Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA0735
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0735, 683 aa
1>>>pF1KSDA0735 683 - 683 aa - 683 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5703+/-0.00122; mu= 18.8574+/- 0.073
mean_var=80.7890+/-16.786, 0's: 0 Z-trim(102.7): 64 B-trim: 251 in 1/49
Lambda= 0.142692
statistics sampled from 7011 (7070) to 7011 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.566), E-opt: 0.2 (0.217), width: 16
Scan time: 3.000
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS10370.1 SV2B gene_id:9899|Hs108|chr15 ( 683) 4648 967.3 0
CCDS53972.1 SV2B gene_id:9899|Hs108|chr15 ( 532) 3613 754.2 1.1e-217
CCDS43331.1 SV2C gene_id:22987|Hs108|chr5 ( 727) 2867 600.7 2.4e-171
CCDS940.1 SV2A gene_id:9900|Hs108|chr1 ( 742) 2849 597.0 3.1e-170
CCDS75261.1 SV2C gene_id:22987|Hs108|chr5 ( 676) 2624 550.7 2.6e-156
CCDS73520.1 SVOP gene_id:55530|Hs108|chr12 ( 548) 334 79.2 1.8e-14
CCDS47721.1 SVOPL gene_id:136306|Hs108|chr7 ( 492) 312 74.6 3.7e-13
>>CCDS10370.1 SV2B gene_id:9899|Hs108|chr15 (683 aa)
initn: 4648 init1: 4648 opt: 4648 Z-score: 5171.7 bits: 967.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4648; 100.0% identity (100.0% similar) in 683 aa overlap (1-683:1-683)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MDDYKYQDNYGGYAPSDGYYRGNESNPEEDAQSDVTEGHDEEDEIYEGEYQGIPHPDDVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MDDYKYQDNYGGYAPSDGYYRGNESNPEEDAQSDVTEGHDEEDEIYEGEYQGIPHPDDVK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD AKQAKMAPSRMDSLRGQTDLMAERLEDEEQLAHQYETIMDECGHGRFQWILFFVLGLALM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 AKQAKMAPSRMDSLRGQTDLMAERLEDEEQLAHQYETIMDECGHGRFQWILFFVLGLALM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD ADGVEVFVVSFALPSAEKDMCLSSSKKGMLGMIVYLGMMAGAFILGGLADKLGRKRVLSM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ADGVEVFVVSFALPSAEKDMCLSSSKKGMLGMIVYLGMMAGAFILGGLADKLGRKRVLSM
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD SLAVNASFASLSSFVQGYGAFLFCRLISGIGIGGALPIVFAYFSEFLSREKRGEHLSWLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SLAVNASFASLSSFVQGYGAFLFCRLISGIGIGGALPIVFAYFSEFLSREKRGEHLSWLG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD IFWMTGGLYASAMAWSIIPHYGWGFSMGTNYHFHSWRVFVIVCALPCTVSMVALKFMPES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 IFWMTGGLYASAMAWSIIPHYGWGFSMGTNYHFHSWRVFVIVCALPCTVSMVALKFMPES
