Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA0781
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0781, 926 aa
1>>>pF1KSDA0781 926 - 926 aa - 926 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 14.0170+/-0.00132; mu= -13.6648+/- 0.080
mean_var=729.3115+/-152.459, 0's: 0 Z-trim(115.1): 543 B-trim: 0 in 0/55
Lambda= 0.047492
statistics sampled from 15048 (15618) to 15048 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.761), E-opt: 0.2 (0.48), width: 16
Scan time: 4.550
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS8347.1 SIK2 gene_id:23235|Hs108|chr11 ( 926) 6274 445.8 1.7e-124
CCDS82645.1 LOC102724428 gene_id:102724428|Hs108|c ( 783) 1719 133.7 1.4e-30
CCDS33575.1 SIK1 gene_id:150094|Hs108|chr21 ( 783) 1719 133.7 1.4e-30
CCDS8379.2 SIK3 gene_id:23387|Hs108|chr11 (1321) 1558 122.9 4e-27
CCDS60974.1 SIK3 gene_id:23387|Hs108|chr11 (1261) 1489 118.1 1e-25
CCDS45166.1 MARK3 gene_id:4140|Hs108|chr14 ( 744) 1208 98.6 4.5e-20
CCDS41993.1 MARK3 gene_id:4140|Hs108|chr14 ( 729) 1206 98.5 4.9e-20
CCDS45165.1 MARK3 gene_id:4140|Hs108|chr14 ( 753) 1204 98.4 5.5e-20
CCDS55947.1 MARK3 gene_id:4140|Hs108|chr14 ( 713) 1186 97.1 1.3e-19
CCDS53651.1 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11 ( 709) 1183 96.9 1.4e-19
CCDS53650.1 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11 ( 719) 1183 96.9 1.5e-19
CCDS8051.2 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11 ( 724) 1183 96.9 1.5e-19
CCDS41665.1 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11 ( 745) 1183 96.9 1.5e-19
CCDS53649.1 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11 ( 788) 1183 97.0 1.5e-19
CCDS73034.1 MARK1 gene_id:4139|Hs108|chr1 ( 780) 1180 96.7 1.8e-19
CCDS31029.2 MARK1 gene_id:4139|Hs108|chr1 ( 795) 1180 96.8 1.8e-19
CCDS73033.1 MARK1 gene_id:4139|Hs108|chr1 ( 796) 1180 96.8 1.8e-19
CCDS12658.1 MARK4 gene_id:57787|Hs108|chr19 ( 688) 1174 96.3 2.2e-19
CCDS56097.1 MARK4 gene_id:57787|Hs108|chr19 ( 752) 1174 96.3 2.3e-19
CCDS605.1 PRKAA2 gene_id:5563|Hs108|chr1 ( 552) 977 82.7 2.2e-15
CCDS3932.2 PRKAA1 gene_id:5562|Hs108|chr5 ( 559) 976 82.6 2.3e-15
CCDS41590.1 BRSK2 gene_id:9024|Hs108|chr11 ( 668) 973 82.5 3e-15
CCDS58106.1 BRSK2 gene_id:9024|Hs108|chr11 ( 674) 973 82.5 3e-15
CCDS58107.1 BRSK2 gene_id:9024|Hs108|chr11 ( 736) 973 82.5 3.2e-15
CCDS12921.1 BRSK1 gene_id:84446|Hs108|chr19 ( 778) 972 82.5 3.4e-15
CCDS43075.1 SNRK gene_id:54861|Hs108|chr3 ( 765) 937 80.1 1.8e-14
CCDS58108.1 BRSK2 gene_id:9024|Hs108|chr11 ( 766) 918 78.8 4.4e-14
CCDS3943.1 NIM1K gene_id:167359|Hs108|chr5 ( 436) 895 76.9 9.1e-14
CCDS65789.1 MARK1 gene_id:4139|Hs108|chr1 ( 758) 866 75.2 5.2e-13
CCDS60696.1 BRSK2 gene_id:9024|Hs108|chr11 ( 614) 846 73.7 1.2e-12
CCDS1453.2 NUAK2 gene_id:81788|Hs108|chr1 ( 672) 790 70.0 1.8e-11
