Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA0755
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0755, 1032 aa
1>>>pF1KSDA0755 1032 - 1032 aa - 1032 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 13.0870+/-0.00133; mu= -9.6520+/- 0.080
mean_var=653.0228+/-136.114, 0's: 0 Z-trim(114.7): 84 B-trim: 414 in 1/53
Lambda= 0.050189
statistics sampled from 15229 (15301) to 15229 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.754), E-opt: 0.2 (0.47), width: 16
Scan time: 3.740
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS3710.1 SEC24D gene_id:9871|Hs108|chr4 (1032) 7109 530.8 5.6e-150
CCDS7332.1 SEC24C gene_id:9632|Hs108|chr10 (1094) 3887 297.5 9.9e-80
CCDS47124.1 SEC24B gene_id:10427|Hs108|chr4 (1268) 1318 111.6 1.1e-23
CCDS43260.1 SEC24B gene_id:10427|Hs108|chr4 (1233) 1295 109.9 3.4e-23
CCDS75179.1 SEC24B gene_id:10427|Hs108|chr4 (1298) 1288 109.4 4.9e-23
CCDS43363.1 SEC24A gene_id:10802|Hs108|chr5 (1093) 1221 104.5 1.3e-21
>>CCDS3710.1 SEC24D gene_id:9871|Hs108|chr4 (1032 aa)
initn: 7109 init1: 7109 opt: 7109 Z-score: 2806.0 bits: 530.8 E(32554): 5.6e-150
Smith-Waterman score: 7109; 99.9% identity (99.9% similar) in 1032 aa overlap (1-1032:1-1032)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MSQQGYVATPPYSQPQPGIGLSPPHYGHYGDPSHTASPTGMMKPAGPLGATATRGMLPPG
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CCDS37 MSQQGYVATPPYSQPQPGIGLSPPHYGHYGDPSHTASPTGMMKPAGPLGATATRGMLPPG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD PPPPGPHQFGQNGAHATGHPPQRFPGPPPVNNVASSHAPYQPSAQSSYPGPISTSSVTQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 PPPPGPHQFGQNGAHATGHPPQRFPGPPPVNNVASSHAPYQPSAQSSYPGPISTSSVTQL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD GSQLSAMQINSYGSGMAPPSQGPPGPLSATSLQTPPRPPQPSILQPGSQVLPPPPTTLNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 GSQLSAMQINSYGSGMAPPSQGPPGPLSATSLQTPPRPPQPSILQPGSQVLPPPPTTLNG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD PGASPLPLPMYRPDGLSGPPPPNAQYQPPPLPGQTLGAGYPPQQANSGPQMAGAQLSYPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 PGASPLPLPMYRPDGLSGPPPPNAQYQPPPLPGQTLGAGYPPQQANSGPQMAGAQLSYPG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD GFPGGPAQMAGPPQPQKKLDPDSIPSPIQVIENDRASRGGQVYATNTRGQIPPLVTTDCM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 GFPGGPAQMAGPPQPQKKLDPDSIPSPIQVIENDRASRGGQVYATNTRGQIPPLVTTDCM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD IQDQGNASPRFIRCTTYCFPCTSDMAKQAQIPLAAVIKPFATIPSNESPLYLVNHGESGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 IQDQGNASPRFIRCTTYCFPCTSDMAKQAQIPLAAVIKPFATIPSNESPLYLVNHGESGP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD VRCNRCKAYMCPFMQFIEGGRRYQCGFCNCVNDVPPFYFQHLDHIGRRLDHYEKPELSLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 VRCNRCKAYMCPFMQFIEGGRRYQCGFCNCVNDVPPFYFQHLDHIGRRLDHYEKPELSLG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD SYEYVATLDYCRKSKPPNPPAFIFMIDVSYSNIKNGLVKLICEELKTMLEKIPKEEQEET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 SYEYVATLDYCRKSKPPNPPAFIFMIDVSYSNIKNGLVKLICEELKTMLEKIPKEEQEET
