Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA0688
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0688, 837 aa
1>>>pF1KSDA0688 837 - 837 aa - 837 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9819+/-0.000799; mu= 19.4379+/- 0.048
mean_var=115.8462+/-22.513, 0's: 0 Z-trim(112.1): 76 B-trim: 62 in 1/52
Lambda= 0.119161
statistics sampled from 12819 (12896) to 12819 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.742), E-opt: 0.2 (0.396), width: 16
Scan time: 3.780
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS1223.1 ADAMTS4 gene_id:9507|Hs108|chr1 ( 837) 5941 1032.7 0
CCDS33524.1 ADAMTS1 gene_id:9510|Hs108|chr21 ( 967) 2656 468.0 3.5e-131
CCDS8488.1 ADAMTS15 gene_id:170689|Hs108|chr11 ( 950) 2379 420.4 7.5e-117
CCDS41732.1 ADAMTS8 gene_id:11095|Hs108|chr11 ( 889) 2268 401.2 4e-111
CCDS13579.1 ADAMTS5 gene_id:11096|Hs108|chr21 ( 930) 2022 359.0 2.2e-98
CCDS2903.1 ADAMTS9 gene_id:56999|Hs108|chr3 (1935) 1961 348.8 5.3e-95
CCDS31778.2 ADAMTS20 gene_id:80070|Hs108|chr12 (1910) 1920 341.7 7e-93
CCDS82801.1 ADAMTS9 gene_id:56999|Hs108|chr3 (1907) 1741 311.0 1.3e-83
CCDS3983.2 ADAMTS6 gene_id:11174|Hs108|chr5 (1117) 1456 261.7 4.9e-69
CCDS12206.1 ADAMTS10 gene_id:81794|Hs108|chr19 (1103) 1395 251.3 7e-66
CCDS7307.1 ADAMTS14 gene_id:140766|Hs108|chr10 (1226) 1186 215.4 4.9e-55
CCDS34140.1 ADAMTS12 gene_id:81792|Hs108|chr5 (1594) 1165 211.9 7.2e-54
CCDS4444.1 ADAMTS2 gene_id:9509|Hs108|chr5 (1211) 1157 210.4 1.5e-53
CCDS32303.1 ADAMTS7 gene_id:11173|Hs108|chr15 (1686) 1143 208.1 1e-52
CCDS3553.1 ADAMTS3 gene_id:9508|Hs108|chr4 (1205) 1130 205.7 3.8e-52
CCDS7306.1 ADAMTS14 gene_id:140766|Hs108|chr10 (1223) 1059 193.5 1.8e-48
CCDS6972.1 ADAMTS13 gene_id:11093|Hs108|chr9 (1371) 1022 187.2 1.6e-46
CCDS6970.1 ADAMTS13 gene_id:11093|Hs108|chr9 (1427) 1022 187.2 1.7e-46
CCDS43299.1 ADAMTS16 gene_id:170690|Hs108|chr5 (1224) 825 153.3 2.4e-36
CCDS10926.1 ADAMTS18 gene_id:170692|Hs108|chr16 (1221) 791 147.5 1.4e-34
CCDS6971.1 ADAMTS13 gene_id:11093|Hs108|chr9 (1340) 603 115.2 7.7e-25
CCDS12071.1 ADAMTSL5 gene_id:339366|Hs108|chr19 ( 471) 574 109.8 1.2e-23
CCDS34311.1 ADAMTS2 gene_id:9509|Hs108|chr5 ( 566) 558 107.1 8.9e-23
CCDS6976.1 ADAMTSL2 gene_id:9719|Hs108|chr9 ( 951) 550 105.9 3.4e-22
CCDS4146.1 ADAMTS19 gene_id:171019|Hs108|chr5 (1207) 542 104.7 1e-21
CCDS30852.1 ADAMTSL4 gene_id:54507|Hs108|chr1 ( 877) 514 99.7 2.3e-20
CCDS955.1 ADAMTSL4 gene_id:54507|Hs108|chr1 (1074) 514 99.8 2.7e-20
CCDS10238.2 THSD4 gene_id:79875|Hs108|chr15 (1018) 502 97.7 1.1e-19
CCDS72908.1 ADAMTSL4 gene_id:54507|Hs108|chr1 (1097) 474 92.9 3.2e-18
CCDS6485.1 ADAMTSL1 gene_id:92949|Hs108|chr9 ( 525) 458 89.9 1.3e-17
CCDS73773.1 ADAMTSL3 gene_id:57188|Hs108|chr15 (1682) 462 91.0 1.8e-17
CCDS10326.1 ADAMTSL3 gene_id:57188|Hs108|chr15 (1691) 462 91.0 1.8e-17
CCDS47954.1 ADAMTSL1 gene_id:92949|Hs108|chr9 (1762) 458 90.4 3e-17
CCDS10383.1 ADAMTS17 gene_id:170691|Hs108|chr15 (1095) 435 86.2 3.3e-16
CCDS32114.1 PAPLN gene_id:89932|Hs108|chr14 (1251) 435 86.3 3.6e-16
CCDS62529.1 ADAMTS10 gene_id:81794|Hs108|chr19 ( 590) 424 84.1 7.9e-16
>>CCDS1223.1 ADAMTS4 gene_id:9507|Hs108|chr1 (837 aa)
initn: 5941 init1: 5941 opt: 5941 Z-score: 5521.5 bits: 1032.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5941; 99.8% identity (100.0% similar) in 837 aa overlap (1-837:1-837)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MSQTGSHPGRGLAGRWLWGAQPCLLLPIVPLSWLVWLLLLLLASLLPSARLASPLPREEE
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CCDS12 MSQTGSHPGRGLAGRWLWGAQPCLLLPIVPLSWLVWLLLLLLASLLPSARLASPLPREEE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD IVFPEKLNGSVLPGSGTPARLLCRLQAFGETLLLELEQDSGVQVEGLTVQYLGQAPELLG
