Result of FASTA (omim) for
pF1KSDA0798
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0798, 652 aa
1>>>pF1KSDA0798 652 - 652 aa - 652 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3656+/-0.000999; mu= 18.0637+/- 0.062
mean_var=420.8538+/-87.645, 0's: 0 Z-trim(108.0): 2020 B-trim: 62 in 1/51
Lambda= 0.062519
statistics sampled from 13823 (16104) to 13823 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.476), E-opt: 0.2 (0.189), width: 16
Scan time: 7.390
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001159354 (OMIM: 604753) zinc finger protein 26 ( 864) 2120 208.0 1.1e-52
NP_001159353 (OMIM: 604753) zinc finger protein 26 ( 947) 2120 208.1 1.2e-52
NP_003406 (OMIM: 604753) zinc finger protein 268 i ( 947) 2120 208.1 1.2e-52
NP_001311072 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 693) 2050 201.5 8.3e-51
NP_001311070 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 693) 2050 201.5 8.3e-51
NP_001311074 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 693) 2050 201.5 8.3e-51
NP_001311081 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 693) 2050 201.5 8.3e-51
NP_001311068 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 693) 2050 201.5 8.3e-51
NP_001311078 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 693) 2050 201.5 8.3e-51
NP_001311086 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 743) 2050 201.6 8.5e-51
NP_001311085 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 745) 2050 201.6 8.5e-51
NP_001311079 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 779) 2050 201.6 8.6e-51
NP_001311073 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 779) 2050 201.6 8.6e-51
NP_001311076 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 779) 2050 201.6 8.6e-51
XP_016885306 (OMIM: 314995) PREDICTED: zinc finger ( 779) 2050 201.6 8.6e-51
NP_009061 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 is ( 779) 2050 201.6 8.6e-51
NP_700359 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 is ( 779) 2050 201.6 8.6e-51
NP_001311069 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 779) 2050 201.6 8.6e-51
NP_001311071 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 781) 2050 201.6 8.7e-51
NP_001311077 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 781) 2050 201.6 8.7e-51
NP_001311082 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 789) 2050 201.7 8.7e-51
XP_016885305 (OMIM: 314995) PREDICTED: zinc finger ( 789) 2050 201.7 8.7e-51
XP_006724618 (OMIM: 314995) PREDICTED: zinc finger ( 789) 2050 201.7 8.7e-51
NP_001311080 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 789) 2050 201.7 8.7e-51
XP_016885299 (OMIM: 314995) PREDICTED: zinc finger ( 813) 2050 201.7 8.8e-51
XP_016885304 (OMIM: 314995) PREDICTED: zinc finger ( 813) 2050 201.7 8.8e-51
XP_016885301 (OMIM: 314995) PREDICTED: zinc finger ( 813) 2050 201.7 8.8e-51
XP_016885300 (OMIM: 314995) PREDICTED: zinc finger ( 813) 2050 201.7 8.8e-51
NP_001311083 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 813) 2050 201.7 8.8e-51
XP_016885303 (OMIM: 314995) PREDICTED: zinc finger ( 813) 2050 201.7 8.8e-51
XP_016885302 (OMIM: 314995) PREDICTED: zinc finger ( 813) 2050 201.7 8.8e-51
XP_006724613 (OMIM: 314995) PREDICTED: zinc finger ( 813) 2050 201.7 8.8e-51
NP_001311084 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 821) 2050 201.7 8.8e-51
XP_005259268 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 2020 198.8 5.3e-50
NP_001276330 (OMIM: 604077) zinc finger protein 13 ( 658) 2019 198.7 5.6e-50
XP_016882729 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 658) 2019 198.7 5.6e-50
NP_008887 (OMIM: 194536) zinc finger protein 12 is ( 659) 2013 198.2 8.2e-50
XP_016881867 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 650) 1993 196.3 2.8e-49
XP_016881866 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 686) 1993 196.4 2.9e-49
NP_689697 (OMIM: 613904) zinc finger protein 569 i ( 686) 1993 196.4 2.9e-49
XP_011524841 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 686) 1993 196.4 2.9e-49
XP_016881865 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 686) 1993 196.4 2.9e-49
XP_011524840 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 710) 1993 196.4 2.9e-49
XP_006723110 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 710) 1993 196.4 2.9e-49
XP_006723109 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 710) 1993 196.4 2.9e-49
XP_006723111 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 710) 1993 196.4 2.9e-49
NP_001269130 (OMIM: 300819) zinc finger protein 63 ( 657) 1984 195.5 5e-49
NP_001032824 (OMIM: 300819) zinc finger protein 63 ( 657) 1984 195.5 5e-49
XP_016881869 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 527) 1971 194.2 1e-48
NP_001317411 (OMIM: 613904) zinc finger protein 56 ( 527) 1971 194.2 1e-48
>>NP_001159354 (OMIM: 604753) zinc finger protein 268 is (864 aa)
initn: 6213 init1: 2120 opt: 2120 Z-score: 1066.6 bits: 208.0 E(85289): 1.1e-52
Smith-Waterman score: 2312; 51.4% identity (72.7% similar) in 663 aa overlap (23-652:13-668)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MINAQELLTLEDVTVEFTWEEWQLLGPFQKDLYRDVMLEIYSNLLSMGYQVSKPDALSKL
::: : :: :::.:::: ::::.:.::: .::: . ::
NP_001 MDVFVDFTWEEWQLLDPAQKCLYRSVMLENYSNLVSLGYQHTKPDIIFKL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KSD ERGEEPWTMEDERHSRICPENN-EVDDHLQDHLENQRMLKSVEQYHEHNAFGNTASQTKS
:.::: .. . .. ::.. ..:: .. : ::. : :. . : ..::.
NP_001 EQGEELCMVQAQVPNQTCPNTVWKIDDLMDWHQENKDKLGSTAKSFECTTFGK-------
60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KSD LCLFRENHDTFELYIK--TLKSNLSLVNQNKSCEINNSTKFSGDGKSFLHGNYEELYSAA
:::. .. . . : : ..:. .. ... :: . :. ::::.:...:. .
NP_001 LCLLSTKYLSRQKPHKCGTHGKSLKYIDFTSDYARNNPNGFQVHGKSFFHSKHEQTVIGI
110 120 130 140 150 160
180 190 200
pF1KSD KF------------------------------SVSTKANSTKSQVSKHQRTHEIEKNHVC
:. : :: :.:: . ::.:: :: . :
NP_001 KYCESIESGKTVNKKSQLMCQQMYMGEKPFGCSCCEKAFSSKSYLLVHQQTHAEEKPYGC
170 180 190 200 210 220
210 220 230 240 250 260
pF1KSD SECGKAFVKKSQLTDHERVHTGEKPYGCTLCAKVFSRKSRLNEHQRIHKREKSFICSECG
.:::: : .:: : :.:.::::: . :. : :.:: .:.: ::::: :. . : :::
NP_001 NECGKDFSSKSYLIVHQRIHTGEKLHECSECRKTFSFHSQLVIHQRIHTGENPYECCECG
230 240 250 260 270 280
270 280 290 300 310 320
pF1KSD KVFTMKSRLIEHQRTHTGEKPYICNECGKGFPGKRNLIVHQRNHTGEKSYICSECGKGFT
:::. :..:. ::.::.:.:::.::::::.: : .::.:.: ::::: : :.:: :.:.
NP_001 KVFSRKDQLVSHQKTHSGQKPYVCNECGKAFGLKSQLIIHERIHTGEKPYECNECQKAFN
290 300 310 320 330 340
330 340 350 360 370 380
pF1KSD GKSMLIIHQRTHTGEKPYICSECGKGFTTKHYVIIHQRNHTGEKPYICNECGKGFTMKSR
:: :..:::::::::::.::.:::.:: : .:.:: ::: ::: : .:::::..::.