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD PRFLLEMGKHDEAWMILKQVHDTNMRAKGTPEKVFTVSNIKTPKQMDEFIEIQSSTGTWY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 PRFLLEMGKHDEAWMILKQVHDTNMRAKGTPEKVFTVSNIKTPKQMDEFIEIQSSTGTWY
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD QRWLVRFKTIFKQVWDNALYCVMGPYRMNTLILAVVWFAMAFSYYGLTVWFPDMIRYFQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 QRWLVRFKTIFKQVWDNALYCVMGPYRMNTLILAVVWFAMAFSYYGLTVWFPDMIRYFQD
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD EEYKSKMKVFFGEHVYGATINFTMENQIHQHGKLVNDKFTRMYFKHVLFEDTFFDECYFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 EEYKSKMKVFFGEHVYGATINFTMENQIHQHGKLVNDKFTRMYFKHVLFEDTFFDECYFE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD DVTSTDTYFKNCTIESTIFYNTDLYEHKFINCRFINSTFLEQKEGCHMDLEQDNDFLIYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 DVTSTDTYFKNCTIESTIFYNTDLYEHKFINCRFINSTFLEQKEGCHMDLEQDNDFLIYL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD VSFLGSLSVLPGNIISALLMDRIGRLKMIGGSMLISAVCCFFLFFGNSESAMIGWQCLFC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 VSFLGSLSVLPGNIISALLMDRIGRLKMIGGSMLISAVCCFFLFFGNSESAMIGWQCLFC
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD GTSIAAWNALDVITVELYPTNQRATAFGILNGLCKFGAILGNTIFASFVGITKVVPILLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GTSIAAWNALDVITVELYPTNQRATAFGILNGLCKFGAILGNTIFASFVGITKVVPILLA
610 620 630 640 650 660
670 680
pF1KSD AASLVGGGLIALRLPETREQVLM
:::::::::::::::::::::::
CCDS10 AASLVGGGLIALRLPETREQVLM
670 680
>>CCDS53972.1 SV2B gene_id:9899|Hs108|chr15 (532 aa)
initn: 3613 init1: 3613 opt: 3613 Z-score: 4021.7 bits: 754.2 E(32554): 1.1e-217
Smith-Waterman score: 3613; 100.0% identity (100.0% similar) in 532 aa overlap (152-683:1-532)
130 140 150 160 170 180
pF1KSD DGVEVFVVSFALPSAEKDMCLSSSKKGMLGMIVYLGMMAGAFILGGLADKLGRKRVLSMS
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MIVYLGMMAGAFILGGLADKLGRKRVLSMS
10 20 30
190 200 210 220 230 240
pF1KSD LAVNASFASLSSFVQGYGAFLFCRLISGIGIGGALPIVFAYFSEFLSREKRGEHLSWLGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 LAVNASFASLSSFVQGYGAFLFCRLISGIGIGGALPIVFAYFSEFLSREKRGEHLSWLGI
40 50 60 70 80 90
250 260 270 280 290 300
pF1KSD FWMTGGLYASAMAWSIIPHYGWGFSMGTNYHFHSWRVFVIVCALPCTVSMVALKFMPESP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 FWMTGGLYASAMAWSIIPHYGWGFSMGTNYHFHSWRVFVIVCALPCTVSMVALKFMPESP
100 110 120 130 140 150
310 320 330 340 350 360
pF1KSD RFLLEMGKHDEAWMILKQVHDTNMRAKGTPEKVFTVSNIKTPKQMDEFIEIQSSTGTWYQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 RFLLEMGKHDEAWMILKQVHDTNMRAKGTPEKVFTVSNIKTPKQMDEFIEIQSSTGTWYQ
160 170 180 190 200 210
370 380 390 400 410 420