::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 IVFPEKLNGSVLPGSGAPARLLCRLQAFGETLLLELEQDSGVQVEGLTVQYLGQAPELLG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD GAEPGTYLTGTINGDPESVASLHWDGGALLGVLQYRGAELHLQPLEGGTPNSAGGPGAHI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 GAEPGTYLTGTINGDPESVASLHWDGGALLGVLQYRGAELHLQPLEGGTPNSAGGPGAHI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD LRRKSPASGQGPMCNVKAPLGSPSPRPRRAKRFASLSRFVETLVVADDKMAAFHGAGLKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LRRKSPASGQGPMCNVKAPLGSPSPRPRRAKRFASLSRFVETLVVADDKMAAFHGAGLKR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD YLLTVMAAAAKAFKHPSIRNPVSLVVTRLVILGSGEEGPQVGPSAAQTLRSFCAWQRGLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 YLLTVMAAAAKAFKHPSIRNPVSLVVTRLVILGSGEEGPQVGPSAAQTLRSFCAWQRGLN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD TPEDSDPDHFDTAILFTRQDLCGVSTCDTLGMADVGTVCDPARSCAIVEDDGLQSAFTAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 TPEDSDPDHFDTAILFTRQDLCGVSTCDTLGMADVGTVCDPARSCAIVEDDGLQSAFTAA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD HELGHVFNMLHDNSKPCISLNGPLSTSRHVMAPVMAHVDPEEPWSPCSARFITDFLDNGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 HELGHVFNMLHDNSKPCISLNGPLSTSRHVMAPVMAHVDPEEPWSPCSARFITDFLDNGY
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD GHCLLDKPEAPLHLPVTFPGKDYDADRQCQLTFGPDSRHCPQLPPPCAALWCSGHLNGHA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 GHCLLDKPEAPLHLPVTFPGKDYDADRQCQLTFGPDSRHCPQLPPPCAALWCSGHLNGHA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD MCQTKHSPWADGTPCGPAQACMGGRCLHMDQLQDFNIPQAGGWGPWGPWGDCSRTCGGGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MCQTKHSPWADGTPCGPAQACMGGRCLHMDQLQDFNIPQAGGWGPWGPWGDCSRTCGGGV
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD QFSSRDCTRPVPRNGGKYCEGRRTRFRSCNTEDCPTGSALTFREEQCAAYNHRTDLFKSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 QFSSRDCTRPVPRNGGKYCEGRRTRFRSCNTEDCPTGSALTFREEQCAAYNHRTDLFKSF
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD PGPMDWVPRYTGVAPQDQCKLTCQARALGYYYVLEPRVVDGTPCSPDSSSVCVQGRCIHA
:::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 PGPMDWVPRYTGVAPQDQCKLTCQAQALGYYYVLEPRVVDGTPCSPDSSSVCVQGRCIHA
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD GCDRIIGSKKKFDKCMVCGGDGSGCSKQSGSFRKFRYGYNNVVTIPAGATHILVRQQGNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 GCDRIIGSKKKFDKCMVCGGDGSGCSKQSGSFRKFRYGYNNVVTIPAGATHILVRQQGNP
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD GHRSIYLALKLPDGSYALNGEYTLMPSPTDVVLPGAVSLRYSGATAASETLSGHGPLAQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 GHRSIYLALKLPDGSYALNGEYTLMPSPTDVVLPGAVSLRYSGATAASETLSGHGPLAQP
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830
pF1KSD LTLQVLVAGNPQDTRLRYSFFVPRPTPSTPRPTPQDWLHRRAQILEILRRRPWAGRK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LTLQVLVAGNPQDTRLRYSFFVPRPTPSTPRPTPQDWLHRRAQILEILRRRPWAGRK
790 800 810 820 830
>>CCDS33524.1 ADAMTS1 gene_id:9510|Hs108|chr21 (967 aa)
initn: 2633 init1: 1584 opt: 2656 Z-score: 2468.6 bits: 468.0 E(32554): 3.5e-131
Smith-Waterman score: 2788; 50.4% identity (73.0% similar) in 840 aa overlap (38-818:36-859)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD PGRGLAGRWLWGAQPCLLLPIVPLSWLVWLLLLLLASLLP-SARLASPLPREEEIVFPEK
:::: :.:: : :. : ..::.: ::
CCDS33 PEGFGRRKLGSDMGNAERAPGSRSFGPVPTLLLLAAALLAVSDALGRPSEEDEELVVPE-
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD LNGSVLPGSGTPARLLCRLQAFGETLLLELEQDSGVQVEGLTVQYLGQAPELLGGAE---
:. . :: :: .:: ::.:: . : :::. ::. . :.:.: .:. .:.:
CCDS33 LERA--PGHGT-TRL--RLHAFDQQLDLELRPDSSFLAPGFTLQNVGRK----SGSETPL
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KSD PGT-----YLTGTINGDPESVASLHWDGGALLGVLQYRGAELHLQPLEGGTPNSA-GGPG
: : . .::.:::: :.:.: : . :.. : .::: ... : ..::
CCDS33 PETDLAHCFYSGTVNGDPSSAAALSLCEG-VRGAFYLLGEAYFIQPLPAASERLATAAPG
120 130 140 150 160 170
180 190 200
pF1KSD A--------HILRRKSPASGQGPMCNV----KAPLG--------------------SPS-
:.:::. .. : :.: : : ::.