NP_001 TKSNLMVHQRTHTGEKPYVCSDCGKAFTFKSQLIVHQGIHTGVKPYGCIQCGKGFSLKSQ
350 360 370 380 390 400
390 400 410 420 430 440
pF1KSD MIEHQRTHTGEKPYICSECGKGFPRKSNLIVHQRNHTVEKSYLCSECGKGFTVKSMLIIH
.: :::.::: :::.:.::::.: :: ::.: :.:: :: . :..:::.:. ::.::::
NP_001 LIVHQRSHTGMKPYVCNECGKAFRSKSYLIIHTRTHTGEKLHECNNCGKAFSFKSQLIIH
410 420 430 440 450 460
450 460 470 480 490 500
pF1KSD QRTHTGEKPYTCSECGKGFPLKSRLIVHQRTHTGEKPYRCSECGKGFIVNSGLMLHQRTH
:: ::::.:: : ::::.: : .:: :::::.:::::.:..:::.: ..: :..:::::
NP_001 QRIHTGENPYECHECGKAFSRKYQLISHQRTHAGEKPYECTDCGKAFGLKSQLIIHQRTH
470 480 490 500 510 520
510 520 530 540 550 560
pF1KSD TGEKPYICNECGKGFAFKSNLVVHQRTHTGEKPFMCSECGKGFTMKRYLIVHQQIHTEEK
:::::. :.:: :.: ::::.:::::::::::. :.::::.::.: ::::. .:: :
NP_001 TGEKPFECSECQKAFNTKSNLIVHQRTHTGEKPYSCNECGKAFTFKSQLIVHKGVHTGVK
530 540 550 560 570 580
570 580 590 600 610 620
pF1KSD SCICSECGRGFAKETELALHKQVHTGEKPYGCNECGKGFTMKSRLIVHQRTHTGEKPFVC
::.:.. :. ...: .:.. ::: :::::.::::.: :: ::.:.:::::::: :
NP_001 PYGCSQCAKTFSLKSQLIVHQRSHTGVKPYGCSECGKAFRSKSYLIIHMRTHTGEKPHEC
590 600 610 620 630 640
630 640 650
pF1KSD SECRKAFSSKRNLIVHQRTHNGNKP
:: :.:: . .:::::: :.:..:
NP_001 RECGKSFSFNSQLIVHQRIHTGENPYECSECGKAFNRKDQLISHQRTHAGEKPYGCSECG
650 660 670 680 690 700
>--
initn: 1807 init1: 916 opt: 920 Z-score: 481.7 bits: 99.8 E(85289): 4.3e-20
Smith-Waterman score: 923; 64.1% identity (82.6% similar) in 195 aa overlap (373-567:669-863)
350 360 370 380 390 400
pF1KSD KPYICSECGKGFTTKHYVIIHQRNHTGEKPYICNECGKGFTMKSRMIEHQRTHTGEKPYI
: :.::::.:. :...: :::::.:::::
NP_001 KPHECRECGKSFSFNSQLIVHQRIHTGENPYECSECGKAFNRKDQLISHQRTHAGEKPYG
640 650 660 670 680 690
410 420 430 440 450 460
pF1KSD CSECGKGFPRKSNLIVHQRNHTVEKSYLCSECGKGFTVKSMLIIHQRTHTGEKPYTCSEC
::::::.: :: ::.:.:.:. :: : :.::::.: ::.::.:.:::.: .:: ::.:
NP_001 CSECGKAFSSKSYLIIHMRTHSGEKPYECNECGKAFIWKSLLIVHERTHAGVNPYKCSQC
700 710 720 730 740 750
470 480 490 500 510 520
pF1KSD GKGFPLKSRLIVHQRTHTGEKPYRCSECGKGFIVNSGLMLHQRTHTGEKPYICNECGKGF
:.: : ::.:::: :: ::::.::::::.:: :: :..:::::.::::: :::::: :
NP_001 EKSFSGKLRLLVHQRMHTREKPYECSECGKAFIRNSQLIVHQRTHSGEKPYGCNECGKTF
760 770 780 790 800 810
530 540 550 560 570 580
pF1KSD AFKSNLVVHQRTHTGEKPFMCSECGKGFTMKRYLIVHQQIHTEEKSCICSECGRGFAKET
. :: : .:::::::::: :.::::.: : ::.::. :...:
NP_001 SQKSILSAHQRTHTGEKPCKCTECGKAFCWKSQLIMHQRTHVDDKH
820 830 840 850 860
590 600 610 620 630 640
pF1KSD ELALHKQVHTGEKPYGCNECGKGFTMKSRLIVHQRTHTGEKPFVCSECRKAFSSKRNLIV
>>NP_001159353 (OMIM: 604753) zinc finger protein 268 is (947 aa)
initn: 6213 init1: 2120 opt: 2120 Z-score: 1066.3 bits: 208.1 E(85289): 1.2e-52
Smith-Waterman score: 2312; 51.4% identity (72.7% similar) in 663 aa overlap (23-652:96-751)
10 20 30 40 50
pF1KSD MINAQELLTLEDVTVEFTWEEWQLLGPFQKDLYRDVMLEIYSNLLSMGYQVS
::: : :: :::.:::: ::::.:.::: .
NP_001 FISQEQPKITKSWGPLSFMDVFVDFTWEEWQLLDPAQKCLYRSVMLENYSNLVSLGYQHT
70 80 90 100 110 120
60 70 80 90 100 110
pF1KSD KPDALSKLERGEEPWTMEDERHSRICPENN-EVDDHLQDHLENQRMLKSVEQYHEHNAFG
::: . :::.::: .. . .. ::.. ..:: .. : ::. : :. . : ..::
NP_001 KPDIIFKLEQGEELCMVQAQVPNQTCPNTVWKIDDLMDWHQENKDKLGSTAKSFECTTFG
130 140 150 160 170 180
120 130 140 150 160
pF1KSD NTASQTKSLCLFRENHDTFELYIK--TLKSNLSLVNQNKSCEINNSTKFSGDGKSFLHGN
. :::. .. . . : : ..:. .. ... :: . :. ::::.:..
NP_001 K-------LCLLSTKYLSRQKPHKCGTHGKSLKYIDFTSDYARNNPNGFQVHGKSFFHSK
190 200 210 220 230
170 180 190
pF1KSD YEELYSAAKF------------------------------SVSTKANSTKSQVSKHQRTH
.:. . :. : :: :.:: . ::.::
NP_001 HEQTVIGIKYCESIESGKTVNKKSQLMCQQMYMGEKPFGCSCCEKAFSSKSYLLVHQQTH
240 250 260 270 280 290
200 210 220 230 240 250
pF1KSD EIEKNHVCSECGKAFVKKSQLTDHERVHTGEKPYGCTLCAKVFSRKSRLNEHQRIHKREK
:: . :.:::: : .:: : :.:.::::: . :. : :.:: .:.: ::::: :.
NP_001 AEEKPYGCNECGKDFSSKSYLIVHQRIHTGEKLHECSECRKTFSFHSQLVIHQRIHTGEN
300 310 320 330 340 350
260 270 280 290 300 310
pF1KSD SFICSECGKVFTMKSRLIEHQRTHTGEKPYICNECGKGFPGKRNLIVHQRNHTGEKSYIC
. : ::::::. :..:. ::.::.:.:::.::::::.: : .::.:.: ::::: : :
NP_001 PYECCECGKVFSRKDQLVSHQKTHSGQKPYVCNECGKAFGLKSQLIIHERIHTGEKPYEC
360 370 380 390 400 410
320 330 340 350 360 370
pF1KSD SECGKGFTGKSMLIIHQRTHTGEKPYICSECGKGFTTKHYVIIHQRNHTGEKPYICNECG
.:: :.:. :: :..:::::::::::.::.:::.:: : .:.:: ::: ::: : .::
NP_001 NECQKAFNTKSNLMVHQRTHTGEKPYVCSDCGKAFTFKSQLIVHQGIHTGVKPYGCIQCG
420 430 440 450 460 470
380 390 400 410 420 430
pF1KSD KGFTMKSRMIEHQRTHTGEKPYICSECGKGFPRKSNLIVHQRNHTVEKSYLCSECGKGFT
:::..::..: :::.::: :::.:.::::.: :: ::.: :.:: :: . :..:::.:.
