Result of FASTA (omim) for
pF1KSDA0736
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0736, 742 aa
1>>>pF1KSDA0736 742 - 742 aa - 742 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3238+/-0.000453; mu= 16.7935+/- 0.028
mean_var=136.8017+/-28.629, 0's: 0 Z-trim(113.8): 129 B-trim: 1381 in 2/52
Lambda= 0.109655
statistics sampled from 23177 (23312) to 23177 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.621), E-opt: 0.2 (0.273), width: 16
Scan time: 10.880
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_055664 (OMIM: 185860) synaptic vesicle glycopro ( 742) 5019 806.5 0
NP_001315604 (OMIM: 185860) synaptic vesicle glyco ( 742) 5019 806.5 0
NP_001315603 (OMIM: 185860) synaptic vesicle glyco ( 742) 5019 806.5 0
XP_005255055 (OMIM: 185861) PREDICTED: synaptic ve ( 683) 2849 463.2 1.6e-129
NP_001309961 (OMIM: 185861) synaptic vesicle glyco ( 683) 2849 463.2 1.6e-129
NP_055663 (OMIM: 185861) synaptic vesicle glycopro ( 683) 2849 463.2 1.6e-129
XP_016878250 (OMIM: 185861) PREDICTED: synaptic ve ( 683) 2849 463.2 1.6e-129
NP_001309968 (OMIM: 185861) synaptic vesicle glyco ( 683) 2849 463.2 1.6e-129
XP_016878251 (OMIM: 185861) PREDICTED: synaptic ve ( 683) 2849 463.2 1.6e-129
NP_001309960 (OMIM: 185861) synaptic vesicle glyco ( 683) 2849 463.2 1.6e-129
NP_001309967 (OMIM: 185861) synaptic vesicle glyco ( 683) 2849 463.2 1.6e-129
NP_001309966 (OMIM: 185861) synaptic vesicle glyco ( 683) 2849 463.2 1.6e-129
XP_011541584 (OMIM: 610291) PREDICTED: synaptic ve ( 727) 2822 458.9 3.2e-128
XP_011541583 (OMIM: 610291) PREDICTED: synaptic ve ( 727) 2822 458.9 3.2e-128
NP_055794 (OMIM: 610291) synaptic vesicle glycopro ( 727) 2822 458.9 3.2e-128
NP_001284645 (OMIM: 610291) synaptic vesicle glyco ( 676) 2608 425.0 4.8e-118
NP_001309965 (OMIM: 185861) synaptic vesicle glyco ( 540) 2474 403.7 9.8e-112
NP_001309969 (OMIM: 185861) synaptic vesicle glyco ( 532) 2466 402.5 2.3e-111
NP_001161052 (OMIM: 185861) synaptic vesicle glyco ( 532) 2466 402.5 2.3e-111
NP_001309963 (OMIM: 185861) synaptic vesicle glyco ( 616) 2061 338.5 5e-92
NP_001309962 (OMIM: 185861) synaptic vesicle glyco ( 572) 1875 309.0 3.4e-83
XP_016864733 (OMIM: 610291) PREDICTED: synaptic ve ( 382) 1342 224.5 6.3e-58
NP_001265648 (OMIM: 185860) synaptic vesicle glyco ( 194) 1168 196.7 7.6e-50
NP_061181 (OMIM: 611699) synaptic vesicle 2-relate ( 548) 359 69.2 5.2e-11
XP_005250200 (OMIM: 611700) PREDICTED: putative tr ( 492) 319 62.8 3.9e-09
NP_001132928 (OMIM: 611700) putative transporter S ( 492) 319 62.8 3.9e-09
NP_001318121 (OMIM: 611700) putative transporter S ( 401) 249 51.6 7.3e-06
XP_011534514 (OMIM: 608276) PREDICTED: solute carr ( 347) 195 43.0 0.0025
XP_011534513 (OMIM: 608276) PREDICTED: solute carr ( 417) 195 43.1 0.0028
NP_001135923 (OMIM: 612583) protein spinster homol ( 476) 195 43.2 0.0031
XP_011534508 (OMIM: 608276) PREDICTED: solute carr ( 483) 195 43.2 0.0031
XP_006721159 (OMIM: 612583) PREDICTED: protein spi ( 521) 195 43.2 0.0033
NP_001135920 (OMIM: 612583) protein spinster homol ( 528) 195 43.2 0.0033
NP_114427 (OMIM: 612583) protein spinster homolog ( 528) 195 43.2 0.0033
XP_016879248 (OMIM: 612583) PREDICTED: protein spi ( 573) 195 43.2 0.0035
XP_016879247 (OMIM: 612583) PREDICTED: protein spi ( 578) 193 42.9 0.0044