CCDS33 EKPPAPLQFHLLRRNRQGD-VGGTCGVVDDEPRPTGKAETEDEDEGTEGEDEGAQWSPQD
180 190 200 210 220 230
210 220 230 240 250
pF1KSD P------RPR-----RAKRFASLSRFVETLVVADDKMAAFHGAGLKRYLLTVMAAAAKAF
: .: : :::.: :.:::..:::..:: :::.:::.::::....::. .
CCDS33 PALQGVGQPTGTGSIRKKRFVSSHRYVETMLVADQSMAEFHGSGLKHYLLTLFSVAARLY
240 250 260 270 280 290
260 270 280 290 300 310
pF1KSD KHPSIRNPVSLVVTRLVILGSGEEGPQVGPSAAQTLRSFCAWQRGLNTPEDSDPDHFDTA
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CCDS33 KHPSIRNSVSLVVVKILVIHDEQKGPEVTSNAALTLRNFCNWQKQHNPPSDRDAEHYDTA
300 310 320 330 340 350
320 330 340 350 360 370
pF1KSD ILFTRQDLCGVSTCDTLGMADVGTVCDPARSCAIVEDDGLQSAFTAAHELGHVFNMLHDN
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CCDS33 ILFTRQDLCGSQTCDTLGMADVGTVCDPSRSCSVIEDDGLQAAFTTAHELGHVFNMPHDD
360 370 380 390 400 410
380 390 400 410 420 430
pF1KSD SKPCISLNGPLSTSRHVMAPVMAHVDPEEPWSPCSARFITDFLDNGYGHCLLDKPEAPLH
.: : :::: .. . :.:: .....: .::::::: .::.:::::.:.::.:::. :..
CCDS33 AKQCASLNG-VNQDSHMMASMLSNLDHSQPWSPCSAYMITSFLDNGHGECLMDKPQNPIQ
420 430 440 450 460 470
440 450 460 470 480 490
pF1KSD LPVTFPGKDYDADRQCQLTFGPDSRHCPQLPPPCAALWCSGHLNGHAMCQTKHSPWADGT
:: .:: .:::.::::.::: ::.:::. :..:::.: .: .::::: ::::::
CCDS33 LPGDLPGTSYDANRQCQFTFGEDSKHCPDAASTCSTLWCTGTSGGVLVCQTKHFPWADGT
480 490 500 510 520 530
500 510 520 530 540 550
pF1KSD PCGPAQACMGGRCLHMDQLQDFNIPQAGGWGPWGPWGDCSRTCGGGVQFSSRDCTRPVPR
:: .. :..:.:.. . . :. : :.:: ::::::::::::::::.. :.: :::.
CCDS33 SCGEGKWCINGKCVNKTDRKHFDTPFHGSWGMWGPWGDCSRTCGGGVQYTMRECDNPVPK
540 550 560 570 580 590
560 570 580 590 600 610
pF1KSD NGGKYCEGRRTRFRSCNTEDCPTGSALTFREEQCAAYNHRTDLFKSF-PGP-MDWVPRYT
::::::::.:.:.:::: :::: ... ::::::: :.:. . :: :: ..:.:.:.
CCDS33 NGGKYCEGKRVRYRSCNLEDCPDNNGKTFREEQCEAHNEFSK--ASFGSGPAVEWIPKYA
600 610 620 630 640 650
620 630 640 650 660 670
pF1KSD GVAPQDQCKLTCQARALGYYYVLEPRVVDGTPCSPDSSSVCVQGRCIHAGCDRIIGSKKK
::.:.:.::: :::...::..::.:.:::::::::::.::::::.:..::::::: ::::
CCDS33 GVSPKDRCKLICQAKGIGYFFVLQPKVVDGTPCSPDSTSVCVQGQCVKAGCDRIIDSKKK
660 670 680 690 700 710
680 690 700 710 720
pF1KSD FDKCMVCGGDGSGCSKQSGSFRKFRYGYNNVVTIPAGATHILVRQQGNPGHRSI--YLAL
:::: ::::.:: :.: ::: . . ::....:::.:::.: :.:... : :. .::.
CCDS33 FDKCGVCGGNGSTCKKISGSVTSAKPGYHDIITIPTGATNIEVKQRNQRGSRNNGSFLAI
720 730 740 750 760 770
730 740 750 760 770 780
pF1KSD KLPDGSYALNGEYTLMPSPTDVVLPGAVSLRYSGATAASETLSGHGPLAQPLTLQVLVAG
: ::.: :::.::: :.. :.: :::::..:: : . . .:: .:::.:::..:
CCDS33 KAADGTYILNGDYTLSTLEQDIMYKGVV-LRYSGSSAALERIRSFSPLKEPLTIQVLTVG
780 790 800 810 820
790 800 810 820 830
pF1KSD NPQDTRLRYSFFVPRPTPS-TPRPTPQDWLHRRAQILEILRRRPWAGRK
: ...:..:: . : . :: . :.
CCDS33 NALRPKIKYTYFVKKKKESFNAIPTFSAWVIEEWGECSKSCELGWQRRLVECRDINGQPA
830 840 850 860 870 880
>>CCDS8488.1 ADAMTS15 gene_id:170689|Hs108|chr11 (950 aa)
initn: 2039 init1: 790 opt: 2379 Z-score: 2211.4 bits: 420.4 E(32554): 7.5e-117
Smith-Waterman score: 2522; 46.3% identity (71.2% similar) in 820 aa overlap (37-816:1-814)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD HPGRGLAGRWLWGAQPCLLLPIVPLSWLVWLLLLLLASLLPSARLASPLPREEEIVFPEK
.::: . .: ..: :. :.:.: : .
CCDS84 MLLLGILTLAFAGRTAGGSEPEREVVVPIR
10 20 30
70 80 90 100 110
pF1KSD LNGSVL--------PGSGTPARLLCRLQAFGETLLLELEQDSGVQVEGLTVQYLGQAPE-
:. .. : .. :. .. :: : . :.: :. . ......:: .
