Result of FASTA (omim) for
pF1KSDA0745
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0745, 905 aa
1>>>pF1KSDA0745 905 - 905 aa - 905 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4199+/-0.000525; mu= 20.3398+/- 0.033
mean_var=64.7505+/-12.764, 0's: 0 Z-trim(106.2): 42 B-trim: 23 in 1/49
Lambda= 0.159387
statistics sampled from 14284 (14320) to 14284 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.49), E-opt: 0.2 (0.168), width: 16
Scan time: 9.670
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_055839 (OMIM: 606140) exportin-7 [Homo sapiens] (1087) 4183 971.8 0
XP_016868735 (OMIM: 606140) PREDICTED: exportin-7 (1088) 4183 971.8 0
XP_016868734 (OMIM: 606140) PREDICTED: exportin-7 (1096) 4183 971.8 0
XP_016868733 (OMIM: 606140) PREDICTED: exportin-7 (1097) 4183 971.8 0
XP_016865229 (OMIM: 606141) PREDICTED: ran-binding ( 999) 2913 679.7 1.8e-194
XP_016865228 (OMIM: 606141) PREDICTED: ran-binding (1039) 2913 679.8 1.9e-194
NP_075048 (OMIM: 606141) ran-binding protein 17 [H (1088) 2913 679.8 2e-194
XP_011532933 (OMIM: 606141) PREDICTED: ran-binding (1090) 2913 679.8 2e-194
XP_016865234 (OMIM: 606141) PREDICTED: ran-binding ( 792) 2895 675.6 2.6e-193
XP_016865232 (OMIM: 606141) PREDICTED: ran-binding (1010) 2895 675.6 3.3e-193
XP_016865227 (OMIM: 606141) PREDICTED: ran-binding (1043) 2895 675.6 3.4e-193
XP_016865225 (OMIM: 606141) PREDICTED: ran-binding (1052) 2895 675.6 3.4e-193
XP_011532929 (OMIM: 606141) PREDICTED: ran-binding (1092) 2895 675.6 3.5e-193
XP_016865226 (OMIM: 606141) PREDICTED: ran-binding (1094) 2895 675.6 3.5e-193
XP_016865231 (OMIM: 606141) PREDICTED: ran-binding ( 986) 2449 573.0 2.4e-162
XP_016865230 (OMIM: 606141) PREDICTED: ran-binding ( 990) 2431 568.9 4.2e-161
XP_016865236 (OMIM: 606141) PREDICTED: ran-binding ( 549) 2331 545.8 2.1e-154
XP_016868736 (OMIM: 606140) PREDICTED: exportin-7 ( 754) 1738 409.5 3.1e-113
XP_016865233 (OMIM: 606141) PREDICTED: ran-binding ( 746) 1377 326.5 3e-88
XP_011532939 (OMIM: 606141) PREDICTED: ran-binding ( 576) 1168 278.4 7e-74
XP_016865235 (OMIM: 606141) PREDICTED: ran-binding ( 580) 1168 278.4 7.1e-74
XP_011532938 (OMIM: 606141) PREDICTED: ran-binding ( 588) 1168 278.4 7.2e-74
>>NP_055839 (OMIM: 606140) exportin-7 [Homo sapiens] (1087 aa)
initn: 4183 init1: 4183 opt: 4183 Z-score: 5189.9 bits: 971.8 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4534; 80.6% identity (80.6% similar) in 937 aa overlap (151-905:151-1087)
130 140 150 160 170 180
pF1KSD FDCQKDDYVFRNAITDVTRFLQDSVEYCIIGVTILSQLTNEINQADTTHPLTKHRKIASS
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 FDCQKDDYVFRNAITDVTRFLQDSVEYCIIGVTILSQLTNEINQADTTHPLTKHRKIASS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD FRDSSLFDIFTLSCNLLKQASGKNLNLNDESQHGLLMQLLKLTHNCLNFDFIGTSTDESS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 FRDSSLFDIFTLSCNLLKQASGKNLNLNDESQHGLLMQLLKLTHNCLNFDFIGTSTDESS
190 200 210 220 230 240
250 260
pF1KSD DDLCTVQIPTSWRSAFLDSSTLQL------------------------------------
::::::::::::::::::::::::
NP_055 DDLCTVQIPTSWRSAFLDSSTLQLFFDLYHSIPPSFSPLVLSCLVQIASVRRSLFNNAER
250 260 270 280 290 300
pF1KSD ------------------------------------------------------------
NP_055 AKFLSHLVDGVKRILENPQSLSDPNNYHEFCRLLARLKSNYQLGELVKVENYPEVIRLIA
310 320 330 340 350 360
pF1KSD ------------------------------------------------------------
NP_055 NFTVTSLQHWEFAPNSVHYLLSLWQRLAASVPYVKATEPHMLETYTPEVTKAYITSRLES
370 380 390 400 410 420
270 280 290
pF1KSD --------------------------STIGRCEYEKTCALLVQLFDQSAQSYQELLQSAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 VHIILRDGLEDPLEDTGLVQQQLDQLSTIGRCEYEKTCALLVQLFDQSAQSYQELLQSAS
430 440 450 460 470 480
300 310 320 330 340 350
pF1KSD ASPMDIAVQEGRLTWLVYIIGAVIGGRVSFASTDEQDAMDGELVCRVLQLMNLTDSRLAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 ASPMDIAVQEGRLTWLVYIIGAVIGGRVSFASTDEQDAMDGELVCRVLQLMNLTDSRLAQ
490 500 510 520 530 540
360 370 380 390 400 410
pF1KSD AGNEKLELAMLSFFEQFRKIYIGDQVQKSSKLYRRLSEVLGLNDETMVLSVFIGKIITNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 AGNEKLELAMLSFFEQFRKIYIGDQVQKSSKLYRRLSEVLGLNDETMVLSVFIGKIITNL
550 560 570 580 590 600
420 430 440 450 460 470
pF1KSD KYWGRCEPITSKTLQLLNDLSIGYSSVRKLVKLSAVQFMLNNHTSEHFSFLGINNQSNLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 KYWGRCEPITSKTLQLLNDLSIGYSSVRKLVKLSAVQFMLNNHTSEHFSFLGINNQSNLT
610 620 630 640 650 660
480 490 500 510 520 530
pF1KSD DMRCRTTFYTALGRLLMVDLGEDEDQYEQFMLPLTAAFEAVAQMFSTNSFNEQEAKRTLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 DMRCRTTFYTALGRLLMVDLGEDEDQYEQFMLPLTAAFEAVAQMFSTNSFNEQEAKRTLV
670 680 690 700 710 720