CCDS31892.1 NUAK1 gene_id:9891|Hs108|chr12 ( 661) 788 69.8 1.9e-11
CCDS59123.1 MELK gene_id:9833|Hs108|chr9 ( 610) 784 69.5 2.2e-11
CCDS6606.1 MELK gene_id:9833|Hs108|chr9 ( 651) 772 68.7 4.1e-11
>>CCDS8347.1 SIK2 gene_id:23235|Hs108|chr11 (926 aa)
initn: 6274 init1: 6274 opt: 6274 Z-score: 2348.5 bits: 445.8 E(32554): 1.7e-124
Smith-Waterman score: 6274; 100.0% identity (100.0% similar) in 926 aa overlap (1-926:1-926)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MVMADGPRHLQRGPVRVGFYDIEGTLGKGNFAVVKLGRHRITKTEVAIKIIDKSQLDAVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 MVMADGPRHLQRGPVRVGFYDIEGTLGKGNFAVVKLGRHRITKTEVAIKIIDKSQLDAVN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD LEKIYREVQIMKMLDHPHIIKLYQVMETKSMLYLVTEYAKNGEIFDYLANHGRLNESEAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 LEKIYREVQIMKMLDHPHIIKLYQVMETKSMLYLVTEYAKNGEIFDYLANHGRLNESEAR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD RKFWQILSAVDYCHGRKIVHRDLKAENLLLDNNMNIKIADFGFGNFFKSGELLATWCGSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 RKFWQILSAVDYCHGRKIVHRDLKAENLLLDNNMNIKIADFGFGNFFKSGELLATWCGSP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD PYAAPEVFEGQQYEGPQLDIWSMGVVLYVLVCGALPFDGPTLPILRQRVLEGRFRIPYFM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 PYAAPEVFEGQQYEGPQLDIWSMGVVLYVLVCGALPFDGPTLPILRQRVLEGRFRIPYFM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD SEDCEHLIRRMLVLDPSKRLTIAQIKEHKWMLIEVPVQRPVLYPQEQENEPSIGEFNEQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 SEDCEHLIRRMLVLDPSKRLTIAQIKEHKWMLIEVPVQRPVLYPQEQENEPSIGEFNEQV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD LRLMHSLGIDQQKTIESLQNKSYNHFAAIYFLLVERLKSHRSSFPVEQRLDGRQRRPSTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 LRLMHSLGIDQQKTIESLQNKSYNHFAAIYFLLVERLKSHRSSFPVEQRLDGRQRRPSTI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD AEQTVAKAQTVGLPVTMHSPNMRLLRSALLPQASNVEAFSFPASGCQAEAAFMEEECVDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 AEQTVAKAQTVGLPVTMHSPNMRLLRSALLPQASNVEAFSFPASGCQAEAAFMEEECVDT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD PKVNGCLLDPVPPVLVRKGCQSLPSNMMETSIDEGLETEGEAEEDPAHAFEAFQSTRSGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 PKVNGCLLDPVPPVLVRKGCQSLPSNMMETSIDEGLETEGEAEEDPAHAFEAFQSTRSGQ
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD RRHTLSEVTNQLVVMPGAGKIFSMNDSPSLDSVDSEYDMGSVQRDLNFLEDNPSLKDIML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 RRHTLSEVTNQLVVMPGAGKIFSMNDSPSLDSVDSEYDMGSVQRDLNFLEDNPSLKDIML
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD ANQPSPRMTSPFISLRPTNPAMQALSSQKREVHNRSPVSFREGRRASDTSLTQGIVAFRQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 ANQPSPRMTSPFISLRPTNPAMQALSSQKREVHNRSPVSFREGRRASDTSLTQGIVAFRQ