CCDS84 LDPDINGRRYYWRGPEDSGDQGLIFQITAFQEDFYLHLTPDAQFLAPAFSTEHLGVPLQG
40 50 60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KSD LLGGAEP--GTYLTGTINGDPESVASLHWDGGALLGVLQYRGAELHLQPLEGGTPNSA--
: ::. . .: .:..:.: :.. :: : :.. ::::: ..:: ... .:
CCDS84 LTGGSSDLRRCFYSGDVNAEPDSFAAVSLCGG-LRGAFGYRGAEYVISPLPNASAPAAQR
100 110 120 130 140
180 190 200
pF1KSD GGPGAHILRRKS-PASGQG-PM--CNV------------------KAPLGSPSPRPR--R
.. :::.:.:.. :.. .: : :.: .: .: : : :
CCDS84 NSQGAHLLQRRGVPGGPSGDPTSRCGVASGWNPAILRALDPYKPRRAGFGESRSRRRSGR
150 160 170 180 190 200
210 220 230 240 250 260
pF1KSD AKRFASLSRFVETLVVADDKMAAFHGAGLKRYLLTVMAAAAKAFKHPSIRNPVSLVVTRL
::::.:. :.::::::::..:. :::: :..::::..:.::. ..:::: ::...::...
CCDS84 AKRFVSIPRYVETLVVADESMVKFHGADLEHYLLTLLATAARLYRHPSILNPINIVVVKV
210 220 230 240 250 260
270 280 290 300 310 320
pF1KSD VILGSGEEGPQVGPSAAQTLRSFCAWQRGLNTPEDSDPDHFDTAILFTRQDLCGVSTCDT
..: . . ::.: .:: :::.:::::. :: :. :...:::::::::::::..::::
CCDS84 LLLRDRDSGPKVTGNAALTLRNFCAWQKKLNKVSDKHPEYWDTAILFTRQDLCGATTCDT
270 280 290 300 310 320
330 340 350 360 370 380
pF1KSD LGMADVGTVCDPARSCAIVEDDGLQSAFTAAHELGHVFNMLHDNSKPCISLNGPLSTSRH
::::::::.::: :::...::::: ::::.:::::::::: ::: : : . : : .. :
CCDS84 LGMADVGTMCDPKRSCSVIEDDGLPSAFTTAHELGHVFNMPHDNVKVCEEVFGKLRAN-H
330 340 350 360 370 380
390 400 410 420 430 440
pF1KSD VMAPVMAHVDPEEPWSPCSARFITDFLDNGYGHCLLDKPEAPLHLPVTFPGKDYDADRQC
.:.:.. ..: .::: ::: .::::::.:.: ::::.: :. :: .:: .: ..::
CCDS84 MMSPTLIQIDRANPWSACSAAIITDFLDSGHGDCLLDQPSKPISLPEDLPGASYTLSQQC
390 400 410 420 430 440
450 460 470 480 490 500
pF1KSD QLTFGPDSRHCPQLPPPCAALWCSGHLNGHAMCQTKHSPWADGTPCGPAQACMGGRCLHM
.:.:: :. :: . :. :::.:. .:. .:::.: :::::: :: .. :. : :..
CCDS84 ELAFGVGSKPCPYMQY-CTKLWCTGKAKGQMVCQTRHFPWADGTSCGEGKLCLKGACVER
450 460 470 480 490 500
510 520 530 540 550 560
pF1KSD DQLQDFNIPQAGGWGPWGPWGDCSRTCGGGVQFSSRDCTRPVPRNGGKYCEGRRTRFRSC
.:. . :.:. : :.: ::::::::::.. :.:: :.: :::::::: :...:::
CCDS84 HNLNKHRVD--GSWAKWDPYGPCSRTCGGGVQLARRQCTNPTPANGGKYCEGVRVKYRSC
510 520 530 540 550 560
570 580 590 600 610 620
pF1KSD NTEDCPTG-SALTFREEQCAAYNHRTDLFKSFPGPMDWVPRYTGVAPQDQCKLTCQARAL
: : ::.. :. .:::::: :.: . . . . :::.:.::.:.:.::: :.: .
CCDS84 NLEPCPSSASGKSFREEQCEAFNGYNHSTNRLTLAVAWVPKYSGVSPRDKCKLICRANGT
570 580 590 600 610 620
630 640 650 660 670 680
pF1KSD GYYYVLEPRVVDGTPCSPDSSSVCVQGRCIHAGCDRIIGSKKKFDKCMVCGGDGSGCSKQ
::.::: :.::::: :::::.::::::.::.:::: .::::.:::: :::::...:.:
CCDS84 GYFYVLAPKVVDGTLCSPDSTSVCVQGKCIKAGCDGNLGSKKRFDKCGVCGGDNKSCKKV
630 640 650 660 670 680
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pF1KSD SGSFRKFRYGYNNVVTIPAGATHILVRQQGNPG--HRSIYLALKLPDGSYALNGEYTLMP
.: : : .::: ::.:::::. : .::.: : . ::::: .:.: :::....
CCDS84 TGLFTKPMHGYNFVVAIPAGASSIDIRQRGYKGLIGDDNYLALKNSQGKYLLNGHFVVSA
690 700 710 720 730 740
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pF1KSD SPTDVVLPGAVSLRYSGATAASETLSGHGPLAQPLTLQVLVAGNPQDTRLRYSFFVPRPT
:.:. :.. :::::. .: :.:.. :. .:::..:: .:. :.::::..:.
