Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA0712
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0712, 1738 aa
1>>>pF1KSDA0712 1738 - 1738 aa - 1738 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.0731+/-0.000996; mu= 2.3805+/- 0.060
mean_var=244.3570+/-50.381, 0's: 0 Z-trim(111.8): 130 B-trim: 5 in 1/52
Lambda= 0.082047
statistics sampled from 12564 (12694) to 12564 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.705), E-opt: 0.2 (0.39), width: 16
Scan time: 5.790
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31718.1 ARHGAP32 gene_id:9743|Hs108|chr11 (1738) 11732 1403.2 0
CCDS44769.1 ARHGAP32 gene_id:9743|Hs108|chr11 (2087) 11732 1403.3 0
CCDS54254.1 ARHGAP33 gene_id:115703|Hs108|chr19 (1123) 1333 172.2 9.1e-42
CCDS12477.1 ARHGAP33 gene_id:115703|Hs108|chr19 (1126) 1235 160.6 2.8e-38
CCDS43135.1 ARHGAP31 gene_id:57514|Hs108|chr3 (1444) 1156 151.3 2.3e-35
CCDS1215.1 ARHGAP30 gene_id:257106|Hs108|chr1 ( 890) 1032 136.5 4e-31
CCDS30918.1 ARHGAP30 gene_id:257106|Hs108|chr1 (1101) 1027 136.0 7.2e-31
>>CCDS31718.1 ARHGAP32 gene_id:9743|Hs108|chr11 (1738 aa)
initn: 11732 init1: 11732 opt: 11732 Z-score: 7512.9 bits: 1403.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 11732; 100.0% identity (100.0% similar) in 1738 aa overlap (1-1738:1-1738)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MKSRPTKQKLKQRGILKERVFGCDLGEHLLNSGFEVPQVLQSCTAFIERYGIVDGIYRLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MKSRPTKQKLKQRGILKERVFGCDLGEHLLNSGFEVPQVLQSCTAFIERYGIVDGIYRLS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD GVASNIQRLRHEFDSEHVPDLTKEPYVQDIHSVGSLCKLYFRELPNPLLTYQLYEKFSDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 GVASNIQRLRHEFDSEHVPDLTKEPYVQDIHSVGSLCKLYFRELPNPLLTYQLYEKFSDA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD VSAATDEERLIKIHDVIQQLPPPHYRTLEFLMRHLSLLADYCSITNMHAKNLAIVWAPNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 VSAATDEERLIKIHDVIQQLPPPHYRTLEFLMRHLSLLADYCSITNMHAKNLAIVWAPNL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD LRSKQIESACFSGTAAFMEVRIQSVVVEFILNHVDVLFSGRISMAMQEGAASLSRPKSLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LRSKQIESACFSGTAAFMEVRIQSVVVEFILNHVDVLFSGRISMAMQEGAASLSRPKSLL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD VSSPSTKLLTLEEAQARTQAQVNSPIVTENKYIEVGEGPAALQGKFHTIIEFPLERKRPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 VSSPSTKLLTLEEAQARTQAQVNSPIVTENKYIEVGEGPAALQGKFHTIIEFPLERKRPQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD NKMKKSPVGSWRSFFNLGKSSSVSKRKLQRNESEPSEMKAMALKGGRAEGTLRSAKSEES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 NKMKKSPVGSWRSFFNLGKSSSVSKRKLQRNESEPSEMKAMALKGGRAEGTLRSAKSEES
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD LTSLHAVDGDSKLFRPRRPRSSSDALSASFNGEMLGNRCNSYDNLPHDNESEEEGGLLHI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LTSLHAVDGDSKLFRPRRPRSSSDALSASFNGEMLGNRCNSYDNLPHDNESEEEGGLLHI
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD PALMSPHSAEDVDLSPPDIGVASLDFDPMSFQCSPPKAESECLESGASFLDSPGYSKDKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 PALMSPHSAEDVDLSPPDIGVASLDFDPMSFQCSPPKAESECLESGASFLDSPGYSKDKP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD SANKKDAETGSSQCQTPGSTASSEPVSPLQEKLSPFFTLDLSPTEDKSSKPSSFTEKVVY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SANKKDAETGSSQCQTPGSTASSEPVSPLQEKLSPFFTLDLSPTEDKSSKPSSFTEKVVY
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD AFSPKIGRKLSKSPSMSISEPISVTLPPRVSEVIGTVSNTTAQNASSSTWDKCVEERDAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 AFSPKIGRKLSKSPSMSISEPISVTLPPRVSEVIGTVSNTTAQNASSSTWDKCVEERDAT
