFHGIKWSCGNGTEE--FSVEHLVQQILDTHPTK
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pF1KSD PQPRTHNCLCTGSLGAGGSVHHKCNSAKHRIISPKVEPRTGGYGSHSEVQHNDVSEGKHE
: :::: :::.:.::.: :. :::.:.::::::::::::. .. .
CCDS54 PAPRTHACLCSGGLGSG-SLTHKCSSTKHRIISPKVEPRA-------------LTLTSIP
250 260 270 280
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pF1KSD HSHSKGSSREKRNGKVAKPVLLHQSSTEVSSTNQVEVPDTTQSSPVSISSGLNSDPDMVD
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CCDS54 HAHPP-----------EPPPLIAPLPPELPKAHT--SPSSSSSSS---SSGFAEPLEIRP
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pF1KSD SPVVTGVSGMAVASVMGSLSQSATVFMSEVTNEAVYTMSPTAGPNHHLLSPDASQGLVLA
:: .. : :: ...... .. . ..:: : . : .. ::
CCDS54 SPPTS--RG-------GSSRGGTAILLLTGLEQRAGGLTPT---RHLAPQADPRPSMSLA
340 350 360 370 380
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pF1KSD VSSDGHKFAFPTTGSSESLSMLPTNVSEELVLSTTLDGGRKIPETTMNFDPDCFLNNPKQ
: ..:. : : . : :::: :::.:..
CCDS54 V----------VVGTEPSAPPAPPS-----------------PA----FDPDRFLNSPQR
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pF1KSD GQTYGGG-GLKAEMVSSNIRHSPPGERSFSFTTVLTKEIKTEDTSFEQQMAKEAYSSSAA
::::::: :.. .. .. :.: ..: ...: : : : .
CCDS54 GQTYGGGQGVSPDFPEAEAAHTP--------CSALEPA-----AALEPQAA--ARGPPPQ
410 420 430 440 450
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pF1KSD AVAASSLTLTAGSSLLPSGGGLSPSTTLEQMDFSAIDSNKDYTSSFSQTGHSPHIHQTPS
.:: :: . . : : ::... .. : .: : .:
CCDS54 SVA----------------GGRRGNCFFIQDD----DSGEE----LKGHGAAPPI-PSPP
460 470 480
620 630 640 650 660 670
pF1KSD PSFFLQDASKPLPVEQNTHSSLSDSGGTFVMPTVKTEASSQTSSCSGHVETRIESTSSLH
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CCDS54 PS----PPPSPAPLE----------------PS-----------------SRV-------
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CCDS54 ------------GRGEALF--------------------------------------GG-
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CCDS54 ------------------AP------SIPAPTPQL-SPALST------------------
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CCDS54 QFRMSILERLEQMEKRMAEIAAAGQVPCQGPDAPPVQDEGQGPG----------------
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CCDS54 RGHVRLARCLEELQR-------QEPSVEPPFALSPPS------------SSPDT--GLSS
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pF1KSD IASTNPELRRPRSEPSNYYSSESHKDYPAPKKHKLNPEYFQTRQEKLLPTALSLEEPNIR
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CCDS54 VSSPSELSDGTFSVTSAYSSAPDGSPPPAPL-----------------------------
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pF1KSD KQSPSSKQSVPETLSPSEGVRDFSRELSPPTPETAAFQASGSQPVGKWNSKDLYIGVSTV
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CCDS54 ---PASEMTM-EDMAPGQ--------LSSGVPEA---------PL-------LLMDYEAT
900 910 920
1340 1350 1360 1370 1380 1390
pF1KSD QVTGNPKGTSVGKEAAPSQVRPREPMSVLMMANREVVNTELGSYRDSAENEECGQPMDDI
: :: . : : : : . :. . :. . : .: :
CCDS54 ----NSKGPLSSLPALP-------PAS------------DDGA---APEDADSPQAVDVI
930 940 950
1400 1410 1420 1430 1440 1450
pF1KSD QVNMMTLAEHIIEATPDRIKQENFVPMESSGL---ERTDPATISSTMSWLASYLADADCL
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CCDS54 PVDMISLAKQIIEATPERIKREDFVGLPEAGASMRERTGAVGLSETMSWLASYLENVDHF
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pF1KSD PSAAQIRSAYNEPLTPSSNTSLSPVGSPVSEIAFEKPNL--PSAADWSEFLSASTSEKVE
::. .: ::. ::. : ::: .:.:::::::: :.:
