Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA0722
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0722, 1050 aa
1>>>pF1KSDA0722 1050 - 1050 aa - 1050 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 14.2180+/-0.0012; mu= -18.4948+/- 0.071
mean_var=555.6232+/-116.151, 0's: 0 Z-trim(115.4): 546 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.054411
statistics sampled from 15356 (15971) to 15356 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.772), E-opt: 0.2 (0.491), width: 16
Scan time: 5.640
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS9274.1 ULK1 gene_id:8408|Hs108|chr12 (1050) 7073 570.8 5.2e-162
CCDS11213.1 ULK2 gene_id:9706|Hs108|chr17 (1036) 2350 200.1 2.1e-50
CCDS76779.1 ULK3 gene_id:25989|Hs108|chr15 ( 470) 685 69.1 2.5e-11
CCDS45305.1 ULK3 gene_id:25989|Hs108|chr15 ( 472) 685 69.1 2.5e-11
>>CCDS9274.1 ULK1 gene_id:8408|Hs108|chr12 (1050 aa)
initn: 7073 init1: 7073 opt: 7073 Z-score: 3022.1 bits: 570.8 E(32554): 5.2e-162
Smith-Waterman score: 7073; 99.9% identity (100.0% similar) in 1050 aa overlap (1-1050:1-1050)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MEPGRGGTETVGKFEFSRKDLIGHGAFAVVFKGRHREKHDLEVAVKCINKKNLAKSQTLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 MEPGRGGTETVGKFEFSRKDLIGHGAFAVVFKGRHREKHDLEVAVKCINKKNLAKSQTLL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD GKEIKILKELKHENIVALYDFQEMANSVYLVMEYCNGGDLADYLHAMRTLSEDTIRLFLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 GKEIKILKELKHENIVALYDFQEMANSVYLVMEYCNGGDLADYLHAMRTLSEDTIRLFLQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD QIAGAMRLLHSKGIIHRDLKPQNILLSNPAGRRANPNSIRVKIADFGFARYLQSNMMAAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 QIAGAMRLLHSKGIIHRDLKPQNILLSNPAGRRANPNSIRVKIADFGFARYLQSNMMAAT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD LCGSPMYMAPEVIMSQHYDGKADLWSIGTIVYQCLTGKAPFQASSPQDLRLFYEKNKTLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 LCGSPMYMAPEVIMSQHYDGKADLWSIGTIVYQCLTGKAPFQASSPQDLRLFYEKNKTLV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD PTIPRETSAPLRQLLLALLQRNHKDRMDFDEFFHHPFLDASPSVRKSPPVPVPSYPSSGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 PTIPRETSAPLRQLLLALLQRNHKDRMDFDEFFHHPFLDASPSVRKSPPVPVPSYPSSGS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD GSSSSSSSTSHLASPPSLGEMQQLQKTLASPADTAGFLHSSRDSGGSKDSSCDTDDFVMV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 GSSSSSSSTSHLASPPSLGEMQQLQKTLASPADTAGFLHSSRDSGGSKDSSCDTDDFVMV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD PAQFPGDLVAEAPSAKPPPDSLMCSGSSLVASAGLESHGRTPSPSPPCSSSPSPSGRAGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 PAQFPGDLVAEAPSAKPPPDSLMCSGSSLVASAGLESHGRTPSPSPPCSSSPSPSGRAGP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD FSSSRCGASVPIPVPTQVQNYQRIERNLQSPTQFQTPRSSAIRRSGSTSPLGFARASPSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 FSSSRCGASVPIPVPTQVQNYQRIERNLQSPTQFQTPRSSAIRRSGSTSPLGFARASPSP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD PAHAEHGGVLARKMSLGGGRPYTPSPQVGTIPERPGWSGTPSPQGAEMRGGRSPRPGSSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 PAHAEHGGVLARKMSLGGGRPYTPSPQVGTIPERPGWSGTPSPQGAEMRGGRSPRPGSSA
