Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA0647
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0647, 1195 aa
1>>>pF1KSDA0647 1195 - 1195 aa - 1195 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.4177+/-0.0009; mu= 13.1549+/- 0.055
mean_var=132.3312+/-26.067, 0's: 0 Z-trim(110.9): 78 B-trim: 23 in 1/50
Lambda= 0.111492
statistics sampled from 11914 (11993) to 11914 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.717), E-opt: 0.2 (0.368), width: 16
Scan time: 5.380
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS11608.1 MTMR4 gene_id:9110|Hs108|chr17 (1195) 8391 1361.8 0
CCDS13870.1 MTMR3 gene_id:8897|Hs108|chr22 (1198) 3768 618.2 3.7e-176
CCDS46682.1 MTMR3 gene_id:8897|Hs108|chr22 (1161) 3275 538.9 2.7e-152
CCDS13871.1 MTMR3 gene_id:8897|Hs108|chr22 (1170) 3275 538.9 2.7e-152
CCDS8306.1 MTMR2 gene_id:8898|Hs108|chr11 ( 571) 909 158.2 5.4e-38
CCDS8305.1 MTMR2 gene_id:8898|Hs108|chr11 ( 643) 909 158.2 5.9e-38
CCDS14694.1 MTM1 gene_id:4534|Hs108|chrX ( 603) 878 153.2 1.8e-36
CCDS14695.1 MTMR1 gene_id:8776|Hs108|chrX ( 665) 863 150.8 1e-35
CCDS78512.1 MTMR1 gene_id:8776|Hs108|chrX ( 673) 863 150.8 1e-35
CCDS14379.1 MTMR8 gene_id:55613|Hs108|chrX ( 704) 817 143.4 1.8e-33
CCDS34851.1 MTMR7 gene_id:9108|Hs108|chr8 ( 660) 777 137.0 1.5e-31
CCDS9313.1 MTMR6 gene_id:9107|Hs108|chr13 ( 621) 750 132.6 2.9e-30
CCDS5979.1 MTMR9 gene_id:66036|Hs108|chr8 ( 549) 696 123.9 1.1e-27
CCDS31427.1 SBF2 gene_id:81846|Hs108|chr11 (1849) 465 87.1 4.5e-16
CCDS14091.2 SBF1 gene_id:6305|Hs108|chr22 (1893) 459 86.1 8.9e-16
CCDS45204.1 MTMR10 gene_id:54893|Hs108|chr15 ( 777) 434 81.8 6.9e-15
CCDS77998.1 MTMR12 gene_id:54545|Hs108|chr5 ( 693) 362 70.2 1.9e-11
CCDS34138.1 MTMR12 gene_id:54545|Hs108|chr5 ( 747) 352 68.7 6.3e-11
CCDS72901.1 MTMR11 gene_id:10903|Hs108|chr1 ( 640) 349 68.1 7.7e-11
CCDS72902.1 MTMR11 gene_id:10903|Hs108|chr1 ( 709) 349 68.2 8.4e-11
>>CCDS11608.1 MTMR4 gene_id:9110|Hs108|chr17 (1195 aa)
initn: 8391 init1: 8391 opt: 8391 Z-score: 7294.9 bits: 1361.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 8391; 99.9% identity (100.0% similar) in 1195 aa overlap (1-1195:1-1195)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MGEEGPPSLEYIQAKDLFPPKELVKEEENLQVPFTVLQGEGVEFLGRAADALIAISNYRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MGEEGPPSLEYIQAKDLFPPKELVKEEENLQVPFTVLQGEGVEFLGRAADALIAISNYRL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD HIKFKDSVINVPLRMIDSVESRDMFQLHISCKDSKVVRCHFSTFKQCQEWLSRLSRATAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 HIKFKDSVINVPLRMIDSVESRDMFQLHISCKDSKVVRCHFSTFKQCQEWLSRLSRATAR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD PAKPEDLFAFAYHAWCLGLTEEDQHTHLCQPGEHIRCRQEAELARMGFDVQNVWRVSHIN
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::
CCDS11 PAKPEDLFAFAYHAWCLGLTEEDQHTHLCQPGEHIRCRQEAELARMGFDLQNVWRVSHIN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD SNYKLCPSYPQKLLVPVWITDKELENVASFRSWKRIPVVVYRHLRNGAAIARCSQPEISW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SNYKLCPSYPQKLLVPVWITDKELENVASFRSWKRIPVVVYRHLRNGAAIARCSQPEISW
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD WGWRNADDEYLVTSIAKACALDPGTRATGGSLSTGNNDTSEACDADFDSSLTACSGVEST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 WGWRNADDEYLVTSIAKACALDPGTRATGGSLSTGNNDTSEACDADFDSSLTACSGVEST
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD AAPQKLLILDARSYTAAVANRAKGGGCECEEYYPNCEVVFMGMANIHAIRNSFQYLRAVC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 AAPQKLLILDARSYTAAVANRAKGGGCECEEYYPNCEVVFMGMANIHAIRNSFQYLRAVC