CCDS54 PSS-----------------------TPPSELPFERGRLAVPSAPSWAEFLSASTSGKME
1020 1030 1040 1050
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pF1KSD NEFAQLTLSDHEQRELYEAARLVQTAFRKYKGRPLREQQEVAAAVIQRCYRKYKQ-----
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CCDS54 SDFALLTLSDHEQRELYEAARVIQTAFRKYKGRRLKEQQEVAAAVIQRCYRKYKQLTWIA
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pF1KSD --YALYKKMTQAAILIQSKFRSYYEQKKFQQSRRAAVLIQKYYRSYKKCGKRRQARRTAV
.::::::::::::::::::::::::.::::::::::::..::::.. . .::..
CCDS54 LKFALYKKMTQAAILIQSKFRSYYEQKRFQQSRRAAVLIQQHYRSYRR--RPGPPHRTSA
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pF1KSD IVQQKLRSSLLTKKQDQAARKIMRFLRRCRHSPLVDHRLYKRSERIEKGQGT
. :..::....
CCDS54 TLPA--RNKLLSHQEAGPGSPEDHEIPAALPTQDEGTEAEPGAGRASPAGTGHMTWPPPF
1180 1190 1200 1210 1220 1230
>>CCDS54071.1 CAMTA2 gene_id:23125|Hs108|chr17 (1201 aa)
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20 30 40 50 60 70
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:: :.:::::::::::::.: :: :: ::
CCDS54 SPSPRPLRPGVTLPPGALTMNTKDTTEVAENSHHLKIFLPKKLLECLPRCPLLPPERLRW
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:::::::.::::::::.:::. .:::::::::.::::::::::::::: :::::::::::
CCDS54 NTNEEIASYLITFEKHDEWLSCAPKTRPQNGSIILYNRKKVKYRKDGYLWKKRKDGKTTR
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140 150 160 170 180 190
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::::::::::.: ::::::::::::::.::::: :.:
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:.:::..:..:: ::..:::.::::::::::::.: ::.. ::::.:::::::.: ::
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: :::: :::.:.::.: :. :::.:.::::::::::::. .. .
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220 230 240 250 260
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:.: : :. :. ... :....:: :::. ..
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:: .: :: ...... .. . ..:: : . : .. ::
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: ..:. : : . : :::: :::.:..
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::::::: :.. .. .. :.: ..: ...: : : : .
CCDS54 GQTYGGGQGVSPDFPEAEAAHTP--------CSALEPA-----AALEPQAA--ARGPPPQ
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.:: :: . . : : ::... .. : .: : .:
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:: .: :.: :.
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:....: :.:. ::
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::. ::..: :..: .: ::....:: :
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pF1KSD QLVSGDSTALSQSEDGARAPFTQAEMCLPCCSPQQGSLQLSSSEGGASTMAYMHVAEVVS
:: .: .:: : ::.
CCDS54 ------------------AP------SIPAPTPQL-SPALST------------------
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.::.::::::::::::::::::: ::...:::.::.:.:::
CCDS54 -------------------ITDFSPEWSYPEGGVKVLITGPWTEAAEHYSCVFDHIAVPA
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::.::::::::::::..:::.:::: . .: ::.:::.:: . .:::.: ::::::::
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::::::::::::::.::::.... : . . :.: :
CCDS54 QFRMSILERLEQMEKRMAEIAAAGQVPCQGPDAPPVQDEGQGPG----------------
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pF1KSD FESRVVVVCEKMMSRACWAKSKHLIHSKTFRGMTLLHLAAAQGYATLIQTLIKWRTKHAD
::.::::. :.:. :. : ..: :.. ::::.::::::::::: ::.:: .::. ..