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD NRSPTQIVKMKTNETVAQEAYESEVQPLDQVAAEEVELPGKEDQSVSSSQSKAVASGQTQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 NRSPTQIVKMKTNETVAQEAYESEVQPLDQVAAEEVELPGKEDQSVSSSQSKAVASGQTQ
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD TGAVTHDPPQDSVPVSSVSLIPPPPPPKNVARMLALALAESAQQASTQSLKRPGTSQAGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 TGAVTHDPPQDSVPVSSVSLIPPPPPPKNVARMLALALAESAQQASTQSLKRPGTSQAGY
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD TNYGDIAVATTEDNLSSSYSAVALDKAYFQTDRPAEQFHLQNNAPGNCDHPLPETTATGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 TNYGDIAVATTEDNLSSSYSAVALDKAYFQTDRPAEQFHLQNNAPGNCDHPLPETTATGD
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD PTHSNTTESGEQHHQVDLTGNQPHQAYLSGDPEKARITSVPLDSEKSDDHVSFPEDQSGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 PTHSNTTESGEQHHQVDLTGNQPHQAYLSGDPEKARITSVPLDSEKSDDHVSFPEDQSGK
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD NSMPTVSFLDQDQSPPRFYSGDQPPSYLGASVDKLHHPLEFADKSPTPPNLPSDKIYPPS
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CCDS31 NSMPTVSFLDQDQSPPRFYSGDQPPSYLGASVDKLHHPLEFADKSPTPPNLPSDKIYPPS
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD GSPEENTSTATMTYMTTTPATAQMSTKEASWDVAEQPTTADFAAATLQRTHRTNRPLPPP
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CCDS31 GSPEENTSTATMTYMTTTPATAQMSTKEASWDVAEQPTTADFAAATLQRTHRTNRPLPPP
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD PSQRSAEQPPVVGQVQAATNIGLNNSHKVQGVVPVPERPPEPRAMDDPASAFISDSGAAA
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CCDS31 PSQRSAEQPPVVGQVQAATNIGLNNSHKVQGVVPVPERPPEPRAMDDPASAFISDSGAAA
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD AQCPMATAVQPGLPEKVRDGARVPLLHLRAESVPAHPCGFPAPLPPTRMMESKMIAAIHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 AQCPMATAVQPGLPEKVRDGARVPLLHLRAESVPAHPCGFPAPLPPTRMMESKMIAAIHS
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD SSADATSSSNYHSFVTASSTSVDDALPLPLPVPQPKHASQKTVYSSFARPDVTTEPFGPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SSADATSSSNYHSFVTASSTSVDDALPLPLPVPQPKHASQKTVYSSFARPDVTTEPFGPD
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD NCLHFNMTPNCQYRPQSVPPHHNKLEQHQVYGARSEPPASMGLRYNTYVAPGRNASGHHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 NCLHFNMTPNCQYRPQSVPPHHNKLEQHQVYGARSEPPASMGLRYNTYVAPGRNASGHHS
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KSD KPCSRVEYVSSLSSSVRNTCYPEDIPPYPTIRRVQSLHAPPSSMIRSVPISRTEVPPDDE
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CCDS31 KPCSRVEYVSSLSSSVRNTCYPEDIPPYPTIRRVQSLHAPPSSMIRSVPISRTEVPPDDE
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KSD PAYCPRPLYQYKPYQSSQARSDYHVTQLQPYFENGRVHYRYSPYSSSSSSYYSPDGALCD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 PAYCPRPLYQYKPYQSSQARSDYHVTQLQPYFENGRVHYRYSPYSSSSSSYYSPDGALCD
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KSD VDAYGTVQLRPLHRLPNRDFAFYNPRLQGKSLYSYAGLAPRPRANVTGYFSPNDHNVVSM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 VDAYGTVQLRPLHRLPNRDFAFYNPRLQGKSLYSYAGLAPRPRANVTGYFSPNDHNVVSM
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KSD PPAADVKHTYTSWDLEDMEKYRMQSIRRESRARQKVKGPVMSQYDNMTPAVQDDLGGIYV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 PPAADVKHTYTSWDLEDMEKYRMQSIRRESRARQKVKGPVMSQYDNMTPAVQDDLGGIYV
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KSD IHLRSKSDPGKTGLLSVAEGKESRHAAKAISPEGEDRFYRRHPEAEMDRAHHHGGHGSTQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 IHLRSKSDPGKTGLLSVAEGKESRHAAKAISPEGEDRFYRRHPEAEMDRAHHHGGHGSTQ