XP_016879246 (OMIM: 612583) PREDICTED: protein spi ( 591) 193 42.9 0.0044
>>NP_055664 (OMIM: 185860) synaptic vesicle glycoprotein (742 aa)
initn: 5019 init1: 5019 opt: 5019 Z-score: 4301.1 bits: 806.5 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5019; 100.0% identity (100.0% similar) in 742 aa overlap (1-742:1-742)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MEEGFRDRAAFIRGAKDIAKEVKKHAAKKVVKGLDRVQDEYSRRSYSRFEEEDDDDDFPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 MEEGFRDRAAFIRGAKDIAKEVKKHAAKKVVKGLDRVQDEYSRRSYSRFEEEDDDDDFPA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD PSDGYYRGEGTQDEEEGGASSDATEGHDEDDEIYEGEYQGIPRAESGGKGERMADGAPLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 PSDGYYRGEGTQDEEEGGASSDATEGHDEDDEIYEGEYQGIPRAESGGKGERMADGAPLA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD GVRGGLSDGEGPPGGRGEAQRRKEREELAQQYEAILRECGHGRFQWTLYFVLGLALMADG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 GVRGGLSDGEGPPGGRGEAQRRKEREELAQQYEAILRECGHGRFQWTLYFVLGLALMADG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD VEVFVVGFVLPSAEKDMCLSDSNKGMLGLIVYLGMMVGAFLWGGLADRLGRRQCLLISLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 VEVFVVGFVLPSAEKDMCLSDSNKGMLGLIVYLGMMVGAFLWGGLADRLGRRQCLLISLS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD VNSVFAFFSSFVQGYGTFLFCRLLSGVGIGGSIPIVFSYFSEFLAQEKRGEHLSWLCMFW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 VNSVFAFFSSFVQGYGTFLFCRLLSGVGIGGSIPIVFSYFSEFLAQEKRGEHLSWLCMFW
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD MIGGVYAAAMAWAIIPHYGWSFQMGSAYQFHSWRVFVLVCAFPSVFAIGALTTQPESPRF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 MIGGVYAAAMAWAIIPHYGWSFQMGSAYQFHSWRVFVLVCAFPSVFAIGALTTQPESPRF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD FLENGKHDEAWMVLKQVHDTNMRAKGHPERVFSVTHIKTIHQEDELIEIQSDTGTWYQRW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 FLENGKHDEAWMVLKQVHDTNMRAKGHPERVFSVTHIKTIHQEDELIEIQSDTGTWYQRW
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD GVRALSLGGQVWGNFLSCFGPEYRRITLMMMGVWFTMSFSYYGLTVWFPDMIRHLQAVDY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 GVRALSLGGQVWGNFLSCFGPEYRRITLMMMGVWFTMSFSYYGLTVWFPDMIRHLQAVDY
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD ASRTKVFPGERVEHVTFNFTLENQIHRGGQYFNDKFIGLRLKSVSFEDSLFEECYFEDVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 ASRTKVFPGERVEHVTFNFTLENQIHRGGQYFNDKFIGLRLKSVSFEDSLFEECYFEDVT
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD SSNTFFRNCTFINTVFYNTDLFEYKFVNSRLINSTFLHNKEGCPLDVTGTGEGAYMVYFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 SSNTFFRNCTFINTVFYNTDLFEYKFVNSRLINSTFLHNKEGCPLDVTGTGEGAYMVYFV
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD SFLGTLAVLPGNIVSALLMDKIGRLRMLAGSSVMSCVSCFFLSFGNSESAMIALLCLFGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 SFLGTLAVLPGNIVSALLMDKIGRLRMLAGSSVMSCVSCFFLSFGNSESAMIALLCLFGG
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD VSIASWNALDVLTVELYPSDKRTTAFGFLNALCKLAAVLGISIFTSFVGITKAAPILFAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 VSIASWNALDVLTVELYPSDKRTTAFGFLNALCKLAAVLGISIFTSFVGITKAAPILFAS
670 680 690 700 710 720
730 740
pF1KSD AALALGSSLALKLPETRGQVLQ
::::::::::::::::::::::
NP_055 AALALGSSLALKLPETRGQVLQ
730 740
>>NP_001315604 (OMIM: 185860) synaptic vesicle glycoprot (742 aa)