NP_001 KGFSLKSQLIVHQRSHTGMKPYVCNECGKAFRSKSYLIIHTRTHTGEKLHECNNCGKAFS
480 490 500 510 520 530
440 450 460 470 480 490
pF1KSD VKSMLIIHQRTHTGEKPYTCSECGKGFPLKSRLIVHQRTHTGEKPYRCSECGKGFIVNSG
::.:::::: ::::.:: : ::::.: : .:: :::::.:::::.:..:::.: ..:
NP_001 FKSQLIIHQRIHTGENPYECHECGKAFSRKYQLISHQRTHAGEKPYECTDCGKAFGLKSQ
540 550 560 570 580 590
500 510 520 530 540 550
pF1KSD LMLHQRTHTGEKPYICNECGKGFAFKSNLVVHQRTHTGEKPFMCSECGKGFTMKRYLIVH
:..::::::::::. :.:: :.: ::::.:::::::::::. :.::::.::.: ::::
NP_001 LIIHQRTHTGEKPFECSECQKAFNTKSNLIVHQRTHTGEKPYSCNECGKAFTFKSQLIVH
600 610 620 630 640 650
560 570 580 590 600 610
pF1KSD QQIHTEEKSCICSECGRGFAKETELALHKQVHTGEKPYGCNECGKGFTMKSRLIVHQRTH
. .:: : ::.:.. :. ...: .:.. ::: :::::.::::.: :: ::.:.:::
NP_001 KGVHTGVKPYGCSQCAKTFSLKSQLIVHQRSHTGVKPYGCSECGKAFRSKSYLIIHMRTH
660 670 680 690 700 710
620 630 640 650
pF1KSD TGEKPFVCSECRKAFSSKRNLIVHQRTHNGNKP
::::: : :: :.:: . .:::::: :.:..:
NP_001 TGEKPHECRECGKSFSFNSQLIVHQRIHTGENPYECSECGKAFNRKDQLISHQRTHAGEK
720 730 740 750 760 770
NP_001 PYGCSECGKAFSSKSYLIIHMRTHSGEKPYECNECGKAFIWKSLLIVHERTHAGVNPYKC
780 790 800 810 820 830
>--
initn: 1807 init1: 916 opt: 920 Z-score: 481.4 bits: 99.9 E(85289): 4.5e-20
Smith-Waterman score: 923; 64.1% identity (82.6% similar) in 195 aa overlap (373-567:752-946)
350 360 370 380 390 400
pF1KSD KPYICSECGKGFTTKHYVIIHQRNHTGEKPYICNECGKGFTMKSRMIEHQRTHTGEKPYI
: :.::::.:. :...: :::::.:::::
NP_001 KPHECRECGKSFSFNSQLIVHQRIHTGENPYECSECGKAFNRKDQLISHQRTHAGEKPYG
730 740 750 760 770 780
410 420 430 440 450 460
pF1KSD CSECGKGFPRKSNLIVHQRNHTVEKSYLCSECGKGFTVKSMLIIHQRTHTGEKPYTCSEC
::::::.: :: ::.:.:.:. :: : :.::::.: ::.::.:.:::.: .:: ::.:
NP_001 CSECGKAFSSKSYLIIHMRTHSGEKPYECNECGKAFIWKSLLIVHERTHAGVNPYKCSQC
790 800 810 820 830 840
470 480 490 500 510 520
pF1KSD GKGFPLKSRLIVHQRTHTGEKPYRCSECGKGFIVNSGLMLHQRTHTGEKPYICNECGKGF
:.: : ::.:::: :: ::::.::::::.:: :: :..:::::.::::: :::::: :
NP_001 EKSFSGKLRLLVHQRMHTREKPYECSECGKAFIRNSQLIVHQRTHSGEKPYGCNECGKTF
850 860 870 880 890 900
530 540 550 560 570 580
pF1KSD AFKSNLVVHQRTHTGEKPFMCSECGKGFTMKRYLIVHQQIHTEEKSCICSECGRGFAKET
. :: : .:::::::::: :.::::.: : ::.::. :...:
NP_001 SQKSILSAHQRTHTGEKPCKCTECGKAFCWKSQLIMHQRTHVDDKH
910 920 930 940
590 600 610 620 630 640
pF1KSD ELALHKQVHTGEKPYGCNECGKGFTMKSRLIVHQRTHTGEKPFVCSECRKAFSSKRNLIV
>>NP_003406 (OMIM: 604753) zinc finger protein 268 isofo (947 aa)
initn: 6213 init1: 2120 opt: 2120 Z-score: 1066.3 bits: 208.1 E(85289): 1.2e-52
Smith-Waterman score: 2312; 51.4% identity (72.7% similar) in 663 aa overlap (23-652:96-751)
10 20 30 40 50
pF1KSD MINAQELLTLEDVTVEFTWEEWQLLGPFQKDLYRDVMLEIYSNLLSMGYQVS
::: : :: :::.:::: ::::.:.::: .
NP_003 FISQEQPKITKSWGPLSFMDVFVDFTWEEWQLLDPAQKCLYRSVMLENYSNLVSLGYQHT
70 80 90 100 110 120
60 70 80 90 100 110
pF1KSD KPDALSKLERGEEPWTMEDERHSRICPENN-EVDDHLQDHLENQRMLKSVEQYHEHNAFG
::: . :::.::: .. . .. ::.. ..:: .. : ::. : :. . : ..::
NP_003 KPDIIFKLEQGEELCMVQAQVPNQTCPNTVWKIDDLMDWHQENKDKLGSTAKSFECTTFG
130 140 150 160 170 180
120 130 140 150 160
pF1KSD NTASQTKSLCLFRENHDTFELYIK--TLKSNLSLVNQNKSCEINNSTKFSGDGKSFLHGN
. :::. .. . . : : ..:. .. ... :: . :. ::::.:..
NP_003 K-------LCLLSTKYLSRQKPHKCGTHGKSLKYIDFTSDYARNNPNGFQVHGKSFFHSK
190 200 210 220 230
170 180 190
pF1KSD YEELYSAAKF------------------------------SVSTKANSTKSQVSKHQRTH
.:. . :. : :: :.:: . ::.::
NP_003 HEQTVIGIKYCESIESGKTVNKKSQLMCQQMYMGEKPFGCSCCEKAFSSKSYLLVHQQTH
240 250 260 270 280 290
200 210 220 230 240 250
pF1KSD EIEKNHVCSECGKAFVKKSQLTDHERVHTGEKPYGCTLCAKVFSRKSRLNEHQRIHKREK
:: . :.:::: : .:: : :.:.::::: . :. : :.:: .:.: ::::: :.
NP_003 AEEKPYGCNECGKDFSSKSYLIVHQRIHTGEKLHECSECRKTFSFHSQLVIHQRIHTGEN
300 310 320 330 340 350
260 270 280 290 300 310
pF1KSD SFICSECGKVFTMKSRLIEHQRTHTGEKPYICNECGKGFPGKRNLIVHQRNHTGEKSYIC
. : ::::::. :..:. ::.::.:.:::.::::::.: : .::.:.: ::::: : :
NP_003 PYECCECGKVFSRKDQLVSHQKTHSGQKPYVCNECGKAFGLKSQLIIHERIHTGEKPYEC
360 370 380 390 400 410
320 330 340 350 360 370
pF1KSD SECGKGFTGKSMLIIHQRTHTGEKPYICSECGKGFTTKHYVIIHQRNHTGEKPYICNECG
.:: :.:. :: :..:::::::::::.::.:::.:: : .:.:: ::: ::: : .::
NP_003 NECQKAFNTKSNLMVHQRTHTGEKPYVCSDCGKAFTFKSQLIVHQGIHTGVKPYGCIQCG
420 430 440 450 460 470
380 390 400 410 420 430
pF1KSD KGFTMKSRMIEHQRTHTGEKPYICSECGKGFPRKSNLIVHQRNHTVEKSYLCSECGKGFT
:::..::..: :::.::: :::.:.::::.: :: ::.: :.:: :: . :..:::.:.