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KSD PEKPSLPQKQSSLRSRKLPDMGCSLPEHRAHQEASHRQFCESKNGPPYPQGAGQLDYGSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 PEKPSLPQKQSSLRSRKLPDMGCSLPEHRAHQEASHRQFCESKNGPPYPQGAGQLDYGSK
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KSD GIPDTSEPVSYHNSGVKYAASGQESLRLNHKEVRLSKEMERPWVRQPSAPEKHSRDCYKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 GIPDTSEPVSYHNSGVKYAASGQESLRLNHKEVRLSKEMERPWVRQPSAPEKHSRDCYKE
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KSD EEHLTQSIVPPPKPERSHSLKLHHTQNVERDPSVLYQYQPHGKRQSSVTVVSQYDNLEDY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 EEHLTQSIVPPPKPERSHSLKLHHTQNVERDPSVLYQYQPHGKRQSSVTVVSQYDNLEDY
1630 1640 1650 1660 1670 1680
1690 1700 1710 1720 1730
pF1KSD HSLPQHQRGVFGGGGMGTYVPPGFPHPQSRTYATALGQGAFLPAELSLQHPETQIHAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 HSLPQHQRGVFGGGGMGTYVPPGFPHPQSRTYATALGQGAFLPAELSLQHPETQIHAE
1690 1700 1710 1720 1730
>>CCDS44769.1 ARHGAP32 gene_id:9743|Hs108|chr11 (2087 aa)
initn: 11732 init1: 11732 opt: 11732 Z-score: 7511.7 bits: 1403.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 11732; 100.0% identity (100.0% similar) in 1738 aa overlap (1-1738:350-2087)
10 20 30
pF1KSD MKSRPTKQKLKQRGILKERVFGCDLGEHLL
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 NQKVPQSVTNSVPKPVSKKHGKLITFLRTFMKSRPTKQKLKQRGILKERVFGCDLGEHLL
320 330 340 350 360 370
40 50 60 70 80 90
pF1KSD NSGFEVPQVLQSCTAFIERYGIVDGIYRLSGVASNIQRLRHEFDSEHVPDLTKEPYVQDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 NSGFEVPQVLQSCTAFIERYGIVDGIYRLSGVASNIQRLRHEFDSEHVPDLTKEPYVQDI
380 390 400 410 420 430
100 110 120 130 140 150
pF1KSD HSVGSLCKLYFRELPNPLLTYQLYEKFSDAVSAATDEERLIKIHDVIQQLPPPHYRTLEF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 HSVGSLCKLYFRELPNPLLTYQLYEKFSDAVSAATDEERLIKIHDVIQQLPPPHYRTLEF
440 450 460 470 480 490
160 170 180 190 200 210
pF1KSD LMRHLSLLADYCSITNMHAKNLAIVWAPNLLRSKQIESACFSGTAAFMEVRIQSVVVEFI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LMRHLSLLADYCSITNMHAKNLAIVWAPNLLRSKQIESACFSGTAAFMEVRIQSVVVEFI
500 510 520 530 540 550
220 230 240 250 260 270
pF1KSD LNHVDVLFSGRISMAMQEGAASLSRPKSLLVSSPSTKLLTLEEAQARTQAQVNSPIVTEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LNHVDVLFSGRISMAMQEGAASLSRPKSLLVSSPSTKLLTLEEAQARTQAQVNSPIVTEN
560 570 580 590 600 610
280 290 300 310 320 330
pF1KSD KYIEVGEGPAALQGKFHTIIEFPLERKRPQNKMKKSPVGSWRSFFNLGKSSSVSKRKLQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 KYIEVGEGPAALQGKFHTIIEFPLERKRPQNKMKKSPVGSWRSFFNLGKSSSVSKRKLQR
620 630 640 650 660 670
340 350 360 370 380 390
pF1KSD NESEPSEMKAMALKGGRAEGTLRSAKSEESLTSLHAVDGDSKLFRPRRPRSSSDALSASF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 NESEPSEMKAMALKGGRAEGTLRSAKSEESLTSLHAVDGDSKLFRPRRPRSSSDALSASF
680 690 700 710 720 730
400 410 420 430 440 450
pF1KSD NGEMLGNRCNSYDNLPHDNESEEEGGLLHIPALMSPHSAEDVDLSPPDIGVASLDFDPMS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 NGEMLGNRCNSYDNLPHDNESEEEGGLLHIPALMSPHSAEDVDLSPPDIGVASLDFDPMS
740 750 760 770 780 790
460 470 480 490 500 510
pF1KSD FQCSPPKAESECLESGASFLDSPGYSKDKPSANKKDAETGSSQCQTPGSTASSEPVSPLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 FQCSPPKAESECLESGASFLDSPGYSKDKPSANKKDAETGSSQCQTPGSTASSEPVSPLQ
800 810 820 830 840 850
520 530 540 550 560 570
pF1KSD EKLSPFFTLDLSPTEDKSSKPSSFTEKVVYAFSPKIGRKLSKSPSMSISEPISVTLPPRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 EKLSPFFTLDLSPTEDKSSKPSSFTEKVVYAFSPKIGRKLSKSPSMSISEPISVTLPPRV
860 870 880 890 900 910
580 590 600 610 620 630
pF1KSD SEVIGTVSNTTAQNASSSTWDKCVEERDATNRSPTQIVKMKTNETVAQEAYESEVQPLDQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SEVIGTVSNTTAQNASSSTWDKCVEERDATNRSPTQIVKMKTNETVAQEAYESEVQPLDQ