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD HLQNLARTKGILELNKVQLLYEQIGPEADPNLAPAAPQLQDLASSCPQEEVSQQQESVST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 HLQNLARTKGILELNKVQLLYEQIGPEADPNLAPAAPQLQDLASSCPQEEVSQQQESVST
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD LPASVHPQLSPRQSLETQYLQHRLQKPSLLSKAQNTCQLYCKEPPRSLEQQLQEHRLQQK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 LPASVHPQLSPRQSLETQYLQHRLQKPSLLSKAQNTCQLYCKEPPRSLEQQLQEHRLQQK
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD RLFLQKQSQLQAYFNQMQIAESSYPQPSQQLPLPRQETPPPSQQAPPFSLTQPLSPVLEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 RLFLQKQSQLQAYFNQMQIAESSYPQPSQQLPLPRQETPPPSQQAPPFSLTQPLSPVLEP
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD SSEQMQYSPFLSQYQEMQLQPLPSTSGPRAAPPLPTQLQQQQPPPPPPPPPPRQPGAAPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 SSEQMQYSPFLSQYQEMQLQPLPSTSGPRAAPPLPTQLQQQQPPPPPPPPPPRQPGAAPA
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD PLQFSYQTCELPSAASPAPDYPTPCQYPVDGAQQSDLTGPDCPRSPGLQEAPSSYDPLAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 PLQFSYQTCELPSAASPAPDYPTPCQYPVDGAQQSDLTGPDCPRSPGLQEAPSSYDPLAL
850 860 870 880 890 900
910 920
pF1KSD SELPGLFDCEMLDAVDPQHNGYVLVN
::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 SELPGLFDCEMLDAVDPQHNGYVLVN
910 920
>>CCDS82645.1 LOC102724428 gene_id:102724428|Hs108|chr21 (783 aa)
initn: 1965 init1: 1497 opt: 1719 Z-score: 662.7 bits: 133.7 E(32554): 1.4e-30
Smith-Waterman score: 2024; 44.7% identity (65.9% similar) in 857 aa overlap (6-851:13-768)
10 20 30 40 50
pF1KSD MVMADGPRHLQRGPVRVGFYDIEGTLGKGNFAVVKLGRHRITKTEVAIKIIDK
: . :. :.:::::::: ::::::::::::.:::.:::.::::::::
CCDS82 MVIMSEFSADPAGQGQGQQKPLRVGFYDIERTLGKGNFAVVKLARHRVTKTQVAIKIIDK
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KSD SQLDAVNLEKIYREVQIMKMLDHPHIIKLYQVMETKSMLYLVTEYAKNGEIFDYLANHGR
..::. ::::::::::.::.:.::::::::::::::.:::.:::.:::::.::::...:.
CCDS82 TRLDSSNLEKIYREVQLMKLLNHPHIIKLYQVMETKDMLYIVTEFAKNGEMFDYLTSNGH
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KSD LNESEARRKFWQILSAVDYCHGRKIVHRDLKAENLLLDNNMNIKIADFGFGNFFKSGELL
:.:.:::.:::::::::.::: ..:::::::.::::::.::.::.::::::::.:::: :
CCDS82 LSENEARKKFWQILSAVEYCHDHHIVHRDLKTENLLLDGNMDIKLADFGFGNFYKSGEPL
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KSD ATWCGSPPYAAPEVFEGQQYEGPQLDIWSMGVVLYVLVCGALPFDGPTLPILRQRVLEGR
.::::::::::::::::..::::::::::.::::::::::.::::::.:: :::::::::
CCDS82 STWCGSPPYAAPEVFEGKEYEGPQLDIWSLGVVLYVLVCGSLPFDGPNLPTLRQRVLEGR
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KSD FRIPYFMSEDCEHLIRRMLVLDPSKRLTIAQIKEHKWMLIEVPVQRPVLYPQEQENEPS-
::::.:::.::: :::::::.::..:.:::::..:.:: : . :. .. :
CCDS82 FRIPFFMSQDCESLIRRMLVVDPARRITIAQIRQHRWMRAEPCLPGPACPAFSAHSYTSN
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KSD IGEFNEQVLRLMHSLGIDQQKTIESLQNKSYNHFAAIYFLLVERLKSHRSSFPVEQRLDG
.:...::.: .:..::.:.:.:.:::::.:::::::::.::.:::: .:.. . .