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD SAIRVGFITYNKVLHFFNVKSNLAQPQMMVVTDVGEVFVPLLDGFLVNYQESQSVIHNLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 SAIRVGFITYNKVLHFFNVKSNLAQPQMMVVTDVGEVFVPLLDGFLVNYQESQSVIHNLL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD DQIPDMFADSNENETVFASVIQAGMEALKAADCPGKLFIFHSSLPTAEAPGKLKNRDDKK
:::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 DQIPDMFADSNENETVFAPVIQAGMEALKAADCPGKLFIFHSSLPTAEAPGKLKNRDDKK
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD LVNTDKEKILFQPQTNVYDSLAKDCVAHGCSVTLFLFPSQYVDVASLGLVPQLTGGTLYK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 LVNTDKEKILFQPQTNVYDSLAKDCVAHGCSVTLFLFPSQYVDVASLGLVPQLTGGTLYK
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD YNNFQMHLDRQQFLNDLRNDIEKKIGFDAIMRVRTSTGFRATDFFGGILMNNTTDVEMAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 YNNFQMHLDRQQFLNDLRNDIEKKIGFDAIMRVRTSTGFRATDFFGGILMNNTTDVEMAA
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD IDCDKAVTVEFKHDDKLSEDSGALIQCAVLYTTISGQRRLRIHNLGLNCSSQLADLYKSC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 IDCDKAVTVEFKHDDKLSEDSGALIQCAVLYTTISGQRRLRIHNLGLNCSSQLADLYKSC
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD ETDALINFFAKSAFKAVLHQPLKVIREILVNQTAHMLACYRKNCASPSAASQLILPDSMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 ETDALINFFAKSAFKAVLHQPLKVIREILVNQTAHMLACYRKNCASPSAASQLILPDSMK
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD VLPVYMNCLLKNCVLLSRPEISTDERAYQRQLVMTMGVADSQLFFYPQLLPIHTLDVKST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 VLPVYMNCLLKNCVLLSRPEISTDERAYQRQLVMTMGVADSQLFFYPQLLPIHTLDVKST
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD MLPAAVRCSESRLSEEGIFLLANGLHMFLWLGVSSPPELIQGIFNVPSFAHINTDMTLLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 MLPAAVRCSESRLSEEGIFLLANGLHMFLWLGVSSPPELIQGIFNVPSFAHINTDMTLLP
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD EVGNPYSQQLRMIMGIIQQKRPYSMKLTIVKQREQPEMVFRQFLVEDKGLYGGSSYVDFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 EVGNPYSQQLRMIMGIIQQKRPYSMKLTIVKQREQPEMVFRQFLVEDKGLYGGSSYVDFL
970 980 990 1000 1010 1020
1030
pF1KSD CCVHKEICQLLN
::::::::::::
CCDS37 CCVHKEICQLLN
1030
>>CCDS7332.1 SEC24C gene_id:9632|Hs108|chr10 (1094 aa)
initn: 3844 init1: 3668 opt: 3887 Z-score: 1544.9 bits: 297.5 E(32554): 9.9e-80
Smith-Waterman score: 3988; 56.5% identity (79.5% similar) in 1063 aa overlap (12-1032:44-1094)
10 20 30 40
pF1KSD MSQQGYVATPPYSQPQPGIGLSPPHYGHYGDPSHTASPTGM
:. : :: .::. . :: : :..
CCDS73 GQPQPIYPGYHQSSYGGQSGSTAPAIPYGAYNGPVPGYQQTPPQGMSRAPPSSGAPPAST
20 30 40 50 60 70
50 60 70 80
pF1KSD MKPAGPLGATAT----RGMLPPGPPP-------PGPHQFGQNGAHATGHPPQRFP-GPPP
. .: : .: .: . :: :: . ::. : . ..:: : ::::
CCDS73 AQ--APCGQAAYGQFGQGDVQNGPSSTVQMQRLPGSQPFGSPLAPVGNQPPVLQPYGPPP
80 90 100 110 120 130
90 100 110 120 130
pF1KSD VN----------NVASSHAPYQPSAQSSYPGPISTSSVTQLGSQLSAMQINSYGSGMAPP
.. ..... :: ::. .. : : .:.. :: .. .:: .:.:::
CCDS73 TSAQVATQLSGMQISGAVAPAPPSSGLGFGPPTSLASAS--GSFPNSGLYGSYPQGQAPP
140 150 160 170 180
140 150 160 170 180 190
pF1KSD ---SQGPPGPLSATSLQTPPR--PPQPSILQPGSQVLPPPPTTLNGP---GASPLPLPMY
.:: :: .::: : : : : . : .. : :. ..:: : : .