initn: 5019 init1: 5019 opt: 5019 Z-score: 4301.1 bits: 806.5 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5019; 100.0% identity (100.0% similar) in 742 aa overlap (1-742:1-742)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MEEGFRDRAAFIRGAKDIAKEVKKHAAKKVVKGLDRVQDEYSRRSYSRFEEEDDDDDFPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MEEGFRDRAAFIRGAKDIAKEVKKHAAKKVVKGLDRVQDEYSRRSYSRFEEEDDDDDFPA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD PSDGYYRGEGTQDEEEGGASSDATEGHDEDDEIYEGEYQGIPRAESGGKGERMADGAPLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PSDGYYRGEGTQDEEEGGASSDATEGHDEDDEIYEGEYQGIPRAESGGKGERMADGAPLA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD GVRGGLSDGEGPPGGRGEAQRRKEREELAQQYEAILRECGHGRFQWTLYFVLGLALMADG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GVRGGLSDGEGPPGGRGEAQRRKEREELAQQYEAILRECGHGRFQWTLYFVLGLALMADG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD VEVFVVGFVLPSAEKDMCLSDSNKGMLGLIVYLGMMVGAFLWGGLADRLGRRQCLLISLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VEVFVVGFVLPSAEKDMCLSDSNKGMLGLIVYLGMMVGAFLWGGLADRLGRRQCLLISLS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD VNSVFAFFSSFVQGYGTFLFCRLLSGVGIGGSIPIVFSYFSEFLAQEKRGEHLSWLCMFW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VNSVFAFFSSFVQGYGTFLFCRLLSGVGIGGSIPIVFSYFSEFLAQEKRGEHLSWLCMFW
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD MIGGVYAAAMAWAIIPHYGWSFQMGSAYQFHSWRVFVLVCAFPSVFAIGALTTQPESPRF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MIGGVYAAAMAWAIIPHYGWSFQMGSAYQFHSWRVFVLVCAFPSVFAIGALTTQPESPRF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD FLENGKHDEAWMVLKQVHDTNMRAKGHPERVFSVTHIKTIHQEDELIEIQSDTGTWYQRW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FLENGKHDEAWMVLKQVHDTNMRAKGHPERVFSVTHIKTIHQEDELIEIQSDTGTWYQRW
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD GVRALSLGGQVWGNFLSCFGPEYRRITLMMMGVWFTMSFSYYGLTVWFPDMIRHLQAVDY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GVRALSLGGQVWGNFLSCFGPEYRRITLMMMGVWFTMSFSYYGLTVWFPDMIRHLQAVDY
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD ASRTKVFPGERVEHVTFNFTLENQIHRGGQYFNDKFIGLRLKSVSFEDSLFEECYFEDVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ASRTKVFPGERVEHVTFNFTLENQIHRGGQYFNDKFIGLRLKSVSFEDSLFEECYFEDVT
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD SSNTFFRNCTFINTVFYNTDLFEYKFVNSRLINSTFLHNKEGCPLDVTGTGEGAYMVYFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SSNTFFRNCTFINTVFYNTDLFEYKFVNSRLINSTFLHNKEGCPLDVTGTGEGAYMVYFV
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD SFLGTLAVLPGNIVSALLMDKIGRLRMLAGSSVMSCVSCFFLSFGNSESAMIALLCLFGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SFLGTLAVLPGNIVSALLMDKIGRLRMLAGSSVMSCVSCFFLSFGNSESAMIALLCLFGG
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD VSIASWNALDVLTVELYPSDKRTTAFGFLNALCKLAAVLGISIFTSFVGITKAAPILFAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VSIASWNALDVLTVELYPSDKRTTAFGFLNALCKLAAVLGISIFTSFVGITKAAPILFAS
670 680 690 700 710 720
730 740
pF1KSD AALALGSSLALKLPETRGQVLQ
::::::::::::::::::::::
NP_001 AALALGSSLALKLPETRGQVLQ
730 740
>>NP_001315603 (OMIM: 185860) synaptic vesicle glycoprot (742 aa)