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD PEHSPRTSGLGCRLHSAPNLSDLHVVRPKLPKPPTDPLGAVFSPPQASPPQPSHGLQSCR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 PEHSPRTSGLGCRLHSAPNLSDLHVVRPKLPKPPTDPLGAVFSPPQASPPQPSHGLQSCR
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD NLRGSPKLPDFLQRNPLPPILGSPTKAVPSFDFPKTPSSQNLLALLARQGVVMTPPRNRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 NLRGSPKLPDFLQRNPLPPILGSPTKAVPSFDFPKTPSSQNLLALLARQGVVMTPPRNRT
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD LPDLSEVGPFHGQPLGPGLRPGEDPKGPFGRSFSTSRLTDLLLKAAFGTQAPDPGSTESL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 LPDLSEVGPFHGQPLGPGLRPGEDPKGPFGRSFSTSRLTDLLLKAAFGTQAPDPGSTESL
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD QEKPMEIAPSAGFGGSLHPGARAGGTSSPSPVVFTVGSPPSGSTPPQGPRTRMFSAGPTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 QEKPMEIAPSAGFGGSLHPGARAGGTSSPSPVVFTVGSPPSGSTPPQGPRTRMFSAGPTG
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD SASSSARHLVPGPCSEAPAPELPAPGHGCSFADPIAANLEGAVTFEAPDLPEETLMEQEH
:::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::
CCDS92 SASSSARHLVPGPCSEAPAPELPAPGHGCSFADPITANLEGAVTFEAPDLPEETLMEQEH
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD TEILRGLRFTLLFVQHVLEIAALKGSASEAAGGPEYQLQESVVADQISLLSREWGFAEQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 TEILRGLRFTLLFVQHVLEIAALKGSASEAAGGPEYQLQESVVADQISLLSREWGFAEQL
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD VLYLKVAELLSSGLQSAIDQIRAGKLCLSSTVKQVVRRLNELYKASVVSCQGLSLRLQRF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 VLYLKVAELLSSGLQSAIDQIRAGKLCLSSTVKQVVRRLNELYKASVVSCQGLSLRLQRF
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD FLDKQRLLDRIHSITAERLIFSHAVQMVQSAALDEMFQHREGCVPRYHKALLLLEGLQHM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 FLDKQRLLDRIHSITAERLIFSHAVQMVQSAALDEMFQHREGCVPRYHKALLLLEGLQHM
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050
pF1KSD LSDQADIENVTKCKLCIERRLSALLTGICA
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 LSDQADIENVTKCKLCIERRLSALLTGICA
1030 1040 1050
>>CCDS11213.1 ULK2 gene_id:9706|Hs108|chr17 (1036 aa)
initn: 2900 init1: 1478 opt: 2350 Z-score: 1018.5 bits: 200.1 E(32554): 2.1e-50
Smith-Waterman score: 3258; 52.7% identity (74.1% similar) in 1073 aa overlap (9-1044:2-1029)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MEPGRGGTETVGKFEFSRKDLIGHGAFAVVFKGRHREKHDLEVAVKCINKKNLAKSQTLL
:.:: ::.:..::.:::::::::.::::.: : :::.: ::::::.::: ::
CCDS11 MEVVGDFEYSKRDLVGHGAFAVVFRGRHRQKTDWEVAIKSINKKNLSKSQILL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KSD GKEIKILKELKHENIVALYDFQEMANSVYLVMEYCNGGDLADYLHAMRTLSEDTIRLFLQ
::::::::::.::::::::: ::. :::.:::::::::::::::.: ::::::::.::.
CCDS11 GKEIKILKELQHENIVALYDVQELPNSVFLVMEYCNGGDLADYLQAKGTLSEDTIRVFLH
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KSD QIAGAMRLLHSKGIIHRDLKPQNILLSNPAGRRANPNSIRVKIADFGFARYLQSNMMAAT
:::.:::.::::::::::::::::::: :... ..::.:::::::::::.:::::::
CCDS11 QIAAAMRILHSKGIIHRDLKPQNILLSYANRRKSSVSGIRIKIADFGFARYLHSNMMAAT
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KSD LCGSPMYMAPEVIMSQHYDGKADLWSIGTIVYQCLTGKAPFQASSPQDLRLFYEKNKTLV
:::::::::::::::::::.:::::::::..::::.:: ::::.::::::.:::::..:.