920 930 940 950 960 970
640 650 660 670 680 690
pF1KSD VAAEEVELPGKEDQSVSSSQSKAVASGQTQTGAVTHDPPQDSVPVSSVSLIPPPPPPKNV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 VAAEEVELPGKEDQSVSSSQSKAVASGQTQTGAVTHDPPQDSVPVSSVSLIPPPPPPKNV
980 990 1000 1010 1020 1030
700 710 720 730 740 750
pF1KSD ARMLALALAESAQQASTQSLKRPGTSQAGYTNYGDIAVATTEDNLSSSYSAVALDKAYFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 ARMLALALAESAQQASTQSLKRPGTSQAGYTNYGDIAVATTEDNLSSSYSAVALDKAYFQ
1040 1050 1060 1070 1080 1090
760 770 780 790 800 810
pF1KSD TDRPAEQFHLQNNAPGNCDHPLPETTATGDPTHSNTTESGEQHHQVDLTGNQPHQAYLSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 TDRPAEQFHLQNNAPGNCDHPLPETTATGDPTHSNTTESGEQHHQVDLTGNQPHQAYLSG
1100 1110 1120 1130 1140 1150
820 830 840 850 860 870
pF1KSD DPEKARITSVPLDSEKSDDHVSFPEDQSGKNSMPTVSFLDQDQSPPRFYSGDQPPSYLGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 DPEKARITSVPLDSEKSDDHVSFPEDQSGKNSMPTVSFLDQDQSPPRFYSGDQPPSYLGA
1160 1170 1180 1190 1200 1210
880 890 900 910 920 930
pF1KSD SVDKLHHPLEFADKSPTPPNLPSDKIYPPSGSPEENTSTATMTYMTTTPATAQMSTKEAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SVDKLHHPLEFADKSPTPPNLPSDKIYPPSGSPEENTSTATMTYMTTTPATAQMSTKEAS
1220 1230 1240 1250 1260 1270
940 950 960 970 980 990
pF1KSD WDVAEQPTTADFAAATLQRTHRTNRPLPPPPSQRSAEQPPVVGQVQAATNIGLNNSHKVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 WDVAEQPTTADFAAATLQRTHRTNRPLPPPPSQRSAEQPPVVGQVQAATNIGLNNSHKVQ
1280 1290 1300 1310 1320 1330
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KSD GVVPVPERPPEPRAMDDPASAFISDSGAAAAQCPMATAVQPGLPEKVRDGARVPLLHLRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 GVVPVPERPPEPRAMDDPASAFISDSGAAAAQCPMATAVQPGLPEKVRDGARVPLLHLRA
1340 1350 1360 1370 1380 1390
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KSD ESVPAHPCGFPAPLPPTRMMESKMIAAIHSSSADATSSSNYHSFVTASSTSVDDALPLPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 ESVPAHPCGFPAPLPPTRMMESKMIAAIHSSSADATSSSNYHSFVTASSTSVDDALPLPL
1400 1410 1420 1430 1440 1450
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KSD PVPQPKHASQKTVYSSFARPDVTTEPFGPDNCLHFNMTPNCQYRPQSVPPHHNKLEQHQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 PVPQPKHASQKTVYSSFARPDVTTEPFGPDNCLHFNMTPNCQYRPQSVPPHHNKLEQHQV
1460 1470 1480 1490 1500 1510
1180 1190 1200 1210 1220 1230
pF1KSD YGARSEPPASMGLRYNTYVAPGRNASGHHSKPCSRVEYVSSLSSSVRNTCYPEDIPPYPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 YGARSEPPASMGLRYNTYVAPGRNASGHHSKPCSRVEYVSSLSSSVRNTCYPEDIPPYPT
1520 1530 1540 1550 1560 1570
1240 1250 1260 1270 1280 1290
pF1KSD IRRVQSLHAPPSSMIRSVPISRTEVPPDDEPAYCPRPLYQYKPYQSSQARSDYHVTQLQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 IRRVQSLHAPPSSMIRSVPISRTEVPPDDEPAYCPRPLYQYKPYQSSQARSDYHVTQLQP
1580 1590 1600 1610 1620 1630
1300 1310 1320 1330 1340 1350
pF1KSD YFENGRVHYRYSPYSSSSSSYYSPDGALCDVDAYGTVQLRPLHRLPNRDFAFYNPRLQGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 YFENGRVHYRYSPYSSSSSSYYSPDGALCDVDAYGTVQLRPLHRLPNRDFAFYNPRLQGK
1640 1650 1660 1670 1680 1690
1360 1370 1380 1390 1400 1410
pF1KSD SLYSYAGLAPRPRANVTGYFSPNDHNVVSMPPAADVKHTYTSWDLEDMEKYRMQSIRRES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SLYSYAGLAPRPRANVTGYFSPNDHNVVSMPPAADVKHTYTSWDLEDMEKYRMQSIRRES
1700 1710 1720 1730 1740 1750
1420 1430 1440 1450 1460 1470
pF1KSD RARQKVKGPVMSQYDNMTPAVQDDLGGIYVIHLRSKSDPGKTGLLSVAEGKESRHAAKAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 RARQKVKGPVMSQYDNMTPAVQDDLGGIYVIHLRSKSDPGKTGLLSVAEGKESRHAAKAI
1760 1770 1780 1790 1800 1810
1480 1490 1500 1510 1520 1530
pF1KSD SPEGEDRFYRRHPEAEMDRAHHHGGHGSTQPEKPSLPQKQSSLRSRKLPDMGCSLPEHRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SPEGEDRFYRRHPEAEMDRAHHHGGHGSTQPEKPSLPQKQSSLRSRKLPDMGCSLPEHRA
