FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0758, 1346 aa
1>>>pF1KSDA0758 1346 - 1346 aa - 1346 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6349+/-0.0013; mu= 16.0404+/- 0.078
mean_var=98.8956+/-19.332, 0's: 0 Z-trim(101.8): 105 B-trim: 5 in 2/48
Lambda= 0.128969
statistics sampled from 6552 (6668) to 6552 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.552), E-opt: 0.2 (0.205), width: 16
Scan time: 3.840
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS4919.1 ADGRF5 gene_id:221395|Hs108|chr6 (1346) 8934 1674.3 0
CCDS34471.1 ADGRF1 gene_id:266977|Hs108|chr6 ( 910) 1348 262.8 3.2e-69
CCDS4922.2 ADGRF4 gene_id:221393|Hs108|chr6 ( 695) 1184 232.2 3.9e-60
CCDS33159.2 ADGRF3 gene_id:165082|Hs108|chr2 ( 873) 993 196.7 2.3e-49
CCDS46238.1 ADGRF3 gene_id:165082|Hs108|chr2 ( 997) 993 196.7 2.6e-49
CCDS46239.1 ADGRF3 gene_id:165082|Hs108|chr2 (1079) 991 196.4 3.6e-49
CCDS55064.1 ADGRG6 gene_id:57211|Hs108|chr6 (1222) 557 115.6 8.2e-25
CCDS47489.1 ADGRG6 gene_id:57211|Hs108|chr6 (1250) 557 115.7 8.4e-25
CCDS47491.1 ADGRG6 gene_id:57211|Hs108|chr6 (1193) 554 115.1 1.2e-24
CCDS47490.1 ADGRG6 gene_id:57211|Hs108|chr6 (1221) 554 115.1 1.2e-24
CCDS55377.1 ADGRG2 gene_id:10149|Hs108|chrX ( 987) 518 108.3 1e-22
CCDS55376.1 ADGRG2 gene_id:10149|Hs108|chrX ( 993) 518 108.3 1.1e-22
CCDS43921.1 ADGRG2 gene_id:10149|Hs108|chrX ( 995) 518 108.3 1.1e-22
CCDS55378.1 ADGRG2 gene_id:10149|Hs108|chrX (1001) 518 108.3 1.1e-22
CCDS43922.1 ADGRG2 gene_id:10149|Hs108|chrX (1003) 518 108.3 1.1e-22
CCDS14191.1 ADGRG2 gene_id:10149|Hs108|chrX (1014) 518 108.4 1.1e-22
CCDS43923.1 ADGRG2 gene_id:10149|Hs108|chrX (1017) 518 108.4 1.1e-22
CCDS55379.1 ADGRG2 gene_id:10149|Hs108|chrX ( 966) 511 107.0 2.5e-22
CCDS9272.1 ADGRD1 gene_id:283383|Hs108|chr12 ( 874) 425 91.0 1.5e-17
CCDS81753.1 ADGRD1 gene_id:283383|Hs108|chr12 ( 906) 425 91.0 1.6e-17
CCDS10786.1 ADGRG3 gene_id:222487|Hs108|chr16 ( 549) 368 80.3 1.6e-14
CCDS76879.1 ADGRG3 gene_id:222487|Hs108|chr16 ( 429) 361 79.0 3.2e-14
CCDS58643.1 ADGRE1 gene_id:2015|Hs108|chr19 ( 709) 362 79.3 4.3e-14
CCDS72746.1 ADGRB2 gene_id:576|Hs108|chr1 (1551) 361 79.2 9.6e-14
CCDS58646.1 ADGRE1 gene_id:2015|Hs108|chr19 ( 745) 350 77.0 2.1e-13
CCDS12175.1 ADGRE1 gene_id:2015|Hs108|chr19 ( 886) 350 77.1 2.5e-13
CCDS82926.1 ADGRL3 gene_id:23284|Hs108|chr4 (1240) 349 76.9 3.7e-13
CCDS54768.1 ADGRL3 gene_id:23284|Hs108|chr4 (1469) 349 77.0 4.3e-13
CCDS64985.1 ADGRB1 gene_id:575|Hs108|chr8 (1584) 346 76.4 6.8e-13