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD SQMPDPSNWLSALESTKWLQHLSVMLKAAVLVANTVDREGRPVLVHCSDGWDRTPQIVAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SQMPDPSNWLSALESTKWLQHLSVMLKAAVLVANTVDREGRPVLVHCSDGWDRTPQIVAL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD AKILLDPYYRTLEGFQVLVESDWLDFGHKFGDRCGHQENVEDQNEQCPVFLQWLDSVHQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 AKILLDPYYRTLEGFQVLVESDWLDFGHKFGDRCGHQENVEDQNEQCPVFLQWLDSVHQL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD LKQFPCLFEFNEAFLVKLVQHTYSCLYGTFLANNPCEREKRNIYKRTCSVWALLRAGNKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LKQFPCLFEFNEAFLVKLVQHTYSCLYGTFLANNPCEREKRNIYKRTCSVWALLRAGNKN
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD FHNFLYTPSSDMVLHPVCHVRALHLWTAVYLPASSPCTLGEENMDLYLSPVAQSQEFSGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 FHNFLYTPSSDMVLHPVCHVRALHLWTAVYLPASSPCTLGEENMDLYLSPVAQSQEFSGR
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD SLDRLPKTRSMDDLLSACDTSSPLTRTSSDPNLNNHCQEVRVGLEPWHSNPEGSETSFVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SLDRLPKTRSMDDLLSACDTSSPLTRTSSDPNLNNHCQEVRVGLEPWHSNPEGSETSFVD
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD SGVGGPQQTVGEVGLPPPLPSSQKDYLSNKPFKSHKSCSPSYKLLNTAVPREMKSNTSDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SGVGGPQQTVGEVGLPPPLPSSQKDYLSNKPFKSHKSCSPSYKLLNTAVPREMKSNTSDP
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD EIKVLEETKGPAPDPSAQDELGRTLDGIGEPPEHCPETEAVSALSKVISNKCDGVCNFPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 EIKVLEETKGPAPDPSAQDELGRTLDGIGEPPEHCPETEAVSALSKVISNKCDGVCNFPE
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD SSQNSPTGTPQQAQPDSMLGVPSKCVLDHSLSTVCNPPSAACQTPLDPSTDFLNQDPSGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SSQNSPTGTPQQAQPDSMLGVPSKCVLDHSLSTVCNPPSAACQTPLDPSTDFLNQDPSGS
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD VASISHQEQLSSVPDLTHGEEDIGKRGNNRNGQLLENPRFGKMPLELVRKPISQSQISEF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VASISHQEQLSSVPDLTHGEEDIGKRGNNRNGQLLENPRFGKMPLELVRKPISQSQISEF
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD SFLGSNWDSFQGMVTSFPSGEATPRRLLSYGCCSKRPNSKQMRATGPCFGGQWAQREGVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SFLGSNWDSFQGMVTSFPSGEATPRRLLSYGCCSKRPNSKQMRATGPCFGGQWAQREGVK
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD SPVCSSHSNGHCTGPGGKNQMWLSSHPKQVSSTKPVPLNCPSPVPPLYLDDDGLPFPTDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SPVCSSHSNGHCTGPGGKNQMWLSSHPKQVSSTKPVPLNCPSPVPPLYLDDDGLPFPTDV
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD IQHRLRQIEAGYKQEVEQLRRQVRELQMRLDIRHCCAPPAEPPMDYEDDFTCLKESDGSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 IQHRLRQIEAGYKQEVEQLRRQVRELQMRLDIRHCCAPPAEPPMDYEDDFTCLKESDGSD
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD TEDFGSDHSEDCLSEASWEPVDKKETEVTRWVPDHMASHCYNCDCEFWLAKRRHHCRNCG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 TEDFGSDHSEDCLSEASWEPVDKKETEVTRWVPDHMASHCYNCDCEFWLAKRRHHCRNCG
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190
pF1KSD NVFCAGCCHLKLPIPDQQLYDPVLVCNSCYEHIQVSRARELMSQQLKKPIATASS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 NVFCAGCCHLKLPIPDQQLYDPVLVCNSCYEHIQVSRARELMSQQLKKPIATASS
1150 1160 1170 1180 1190
>>CCDS13870.1 MTMR3 gene_id:8897|Hs108|chr22 (1198 aa)
initn: 2844 init1: 1557 opt: 3768 Z-score: 3276.2 bits: 618.2 E(32554): 3.7e-176
Smith-Waterman score: 3785; 49.6% identity (71.7% similar) in 1242 aa overlap (1-1195:1-1198)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MGEEGPPSLEYIQAKDLFPPKELVKEEENLQVPFTVLQGEGVEFLGRAADALIAISNYRL
: :: ::: :::...:: :.:..:.::::::: :.::..::.::: ::.::.:::::
CCDS13 MDEETRHSLECIQANQIFPRKQLIREDENLQVPFLELHGESTEFVGRAEDAIIALSNYRL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD HIKFKDSVINVPLRMIDSVESRDMFQLHISCKDSKVVRCHFSTFKQCQEWLSRLSRATAR
:::::.:..::::..:.::: ::.::::..::: ::.::.::::.::::::.::. :
CCDS13 HIKFKESLVNVPLQLIESVECRDIFQLHLTCKDCKVIRCQFSTFEQCQEWLKRLNNAIRP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KSD PAKPEDLFAFAYHAWCLGL--TEEDQHTHLCQPGEHIRCRQEAELARMGFDVQNVWRVSH
::: ::::.:::::::. . .:..:: ::.::::. : . :. :::::..:.::.:.