pF1KSD RWLVRFKTIFKQVWDNALYCVMGPYRMNTLILAVVWFAMAFSYYGLTVWFPDMIRYFQDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 RWLVRFKTIFKQVWDNALYCVMGPYRMNTLILAVVWFAMAFSYYGLTVWFPDMIRYFQDE
220 230 240 250 260 270
430 440 450 460 470 480
pF1KSD EYKSKMKVFFGEHVYGATINFTMENQIHQHGKLVNDKFTRMYFKHVLFEDTFFDECYFED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 EYKSKMKVFFGEHVYGATINFTMENQIHQHGKLVNDKFTRMYFKHVLFEDTFFDECYFED
280 290 300 310 320 330
490 500 510 520 530 540
pF1KSD VTSTDTYFKNCTIESTIFYNTDLYEHKFINCRFINSTFLEQKEGCHMDLEQDNDFLIYLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 VTSTDTYFKNCTIESTIFYNTDLYEHKFINCRFINSTFLEQKEGCHMDLEQDNDFLIYLV
340 350 360 370 380 390
550 560 570 580 590 600
pF1KSD SFLGSLSVLPGNIISALLMDRIGRLKMIGGSMLISAVCCFFLFFGNSESAMIGWQCLFCG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 SFLGSLSVLPGNIISALLMDRIGRLKMIGGSMLISAVCCFFLFFGNSESAMIGWQCLFCG
400 410 420 430 440 450
610 620 630 640 650 660
pF1KSD TSIAAWNALDVITVELYPTNQRATAFGILNGLCKFGAILGNTIFASFVGITKVVPILLAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 TSIAAWNALDVITVELYPTNQRATAFGILNGLCKFGAILGNTIFASFVGITKVVPILLAA
460 470 480 490 500 510
670 680
pF1KSD ASLVGGGLIALRLPETREQVLM
::::::::::::::::::::::
CCDS53 ASLVGGGLIALRLPETREQVLM
520 530
>>CCDS43331.1 SV2C gene_id:22987|Hs108|chr5 (727 aa)
initn: 2930 init1: 2184 opt: 2867 Z-score: 3189.8 bits: 600.7 E(32554): 2.4e-171
Smith-Waterman score: 2867; 61.1% identity (83.0% similar) in 682 aa overlap (5-683:48-727)
10 20 30
pF1KSD MDDYKYQD--NYGGYAPSDGYYRGNESNPEEDAQ
..:: . : :. : : :.: .: ..
CCDS43 IAREVKKQTVKKVNQAVDRAQDEYTQRSYSRFQDEEDDDDYYPAGETYNG-EANDDE-GS
20 30 40 50 60 70
40 50 60 70 80 90
pF1KSD SDVTEGHDEEDEIYEGEYQGIPHPDDVKAKQAKMAPSRMDSLRGQTDLMAERLEDEEQLA
:..::::::.:::::::::::: ...: . .... . : . . .: .:: :::.::
CCDS43 SEATEGHDEDDEIYEGEYQGIPSMNQAKDSIVSVGQPKGDEYKDRRELESERRADEEELA
80 90 100 110 120 130
100 110 120 130 140 150
pF1KSD HQYETIMDECGHGRFQWILFFVLGLALMADGVEVFVVSFALPSAEKDMCLSSSKKGMLGM
.::: :..::::::::: ::::::.::::::::::::.:.::::: :.:. .: .: ::
CCDS43 QQYELIIQECGHGRFQWALFFVLGMALMADGVEVFVVGFVLPSAETDLCIPNSGSGWLGS
140 150 160 170 180 190
160 170 180 190 200 210
pF1KSD IVYLGMMAGAFILGGLADKLGRKRVLSMSLAVNASFASLSSFVQGYGAFLFCRLISGIGI
:::::::.:::. ::::::.:::. : . ..::. :: ::::::::: ::::::.::.::
CCDS43 IVYLGMMVGAFFWGGLADKVGRKQSLLICMSVNGFFAFLSSFVQGYGFFLFCRLLSGFGI
200 210 220 230 240 250
220 230 240 250 260 270
pF1KSD GGALPIVFAYFSEFLSREKRGEHLSWLGIFWMTGGLYASAMAWSIIPHYGWGFSMGTNYH
:::.: ::.::.: :.::::::::::: .::: ::.:::::::.:::::::.::::. :.