CCDS35409.1 ADGRG4 gene_id:139378|Hs108|chrX (3080) 346 76.6 1.2e-12
CCDS32460.1 ADGRG1 gene_id:9289|Hs108|chr16 ( 693) 336 74.4 1.2e-12
CCDS58644.1 ADGRE1 gene_id:2015|Hs108|chr19 ( 821) 313 70.2 2.7e-11
>>CCDS4919.1 ADGRF5 gene_id:221395|Hs108|chr6 (1346 aa)
initn: 8934 init1: 8934 opt: 8934 Z-score: 8981.9 bits: 1674.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 8934; 99.9% identity (99.9% similar) in 1346 aa overlap (1-1346:1-1346)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MKSPRRTTLCLMFIVIYSSKAALNWNYESTIHPLSLHEHEPAGEEALRQKRAVATKSPTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 MKSPRRTTLCLMFIVIYSSKAALNWNYESTIHPLSLHEHEPAGEEALRQKRAVATKSPTA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD EEYTVNIEISFENASFLDPIKAYLNSLSFPIHGNNTDQITDILSINVTTVCRPAGNEIWC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 EEYTVNIEISFENASFLDPIKAYLNSLSFPIHGNNTDQITDILSINVTTVCRPAGNEIWC
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD SCETGYGWPRERCLHNLICQERDVFLPGHHCSCLKELPPNGPFCLLQEDVTLNMRVRLNV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 SCETGYGWPRERCLHNLICQERDVFLPGHHCSCLKELPPNGPFCLLQEDVTLNMRVRLNV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD GFQEDLMNTSSALYRSYKTDLETAFRKGYGILPGFKGVTVTGFKSGSVVVTYEVKTTPPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 GFQEDLMNTSSALYRSYKTDLETAFRKGYGILPGFKGVTVTGFKSGSVVVTYEVKTTPPS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD LELIHKANEQVVQSLNQTYKMDYNSFQAVTINESNFFVTPEIIFEGDTVSLVCEKEVLSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 LELIHKANEQVVQSLNQTYKMDYNSFQAVTINESNFFVTPEIIFEGDTVSLVCEKEVLSS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD NVSWRYEEQQLEIQNSSRFSIYTALFNNMTSVSKLTIHNITPGDAGEYVCKLILDIFEYE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 NVSWRYEEQQLEIQNSSRFSIYTALFNNMTSVSKLTIHNITPGDAGEYVCKLILDIFEYE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD CKKKIDVMPIQILANEEMKVMCDNNPVSLNCCSQGNVNWSKVEWKQEGKINIPGTPETDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 CKKKIDVMPIQILANEEMKVMCDNNPVSLNCCSQGNVNWSKVEWKQEGKINIPGTPETDI
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD DSSCSRYTLKADGTQCPSGSSGTTVIYTCEFISAYGARGSANIKVTFISVANLTITPDPI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 DSSCSRYTLKADGTQCPSGSSGTTVIYTCEFISAYGARGSANIKVTFISVANLTITPDPI
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD SVSEGQNFSIKCISDVSNYDEVYWNTSAGIKIYQRFYTTRRYLDGAESVLTVKTSTREWN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 SVSEGQNFSIKCISDVSNYDEVYWNTSAGIKIYQRFYTTRRYLDGAESVLTVKTSTREWN