CCDS13 PAKIEDLFSFAYHAWCMEVYASEKEQHGDLCRPGEHVTSRFKNEVERMGFDMNNAWRISN
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KSD INSNYKLCPSYPQKLLVPVWITDKELENVASFRSWKRIPVVVYRHLRNGAAIARCSQPEI
:: .:::: ::::.:.::.::::::::.:.:::::::::.:.::: :::.::::.:::.
CCDS13 INEKYKLCGSYPQELIVPAWITDKELESVSSFRSWKRIPAVIYRHQSNGAVIARCGQPEV
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KSD SWWGWRNADDEYLVTSIAKACALDPGTRATGGSLSTGNN-----DTSEACDADFDSSLTA
:::::::::::.:: :.::::: : .:..:..::: :. . .. :..:::::.
CCDS13 SWWGWRNADDEHLVQSVAKACASD--SRSSGSKLSTRNTSRDFPNGGDLSDVEFDSSLSN
250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KSD CSGVESTAA-PQKLLILDARSYTAAVANRAKGGGCECEEYYPNCEVVFMGMANIHAIRNS
::.:: : ::::::::::::.:::::::::::::: :::::::::::::::::.:: :
CCDS13 ASGAESLAIQPQKLLILDARSYAAAVANRAKGGGCECPEYYPNCEVVFMGMANIHSIRRS
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KSD FQYLRAVCSQMPDPSNWLSALESTKWLQHLSVMLKAAVLVANTVDREGRPVLVHCSDGWD
:: :: .:.:::::.::::::::::::.::::.::.:.::...::.. ::::::::::::
CCDS13 FQSLRLLCTQMPDPGNWLSALESTKWLHHLSVLLKSALLVVHAVDQDQRPVLVHCSDGWD
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KSD RTPQIVALAKILLDPYYRTLEGFQVLVESDWLDFGHKFGDRCGHQENVEDQNEQCPVFLQ
::::::::::.::::::::.:::::::: .::::::::.::::: :: .: ::.::::::
CCDS13 RTPQIVALAKLLLDPYYRTIEGFQVLVEMEWLDFGHKFADRCGHGENSDDLNERCPVFLQ
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KSD WLDSVHQLLKQFPCLFEFNEAFLVKLVQHTYSCLYGTFLANNPCEREKRNIYKRTCSVWA
::: :::: .:::: :::::::::::::::::::.:::: :: :: ... .::::::.
CCDS13 WLDCVHQLQRQFPCSFEFNEAFLVKLVQHTYSCLFGTFLCNNAKERGEKHTQERTCSVWS
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KSD LLRAGNKNFHNFLYTPSSDMVLHPVCHVRALHLWTAVYLPASSPCTLGEENMDLYLSPVA
::::::: :.:.::. .:. ::.:::::: : ::.::::: :: : ... : .: .
CCDS13 LLRAGNKAFKNLLYSSQSEAVLYPVCHVRNLMLWSAVYLPCPSPTTPVDDSCAPYPAPGT
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KSD QSQEFSGRSLDRLPKTRSMDDLLSACDTSSPL-TRTSSDPNLNNHCQEVRVGLEPWHSNP
. .. :.:::::::.:.: .:::.. :: .: :::.::.. :: : .::
CCDS13 SPDD---PPLSRLPKTRSYDNLTTACDNTVPLASRRCSDPSLNEKWQEHRRSLELSSLAG
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700
pF1KSD EGSETSFVDSGVGGPQQTVG--EVGLPPPLPSSQKDYLSNKPFKSHKSCS-PSYKLLNTA
: . .:: .: : .. : :... . .: . . .. : ... :... ..
CCDS13 PGEDPLSADS-LGKPTRVPGGAELSVAAGVAEGQMENILQEATKEESGVEEPAHR---AG
660 670 680 690 700 710
710 720 730 740 750 760
pF1KSD VPREMKSNTSDPEIKVLEETKGPAPDPSAQDELGRTLDG-IGEPPEHCPETEAVSALSKV
. :.. . :: .. .:.. .:. :: .: : .:. . . .:.
CCDS13 I--EIQEGKEDPLLE--KESRRKTPEASA---IGLHQDPELGDAALRSHLDMSWPLFSQG
720 730 740 750 760
770 780 790 800 810
pF1KSD ISNKCDGVCNFPESSQNSPTGTPQQAQP--------------DSMLGVPSKCVLDHSLST
::.. .:. . : : : : . : ...: .: . .. :
CCDS13 ISEQQSGLSVLLSSLQVPPRGEDSLEVPVEQFRIEEIAEGREEAVLPIPVDAKVGYGTSQ
770 780 790 800 810 820
820 830 840 850 860
pF1KSD VCN--PPSAACQT--P-LDPSTDFLNQDPSGSVASISHQEQLSSVPDLTHGEEDIGKRGN
:. : .. .: : .: :::.: .: .: :.: . : . . . :.
CCDS13 SCSLLPSQVPFETRGPNVDSSTDMLVED---KVKSVSGPQG--------HHRSCLVNSGK
830 840 850 860 870
870 880 890 900 910 920
pF1KSD NRNGQLLENPRFGKMPLE--LVRKPISQSQISEFSFLGSNWDSFQGMVTSFPSGEATPRR
.: : .: : : : ::..: : . . : :::. :. ..: .: .