CCDS11 LCGSPMYMAPEVIMSQHYDAKADLWSIGTVIYQCLVGKPPFQANSPQDLRMFYEKNRSLM
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KSD PTIPRETSAPLRQLLLALLQRNHKDRMDFDEFFHHPFLDASPSVRKSPPVPVPSYPSSGS
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CCDS11 PSIPRETSPYLANLLLGLLQRNQKDRMDFEAFFSHPFLEQGP-VKKSCPVPVPMYSGSVS
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350
pF1KSD GSSSSSSSTSHLASPPSLGEMQQLQK-TLASPA-DTAGFLHSSRDSGG--SKDSSCDTDD
::: .:: . ..:::::: .::..:. .:.:: ..:. :.::.. ::.:::::::
CCDS11 GSSCGSSPSCRFASPPSLPDMQHIQEENLSSPPLGPPNYLQVSKDSASTSSKNSSCDTDD
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KSD FVMVPAQFPGDLVAEAPSAKPPPDSLMCSGSSLVASAGLESHGRTPSPSPPCSSSPSPSG
::.:: .. .: . : :..:: .. .. . :. . :: .
CCDS11 FVLVPHNISSDHSCDMP----------------VGTAGRRASNEFLVCGGQCQPTVSPHS
360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KSD RAGPFSSSRCGASVPIPVPTQVQNYQRIERNLQSPTQFQT-----PRSSAIRRSGSTSPL
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CCDS11 E-----------TAPIPVPTQIRNYQRIEQNLTSTASSGTNVHGSPRSAVVRRS-NTSPM
400 410 420 430 440
480 490 500 510 520 530
pF1KSD GFARASPSPPAHAEHGGVLARKMSLGGGRPYTPSPQVGTIPERPGWSGTPSPQGAEMRGG
:: : . :. :. . ...:..: :..:::.::: ::::::. . ::: . :.
CCDS11 GFLRPGSCSPVPADTAQTVGRRLSTGSSRPYSPSPLVGTIPEQFSQCCCGHPQGHDSRSR
450 460 470 480 490 500
540 550 560 570 580
pF1KSD RSPRPGSSAPE-HSPRTSGLGCRLHSAPNLSDLHVVRPKLPKPPTDPL-----GAVFS-P
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CCDS11 NSS--GSPVPQAQSPQSLLSGARLQSAPTLTDIYQNKQKLRKQHSDPVCPSHTGAGYSYS
510 520 530 540 550 560
590 600 610 620 630 640
pF1KSD PQASPPQPSHGLQSCRNLRGSPKLPDFLQRNPLPPILGSPTKAVPSFDFPKTPSSQNLLA
:: : : : : . ..: .::. :.. ..::: :.:::::.. : .::: .:.::::
CCDS11 PQPSRPG-SLGTSPTKHLGSSPRSSDWFFKTPLPTIIGSPTKTTAPFKIPKTQASSNLLA
570 580 590 600 610 620
650 660 670 680 690 700
pF1KSD LLARQGVVMTPPRNRTLP-DLSEVGPFHGQPLGPGLRPGEDPKGPFGRSFSTSRLTDLLL
:..:.: . .. . : . .. .:. : .. :. :::: ::..:.:
CCDS11 LVTRHGPAEEQSKDGNEPRECAHCLLVQGSERQ---RAEQQSKAVFGRSVSTGKLSDQQG
630 640 650 660 670
710 720 730 740 750 760
pF1KSD KAAFGTQAPDPGSTESLQ-EKPMEIAPSAGFGGSLHPGARAGGTSSPSPVVFTVGSPPSG
:. . . :::.::. :.::.:::... :: : : :: ..: . :.::::::: .