540 550 560 570 580 590
pF1KSD GLVRDLRGIAFAFNAKTSFMMLFEWIYPSYMPILQRAIELWYHDPACTTPVLKLMAELVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 GLVRDLRGIAFAFNAKTSFMMLFEWIYPSYMPILQRAIELWYHDPACTTPVLKLMAELVH
730 740 750 760 770 780
600 610 620 630 640 650
pF1KSD NRSQRLQFDVSSPNGILLFRETSKMITMYGNRILTLGEVPKDQVYALKLKGISICFSMLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 NRSQRLQFDVSSPNGILLFRETSKMITMYGNRILTLGEVPKDQVYALKLKGISICFSMLK
790 800 810 820 830 840
660 670 680 690 700 710
pF1KSD AALSGSYVNFGVFRLYGDDALDNALQTFIKLLLSIPHSDLLDYPKLSQSYYSLLEVLTQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 AALSGSYVNFGVFRLYGDDALDNALQTFIKLLLSIPHSDLLDYPKLSQSYYSLLEVLTQD
850 860 870 880 890 900
720 730 740 750 760 770
pF1KSD HMNFIASLEPHVIMYILSSISEGLTALDTMVCTGCCSCLDHIVTYLFKQLSRSTKKRTTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 HMNFIASLEPHVIMYILSSISEGLTALDTMVCTGCCSCLDHIVTYLFKQLSRSTKKRTTP
910 920 930 940 950 960
780 790 800 810 820 830
pF1KSD LNQESDRFLHIMQQHPEMIQQMLSTVLNIIIFEDCRNQWSMSRPLLGLILLNEKYFSDLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 LNQESDRFLHIMQQHPEMIQQMLSTVLNIIIFEDCRNQWSMSRPLLGLILLNEKYFSDLR
970 980 990 1000 1010 1020
840 850 860 870 880 890
pF1KSD NSIVNSQPPEKQQAMHLCFENLMEGIERNLLTKNRDRFTQNLSAFRREVNDSMKNSTYGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 NSIVNSQPPEKQQAMHLCFENLMEGIERNLLTKNRDRFTQNLSAFRREVNDSMKNSTYGV
1030 1040 1050 1060 1070 1080
900
pF1KSD NSNDMMS
:::::::
NP_055 NSNDMMS
>--
initn: 972 init1: 972 opt: 972 Z-score: 1199.5 bits: 233.4 E(85289): 4.5e-60
Smith-Waterman score: 972; 100.0% identity (100.0% similar) in 150 aa overlap (1-150:1-150)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MADHVQSLAQLENLCKQLYETTDTTTRLQAEKALVEFTNSPDCLSKCQLLLERGSSSYSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 MADHVQSLAQLENLCKQLYETTDTTTRLQAEKALVEFTNSPDCLSKCQLLLERGSSSYSQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD LLAATCLTKLVSRTNNPLPLEQRIDIRNYVLNYLATRPKLATFVTQALIQLYARITKLGW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 LLAATCLTKLVSRTNNPLPLEQRIDIRNYVLNYLATRPKLATFVTQALIQLYARITKLGW
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD FDCQKDDYVFRNAITDVTRFLQDSVEYCIIGVTILSQLTNEINQADTTHPLTKHRKIASS
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 FDCQKDDYVFRNAITDVTRFLQDSVEYCIIGVTILSQLTNEINQADTTHPLTKHRKIASS
130 140 150 160 170 180
>>XP_016868735 (OMIM: 606140) PREDICTED: exportin-7 isof (1088 aa)
initn: 4183 init1: 4183 opt: 4183 Z-score: 5189.9 bits: 971.8 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4534; 80.6% identity (80.6% similar) in 937 aa overlap (151-905:152-1088)
130 140 150 160 170 180
pF1KSD FDCQKDDYVFRNAITDVTRFLQDSVEYCIIGVTILSQLTNEINQADTTHPLTKHRKIASS
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FDCQKDDYVFRNAITDVTRFLQDSVEYCIIGVTILSQLTNEINQADTTHPLTKHRKIASS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD FRDSSLFDIFTLSCNLLKQASGKNLNLNDESQHGLLMQLLKLTHNCLNFDFIGTSTDESS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FRDSSLFDIFTLSCNLLKQASGKNLNLNDESQHGLLMQLLKLTHNCLNFDFIGTSTDESS
190 200 210 220 230 240
250 260
pF1KSD DDLCTVQIPTSWRSAFLDSSTLQL------------------------------------
::::::::::::::::::::::::
XP_016 DDLCTVQIPTSWRSAFLDSSTLQLFFDLYHSIPPSFSPLVLSCLVQIASVRRSLFNNAER
250 260 270 280 290 300
pF1KSD ------------------------------------------------------------
XP_016 AKFLSHLVDGVKRILENPQSLSDPNNYHEFCRLLARLKSNYQLGELVKVENYPEVIRLIA
310 320 330 340 350 360
pF1KSD ------------------------------------------------------------
XP_016 NFTVTSLQHWEFAPNSVHYLLSLWQRLAASVPYVKATEPHMLETYTPEVTKAYITSRLES
370 380 390 400 410 420
270 280 290
pF1KSD --------------------------STIGRCEYEKTCALLVQLFDQSAQSYQELLQSAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VHIILRDGLEDPLEDTGLVQQQLDQLSTIGRCEYEKTCALLVQLFDQSAQSYQELLQSAS
430 440 450 460 470 480
300 310 320 330 340 350
pF1KSD ASPMDIAVQEGRLTWLVYIIGAVIGGRVSFASTDEQDAMDGELVCRVLQLMNLTDSRLAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ASPMDIAVQEGRLTWLVYIIGAVIGGRVSFASTDEQDAMDGELVCRVLQLMNLTDSRLAQ
490 500 510 520 530 540
360 370 380 390 400 410
pF1KSD AGNEKLELAMLSFFEQFRKIYIGDQVQKSSKLYRRLSEVLGLNDETMVLSVFIGKIITNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 AGNEKLELAMLSFFEQFRKIYIGDQVQKSSKLYRRLSEVLGLNDETMVLSVFIGKIITNL
550 560 570 580 590 600
420 430 440 450 460 470
pF1KSD KYWGRCEPITSKTLQLLNDLSIGYSSVRKLVKLSAVQFMLNNHTSEHFSFLGINNQSNLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KYWGRCEPITSKTLQLLNDLSIGYSSVRKLVKLSAVQFMLNNHTSEHFSFLGINNQSNLT
610 620 630 640 650 660
480 490 500 510 520 530
pF1KSD DMRCRTTFYTALGRLLMVDLGEDEDQYEQFMLPLTAAFEAVAQMFSTNSFNEQEAKRTLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DMRCRTTFYTALGRLLMVDLGEDEDQYEQFMLPLTAAFEAVAQMFSTNSFNEQEAKRTLV