CCDS13 DRLPQTME-PS----PSETSLVERPQVGSVVHRTS-LGSTL-SLTRSPCALPLAECK-EG
880 890 900 910 920
930 940 950 960 970
pF1KSD LLSYGC------CSKRP---NSKQMRAT--GPCFGGQWAQREGVKSPVCS--SHSNGHCT
:. : :..: .. :: : : : .:. .. . : : : :..:
CCDS13 LVCNGAPETENRASEQPPGLSTLQMYPTPNGHCANGEAGRSKDSLSRQLSAMSCSSAHLH
930 940 950 960 970 980
980 990 1000 1010 1020 1030
pF1KSD GPGGKNQMWLSSHPKQVSSTKPVPLNCPSPVPPLYLDDDGLPFPTDVIQHRLRQIEAGYK
. . ... :: :: : .: . :. .:::::. ::.::.::::::.:..
CCDS13 SRNLHHK-WLHSH-----SGRPSATSSPDQPSRSHLDDDGMSVYTDTIQQRLRQIESGHQ
990 1000 1010 1020 1030
1040 1050 1060 1070 1080 1090
pF1KSD QEVEQLRRQVRELQMRLDIRHCCAPPAEPPMDYEDDFTCLKESDGSDTEDFGSDHSEDCL
:::: :..::.::. ::. .. . . :. :. : . .:... .. : : . .
CCDS13 QEVETLKKQVQELKSRLESQYLTSS-LHFNGDFGDEVTSIPDSESNLDQNCLSRCSTEIF
1040 1050 1060 1070 1080 1090
1100 1110 1120 1130 1140 1150
pF1KSD SEASWEPVDKKETEVTRWVPDHMASHCYNCDCEFWLAKRRHHCRNCGNVFCAGCCHLKLP
:::::: :::..::.:::.:::.:.::: :: ::::.:.:::::::::::..::. :.:
CCDS13 SEASWEQVDKQDTEMTRWLPDHLAAHCYACDSAFWLASRKHHCRNCGNVFCSSCCNQKVP
1100 1110 1120 1130 1140 1150
1160 1170 1180 1190
pF1KSD IPDQQLYDPVLVCNSCYEHIQVSRARELMSQQLKKPIATASS
.:.:::..: ::.::: .. . . .. .: ::::..:.
CCDS13 VPSQQLFEPSRVCKSCYSSLHPTSSS--IDLELDKPIAATSN
1160 1170 1180 1190
>>CCDS46682.1 MTMR3 gene_id:8897|Hs108|chr22 (1161 aa)
initn: 2768 init1: 1557 opt: 3275 Z-score: 2847.8 bits: 538.9 E(32554): 2.7e-152
Smith-Waterman score: 3628; 48.6% identity (69.9% similar) in 1242 aa overlap (1-1195:1-1161)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MGEEGPPSLEYIQAKDLFPPKELVKEEENLQVPFTVLQGEGVEFLGRAADALIAISNYRL
: :: ::: :::...:: :.:..:.::::::: :.::..::.::: ::.::.:::::
CCDS46 MDEETRHSLECIQANQIFPRKQLIREDENLQVPFLELHGESTEFVGRAEDAIIALSNYRL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD HIKFKDSVINVPLRMIDSVESRDMFQLHISCKDSKVVRCHFSTFKQCQEWLSRLSRATAR
:::::.:..::::..:.::: ::.::::..::: ::.::.::::.::::::.::. :
CCDS46 HIKFKESLVNVPLQLIESVECRDIFQLHLTCKDCKVIRCQFSTFEQCQEWLKRLNNAIRP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KSD PAKPEDLFAFAYHAWCLGL--TEEDQHTHLCQPGEHIRCRQEAELARMGFDVQNVWRVSH
::: ::::.:::::::. . .:..:: ::.::::. : . :. :::::..:.::.:.
CCDS46 PAKIEDLFSFAYHAWCMEVYASEKEQHGDLCRPGEHVTSRFKNEVERMGFDMNNAWRISN
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KSD INSNYKLCPSYPQKLLVPVWITDKELENVASFRSWKRIPVVVYRHLRNGAAIARCSQPEI
:: .:::: ::::.:.::.::::::::.:.:::::::::.:.::: :::.::::.:::.
CCDS46 INEKYKLCGSYPQELIVPAWITDKELESVSSFRSWKRIPAVIYRHQSNGAVIARCGQPEV
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KSD SWWGWRNADDEYLVTSIAKACALDPGTRATGGSLSTGNN-----DTSEACDADFDSSLTA
:::::::::::.:: :.::::: : .:..:..::: :. . .. :..:::::.