CCDS84 VERDLVVKGSL-LRYSGTGTAVESLQASRPILEPLTVEVLSVGKMTPPRVRYSFYLPKEP
750 760 770 780 790 800
810 820 830
pF1KSD PSTPRPTPQDWLHRRAQILEILRRRPWAGRK
:.:
CCDS84 REDKSSHPKDPRGPSVLHNSVLSLSNQVEQPDDRPPARWVAGSWGPCSASCGSGLQKRAV
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. :.: : .: :::. ..: .:.:::. ..:.: :.. . . .. :: .
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. :: . : ...::.::.:::.:.. : : : . : :. .:: :. .: .
CCDS41 RATGGERGLRGCFFSGTVNGEPESLAAVSLCRG-LSGSFLLDGEEFTIQPQ--GAGGSLA
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: : :.: .::... :: .:.. : : :
CCDS41 QP--HRLQRWGPAGARPLPRGPEWEVETGEGQRQERGDHQEDSEEESQEEEAEGASEPPP
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pF1KSD P----RRAKRFASLSRFVETLVVADDKMAAFHGAGLKRYLLTVMAAAAKAFKHPSIRNPV
: :.:::.: .::::::.::: .::::.:: :. ..::.:..::. .:::::.: .
CCDS41 PLGATSRTKRFVSEARFVETLLVADASMAAFYGADLQNHILTLMSVAARIYKHPSIKNSI
210 220 230 240 250 260
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pF1KSD SLVVTRLVILGSGEEGPQVGPSAAQTLRSFCAWQRGLNTPEDSDPDHFDTAILFTRQDLC
.:.:....:. . . ::.:. ... :::.:: ::: .: : : :.:.:::::.:::..:
CCDS41 NLMVVKVLIVEDEKWGPEVSDNGGLTLRNFCNWQRRFNQPSDRHPEHYDTAILLTRQNFC
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: . :::::.::.::.::: .::...::.:::.: : :::::::..: ::.:::: :
CCDS41 GQEGLCDTLGVADIGTICDPNKSCSVIEDEGLQAAHTLAHELGHVLSMPHDDSKPCTRLF
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pF1KSD GPLSTSRHVMAPVMAHVDPEEPWSPCSARFITDFLDNGYGHCLLDKPEAPLHLPVTFPGK
::.. ..:::::...:.. ::::::: ..:..::.:.: :::: : : : ::. .::.
CCDS41 GPMG-KHHVMAPLFVHLNQTLPWSPCSAMYLTELLDGGHGDCLLDAPAAALPLPTGLPGR
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CCDS41 MALYQLDQQCRQIFGPDFRHCPNTSAQDVCAQLWC--HTDGAEPLCHTKNGSLPWADGTP
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:::.. : : :: .... . :::.::::::.:::::::::::: :.: : :.:
CCDS41 CGPGHLCSEGSCLPEEEVERPKPVADGGWAPWGPWGECSRTCGGGVQFSHRECKDPEPQN
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::.:: :::....::.::.:: . .:::.:: :: . ::. .. ..:::.:.:
CCDS41 GGRYCLGRRAKYQSCHTEECPPDGK-SFREQQCEKYNAYNYTDMDGNL---LQWVPKYAG
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pF1KSD VAPQDQCKLTCQARALGYYYVLEPRVVDGTPCSPDSSSVCVQGRCIHAGCDRIIGSKKKF
:.:.:.::: :.::. . . :.: .:.::: :.:.. ..::.:.:..::::... : .:.
CCDS41 VSPRDRCKLFCRARGRSEFKVFEAKVIDGTLCGPETLAICVRGQCVKAGCDHVVDSPRKL
620 630 640 650 660 670
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CCDS41 DKCGVCGGKGNSCRKVSGSLTPTNYGYNDIVTIPAGATNIDVKQRSHPGVQNDGNYLALK
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pF1KSD LPDGSYALNGEYTLMPSPTDVVLPGAVSLRYSGATAASETLSGHGPLAQPLTLQVL-VAG
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CCDS41 TADGQYLLNGNLAISAIEQDILVKGTI-LKYSGSIATLERLQSFRPLPEPLTVQLLTVPG
740 750 760 770 780 790
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pF1KSD NPQDTRLRYSFFVPRPTPSTPRPTPQDWLHRRAQILEILRRRPWAGRK
. ...:.::::
CCDS41 EVFPPKVKYTFFVPNDVDFSMQSSKERATTNIIQPLLHAQWVLGDWSECSSTCGAGWQRR
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: . . ::..:.:.:.: . :: : : . . :. :.:: : . .
CCDS13 P---WRHRSHCFYRGTVDGSPRSLAVFDLCGG-LDGFFAVKHARYTLKPLLRGPWAEEEK
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: : :. :. :. .::: :.. . .
CCDS13 GRVYGDGSARILHVYTREGFSFEALPPRASCETPASTPEAHEHAPAHSNPSGRAALASQL
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200 210 220 230 240
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CCDS13 LDQSALSPAGGSGPQTWWRRRRRSISRARQVELLLVADASMARLYGRGLQHYLLTLASIA
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250 260 270 280 290 300
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. ..: ::.: . :.:...:.::. ... .:. .:: ::..:: ::. : :. .:
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310 320 330 340 350 360
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CCDS13 YDAAILFTREDLCGHHSCDTLGMADVGTICSPERSCAVIEDDGLHAAFTVAHEIGHLLGL
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CCDS13 SHDDSKFCEETFGS-TEDKRLMSSILTSIDASKPWSKCTSATITEFLDDGHGNCLLDLPR
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430 440 450 460 470 480
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CCDS13 KQILGPEELPGQTYDATQQCNLTFGPEYSVCPGMDV-CARLWCAVVRQGQMVCLTKKLPA
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490 500 510 520 530 540
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..::::: .. :. :.:. . . .. . :.:: :: ::.:::.:::::::. : :.