CCDS43 GGAIPTVFSYFAEVLAREKRGEHLSWLCMFWMIGGIYASAMAWAIIPHYGWSFSMGSAYQ
260 270 280 290 300 310
280 290 300 310 320 330
pF1KSD FHSWRVFVIVCALPCTVSMVALKFMPESPRFLLEMGKHDEAWMILKQVHDTNMRAKGTPE
:::::::::::::::. :.::: :::::::::::.::::::::::: .:::::::.: ::
CCDS43 FHSWRVFVIVCALPCVSSVVALTFMPESPRFLLEVGKHDEAWMILKLIHDTNMRARGQPE
320 330 340 350 360 370
340 350 360 370 380 390
pF1KSD KVFTVSNIKTPKQMDEFIEIQSSTGTWYQRWLVRFKTIFKQVWDNALYCVMGPYRMNTLI
:::::..::::::.::.:::.:.:::::.: .::..: . .: . . : : : ::.
CCDS43 KVFTVNKIKTPKQIDELIEIESDTGTWYRRCFVRIRTELYGIWLTFMRCFNYPVRDNTIK
380 390 400 410 420 430
400 410 420 430 440 450
pF1KSD LAVVWFAMAFSYYGLTVWFPDMIRYFQDEEYKSKMKVFFGEHVYGATINFTMENQIHQHG
:..:::...:.::::.:::::.:. .:..:: . .. . :::::::::::
CCDS43 LTIVWFTLSFGYYGLSVWFPDVIKPLQSDEYALLTRNVERDKYANFTINFTMENQIHTGM
440 450 460 470 480 490
460 470 480 490 500 510
pF1KSD KLVNDKFTRMYFKHVLFEDTFFDECYFEDVTSTDTYFKNCTIESTIFYNTDLYEHKFINC
. : .: . :: : :.:. : : ::::::..:::::::. .:.: :::. .:::.
CCDS43 EYDNGRFIGVKFKSVTFKDSVFKSCTFEDVTSVNTYFKNCTFIDTVFDNTDFEPYKFIDS
500 510 520 530 540 550
520 530 540 550 560 570
pF1KSD RFINSTFLEQKEGCHMDLEQD-NDFLIYLVSFLGSLSVLPGNIISALLMDRIGRLKMIGG
.: : .:...: ::.. ...: . . ::.:.:::.:.::::::.::::::::::: :.::
CCDS43 EFKNCSFFHNKTGCQITFDDDYSAYWIYFVNFLGTLAVLPGNIVSALLMDRIGRLTMLGG
560 570 580 590 600 610
580 590 600 610 620 630
pF1KSD SMLISAVCCFFLFFGNSESAMIGWQCLFCGTSIAAWNALDVITVELYPTNQRATAFGILN
::..:.. ::::.::.::: ::: ::. : .:.:::.:::.:::::::..:::.::.::
CCDS43 SMVLSGISCFFLWFGTSESMMIGMLCLYNGLTISAWNSLDVVTVELYPTDRRATGFGFLN
620 630 640 650 660 670
640 650 660 670 680
pF1KSD GLCKFGAILGNTIFASFVGITKVVPILLAAASLVGGGLIALRLPETREQVLM
.::: .:.::: ::.:.:.::: .:::::.. :: :::..: ::.:: ::::
CCDS43 ALCKAAAVLGNLIFGSLVSITKSIPILLASTVLVCGGLVGLCLPDTRTQVLM
680 690 700 710 720
>>CCDS940.1 SV2A gene_id:9900|Hs108|chr1 (742 aa)
initn: 2988 init1: 2187 opt: 2849 Z-score: 3169.7 bits: 597.0 E(32554): 3.1e-170
Smith-Waterman score: 3027; 64.0% identity (85.9% similar) in 695 aa overlap (4-682:49-741)
10 20 30
pF1KSD MDDYKYQDNYGGY-APSDGYYRGNESNPEED--
.. .:. . :::::::::. .. ::.