CCDS46 SWWGWRNADDEHLVQSVAKACASD--SRSSGSKLSTRNTSRDFPNGGDLSDVEFDSSLSN
250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KSD CSGVESTAA-PQKLLILDARSYTAAVANRAKGGGCECEEYYPNCEVVFMGMANIHAIRNS
::.:: : ::::::::::::.:::::::::::::: :::::::::::::::::.:: :
CCDS46 ASGAESLAIQPQKLLILDARSYAAAVANRAKGGGCECPEYYPNCEVVFMGMANIHSIRRS
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KSD FQYLRAVCSQMPDPSNWLSALESTKWLQHLSVMLKAAVLVANTVDREGRPVLVHCSDGWD
:: :: .:.:::::.::::::::::::.::::.::.:.::...::.. ::::::::::::
CCDS46 FQSLRLLCTQMPDPGNWLSALESTKWLHHLSVLLKSALLVVHAVDQDQRPVLVHCSDGWD
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KSD RTPQIVALAKILLDPYYRTLEGFQVLVESDWLDFGHKFGDRCGHQENVEDQNEQCPVFLQ
::::::::::.::::::::.:::::::: .::::::::.::::: :: .: ::.::::::
CCDS46 RTPQIVALAKLLLDPYYRTIEGFQVLVEMEWLDFGHKFADRCGHGENSDDLNERCPVFLQ
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KSD WLDSVHQLLKQFPCLFEFNEAFLVKLVQHTYSCLYGTFLANNPCEREKRNIYKRTCSVWA
::: :::: .:::: :::::::::::::::::::.:::: :: :: ... .::::::.
CCDS46 WLDCVHQLQRQFPCSFEFNEAFLVKLVQHTYSCLFGTFLCNNAKERGEKHTQERTCSVWS
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KSD LLRAGNKNFHNFLYTPSSDMVLHPVCHVRALHLWTAVYLPASSPCTLGEENMDLYLSPVA
::::::: :.:.::. .:. ::.:::::: : ::.::::: :: : ... : .: .
CCDS46 LLRAGNKAFKNLLYSSQSEAVLYPVCHVRNLMLWSAVYLPCPSPTTPVDDSCAPYPAPGT
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KSD QSQEFSGRSLDRLPKTRSMDDLLSACDTSSPL-TRTSSDPNLNNHCQEVRVGLEPWHSNP
. .. :.:::::::.:.: .:::.. :: .: :::.::.. :: : .::
CCDS46 SPDD---PPLSRLPKTRSYDNLTTACDNTVPLASRRCSDPSLNEKWQEHRRSLELSSLAG
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700
pF1KSD EGSETSFVDSGVGGPQQTVG--EVGLPPPLPSSQKDYLSNKPFKSHKSCS-PSYKLLNTA
: . .:: .: : .. : :... . .: . . .. : ... :... ..
CCDS46 PGEDPLSADS-LGKPTRVPGGAELSVAAGVAEGQMENILQEATKEESGVEEPAHR---AG
660 670 680 690 700 710
710 720 730 740 750 760
pF1KSD VPREMKSNTSDPEIKVLEETKGPAPDPSAQDELGRTLDG-IGEPPEHCPETEAVSALSKV
. :.. . :: .. .:.. .:. :: .: : .:. . . .:.
CCDS46 I--EIQEGKEDPLLE--KESRRKTPEASA---IGLHQDPELGDAALRSHLDMSWPLFSQG
720 730 740 750 760
770 780 790 800 810
pF1KSD ISNKCDGVCNFPESSQNSPTGTPQQAQP--------------DSMLGVPSKCVLDHSLST
::.. .:. . : : : : . : ...: .: . .. :
CCDS46 ISEQQSGLSVLLSSLQVPPRGEDSLEVPVEQFRIEEIAEGREEAVLPIPVDAKVGYGTSQ
770 780 790 800 810 820
820 830 840 850 860
pF1KSD VCN--PPSAACQT--P-LDPSTDFLNQDPSGSVASISHQEQLSSVPDLTHGEEDIGKRGN
:. : .. .: : .: :::.: .: .: :.: . : . . . :.
CCDS46 SCSLLPSQVPFETRGPNVDSSTDMLVED---KVKSVSGPQG--------HHRSCLVNSGK
830 840 850 860 870
870 880 890 900 910 920
pF1KSD NRNGQLLENPRFGKMPLE--LVRKPISQSQISEFSFLGSNWDSFQGMVTSFPSGEATPRR
.: : .: : : : ::..: : . . : :::. :. ..: .: .
CCDS46 DRLPQTME-PS----PSETSLVERPQVGSVVHRTS-LGSTL-SLTRSPCALPLAECK-EG
880 890 900 910 920
930 940 950 960 970
pF1KSD LLSYGC------CSKRP---NSKQMRAT--GPCFGGQWAQREGVKSPVCS--SHSNGHCT
:. : :..: .. :: : : : .:. .. . : : : :..:
CCDS46 LVCNGAPETENRASEQPPGLSTLQMYPTPNGHCANGEAGRSKDSLSRQLSAMSCSSAHLH
930 940 950 960 970 980
980 990 1000 1010 1020 1030
pF1KSD GPGGKNQMWLSSHPKQVSSTKPVPLNCPSPVPPLYLDDDGLPFPTDVIQHRLRQIEAGYK
. . ... :: :: : .: . :. .:::::. ::.::.::::::.:..
CCDS46 SRNLHHK-WLHSH-----SGRPSATSSPDQPSRSHLDDDGMSVYTDTIQQRLRQIESGHQ
990 1000 1010 1020 1030
1040 1050 1060 1070 1080 1090
pF1KSD QEVEQLRRQVRELQMRLDIRHCCAPPAEPPMDYEDDFTCLKESDGSDTEDFGSDHSEDCL
:::: :..::.::. ::. .. .: . .: :::..