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD GTYHCIFRYKNSYSIATKDVIVHPLPLKLNIMVDPLEATVSCSGSHHIKCCIEEDGDYKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 GTYHCIFRYKNSYSIATKDVIVHPLPLKLNIMVDPLEATVSCSGSHHIKCCIEEDGDYKV
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD TFHMGSSSLPAAKEVNKKQVCYKHNFNASSVSWCSKTVDVCCHFTNAANNSVWSPSMKLN
::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 TFHTGSSSLPAAKEVNKKQVCYKHNFNASSVSWCSKTVDVCCHFTNAANNSVWSPSMKLN
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD LVPGENITCQDPVIGVGEPGKVIQKLCRFSNVPSSPESPIGGTITYKCVGSQWEEKRNDC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 LVPGENITCQDPVIGVGEPGKVIQKLCRFSNVPSSPESPIGGTITYKCVGSQWEEKRNDC
670 680 690 700 710 720
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pF1KSD ISAPINSLLQMAKALIKSPSQDEMLPTYLKDLSISIDKAEHEISSSPGSLGAIINILDLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 ISAPINSLLQMAKALIKSPSQDEMLPTYLKDLSISIDKAEHEISSSPGSLGAIINILDLL
730 740 750 760 770 780
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pF1KSD STVPTQVNSEMMTHVLSTVNVILGKPVLNTWKVLQQQWTNQSSQLLHSVERFSQALQSGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 STVPTQVNSEMMTHVLSTVNVILGKPVLNTWKVLQQQWTNQSSQLLHSVERFSQALQSGD
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD SPPLSFSQTNVQMSSTVIKSSHPETYQQRFVFPYFDLWGNVVIDKSYLENLQSDSSIVTM
::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 SPPLSFSQTNVQMSSMVIKSSHPETYQQRFVFPYFDLWGNVVIDKSYLENLQSDSSIVTM
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD AFPTLQAILAQDIQENNFAESLVMTTTVSHNTTMPFRISMTFKNNSPSGGETKCVFWNFR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 AFPTLQAILAQDIQENNFAESLVMTTTVSHNTTMPFRISMTFKNNSPSGGETKCVFWNFR
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD LANNTGGWDSSGCYVEEGDGDNVTCICDHLTSFSILMSPDSPDPSSLLGILLDIISYVGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 LANNTGGWDSSGCYVEEGDGDNVTCICDHLTSFSILMSPDSPDPSSLLGILLDIISYVGV
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD GFSILSLAACLVVEAVVWKSVTKNRTSYMRHTCIVNIAASLLVANTWFIVVAAIQDNRYI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 GFSILSLAACLVVEAVVWKSVTKNRTSYMRHTCIVNIAASLLVANTWFIVVAAIQDNRYI
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD LCKTACVAATFFIHFFYLSVFFWMLTLGLMLFYRLVFILHETSRSTQKAIAFCLGYGCPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 LCKTACVAATFFIHFFYLSVFFWMLTLGLMLFYRLVFILHETSRSTQKAIAFCLGYGCPL
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD AISVITLGATQPREVYTRKNVCWLNWEDTKALLAFAIPALIIVVVNITITIVVITKILRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 AISVITLGATQPREVYTRKNVCWLNWEDTKALLAFAIPALIIVVVNITITIVVITKILRP