CCDS73 LSQAQGHPG------IQTPQRSAPSQASSFTPPASGGPRLPS-MTGPLLPGQSFGGPSVS
190 200 210 220 230 240
200 210 220 230 240
pF1KSD RPDGLSGPP---PPNAQYQPP--PLPGQ--TLGAGYPPQQANS-GPQMAGAQLSYPGGFP
.:. .:.:: ::..:. : ::: . :: ::: .: :: : : .: : .:
CCDS73 QPNHVSSPPQALPPGTQMTGPLGPLPPMHSPQQPGYQPQQNGSFGPAR-GPQSNYGGPYP
250 260 270 280 290 300
250 260 270 280 290
pF1KSD GGPA--QMAGPPQP--QKKLDPDSIPSPIQVIENDRASRGGQVYATNTRGQIPPLVTTDC
..:. .. ::::: :.::::.:::::::::.:: .:: . ..:..:::.::::::.
CCDS73 AAPTFGSQPGPPQPLPPKRLDPDAIPSPIQVIEDDRNNRGTEPFVTGVRGQVPPLVTTNF
310 320 330 340 350 360
300 310 320 330 340 350
pF1KSD MIQDQGNASPRFIRCTTYCFPCTSDMAKQAQIPLAAVIKPFATIPSNESPLYLVNHGESG
...::::::::.::::.: .:::::::::::.::::::::.: .: .:. :.:.:::::
CCDS73 LVKDQGNASPRYIRCTSYNIPCTSDMAKQAQVPLAAVIKPLARLPPEEASPYVVDHGESG
370 380 390 400 410 420
360 370 380 390 400 410
pF1KSD PVRCNRCKAYMCPFMQFIEGGRRYQCGFCNCVNDVPPFYFQHLDHIGRRLDHYEKPELSL
:.:::::::::::::::::::::.:: ::.:.::::: ::::::: :.:.: :..:::::
CCDS73 PLRCNRCKAYMCPFMQFIEGGRRFQCCFCSCINDVPPQYFQHLDHTGKRVDAYDRPELSL
430 440 450 460 470 480
420 430 440 450 460 470
pF1KSD GSYEYVATLDYCRKSKPPNPPAFIFMIDVSYSNIKNGLVKLICEELKTMLEKIPKEEQEE
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CCDS73 GSYEFLATVDYCKNNKFPSPPAFIFMIDVSYNAIRTGLVRLLCEELKSLLDFLPREGGAE
490 500 510 520 530 540
480 490 500 510 520 530
pF1KSD TSAIRVGFITYNKVLHFFNVKSNLAQPQMMVVTDVGEVFVPLLDGFLVNYQESQSVIHNL
:::::::.::::::::.::::.:::::::::.::...::::::::::: .::..:: .:
CCDS73 ESAIRVGFVTYNKVLHFYNVKSSLAQPQMMVVSDVADMFVPLLDGFLVNVNESRAVITSL
550 560 570 580 590 600
540 550 560 570 580 590
pF1KSD LDQIPDMFADSNENETVFASVIQAGMEALKAADCPGKLFIFHSSLPTAEAPGKLKNRDDK
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CCDS73 LDQIPEMFADTRETETVFVPVIQAGMEALKAAECAGKLFLFHTSLPIAEAPGKLKNRDDR
610 620 630 640 650 660
600 610 620 630 640 650
pF1KSD KLVNTDKEKILFQPQTNVYDSLAKDCVAHGCSVTLFLFPSQYVDVASLGLVPQLTGGTLY
::.:::::: ::::::..:..:::.:::.:: : :::::.::::::.:..:::::::..:
CCDS73 KLINTDKEKTLFQPQTGAYQTLAKECVAQGCCVDLFLFPNQYVDVATLSVVPQLTGGSVY
670 680 690 700 710 720
660 670 680 690 700 710
pF1KSD KYNNFQMHLDRQQFLNDLRNDIEKKIGFDAIMRVRTSTGFRATDFFGGILMNNTTDVEMA
:: .::.. :...::.::: :..: .::::.::::::::.::.::::.. :.::::::.:
CCDS73 KYASFQVENDQERFLSDLRRDVQKVVGFDAVMRVRTSTGIRAVDFFGAFYMSNTTDVELA
730 740 750 760 770 780
720 730 740 750 760 770
pF1KSD AIDCDKAVTVEFKHDDKLSEDSGALIQCAVLYTTISGQRRLRIHNLGLNCSSQLADLYKS
..: ::.:::::::::.:.:.::::.:::.:::. .::::::::::.::: .::::::..