CCDS11 KTPICRHQ---GSTDSLNTERPMDIAPAGACGGVLAPP--AGTAASSKAVLFTVGSPPHS
680 690 700 710 720 730
770 780 790 800
pF1KSD STPPQGP----RTRMFSAGPTGSASS----SARHLV---PGPC--SEAP----APELPAP
.. : ::: :.::..:..: :.: : ::: : : :: :
CCDS11 AAAPTCTHMFLRTRTTSVGPSNSGGSLCAMSGRVCVGSPPGPGFGSSPPGAEAAPSLRYV
740 750 760 770 780 790
810 820 830 840 850 860
pF1KSD GHGCSFADPIAANLEGAVTFEAPDLPEETLMEQEHTEILRGLRFTLLFVQHVLEIAALKG
.: :.: .::: .:::::.::::::::.:::. :: : :.:.. ::...:..:
CCDS11 PYG---ASP--PSLEGLITFEAPELPEETLMEREHTDTLRHLNVMLMFTECVLDLTAMRG
800 810 820 830 840
870 880 890 900 910 920
pF1KSD SASE--AAGGPEYQLQESVVADQISLLSREWGFAEQLVLYLKVAELLSSGLQSAIDQIRA
. : ... ::.:::::.:::: ::..:: .::::::.:.:.::...:. : ::..
CCDS11 GNPELCTSAVSLYQIQESVVVDQISQLSKDWGRVEQLVLYMKAAQLLAASLHLAKAQIKS
850 860 870 880 890 900
930 940 950 960 970 980
pF1KSD GKLCLSSTVKQVVRRLNELYKASVVSCQGLSLRLQRFFLDKQRLLDRIHSITAERLIFSH
::: :..:::::. ::: :: .. :. :. .:.::: ::::..:.:.:.:::.::..
CCDS11 GKLSPSTAVKQVVKNLNERYKFCITMCKKLTEKLNRFFSDKQRFIDEINSVTAEKLIYNC
910 920 930 940 950 960
990 1000 1010 1020 1030 1040
pF1KSD AVQMVQSAALDEMFQHREGCVPRYHKALLLLEGLQHMLSDQADIENVTKCKLCIERRLSA
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CCDS11 AVEMVQSAALDEMFQQTEDIVYRYHKAALLLEGLSRILQDPADIENVHKYKCSIERRLSA
970 980 990 1000 1010 1020
1050
pF1KSD LLTGICA
:
CCDS11 LCHSTATV
1030
>>CCDS76779.1 ULK3 gene_id:25989|Hs108|chr15 (470 aa)
initn: 690 init1: 318 opt: 685 Z-score: 316.9 bits: 69.1 E(32554): 2.5e-11
Smith-Waterman score: 685; 37.7% identity (68.7% similar) in 313 aa overlap (3-308:4-305)
10 20 30 40 50
pF1KSD MEPGRGGTETVGKFEFSRKDLIGHGAFAVVFKGRHREKHDLEVAVKCINKKNLAKSQTL
:: : . : : . .: :..:.:.:. .. ::.::. ::.: :...
CCDS76 MAGPGWGPPRLDG---FILTERLGSGTYATVYKAYAKKDTREVVAIKCVAKKSLNKASVE
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KSD -LGKEIKILKELKHENIVALYDFQEMANSVYLVMEYCNGGDLADYLHAMRTLSEDTIRLF
: ::.::: ..: .:: : ::: ....::.::.: ::::. ..:. : : : . :.:
CCDS76 NLLTEIEILKGIRHPHIVQLKDFQWDSDNIYLIMEFCAGGDLSRFIHTRRILPEKVARVF
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KSD LQQIAGAMRLLHSKGIIHRDLKPQNILLSNPAGRRANPNSIRVKIADFGFARYLQSNMMA
.::.:.:...:: ..: : ::::::::::. .:. .:.::::::....