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KSD SIGDKPCKQEKSSLFQISKSIGVLTPLLGLTWGFGLTTVFPGTNLVFHIIFAILNVFQGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 SIGDKPCKQEKSSLFQISKSIGVLTPLLGLTWGFGLTTVFPGTNLVFHIIFAILNVFQGL
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KSD FILLFGCLWDLKVQEALLNKFSLSRWSSQHSKSTSLGSSTPVFSMSSPISRRFNNLFGKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 FILLFGCLWDLKVQEALLNKFSLSRWSSQHSKSTSLGSSTPVFSMSSPISRRFNNLFGKT
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340
pF1KSD GTYNVSTPEATSSSLENSSSASSLLN
::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 GTYNVSTPEATSSSLENSSSASSLLN
1330 1340
>>CCDS34471.1 ADGRF1 gene_id:266977|Hs108|chr6 (910 aa)
initn: 1282 init1: 405 opt: 1348 Z-score: 1356.3 bits: 262.8 E(32554): 3.2e-69
Smith-Waterman score: 1417; 36.8% identity (70.5% similar) in 668 aa overlap (669-1321:257-895)
640 650 660 670 680 690
pF1KSD DVCCHFTNAANNSVWSPSMKLNLVPGENITCQDPVIGVGEPGKVIQKLCRFSNVPSSPES
:.: :.: : .: ... .: : :
CCDS34 IEHVAEKAKTALHKLFPLEDGSFRVFGKAQCNDIVFGFG------SKDDEYT-LPCS--S
230 240 250 260 270
700 710 720 730 740 750
pF1KSD PIGGTITYKCVGSQWEEKRNDCISAPINSLLQMAK--ALIKSPSQDEMLPTYLKDLSISI
:.:: :: .: :. :. :. .. : .. : ..: . . . . .....::. :
CCDS34 GYRGNITAKCESSGWQVIRETCV---LSLLEELNKNFSMIVGNATEAAVSSFVQNLSVII
280 290 300 310 320 330
760 770 780 790 800 810
pF1KSD DKAEHEISSSPGSLGAIINILDLLSTVPT----QVNSEMMTHVLSTVNVILGKPVLNTWK
... :.. :.:.....::. .:.. .:.. : :.: .. ::.. ...:
CCDS34 ---RQNPSTTVGNLASVVSILSNISSLSLASHFRVSNSTMEDVISIADNILNSASVTNWT
340 350 360 370 380 390
820 830 840 850 860
pF1KSD VLQQQWTNQSSQLLHSVERFSQALQSGDSPPLSFSQTNVQMSSTVIKSSHPE---TYQQR
:: .. ::.::...: .: .: . ::.::. .. .. ...:. . .:: .
CCDS34 VLLREEKYASSRLLETLENIS-TLVPPTALPLNFSRKFIDWKGIPVNKSQLKRGYSYQIK
400 410 420 430 440 450
870 880 890 900 910 920
pF1KSD FVFPY---FDLWGNVVIDKSYLENLQSDSSIVTMAFPTLQAILAQDIQENNFAESLVMTT
. : . . : :.: .. .. .. :..:: :: :: . . : ... :..:
CCDS34 MC-PQNTSIPIRGRVLIGSDQFQRSLPET-IISMASLTLGNILPVSKNGNAQVNGPVIST
460 470 480 490 500
930 940 950 960 970 980
pF1KSD TVSHNTTMPFRISMTFKNNSPSGGETKCVFWNFRLANNTGGWDSSGCYVEEGDGDNVTCI
.. .: .. .. . :.. . .. .::::.: . :...::.. . : :::
CCDS34 VI-QNYSIN-EVFLFFSKIESNLSQPHCVFWDFSHLQ----WNDAGCHLVNETQDIVTCQ
510 520 530 540 550 560
990 1000 1010 1020 1030 1040
pF1KSD CDHLTSFSILMSPDSPDPSSLLGILLDIISYVGVGFSILSLAACLVVEAVVWKSVTKNRT
: ::::::::::: : :... .. :.:::.:.:: :: ::..::. ::.. :..:
CCDS34 CTHLTSFSILMSPFVP--STIFPVV-KWITYVGLGISIGSLILCLIIEALFWKQIKKSQT
570 580 590 600 610
1050 1060 1070 1080 1090 1100
pF1KSD SYMRHTCIVNIAASLLVANTWFIVVAAIQDNRYILCKTACVAATFFIHFFYLSVFFWMLT
:. :. :.:::: :::.:..:::: :... . . . .:.::.:: ::::::.:::::
CCDS34 SHTRRICMVNIALSLLIADVWFIVGATVDTT--VNPSGVCTAAVFFTHFFYLSLFFWMLM
620 630 640 650 660 670
1110 1120 1130 1140 1150 1160
pF1KSD LGLMLFYRLVFILHETSRSTQKAIAFCLGYGCPLAISVITLGATQPREVYTRKNVCWLNW
::..: ::.....:. .. . :..::::::::: :::::...::: ..: ::.::::::
CCDS34 LGILLAYRIILVFHHMAQHLMMAVGFCLGYGCPLIISVITIAVTQPSNTYKRKDVCWLNW
680 690 700 710 720 730
1170 1180 1190 1200 1210 1220
pF1KSD ED-TKALLAFAIPALIIVVVNITITIVVITKILRPSIGDKPCKQEKSSLFQISKSIGVLT
. .: ::::..::: ::.::......:.::. ::..:.. ...:.......::. .::
CCDS34 SNGSKPLLAFVVPALAIVAVNFVVVLLVLTKLWRPTVGERLSRDDKATIIRVGKSLLILT
740 750 760 770 780 790
1230 1240 1250 1260 1270 1280
pF1KSD PLLGLTWGFGLTTVFPGTNLVFHIIFAILNVFQGLFILLFGCLWDLKVQEALLNKFS-LS
::::::::::. :. . ::..:.:::.::.:::.::: :: : : :... :.::.: ::
CCDS34 PLLGLTWGFGIGTIVDSQNLAWHVIFALLNAFQGFFILCFGILLDSKLRQLLFNKLSALS
800 810 820 830 840 850
1290 1300 1310 1320 1330 1340
pF1KSD RWSSQHSKSTSLGSSTPVFSMS-SPISRRFNNLFGKTGTYNVSTPEATSSSLENSSSASS
:.. .....: :. : :: .:.. . . :..::
CCDS34 SWKQTEKQNSSDLSAKPKFSKPFNPLQNKGHYAFSHTGDSSDNIMLTQFVSNE
860 870 880 890 900 910
pF1KSD LLN
>>CCDS4922.2 ADGRF4 gene_id:221393|Hs108|chr6 (695 aa)
initn: 1051 init1: 454 opt: 1184 Z-score: 1193.2 bits: 232.2 E(32554): 3.9e-60
Smith-Waterman score: 1240; 34.8% identity (64.6% similar) in 706 aa overlap (635-1299:5-685)
610 620 630 640 650 660
pF1KSD GSSSLPAAKEVNKKQVCYKHNFNASSVSWCSKTVDVCC--HFTNAANNSVWSPSMKLNLV
:... .:: : .. . : :..:
CCDS49 MKMKSQATMICCLVFFLSTECSHYRS---KIHLK
10 20 30
670 680 690 700 710
pF1KSD PGENITCQDPVIGVGEPGKVIQKLCRFSNVPSSPES-PIG----GTITYKCVGSQWEEKR
:... :.: : . :. ::. :. . :: : : . : : . : ..:...
CCDS49 AGDKL--QSPE-GKPKTGR-IQEKCEGPCISSSNCSQPCAKDFHGEIGFTCNQKKWQKSA
40 50 60 70 80
720 730 740 750 760
pF1KSD NDCISAPINSLLQ----MAKALIKSPS-----QDEMLPTYLKDLSISIDKA--------E
. : : ...:.. .. . .:: : : ..... .: :
CCDS49 ETCTSLSVEKLFKDSTGASRLSVAAPSIPLHILDFRAPETIESVAQGIRKNCPFDYACIT
90 100 110 120 130 140
770 780 790 800 810
pF1KSD HEISSSPGSLGAIINILDLLSTVPTQ----VNSEMMTHVLSTVNVILGKPVLNTWKVLQQ
..:: . : : :..::... :. :. : : ..: :: ....: . .
CCDS49 DMVKSSETTSGNIAFIVELLKNISTDLSDNVTREKMKSYSEVANHILDTAAISNWAFIPN
150 160 170 180 190 200
820 830 840 850 860 870
pF1KSD QWTNQSSQLLHSVERFSQALQSGDSPPLSFSQTNVQMSSTVIKSSHPE---TYQQRFVFP
. : ::.::.::. :.. :. .. .. .: .. :. . : .... .