CCDS73 GLDGDKTVTVEFKHDDRLNEESGALLQCALLYTSCAGQRRLRIHNLALNCCTQLADLYRN
790 800 810 820 830 840
780 790 800 810 820 830
pF1KSD CETDALINFFAKSAFKAVLHQPLKVIREILVNQTAHMLACYRKNCASPSAASQLILPDSM
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CCDS73 CETDTLINYMAKFAYRGVLNSPVKAVRDTLITQCAQILACYRKNCASPSSAGQLILPECM
850 860 870 880 890 900
840 850 860 870 880 890
pF1KSD KVLPVYMNCLLKNCVLLSRPEISTDERAYQRQLVMTMGVADSQLFFYPQLLPIHTLDVKS
:.::::.::.::. :: :..::.::: :::: .: :.....::::.:::. :.:
CCDS73 KLLPVYLNCVLKSDVLQPGAEVTTDDRAYVRQLVTSMDVTETNVFFYPRLLPLTKSPVES
910 920 930 940 950 960
900 910 920 930 940 950
pF1KSD TMLPAAVRCSESRLSEEGIFLLANGLHMFLWLGVSSPPELIQGIFNVPSFAHINTDMTLL
: : ::: :: :::. :.:: :::..:::.:.: ..:..:.: ::..:.. ...:
CCDS73 TTEPPAVRASEERLSNGDIYLLENGLNLFLWVGASVQQGVVQSLFSVSSFSQITSGLSVL
970 980 990 1000 1010 1020
960 970 980 990 1000 1010
pF1KSD PEVGNPYSQQLRMIMGIIQQKRPYSMKLTIVKQREQPEMVFRQFLVEDKGLYGGSSYVDF
: . :: :...: .. .. .: ::::.:::... ::.:..::::::.: ::.:::::
CCDS73 PVLDNPLSKKVRGLIDSLRAQRSRYMKLTVVKQEDKMEMLFKHFLVEDKSLSGGASYVDF
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1020 1030
pF1KSD LCCVHKEICQLLN
:: .:::: :::.
CCDS73 LCHMHKEIRQLLS
1090
>>CCDS47124.1 SEC24B gene_id:10427|Hs108|chr4 (1268 aa)
initn: 900 init1: 429 opt: 1318 Z-score: 538.8 bits: 111.6 E(32554): 1.1e-23
Smith-Waterman score: 1480; 28.8% identity (59.6% similar) in 1054 aa overlap (3-1029:251-1268)
10 20 30
pF1KSD MSQQGYVATPPYSQPQPGIGLSPPHY--GHYG
::. . . .::. . . .: :
CCDS47 PVKDNSFSGQNTAISHPSPLPPLPSQQHHQQQSLSGYSTLTWSSPGLPSTQDNLIRNHTG
230 240 250 260 270 280
40 50 60 70 80
pF1KSD DPSHTASPTGMMKPAGPLGATATRGMLPPGPPPPGPHQF-GQNGAHATGHPPQRFPGPPP
. . .:. . . : :. . ... :: : . :..:. .: :: :
CCDS47 SLA-VANNNPTITVADSLSCPVMQNVQPPKSSPVVSTVLSGSSGSSSTRTPPTANHPVEP
290 300 310 320 330
90 100 110 120 130 140
pF1KSD VNNVASSHAPYQPSAQSSYPGPISTSSVT-QLGSQLSAMQINSYGSGMAPPSQGPPGPLS
:..:. ::: . : :. : .: . .. .: .. :
CCDS47 VTSVT------QPSELLQQKGVQYGEYVNNQASSAPTPLSSTSDDEEEEEEDEEAGVDSS
340 350 360 370 380 390
150 160 170 180 190 200
pF1KSD ATSLQTPPRPPQPSILQPGSQVLPPPPTTLNGPGASPLPLPMYRPDGLSGPPPPNAQYQP
.:. .. : : . . :. :: : :.. ..:: : : .:: :.: : .:
CCDS47 STTSSASPMPNSYDALEGGSY-----PDMLSSSASSPAPDPAPEPDPASAPAPASAPAPV
400 410 420 430 440
210 220 230 240 250
pF1KSD PPLPGQT---LGAGYP---P-QQANSGPQMAGAQLSYP--GGFPGGPAQMAGPPQPQKKL
: :.. .: ::: : : ..: ..:.: : : .:: : :. : : ....