CCDS94 AKEVKKHAAKKVVKGLDRVQDEYSRRSYSRFEEEDDDDDFPAPSDGYYRGEGTQDEEEGG
20 30 40 50 60 70
40 50 60 70 80
pF1KSD AQSDVTEGHDEEDEIYEGEYQGIPHPDDVKAKQAKMAPSR-MDSLRGQ-TDLM-------
:.::.::::::.::::::::::::. .. .: .:: . . ..:: .:
CCDS94 ASSDATEGHDEDDEIYEGEYQGIPRAES-GGKGERMADGAPLAGVRGGLSDGEGPPGGRG
80 90 100 110 120 130
90 100 110 120 130 140
pF1KSD -AERLEDEEQLAHQYETIMDECGHGRFQWILFFVLGLALMADGVEVFVVSFALPSAEKDM
:.: ...:.::.:::.:. ::::::::: :.:::::::::::::::::.:.::::::::
CCDS94 EAQRRKEREELAQQYEAILRECGHGRFQWTLYFVLGLALMADGVEVFVVGFVLPSAEKDM
140 150 160 170 180 190
150 160 170 180 190 200
pF1KSD CLSSSKKGMLGMIVYLGMMAGAFILGGLADKLGRKRVLSMSLAVNASFASLSSFVQGYGA
:::.:.:::::.:::::::.:::. :::::.:::.. : .::.::. :: .::::::::.
CCDS94 CLSDSNKGMLGLIVYLGMMVGAFLWGGLADRLGRRQCLLISLSVNSVFAFFSSFVQGYGT
200 210 220 230 240 250
210 220 230 240 250 260
pF1KSD FLFCRLISGIGIGGALPIVFAYFSEFLSREKRGEHLSWLGIFWMTGGLYASAMAWSIIPH
::::::.::.::::..::::.::::::..:::::::::: .::: ::.::.::::.::::
CCDS94 FLFCRLLSGVGIGGSIPIVFSYFSEFLAQEKRGEHLSWLCMFWMIGGVYAAAMAWAIIPH
260 270 280 290 300 310
270 280 290 300 310 320
pF1KSD YGWGFSMGTNYHFHSWRVFVIVCALPCTVSMVALKFMPESPRFLLEMGKHDEAWMILKQV
:::.:.::. :.::::::::.:::.: . .. :: .::::::.:: ::::::::.::::
CCDS94 YGWSFQMGSAYQFHSWRVFVLVCAFPSVFAIGALTTQPESPRFFLENGKHDEAWMVLKQV
320 330 340 350 360 370
330 340 350 360 370 380
pF1KSD HDTNMRAKGTPEKVFTVSNIKTPKQMDEFIEIQSSTGTWYQRWLVRFKTIFKQVWDNALY
::::::::: ::.::.:..::: .: ::.:::::.:::::::: :: .. ::: : :
CCDS94 HDTNMRAKGHPERVFSVTHIKTIHQEDELIEIQSDTGTWYQRWGVRALSLGGQVWGNFLS
380 390 400 410 420 430
390 400 410 420 430
pF1KSD CVMGP-YRMNTLILAVVWFAMAFSYYGLTVWFPDMIRYFQDEEYKSKMKVFFGEHVYGAT
: .:: :: ::.. :::.:.:::::::::::::::..: .: :. ::: ::.: .:
CCDS94 C-FGPEYRRITLMMMGVWFTMSFSYYGLTVWFPDMIRHLQAVDYASRTKVFPGERVEHVT
440 450 460 470 480 490
440 450 460 470 480 490
pF1KSD INFTMENQIHQHGKLVNDKFTRMYFKHVLFEDTFFDECYFEDVTSTDTYFKNCTIESTIF
.:::.:::::. :. :::: . .: : :::..:.:::::::::..:.:.:::. .:.:
CCDS94 FNFTLENQIHRGGQYFNDKFIGLRLKSVSFEDSLFEECYFEDVTSSNTFFRNCTFINTVF
500 510 520 530 540 550
500 510 520 530 540 550
pF1KSD YNTDLYEHKFINCRFINSTFLEQKEGCHMDLEQDND--FLIYLVSFLGSLSVLPGNIISA
:::::.:.::.: :.::::::..:::: .:. .. ...:.:::::.:.::::::.::
CCDS94 YNTDLFEYKFVNSRLINSTFLHNKEGCPLDVTGTGEGAYMVYFVSFLGTLAVLPGNIVSA
560 570 580 590 600 610
560 570 580 590 600 610
pF1KSD LLMDRIGRLKMIGGSMLISAVCCFFLFFGNSESAMIGWQCLFCGTSIAAWNALDVITVEL
::::.::::.:..:: ..: : :::: :::::::::. ::: :.:::.::::::.::::
CCDS94 LLMDKIGRLRMLAGSSVMSCVSCFFLSFGNSESAMIALLCLFGGVSIASWNALDVLTVEL
620 630 640 650 660 670
620 630 640 650 660 670