initn: 5019 init1: 5019 opt: 5019 Z-score: 4301.1 bits: 806.5 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5019; 100.0% identity (100.0% similar) in 742 aa overlap (1-742:1-742)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MEEGFRDRAAFIRGAKDIAKEVKKHAAKKVVKGLDRVQDEYSRRSYSRFEEEDDDDDFPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MEEGFRDRAAFIRGAKDIAKEVKKHAAKKVVKGLDRVQDEYSRRSYSRFEEEDDDDDFPA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD PSDGYYRGEGTQDEEEGGASSDATEGHDEDDEIYEGEYQGIPRAESGGKGERMADGAPLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PSDGYYRGEGTQDEEEGGASSDATEGHDEDDEIYEGEYQGIPRAESGGKGERMADGAPLA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD GVRGGLSDGEGPPGGRGEAQRRKEREELAQQYEAILRECGHGRFQWTLYFVLGLALMADG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GVRGGLSDGEGPPGGRGEAQRRKEREELAQQYEAILRECGHGRFQWTLYFVLGLALMADG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD VEVFVVGFVLPSAEKDMCLSDSNKGMLGLIVYLGMMVGAFLWGGLADRLGRRQCLLISLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VEVFVVGFVLPSAEKDMCLSDSNKGMLGLIVYLGMMVGAFLWGGLADRLGRRQCLLISLS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD VNSVFAFFSSFVQGYGTFLFCRLLSGVGIGGSIPIVFSYFSEFLAQEKRGEHLSWLCMFW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VNSVFAFFSSFVQGYGTFLFCRLLSGVGIGGSIPIVFSYFSEFLAQEKRGEHLSWLCMFW
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD MIGGVYAAAMAWAIIPHYGWSFQMGSAYQFHSWRVFVLVCAFPSVFAIGALTTQPESPRF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MIGGVYAAAMAWAIIPHYGWSFQMGSAYQFHSWRVFVLVCAFPSVFAIGALTTQPESPRF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD FLENGKHDEAWMVLKQVHDTNMRAKGHPERVFSVTHIKTIHQEDELIEIQSDTGTWYQRW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FLENGKHDEAWMVLKQVHDTNMRAKGHPERVFSVTHIKTIHQEDELIEIQSDTGTWYQRW
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD GVRALSLGGQVWGNFLSCFGPEYRRITLMMMGVWFTMSFSYYGLTVWFPDMIRHLQAVDY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GVRALSLGGQVWGNFLSCFGPEYRRITLMMMGVWFTMSFSYYGLTVWFPDMIRHLQAVDY
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD ASRTKVFPGERVEHVTFNFTLENQIHRGGQYFNDKFIGLRLKSVSFEDSLFEECYFEDVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ASRTKVFPGERVEHVTFNFTLENQIHRGGQYFNDKFIGLRLKSVSFEDSLFEECYFEDVT
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD SSNTFFRNCTFINTVFYNTDLFEYKFVNSRLINSTFLHNKEGCPLDVTGTGEGAYMVYFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SSNTFFRNCTFINTVFYNTDLFEYKFVNSRLINSTFLHNKEGCPLDVTGTGEGAYMVYFV
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD SFLGTLAVLPGNIVSALLMDKIGRLRMLAGSSVMSCVSCFFLSFGNSESAMIALLCLFGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SFLGTLAVLPGNIVSALLMDKIGRLRMLAGSSVMSCVSCFFLSFGNSESAMIALLCLFGG
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD VSIASWNALDVLTVELYPSDKRTTAFGFLNALCKLAAVLGISIFTSFVGITKAAPILFAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VSIASWNALDVLTVELYPSDKRTTAFGFLNALCKLAAVLGISIFTSFVGITKAAPILFAS
670 680 690 700 710 720
730 740
pF1KSD AALALGSSLALKLPETRGQVLQ
::::::::::::::::::::::
NP_001 AALALGSSLALKLPETRGQVLQ
730 740
>>XP_005255055 (OMIM: 185861) PREDICTED: synaptic vesicl (683 aa)
initn: 2988 init1: 2187 opt: 2849 Z-score: 2446.3 bits: 463.2 E(85289): 1.6e-129
Smith-Waterman score: 3027; 64.0% identity (85.9% similar) in 695 aa overlap (49-741:4-682)
20 30 40 50 60 70
pF1KSD AKEVKKHAAKKVVKGLDRVQDEYSRRSYSRFEEEDDDDDFPAPSDGYYRGEGTQDEEEGG
.. .:. . :::::::::. .. ::.