CCDS82 LGDYDEQALGIMQTLGVDRQRTVESLQNSSYNHFAAIYYLLLERLKEYRNA-QCARPGPA
310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KSD RQRRPSTIAEQTVAKAQTVGLPVTMHSPNMRLLRSALL-PQASNVEAFSFPAS-GCQAEA
:: :: . .. :: : ... . .: ::: :: ... . : :. ..
CCDS82 RQPRPRS--------SDLSGLEVPQEGLSTDPFRPALLCPQPQTLVQSVLQAEMDCELQS
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KSD AFMEEECVDTPKVNGCLLDPVPPVLVRKGCQSLPSNMMETSIDEGLETEGEAEEDPAHAF
... . . .. : : ::....:.:.: . .: . :. .
CCDS82 SLQWPLFFPVDASCSGVFRPRP---------VSPSSLLDTAISEEAR-QGPGLEEEQDTQ
420 430 440 450 460
480 490 500 510 520
pF1KSD EAFQSTRSGQRRHTLSEVTNQLVVMPGAGKIFSMND--SPSLD-SVDSEYDMGSVQRDLN
:.. :. .: :::::.::...: . . . : . ::. : :: . :....
CCDS82 ESLPSS-TG-RRHTLAEVSTRLSPLTAPCIVVSPSTTASPAEGTSSDSCLTF-SASKSPA
470 480 490 500 510
530 540 550 560 570 580
pF1KSD FLEDNPSLKDIMLANQPSPRMTSPFISLRPTNPAMQALSSQKREVHNRSPVSFREGRRAS
: .:. . .. : .: :..:::.. . ..:..:: .. : ::::.::::::
CCDS82 GLSGTPATQGLLGACSPV-RLASPFLGSQSATPVLQAQGGLGGAVL--LPVSFQEGRRAS
520 530 540 550 560 570
590 600 610 620 630 640
pF1KSD DTSLTQGIVAFRQHLQNLARTKGILELNKVQLLYEQIGPEADPNLAPAAPQLQDLASSCP
:::::::. ::::.:.. .::::.: :::.. : .:. . :
CCDS82 DTSLTQGLKAFRQQLRKTTRTKGFLGLNKIKGLARQV-------------------CQVP
580 590 600 610
650 660 670 680 690 700
pF1KSD QEEVSQQQESVSTLPASVHPQLSPRQSLETQYLQHRLQKPSLLSKAQNTCQLYCKEPPRS
..:. ... : .: :: :.: . : .. .:
CCDS82 ASRASR---------GGLSPFHAPAQS------------PGLHGGAAGS-----REGWSL
620 630 640 650
710 720 730 740 750 760
pF1KSD LEQQLQEHRLQQKRLFLQKQSQLQAYFNQMQIAESSYPQPSQQLPLPRQETP---PPSQQ
::. :...:: : ::.. .: :::. : : .: : .
CCDS82 LEEVLEQQRLLQ----LQHHPAAAPGCSQA-------PQPA---PAPFVIAPCDGPGAAP
660 670 680 690
770 780 790 800 810 820
pF1KSD APPFSLTQPLSPVLEPSSEQMQYSPFLSQYQEMQLQPLPSTSGPRAAPPLPTQLQQQQPP
: ::. : :.: : : :: : : .. . : .:: : : .:
CCDS82 LPSTLLTSGL-PLLPPPLLQTGASPVASAAQLLDTH-LHIGTGPTALPAVP---------
700 710 720 730 740
830 840 850 860 870 880
pF1KSD PPPPPPPPRQPGAAPA--PLQFSYQTCELPSAASPAPDYPTPCQYPVDGAQQSDLTGPDC
::: ::. :: . ::.