pF1KSD YPTNQRATAFGILNGLCKFGAILGNTIFASFVGITKVVPILLAAASLVGGGLIALRLPET
::...:.::::.::.:::..:.:: .::.:::::::..:::.:.:.:. :. .::.::::
CCDS94 YPSDKRTTAFGFLNALCKLAAVLGISIFTSFVGITKAAPILFASAALALGSSLALKLPET
680 690 700 710 720 730
680
pF1KSD REQVLM
: :::
CCDS94 RGQVLQ
740
>>CCDS75261.1 SV2C gene_id:22987|Hs108|chr5 (676 aa)
initn: 2685 init1: 2184 opt: 2624 Z-score: 2919.9 bits: 550.7 E(32554): 2.6e-156
Smith-Waterman score: 2624; 60.8% identity (82.5% similar) in 622 aa overlap (5-623:48-667)
10 20 30
pF1KSD MDDYKYQD--NYGGYAPSDGYYRGNESNPEEDAQ
..:: . : :. : : :.: .: ..
CCDS75 IAREVKKQTVKKVNQAVDRAQDEYTQRSYSRFQDEEDDDDYYPAGETYNG-EANDDE-GS
20 30 40 50 60 70
40 50 60 70 80 90
pF1KSD SDVTEGHDEEDEIYEGEYQGIPHPDDVKAKQAKMAPSRMDSLRGQTDLMAERLEDEEQLA
:..::::::.:::::::::::: ...: . .... . : . . .: .:: :::.::
CCDS75 SEATEGHDEDDEIYEGEYQGIPSMNQAKDSIVSVGQPKGDEYKDRRELESERRADEEELA
80 90 100 110 120 130
100 110 120 130 140 150
pF1KSD HQYETIMDECGHGRFQWILFFVLGLALMADGVEVFVVSFALPSAEKDMCLSSSKKGMLGM
.::: :..::::::::: ::::::.::::::::::::.:.::::: :.:. .: .: ::
CCDS75 QQYELIIQECGHGRFQWALFFVLGMALMADGVEVFVVGFVLPSAETDLCIPNSGSGWLGS
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160 170 180 190 200 210
pF1KSD IVYLGMMAGAFILGGLADKLGRKRVLSMSLAVNASFASLSSFVQGYGAFLFCRLISGIGI
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CCDS75 IVYLGMMVGAFFWGGLADKVGRKQSLLICMSVNGFFAFLSSFVQGYGFFLFCRLLSGFGI
200 210 220 230 240 250
220 230 240 250 260 270
pF1KSD GGALPIVFAYFSEFLSREKRGEHLSWLGIFWMTGGLYASAMAWSIIPHYGWGFSMGTNYH
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CCDS75 GGAIPTVFSYFAEVLAREKRGEHLSWLCMFWMIGGIYASAMAWAIIPHYGWSFSMGSAYQ
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280 290 300 310 320 330
pF1KSD FHSWRVFVIVCALPCTVSMVALKFMPESPRFLLEMGKHDEAWMILKQVHDTNMRAKGTPE
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CCDS75 FHSWRVFVIVCALPCVSSVVALTFMPESPRFLLEVGKHDEAWMILKLIHDTNMRARGQPE
320 330 340 350 360 370
340 350 360 370 380 390
pF1KSD KVFTVSNIKTPKQMDEFIEIQSSTGTWYQRWLVRFKTIFKQVWDNALYCVMGPYRMNTLI
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CCDS75 KVFTVNKIKTPKQIDELIEIESDTGTWYRRCFVRIRTELYGIWLTFMRCFNYPVRDNTIK
380 390 400 410 420 430
400 410 420 430 440 450
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CCDS75 LTIVWFTLSFGYYGLSVWFPDVIKPLQSDEYALLTRNVERDKYANFTINFTMENQIHTGM
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460 470 480 490 500 510
pF1KSD KLVNDKFTRMYFKHVLFEDTFFDECYFEDVTSTDTYFKNCTIESTIFYNTDLYEHKFINC
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CCDS75 EYDNGRFIGVKFKSVTFKDSVFKSCTFEDVTSVNTYFKNCTFIDTVFDNTDFEPYKFIDS