CCDS46 QEVETLKKQVQELKSRLESQY---------------LTSSLHFNG----DFGDE------
1040 1050 1060 1070
1100 1110 1120 1130 1140 1150
pF1KSD SEASWEPVDKKETEVTRWVPDHMASHCYNCDCEFWLAKRRHHCRNCGNVFCAGCCHLKLP
.:::.:::.:.::: :: ::::.:.:::::::::::..::. :.:
CCDS46 -------------VMTRWLPDHLAAHCYACDSAFWLASRKHHCRNCGNVFCSSCCNQKVP
1080 1090 1100 1110 1120
1160 1170 1180 1190
pF1KSD IPDQQLYDPVLVCNSCYEHIQVSRARELMSQQLKKPIATASS
.:.:::..: ::.::: .. . . .. .: ::::..:.
CCDS46 VPSQQLFEPSRVCKSCYSSLHPTSSS--IDLELDKPIAATSN
1130 1140 1150 1160
>>CCDS13871.1 MTMR3 gene_id:8897|Hs108|chr22 (1170 aa)
initn: 2759 init1: 1557 opt: 3275 Z-score: 2847.7 bits: 538.9 E(32554): 2.7e-152
Smith-Waterman score: 3600; 48.3% identity (69.4% similar) in 1251 aa overlap (1-1195:1-1170)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MGEEGPPSLEYIQAKDLFPPKELVKEEENLQVPFTVLQGEGVEFLGRAADALIAISNYRL
: :: ::: :::...:: :.:..:.::::::: :.::..::.::: ::.::.:::::
CCDS13 MDEETRHSLECIQANQIFPRKQLIREDENLQVPFLELHGESTEFVGRAEDAIIALSNYRL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD HIKFKDSVINVPLRMIDSVESRDMFQLHISCKDSKVVRCHFSTFKQCQEWLSRLSRATAR
:::::.:..::::..:.::: ::.::::..::: ::.::.::::.::::::.::. :
CCDS13 HIKFKESLVNVPLQLIESVECRDIFQLHLTCKDCKVIRCQFSTFEQCQEWLKRLNNAIRP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KSD PAKPEDLFAFAYHAWCLGL--TEEDQHTHLCQPGEHIRCRQEAELARMGFDVQNVWRVSH
::: ::::.:::::::. . .:..:: ::.::::. : . :. :::::..:.::.:.
CCDS13 PAKIEDLFSFAYHAWCMEVYASEKEQHGDLCRPGEHVTSRFKNEVERMGFDMNNAWRISN
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KSD INSNYKLCPSYPQKLLVPVWITDKELENVASFRSWKRIPVVVYRHLRNGAAIARCSQPEI
:: .:::: ::::.:.::.::::::::.:.:::::::::.:.::: :::.::::.:::.
CCDS13 INEKYKLCGSYPQELIVPAWITDKELESVSSFRSWKRIPAVIYRHQSNGAVIARCGQPEV
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KSD SWWGWRNADDEYLVTSIAKACALDPGTRATGGSLSTGNN-----DTSEACDADFDSSLTA
:::::::::::.:: :.::::: : .:..:..::: :. . .. :..:::::.
CCDS13 SWWGWRNADDEHLVQSVAKACASD--SRSSGSKLSTRNTSRDFPNGGDLSDVEFDSSLSN
250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KSD CSGVESTAA-PQKLLILDARSYTAAVANRAKGGGCECEEYYPNCEVVFMGMANIHAIRNS
::.:: : ::::::::::::.:::::::::::::: :::::::::::::::::.:: :
CCDS13 ASGAESLAIQPQKLLILDARSYAAAVANRAKGGGCECPEYYPNCEVVFMGMANIHSIRRS
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KSD FQYLRAVCSQMPDPSNWLSALESTKWLQHLSVMLKAAVLVANTVDREGRPVLVHCSDGWD
:: :: .:.:::::.::::::::::::.::::.::.:.::...::.. ::::::::::::
CCDS13 FQSLRLLCTQMPDPGNWLSALESTKWLHHLSVLLKSALLVVHAVDQDQRPVLVHCSDGWD
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KSD RTPQIVALAKILLDPYYRTLEGFQVLVESDWLDFGHKFGDRCGHQENVEDQNEQCPVFLQ
::::::::::.::::::::.:::::::: .::::::::.::::: :: .: ::.::::::
CCDS13 RTPQIVALAKLLLDPYYRTIEGFQVLVEMEWLDFGHKFADRCGHGENSDDLNERCPVFLQ
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KSD WLDSVHQLLKQFPCLFEFNEAFLVKLVQHTYSCLYGTFLANNPCEREKRNIYKRTCSVWA
::: :::: .:::: :::::::::::::::::::.:::: :: :: ... .::::::.
CCDS13 WLDCVHQLQRQFPCSFEFNEAFLVKLVQHTYSCLFGTFLCNNAKERGEKHTQERTCSVWS
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KSD LLRAGNKNFHNFLYTPSSDMVLHPVCHVRALHLWTAVYLPASSPCTLGEENMDLYLSPVA
::::::: :.:.::. .:. ::.:::::: : ::.::::: :: : ... : .: .