670 680 690 700 710 720
540 550 560 570 580 590
pF1KSD GLVRDLRGIAFAFNAKTSFMMLFEWIYPSYMPILQRAIELWYHDPACTTPVLKLMAELVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GLVRDLRGIAFAFNAKTSFMMLFEWIYPSYMPILQRAIELWYHDPACTTPVLKLMAELVH
730 740 750 760 770 780
600 610 620 630 640 650
pF1KSD NRSQRLQFDVSSPNGILLFRETSKMITMYGNRILTLGEVPKDQVYALKLKGISICFSMLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NRSQRLQFDVSSPNGILLFRETSKMITMYGNRILTLGEVPKDQVYALKLKGISICFSMLK
790 800 810 820 830 840
660 670 680 690 700 710
pF1KSD AALSGSYVNFGVFRLYGDDALDNALQTFIKLLLSIPHSDLLDYPKLSQSYYSLLEVLTQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 AALSGSYVNFGVFRLYGDDALDNALQTFIKLLLSIPHSDLLDYPKLSQSYYSLLEVLTQD
850 860 870 880 890 900
720 730 740 750 760 770
pF1KSD HMNFIASLEPHVIMYILSSISEGLTALDTMVCTGCCSCLDHIVTYLFKQLSRSTKKRTTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 HMNFIASLEPHVIMYILSSISEGLTALDTMVCTGCCSCLDHIVTYLFKQLSRSTKKRTTP
910 920 930 940 950 960
780 790 800 810 820 830
pF1KSD LNQESDRFLHIMQQHPEMIQQMLSTVLNIIIFEDCRNQWSMSRPLLGLILLNEKYFSDLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LNQESDRFLHIMQQHPEMIQQMLSTVLNIIIFEDCRNQWSMSRPLLGLILLNEKYFSDLR
970 980 990 1000 1010 1020
840 850 860 870 880 890
pF1KSD NSIVNSQPPEKQQAMHLCFENLMEGIERNLLTKNRDRFTQNLSAFRREVNDSMKNSTYGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NSIVNSQPPEKQQAMHLCFENLMEGIERNLLTKNRDRFTQNLSAFRREVNDSMKNSTYGV
1030 1040 1050 1060 1070 1080
900
pF1KSD NSNDMMS
:::::::
XP_016 NSNDMMS
>--
initn: 932 init1: 932 opt: 932 Z-score: 1149.8 bits: 224.2 E(85289): 2.6e-57
Smith-Waterman score: 932; 99.3% identity (100.0% similar) in 145 aa overlap (6-150:7-151)
10 20 30 40 50
pF1KSD MADHVQSLAQLENLCKQLYETTDTTTRLQAEKALVEFTNSPDCLSKCQLLLERGSSSYS
.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MRDPGRKSLAQLENLCKQLYETTDTTTRLQAEKALVEFTNSPDCLSKCQLLLERGSSSYS
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KSD QLLAATCLTKLVSRTNNPLPLEQRIDIRNYVLNYLATRPKLATFVTQALIQLYARITKLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QLLAATCLTKLVSRTNNPLPLEQRIDIRNYVLNYLATRPKLATFVTQALIQLYARITKLG
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KSD WFDCQKDDYVFRNAITDVTRFLQDSVEYCIIGVTILSQLTNEINQADTTHPLTKHRKIAS
:::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 WFDCQKDDYVFRNAITDVTRFLQDSVEYCIIGVTILSQLTNEINQADTTHPLTKHRKIAS
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KSD SFRDSSLFDIFTLSCNLLKQASGKNLNLNDESQHGLLMQLLKLTHNCLNFDFIGTSTDES
XP_016 SFRDSSLFDIFTLSCNLLKQASGKNLNLNDESQHGLLMQLLKLTHNCLNFDFIGTSTDES
190 200 210 220 230 240
>>XP_016868734 (OMIM: 606140) PREDICTED: exportin-7 isof (1096 aa)
initn: 5228 init1: 4183 opt: 4183 Z-score: 5189.8 bits: 971.8 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4456; 79.6% identity (79.6% similar) in 937 aa overlap (160-905:160-1096)
130 140 150 160 170 180
pF1KSD FRNAITDVTRFLQDSVEYCIIGVTILSQLTNEINQ---------ADTTHPLTKHRKIASS
::::: ::::::::::::::::
XP_016 FRNAITDVTRFLQDSVEYCIIGVTILSQLTNEINQVSATAFLIEADTTHPLTKHRKIASS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD FRDSSLFDIFTLSCNLLKQASGKNLNLNDESQHGLLMQLLKLTHNCLNFDFIGTSTDESS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FRDSSLFDIFTLSCNLLKQASGKNLNLNDESQHGLLMQLLKLTHNCLNFDFIGTSTDESS
190 200 210 220 230 240
250 260
pF1KSD DDLCTVQIPTSWRSAFLDSSTLQL------------------------------------
::::::::::::::::::::::::
XP_016 DDLCTVQIPTSWRSAFLDSSTLQLFFDLYHSIPPSFSPLVLSCLVQIASVRRSLFNNAER
250 260 270 280 290 300
pF1KSD ------------------------------------------------------------
XP_016 AKFLSHLVDGVKRILENPQSLSDPNNYHEFCRLLARLKSNYQLGELVKVENYPEVIRLIA
310 320 330 340 350 360
pF1KSD ------------------------------------------------------------
XP_016 NFTVTSLQHWEFAPNSVHYLLSLWQRLAASVPYVKATEPHMLETYTPEVTKAYITSRLES
370 380 390 400 410 420
270 280 290
pF1KSD --------------------------STIGRCEYEKTCALLVQLFDQSAQSYQELLQSAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VHIILRDGLEDPLEDTGLVQQQLDQLSTIGRCEYEKTCALLVQLFDQSAQSYQELLQSAS
430 440 450 460 470 480
300 310 320 330 340 350
pF1KSD ASPMDIAVQEGRLTWLVYIIGAVIGGRVSFASTDEQDAMDGELVCRVLQLMNLTDSRLAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ASPMDIAVQEGRLTWLVYIIGAVIGGRVSFASTDEQDAMDGELVCRVLQLMNLTDSRLAQ
490 500 510 520 530 540
360 370 380 390 400 410
pF1KSD AGNEKLELAMLSFFEQFRKIYIGDQVQKSSKLYRRLSEVLGLNDETMVLSVFIGKIITNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 AGNEKLELAMLSFFEQFRKIYIGDQVQKSSKLYRRLSEVLGLNDETMVLSVFIGKIITNL
550 560 570 580 590 600
420 430 440 450 460 470