CCDS47 VPQPSKMAKPFGYGYPTLQPGYQNATAPLISGVQPSNPVYSGFQQYPQQYPGVNQLSSSI
450 460 470 480 490 500
260 270 280 290 300 310
pF1KSD DPDSIPSPIQVIENDRASRGGQVYATNTRGQIPPLVTTDCMIQD--QGNASPRFIRCTTY
:. : : :. : : : . : . . . : . : :: .:::
CCDS47 GGLSLQSSPQP-ESLRPVNLTQ--ERNILPMTPVWAPVPNLNADLKKLNCSPDSFRCTLT
510 520 530 540 550 560
320 330 340 350 360 370
pF1KSD CFPCTSDMAKQAQIPLAAVIKPFATIPSNESPLYLVNHGESGPVRCNRCKAYMCPFMQFI
.: :. . ..:..::. ...:: . .. :. : ::: :..:. ::..::
CCDS47 NIPQTQALLNKAKLPLGLLLHPFRDL--TQLPVITSN----TIVRCRSCRTYINPFVSFI
570 580 590 600 610
380 390 400 410 420 430
pF1KSD EGGRRYQCGFCNCVNDVPP-FYFQHLDHIGRRLDHYEKPELSLGSYEYVATLDYCRKSKP
. ::..:..: ::::: :... : . . ...::.. .. :..:. :: .:
CCDS47 DQ-RRWKCNLCYRVNDVPEEFMYNPLTR--SYGEPHKRPEVQNSTVEFIASSDYML--RP
620 630 640 650 660 670
440 450 460 470 480 490
pF1KSD PNPPAFIFMIDVSYSNIKNGLVKLICEELKTMLEKIPKEEQEETSAIRVGFITYNKVLHF
:.: ...:..:::.. .. : . ..:. : :.:.: . : :.::.:.....::
CCDS47 PQPAVYLFVLDVSHNAVEAGYLTILCQSLLENLDKLPGD-----SRTRIGFMTFDSTIHF
680 690 700 710 720
500 510 520 530 540 550
pF1KSD FNVKSNLAQPQMMVVTDVGEVFVPLLDGFLVNYQESQSVIHNLLDQIPDMFADSNENETV
.:.. .:.::::..:.:. .::.: :..::: ::. .:..::. .:.::... :....
CCDS47 YNLQEGLSQPQMLIVSDIDDVFLPTPDSLLVNLYESKELIKDLLNALPNMFTNTRETHSA
730 740 750 760 770 780
560 570 580 590 600 610
pF1KSD FASVIQAGMEALKAADCPGKLFIFHSSLPTAEAPGKLKNRDDKKLVNTDKEKILFQPQTN
.. ..::... .. . :.. .:...::. : : :..:.: . .. : . : :.
CCDS47 LGPALQAAFKLMSPTG--GRVSVFQTQLPSLGA-GLLQSREDPNQRSSTKVVQHLGPATD
790 800 810 820 830 840
620 630 640 650 660 670
pF1KSD VYDSLAKDCVAHGCSVTLFLFPSQYVDVASLGLVPQLTGGTLYKYNNFQM-HLDRQ--QF
: .:: :: .. .: :::. ::: :.:::. . . ..: .: : .:.. : : ..
CCDS47 FYKKLALDCSGQQTAVDLFLLSSQYSDLASLACMSKYSAGCIYYYPSFHYTHNPSQAEKL
850 860 870 880 890 900
680 690 700 710 720 730
pF1KSD LNDLRNDIEKKIGFDAIMRVRTSTGFRATDFFGGILMNNTTDVEMAAIDCDKAVTVEFKH
.::. . .::::.:.::.: . :. : :.... .: . .: :. : . .:...
CCDS47 QKDLKRYLTRKIGFEAVMRIRCTKGLSMHTFHGNFFVRSTDLLSLANINPDAGFAVQLSI
910 920 930 940 950 960
740 750 760 770 780 790
pF1KSD DDKLSEDSGALIQCAVLYTTISGQRRLRIHNLGLNCSSQLADLYKSCETDALINFFAKSA
...:.. : . .: :.:::. .:.::.:.:.: : :.:::.: . ...: : ..:. :
CCDS47 EESLTDTSLVCFQTALLYTSSKGERRIRVHTLCLPVVSSLADVYAGVDVQAAICLLANMA
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800 810 820 830 840 850
pF1KSD FKAVLHQPLKVIREILVNQTAHMLACYRKNCASPSAASQLILPDSMKVLPVYMNCLLKNC
. . :. :. ::: .. :. : . .: : :. :.:.:..:.:. :::.