CCDS54 FEARVVVLVESMIPRSTWKGPERLAHGSPFRGMSLLHLAAAQGYARLIETLSQWRSVETG
680 690 700 710 720 730
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pF1KSD SIDLELEVDPLNVDHFSCTPLMWACALGHLEAAVVLYKWDRRAISIPDSLGRLPLGIARS
:.::: ::::::::::::::::::::::::::::.:..:.:.:.:::::::::::..:.:
CCDS54 SLDLEQEVDPLNVDHFSCTPLMWACALGHLEAAVLLFRWNRQALSIPDSLGRLPLSVAHS
740 750 760 770 780 790
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::::.::.:::.::: :.: .. : . : . :::. :..
CCDS54 RGHVRLARCLEELQR-------QEPSVEPPFALSPPS------------SSPDT--GLSS
800 810 820 830
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..: . : : : :. . . :::
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:.:.... : ..:.. :: .::. :. : . ..
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870 880 890 900
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: :: . : : : : . :. . :. . : .: :
CCDS54 ----NSKGPLSSLPALP-------PAS------------DDGA---APEDADSPQAVDVI
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:.:..::..::::::.:::.:.:: . .: ::: . .: ::::::::: ..: .
CCDS54 PVDMISLAKQIIEATPERIKREDFVGLPEAGASMRERTGAVGLSETMSWLASYLENVDHF
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::. .: ::. ::. : ::: .:.:::::::: :.:
CCDS54 PSS-----------------------TPPSELPFERGRLAVPSAPSWAEFLSASTSGKME
1000 1010 1020 1030
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..:: ::::::::::::::::..:::::::::: :.:::::::::::::::::::
CCDS54 SDFALLTLSDHEQRELYEAARVIQTAFRKYKGRRLKEQQEVAAAVIQRCYRKYKQLTWIA
1040 1050 1060 1070 1080 1090
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pF1KSD --YALYKKMTQAAILIQSKFRSYYEQKKFQQSRRAAVLIQKYYRSYKKCGKRRQARRTAV
.::::::::::::::::::::::::.::::::::::::..::::.. . .::..
CCDS54 LKFALYKKMTQAAILIQSKFRSYYEQKRFQQSRRAAVLIQQHYRSYRR--RPGPPHRTSA
1100 1110 1120 1130 1140
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. . ..:.::::::::::::::::::::: : :.....:
CCDS54 TLPARNKGSFLTKKQDQAARKIMRFLRRCRHR----MRELKQNQELEGLPQPGLAT
1150 1160 1170 1180 1190 1200
>>CCDS55575.1 CAMTA1 gene_id:23261|Hs108|chr1 (101 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KSD MWRAEGKWLPKTSRKSVSQSVFCGTSTYCVLNTVPPIEDDHGNSNSSHVKIFLPKKLLEC
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CCDS55 MWRAEGKWLPKTSRKSVSQSVFCGTSTYCVLNTVPPIEDDHGNSNSSHVKIFLPKKLLEC
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pF1KSD LPKCSSLPKERHRWNTNEEIAAYLITFEKHEEWLTTSPKTRPQNGSMILYNRKKVKYRKD
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CCDS55 LPKCSSLPKERHRWNTNEALTTHLFMGAAKKRDPQSWSHEG
70 80 90 100
>>CCDS55574.1 CAMTA1 gene_id:23261|Hs108|chr1 (80 aa)
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10 20 30 40 50 60
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CCDS55 MWRAEGKWLPKTSRKSVSQSVFCGTSTYCVLNTVPPIEDDHGNSNSSHVKIFLPKKLLEC
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CCDS55 LPKCSSLPKERHRWNTNERS
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