pF1KSD KYWGRCEPITSKTLQLLNDLSIGYSSVRKLVKLSAVQFMLNNHTSEHFSFLGINNQSNLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KYWGRCEPITSKTLQLLNDLSIGYSSVRKLVKLSAVQFMLNNHTSEHFSFLGINNQSNLT
610 620 630 640 650 660
480 490 500 510 520 530
pF1KSD DMRCRTTFYTALGRLLMVDLGEDEDQYEQFMLPLTAAFEAVAQMFSTNSFNEQEAKRTLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DMRCRTTFYTALGRLLMVDLGEDEDQYEQFMLPLTAAFEAVAQMFSTNSFNEQEAKRTLV
670 680 690 700 710 720
540 550 560 570 580 590
pF1KSD GLVRDLRGIAFAFNAKTSFMMLFEWIYPSYMPILQRAIELWYHDPACTTPVLKLMAELVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GLVRDLRGIAFAFNAKTSFMMLFEWIYPSYMPILQRAIELWYHDPACTTPVLKLMAELVH
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pF1KSD NRSQRLQFDVSSPNGILLFRETSKMITMYGNRILTLGEVPKDQVYALKLKGISICFSMLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NRSQRLQFDVSSPNGILLFRETSKMITMYGNRILTLGEVPKDQVYALKLKGISICFSMLK
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660 670 680 690 700 710
pF1KSD AALSGSYVNFGVFRLYGDDALDNALQTFIKLLLSIPHSDLLDYPKLSQSYYSLLEVLTQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 AALSGSYVNFGVFRLYGDDALDNALQTFIKLLLSIPHSDLLDYPKLSQSYYSLLEVLTQD
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pF1KSD HMNFIASLEPHVIMYILSSISEGLTALDTMVCTGCCSCLDHIVTYLFKQLSRSTKKRTTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 HMNFIASLEPHVIMYILSSISEGLTALDTMVCTGCCSCLDHIVTYLFKQLSRSTKKRTTP
910 920 930 940 950 960
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pF1KSD LNQESDRFLHIMQQHPEMIQQMLSTVLNIIIFEDCRNQWSMSRPLLGLILLNEKYFSDLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LNQESDRFLHIMQQHPEMIQQMLSTVLNIIIFEDCRNQWSMSRPLLGLILLNEKYFSDLR
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pF1KSD NSIVNSQPPEKQQAMHLCFENLMEGIERNLLTKNRDRFTQNLSAFRREVNDSMKNSTYGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NSIVNSQPPEKQQAMHLCFENLMEGIERNLLTKNRDRFTQNLSAFRREVNDSMKNSTYGV
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900
pF1KSD NSNDMMS
:::::::
XP_016 NSNDMMS
1090
>--
initn: 1022 init1: 1022 opt: 1022 Z-score: 1261.6 bits: 244.9 E(85289): 1.6e-63
Smith-Waterman score: 1022; 100.0% identity (100.0% similar) in 159 aa overlap (1-159:1-159)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MADHVQSLAQLENLCKQLYETTDTTTRLQAEKALVEFTNSPDCLSKCQLLLERGSSSYSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MADHVQSLAQLENLCKQLYETTDTTTRLQAEKALVEFTNSPDCLSKCQLLLERGSSSYSQ
10 20 30 40 50 60
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pF1KSD LLAATCLTKLVSRTNNPLPLEQRIDIRNYVLNYLATRPKLATFVTQALIQLYARITKLGW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LLAATCLTKLVSRTNNPLPLEQRIDIRNYVLNYLATRPKLATFVTQALIQLYARITKLGW
70 80 90 100 110 120
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pF1KSD FDCQKDDYVFRNAITDVTRFLQDSVEYCIIGVTILSQLTNEINQADTTHPLTKHRKIASS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FDCQKDDYVFRNAITDVTRFLQDSVEYCIIGVTILSQLTNEINQVSATAFLIEADTTHPL
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pF1KSD FRDSSLFDIFTLSCNLLKQASGKNLNLNDESQHGLLMQLLKLTHNCLNFDFIGTSTDESS
XP_016 TKHRKIASSFRDSSLFDIFTLSCNLLKQASGKNLNLNDESQHGLLMQLLKLTHNCLNFDF
190 200 210 220 230 240
>>XP_016868733 (OMIM: 606140) PREDICTED: exportin-7 isof (1097 aa)
initn: 5188 init1: 4183 opt: 4183 Z-score: 5189.8 bits: 971.8 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4456; 79.6% identity (79.6% similar) in 937 aa overlap (160-905:161-1097)
130 140 150 160 170 180
pF1KSD FRNAITDVTRFLQDSVEYCIIGVTILSQLTNEINQ---------ADTTHPLTKHRKIASS
::::: ::::::::::::::::
XP_016 FRNAITDVTRFLQDSVEYCIIGVTILSQLTNEINQVSATAFLIEADTTHPLTKHRKIASS
140 150 160 170 180 190
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pF1KSD FRDSSLFDIFTLSCNLLKQASGKNLNLNDESQHGLLMQLLKLTHNCLNFDFIGTSTDESS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FRDSSLFDIFTLSCNLLKQASGKNLNLNDESQHGLLMQLLKLTHNCLNFDFIGTSTDESS
200 210 220 230 240 250
250 260
pF1KSD DDLCTVQIPTSWRSAFLDSSTLQL------------------------------------
::::::::::::::::::::::::
XP_016 DDLCTVQIPTSWRSAFLDSSTLQLFFDLYHSIPPSFSPLVLSCLVQIASVRRSLFNNAER
260 270 280 290 300 310
pF1KSD ------------------------------------------------------------
XP_016 AKFLSHLVDGVKRILENPQSLSDPNNYHEFCRLLARLKSNYQLGELVKVENYPEVIRLIA
320 330 340 350 360 370
pF1KSD ------------------------------------------------------------
XP_016 NFTVTSLQHWEFAPNSVHYLLSLWQRLAASVPYVKATEPHMLETYTPEVTKAYITSRLES
380 390 400 410 420 430
270 280 290
pF1KSD --------------------------STIGRCEYEKTCALLVQLFDQSAQSYQELLQSAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VHIILRDGLEDPLEDTGLVQQQLDQLSTIGRCEYEKTCALLVQLFDQSAQSYQELLQSAS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ASPMDIAVQEGRLTWLVYIIGAVIGGRVSFASTDEQDAMDGELVCRVLQLMNLTDSRLAQ