NP_003 KGFSLKSQLIVHQRSHTGMKPYVCNECGKAFRSKSYLIIHTRTHTGEKLHECNNCGKAFS
480 490 500 510 520 530
440 450 460 470 480 490
pF1KSD VKSMLIIHQRTHTGEKPYTCSECGKGFPLKSRLIVHQRTHTGEKPYRCSECGKGFIVNSG
::.:::::: ::::.:: : ::::.: : .:: :::::.:::::.:..:::.: ..:
NP_003 FKSQLIIHQRIHTGENPYECHECGKAFSRKYQLISHQRTHAGEKPYECTDCGKAFGLKSQ
540 550 560 570 580 590
500 510 520 530 540 550
pF1KSD LMLHQRTHTGEKPYICNECGKGFAFKSNLVVHQRTHTGEKPFMCSECGKGFTMKRYLIVH
:..::::::::::. :.:: :.: ::::.:::::::::::. :.::::.::.: ::::
NP_003 LIIHQRTHTGEKPFECSECQKAFNTKSNLIVHQRTHTGEKPYSCNECGKAFTFKSQLIVH
600 610 620 630 640 650
560 570 580 590 600 610
pF1KSD QQIHTEEKSCICSECGRGFAKETELALHKQVHTGEKPYGCNECGKGFTMKSRLIVHQRTH
. .:: : ::.:.. :. ...: .:.. ::: :::::.::::.: :: ::.:.:::
NP_003 KGVHTGVKPYGCSQCAKTFSLKSQLIVHQRSHTGVKPYGCSECGKAFRSKSYLIIHMRTH
660 670 680 690 700 710
620 630 640 650
pF1KSD TGEKPFVCSECRKAFSSKRNLIVHQRTHNGNKP
::::: : :: :.:: . .:::::: :.:..:
NP_003 TGEKPHECRECGKSFSFNSQLIVHQRIHTGENPYECSECGKAFNRKDQLISHQRTHAGEK
720 730 740 750 760 770
NP_003 PYGCSECGKAFSSKSYLIIHMRTHSGEKPYECNECGKAFIWKSLLIVHERTHAGVNPYKC
780 790 800 810 820 830
>--
initn: 1807 init1: 916 opt: 920 Z-score: 481.4 bits: 99.9 E(85289): 4.5e-20
Smith-Waterman score: 923; 64.1% identity (82.6% similar) in 195 aa overlap (373-567:752-946)
350 360 370 380 390 400
pF1KSD KPYICSECGKGFTTKHYVIIHQRNHTGEKPYICNECGKGFTMKSRMIEHQRTHTGEKPYI
: :.::::.:. :...: :::::.:::::
NP_003 KPHECRECGKSFSFNSQLIVHQRIHTGENPYECSECGKAFNRKDQLISHQRTHAGEKPYG
730 740 750 760 770 780
410 420 430 440 450 460
pF1KSD CSECGKGFPRKSNLIVHQRNHTVEKSYLCSECGKGFTVKSMLIIHQRTHTGEKPYTCSEC
::::::.: :: ::.:.:.:. :: : :.::::.: ::.::.:.:::.: .:: ::.:
NP_003 CSECGKAFSSKSYLIIHMRTHSGEKPYECNECGKAFIWKSLLIVHERTHAGVNPYKCSQC
790 800 810 820 830 840
470 480 490 500 510 520
pF1KSD GKGFPLKSRLIVHQRTHTGEKPYRCSECGKGFIVNSGLMLHQRTHTGEKPYICNECGKGF
:.: : ::.:::: :: ::::.::::::.:: :: :..:::::.::::: :::::: :
NP_003 EKSFSGKLRLLVHQRMHTREKPYECSECGKAFIRNSQLIVHQRTHSGEKPYGCNECGKTF
850 860 870 880 890 900
530 540 550 560 570 580
pF1KSD AFKSNLVVHQRTHTGEKPFMCSECGKGFTMKRYLIVHQQIHTEEKSCICSECGRGFAKET
. :: : .:::::::::: :.::::.: : ::.::. :...:
NP_003 SQKSILSAHQRTHTGEKPCKCTECGKAFCWKSQLIMHQRTHVDDKH
910 920 930 940
590 600 610 620 630 640
pF1KSD ELALHKQVHTGEKPYGCNECGKGFTMKSRLIVHQRTHTGEKPFVCSECRKAFSSKRNLIV
>>NP_001311072 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 iso (693 aa)
initn: 3875 init1: 2011 opt: 2050 Z-score: 1033.2 bits: 201.5 E(85289): 8.3e-51
Smith-Waterman score: 2055; 47.9% identity (71.4% similar) in 637 aa overlap (27-652:38-660)
10 20 30 40 50
pF1KSD MINAQELLTLEDVTVEFTWEEWQLLGPFQKDLYRDVMLEIYSNLLSM-GYQVSKPD
:. .: ... :.... .. : .. .
NP_001 HQSCSGEAIGKMQQQGIPGGIFFHCERFDQPIGEDSLCSILEELWQDNDQLEQRQENQNN
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100
pF1KSD ALSKL-----ERGEEPWTMEDERH--SRICPENNEVDDHLQDHLENQRMLKSVEQYHEHN
::.. ::: : ..: : ... : ... : : .:: . . :.::
NP_001 LLSHVKVLIKERGYEHKNIEKIIHVTTKLVPSIKRL--HNCD-----TILKHTLNSHNHN
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KSD AFGNTASQTKSLCLFRENHDTFELYIKTLKSNLSLVNQNKSCEINNSTKFSGDGKSFLHG
: ::.: . : ..: .. :.. . .. : ::: .. : . .. :
NP_001 ----RNSATKNLGKIFGNGNNFPHSPSSTKNENAKTGAN-SCEHDHYEKHLSHKQAPTH-
130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KSD NYEELYSAAKFSVSTKAN---STKSQVSKHQRTHEIEKNHVCSECGKAFVKKSQLTDHER
..... :. : :. . ::.. .::: : ::.. :.. .:.: .: :. :
NP_001 -HQKIHPEEKLYVCTECVMGFTQKSHLFEHQRIHAGEKSRECDKSNKVFPQKPQVDVHPS
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KSD VHTGEKPYGCTLCAKVFSRKSRLNEHQRIHKREKSFICSECGKVFTMKSRLIEHQRTHTG
:.:::::: :: :.:::. :: : ::.:: .: . ::::::.: ..: :..: : :::
NP_001 VYTGEKPYLCTQCGKVFTLKSNLITHQKIHTGQKPYKCSECGKAFFQRSDLFRHLRIHTG
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KSD EKPYICNECGKGFPGKRNLIVHQRNHTGEKSYICSECGKGFTGKSMLIIHQRTHTGEKPY
:::: :.:::::: . .: .::..::::: : :.::::.:: :: : .::: :::::::
NP_001 EKPYECSECGKGFSQNSDLSIHQKTHTGEKHYECNECGKAFTRKSALRMHQRIHTGEKPY
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KSD ICSECGKGFTTKHYVIIHQRNHTGEKPYICNECGKGFTMKSRMIEHQRTHTGEKPYICSE
.:..:::.: : . ::: ::::::: :..:::.:: ::.. ::: :::::::::.:
NP_001 VCADCGKAFIQKSHFNTHQRIHTGEKPYECSDCGKSFTKKSQLHVHQRIHTGEKPYICTE
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KSD CGKGFPRKSNLIVHQRNHTVEKSYLCSECGKGFTVKSMLIIHQRTHTGEKPYTCSECGKG
::: : ...:: .::..:: :: :.:.::::.:: .: :: ::.:::::::: :. :::.