CCDS13 LLRAGNKAFKNLLYSSQSEAVLYPVCHVRNLMLWSAVYLPCPSPTTPVDDSCAPYPAPGT
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KSD QSQEFSGRSLDRLPKTRSMDDLLSACDTSSPL-TRTSSDPNLNNHCQEVRVGLEPWHSNP
. .. :.:::::::.:.: .:::.. :: .: :::.::.. :: : .::
CCDS13 SPDD---PPLSRLPKTRSYDNLTTACDNTVPLASRRCSDPSLNEKWQEHRRSLELSSLAG
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700
pF1KSD EGSETSFVDSGVGGPQQTVG--EVGLPPPLPSSQKDYLSNKPFKSHKSCS-PSYKLLNTA
: . .:: .: : .. : :... . .: . . .. : ... :... ..
CCDS13 PGEDPLSADS-LGKPTRVPGGAELSVAAGVAEGQMENILQEATKEESGVEEPAHR---AG
660 670 680 690 700 710
710 720 730 740 750 760
pF1KSD VPREMKSNTSDPEIKVLEETKGPAPDPSAQDELGRTLDG-IGEPPEHCPETEAVSALSKV
. :.. . :: .. .:.. .:. :: .: : .:. . . .:.
CCDS13 I--EIQEGKEDPLLE--KESRRKTPEASA---IGLHQDPELGDAALRSHLDMSWPLFSQG
720 730 740 750 760
770 780 790 800 810
pF1KSD ISNKCDGVCNFPESSQNSPTGTPQQAQP--------------DSMLGVPSKCVLDHSLST
::.. .:. . : : : : . : ...: .: . .. :
CCDS13 ISEQQSGLSVLLSSLQVPPRGEDSLEVPVEQFRIEEIAEGREEAVLPIPVDAKVGYGTSQ
770 780 790 800 810 820
820 830 840 850 860
pF1KSD VCN--PPSAACQT--P-LDPSTDFLNQDPSGSVASISHQEQLSSVPDLTHGEEDIGKRGN
:. : .. .: : .: :::.: .: .: :.: . : . . . :.
CCDS13 SCSLLPSQVPFETRGPNVDSSTDMLVED---KVKSVSGPQG--------HHRSCLVNSGK
830 840 850 860 870
870 880 890 900 910 920
pF1KSD NRNGQLLENPRFGKMPLE--LVRKPISQSQISEFSFLGSNWDSFQGMVTSFPSGEATPRR
.: : .: : : : ::..: : . . : :::. :. ..: .: .
CCDS13 DRLPQTME-PS----PSETSLVERPQVGSVVHRTS-LGSTL-SLTRSPCALPLAECK-EG
880 890 900 910 920
930 940 950 960 970
pF1KSD LLSYGC------CSKRP---NSKQMRAT--GPCFGGQWAQREGVKSPVCS--SHSNGHCT
:. : :..: .. :: : : : .:. .. . : : : :..:
CCDS13 LVCNGAPETENRASEQPPGLSTLQMYPTPNGHCANGEAGRSKDSLSRQLSAMSCSSAHLH
930 940 950 960 970 980
980 990 1000 1010 1020 1030
pF1KSD GPGGKNQMWLSSHPKQVSSTKPVPLNCPSPVPPLYLDDDGLPFPTDVIQHRLRQIEAGYK
. . ... :: :: : .: . :. .:::::. ::.::.::::::.:..
CCDS13 SRNLHHK-WLHSH-----SGRPSATSSPDQPSRSHLDDDGMSVYTDTIQQRLRQIESGHQ
990 1000 1010 1020 1030
1040 1050 1060 1070 1080 1090
pF1KSD QEVEQLRRQVRELQMRLDIRHCCAPPAEPPMDYEDDFTCLKESDGSDTEDFGSDHSEDCL
:::: :..::.::. ::. .. .: . .: :::..
CCDS13 QEVETLKKQVQELKSRLESQY---------------LTSSLHFNG----DFGDE------
1040 1050 1060 1070
1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD SEASWEPVDKKETEVTRWVPDHMASHCYNCDCEFWLAKRRHHCR---------NCGNVFC
.:::.:::.:.::: :: ::::.:.:::: :::::::
CCDS13 -------------VMTRWLPDHLAAHCYACDSAFWLASRKHHCRDTDRVDQTWNCGNVFC
1080 1090 1100 1110 1120
1150 1160 1170 1180 1190
pF1KSD AGCCHLKLPIPDQQLYDPVLVCNSCYEHIQVSRARELMSQQLKKPIATASS
..::. :.:.:.:::..: ::.::: .. . . .. .: ::::..:.
CCDS13 SSCCNQKVPVPSQQLFEPSRVCKSCYSSLHPTSSS--IDLELDKPIAATSN
1130 1140 1150 1160 1170
>>CCDS8306.1 MTMR2 gene_id:8898|Hs108|chr11 (571 aa)
initn: 1119 init1: 873 opt: 909 Z-score: 795.6 bits: 158.2 E(32554): 5.4e-38
Smith-Waterman score: 1105; 35.4% identity (61.0% similar) in 593 aa overlap (44-623:25-560)
20 30 40 50 60
pF1KSD AKDLFPPKELVKEEENLQVPFTVLQGEGVEFLGRAADALIAISNYRLHIKF--KDS--VI
: : :. . ....::::..: .: :.