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pF1KSD AGNEKLELAMLSFFEQFRKIYIGDQVQKSSKLYRRLSEVLGLNDETMVLSVFIGKIITNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 AGNEKLELAMLSFFEQFRKIYIGDQVQKSSKLYRRLSEVLGLNDETMVLSVFIGKIITNL
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pF1KSD KYWGRCEPITSKTLQLLNDLSIGYSSVRKLVKLSAVQFMLNNHTSEHFSFLGINNQSNLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KYWGRCEPITSKTLQLLNDLSIGYSSVRKLVKLSAVQFMLNNHTSEHFSFLGINNQSNLT
620 630 640 650 660 670
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pF1KSD DMRCRTTFYTALGRLLMVDLGEDEDQYEQFMLPLTAAFEAVAQMFSTNSFNEQEAKRTLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DMRCRTTFYTALGRLLMVDLGEDEDQYEQFMLPLTAAFEAVAQMFSTNSFNEQEAKRTLV
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pF1KSD GLVRDLRGIAFAFNAKTSFMMLFEWIYPSYMPILQRAIELWYHDPACTTPVLKLMAELVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GLVRDLRGIAFAFNAKTSFMMLFEWIYPSYMPILQRAIELWYHDPACTTPVLKLMAELVH
740 750 760 770 780 790
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pF1KSD NRSQRLQFDVSSPNGILLFRETSKMITMYGNRILTLGEVPKDQVYALKLKGISICFSMLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NRSQRLQFDVSSPNGILLFRETSKMITMYGNRILTLGEVPKDQVYALKLKGISICFSMLK
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pF1KSD AALSGSYVNFGVFRLYGDDALDNALQTFIKLLLSIPHSDLLDYPKLSQSYYSLLEVLTQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 AALSGSYVNFGVFRLYGDDALDNALQTFIKLLLSIPHSDLLDYPKLSQSYYSLLEVLTQD
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pF1KSD HMNFIASLEPHVIMYILSSISEGLTALDTMVCTGCCSCLDHIVTYLFKQLSRSTKKRTTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 HMNFIASLEPHVIMYILSSISEGLTALDTMVCTGCCSCLDHIVTYLFKQLSRSTKKRTTP
920 930 940 950 960 970
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LNQESDRFLHIMQQHPEMIQQMLSTVLNIIIFEDCRNQWSMSRPLLGLILLNEKYFSDLR
980 990 1000 1010 1020 1030
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pF1KSD NSIVNSQPPEKQQAMHLCFENLMEGIERNLLTKNRDRFTQNLSAFRREVNDSMKNSTYGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NSIVNSQPPEKQQAMHLCFENLMEGIERNLLTKNRDRFTQNLSAFRREVNDSMKNSTYGV
1040 1050 1060 1070 1080 1090
900
pF1KSD NSNDMMS
:::::::
XP_016 NSNDMMS
>--
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Smith-Waterman score: 982; 99.4% identity (100.0% similar) in 154 aa overlap (6-159:7-160)
10 20 30 40 50
pF1KSD MADHVQSLAQLENLCKQLYETTDTTTRLQAEKALVEFTNSPDCLSKCQLLLERGSSSYS
.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MRDPGRKSLAQLENLCKQLYETTDTTTRLQAEKALVEFTNSPDCLSKCQLLLERGSSSYS
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KSD QLLAATCLTKLVSRTNNPLPLEQRIDIRNYVLNYLATRPKLATFVTQALIQLYARITKLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QLLAATCLTKLVSRTNNPLPLEQRIDIRNYVLNYLATRPKLATFVTQALIQLYARITKLG
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KSD WFDCQKDDYVFRNAITDVTRFLQDSVEYCIIGVTILSQLTNEINQADTTHPLTKHRKIAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 WFDCQKDDYVFRNAITDVTRFLQDSVEYCIIGVTILSQLTNEINQVSATAFLIEADTTHP
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KSD SFRDSSLFDIFTLSCNLLKQASGKNLNLNDESQHGLLMQLLKLTHNCLNFDFIGTSTDES
XP_016 LTKHRKIASSFRDSSLFDIFTLSCNLLKQASGKNLNLNDESQHGLLMQLLKLTHNCLNFD
190 200 210 220 230 240
>>XP_016865229 (OMIM: 606141) PREDICTED: ran-binding pro (999 aa)
initn: 2535 init1: 1209 opt: 2913 Z-score: 3612.2 bits: 679.7 E(85289): 1.8e-194
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40 50 60 70 80 90
pF1KSD EKALVEFTNSPDCLSKCQLLLERGSSSYSQLLAATCLTKLVSRTNNPLPLEQRIDIRNYV
:::::::.:::::.. :::.:::.:::::.
XP_016 EKALLELIDSPECLSKCQLLLEQGTTSYAQLLAATCLSKLVSRVS-PLPVEQRMDIRNYI
40 50 60 70 80
100 110 120 130 140 150
pF1KSD LNYLATRPKLATFVTQALIQLYARITKLGWFDCQKDDYVFRNAITDVTRFLQDSVEYCII
:::.:..:::: :: :::::. :.:::::::. :::..:::. :.:: .::: .::.:::
XP_016 LNYVASQPKLAPFVIQALIQVIAKITKLGWFEVQKDQFVFREIIADVKKFLQGTVEHCII
90 100 110 120 130 140
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pF1KSD GVTILSQLTNEINQADTTHPLTKHRKIASSFRDSSLFDIFTLSCNLLKQASGKNLNLNDE
:: :::.::.:.: .: ..: .::::::.::::.:: :...:.:.:::.. .: :::.:.
XP_016 GVIILSELTQEMNLVDYSRPSAKHRKIATSFRDTSLKDVLVLACSLLKEVFAKPLNLQDQ
150 160 170 180 190 200
220 230 240 250 260
pF1KSD SQHGLLMQLLKLTHNCLNFDFIGTSTDESSDDLCTVQIPTSWRSAFLDSSTL--------
:..:.::.:::. :::::::::.:.:::.::::::::::.::. ::. ::
XP_016 CQQNLVMQVLKLVLNCLNFDFIGSSADESADDLCTVQIPTTWRTIFLEPETLDLFFNLYH
210 220 230 240 250 260
pF1KSD ------------------------------------------------------------
XP_016 SLPPLLSQLHWEFAPNSVHYLLTLWQRMVASVPFVKSTEPHLLDTYAPEITKAFITSRLD
270 280 290 300 310 320
270 280 290
pF1KSD -------------------------QLSTIGRCEYEKTCALLVQLFDQSAQSYQELLQSA
:: :..:::::::::::::::::.::.::.::.