XP_005 MDDYKYQDNYGGY-APSDGYYRGNESNPEED--
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KSD ASSDATEGHDEDDEIYEGEYQGIPRAES-GGKGERMADGAPLAGVRGGLSDGEGPPGGRG
:.::.::::::.::::::::::::. .. .: .:: . . ..:: .:
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:.: ...:.::.:::.:. ::::::::: :.:::::::::::::::::.:.::::::::
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: :::
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pF1KSD EAQRRKEREELAQQYEAILRECGHGRFQWTLYFVLGLALMADGVEVFVVGFVLPSAEKDM
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pF1KSD YGWSFQMGSAYQFHSWRVFVLVCAFPSVFAIGALTTQPESPRFFLENGKHDEAWMVLKQV
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::...:.::::.::.:::..:.:: .::.:::::::..:::.:.:.:. :. .::.::::
NP_001 YPTNQRATAFGILNGLCKFGAILGNTIFASFVGITKVVPILLAAASLVGGGLIALRLPET
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740
pF1KSD RGQVLQ
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NP_001 REQVLM
680
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NP_055 AQSDVTEGHDEEDEIYEGEYQGIPHPDDVKAKQAKMAP-SRMDSLRGQ-TDLM-------
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NP_055 -AERLEDEEQLAHQYETIMDECGHGRFQWILFFVLGLALMADGVEVFVVSFALPSAEKDM
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pF1KSD RGQVLQ
: :::
NP_055 REQVLM
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pF1KSD FLFCRLLSGVGIGGSIPIVFSYFSEFLAQEKRGEHLSWLCMFWMIGGVYAAAMAWAIIPH
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XP_016 FLFCRLISGIGIGGALPIVFAYFSEFLSREKRGEHLSWLGIFWMTGGLYASAMAWSIIPH
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pF1KSD YGWSFQMGSAYQFHSWRVFVLVCAFPSVFAIGALTTQPESPRFFLENGKHDEAWMVLKQV
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XP_016 YGWGFSMGTNYHFHSWRVFVIVCALPCTVSMVALKFMPESPRFLLEMGKHDEAWMILKQV
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pF1KSD HDTNMRAKGHPERVFSVTHIKTIHQEDELIEIQSDTGTWYQRWGVRALSLGGQVWGNFLS
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XP_016 HDTNMRAKGTPEKVFTVSNIKTPKQMDEFIEIQSSTGTWYQRWLVRFKTIFKQVWDNALY
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pF1KSD C-FGPEYRRITLMMMGVWFTMSFSYYGLTVWFPDMIRHLQAVDYASRTKVFPGERVEHVT
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XP_016 CVMGP-YRMNTLILAVVWFAMAFSYYGLTVWFPDMIRYFQDEEYKSKMKVFFGEHVYGAT
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XP_016 INFTMENQIHQHGKLVNDKFTRMYFKHVLFEDTFFDECYFEDVTSTDTYFKNCTIESTIF
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pF1KSD YNTDLFEYKFVNSRLINSTFLHNKEGCPLDVTGTGEGAYMVYFVSFLGTLAVLPGNIVSA
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XP_016 YNTDLYEHKFINCRFINSTFLEQKEGCHMDLEQDND--FLIYLVSFLGSLSVLPGNIISA
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620 630 640 650 660 670
pF1KSD LLMDKIGRLRMLAGSSVMSCVSCFFLSFGNSESAMIALLCLFGGVSIASWNALDVLTVEL
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XP_016 LLMDRIGRLKMIGGSMLISAVCCFFLFFGNSESAMIGWQCLFCGTSIAAWNALDVITVEL
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680 690 700 710 720 730
pF1KSD YPSDKRTTAFGFLNALCKLAAVLGISIFTSFVGITKAAPILFASAALALGSSLALKLPET
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XP_016 YPTNQRATAFGILNGLCKFGAILGNTIFASFVGITKVVPILLAAASLVGGGLIALRLPET
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pF1KSD RGQVLQ
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XP_016 REQVLM
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>>NP_001309968 (OMIM: 185861) synaptic vesicle glycoprot (683 aa)
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pF1KSD AKEVKKHAAKKVVKGLDRVQDEYSRRSYSRFEEEDDDDDFPAPSDGYYRGEGTQDEEEGG
.. .:. . :::::::::. .. ::.