CCDS49 K--NASSDLLQSVNLFARQLHIHNNSENIVNELFIQTKGFHINHNTSEKSLNFSMSMNNT
210 220 230 240 250 260
880 890 900 910 920 930
pF1KSD YFDLWGNVVIDKSYLENLQSDSS-IVTMAFPTLQAILAQDIQENNFAESLVMTTTVSHNT
:. : : : .. :..: ..: ...::::: ::: . .: : ..: .
CCDS49 TEDILGMVQIPRQELRKLWPNASQAISIAFPTLGAILREAHLQNVSLPRQVNGLVLS--V
270 280 290 300 310 320
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pF1KSD TMPFRIS---MTF-KNNSPSGGETKCVFWNFRLANNTGGWDSSGCYVEEGDGDNVTCICD
..: :.. .:: : :. .....:: :. .. :: ..: . ..: : :.
CCDS49 VLPERLQEIILTFEKINKTRNARAQCVGWH----SKKRRWDEKACQMMLDIRNEVKCRCN
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pF1KSD HLT---SFSILMSPDSPDPSSLLGILLDIISYVGVGFSILSLAACLVVEAVVWKSVTKNR
. . ::::::: .:. .:: :. .:.. :::::. ::..::.::. :. ..
CCDS49 YTSVVMSFSILMSS-----KSMTDKVLDYITCIGLSVSILSLVLCLIIEATVWSRVVVTE
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pF1KSD TSYMRHTCIVNIAASLLVANTWFIVVA--AIQDNRYILCKTACVAATFFIHFFYLSVFFW
:::::.::::::.:::.::.:::. . :. . : .: ::.::: ::::::.:::
CCDS49 ISYMRHVCIVNIAVSLLTANVWFIIGSHFNIKAQDYNMC----VAVTFFSHFFYLSLFFW
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pF1KSD MLTLGLMLFYRLVFILHETSRSTQKAIAFCLGYGCPLAISVITLGATQPREVYTRKNVCW
:: .:...: .. :... .: . .:.: .:::::: :.: :.. :.:.. : : ..::
CCDS49 MLFKALLIIYGILVIFRRMMKSRMMVIGFAIGYGCPLIIAVTTVAITEPEKGYMRPEACW
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:::..:::::::::::..::.::. ...:: .. :::::.. .:. ...:::....
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. .:. ....::: .
CCDS49 LKGKSRAAENASLGPTNGSKLMNRQG
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:: .. : . ..::. : ...::: . : ... : .: .. . . .:
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:. . .:. : . . : . . . . : ...... .::: .: . .
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: . :.: : : ::: : :. . :.. : ...: .: . .:. .:
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: . : : .: : .: . .: :::..: .... . .. : . :..
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. . ..: ... .: . . : . : . .: :: .:: .. .: : : ..::
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:: ..: .. . : :. : . : . .. : . : : .. ::.....
CCDS33 PNVLLQSQLFGPTFPADYSISFPTRPPL----QAQIPRHSLAPLVRNGTEISITSLVLRK
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. : .. :::.. :: .. .... .. :.:.:::.::.:::: . :. .: ..
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CCDS33 TQVGLGASILALLVCLGVYWLVWRVVVRNKISYFRHAALLNMVFCLLAADTCFLGAPFLS
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pF1KSD DN-RYILCKTACVAATFFIHFFYLSVFFWMLTLGLMLFYRLVFILHETSRSTQKAIAFCL
. : :: .::.:. ::.::..:::::. .:.: ..:.:..:. .. . :
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CCDS33 GYLCPLGLAGVTLGLYLPQGQYLREGECWLDGKGG-ALYTFVGPVLAIIGVNGLVLAMAM
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CCDS33 NTLQGVFILLFGCLMDRKIQEALRKRFCRAQAPSSTISLATNEGCILEHSKGGSDTARKT
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CCDS33 DASE
870
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CCDS46 NESGSQ-CF-----VLAVQRCPMADTTYACDLQSLGLAPLRVP-ISITIIQDGDITCPED
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. .: . :.: : : ::: : :. . :.. : ...: .: .