XP_016 SVAIVVRDHLDDPLDDTATVFQQLEQLCTVSRCEYEKTCALLVQLFDQNAQNYQKLLHPY
330 340 350 360 370 380
300 310 320 330 340 350
pF1KSD SASPMDIAVQEGRLTWLVYIIGAVIGGRVSFASTDEQDAMDGELVCRVLQLMNLTDSRLA
:. .::..:::::.::::..:.:.:::....::::.::::::: :::.::..: :. :
XP_016 SGVTVDITIQEGRLAWLVYLVGTVVGGRLTYTSTDEHDAMDGELSCRVFQLISLMDTGLP
390 400 410 420 430 440
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pF1KSD QAGNEKLELAMLSFFEQFRKIYIGDQVQKSSKLYRRLSEVLGLNDETMVLSVFIGKIITN
. :::.:::.: :..:::: :.:::.:..::.: :.:::::..:.. :: .:. ::.::
XP_016 RCCNEKIELAILWFLDQFRKTYVGDQLQRTSKVYARMSEVLGITDDNHVLETFMTKIVTN
450 460 470 480 490 500
420 430 440 450 460 470
pF1KSD LKYWGRCEPITSKTLQLLNDLSIGYSSVRKLVKLSAVQFMLNNHTSEHFSFLGINNQSNL
:::::: ::. :.:::.:::::.:: ..::::..::.:::.::::::: ::::... .:
XP_016 LKYWGRYEPVISRTLQFLNDLSVGYILLKKLVKIDAVKFMLKNHTSEHFPFLGISDNHSL
510 520 530 540 550 560
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pF1KSD TDMRCRTTFYTALGRLLMVDLGEDEDQYEQFMLPLTAAFEAVAQMFSTNSFNEQEAKRTL
.:.:::::::::: ::::::::::::..:.::::::.:::.: :.:. :.:.....:: :
XP_016 SDFRCRTTFYTALTRLLMVDLGEDEDEFENFMLPLTVAFETVLQIFN-NNFKQEDVKRML
570 580 590 600 610 620
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pF1KSD VGLVRDLRGIAFAFNAKTSFMMLFEWIYPSYMPILQRAIELWYHDPACTTPVLKLMAELV
.::.:::::::::.:.:::. :::.:.::.:.:.:: :.: :: .:.::::.:::::::.
XP_016 IGLARDLRGIAFALNTKTSYTMLFDWMYPTYLPLLQNAVERWYGEPTCTTPILKLMAELM
630 640 650 660 670 680
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pF1KSD HNRSQRLQFDVSSPNGILLFRETSKMITMYGNRILTLGEVPKDQVYALKLKGISICFSML
.::::::.::::::::::::::.:::. :::.::.:: . :::.: .::::::::.: :
XP_016 QNRSQRLNFDVSSPNGILLFREASKMVCTYGNQILSLGSLSKDQIYPMKLKGISICYSAL
690 700 710 720 730 740
660 670 680 690 700 710
pF1KSD KAALSGSYVNFGVFRLYGDDALDNALQTFIKLLLSIPHSDLLDYPKLSQSYYSLLEVLTQ
:.:: :.::.::::.::::. .::.::.:.:.:::. :::::.: ::::::: ::: :::
XP_016 KSALCGNYVSFGVFKLYGDNHFDNVLQAFVKMLLSVSHSDLLQYRKLSQSYYPLLECLTQ
750 760 770 780 790 800
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pF1KSD DHMNFIASLEPHVIMYILSSISEGLTALDTMVCTGCCSCLDHIVTYLFKQLSRSTKK--R
:::.:: .::: :.::.:.:::::::.:::.: ..::. ::.:::::::.... :: :
XP_016 DHMSFIINLEPPVLMYVLTSISEGLTTLDTVVSSSCCTSLDYIVTYLFKHIAKEGKKPLR
810 820 830 840 850 860
780 790 800 810 820 830
pF1KSD TTPLNQESDRFLHIMQQHPEMIQQMLSTVLNIIIFEDCRNQWSMSRPLLGLILLNEKYFS
.: ..:.::.:::.:...:::.:...: :.:::::::::.::::::::::::::::
XP_016 CREATQAGQRLLHFMQQNPDVLQQMMSVLMNTIVFEDCRNQWSVSRPLLGLILLNEKYFS
870 880 890 900 910 920
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pF1KSD DLRNSIVNSQPPEKQQAMHLCFENLMEGIERNLLTKNRDRFTQNLSAFRREVNDSMK-NS
.:: :..:::: ::... ::.:::::.:.:: .:::::::::::.:::.: .... ..
XP_016 ELRASLINSQPLPKQEVLAQCFRNLMEGVEQNLSVKNRDRFTQNLSVFRRDVAEALRSDG
930 940 950 960 970 980
900
pF1KSD TYGVNSNDMMS
. : ::::
XP_016 NTEPCSLDMMS
990
>--
initn: 258 init1: 258 opt: 258 Z-score: 312.7 bits: 69.2 E(85289): 1.1e-10
Smith-Waterman score: 258; 65.0% identity (85.0% similar) in 60 aa overlap (1-60:1-60)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MADHVQSLAQLENLCKQLYETTDTTTRLQAEKALVEFTNSPDCLSKCQLLLERGSSSYSQ
:: : ::::.:: :: .:: :: : :..:::::.:. .::.::::::::::.:..::.:
XP_016 MALHFQSLAELEVLCTHLYIGTDLTQRIEAEKALLELIDSPECLSKCQLLLEQGTTSYAQ
10 20 30 40 50 60
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pF1KSD LLAATCLTKLVSRTNNPLPLEQRIDIRNYVLNYLATRPKLATFVTQALIQLYARITKLGW
XP_016 LLAATCLSKLVSRVSPLPVEQRMDIRNYILNYVASQPKLAPFVIQALIQVIAKITKLGWF
70 80 90 100 110 120
>>XP_016865228 (OMIM: 606141) PREDICTED: ran-binding pro (1039 aa)
initn: 2535 init1: 1209 opt: 2913 Z-score: 3611.9 bits: 679.8 E(85289): 1.9e-194
Smith-Waterman score: 3339; 55.5% identity (76.5% similar) in 939 aa overlap (103-905:102-1039)
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pF1KSD RTNNPLPLEQRIDIRNYVLNYLATRPKLATFVTQALIQLYARITKLGWFDCQKDDYVFRN
:: :::::. :.:::::::. :::..:::.
XP_016 SRVSPLPVEQRMDIRNYILNYVASQPKLAPFVIQALIQVIAKITKLGWFEVQKDQFVFRE
80 90 100 110 120 130
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pF1KSD AITDVTRFLQDSVEYCIIGVTILSQLTNEINQADTTHPLTKHRKIASSFRDSSLFDIFTL
:.:: .::: .::.::::: :::.::.:.: .: ..: .::::::.::::.:: :...:
XP_016 IIADVKKFLQGTVEHCIIGVIILSELTQEMNLVDYSRPSAKHRKIATSFRDTSLKDVLVL
140 150 160 170 180 190
200 210 220 230 240 250
pF1KSD SCNLLKQASGKNLNLNDESQHGLLMQLLKLTHNCLNFDFIGTSTDESSDDLCTVQIPTSW
.:.:::.. .: :::.:. :..:.::.:::. :::::::::.:.:::.::::::::::.:
XP_016 ACSLLKEVFAKPLNLQDQCQQNLVMQVLKLVLNCLNFDFIGSSADESADDLCTVQIPTTW
200 210 220 230 240 250
260
pF1KSD RSAFLDSSTL--------------------------------------------------
:. ::. ::
XP_016 RTIFLEPETLDLFFNLYHSLPPLLSQLALSCLVQFASTRRSLFNSPERAKYLGNLIKGVK
260 270 280 290 300 310
pF1KSD ------------------------------------------------------------
XP_016 RILENPQHWEFAPNSVHYLLTLWQRMVASVPFVKSTEPHLLDTYAPEITKAFITSRLDSV
320 330 340 350 360 370
270 280 290
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:: :..:::::::::::::::::.::.::.::. :.