CCDS47 VDRSVSSSLSDARDALVNAVVDSLSAY-GSTVSNLQHSALMAPSSLKLFPLYVLALLKQK
1030 1040 1050 1060 1070 1080
860 870 880 890 900
pF1KSD VLLSRPEISTDERAY------QRQLVMTMGVADSQLFFYPQLLPIHTLDVKSTMLPAAV-
.. . :.:.: .. :: : . .:. .: .. :.. ..:
CCDS47 AFRTGTSTRLDDRVYAMCQIKSQPLVHLMKMIHPNLYRIDRLTDEGAVHVNDRIVPQPPL
1090 1100 1110 1120 1130 1140
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pF1KSD -RCSESRLSEEGIFLLANGLHMFLWLGVSSPPELIQGIFNVPSFAHINTDMTLLPEVGNP
. : .:..:: ::. : ...:.: . ..:. ... .:: : :: :::. .
CCDS47 QKLSAEKLTREGAFLMDCGSVFYIWVGKGCDNNFIEDVLGYTNFASIPQKMTHLPELDTL
1150 1160 1170 1180 1190 1200
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD YSQQLRMIMGIIQQKRPYSMKLTIVKQREQPEMVFRQFLVEDKGLYGGSSYVDFLCCVHK
:.. : .. ....:: : : :::.. . : : :.::. .. :: .:: :..
CCDS47 SSERARSFITWLRDSRPLSPILHIVKDESPAKAEFFQHLIEDR-TEAAFSYYEFLLHVQQ
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1030
pF1KSD EICQLLN
.::.
CCDS47 QICK
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10 20 30 40 50
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CCDS43 SASQPYSSFVNHYNSPAMYSASSSVASQGFPSTCGHYAMSTVSNAAYPS-VSYPSLPAGD
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: . . . : : ..: ::: : .:: : : .. .: . :. . :
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CCDS43 S-PGLPSTQDNLIRNHTGSLAVANNNPTITVADSLSCPVMQNVQPPKSSPVVSTVLSGSS
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:.. ..:: : : .:: :.: : .: : :.. .: ::: : : ..:
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..:.: : : .:: : :. : : .... :. : : :. : : :
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. : . . . : . : :: .::: .: :. . ..:..::. ...:: . .
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. ...::.. .. :..:. :: .::.: ...:..:::.. .. : . ..:. :
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:.:.: . : :.::.:.....::.:.. .:.::::..:.:. .::.: :..
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pF1KSD LVNYQESQSVIHNLLDQIPDMFADSNENETVFASVIQAGMEALKAADCPGKLFIFHSSLP
::: ::. .:..::. .:.::... :...... ..::... .. . :.. .:...::
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. : : :..:.: . .. : . : :. : .:: :: .. .: :::. ::: :.:
CCDS43 SLGA-GLLQSREDPNQRSSTKVVQHLGPATDFYKKLALDCSGQQTAVDLFLLSSQYSDLA
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pF1KSD SLGLVPQLTGGTLYKYNNFQM-HLDRQ--QFLNDLRNDIEKKIGFDAIMRVRTSTGFRAT
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pF1KSD DFFGGILMNNTTDVEMAAIDCDKAVTVEFKHDDKLSEDSGALIQCAVLYTTISGQRRLRI
: :.... .: . .: :. : . .:... ...:.. : . .: :.:::. .:.::.:.
CCDS43 TFHGNFFVRSTDLLSLANINPDAGFAVQLSIEESLTDTSLVCFQTALLYTSSKGERRIRV
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pF1KSD HNLGLNCSSQLADLYKSCETDALINFFAKSAFKAVLHQPLKVIREILVNQTAHMLACYRK
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CCDS43 HTLCLPVVSSLADVYAGVDVQAAICLLANMAVDRSVSSSLSDARDALVNAVVDSLSAY-G
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pF1KSD NCASPSAASQLILPDSMKVLPVYMNCLLKNCVLLSRPEISTDERAY------QRQLVMTM
. .: : :. :.:.:..:.:. :::. .. . :.:.: .. :: :
CCDS43 STVSNLQHSALMAPSSLKLFPLYVLALLKQKAFRTGTSTRLDDRVYAMCQIKSQPLVHLM
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. .:. .: .. :.. ..: . : .:..:: ::. : ...:.: .