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520 530 540 550 560 570
pF1KSD RFINSTFLEQKEGCHMDLEQD-NDFLIYLVSFLGSLSVLPGNIISALLMDRIGRLKMIGG
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CCDS75 EFKNCSFFHNKTGCQITFDDDYSAYWIYFVNFLGTLAVLPGNIVSALLMDRIGRLTMLGG
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580 590 600 610 620 630
pF1KSD SMLISAVCCFFLFFGNSESAMIGWQCLFCGTSIAAWNALDVITVELYPTNQRATAFGILN
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CCDS75 SMVLSGISCFFLWFGTSESMMIGMLCLYNGLTISAWNSLDVVTVELYPTDRRRRVLPCCP
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640 650 660 670 680
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CCDS75 G
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CCDS73 EAVELDDGAAVPKEFANPTDDTFMVEDAVEAI----GFGKFQWKLSVLTGLAWMADAMEM
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...:. :. . . : : . ..: .:..:::... . :...:. ::: :..:. .
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.. ::.:. :. .: : . :.:::: .: . ..::: . :.. . . .:: :
CCDS73 YYGILSAFAPVYSWILVLRGLVGFGIGG-VPQSVTLYAEFLPMKARAKCILLIEVFWAIG
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.. ..: ..: :: : ..:. :.: . : ..::: :. .
CCDS73 TVFEVVLAVFVMPSLGW-----------RW--LLILSAVPLLLFAVLCFWLPESARYDVL
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CCDS73 SGNQEKAIATLKRIATEN----GAP---MPLGKLIISRQEDR--------G--------K
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.. .: .: .::.: .::. :::::::.. ....
CCDS73 MRDLFTP-----------HFRWTTLLLWFIWFSNAFSYYGLVLLTTELFQAGDVCGISSR
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CCDS73 KKAVEAKCSLACEYLSEEDYMDLLWTTLSEFPGVLVTLWIIDRLGRKKTMALCFVIFSFC
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>>CCDS47721.1 SVOPL gene_id:136306|Hs108|chr7 (492 aa)
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CCDS47 MATKPTEPVTILSLR-KLSLGTAEPQVKEPKTFTVED
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CCDS47 AVETIGFGRFHIALFLIMGSTGVVEAMEIMLIAVVSPVIRCEWQLENWQVALVTTMVFFG
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CCDS47 YMVFSILFGLLADRYGRWKILLISFLWGAYFSLLTSFAPSYIWFVFLRTMVGCGVSGHSQ
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CCDS47 GLIIK-TEFLPTKYRGYMLPLSQVFWLAGSLLIIGLASVIIPTIGW-------------R
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CCDS47 ------KLVEPVLEKRG-----------RFADLLD-----------AKYLRTTLQIWVIW
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. ::
CCDS47 -----------------SPCY---------------------------------------
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]