NP_001 MDDYKYQDNYGGY-APSDGYYRGNESNPEED--
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pF1KSD ASSDATEGHDEDDEIYEGEYQGIPRAES-GGKGERMADGAPLAGVRGGLSDGEGPPGGRG
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NP_001 AQSDVTEGHDEEDEIYEGEYQGIPHPDDVKAKQAKMAP-SRMDSLRGQ-TDLM-------
40 50 60 70 80
140 150 160 170 180 190
pF1KSD EAQRRKEREELAQQYEAILRECGHGRFQWTLYFVLGLALMADGVEVFVVGFVLPSAEKDM
:.: ...:.::.:::.:. ::::::::: :.:::::::::::::::::.:.::::::::
NP_001 -AERLEDEEQLAHQYETIMDECGHGRFQWILFFVLGLALMADGVEVFVVSFALPSAEKDM
90 100 110 120 130 140
200 210 220 230 240 250
pF1KSD CLSDSNKGMLGLIVYLGMMVGAFLWGGLADRLGRRQCLLISLSVNSVFAFFSSFVQGYGT
:::.:.:::::.:::::::.:::. :::::.:::.. : .::.::. :: .::::::::.
NP_001 CLSSSKKGMLGMIVYLGMMAGAFILGGLADKLGRKRVLSMSLAVNASFASLSSFVQGYGA
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::::::.::.::::..::::.::::::..:::::::::: .::: ::.::.::::.::::
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::::::::: ::.::.:..::: .: ::.:::::.:::::::: :: .. ::: : :
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pF1KSD C-FGPEYRRITLMMMGVWFTMSFSYYGLTVWFPDMIRHLQAVDYASRTKVFPGERVEHVT
: .:: :: ::.. :::.:.:::::::::::::::..: .: :. ::: ::.: .:
NP_001 CVMGP-YRMNTLILAVVWFAMAFSYYGLTVWFPDMIRYFQDEEYKSKMKVFFGEHVYGAT
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pF1KSD FNFTLENQIHRGGQYFNDKFIGLRLKSVSFEDSLFEECYFEDVTSSNTFFRNCTFINTVF
.:::.:::::. :. :::: . .: : :::..:.:::::::::..:.:.:::. .:.:
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:::::.:.::.: :.::::::..:::: .:. .. ...:.:::::.:.::::::.::
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::::.::::.:..:: ..: : :::: :::::::::. ::: :.:::.::::::.::::
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pF1KSD YPSDKRTTAFGFLNALCKLAAVLGISIFTSFVGITKAAPILFASAALALGSSLALKLPET
::...:.::::.::.:::..:.:: .::.:::::::..:::.:.:.:. :. .::.::::
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740
pF1KSD RGQVLQ
: :::
NP_001 REQVLM
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.. .:. . :::::::::. .. ::.