CCDS43 KMIHPNLYRIDRLTDEGAVHVNDRIVPQPPLQKLSAEKLTREGAFLMDCGSVFYIWVGKG
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pF1KSD SPPELIQGIFNVPSFAHINTDMTLLPEVGNPYSQQLRMIMGIIQQKRPYSMKLTIVKQRE
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CCDS43 CDNNFIEDVLGYTNFASIPQKMTHLPELDTLSSERARSFITWLRDSRPLSPILHIVKDES
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CCDS43 PAKAEFFQHLIEDR-TEAAFSYYEFLLHVQQQICK
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CCDS75 VTSVT------QPSELLQQKGVQYGEYVNNQASSAPTPLSSTSDDEEEEEEDEEAGVDSS
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.:. .. : : . . :. :: : :.. ..:: : : .:: :.: : .:
CCDS75 STTSSASPMPNSYDALEGGSY-----PDMLSSSASSPAPDPAPEPDPASAPAPASAPAPV
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pF1KSD PPLPGQT---LGAGYP---P-QQANSGPQMAGAQLSYP--GGFPGGPAQMAGPPQPQKKL
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CCDS75 VPQPSKMAKPFGYGYPTLQPGYQNATAPLISGVQPSNPVYSGFQQYP-QYPGVNQLSSSI
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pF1KSD DPDSIPSPIQVIENDRASRGGQVYATNTRGQIPPLVTTDCMIQD--QGNASPRFIRCTTY
:. : : :. : : : . : . . . : . : :: .:::
CCDS75 GGLSLQSSPQP-ESLRPVNLTQ--ERNILPMTPVWAPVPNLNADLKKLNCSPDSFRCTLT
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.: :. . ..:..::. ...:: . .. :. : ::: :..:. ::..::
CCDS75 NIPQTQALLNKAKLPLGLLLHPFRDL--TQLPVITSN----TIVRCRSCRTYINPFVSFI
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. ::..:..: ::::: :... : . . ...::.. .. :..:. :: .:
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CCDS75 PQPAVYLFVLDVSHNAVEAGYLTILCQSLLENLDKLPGD-----SRTRIGFMTFDSTIHF
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pF1KSD FASVIQAGMEALKAADCPGKLFIFHSSLPTAEAPGKLKNRDDKKLVNTDKEKILFQPQTN
.. ..::... .. . :.. .:...::. : : :..:.: . .. : . : :.
CCDS75 LGPALQAAFKLMSPTG--GRVSVFQTQLPSLGA-GLLQSREDPNQRSSTKVVQHLGPATD
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pF1KSD VYDSLAKDCVAHGCSVTLFLFPSQYVDVASLGLVPQLTGGTLYKYNNFQM-HLDRQ--QF
: .:: :: .. .: :::. ::: :.:::. . . ..: .: : .:.. : : ..
CCDS75 FYKKLALDCSGQQTAVDLFLLSSQYSDLASLACMSKYSAGCIYYYPSFHYTHNPSQAEKL
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pF1KSD LNDLRNDIEKKIGFDAIMRVRTSTGFRATDFFGGILMNNTTDVEMAAIDCDKAVTVEFKH
.::. . .::::.:.::.: . :. : :.... .: . .: :. : . .:...
CCDS75 QKDLKRYLTRKIGFEAVMRIRCTKGLSMHTFHGNFFVRSTDLLSLANINPDAGFAVQLSI
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pF1KSD DDKLSEDSGALIQCAVLYTTISGQRRLRIHNLGLNCSSQLADLYKSCETDALINFFAKSA
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CCDS75 EESLTDTSLVCFQTALLYTSSKGERRIRVHTLCLPVVSSLADVYAGVDVQAAICLLANMA
1000 1010 1020 1030 1040 1050
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pF1KSD FKAVLHQPLKVIREILVNQTAHMLACYRKNCASPSAASQLILPDSMKVLPVYMNCLLKNC
. . :. :. ::: .. :. : . .: : :. :.:.:..:.:. :::.