1820 1830 1840 1850 1860 1870
1540 1550 1560 1570 1580 1590
pF1KSD HQEASHRQFCESKNGPPYPQGAGQLDYGSKGIPDTSEPVSYHNSGVKYAASGQESLRLNH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 HQEASHRQFCESKNGPPYPQGAGQLDYGSKGIPDTSEPVSYHNSGVKYAASGQESLRLNH
1880 1890 1900 1910 1920 1930
1600 1610 1620 1630 1640 1650
pF1KSD KEVRLSKEMERPWVRQPSAPEKHSRDCYKEEEHLTQSIVPPPKPERSHSLKLHHTQNVER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 KEVRLSKEMERPWVRQPSAPEKHSRDCYKEEEHLTQSIVPPPKPERSHSLKLHHTQNVER
1940 1950 1960 1970 1980 1990
1660 1670 1680 1690 1700 1710
pF1KSD DPSVLYQYQPHGKRQSSVTVVSQYDNLEDYHSLPQHQRGVFGGGGMGTYVPPGFPHPQSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 DPSVLYQYQPHGKRQSSVTVVSQYDNLEDYHSLPQHQRGVFGGGGMGTYVPPGFPHPQSR
2000 2010 2020 2030 2040 2050
1720 1730
pF1KSD TYATALGQGAFLPAELSLQHPETQIHAE
::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 TYATALGQGAFLPAELSLQHPETQIHAE
2060 2070 2080
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10 20 30
pF1KSD MKSRPTKQKLKQRGILKERVFGCDLGEHLL
:.:::..:.:.:::::..:::::::::::
CCDS54 CGIPAPQGISSLTSAVPRPRGKLAGLLRTFMRSRPSRQRLRQRGILRQRVFGCDLGEHLS
130 140 150 160 170 180
40 50 60 70 80 90
pF1KSD NSGFEVPQVLQSCTAFIERYGIVDGIYRLSGVASNIQRLRHEFDSEHVPDLTKEPYVQDI
::: .:::::. :. ::: .:.::::::::::.:::::::::::::..:.:. ..:::
CCDS54 NSGQDVPQVLRCCSEFIEAHGVVDGIYRLSGVSSNIQRLRHEFDSERIPELSGPAFLQDI
190 200 210 220 230 240
100 110 120 130 140 150
pF1KSD HSVGSLCKLYFRELPNPLLTYQLYEKFSDAVSAATDEERLIKIHDVIQQLPPPHYRTLEF
:::.:::::::::::::::::::: :::.:.:. .::::...::::::::::::::::.
CCDS54 HSVSSLCKLYFRELPNPLLTYQLYGKFSEAMSVPGEEERLVRVHDVIQQLPPPHYRTLEY
250 260 270 280 290 300
160 170 180 190 200 210
pF1KSD LMRHLSLLADYCSITNMHAKNLAIVWAPNLLRSKQIESACFSGTAAFMEVRIQSVVVEFI
:.:::. .: . . :.:::.::::::::::::: ..::. ..:.::: :::.:::::::.
CCDS54 LLRHLARMARHSANTSMHARNLAIVWAPNLLRSMELESVGMGGAAAFREVRVQSVVVEFL
310 320 330 340 350 360
220 230 240 250 260
pF1KSD LNHVDVLFSGRISMAMQEGAAS--LSRPKSLLVSSPSTKLLTLEEAQARTQAQVNSPIVT
:.::::::: .. : . :. : ::::: : :::.::::::::::::.....: :
CCDS54 LTHVDVLFSDTFTSAGLDPAGRCLLPRPKSLAGSCPSTRLLTLEEAQARTQGRLGTP--T
370 380 390 400 410 420
270 280 290 300 310 320
pF1KSD ENKYIEVGEGPAALQGKFHTIIEFPLERKRPQNKMK-KSPVGS-WRSFFNLGKSSSVSKR
: . ..::. : ::.. . : ..: :: :..:: ::.. :: ..
CCDS54 EP---TTPKAPAS-----------PAERRKGERGEKQRKPGGSSWKTFFALGRGPSVPRK
430 440 450 460 470
330 340 350 360 370 380
pF1KSD K----LQRNESEPSEMKAMALKGGRAEG-TLRSAKSEESLTSLHAVDGDSKLFRPRRPRS
: : ... :. .:.: . :::::::::::.: . : ..: : :::.:
CCDS54 KPLPWLGGTRAPPQP------SGSRPDTVTLRSAKSEESLSSQASGAGLQRLHRLRRPHS
480 490 500 510 520
390 400 410 420
pF1KSD SSDAL----SASFNGEMLGNRCNSYDNLPHDNESEEEGGLLHIPALM-SP-H--SA----
::::. . . . : :.. .: .. ... : :.. . :: :: : ::
CCDS54 SSDAFPVGPAPAGSCESLSSSSSSESSSSESSSSSSESSAAGLGALSGSPSHRTSAWLDD
530 540 550 560 570 580
430 440 450 460 470 480
pF1KSD -EDVDLSPPDI--GVASLDFDPMSFQCSPPKAESECLESGASFLDSPGYSKDKPSANKKD
...:.::: :. .:::::..:.:: :
CCDS54 GDELDFSPPRCLEGLRGLDFDPLTFRCSSP------------------------------
590 600 610
490 500 510 520 530 540
pF1KSD AETGSSQCQTPGSTASSEPVSPLQEKLSPFFTLDLSPTEDKSSKPSSFTEKVVYAFSPKI
:::. : :.:: .: :. : : . :.::.
CCDS54 ---------TPGDPAP--PASP-------------APPAPASAFPPRVTPQ---AISPR-
620 630 640
550 560 570 580 590 600
pF1KSD GRKLSKSPS-MSISEPISVTLPPRVSEVIGTVSNTTAQNASSSTWDKCVEERDATNRSPT
: ::. ..::::..:..:: : :..: : .: .:. .::
CCDS54 GPTSPASPAALDISEPLAVSVPPAVLELLG------AGGAPASA-------------TPT
650 660 670 680
610 620 630 640 650 660
pF1KSD QIVKMKTNETVAQEAYESEVQPLDQVAAEEVELPGKEDQSVSSSQSKAVASGQTQTGAVT
.. .. . .. :: : : : ... :.. .. . : .