CCDS13 VEGTPCGKGRICLQGKCVDKTKKKYYSTSSHGNWGSWGSWGQCSRSCGGGVQFAYRHCNN
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:.:::.:.:: :.:. .:::. :: .. .::.::: : : . :. ..:::.
CCDS13 PAPRNNGRYCTGKRAIYRSCSLMPCPPNGK-SFRHEQCEAKNGYQSDAKGVKTFVEWVPK
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CCDS13 YAGVLPADVCKLTCRAKGTGYYVVFSPKVTDGTECRLYSNSVCVRGKCVRTGCDGIIGSK
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670 680 690 700 710 720
pF1KSD KKFDKCMVCGGDGSGCSKQSGSFRKFRYGYNNVVTIPAGATHILVRQ-QGNPGHR-SIYL
..::: :::::.:.:.: :.: : ::..:: :: ::::: ::: ... : . ::
CCDS13 LQYDKCGVCGGDNSSCTKIVGTFNKKSKGYTDVVRIPEGATHIKVRQFKAKDQTRFTAYL
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730 740 750 760 770 780
pF1KSD ALKLPDGSYALNGEYTLMPSPTDVVLPGAVSLRYSGATAASETLSGHGPLA--QPLTLQV
::: .: : .::.: . : : . . :.: . ::: . .. : : : : . : .:.
CCDS13 ALKKKNGEYLINGKYMISTSETIIDINGTV-MNYSGWSHRDDFLHGMGYSATKEILIVQI
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790 800 810 820 830
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:.. . .:::::::. :::.
CCDS13 LATDPTKPLDVRYSFFVPKK--STPKVNSVTSHGSNKVGSHTSQPQWVTGPWLACSRTCD
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CCDS29 DVAALNSGLATEAFSAYGNKTDNTREKRTHRRTKRFLSYPRFVEVLVVADNRMVSYHGEN
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CCDS29 LQHYILTLMSIVASIYKDPSIGNLINIVIVNLIVIHNEQDGPSISFNAQTTLKNFCQWQH
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CCDS29 SKNSPGGI---HHDTAVLLTRQDICRAHDKCDTLGLAELGTICDPYRSCSISEDSGLSTA
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CCDS29 FTIAHELGHVFNMPHDDNNKC-KEEG-VKSPQHVMAPTLNFYTNPWMWSKCSRKYITEFL
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CCDS29 DTGYGECLLNEPESRPYPLPVQLPGILYNVNKQCELIFGPGSQVCPYMMQ-CRRLWCN-N
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CCDS29 VNGVHKGCRTQHTPWADGTECEPGKHCKYGFCVP----KEMDVPVTDGSWGSWSPFGTCS
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CCDS29 RTCGGGIKTAIRECNRPEPKNGGKYCVGRRMKFKSCNTEPC-LKQKRDFRDEQCAHFDGK
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CCDS29 QGLCRQAGCDHVLNSKARRDKCGVCGGDNSSCKTVAGTFNTVHYGYNTVVRIPAGATNID
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pF1KSD VRQQGNPGHRS--IYLALKLPDGSYALNGEYTLMPSPTDVVLPGAVSLRYSGATAASETL
:::.. :. . ::::. : . :::.... . .. . .:: ..:::. .: : .
CCDS29 VRQHSFSGETDDDNYLALSSSKGEFLLNGNFVVTMAKREIRIGNAV-VEYSGSETAVERI
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pF1KSD SGHGPLAQPLTLQVLVAGNPQDTRLRYSFFVPRPTPSTPRPTPQDWLHRRAQILEILRRR
.. . : : :::: .:. . .:::: .:
CCDS29 NSTDRIEQELLLQVLSVGKLYNPDVRYSFNIPIEDKPQQFYWNSHGPWQACSKPCQGERK
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pF1KSD PWAGRK
CCDS29 RKLVCTRESDQLTVSDQRCDRLPQPGHITEPCGTDCDLRWHVASRSECSAQCGLGYRTLD
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CCDS31 MWVAKWLTGLLYHLSLFITRSWEVDFHPRQEALVR
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pF1KSD -----EIVFPEKLN--GSVLPGSG--------------TPARLLCRLQAFGETLLLELEQ
:.:.::..: : :.: : : : :. :.:. . :.:
CCDS31 TLTSYEVVIPERVNEFGEVFPQSHHFSRQKRSSEALEPMPFRTHYRFTAYGQLFQLNLTA
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:.. . : : .:: .:: . : :. . : .:. : ..:.:: :.:
CCDS31 DASFLAAGYTEVHLG-TPERGAWESDAGPSDLRHCFYRGQVNSQEDYKAVVSLC---GGL
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pF1KSD LGVLQYRGAELHLQPL--EGGTPNSAGGPGAHILRRKSPASG--QG-PMCNVKA------
:... ...: :.:. :. : :.. :.. .. : .:.:.
CCDS31 TGTFKGQNGEYFLEPIMKADGNEYEDGHNKPHLIYRQDLNNSFLQTLKYCSVSESQIKET
160 170 180 190 200 210
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pF1KSD --P------------------LGSPS---P-----RPRRAKRFASLSRFVETLVVADDKM
: :: : : : : ::. : :..: .:.:: :.
CCDS31 SLPFHTYSNMNEDLNVMKERVLGHTSKNVPLKDERRHSRKKRLISYPRYIEIMVTADAKV
220 230 240 250 260 270
240 250 260 270 280 290
pF1KSD AAFHGAGLKRYLLTVMAAAAKAFKHPSIRNPVSLVVTRLVILGSGEEGPQVGPSAAQTLR
.. ::..:. :.::.:. .: .: ::: : . .::..::.. :::: .. ..: ::.