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300 310 320 330 340 350
pF1KSD SPMDIAVQEGRLTWLVYIIGAVIGGRVSFASTDEQDAMDGELVCRVLQLMNLTDSRLAQA
.::..:::::.::::..:.:.:::....::::.::::::: :::.::..: :. : .
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:::.:::.: :..:::: :.:::.:..::.: :.:::::..:.. :: .:. ::.::::
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pF1KSD YWGRCEPITSKTLQLLNDLSIGYSSVRKLVKLSAVQFMLNNHTSEHFSFLGINNQSNLTD
:::: ::. :.:::.:::::.:: ..::::..::.:::.::::::: ::::... .:.:
XP_016 YWGRYEPVISRTLQFLNDLSVGYILLKKLVKIDAVKFMLKNHTSEHFPFLGISDNHSLSD
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pF1KSD MRCRTTFYTALGRLLMVDLGEDEDQYEQFMLPLTAAFEAVAQMFSTNSFNEQEAKRTLVG
.:::::::::: ::::::::::::..:.::::::.:::.: :.:. :.:.....:: :.:
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:.:::::::::.:.:::. :::.:.::.:.:.:: :.: :: .:.::::.:::::::..:
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:: :.::.::::.::::. .::.::.:.:.:::. :::::.: ::::::: ::: :::::
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:.:: .::: :.::.:.:::::::.:::.: ..::. ::.:::::::.... :: :
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.: ..:.::.:::.:...:::.:...: :.:::::::::.::::::::::::::::.:
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: :..:::: ::... ::.:::::.:.:: .:::::::::::.:::.: .... ...
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: ::::
XP_016 EPCSLDMMS
>--
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pF1KSD FDCQKDDYVFRNAITDVTRFLQDSVEYCIIGVTILSQLTNEINQADTTHPLTKHRKIASS
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NP_075 REATQAGQRLLHFMQQNPDVLQQMMSVLMNTIVFEDCRNQWSVSRPLLGLILLNEKYFSE
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NP_075 TEPCSLDMMS
1080
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pF1KSD MADHVQSLAQLENLCKQLYETTDTTTRLQAEKALVEFTNSPDCLSKCQLLLERGSSSYSQ
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NP_075 MALHFQSLAELEVLCTHLYIGTDLTQRIEAEKALLELIDSPECLSKCQLLLEQGTTSYAQ
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NP_075 LLAATCLSKLVSRVS-PLPVEQRMDIRNYILNYVASQPKLAPFVIQALIQVIAKITKLGW
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pF1KSD FDCQKDDYVFRNAITDVTRFLQDSVEYCIIGVTILSQLTNEINQADTTHPLTKHRKIASS
:. :::..:::. :.:: .::: .::.:::
NP_075 FEVQKDQFVFREIIADVKKFLQGTVEHCIIGVIILSELTQEMNLVDYSRPSAKHRKIATS
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>>XP_011532933 (OMIM: 606141) PREDICTED: ran-binding pro (1090 aa)
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Smith-Waterman score: 3018; 52.0% identity (71.9% similar) in 940 aa overlap (151-905:152-1090)
130 140 150 160 170 180
pF1KSD FDCQKDDYVFRNAITDVTRFLQDSVEYCIIGVTILSQLTNEINQADTTHPLTKHRKIASS
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pF1KSD FRDSSLFDIFTLSCNLLKQASGKNLNLNDESQHGLLMQLLKLTHNCLNFDFIGTSTDESS
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XP_011 FRDTSLKDVLVLACSLLKEVFAKPLNLQDQCQQNLVMQVLKLVLNCLNFDFIGSSADESA
190 200 210 220 230 240
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pF1KSD DDLCTVQIPTSWRSAFLDSSTL--------------------------------------
::::::::::.::. ::. ::
XP_011 DDLCTVQIPTTWRTIFLEPETLDLFFNLYHSLPPLLSQLALSCLVQFASTRRSLFNSPER
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pF1KSD ------------------------------------------------------------
XP_011 AKYLGNLIKGVKRILENPQGLSDPGNYHEFCRFLARLKTNYQLGELVMVKEYPEVIRLIA
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XP_011 NFTITSLQHWEFAPNSVHYLLTLWQRMVASVPFVKSTEPHLLDTYAPEITKAFITSRLDS
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pF1KSD ------------------------QLSTIGRCEYEKTCALLVQLFDQSAQSYQELLQSAS
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XP_011 VAIVVRDHLDDPLDDTATVFQQLEQLCTVSRCEYEKTCALLVQLFDQNAQNYQKLLHPYS
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pF1KSD ASPMDIAVQEGRLTWLVYIIGAVIGGRVSFASTDEQDAMDGELVCRVLQLMNLTDSRLAQ
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XP_011 GVTVDITIQEGRLAWLVYLVGTVVGGRLTYTSTDEHDAMDGELSCRVFQLISLMDTGLPR
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pF1KSD AGNEKLELAMLSFFEQFRKIYIGDQVQKSSKLYRRLSEVLGLNDETMVLSVFIGKIITNL
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pF1KSD KYWGRCEPITSKTLQLLNDLSIGYSSVRKLVKLSAVQFMLNNHTSEHFSFLGINNQSNLT
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XP_011 DFRCRTTFYTALTRLLMVDLGEDEDEFENFMLPLTVAFETVLQIFN-NNFKQEDVKRMLI
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XP_011 GLARDLRGIAFALNTKTSYTMLFDWMYPTYLPLLQNAVERWYGEPTCTTPILKLMAELMQ
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XP_011 NRSQRLNFDVSSPNGILLFREASKMVCTYGNQILSLGSLSKDQIYPMKLKGISICYSALK
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pF1KSD AALSGSYVNFGVFRLYGDDALDNALQTFIKLLLSIPHSDLLDYPKLSQSYYSLLEVLTQD
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XP_011 SALCGNYVSFGVFKLYGDNHFDNVLQAFVKMLLSVSHSDLLQYRKLSQSYYPLLECLTQD
850 860 870 880 890 900
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pF1KSD HMNFIASLEPHVIMYILSSISEGLTALDTMVCTGCCSCLDHIVTYLFKQLSRSTKK--RT
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XP_011 HMSFIINLEPPVLMYVLTSISEGLTTLDTVVSSSCCTSLDYIVTYLFKHIAKEGKKPLRC
910 920 930 940 950 960
780 790 800 810 820 830
pF1KSD TPLNQESDRFLHIMQQHPEMIQQMLSTVLNIIIFEDCRNQWSMSRPLLGLILLNEKYFSD
.: ..:.::.:::.:...:::.:...: :.:::::::::.::::::::::::::::.