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..... :. .: .: . .. .: ::.. .. . .. : : : . :
CCDS46 TSLVLRKLDHLLPSNYGQGLGDSLYATPGLVLVISIMAGDRAFSQGEVIMDFGN---TDG
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. ::: :::... .::: :. : :.. :::. . :: .:. :.: :. ::
CCDS46 PLMVLLGYLCPLGLAGVTLGLYLPQGQYLREGECWLDGKGG-ALYTFVGPVLAIIGVNGL
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pF1KSD ITIVVITKILRPSIGDKPCKQEKSSLFQISKSIGVLTPLLGLTWGFGLTTVFPGTNLVFH
. ... :.::::... : .....:. . :.. .:::..:::::.::.:.. .. : :
CCDS46 VLAMAMLKLLRPSLSEGPPAEKRQALLGVIKALLILTPIFGLTWGLGLATLLEEVSTVPH
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CCDS46 YIFTILNTLQGVFILLFGCLMDRKIQEALRKRFCRAQAPSSTISLATNEGCILEHSKGGS
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pF1KSD PISRRFNNLFGKTGTYNVSTPEATSSSLENSSSASSLLN
CCDS46 DTAR
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CCDS46 LYEVVRVPLK-ATDVARLPYQLSISCATSPGFQLSCCIPSTNLAYTAAWSPGEGSKASSF
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CCDS46 NESGSQ-CF-----VLAVQRCPMADTTYACDLQSLGLAPLRVP-ISITIIQDGDITCPED
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CCDS46 ASVLTWNVTKAGHVAQAPC--------PESKRG--IVRRLCGADGVWGPVHSSCTDARLL
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CCDS46 ALFTRTKLLQAGQGSPAEEVPQILAQLPGQAAEA-----SSPSDLLTLLSTMKYVAKVVA
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CCDS46 EARIQLDRRALKNLLIATDKVLDMDTRSLWTLAQARKPWAGSTLLLAVETLACSLCPQDH
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CCDS46 TSLVLRKLDHLLPSNYGQGLGDSLYATPGLVLVISIMAGDRAFSQGEVIMDFGN---TDG
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CCDS46 SPHCVFWDHSLFQGRGGWSKEGCQAQVASASPTAQCLCQHLTAFSVLMSPHTVPEEPALA
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CCDS46 LGAPFLSPGPRSPLC----LAAAFLCHFLYLATFFWMLAQALVLAHQLLFVFHQLAKHRV
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pF1KSD KAIAFCLGYGCPLAISVITLGATQPREVYTRKNVCWLNWEDTKALLAFAIPALIIVVVNI
. ::: :::... .::: :. : :.. :::. . :: .:. :.: :. ::
CCDS46 LPLMVLLGYLCPLGLAGVTLGLYLPQGQYLREGECWLDGKGG-ALYTFVGPVLAIIGVNG
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pF1KSD TITIVVITKILRPSIGDKPCKQEKSSLFQISKSIGVLTPLLGLTWGFGLTTVFPGTNLVF
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CCDS46 LVLAMAMLKLLRPSLSEGPPAEKRQALLGVIKALLILTPIFGLTWGLGLATLLEEVSTVP
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pF1KSD HIIFAILNVFQGLFILLFGCLWDLKVQEALLNKFSLSRWSSQHSKSTSLGSSTPVFSMSS
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CCDS46 HYIFTILNTLQGVFILLFGCLMDRKIQEALRKRFCRAQAPSSTISLVSCCLQILSCASKS
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pF1KSD PISRRFNNLFGKTGTYNVSTPEATSSSLENSSSASSLLN
CCDS46 MSEGIPWPSSEDMGTARS
1070
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]