CCDS54 PALS-------PGRSLRPHLIPL--------LLRGAEAPLTDACQQEMCSKLRGAQGPLG
690 700 710 720 730
670 680 690 700 710
pF1KSD HDPPQDSVPVSSVSLI-P---PPPPPKNVARMLALALAESAQQASTQSLKRP--GTSQAG
: .. .: .::. : ::::::: ::..:::::: :::.. :. .. :: :.
CCDS54 PDM-ESPLPPPPLSLLRPGGAPPPPPKNPARLMALALAERAQQVAEQQSQQECGGTPPAS
740 750 760 770 780 790
720 730 740 750 760 770
pF1KSD YTNYG-DIAVATTEDNLSSSYSAVALDKAYFQTDRPAEQFHLQNNAPGNCDHPLPETTAT
. . .... . . :..: :. : : .:: . ::. .
CCDS54 QSPFHRSLSLEVGGEPLGTSGSG----------PPPNSLAHPGAWVPGPPPY-LPRQQSD
800 810 820 830 840
780 790 800 810 820 830
pF1KSD GDPTHSNTTESGEQHHQVDLTGNQPHQAYLSGDPEKARITSVPLDSEKSDDHVSFPEDQS
:. .:. : ... . .. : ...: :.. .: .. : .
CCDS54 GSLLRSQRPM-GTSRRGLRGPAQVPTPGFFSPAPREC----LP-------PFLGVP--KP
850 860 870 880
840 850 860 870 880
pF1KSD GKNSMPTVSFLDQDQSP-PRFYSGDQPPSYLGASVDKLHHPLEFADKSP-TPP-------
: . :: : .:: : . :. ::. : . ..:.. . .. :: . :
CCDS54 GLYPLGPPSF--QPSSPAPVWRSSLGPPAPLDRG-ENLYYEIGASEGSPYSGPTRSWSPF
890 900 910 920 930 940
890 900 910 920 930 940
pF1KSD -NLPSDKIYPPSG----SPEENTSTATMTYMTTTPAT--AQMSTKEASWDVAEQPTTADF
..: :.. : :: . : . . .:. . : :..:: .
CCDS54 RSMPPDRLNASYGMLGQSPPLHRSPDFLLSYPPAPSCFPPDHLGYSAPQHPARRPTPPEP
950 960 970 980 990 1000
950 960 970 980 990
pF1KSD AAATLQRTHRTNRPLP-----PP--PSQRSAEQPPV--VGQVQAATNIGLNNSHKVQGVV
..: : : :: : .:: ::: . : : : : . :.: :
CCDS54 LYVNLALGPRGPSPASSSSSSPPAHPRSRSDPGPPVPRLPQKQRAP-WGPRTPHRVPG--
1010 1020 1030 1040 1050 1060
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KSD PVPERPPEPRAMDDPASAFISDSGAAAAQCPMATAVQPGLPEKVRDGARVPLLHLRAESV
: ::::
CCDS54 --PWGPPEPLLLYRAAPPAYGRGGELHRGSLYRNGGQRGEGAGPPPPYPTPSWSLHSEGQ
1070 1080 1090 1100 1110
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10 20 30
pF1KSD MKSRPTKQKLKQRGILKERVFGCDLGEHLL
:.:::..:.:.:::::..:::::::::::
CCDS12 CGIPAPQGISSLTSAVPRPRGKLAGLLRTFMRSRPSRQRLRQRGILRQRVFGCDLGEHLS
270 280 290 300 310 320
40 50 60 70 80 90
pF1KSD NSGFEVPQVLQSCTAFIERYGIVDGIYRLSGVASNIQRLRHEFDSEHVPDLTKEPYVQDI
::: .:::::. :. ::: .:.::::::::::.:::::::::::::..:.:. ..:::
CCDS12 NSGQDVPQVLRCCSEFIEAHGVVDGIYRLSGVSSNIQRLRHEFDSERIPELSGPAFLQDI
330 340 350 360 370 380
100 110 120 130 140 150
pF1KSD HSVGSLCKLYFRELPNPLLTYQLYEKFSDAVSAATDEERLIKIHDVIQQLPPPHYRTLEF
:::.:::::::::::::::::::: :::.:.:. .::::...::::::::::::::::.
CCDS12 HSVSSLCKLYFRELPNPLLTYQLYGKFSEAMSVPGEEERLVRVHDVIQQLPPPHYRTLEY
390 400 410 420 430 440
160 170 180 190 200 210
pF1KSD LMRHLSLLADYCSITNMHAKNLAIVWAPNLLRSKQIESACFSGTAAFMEVRIQSVVVEFI
:.:::. .: . . :.:::.::::::::::::: ..::. ..:.::: :::.:::::::.