CCDS31 VSAHGSNLQNYILTLMSIVATIYKDPSIGNLIHIVVVKLVMIHREEEGPVINFDGATTLK
280 290 300 310 320 330
300 310 320 330 340
pF1KSD SFCAWQRGLNTPEDSDPDHFDTAILFTRQDLCGVST-CDTLGMADVGTVCDPARSCAIVE
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CCDS31 NFCSWQQTQNDLDDVHPSHHDTAVLITREDICSSKEKCNMLGLSYLGTICDPLQSCFINE
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350 360 370 380 390 400
pF1KSD DDGLQSAFTAAHELGHVFNMLHDNSKPCISLNGPLSTSRHVMAPVMA-HVDPEEPWSPCS
. :: :::: ::::::.... ::.. : .. :. :::::... :..: :: ::
CCDS31 EKGLISAFTIAHELGHTLGVQHDDNPRCKEMK---VTKYHVMAPALSFHMSPWS-WSNCS
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410 420 430 440 450 460
pF1KSD ARFITDFLDNGYGHCLLDKPEAPLH-LPVTFPGKDYDADRQCQLTFGPDSRHCPQLPPPC
...:.:::.:::.::::::. .. :: .::. ::...::.:.::: :. ::.. :
CCDS31 RKYVTEFLDTGYGECLLDKPDEEIYNLPSELPGSRYDGNKQCELAFGPGSQMCPHINI-C
450 460 470 480 490 500
470 480 490 500 510 520
pF1KSD AALWCSGHLNGHAMCQTKHSPWADGTPCGPAQACMGGRCLHMDQLQDFNIPQAGGWGPWG
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CCDS31 MHLWCTSTEKLHKGCFTQHVPPADGTDCGPGMHCRHGLCVNKETETR---PVNGEWGPWE
510 520 530 540 550 560
530 540 550 560 570 580
pF1KSD PWGDCSRTCGGGVQFSSRDCTRPVPRNGGKYCEGRRTRFRSCNTEDCPTGSALTFREEQC
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CCDS31 PYSSCSRTCGGGIESATRRCNRPEPRNGGNYCVGRRMKFRSCNTDSCPKGTQ-DFREKQC
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pF1KSD AAYNHRTDLFKSFPGPMDWVPRYTGVAPQDQCKLTCQARALGYYYVLEPRVVDGTPCSPD
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650 660 670 680 690 700
pF1KSD SSSVCVQGRCIHAGCDRIIGSKKKFDKCMVCGGDGSGCSKQSGSFRKFRYGYNNVVTIPA
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CCDS31 THDICVQGQCMAAGCDHVLNSSAKIDKCGVCGGDNSSCKTITGVFNSSHYGYNVVVKIPA
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710 720 730 740 750 760
pF1KSD GATHILVRQQGNPGH-RSIYLALKLPDGSYALNGEYTLMPSPTDVVLPGAVS-LRYSGAT
:::.. .:: . :. . ::::. .:.. .::.. : : .. . :. . ..:::..
CCDS31 GATNVDIRQYSYSGQPDDSYLALSDAEGNFLFNGNFLLSTSKKEINVQGTRTVIEYSGSN
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770 780 790 800 810 820
pF1KSD AASETLSGHGPLAQPLTLQVLVAGNPQDTRLRYSFFVPRPTPSTPRPTPQDWLHRRAQIL
: : ... . . : :::: .:: . ..::: .:
CCDS31 NAVERINSTNRQEKELILQVLCVGNLYNPDVHYSFNIPLEERSDMFTWDPYGPWEGCTKM
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830
pF1KSD EILRRRPWAGRK
CCDS31 CQGLQRRNITCIHKSDHSVVSDKECDHLPLPSFVTQSCNTDCELRWHVIGKSECSSQCGQ
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CCDS82 LQHYILTLMSI----------------------------DGPSISFNAQTTLKNFCQWQH
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pF1KSD GLNTPEDSDPDHFDTAILFTRQDLCGV-STCDTLGMADVGTVCDPARSCAIVEDDGLQSA
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CCDS82 SKNSPGGI---HHDTAVLLTRQDICRAHDKCDTLGLAELGTICDPYRSCSISEDSGLSTA
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CCDS82 FTIAHELGHVFNMPHDDNNKC-KEEG-VKSPQHVMAPTLNFYTNPWMWSKCSRKYITEFL
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CCDS82 DTGYGECLLNEPESRPYPLPVQLPGILYNVNKQCELIFGPGSQVCPYMMQ-CRRLWCN-N
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CCDS82 VNGVHKGCRTQHTPWADGTECEPGKHCKYGFCVP----KEMDVPVTDGSWGSWSPFGTCS
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.... . :::.:.:. .:.::: :.. . :: :. ::.:::::. :....::
CCDS82 HFNINGLLPNVRWVPKYSGILMKDRCKLFCRVAGNTAYYQLRDRVIDGTPCGQDTNDICV
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:: : .::::....:: . ::: :::::.:.:. .:.: .::::.:: ::::::.:
CCDS82 QGLCRQAGCDHVLNSKARRDKCGVCGGDNSSCKTVAGTFNTVHYGYNTVVRIPAGATNID
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pF1KSD VRQQGNPGHRS--IYLALKLPDGSYALNGEYTLMPSPTDVVLPGAVSLRYSGATAASETL
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CCDS82 VRQHSFSGETDDDNYLALSSSKGEFLLNGNFVVTMAKREIRIGNAV-VEYSGSETAVERI
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pF1KSD SGHGPLAQPLTLQVLVAGNPQDTRLRYSFFVPRPTPSTPRPTPQDWLHRRAQILEILRRR
.. . : : :::: .:. . .:::: .:
CCDS82 NSTDRIEQELLLQVLSVGKLYNPDVRYSFNIPIEDKPQQFYWNSHGPWQACSKPCQGERK
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pF1KSD PWAGRK
CCDS82 RKLVCTRESDQLTVSDQRCDRLPQPGHITEPCGTDCDLRWHVASRSECSAQCGLGYRTLD
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CCDS39 VEYWGKDGPQWKHDFLDNCHYTGYLQ-DQRSTTKVALSNCVGLHGVIATEDEEYFIEPLK