XP_011 REATQAGQRLLHFMQQNPDVLQQMMSVLMNTIVFEDCRNQWSVSRPLLGLILLNEKYFSE
970 980 990 1000 1010 1020
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pF1KSD LRNSIVNSQPPEKQQAMHLCFENLMEGIERNLLTKNRDRFTQNLSAFRREVNDSMK-NST
:: :..:::: ::... ::.:::::.:.:: .:::::::::::.:::.: .... ...
XP_011 LRASLINSQPLPKQEVLAQCFRNLMEGVEQNLSVKNRDRFTQNLSVFRRDVAEALRSDGN
1030 1040 1050 1060 1070 1080
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pF1KSD YGVNSNDMMS
: ::::
XP_011 TEPCSLDMMS
1090
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initn: 674 init1: 365 opt: 663 Z-score: 815.5 bits: 162.4 E(85289): 1.1e-38
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10 20 30 40 50
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XP_011 MLIFFSLKSLAELEVLCTHLYIGTDLTQRIEAEKALLELIDSPECLSKCQLLLEQGTTSY
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.::::::::.:::::.. :::.:::.:::::.:::.:..:::: :: :::::. :.::::
XP_011 AQLLAATCLSKLVSRVS-PLPVEQRMDIRNYILNYVASQPKLAPFVIQALIQVIAKITKL
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pF1KSD SSFRDSSLFDIFTLSCNLLKQASGKNLNLNDESQHGLLMQLLKLTHNCLNFDFIGTSTDE
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::. :. .::..:::::.::::..:.:.:::....::::.::::::: :::.::..:
XP_016 LLHPYSGVTVDITIQEGRLAWLVYLVGTVVGGRLTYTSTDEHDAMDGELSCRVFQLISLM
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:. : . :::.:::.: :..:::: :.:::.:..::.: :.:::::..:.. :: .:.
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.. .:.:.:::::::::: ::::::::::::..:.::::::.:::.: :.:. :.:....
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:::::.: ::.:: :.::.::::.::::. .::.::.:.:.:::. :::::.: ::::::
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pF1KSD YSLLEVLTQDHMNFIASLEPHVIMYILSSISEGLTALDTMVCTGCCSCLDHIVTYLFKQL
: ::: ::::::.:: .::: :.::.:.:::::::.:::.: ..::. ::.:::::::..
XP_016 YPLLECLTQDHMSFIINLEPPVLMYVLTSISEGLTTLDTVVSSSCCTSLDYIVTYLFKHI
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.. :: : .: ..:.::.:::.:...:::.:...: :.:::::::::.:::::::
XP_016 AKEGKKPLRCREATQAGQRLLHFMQQNPDVLQQMMSVLMNTIVFEDCRNQWSVSRPLLGL
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pF1KSD ILLNEKYFSDLRNSIVNSQPPEKQQAMHLCFENLMEGIERNLLTKNRDRFTQNLSAFRRE
:::::::::.:: :..:::: ::... ::.:::::.:.:: .:::::::::::.:::.
XP_016 ILLNEKYFSELRASLINSQPLPKQEVLAQCFRNLMEGVEQNLSVKNRDRFTQNLSVFRRD
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890 900
pF1KSD VNDSMK-NSTYGVNSNDMMS
: .... ... : ::::
XP_016 VAEALRSDGNTEPCSLDMMS
780 790
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pF1KSD FDCQKDDYVFRNAITDVTRFLQDSVEYCIIGVTILSQLTNEINQADTTHPLTKHRKIASS
:: :::.::.:.: .: ..: .::::::.:
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pF1KSD FRDSSLFDIFTLSCNLLKQASGKNLNLNDESQHGLLMQLLKLTHNCLNFDFIGTSTDESS
:::.:: :...:.:.:::.. .: :::.:. :..:.::.:::. :::::::::.:.:::.
XP_016 FRDTSLKDVLVLACSLLKEVFAKPLNLQDQCQQNLVMQVLKLVLNCLNFDFIGSSADESA
100 110 120 130 140 150
250 260
pF1KSD DDLCTVQIPTSWRSAFLDSSTL--------------------------------------
::::::::::.::. ::. ::
XP_016 DDLCTVQIPTTWRTIFLEPETLDLFFNLYHSLPPLLSQLALSCLVQFASTRRSLFNSPER
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pF1KSD ------------------------------------------------------------
XP_016 AKYLGNLIKGVKRILENPQGLSDPGNYHEFCRFLARLKTNYQLGELVMVKEYPEVIRLIA
220 230 240 250 260 270
pF1KSD ------------------------------------------------------------
XP_016 NFTITSLQHWEFAPNSVHYLLTLWQRMVASVPFVKSTEPHLLDTYAPEITKAFITSRLDS
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270 280 290
pF1KSD ------------------------QLSTIGRCEYEKTCALLVQLFDQSAQSYQELLQSAS
:: :..:::::::::::::::::.::.::.::. :
XP_016 VAIVVRDHLDDPLDDTATVFQQLEQLCTVSRCEYEKTCALLVQLFDQNAQNYQKLLHPYS
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300 310 320 330 340 350
pF1KSD ASPMDIAVQEGRLTWLVYIIGAVIGGRVSFASTDEQDAMDGELVCRVLQLMNLTDSRLAQ
. .::..:::::.::::..:.:.:::....::::.::::::: :::.::..: :. : .
XP_016 GVTVDITIQEGRLAWLVYLVGTVVGGRLTYTSTDEHDAMDGELSCRVFQLISLMDTGLPR
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pF1KSD AGNEKLELAMLSFFEQFRKIYIGDQVQKSSKLYRRLSEVLGLNDETMVLSVFIGKIITNL
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XP_016 CCNEKIELAILWFLDQFRKTYVGDQLQRTSKVYARMSEVLGITDDNHVLETFMTKIVTNL
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420 430 440 450 460 470
pF1KSD KYWGRCEPITSKTLQLLNDLSIGYSSVRKLVKLSAVQFMLNNHTSEHFSFLGINNQSNLT
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XP_016 KYWGRYEPVISRTLQFLNDLSVGYILLKKLVKIDAVKFMLKNHTSEHFPFLGISDNHSLS
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XP_016 DFRCRTTFYTALTRLLMVDLGEDEDEFENFMLPLTVAFETVLQIFN-NNFKQEDVKRMLI
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820 830 840 850 860 870
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880 890 900 910 920 930
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pF1KSD YFSDLRNSIVNSQPPEKQQAMHLCFENLMEGIERNLLTKNRDRFTQNLSAFRREVNDSMK
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XP_016 SDGNTEPCSLDMMS
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60 70 80 90 100 110
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]