CCDS82 ------PPRLARLAPGCEPLGLLQGDCEMEDLMPCSLGTFVLVQ
750 760 770 780
>>CCDS33575.1 SIK1 gene_id:150094|Hs108|chr21 (783 aa)
initn: 1965 init1: 1497 opt: 1719 Z-score: 662.7 bits: 133.7 E(32554): 1.4e-30
Smith-Waterman score: 2025; 45.0% identity (65.9% similar) in 857 aa overlap (6-851:13-768)
10 20 30 40 50
pF1KSD MVMADGPRHLQRGPVRVGFYDIEGTLGKGNFAVVKLGRHRITKTEVAIKIIDK
: . :. :.:::::::: ::::::::::::.:::.:::.::::::::
CCDS33 MVIMSEFSADPAGQGQGQQKPLRVGFYDIERTLGKGNFAVVKLARHRVTKTQVAIKIIDK
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KSD SQLDAVNLEKIYREVQIMKMLDHPHIIKLYQVMETKSMLYLVTEYAKNGEIFDYLANHGR
..::. ::::::::::.::.:.::::::::::::::.:::.:::.:::::.::::...:.
CCDS33 TRLDSSNLEKIYREVQLMKLLNHPHIIKLYQVMETKDMLYIVTEFAKNGEMFDYLTSNGH
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KSD LNESEARRKFWQILSAVDYCHGRKIVHRDLKAENLLLDNNMNIKIADFGFGNFFKSGELL
:.:.:::.:::::::::.::: ..:::::::.::::::.::.::.::::::::.:::: :
CCDS33 LSENEARKKFWQILSAVEYCHDHHIVHRDLKTENLLLDGNMDIKLADFGFGNFYKSGEPL
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KSD ATWCGSPPYAAPEVFEGQQYEGPQLDIWSMGVVLYVLVCGALPFDGPTLPILRQRVLEGR
.::::::::::::::::..::::::::::.::::::::::.::::::.:: :::::::::
CCDS33 STWCGSPPYAAPEVFEGKEYEGPQLDIWSLGVVLYVLVCGSLPFDGPNLPTLRQRVLEGR
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KSD FRIPYFMSEDCEHLIRRMLVLDPSKRLTIAQIKEHKWMLIEVPVQRPVLYPQEQENEPS-
::::.:::.::: :::::::.::..:.:::::..:.:: : . :. .. :
CCDS33 FRIPFFMSQDCESLIRRMLVVDPARRITIAQIRQHRWMRAEPCLPGPACPAFSAHSYTSN
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KSD IGEFNEQVLRLMHSLGIDQQKTIESLQNKSYNHFAAIYFLLVERLKSHRSSFPVEQRLDG
.:...::.: .:..::.:.:.:.:::::.:::::::::.::.:::: .:.. . .
CCDS33 LGDYDEQALGIMQTLGVDRQRTVESLQNSSYNHFAAIYYLLLERLKEYRNA-QCARPGPA
310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KSD RQRRPSTIAEQTVAKAQTVGLPVTMHSPNMRLLRSALL-PQASNVEAFSFPAS-GCQAEA
:: :: . .. :: : ... . .: ::: :: ... . : :. ..
CCDS33 RQPRPRS--------SDLSGLEVPQEGLSTDPFRPALLCPQPQTLVQSVLQAEMDCELQS
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KSD AFMEEECVDTPKVNGCLLDPVPPVLVRKGCQSLPSNMMETSIDEGLETEGEAEEDPAHAF
... . . .. : : ::....:.:.: . .: . :. .
CCDS33 SLQWPLFFPVDASCSGVFRPRP---------VSPSSLLDTAISEEAR-QGPGLEEEQDTQ
420 430 440 450 460
480 490 500 510 520
pF1KSD EAFQSTRSGQRRHTLSEVTNQLVVMPGAGKIFSMND--SPSLD-SVDSEYDMGSVQRDLN
:.. :. .: :::::.::...: . . . : . ::. : :: . :....