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CCDS39 SLPINNTHIHHRQKRSVSIERFVETLVVADKMMVGYHGRKDIEHYILSVMNIVAKLYRDS
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260 270 280 290 300
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CCDS39 SLGNVVNIIVARLIVLTEDQPNLEINHHADKSLDSFCKWQKSILSHQSDGNTIPENGIAH
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CCDS39 YNWKP-YTGGGVKP---CALNCLAEGYNFYTERAPAVIDGTQCNADSLDICINGECKHVG
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CCDS39 CDNILGSDAREDRCRVCGGDGSTCDAIEGFFNDSLPRGGYMEVVQIPRGSVHIEVREVAM
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CCDS39 SKN---YIALKSEGDDYYINGAWTIDWPRKFDVA---GTAFHYKRPTDEPESLEALGPTS
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CCDS39 ENLIVMVLL--QEQNLGIRYKFNVPITRTGSGDNEVGFTWNHQPWSECSATCAGGVQRQE
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CCDS39 VVCKRLDDNSIVQNNYCDPDSKPPENQRACNTEPCPPEWFIGDWLECSKTCDGGMRTRAV
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pF1KSD TPA--RLLCRLQAFGETLLLELEQDSGVQVEGLTVQYL---GQAPELLGGAEPGTYLTGT
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CCDS12 ATAESRLFYKVASPSTHFLLNLTRSSRLLAGHVSVEYWTREGLAWQR--AARPHCLYAGH
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pF1KSD INGDPESVASLHWDGGALLGVLQYRGAELHLQPLEGGTPNSAGGP---GAHILRRKSPAS
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CCDS12 LQGQASSSHVAISTCGGLHGLIVADEEEYLIEPLHGG-PKGSRSPEESGPHVVYKRS--S
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pF1KSD GQGPM----CNVK--APL-GSP------SPRPRRA------------KRFASLSRFVETL
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CCDS12 LRHPHLDTACGVRDEKPWKGRPWWLRTLKPPPARPLGNETERGQPGLKRSVSRERYVETL
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pF1KSD VVADDKMAAFHGA-GLKRYLLTVMAAAAKAFKHPSIRNPVSLVVTRLVILGSGEEGPQVG
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CCDS12 VVADKMMVAYHGRRDVEQYVLAIMNIVAKLFQDSSLGSTVNILVTRLILLTEDQPTLEIT
250 260 270 280 290 300
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pF1KSD PSAAQTLRSFCAWQR--------GLNTPEDSDPDHFDTAILFTRQDLCGVST--CDTLGM
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CCDS12 HHAGKSLDSFCKWQKSIVNHSGHGNAIPENGVANH-DTAVLITRYDICIYKNKPCGTLGL
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pF1KSD ADVGTVCDPARSCAIVEDDGLQSAFTAAHELGHVFNMLHDNSKPCISLNGPLSTSRHVMA
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CCDS12 APVGGMCERERSCSVNEDIGLATAFTIAHEIGHTFGMNHDGVGNSCGARGQ-DPAKLMAA
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pF1KSD PVMAHVDPEEPWSPCSARFITDFLDNGYGHCLLDKP-EAPLHLPVTFPGKDYDADRQCQL
. ...: :: :: .::.:::.: : :: ..: . . :.. ::. ::::.::..
CCDS12 HITMKTNPFV-WSSCSRDYITSFLDSGLGLCLNNRPPRQDFVYPTVAPGQAYDADEQCRF
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pF1KSD TFGPDSRHCPQLPPPCAALWCSGHLNGHAMCQTKHSPWADGTPCGPAQACMGGRCLHMDQ
: ::.: . :. ::: :. : :. : :.:: : ... : : .
CCDS12 QHGVKSRQC-KYGEVCSELWC---LSKSNRCITNSIPAAEGTLC-QTHTIDKGWCYKRVC
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CCDS12 VPFGSRPEGVDGAWGPWTPWGDCSRTCGGGVSSSSRHCDSPRPTIGGKYCLGERRRHRSC
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::.::: :: ::: ::. .. : : . : : . . :.::: :....
CCDS12 NTDDCPPGSQ-DFREVQCSEFDS-----IPFRGKFYKWKTYRGGGVK-ACSLTCLAEGFN
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CCDS12 FYTERAAAVVDGTPCRPDTVDICVSGECKHVGCDRVLGSDLREDKCRVCGGDGSACETIE
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pF1KSD GSFRKFR--YGYNNVVTIPAGATHILVRQQGNPGHRSIYLALKLPDGSYALNGEYTLMPS
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CCDS12 GVFSPASPGAGYEDVVWIPKGSVHIFI-QDLNLSLS--HLALKGDQESLLLEG-LPGTPQ
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pF1KSD PTDVVLPGAVSLRYSGATAASETLSGHGPLAQPLTLQVLVAGNPQDTRLRYSFFVPRPTP
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CCDS12 PHRLPLAGTTFQLRQGPDQV-QSLEALGPINA--SLIVMVLARTELPALRYRFNAPIARD
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pF1KSD STPRPTPQDWLHRRAQILEILRRRPWAGRK
: : : .:
CCDS12 SLP---PYSWHYAPWTKCSAQCAGGSQVQAVECRNQLDSSAVAPHYCSAHSKLPKRQRAC
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837 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 02:41:16 2016 done: Thu Nov 3 02:41:17 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]