Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA0823
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0823, 567 aa
1>>>pF1KSDA0823 567 - 567 aa - 567 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.8267+/-0.00114; mu= 6.3196+/- 0.067
mean_var=153.2498+/-30.832, 0's: 0 Z-trim(107.4): 194 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.103603
statistics sampled from 9361 (9579) to 9361 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.662), E-opt: 0.2 (0.294), width: 16
Scan time: 3.110
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS13309.1 PPP1R16B gene_id:26051|Hs108|chr20 ( 567) 3776 576.9 2.2e-164
CCDS54462.1 PPP1R16B gene_id:26051|Hs108|chr20 ( 525) 1933 301.4 1.8e-81
CCDS6429.1 PPP1R16A gene_id:84988|Hs108|chr8 ( 528) 1503 237.2 3.9e-62
CCDS53458.1 PPP1R12B gene_id:4660|Hs108|chr1 ( 515) 685 114.9 2.5e-25
CCDS1426.1 PPP1R12B gene_id:4660|Hs108|chr1 ( 982) 685 115.1 4.2e-25
CCDS81416.1 PPP1R12B gene_id:4660|Hs108|chr1 (1043) 685 115.1 4.4e-25
CCDS53459.1 PPP1R12B gene_id:4660|Hs108|chr1 ( 386) 674 113.2 6.1e-25
CCDS58259.1 PPP1R12A gene_id:4659|Hs108|chr12 ( 974) 652 110.1 1.3e-23
CCDS58260.1 PPP1R12A gene_id:4659|Hs108|chr12 ( 995) 652 110.1 1.3e-23
CCDS44947.1 PPP1R12A gene_id:4659|Hs108|chr12 (1030) 652 110.1 1.3e-23
CCDS12916.1 PPP1R12C gene_id:54776|Hs108|chr19 ( 782) 624 105.9 1.9e-22
CCDS73598.1 MYO16 gene_id:23026|Hs108|chr13 (1880) 529 91.9 7.4e-18
CCDS32008.1 MYO16 gene_id:23026|Hs108|chr13 (1858) 528 91.8 8.1e-18
CCDS44948.1 PPP1R12A gene_id:4659|Hs108|chr12 ( 943) 487 85.5 3.3e-16
CCDS7417.1 TNKS2 gene_id:80351|Hs108|chr10 (1166) 372 68.3 5.8e-11
CCDS5974.1 TNKS gene_id:8658|Hs108|chr8 (1327) 373 68.5 5.8e-11
CCDS46769.1 ANKRD28 gene_id:23243|Hs108|chr3 (1053) 366 67.4 1e-10
>>CCDS13309.1 PPP1R16B gene_id:26051|Hs108|chr20 (567 aa)
initn: 3776 init1: 3776 opt: 3776 Z-score: 3064.6 bits: 576.9 E(32554): 2.2e-164
Smith-Waterman score: 3776; 100.0% identity (100.0% similar) in 567 aa overlap (1-567:1-567)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MASHVDLLTELQLLEKVPTLERLRAAQKRRAQQLKKWAQYEQDLQHRKRKHERKRSTGGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MASHVDLLTELQLLEKVPTLERLRAAQKRRAQQLKKWAQYEQDLQHRKRKHERKRSTGGR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD RKKVSFEASVALLEASLRNDAEEVRYFLKNKVSPDLCNEDGLTALHQCCIDNFEEIVKLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 RKKVSFEASVALLEASLRNDAEEVRYFLKNKVSPDLCNEDGLTALHQCCIDNFEEIVKLL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD LSHGANVNAKDNELWTPLHAAATCGHINLVKILVQYGADLLAVNSDGNMPYDLCEDEPTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LSHGANVNAKDNELWTPLHAAATCGHINLVKILVQYGADLLAVNSDGNMPYDLCEDEPTL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD DVIETCMAYQGITQEKINEMRVAPEQQMIADIHCMIAAGQDLDWIDAQGATLLHIAGANG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 DVIETCMAYQGITQEKINEMRVAPEQQMIADIHCMIAAGQDLDWIDAQGATLLHIAGANG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD YLRAAELLLDHGVRVDVKDWDGWEPLHAAAFWGQMQMAELLVSHGASLSARTSMDEMPID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 YLRAAELLLDHGVRVDVKDWDGWEPLHAAAFWGQMQMAELLVSHGASLSARTSMDEMPID