CCDS33 ESLPSS-TG-RRHTLAEVSTRLSPLTAPCIVVSPSTTASPAEGTSSDSCLTF-SASKSPA
470 480 490 500 510
530 540 550 560 570 580
pF1KSD FLEDNPSLKDIMLANQPSPRMTSPFISLRPTNPAMQALSSQKREVHNRSPVSFREGRRAS
: .:. . .. : .: :..:::.. . ..:..:: .. : ::::.::::::
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:::::::. ::::.:.. .::::.: :::.. : .:. :::. ::
CCDS33 DTSLTQGLKAFRQQLRKTTRTKGFLGLNKIKGLARQV------CQAPASR-----ASR--
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pF1KSD QEEVSQQQESVSTLPASVHPQLSPRQSLETQYLQHRLQKPSLLSKAQNTCQLYCKEPPRS
... : .: :: :.: . : .. .:
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::. :...:: : ::.. .: :::. : : .: : .
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: ::. : :.: : : :: : : .. . : .:: : : .:
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40 50 60 70 80 90
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220 230 240 250 260 270
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340 350 360 370 380
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390 400 410 420 430 440
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:. . :: : . . .. :: : : .::: ...
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.: . : :. : .: : .: . . . :.: . : . : :.
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. :.:. ... :: . : . : .:. .: .. :: ::.... :. ::.
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.:..:. . : . :. : :: :: . . : ::. ::....
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. : : . .: : :.: . : : :. : .. : :::. : .. . .
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780 790 800 810 820
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. :: . .. :: .:.: .. : .: : : :: ::. ..
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830 840 850 860 870 880
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CCDS83 PSAHQQPPHYTTSALQQALLSPTPPDYTRHQQVPHILQGLLSPRHSLTGHSDIRLPPTEF
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CCDS60 DADPNFDRLIAECQQLKEERQVDPLNEDVLLAMEDMGLDKEQTLQAEQAGTAMNISVPQV
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:.. .. ... ... .:.. : .... . .:::. . .. :. :..
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.: . . :. . . . :... ... ..::. : : . . .:.
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. :.. .: :.: :. .::: : : : . . ..:. .. .:
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CCDS60 PSPPLQAACENQPALLTHQLQRLRIQPSSPPPNHPNNHLFRQPSNSPPPMSSAMIQPHGA
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CCDS60 ASSSQF-QGLPSRSAIFQQ-QPENCSSP-PNVALTCLGMQQPAQSQQVTIQVQEPVDMLS
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. . :: . .. :: .:.: .. : .: : : :: ::. ..
CCDS60 NMPGTAAGSSGRGISISPSAGQMQMQHRTNLMATLSYGHR---PLSKQLSADSAEAHSAH
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830 840 850 860 870 880
pF1KSD PPPRQPGAAPAPLQFSYQTCELPSAASPAPDYPTPCQYP--VDG--AQQSDLTGPDCPRS
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CCDS60 QQP--PHYTTSALQ---QALLSPT---P-PDYTRHQQVPHILQGLLSPRHSLTGHSDIRL
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890 900 910 920
pF1KSD PGLQEAPSSYDPLALSELPGLFDCEMLDAVDPQHNGYVLVN
: . :
CCDS60 PPTEFAQLIKRQQQQRQQQQQQQQQQEYQELFRHMNQGDAGSLAPSLGGQSMTERQALSY
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CCDS45 DGRQEVTSRTSRSGARCRNSIASCADEQPHIGNYRLLKTIGKGNFAKVKLARHILTGREV
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CCDS45 AIKIIDKTQLNPTSLQKLFREVRIMKILNHPNIVKLFEVIETEKTLYLIMEYASGGEVFD
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CCDS45 YLVAHGRMKEKEARSKFRQIVSAVQYCHQKRIVHRDLKAENLLLDADMNIKIADFGFSNE
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CCDS45 FTVGGKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVDVWSLGVILYTLVSGSLPFDGQNLKELR
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230 240 250 260 270 280
pF1KSD QRVLEGRFRIPYFMSEDCEHLIRRMLVLDPSKRLTIAQIKEHKWMLIEVPVQRPVLYPQE
.:::.:..:::..:: :::.:..:.:::.: :: :. :: . .: :.. .. : :
CCDS45 ERVLRGKYRIPFYMSTDCENLLKRFLVLNPIKRGTLEQIMKDRW--INAGHEEDELKP--
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:: . ... . .: ..: .:.. :::.. .:....: :.:: .. . :.