CCDS75 VDRSVSSSLSDARDALVNAVVDSLSAY-GSTVSNLQHSALMAPSSLKLFPLYVLALLKQK
1060 1070 1080 1090 1100 1110
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pF1KSD VLLSRPEISTDERAY------QRQLVMTMGVADSQLFFYPQLLPIHTLDVKSTMLPAAV-
.. . :.:.: .. :: : . .:. .: .. :.. ..:
CCDS75 AFRTGTSTRLDDRVYAMCQIKSQPLVHLMKMIHPNLYRIDRLTDEGAVHVNDRIVPQPPL
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pF1KSD -RCSESRLSEEGIFLLANGLHMFLWLGVSSPPELIQGIFNVPSFAHINTDMTLLPEVGNP
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CCDS75 QKLSAEKLTREGAFLMDCGSVFYIWVGKGCDNNFIEDVLGYTNFASIPQKMTHLPELDTL
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pF1KSD YSQQLRMIMGIIQQKRPYSMKLTIVKQREQPEMVFRQFLVEDKGLYGGSSYVDFLCCVHK
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CCDS75 SSERARSFITWLRDSRPLSPILHIVKDESPAKAEFFQHLIEDR-TEAAFSYYEFLLHVQQ
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pF1KSD EICQLLN
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CCDS75 QICK
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CCDS43 AQNGAALASGSPYTNGPVQNALLSSQESVSQGYNFQLPGSYPHPIPAKTLNPVSGQSNYG
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CCDS43 GSQ--GSGQTLNRP--PVASNPVTPSLHSGPAPRMPLPASQNPA-TTPMPSSSFLPEANL
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pF1KSD PPPVNNVASSHAPYQPSAQSSYPGPISTSSVTQLGSQLSAMQINSYGSGMAPPSQGPPGP
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CCDS43 PPPLN--WQYNYPSTASQTNHCPRASSQPTVSGNTSLTTNHQYVSSGYPSLQNSFIKSGP
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150 160 170 180 190
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..:: :: :. .:::. ::: :. : .: .: :..
CCDS43 ------SVPPLVNPPLPTTFQPGAPHGPPPAGGPPPVRALTPLTSSYRDVPQPLFNSAVN
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200 210 220 230 240
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CCDS43 QEGITSNTN-NGSMVVHSSYDEIEGGGLLATPQLTNKNPKMSRSVGYSYPSLPPG--YQN
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250 260 270 280 290
pF1KSD AGPPQ----PQKKLDPDSIP-----SPIQVIENDRASRGGQ--------VYATNTRGQIP
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CCDS43 TTPPGATGVPPSSLNYPSGPQAFTQTPLGANHLTTSMSGLSLQPEGLRVVNLLQERNMLP
310 320 330 340 350 360
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pF1KSD --PLVT-TDCMIQD--QGNASPRFIRCTTYCFPCTSDMAKQAQIPLAAVIKPFATIPSNE
:: . . .: . : .:...::: .: :. . ..:..::. ...:: .
CCDS43 STPLKPPVPNLHEDIQKLNCNPELFRCTLTSIPQTQALLNKAKLPLGLLLHPFKDL----
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: .:. : ::: :..:. ::..:.. ::..:..: ::::: : .. : ..
CCDS43 VQLPVVTS--STIVRCRSCRTYINPFVSFLDQ-RRWKCNLCYRVNDVPEEFLYNPLTRV-
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pF1KSD RRLDHYEKPELSLGSYEYVATLDYCRKSKPPNPPAFIFMIDVSYSNIKNGLVKLICEELK
. ...::.. .. :..: .: . ::.::...:..:::.. ...: .. .:. :
CCDS43 -YGEPHRRPEVQNATIEFMAPSEYMLR--PPQPPVYLFVFDVSHNAVETGYLNSVCQSLL
480 490 500 510 520 530
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pF1KSD TMLEKIPKEEQEETSAIRVGFITYNKVLHFFNVKSNLAQPQMMVVTDVGEVFVPLLDGFL
:. .: . . ..::::.....::.... .:.::::..:.:. .::.:. ...:
CCDS43 DNLDLLPGNTRT-----KIGFITFDSTIHFYGLQESLSQPQMLIVSDIEDVFIPMPENLL
540 550 560 570 580
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pF1KSD VNYQESQSVIHNLLDQIPDMFADSNENETVFASVIQAGMEALKAADCPGKLFIFHSSLPT
:: .::. ....:: .:.::. . :...... ..::... .. . :.. .:...:::
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