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD LCEEEEFKVLLLELKHKHDVIMKSQLRHKSSLSRRTSSAGSRGKVVRRASLSDRTNLYRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LCEEEEFKVLLLELKHKHDVIMKSQLRHKSSLSRRTSSAGSRGKVVRRASLSDRTNLYRK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD EYEGEAILWQRSAAEDQRTSTYNGDIRETRTDQENKDPNPRLEKPVLLSEFPTKIPRGEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 EYEGEAILWQRSAAEDQRTSTYNGDIRETRTDQENKDPNPRLEKPVLLSEFPTKIPRGEL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD DMPVENGLRAPVSAYQYALANGDVWKVHEVPDYSMAYGNPGVADATPPWSSYKEQSPQTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 DMPVENGLRAPVSAYQYALANGDVWKVHEVPDYSMAYGNPGVADATPPWSSYKEQSPQTL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD LELKRQRAAAKLLSHPFLSTHLGSSMARTGESSSEGKAPLIGGRTSPYSSNGTSVYYTVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LELKRQRAAAKLLSHPFLSTHLGSSMARTGESSSEGKAPLIGGRTSPYSSNGTSVYYTVT
490 500 510 520 530 540
550 560
pF1KSD SGDPPLLKFKAPIEEMEEKVHGCCRIS
:::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SGDPPLLKFKAPIEEMEEKVHGCCRIS
550 560
>>CCDS54462.1 PPP1R16B gene_id:26051|Hs108|chr20 (525 aa)
initn: 1930 init1: 1930 opt: 1933 Z-score: 1576.3 bits: 301.4 E(32554): 1.8e-81
Smith-Waterman score: 3378; 92.6% identity (92.6% similar) in 567 aa overlap (1-567:1-525)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MASHVDLLTELQLLEKVPTLERLRAAQKRRAQQLKKWAQYEQDLQHRKRKHERKRSTGGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MASHVDLLTELQLLEKVPTLERLRAAQKRRAQQLKKWAQYEQDLQHRKRKHERKRSTGGR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD RKKVSFEASVALLEASLRNDAEEVRYFLKNKVSPDLCNEDGLTALHQCCIDNFEEIVKLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 RKKVSFEASVALLEASLRNDAEEVRYFLKNKVSPDLCNEDGLTALHQCCIDNFEEIVKLL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD LSHGANVNAKDNELWTPLHAAATCGHINLVKILVQYGADLLAVNSDGNMPYDLCEDEPTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LSHGANVNAKDNELWTPLHAAATCGHINLVKILVQYGADLLAVNSDGNMPYDLCEDEPTL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD DVIETCMAYQGITQEKINEMRVAPEQQMIADIHCMIAAGQDLDWIDAQGATLLHIAGANG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 DVIETCMAYQGITQEKINEMRVAPEQQMIADIHCMIAAGQDLDWIDAQGATL--------
190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KSD YLRAAELLLDHGVRVDVKDWDGWEPLHAAAFWGQMQMAELLVSHGASLSARTSMDEMPID
::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ----------------------------------MQMAELLVSHGASLSARTSMDEMPID
240 250
310 320 330 340 350 360
pF1KSD LCEEEEFKVLLLELKHKHDVIMKSQLRHKSSLSRRTSSAGSRGKVVRRASLSDRTNLYRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LCEEEEFKVLLLELKHKHDVIMKSQLRHKSSLSRRTSSAGSRGKVVRRASLSDRTNLYRK