CCDS12 LLRHLARMARHSANTSMHARNLAIVWAPNLLRSMELESVGMGGAAAFREVRVQSVVVEFL
450 460 470 480 490 500
220 230 240 250 260
pF1KSD LNHVDVLFSGRISMAMQEGAAS--LSRPKSLLVSSPSTKLLTLEEAQARTQAQVNSPIVT
:.::::::: .. : . :. : ::::: : :::.::::::::::::.....: :
CCDS12 LTHVDVLFSDTFTSAGLDPAGRCLLPRPKSLAGSCPSTRLLTLEEAQARTQGRLGTP--T
510 520 530 540 550 560
270 280 290 300 310 320
pF1KSD ENKYIEVGEGPAALQGKFHTIIEFPLERKRPQNKMK-KSPVGS-WRSFFNLGKSSSVSKR
: . ..::. : ::.. . : ..: :: :..:: ::.. :: ..
CCDS12 EPT---TPKAPAS-----------PAERRKGERGEKQRKPGGSSWKTFFALGRGPSVPRK
570 580 590 600
330 340 350 360 370
pF1KSD K----LQRNESEPSEMKAMALKGGRAEG-TLRSAKSEESLTS------LHAVDGDSKLFR
: : ... :. .:.: . :::::::::::.: : .. :
CCDS12 KPLPWLGGTRAPPQP------SGSRPDTVTLRSAKSEESLSSQASGAELLGAGGAPASAT
610 620 630 640 650 660
380 390 400 410 420 430
pF1KSD PRRPRSSSDALSASFNGEML-GNRCNSYDNLPHDNESEEEGGLLHI-PALMSPHSAEDVD
: : . .: . .: : . : .. :. .:. . : . ::
CCDS12 PTPALSPGRSLRPHLIPLLLRGAEAPLTDACQQEMCSKLRGAQGPLGPDMESP-------
670 680 690 700 710
440 450 460 470 480 490
pF1KSD LSPPDIGVASLDFDPMSFQCSPPKAESECLESGASFLDSPGYSKDKPSANKKDAETGSSQ
: :: ... . : . ::: .. . . . . . :... ::
CCDS12 LPPPPLSL----LRPGGAPPPPPKNPARLMALALA-------ERAQQVAEQQ------SQ
720 730 740 750
500 510 520 530 540
pF1KSD CQTPGSTASSEPVSPLQEKLS------PFFTLDLSPTEDKSSKPSSFTEKVVYAFSPKIG
. :. .:. ::....:: :. : .: .. ..:... : . : .
CCDS12 QECGGTPPASQ--SPFHRSLSLEVGGEPLGTSGSGPPPNSLAHPGAW----VPGPPPYLP
760 770 780 790 800 810
550 560 570 580 590 600
pF1KSD RKLSKSPSMSISEPISVTLPPRVSEVIGTVSNTTAQNASSSTWDKCVEERDATNRSPTQI
:. : . . ..:....
CCDS12 RQQSDGSLLRSQRPMGTSRRGLRGPAQVSAQLRAGGGGRDAPEAAAQSPCSVPSQVPTPG
820 830 840 850 860 870
>>CCDS43135.1 ARHGAP31 gene_id:57514|Hs108|chr3 (1444 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KSD MKSRPTKQKLKQRGILKERVFGCDLGEHLLNSGFEVPQVLQSCTAFIERYGIVDGIYRLS
::.. .:::::..: .::::: :.: .:: .:: ::.::. ::: .::::::::::
CCDS43 MKNKGAKQKLKRKGA--ASAFGCDLTEYLESSGQDVPYVLKSCAEFIETHGIVDGIYRLS
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KSD GVASNIQRLRHEFDSEHVPDLTKEPYVQDIHSVGSLCKLYFRELPNPLLTYQLYEKFSDA
::.:::::::.:: :.. ::::.: :.:::: :::::::::::::::::::.:::::..:
CCDS43 GVTSNIQRLRQEFGSDQCPDLTREVYLQDIHCVGSLCKLYFRELPNPLLTYELYEKFTEA
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KSD VSAATDEERLIKIHDVIQQLPPPHYRTLEFLMRHLSLLADYCSITNMHAKNLAIVWAPNL
:: .: .: .:..:::.::: ::::::.:.:::. .:.. : :::::.:::.::::::
CCDS43 VSHCPEEGQLARIQNVIQELPPSHYRTLEYLIRHLAHIASFSSKTNMHARNLALVWAPNL
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KSD LRSKQIESACFSGTAAFMEVRIQSVVVEFILNHVDVLFSGRISMAMQEGAASLSRP--KS
::::.::.. .: :::. ::.:.::.:::::::: .:.. .... .:: ::
CCDS43 LRSKEIEATGCNGDAAFLAVRVQQVVIEFILNHVDQIFNNGAPGSLENDE---NRPIMKS
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KSD LLVSSPST--KLLTLEEAQARTQAQVNSPIVTENKYIEVGEGPAALQGKFHTIIEFPLER
: . . : ::..:::::::. : .: : : . . : . :::..:.: ..