CCDS45 -FVEPELDISDQKRIDIMVGMGYSQEEIQESLSKMKYDEITATYLLLGRKSSELDASDSS
320 330 340 350 360 370
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pF1KSD VEQRLDGRQRRPSTIAEQTVAKA--QTVGLPVTMHSPNMRLLRSALLPQASNVEAFSFPA
. :. . :::. ....... . : :. : ..: . : .: :. .
CCDS45 SSSNLSLAKVRPSSDLNNSTGQSPHHKVQRSVS-SSQKQRRYSDHAGPAIPSVVAYPKRS
380 390 400 410 420 430
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. :.. ..:. ... : :.: . :. :.: : : :. .. : . . .
CCDS45 QTSTADSD-LKEDGISSRKSSGSAVGGKGIAPASPML---GNASNPNKADIPERKKSSTV
440 450 460 470 480 490
460 470 480 490 500 510
pF1KSD ETEGEAEEDPAHAFEAFQSTRSGQRRHTLSEVTNQLVVMPG----AGKIFSMNDSPSLDS
. . : .. : :. ::.. . .. ..: ... :.... . :
CCDS45 PSSNTASGGMTRRNTYVCSERTTADRHSVIQNGKENSTIPDQRTPVASTHSISSAATPDR
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pF1KSD VDSEYDMGSVQRDLNFLEDNPSLKDIMLANQP--SPRMT---SPFISLRPTNPAMQALSS
. .. :...:. .. .: . : : :: .. .:. . : . . . .:.
CCDS45 I--RFPRGTASRST--FHGQPRERRTATYNGPPASPSLSHEATPLSQTR-SRGSTNLFSK
560 570 580 590 600
570 580 590 600 610 620
pF1KSD QKREVHNRSPVSF-REGRRASDTSLTQGIVAFRQHLQNLARTKGILELNKVQLLYEQIGP
.. : :. . :.::
CCDS45 LTSKLTRRLPTEYERNGRYEGSSRNVSAEQKDENKEAKPRSLRFTWSMKTTSSMDPGDMM
610 620 630 640 650 660
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pF1KSD MVMADGPRHLQRGPVRVGFYDIEGTLGKGNFAVVKLGRHRITKTEV
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CCDS41 DGRQEVTSRTSRSGARCRNSIASCADEQPHIGNYRLLKTIGKGNFAKVKLARHILTGREV
30 40 50 60 70 80
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pF1KSD AIKIIDKSQLDAVNLEKIYREVQIMKMLDHPHIIKLYQVMETKSMLYLVTEYAKNGEIFD
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CCDS41 AIKIIDKTQLNPTSLQKLFREVRIMKILNHPNIVKLFEVIETEKTLYLIMEYASGGEVFD
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pF1KSD YLANHGRLNESEARRKFWQILSAVDYCHGRKIVHRDLKAENLLLDNNMNIKIADFGFGNF
::. :::..:.::: :: ::.:::.::: ..:::::::::::::: .::::::::::.:
CCDS41 YLVAHGRMKEKEARSKFRQIVSAVQYCHQKRIVHRDLKAENLLLDADMNIKIADFGFSNE
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CCDS53 YLVAHGRMKEKEARAKFRQIVSAVQYCHQKFIVHRDLKAENLLLDADMNIKIADFGFSNE
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pF1KSD FKSGELLATWCGSPPYAAPEVFEGQQYEGPQLDIWSMGVVLYVLVCGALPFDGPTLPILR
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CCDS53 FTFGNKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVDVWSLGVILYTLVSGSLPFDGQNLKELR
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CCDS53 ERVLRGKYRIPFYMSTDCENLLKKFLILNPSKRGTLEQIMKDRWMNVGHEDDELKPYVEP
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CCDS53 KTQSNNAENKRPEEDRESGRKASSTAKVPASPLPGLERKKTTPTPSTNSVLSTSTNRSRN
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]