NP_001 CGKVFTHRTNLTTHQKTHTGEKPYMCAECGKAFTDQSNLIKHQKTHTGEKPYKCNGCGKA
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KSD FPLKSRLIVHQRTHTGEKPYRCSECGKGFIVNSGLMLHQRTHTGEKPYICNECGKGFAFK
: :::: .::..: ::. :.:..:::.:: .: : .::: :::::::.: ::::.: :
NP_001 FIWKSRLKIHQKSHIGERHYECKDCGKAFIQKSTLSVHQRIHTGEKPYVCPECGKAFIQK
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570 580
pF1KSD SNLVVHQRTHTGEKPFMCSECGKGFTMKRYLIVHQQIHTEEKSCICSECGRGFAKETELA
:....:.: ::::::. ::.::: :: : : :::.::: :: ::.:::..:. ...:
NP_001 SHFIAHHRIHTGEKPYECSDCGKCFTKKSQLRVHQKIHTGEKPNICAECGKAFTDRSNLI
540 550 560 570 580 590
590 600 610 620 630 640
pF1KSD LHKQVHTGEKPYGCNECGKGFTMKSRLIVHQRTHTGEKPFVCSECRKAFSSKRNLIVHQR
:...:: :::: :..::: :: :::: .::..::::. . ::.: ::: .: .: .::
NP_001 THQKIHTREKPYECGDCGKTFTWKSRLNIHQKSHTGERHYECSKCGKAFIQKATLSMHQI
600 610 620 630 640 650
650
pF1KSD THNGNKP
:.:.::
NP_001 IHTGKKPYACTECQKAFTDRSNLIKHQKMHSGEKRYKASD
660 670 680 690
>>NP_001311070 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 iso (693 aa)
initn: 3875 init1: 2011 opt: 2050 Z-score: 1033.2 bits: 201.5 E(85289): 8.3e-51
Smith-Waterman score: 2055; 47.9% identity (71.4% similar) in 637 aa overlap (27-652:38-660)
10 20 30 40 50
pF1KSD MINAQELLTLEDVTVEFTWEEWQLLGPFQKDLYRDVMLEIYSNLLSM-GYQVSKPD
:. .: ... :.... .. : .. .
NP_001 HQSCSGEAIGKMQQQGIPGGIFFHCERFDQPIGEDSLCSILEELWQDNDQLEQRQENQNN
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100
pF1KSD ALSKL-----ERGEEPWTMEDERH--SRICPENNEVDDHLQDHLENQRMLKSVEQYHEHN
::.. ::: : ..: : ... : ... : : .:: . . :.::
NP_001 LLSHVKVLIKERGYEHKNIEKIIHVTTKLVPSIKRL--HNCD-----TILKHTLNSHNHN
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KSD AFGNTASQTKSLCLFRENHDTFELYIKTLKSNLSLVNQNKSCEINNSTKFSGDGKSFLHG
: ::.: . : ..: .. :.. . .. : ::: .. : . .. :
NP_001 ----RNSATKNLGKIFGNGNNFPHSPSSTKNENAKTGAN-SCEHDHYEKHLSHKQAPTH-
130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KSD NYEELYSAAKFSVSTKAN---STKSQVSKHQRTHEIEKNHVCSECGKAFVKKSQLTDHER
..... :. : :. . ::.. .::: : ::.. :.. .:.: .: :. :
NP_001 -HQKIHPEEKLYVCTECVMGFTQKSHLFEHQRIHAGEKSRECDKSNKVFPQKPQVDVHPS
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KSD VHTGEKPYGCTLCAKVFSRKSRLNEHQRIHKREKSFICSECGKVFTMKSRLIEHQRTHTG
:.:::::: :: :.:::. :: : ::.:: .: . ::::::.: ..: :..: : :::
NP_001 VYTGEKPYLCTQCGKVFTLKSNLITHQKIHTGQKPYKCSECGKAFFQRSDLFRHLRIHTG
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KSD EKPYICNECGKGFPGKRNLIVHQRNHTGEKSYICSECGKGFTGKSMLIIHQRTHTGEKPY
:::: :.:::::: . .: .::..::::: : :.::::.:: :: : .::: :::::::
NP_001 EKPYECSECGKGFSQNSDLSIHQKTHTGEKHYECNECGKAFTRKSALRMHQRIHTGEKPY
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KSD ICSECGKGFTTKHYVIIHQRNHTGEKPYICNECGKGFTMKSRMIEHQRTHTGEKPYICSE
.:..:::.: : . ::: ::::::: :..:::.:: ::.. ::: :::::::::.:
NP_001 VCADCGKAFIQKSHFNTHQRIHTGEKPYECSDCGKSFTKKSQLHVHQRIHTGEKPYICTE
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KSD CGKGFPRKSNLIVHQRNHTVEKSYLCSECGKGFTVKSMLIIHQRTHTGEKPYTCSECGKG
::: : ...:: .::..:: :: :.:.::::.:: .: :: ::.:::::::: :. :::.
NP_001 CGKVFTHRTNLTTHQKTHTGEKPYMCAECGKAFTDQSNLIKHQKTHTGEKPYKCNGCGKA
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KSD FPLKSRLIVHQRTHTGEKPYRCSECGKGFIVNSGLMLHQRTHTGEKPYICNECGKGFAFK
: :::: .::..: ::. :.:..:::.:: .: : .::: :::::::.: ::::.: :
NP_001 FIWKSRLKIHQKSHIGERHYECKDCGKAFIQKSTLSVHQRIHTGEKPYVCPECGKAFIQK
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570 580
pF1KSD SNLVVHQRTHTGEKPFMCSECGKGFTMKRYLIVHQQIHTEEKSCICSECGRGFAKETELA
:....:.: ::::::. ::.::: :: : : :::.::: :: ::.:::..:. ...:
NP_001 SHFIAHHRIHTGEKPYECSDCGKCFTKKSQLRVHQKIHTGEKPNICAECGKAFTDRSNLI
540 550 560 570 580 590
590 600 610 620 630 640
pF1KSD LHKQVHTGEKPYGCNECGKGFTMKSRLIVHQRTHTGEKPFVCSECRKAFSSKRNLIVHQR
:...:: :::: :..::: :: :::: .::..::::. . ::.: ::: .: .: .::
NP_001 THQKIHTREKPYECGDCGKTFTWKSRLNIHQKSHTGERHYECSKCGKAFIQKATLSMHQI
600 610 620 630 640 650
650
pF1KSD THNGNKP
:.:.::
NP_001 IHTGKKPYACTECQKAFTDRSNLIKHQKMHSGEKRYKASD
660 670 680 690
>>NP_001311074 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 iso (693 aa)
initn: 3875 init1: 2011 opt: 2050 Z-score: 1033.2 bits: 201.5 E(85289): 8.3e-51
Smith-Waterman score: 2055; 47.9% identity (71.4% similar) in 637 aa overlap (27-652:38-660)
10 20 30 40 50
pF1KSD MINAQELLTLEDVTVEFTWEEWQLLGPFQKDLYRDVMLEIYSNLLSM-GYQVSKPD
:. .: ... :.... .. : .. .