CCDS43 LTLPALSLPMKLVSLEEAQARSLA-TNHPARKERRENSLPEIVPPMGTLFHTVLELPDNK
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KSD KRPQNKMKKSPVGSWRSFFNLGKSSSVSKRKLQRNESEPSEMKAMALKGGRAEGTLRSAK
.. ..: :: :.:.::::.:.: :: ::.:: : . . .... ..:.: ::
CCDS43 RKLSSKSKK-----WKSIFNLGRSGSDSKSKLSRNGSVFVRGQRLSVE----KATIRPAK
300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KSD SEESLTSLHAVDGDSKLFRPRRPRSSSDALSAS-FNGEMLGNRCNSYDNLPHDNESEEEG
: .:: :. . ..: : ... . :. ... :. : : ...: .::
CCDS43 SMDSLCSVPVEGKETKGNFNRTVTTGGFFIPATKMHSTGTGSSC---DLTKQEGEWGQEG
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KSD GLLHIPALMSPHSAEDVDLSPP--DIGVASLDFDPMSFQCSPPKAESECLESGASFLDSP
: : . :.: . :. : ... : . : ... ..:
CCDS43 --------MPPGAEGGFDVSSDRSHLQGAQARPPPEQLKVFRPVEDPESEQTAPKMLGMF
410 420 430 440 450
480 490 500 510 520
pF1KSD GYSKDKPSANKKDAETGSSQCQTPGSTAS------SEPVS---PLQEKLSPFFTLDLSPT
:.:.:: :.. :.: . :. . ::: . :: ..: .. . .:
CCDS43 YTSNDSPS---KSVFTSSLFQMEPSPRNQRKALNISEPFAVSVPL--RVSAVISTNSTPC
460 470 480 490 500
530 540 550 560 570
pF1KSD EDKSSKPSSFTEKVVYAFS-------PKIGRKL-SKSPSMSISEPISVTLPPRVSEVIGT
. .. .:.. ..: :. . : ... . :. . .. : :. ::
CCDS43 RTPPKELQSLSSLEEFSFHGSESGGWPEEEKPLGAETSAASVPKKAGLEDAKAVPEAPGT
510 520 530 540 550 560
580 590 600 610 620
pF1KSD V--SNTTAQNASSSTWDKCVEERDATNRSPTQIVKMKTNETVAQEAYE------SEVQPL
: :. .:. .. .: . : . ... ... : . : :..:. : : .:
CCDS43 VECSKGLSQEPGAHLEEKKTPESSLSSQHLNELEKRPNPEKVVEEGREAGEMESSTLQES
570 580 590 600 610 620
630 640 650 660 670
pF1KSD DQVAAEEVELPGKEDQSVSSS--------QSKAVASGQTQTG----AVTHDPPQDSVPVS
.. :: : : ........ . : . : . .. :. .: : . :
CCDS43 PRARAEAVLLHEMDEDDLANALIWPEIQQELKIIESEEELSSLPPPALKTSPIQPILESS
630 640 650 660 670 680
680 690 700 710 720
pF1KSD SVSLIPPPPP--------PKNVARMLALALAESAQQASTQSLKRPGTSQAGYTNYGDIAV
.:: :: : :. : . . :.: ::: :.: :. . .
CCDS43 LGPFIPSEPPGSLPCGSFPAPVSTPLEVWTRDPANQ-STQ-----GASTAASREKPE---
690 700 710 720 730 740
730 740 750 760 770 780
pF1KSD ATTEDNLSSSYSAVA-LDKAYFQTDRPAEQFHLQNNAPGNCDHPLPETTATGDPTHSNTT
:..: . ...: :. . :. : : .. ..::: . ::: . : . .:
CCDS43 --PEQGLHPDLASLAPLEIVPFEKASP--QATVEVGGPGNLSPPLPPAPPPPTPLEESTP
750 760 770 780 790
790 800 810 820 830 840
pF1KSD ESGEQHHQVDLTGNQPHQAYLSGDPEKARITSVPLDSEKSDDHVSFPEDQSGKNSMPTVS
: :. . :.. : . :.. .:. ::.: : .:
CCDS43 --------VLLSKGGPERE----DSSRKLRTDLYIDQLKSQDS-------------PEIS
800 810 820 830
850 860 870 880 890 900
pF1KSD FLDQ-DQSPPRFYSGDQPPSYLGASVDK---LHHPLEFADKSPTPPNLPSDKIYPPSGSP
: : ... :: .:. : .:: : . : . .. . . .. ::
CCDS43 SLCQGEEATPRH--SDKQNSKNAASEGKGCGFPSPTREVEIVSQEEEDVTHSVQEPSDCD
840 850 860 870 880
910 920 930 940 950
pF1KSD EENTST--ATMTYMTTTPATAQMSTKEASWDVA--EQPTTADFAAATLQ--RTHRTNRPL
:..: : : . : .: .: .. ..:: : : .: . :. .. :
CCDS43 EDDTVTDIAQHGLEMVEPW------EEPQWVTSPLHSPTLKDAHKAQVQGLQGHQLEKRL
890 900 910 920 930 940
960 970 980 990 1000
pF1KSD PPPPSQRSAE----QPPVVGQ--VQAATNIGLNNSHKVQGVVPVPERPP--EPRAMDDPA
:: :... .: : .: ... .. . : . .. :. . : : . :. :
CCDS43 SHRPSLRQSHSLDSKPTVKSQWTLEVPSSSSCANLETERNSDPLQPQAPRREITGWDEKA
950 960 970 980 990 1000
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CCDS43 LRSFREFSGLKGAEAPPNQKGPSGVQPNPAETSPISLAEGKELGT-HLGHSSPQIRQGGV
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CCDS43 LLCGELAENTWVTPEGVTLRNKMTIPKNGQRLETSTSCFYQPQRRSVILDGRSGRQIE
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start: Thu Nov 3 02:45:34 2016 done: Thu Nov 3 02:45:35 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]