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:.::.::::::.::::::::::::. .. .: .:: . . ..:: .:
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pF1KSD EAQRRKEREELAQQYEAILRECGHGRFQWTLYFVLGLALMADGVEVFVVGFVLPSAEKDM
:.: ...:.::.:::.:. ::::::::: :.:::::::::::::::::.:.::::::::
XP_016 -AERLEDEEQLAHQYETIMDECGHGRFQWILFFVLGLALMADGVEVFVVSFALPSAEKDM
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320 330 340 350 360 370
pF1KSD YGWSFQMGSAYQFHSWRVFVLVCAFPSVFAIGALTTQPESPRFFLENGKHDEAWMVLKQV
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::::::::: ::.::.:..::: .: ::.:::::.:::::::: :: .. ::: : :
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: .:: :: ::.. :::.:.:::::::::::::::..: .: :. ::: ::.: .:
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.:::.:::::. :. :::: . .: : :::..:.:::::::::..:.:.:::. .:.:
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::::.::::.:..:: ..: : :::: :::::::::. ::: :.:::.::::::.::::
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::...:.::::.::.:::..:.:: .::.:::::::..:::.:.:.:. :. .::.::::
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740
pF1KSD RGQVLQ
: :::
XP_016 REQVLM
680
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20 30 40 50 60 70
pF1KSD AKEVKKHAAKKVVKGLDRVQDEYSRRSYSRFEEEDDDDDFPAPSDGYYRGEGTQDEEEGG
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NP_001 MDDYKYQDNYGGY-APSDGYYRGNESNPEED--
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NP_001 AQSDVTEGHDEEDEIYEGEYQGIPHPDDVKAKQAKMAP-SRMDSLRGQ-TDLM-------
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pF1KSD EAQRRKEREELAQQYEAILRECGHGRFQWTLYFVLGLALMADGVEVFVVGFVLPSAEKDM
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NP_001 -AERLEDEEQLAHQYETIMDECGHGRFQWILFFVLGLALMADGVEVFVVSFALPSAEKDM
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pF1KSD CLSDSNKGMLGLIVYLGMMVGAFLWGGLADRLGRRQCLLISLSVNSVFAFFSSFVQGYGT
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NP_001 CLSSSKKGMLGMIVYLGMMAGAFILGGLADKLGRKRVLSMSLAVNASFASLSSFVQGYGA
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260 270 280 290 300 310
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NP_001 FLFCRLISGIGIGGALPIVFAYFSEFLSREKRGEHLSWLGIFWMTGGLYASAMAWSIIPH
210 220 230 240 250 260
320 330 340 350 360 370
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NP_001 HDTNMRAKGTPEKVFTVSNIKTPKQMDEFIEIQSSTGTWYQRWLVRFKTIFKQVWDNALY
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NP_001 CVMGP-YRMNTLILAVVWFAMAFSYYGLTVWFPDMIRYFQDEEYKSKMKVFFGEHVYGAT
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pF1KSD FNFTLENQIHRGGQYFNDKFIGLRLKSVSFEDSLFEECYFEDVTSSNTFFRNCTFINTVF
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NP_001 INFTMENQIHQHGKLVNDKFTRMYFKHVLFEDTFFDECYFEDVTSTDTYFKNCTIESTIF
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pF1KSD YNTDLFEYKFVNSRLINSTFLHNKEGCPLDVTGTGEGAYMVYFVSFLGTLAVLPGNIVSA
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NP_001 YNTDLYEHKFINCRFINSTFLEQKEGCHMDLEQDND--FLIYLVSFLGSLSVLPGNIISA
500 510 520 530 540 550
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pF1KSD LLMDKIGRLRMLAGSSVMSCVSCFFLSFGNSESAMIALLCLFGGVSIASWNALDVLTVEL
::::.::::.:..:: ..: : :::: :::::::::. ::: :.:::.::::::.::::
NP_001 LLMDRIGRLKMIGGSMLISAVCCFFLFFGNSESAMIGWQCLFCGTSIAAWNALDVITVEL
560 570 580 590 600 610
680 690 700 710 720 730
pF1KSD YPSDKRTTAFGFLNALCKLAAVLGISIFTSFVGITKAAPILFASAALALGSSLALKLPET
::...:.::::.::.:::..:.:: .::.:::::::..:::.:.:.:. :. .::.::::
NP_001 YPTNQRATAFGILNGLCKFGAILGNTIFASFVGITKVVPILLAAASLVGGGLIALRLPET
620 630 640 650 660 670
740
pF1KSD RGQVLQ
: :::
NP_001 REQVLM
680
742 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 02:52:10 2016 done: Thu Nov 3 02:52:11 2016
Total Scan time: 10.880 Total Display time: 0.210
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]