NP_001 HQSCSGEAIGKMQQQGIPGGIFFHCERFDQPIGEDSLCSILEELWQDNDQLEQRQENQNN
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100
pF1KSD ALSKL-----ERGEEPWTMEDERH--SRICPENNEVDDHLQDHLENQRMLKSVEQYHEHN
::.. ::: : ..: : ... : ... : : .:: . . :.::
NP_001 LLSHVKVLIKERGYEHKNIEKIIHVTTKLVPSIKRL--HNCD-----TILKHTLNSHNHN
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KSD AFGNTASQTKSLCLFRENHDTFELYIKTLKSNLSLVNQNKSCEINNSTKFSGDGKSFLHG
: ::.: . : ..: .. :.. . .. : ::: .. : . .. :
NP_001 ----RNSATKNLGKIFGNGNNFPHSPSSTKNENAKTGAN-SCEHDHYEKHLSHKQAPTH-
130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KSD NYEELYSAAKFSVSTKAN---STKSQVSKHQRTHEIEKNHVCSECGKAFVKKSQLTDHER
..... :. : :. . ::.. .::: : ::.. :.. .:.: .: :. :
NP_001 -HQKIHPEEKLYVCTECVMGFTQKSHLFEHQRIHAGEKSRECDKSNKVFPQKPQVDVHPS
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KSD VHTGEKPYGCTLCAKVFSRKSRLNEHQRIHKREKSFICSECGKVFTMKSRLIEHQRTHTG
:.:::::: :: :.:::. :: : ::.:: .: . ::::::.: ..: :..: : :::
NP_001 VYTGEKPYLCTQCGKVFTLKSNLITHQKIHTGQKPYKCSECGKAFFQRSDLFRHLRIHTG
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KSD EKPYICNECGKGFPGKRNLIVHQRNHTGEKSYICSECGKGFTGKSMLIIHQRTHTGEKPY
:::: :.:::::: . .: .::..::::: : :.::::.:: :: : .::: :::::::
NP_001 EKPYECSECGKGFSQNSDLSIHQKTHTGEKHYECNECGKAFTRKSALRMHQRIHTGEKPY
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KSD ICSECGKGFTTKHYVIIHQRNHTGEKPYICNECGKGFTMKSRMIEHQRTHTGEKPYICSE
.:..:::.: : . ::: ::::::: :..:::.:: ::.. ::: :::::::::.:
NP_001 VCADCGKAFIQKSHFNTHQRIHTGEKPYECSDCGKSFTKKSQLHVHQRIHTGEKPYICTE
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KSD CGKGFPRKSNLIVHQRNHTVEKSYLCSECGKGFTVKSMLIIHQRTHTGEKPYTCSECGKG
::: : ...:: .::..:: :: :.:.::::.:: .: :: ::.:::::::: :. :::.
NP_001 CGKVFTHRTNLTTHQKTHTGEKPYMCAECGKAFTDQSNLIKHQKTHTGEKPYKCNGCGKA
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KSD FPLKSRLIVHQRTHTGEKPYRCSECGKGFIVNSGLMLHQRTHTGEKPYICNECGKGFAFK
: :::: .::..: ::. :.:..:::.:: .: : .::: :::::::.: ::::.: :
NP_001 FIWKSRLKIHQKSHIGERHYECKDCGKAFIQKSTLSVHQRIHTGEKPYVCPECGKAFIQK
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570 580
pF1KSD SNLVVHQRTHTGEKPFMCSECGKGFTMKRYLIVHQQIHTEEKSCICSECGRGFAKETELA
:....:.: ::::::. ::.::: :: : : :::.::: :: ::.:::..:. ...:
NP_001 SHFIAHHRIHTGEKPYECSDCGKCFTKKSQLRVHQKIHTGEKPNICAECGKAFTDRSNLI
540 550 560 570 580 590
590 600 610 620 630 640
pF1KSD LHKQVHTGEKPYGCNECGKGFTMKSRLIVHQRTHTGEKPFVCSECRKAFSSKRNLIVHQR
:...:: :::: :..::: :: :::: .::..::::. . ::.: ::: .: .: .::
NP_001 THQKIHTREKPYECGDCGKTFTWKSRLNIHQKSHTGERHYECSKCGKAFIQKATLSMHQI
600 610 620 630 640 650
650
pF1KSD THNGNKP
:.:.::
NP_001 IHTGKKPYACTECQKAFTDRSNLIKHQKMHSGEKRYKASD
660 670 680 690
>>NP_001311081 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 iso (693 aa)
initn: 3875 init1: 2011 opt: 2050 Z-score: 1033.2 bits: 201.5 E(85289): 8.3e-51
Smith-Waterman score: 2055; 47.9% identity (71.4% similar) in 637 aa overlap (27-652:38-660)
10 20 30 40 50
pF1KSD MINAQELLTLEDVTVEFTWEEWQLLGPFQKDLYRDVMLEIYSNLLSM-GYQVSKPD
:. .: ... :.... .. : .. .
NP_001 HQSCSGEAIGKMQQQGIPGGIFFHCERFDQPIGEDSLCSILEELWQDNDQLEQRQENQNN
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100
pF1KSD ALSKL-----ERGEEPWTMEDERH--SRICPENNEVDDHLQDHLENQRMLKSVEQYHEHN
::.. ::: : ..: : ... : ... : : .:: . . :.::
NP_001 LLSHVKVLIKERGYEHKNIEKIIHVTTKLVPSIKRL--HNCD-----TILKHTLNSHNHN
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KSD AFGNTASQTKSLCLFRENHDTFELYIKTLKSNLSLVNQNKSCEINNSTKFSGDGKSFLHG
: ::.: . : ..: .. :.. . .. : ::: .. : . .. :
NP_001 ----RNSATKNLGKIFGNGNNFPHSPSSTKNENAKTGAN-SCEHDHYEKHLSHKQAPTH-
130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KSD NYEELYSAAKFSVSTKAN---STKSQVSKHQRTHEIEKNHVCSECGKAFVKKSQLTDHER
..... :. : :. . ::.. .::: : ::.. :.. .:.: .: :. :
NP_001 -HQKIHPEEKLYVCTECVMGFTQKSHLFEHQRIHAGEKSRECDKSNKVFPQKPQVDVHPS
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KSD VHTGEKPYGCTLCAKVFSRKSRLNEHQRIHKREKSFICSECGKVFTMKSRLIEHQRTHTG
:.:::::: :: :.:::. :: : ::.:: .: . ::::::.: ..: :..: : :::
NP_001 VYTGEKPYLCTQCGKVFTLKSNLITHQKIHTGQKPYKCSECGKAFFQRSDLFRHLRIHTG
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KSD EKPYICNECGKGFPGKRNLIVHQRNHTGEKSYICSECGKGFTGKSMLIIHQRTHTGEKPY
:::: :.:::::: . .: .::..::::: : :.::::.:: :: : .::: :::::::
NP_001 EKPYECSECGKGFSQNSDLSIHQKTHTGEKHYECNECGKAFTRKSALRMHQRIHTGEKPY
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KSD ICSECGKGFTTKHYVIIHQRNHTGEKPYICNECGKGFTMKSRMIEHQRTHTGEKPYICSE
.:..:::.: : . ::: ::::::: :..:::.:: ::.. ::: :::::::::.:
NP_001 VCADCGKAFIQKSHFNTHQRIHTGEKPYECSDCGKSFTKKSQLHVHQRIHTGEKPYICTE
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KSD CGKGFPRKSNLIVHQRNHTVEKSYLCSECGKGFTVKSMLIIHQRTHTGEKPYTCSECGKG
::: : ...:: .::..:: :: :.:.::::.:: .: :: ::.:::::::: :. :::.
NP_001 CGKVFTHRTNLTTHQKTHTGEKPYMCAECGKAFTDQSNLIKHQKTHTGEKPYKCNGCGKA
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KSD FPLKSRLIVHQRTHTGEKPYRCSECGKGFIVNSGLMLHQRTHTGEKPYICNECGKGFAFK
: :::: .::..: ::. :.:..:::.:: .: : .::: :::::::.: ::::.: :
NP_001 FIWKSRLKIHQKSHIGERHYECKDCGKAFIQKSTLSVHQRIHTGEKPYVCPECGKAFIQK
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570 580
pF1KSD SNLVVHQRTHTGEKPFMCSECGKGFTMKRYLIVHQQIHTEEKSCICSECGRGFAKETELA
:....:.: ::::::. ::.::: :: : : :::.::: :: ::.:::..:. ...:
NP_001 SHFIAHHRIHTGEKPYECSDCGKCFTKKSQLRVHQKIHTGEKPNICAECGKAFTDRSNLI
540 550 560 570 580 590
590 600 610 620 630 640
pF1KSD LHKQVHTGEKPYGCNECGKGFTMKSRLIVHQRTHTGEKPFVCSECRKAFSSKRNLIVHQR
:...:: :::: :..::: :: :::: .::..::::. . ::.: ::: .: .: .::
NP_001 THQKIHTREKPYECGDCGKTFTWKSRLNIHQKSHTGERHYECSKCGKAFIQKATLSMHQI
600 610 620 630 640 650
650
pF1KSD THNGNKP
:.:.::
NP_001 IHTGKKPYACTECQKAFTDRSNLIKHQKMHSGEKRYKASD
660 670 680 690
>>NP_001311068 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 iso (693 aa)
initn: 3875 init1: 2011 opt: 2050 Z-score: 1033.2 bits: 201.5 E(85289): 8.3e-51
Smith-Waterman score: 2055; 47.9% identity (71.4% similar) in 637 aa overlap (27-652:38-660)
10 20 30 40 50
pF1KSD MINAQELLTLEDVTVEFTWEEWQLLGPFQKDLYRDVMLEIYSNLLSM-GYQVSKPD
:. .: ... :.... .. : .. .