260 270 280 290 300 310
370 380 390 400 410 420
pF1KSD EYEGEAILWQRSAAEDQRTSTYNGDIRETRTDQENKDPNPRLEKPVLLSEFPTKIPRGEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 EYEGEAILWQRSAAEDQRTSTYNGDIRETRTDQENKDPNPRLEKPVLLSEFPTKIPRGEL
320 330 340 350 360 370
430 440 450 460 470 480
pF1KSD DMPVENGLRAPVSAYQYALANGDVWKVHEVPDYSMAYGNPGVADATPPWSSYKEQSPQTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 DMPVENGLRAPVSAYQYALANGDVWKVHEVPDYSMAYGNPGVADATPPWSSYKEQSPQTL
380 390 400 410 420 430
490 500 510 520 530 540
pF1KSD LELKRQRAAAKLLSHPFLSTHLGSSMARTGESSSEGKAPLIGGRTSPYSSNGTSVYYTVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LELKRQRAAAKLLSHPFLSTHLGSSMARTGESSSEGKAPLIGGRTSPYSSNGTSVYYTVT
440 450 460 470 480 490
550 560
pF1KSD SGDPPLLKFKAPIEEMEEKVHGCCRIS
:::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SGDPPLLKFKAPIEEMEEKVHGCCRIS
500 510 520
>>CCDS6429.1 PPP1R16A gene_id:84988|Hs108|chr8 (528 aa)
initn: 1799 init1: 1295 opt: 1503 Z-score: 1228.9 bits: 237.2 E(32554): 3.9e-62
Smith-Waterman score: 1603; 48.0% identity (68.5% similar) in 569 aa overlap (1-564:1-525)
10 20 30 40 50
pF1KSD MASHVDLLTELQLLEKVPTLERLRAAQKRRAQQLKKWAQYEQDLQHRKRKHERKR---ST
:: :..::.:. .. .. : :::. ::::::::.: ::: :.. : .: :: : ..
CCDS64 MAEHLELLAEMPMVGRMSTQERLKHAQKRRAQQVKMWAQAEKEAQGKKGPGERPRKEAAS
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KSD GGRRKKVSFEASVALLEASLRNDAEEVRYFLKNKVSPDLCNEDGLTALHQCCIDNFEEIV
: :.: : ::.::::. ::: :::: :: . ::::: ::::::::::::::.:.:.:
CCDS64 QGLLKQVLFPPSVVLLEAAARNDLEEVRQFLGSGVSPDLANEDGLTALHQCCIDDFREMV
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KSD KLLLSHGANVNAKDNELWTPLHAAATCGHINLVKILVQYGADLLAVNSDGNMPYDLCEDE
. :: :::.:: :.: ::::::::::::..::..:. ::.:::::.:::::::::.::
CCDS64 QQLLEAGANINACDSECWTPLHAAATCGHLHLVELLIASGANLLAVNTDGNMPYDLCDDE
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KSD PTLDVIETCMAYQGITQEKINEMRVAPEQQMIADIHCMIAAGQDLDWIDAQGATLLHIAG
::: .:: :: .::::..:. :..:: .:. ::. . :: :: .::::::.:.
CCDS64 QTLDCLETAMADRGITQDSIEAARAVPELRMLDDIRSRLQAGADLHAPLDHGATLLHVAA
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KSD ANGYLRAAELLLDHGVRVDVKDWDGWEPLHAAAFWGQMQMAELLVSHGASLSARTSMDEM
:::. .:: :::.: . ...:: ::::::::::.:::. ..::::.:::.:.:.. :::
CCDS64 ANGFSEAAALLLEHRASLSAKDQDGWEPLHAAAYWGQVPLVELLVAHGADLNAKSLMDET
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KSD PIDLCEEEEFKVLLLELKHKHDVIMKSQLRHKSSLSRRTSSAGSRGKVVRRASLSDRTNL
:.:.: .:: .. :::::::::.....: :..: : :::::::::::::::.::..::.:
CCDS64 PLDVCGDEEVRAKLLELKHKHDALLRAQSRQRSLLRRRTSSAGSRGKVVRRVSLTQRTDL
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KSD YRKEYEGEAILWQRSAAEDQRTSTYNGDIRETRTDQENKDPNPRLEKPVLLSEFPTKIPR
:::.. :::.::. . . : : .: : . : :. ..: .. ..
CCDS64 YRKQHAQEAIVWQQPPPTSPEPPEDNDD---RQTGAELRPPPPEEDNPEVVRPHNGRVGG
370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KSD GELDMPVENGLRAPVSAYQYALANGDVWKVHEVPDYSMAYG-NPGVADATPPWSSYKEQS
. ::.. :. : : :..: .: :.: : . ....