CCDS76 MQQLASALQFLHERNISHLDLKPQNILLSS----LEKPH---LKLADFGFAQHMSPWDEK
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KSD ATLCGSPMYMAPEVIMSQHYDGKADLWSIGTIVYQCLTGKAPFQASSPQDLRLFYEKNKT
.: :::.:::::.. ...::...::::.:.:.:. : :. :: . : ..:. ..:..
CCDS76 HVLRGSPLYMAPEMVCQRQYDARVDLWSMGVILYEALFGQPPFASRSFSELEEKIRSNRV
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KSD L-VPTIPRETSAPLRQLLLALLQRNHKDRMDFDEFFHHPFLD-----ASPSVRKSPPVPV
. .: : : :.:: ::.:. . :..:..:: ::..: .. :. .. . :
CCDS76 IELPLRPL-LSRDCRDLLQRLLERDPSRRISFQDFFAHPWVDLEHMPSGESLGRATALVV
240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KSD PSYPSSGSGSSSSSSSTSHLASPPSLGEMQQLQKTLASPADTAGFLHSSRDSGGSKDSSC
. .. :.:... :
CCDS76 QAVKKDQEGDSAAALSLYCKALDFFVPALHYEVDAQRKEAIKAKVGQYVSRAEELKAIVS
290 300 310 320 330 340
>>CCDS45305.1 ULK3 gene_id:25989|Hs108|chr15 (472 aa)
initn: 690 init1: 318 opt: 685 Z-score: 316.9 bits: 69.1 E(32554): 2.5e-11
Smith-Waterman score: 685; 37.7% identity (68.7% similar) in 313 aa overlap (3-308:4-305)
10 20 30 40 50
pF1KSD MEPGRGGTETVGKFEFSRKDLIGHGAFAVVFKGRHREKHDLEVAVKCINKKNLAKSQTL
:: : . : : . .: :..:.:.:. .. ::.::. ::.: :...
CCDS45 MAGPGWGPPRLDG---FILTERLGSGTYATVYKAYAKKDTREVVAIKCVAKKSLNKASVE
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KSD -LGKEIKILKELKHENIVALYDFQEMANSVYLVMEYCNGGDLADYLHAMRTLSEDTIRLF
: ::.::: ..: .:: : ::: ....::.::.: ::::. ..:. : : : . :.:
CCDS45 NLLTEIEILKGIRHPHIVQLKDFQWDSDNIYLIMEFCAGGDLSRFIHTRRILPEKVARVF
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KSD LQQIAGAMRLLHSKGIIHRDLKPQNILLSNPAGRRANPNSIRVKIADFGFARYLQSNMMA
.::.:.:...:: ..: : ::::::::::. .:. .:.::::::....
CCDS45 MQQLASALQFLHERNISHLDLKPQNILLSS----LEKPH---LKLADFGFAQHMSPWDEK
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KSD ATLCGSPMYMAPEVIMSQHYDGKADLWSIGTIVYQCLTGKAPFQASSPQDLRLFYEKNKT
.: :::.:::::.. ...::...::::.:.:.:. : :. :: . : ..:. ..:..
CCDS45 HVLRGSPLYMAPEMVCQRQYDARVDLWSMGVILYEALFGQPPFASRSFSELEEKIRSNRV
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KSD L-VPTIPRETSAPLRQLLLALLQRNHKDRMDFDEFFHHPFLD-----ASPSVRKSPPVPV
. .: : : :.:: ::.:. . :..:..:: ::..: .. :. .. . :
CCDS45 IELPLRPL-LSRDCRDLLQRLLERDPSRRISFQDFFAHPWVDLEHMPSGESLGRATALVV
240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KSD PSYPSSGSGSSSSSSSTSHLASPPSLGEMQQLQKTLASPADTAGFLHSSRDSGGSKDSSC
. .. :.:... :
CCDS45 QAVKKDQEGDSAAALSLYCKALDFFVPALHYEVDAQRKEAIKAKVGQYVSRAEELKAIVS
290 300 310 320 330 340
1050 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 02:47:37 2016 done: Thu Nov 3 02:47:37 2016
Total Scan time: 5.640 Total Display time: 0.090
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]