NP_001 HQSCSGEAIGKMQQQGIPGGIFFHCERFDQPIGEDSLCSILEELWQDNDQLEQRQENQNN
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100
pF1KSD ALSKL-----ERGEEPWTMEDERH--SRICPENNEVDDHLQDHLENQRMLKSVEQYHEHN
::.. ::: : ..: : ... : ... : : .:: . . :.::
NP_001 LLSHVKVLIKERGYEHKNIEKIIHVTTKLVPSIKRL--HNCD-----TILKHTLNSHNHN
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KSD AFGNTASQTKSLCLFRENHDTFELYIKTLKSNLSLVNQNKSCEINNSTKFSGDGKSFLHG
: ::.: . : ..: .. :.. . .. : ::: .. : . .. :
NP_001 ----RNSATKNLGKIFGNGNNFPHSPSSTKNENAKTGAN-SCEHDHYEKHLSHKQAPTH-
130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KSD NYEELYSAAKFSVSTKAN---STKSQVSKHQRTHEIEKNHVCSECGKAFVKKSQLTDHER
..... :. : :. . ::.. .::: : ::.. :.. .:.: .: :. :
NP_001 -HQKIHPEEKLYVCTECVMGFTQKSHLFEHQRIHAGEKSRECDKSNKVFPQKPQVDVHPS
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KSD VHTGEKPYGCTLCAKVFSRKSRLNEHQRIHKREKSFICSECGKVFTMKSRLIEHQRTHTG
:.:::::: :: :.:::. :: : ::.:: .: . ::::::.: ..: :..: : :::
NP_001 VYTGEKPYLCTQCGKVFTLKSNLITHQKIHTGQKPYKCSECGKAFFQRSDLFRHLRIHTG
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KSD EKPYICNECGKGFPGKRNLIVHQRNHTGEKSYICSECGKGFTGKSMLIIHQRTHTGEKPY
:::: :.:::::: . .: .::..::::: : :.::::.:: :: : .::: :::::::
NP_001 EKPYECSECGKGFSQNSDLSIHQKTHTGEKHYECNECGKAFTRKSALRMHQRIHTGEKPY
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KSD ICSECGKGFTTKHYVIIHQRNHTGEKPYICNECGKGFTMKSRMIEHQRTHTGEKPYICSE
.:..:::.: : . ::: ::::::: :..:::.:: ::.. ::: :::::::::.:
NP_001 VCADCGKAFIQKSHFNTHQRIHTGEKPYECSDCGKSFTKKSQLHVHQRIHTGEKPYICTE
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KSD CGKGFPRKSNLIVHQRNHTVEKSYLCSECGKGFTVKSMLIIHQRTHTGEKPYTCSECGKG
::: : ...:: .::..:: :: :.:.::::.:: .: :: ::.:::::::: :. :::.
NP_001 CGKVFTHRTNLTTHQKTHTGEKPYMCAECGKAFTDQSNLIKHQKTHTGEKPYKCNGCGKA
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KSD FPLKSRLIVHQRTHTGEKPYRCSECGKGFIVNSGLMLHQRTHTGEKPYICNECGKGFAFK
: :::: .::..: ::. :.:..:::.:: .: : .::: :::::::.: ::::.: :
NP_001 FIWKSRLKIHQKSHIGERHYECKDCGKAFIQKSTLSVHQRIHTGEKPYVCPECGKAFIQK
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570 580
pF1KSD SNLVVHQRTHTGEKPFMCSECGKGFTMKRYLIVHQQIHTEEKSCICSECGRGFAKETELA
:....:.: ::::::. ::.::: :: : : :::.::: :: ::.:::..:. ...:
NP_001 SHFIAHHRIHTGEKPYECSDCGKCFTKKSQLRVHQKIHTGEKPNICAECGKAFTDRSNLI
540 550 560 570 580 590
590 600 610 620 630 640
pF1KSD LHKQVHTGEKPYGCNECGKGFTMKSRLIVHQRTHTGEKPFVCSECRKAFSSKRNLIVHQR
:...:: :::: :..::: :: :::: .::..::::. . ::.: ::: .: .: .::
NP_001 THQKIHTREKPYECGDCGKTFTWKSRLNIHQKSHTGERHYECSKCGKAFIQKATLSMHQI
600 610 620 630 640 650
650
pF1KSD THNGNKP
:.:.::
NP_001 IHTGKKPYACTECQKAFTDRSNLIKHQKMHSGEKRYKASD
660 670 680 690
>>NP_001311078 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 iso (693 aa)
initn: 3875 init1: 2011 opt: 2050 Z-score: 1033.2 bits: 201.5 E(85289): 8.3e-51
Smith-Waterman score: 2055; 47.9% identity (71.4% similar) in 637 aa overlap (27-652:38-660)
10 20 30 40 50
pF1KSD MINAQELLTLEDVTVEFTWEEWQLLGPFQKDLYRDVMLEIYSNLLSM-GYQVSKPD
:. .: ... :.... .. : .. .
NP_001 HQSCSGEAIGKMQQQGIPGGIFFHCERFDQPIGEDSLCSILEELWQDNDQLEQRQENQNN
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100
pF1KSD ALSKL-----ERGEEPWTMEDERH--SRICPENNEVDDHLQDHLENQRMLKSVEQYHEHN
::.. ::: : ..: : ... : ... : : .:: . . :.::
NP_001 LLSHVKVLIKERGYEHKNIEKIIHVTTKLVPSIKRL--HNCD-----TILKHTLNSHNHN
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KSD AFGNTASQTKSLCLFRENHDTFELYIKTLKSNLSLVNQNKSCEINNSTKFSGDGKSFLHG
: ::.: . : ..: .. :.. . .. : ::: .. : . .. :
NP_001 ----RNSATKNLGKIFGNGNNFPHSPSSTKNENAKTGAN-SCEHDHYEKHLSHKQAPTH-
130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KSD NYEELYSAAKFSVSTKAN---STKSQVSKHQRTHEIEKNHVCSECGKAFVKKSQLTDHER
..... :. : :. . ::.. .::: : ::.. :.. .:.: .: :. :
NP_001 -HQKIHPEEKLYVCTECVMGFTQKSHLFEHQRIHAGEKSRECDKSNKVFPQKPQVDVHPS
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KSD VHTGEKPYGCTLCAKVFSRKSRLNEHQRIHKREKSFICSECGKVFTMKSRLIEHQRTHTG
:.:::::: :: :.:::. :: : ::.:: .: . ::::::.: ..: :..: : :::
NP_001 VYTGEKPYLCTQCGKVFTLKSNLITHQKIHTGQKPYKCSECGKAFFQRSDLFRHLRIHTG
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KSD EKPYICNECGKGFPGKRNLIVHQRNHTGEKSYICSECGKGFTGKSMLIIHQRTHTGEKPY
:::: :.:::::: . .: .::..::::: : :.::::.:: :: : .::: :::::::
NP_001 EKPYECSECGKGFSQNSDLSIHQKTHTGEKHYECNECGKAFTRKSALRMHQRIHTGEKPY
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KSD ICSECGKGFTTKHYVIIHQRNHTGEKPYICNECGKGFTMKSRMIEHQRTHTGEKPYICSE
.:..:::.: : . ::: ::::::: :..:::.:: ::.. ::: :::::::::.:
NP_001 VCADCGKAFIQKSHFNTHQRIHTGEKPYECSDCGKSFTKKSQLHVHQRIHTGEKPYICTE
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KSD CGKGFPRKSNLIVHQRNHTVEKSYLCSECGKGFTVKSMLIIHQRTHTGEKPYTCSECGKG
::: : ...:: .::..:: :: :.:.::::.:: .: :: ::.:::::::: :. :::.