CCDS64 S----PVRH-------LYSKRL------------DRSVSYQLSP--LDSTTPHTLVHDKA
420 430 440 450
480 490 500 510 520 530
pF1KSD PQTLLELKRQRAAAKLLSHPFLSTHLGSSMARTGESSSEGKAP-LIGGRTSPYSSNGTSV
.:: .:::::::::: : : : : : : : ..: . : .
CCDS64 HHTLADLKRQRAAAKLQRPP-----------PEGPESPETAEPGLPGDTVTPQPDCGFRA
460 470 480 490 500
540 550 560
pF1KSD YYTVTSGDPPLLKFKAPIEEMEEKVHGCCRIS
.:::::::. :: : . . ::
CCDS64 -----GGDPPLLKLTAPAVEAPVERRPCCLLM
510 520
>>CCDS53458.1 PPP1R12B gene_id:4660|Hs108|chr1 (515 aa)
initn: 583 init1: 373 opt: 685 Z-score: 568.3 bits: 114.9 E(32554): 2.5e-25
Smith-Waterman score: 687; 32.5% identity (63.7% similar) in 443 aa overlap (21-454:10-434)
10 20 30 40 50
pF1KSD MASHVDLLTELQLLEKVPTLERLRAAQKRRAQQLKKW--AQYEQDLQHRKRKHERKRSTG
.: ..:. :::.::..: . ::. .:. .. .
CCDS53 MAELEHLGGKRAESARMRRAEQLRRWRGSLTEQEPAERRGAGRQPLTRR
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KSD GRRKKVSFEASVALLEASLRNDAEEVRYFLKNKVSPDLCNEDGLTALHQCCIDNFEEIVK
: .: :: ....: : .:..::: .: .. . : :::::::: :::. ..::
CCDS53 GS-PRVRFEDGAVFLAACSSGDTDEVRKLLARGADINTVNVDGLTALHQACIDENLDMVK
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KSD LLLSHGANVNAKDNELWTPLHAAATCGHINLVKILVQYGADLLAVNSDGNMPYDLCEDEP
.:. . :::: .::: ::::::::.::..:... ....::.. :::.:..: :: :.
CCDS53 FLVENRANVNQQDNEGWTPLHAAASCGYLNIAEYFINHGASVGIVNSEGEVPSDLAEEPA
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KSD TLDVIETCMAYQGITQEKINEMRVAPEQQMIADIHCMIAAGQDLDWIDAQ-GATLLHIAG
:.. . ::. : . : ::::. : . . .:. : .:. ::: ::.:.
CCDS53 MKDLLLEQVKKQGVDLE---QSRKEEEQQMLQDARQWLNSGKIEDVRQARSGATALHVAA
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KSD ANGYLRAAELLLDHGVRVDVKDWDGWEPLHAAAFWGQMQMAELLVSHGASLSARTSMDEM
:.:: .. .::.. : ...:.:.::: :::::: :: . .:. ... :... .
CCDS53 AKGYSEVLRLLIQAGYELNVQDYDGWTPLHAAAHWGVKEACSILAEALCDMDIRNKLGQT
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KSD PIDLCEEEEFKVLLLELKHKHDVIMKSQ--LRHK---SSLSRRTSSAGSRGKVVRRASLS
:.:. .: : ::: .:.. ...:. :.: :.:. . .:. ..: . :
CCDS53 PFDVADEGL--VEHLELLQKKQNVLRSEKETRNKLIESDLNSKIQSGFFKNK---EKMLY
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KSD DRTNLYRKEYEGEAILWQRSAAEDQRTSTYNGDIRETRTDQE-NKDPNPRLEKPVLLSEF
.. . .:.: : . :..:... . . :..:..: .: :. ... ::
CCDS53 EEETPKSQEMEEENKESSSSSSEEEEG---EDEASESETEKEADKKPEAFVNHSN--SES
350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KSD PTKIPRGELDMPVENGLRAPVSAYQYALANGDVWKVHEVPDYSMAYGNPGVADATPPWSS
..: . .. :..: . : :: ... .: : .: : :
CCDS53 KSSITE-QIPAPAQNTFSAS-SARRFS--SGLFNKPEEPKDESPSSWRLGLRKTGSHNML
400 410 420 430 440 450
480 490 500 510 520 530
pF1KSD YKEQSPQTLLELKRQRAAAKLLSHPFLSTHLGSSMARTGESSSEGKAPLIGGRTSPYSSN
CCDS53 SEVANSREPIRDRGSSIYRSSSSPRISALLDNKDKVQFGRVWGNSKAVFFFHENSILGTN
460 470 480 490 500 510
>>CCDS1426.1 PPP1R12B gene_id:4660|Hs108|chr1 (982 aa)
initn: 583 init1: 373 opt: 685 Z-score: 564.2 bits: 115.1 E(32554): 4.2e-25
Smith-Waterman score: 687; 32.5% identity (63.7% similar) in 443 aa overlap (21-454:10-434)
10 20 30 40 50
pF1KSD MASHVDLLTELQLLEKVPTLERLRAAQKRRAQQLKKW--AQYEQDLQHRKRKHERKRSTG
.: ..:. :::.::..: . ::. .:. .. .