NP_001 CGKVFTHRTNLTTHQKTHTGEKPYMCAECGKAFTDQSNLIKHQKTHTGEKPYKCNGCGKA
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KSD FPLKSRLIVHQRTHTGEKPYRCSECGKGFIVNSGLMLHQRTHTGEKPYICNECGKGFAFK
: :::: .::..: ::. :.:..:::.:: .: : .::: :::::::.: ::::.: :
NP_001 FIWKSRLKIHQKSHIGERHYECKDCGKAFIQKSTLSVHQRIHTGEKPYVCPECGKAFIQK
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570 580
pF1KSD SNLVVHQRTHTGEKPFMCSECGKGFTMKRYLIVHQQIHTEEKSCICSECGRGFAKETELA
:....:.: ::::::. ::.::: :: : : :::.::: :: ::.:::..:. ...:
NP_001 SHFIAHHRIHTGEKPYECSDCGKCFTKKSQLRVHQKIHTGEKPNICAECGKAFTDRSNLI
540 550 560 570 580 590
590 600 610 620 630 640
pF1KSD LHKQVHTGEKPYGCNECGKGFTMKSRLIVHQRTHTGEKPFVCSECRKAFSSKRNLIVHQR
:...:: :::: :..::: :: :::: .::..::::. . ::.: ::: .: .: .::
NP_001 THQKIHTREKPYECGDCGKTFTWKSRLNIHQKSHTGERHYECSKCGKAFIQKATLSMHQI
600 610 620 630 640 650
650
pF1KSD THNGNKP
:.:.::
NP_001 IHTGKKPYACTECQKAFTDRSNLIKHQKMHSGEKRYKASD
660 670 680 690
>>NP_001311086 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 iso (743 aa)
initn: 3875 init1: 2011 opt: 2050 Z-score: 1033.0 bits: 201.6 E(85289): 8.5e-51
Smith-Waterman score: 2276; 49.4% identity (70.3% similar) in 688 aa overlap (8-652:27-710)
10 20 30 40
pF1KSD MINAQELLTLEDVTVEFTWEEWQLLGPFQKDLYRDVMLEIY
...:::::.:. :::: : : :. :: :: :: :
NP_001 MAANGDSPPWSPALAAEGRGSSCEASVSFEDVTVDFSKEEWQHLDPAQRRLYWDVTLENY
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KSD SNLLSMGYQVSKPDALSKLERGEEPWTMEDERHSRICPENNEVD-DHLQDHLENQRMLKS
:.:::.:::. : .: :::.:: :: .: : . : :. : :.:... ::: : :
NP_001 SHLLSVGYQIPKSEAAFKLEQGEGPWMLEGEAPHQSCSEELWQDNDQLEQRQENQNNLLS
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150
pF1KSD ------VEQYHEHNAFGNTASQTKSLC-LFRENHDTFELYIKTLKSNLSLVNQNKSCEIN
:. .::. . . : .: ... :. . .::.:. :.:.. .
NP_001 HVKVLIKERGYEHKNIEKIIHVTTKLVPSIKRLHNCDTILKHTLNSH----NHNRNSATK
130 140 150 160 170
160 170 180 190 200
pF1KSD NSTKFSGDGKSFLHGNYEELYSAAKFSVST-------KANSTKSQVSKHQRTHEIEKNHV
: :. :.:..: :. :: .... : : :. ..::. : :: .:
NP_001 NLGKIFGNGNNFPHSPSSTKNENAKTGANSCEHDHYEKHLSHKQAPTHHQKIHPEEKLYV
180 190 200 210 220 230
210 220 230
pF1KSD CSECGKAFVKKSQLTDHERVH----------------------------TGEKPYGCTLC
:.:: .:..::.: .:.:.: :::::: :: :
NP_001 CTECVMGFTQKSHLFEHQRIHAGEKSRECDKSNKVFPQKPQVDVHPSVYTGEKPYLCTQC
240 250 260 270 280 290
240 250 260 270 280 290
pF1KSD AKVFSRKSRLNEHQRIHKREKSFICSECGKVFTMKSRLIEHQRTHTGEKPYICNECGKGF
.:::. :: : ::.:: .: . ::::::.: ..: :..: : ::::::: :.::::::
NP_001 GKVFTLKSNLITHQKIHTGQKPYKCSECGKAFFQRSDLFRHLRIHTGEKPYECSECGKGF
300 310 320 330 340 350
300 310 320 330 340 350
pF1KSD PGKRNLIVHQRNHTGEKSYICSECGKGFTGKSMLIIHQRTHTGEKPYICSECGKGFTTKH
. .: .::..::::: : :.::::.:: :: : .::: :::::::.:..:::.: :
NP_001 SQNSDLSIHQKTHTGEKHYECNECGKAFTRKSALRMHQRIHTGEKPYVCADCGKAFIQKS
360 370 380 390 400 410
360 370 380 390 400 410
pF1KSD YVIIHQRNHTGEKPYICNECGKGFTMKSRMIEHQRTHTGEKPYICSECGKGFPRKSNLIV
. ::: ::::::: :..:::.:: ::.. ::: :::::::::.:::: : ...:: .
NP_001 HFNTHQRIHTGEKPYECSDCGKSFTKKSQLHVHQRIHTGEKPYICTECGKVFTHRTNLTT
420 430 440 450 460 470
420 430 440 450 460 470
pF1KSD HQRNHTVEKSYLCSECGKGFTVKSMLIIHQRTHTGEKPYTCSECGKGFPLKSRLIVHQRT
::..:: :: :.:.::::.:: .: :: ::.:::::::: :. :::.: :::: .::..
NP_001 HQKTHTGEKPYMCAECGKAFTDQSNLIKHQKTHTGEKPYKCNGCGKAFIWKSRLKIHQKS
480 490 500 510 520 530
480 490 500 510 520 530
pF1KSD HTGEKPYRCSECGKGFIVNSGLMLHQRTHTGEKPYICNECGKGFAFKSNLVVHQRTHTGE
: ::. :.:..:::.:: .: : .::: :::::::.: ::::.: ::....:.: ::::
NP_001 HIGERHYECKDCGKAFIQKSTLSVHQRIHTGEKPYVCPECGKAFIQKSHFIAHHRIHTGE
540 550 560 570 580 590
540 550 560 570 580 590
pF1KSD KPFMCSECGKGFTMKRYLIVHQQIHTEEKSCICSECGRGFAKETELALHKQVHTGEKPYG
::. ::.::: :: : : :::.::: :: ::.:::..:. ...: :...:: ::::
NP_001 KPYECSDCGKCFTKKSQLRVHQKIHTGEKPNICAECGKAFTDRSNLITHQKIHTREKPYE
600 610 620 630 640 650
600 610 620 630 640 650
pF1KSD CNECGKGFTMKSRLIVHQRTHTGEKPFVCSECRKAFSSKRNLIVHQRTHNGNKP
:..::: :: :::: .::..::::. . ::.: ::: .: .: .:: :.:.::
NP_001 CGDCGKTFTWKSRLNIHQKSHTGERHYECSKCGKAFIQKATLSMHQIIHTGKKPYACTEC
660 670 680 690 700 710
NP_001 QKAFTDRSNLIKHQKMHSGEKRYKASD
720 730 740
652 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 03:13:22 2016 done: Thu Nov 3 03:13:23 2016
Total Scan time: 7.390 Total Display time: 0.160
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]