CCDS14 MAELEHLGGKRAESARMRRAEQLRRWRGSLTEQEPAERRGAGRQPLTRR
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KSD GRRKKVSFEASVALLEASLRNDAEEVRYFLKNKVSPDLCNEDGLTALHQCCIDNFEEIVK
: .: :: ....: : .:..::: .: .. . : :::::::: :::. ..::
CCDS14 GS-PRVRFEDGAVFLAACSSGDTDEVRKLLARGADINTVNVDGLTALHQACIDENLDMVK
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KSD LLLSHGANVNAKDNELWTPLHAAATCGHINLVKILVQYGADLLAVNSDGNMPYDLCEDEP
.:. . :::: .::: ::::::::.::..:... ....::.. :::.:..: :: :.
CCDS14 FLVENRANVNQQDNEGWTPLHAAASCGYLNIAEYFINHGASVGIVNSEGEVPSDLAEEPA
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KSD TLDVIETCMAYQGITQEKINEMRVAPEQQMIADIHCMIAAGQDLDWIDAQ-GATLLHIAG
:.. . ::. : . : ::::. : . . .:. : .:. ::: ::.:.
CCDS14 MKDLLLEQVKKQGVDLE---QSRKEEEQQMLQDARQWLNSGKIEDVRQARSGATALHVAA
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KSD ANGYLRAAELLLDHGVRVDVKDWDGWEPLHAAAFWGQMQMAELLVSHGASLSARTSMDEM
:.:: .. .::.. : ...:.:.::: :::::: :: . .:. ... :... .
CCDS14 AKGYSEVLRLLIQAGYELNVQDYDGWTPLHAAAHWGVKEACSILAEALCDMDIRNKLGQT
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KSD PIDLCEEEEFKVLLLELKHKHDVIMKSQ--LRHK---SSLSRRTSSAGSRGKVVRRASLS
:.:. .: : ::: .:.. ...:. :.: :.:. . .:. ..: . :
CCDS14 PFDVADEGL--VEHLELLQKKQNVLRSEKETRNKLIESDLNSKIQSGFFKNK---EKMLY
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KSD DRTNLYRKEYEGEAILWQRSAAEDQRTSTYNGDIRETRTDQE-NKDPNPRLEKPVLLSEF
.. . .:.: : . :..:... . . :..:..: .: :. ... ::
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CCDS44 VENGANINQPDNEGWIPLHAAASCGYLDIAEFLIGQGAHVGAVNSEGDTPLDIAEEEAME
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CCDS44 ELLQNEVNRQGV---DIEAARKEEERIMLRDARQWLNSGHINDVRHAKSGGTALHVAAAK
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pF1KSD GYLRAAELLLDHGVRVDVKDWDGWEPLHAAAFWGQMQMAELLVSHGASLSARTSMDEMPI
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CCDS44 GYTEVLKLLIQAGYDVNIKDYDGWTPLHAAAHWGKEEACRILVDNLCDMEMVNKVGQTAF
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CCDS44 PEKNASRIESLEQEKVDEEEEGKKDESSCSSEEDEEDDSESEAETDK--------TKPLA
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18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]