CCDS83 MEEPPLLPGENIKDMAKDVTYICPFTG-AVRGTLTVTNYRLYFKSMERDPPFVL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KSD NVPLRMIDSVE------SR--DMFQLHISCKDSKVVR-CHFSTFKQCQEWLSRLSRATAR
.. : .:. :: :: . . :. ::: . .: : . . . : . .
CCDS83 DASLGVINRVEKIGGASSRGENSYGLETVCKDIRNLRFAHKPEGRTRRSIFENLMKYAFP
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KSD PAKPEDLFAFAYHAWCLGLTEEDQHTHLCQPGEHIRCRQEAELARMGFDVQNVWRVSHIN
.. :::: :. . .. .: .: . : :.:. .. ::...::
CCDS83 VSNNLPLFAFEYKE-----VFPENGWKLYDPLLEYR--------RQGIPNES-WRITKIN
120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KSD SNYKLCPSYPQKLLVPVWITDKELENVASFRSWKRIPVVVYRHLRNGAAIARCSQPEISW
:.:: .:: :.::. : :.::. :::::: ::::. . : .. :.:.::::: ..
CCDS83 ERYELCDTYPALLVVPANIPDEELKRVASFRSRGRIPVLSWIHPESQATITRCSQPMVGV
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KSD WGWRNADDEYLVTSIAKACALDPGTRATGGSLSTGNNDTSEACDADFDSSLTACSGVEST
: :. .:: . .: ..:.
CCDS83 SGKRSKEDEKYLQAI-----------------------------------------MDSN
220 230
310 320 330 340 350 360
pF1KSD AAPQKLLILDARSYTAAVANRAKGGGCECEEYYPNCEVVFMGMANIHAIRNSFQYLRAVC
: .:..:.::: . ::::.::::: : :. : : :.::. . :::..:.:.. :. .
CCDS83 AQSHKIFIFDARPSVNAVANKAKGGGYESEDAYQNAELVFLDIHNIHVMRESLRKLKEIV
240 250 260 270 280 290
370 380 390 400 410 420
pF1KSD SQMPDPSNWLSALESTKWLQHLSVMLKAAVLVANTVDREGRPVLVHCSDGWDRTPQIVAL
. ..::: ::::.::.:....: .:. .:. :. :.:::::::::: :...:
CCDS83 YPNIEETHWLSNLESTHWLEHIKLILAGALRIADKVESGKTSVVVHCSDGWDRTAQLTSL
300 310 320 330 340 350
430 440 450 460 470 480
pF1KSD AKILLDPYYRTLEGFQVLVESDWLDFGHKFGDRCGHQENVEDQNEQCPVFLQWLDSVHQL
: ..:: ::::..::.::::..::.:::.: : :: .. . . .. :::::..: : :.
CCDS83 AMLMLDGYYRTIRGFEVLVEKEWLSFGHRFQLRVGHGDKNHADADRSPVFLQFIDCVWQM
360 370 380 390 400 410
490 500 510 520 530 540
pF1KSD LKQFPCLFEFNEAFLVKLVQHTYSCLYGTFLANNPCEREKRNIYKRTCSVWALLRAGNKN
.::: ::::: ::. ...: ::::.:::: :. .: :.:. ::: :.:. . . ..
CCDS83 TRQFPTAFEFNEYFLITILDHLYSCLFGTFLCNSEQQRGKENLPKRTVSLWSYINSQLED
420 430 440 450 460 470
550 560 570 580 590 600
pF1KSD FHNFLYTPSSDMVLHPVCHVRALHLWTAVYLPASSPCTLGEENMDLYLSPVAQSQEFSGR
: : :: :. ::.:: .: :.::.. :. . : . : .:. :.. .
CCDS83 FTNPLYGSYSNHVLYPVASMRHLELWVGYYIRWNPRMKPQEPIHNRYKELLAKRAELQ-K
480 490 500 510 520 530
610 620 630 640 650 660
pF1KSD SLDRLPKTRSMDDLLSACDTSSPLTRTSSDPNLNNHCQEVRVGLEPWHSNPEGSETSFVD
....: . : . :. .:::
CCDS83 KVEELQREISNRSTSSSERASSPAQCVTPVQTVV
540 550 560 570
>>CCDS8305.1 MTMR2 gene_id:8898|Hs108|chr11 (643 aa)
initn: 1119 init1: 873 opt: 909 Z-score: 794.8 bits: 158.2 E(32554): 5.9e-38
Smith-Waterman score: 1106; 34.3% identity (59.8% similar) in 635 aa overlap (16-623:55-632)
10 20 30 40
pF1KSD MGEEGPPSLEYIQAKDLFPPKELVKEEEN----LQVPFTVLQGEG
: : : : .: : .. : .: ::.
CCDS83 LSSASTSHSENSVHTKSASVVSSDSISTSADNFSPDLRVLRESNKLAEMEEP-PLLPGEN
30 40 50 60 70 80
50 60 70 80
pF1KSD VEFLGR----------AADALIAISNYRLHIKF--KDS--VINVPLRMIDSVE------S
.. ... :. . ....::::..: .: :... : .:. :: :
CCDS83 IKDMAKDVTYICPFTGAVRGTLTVTNYRLYFKSMERDPPFVLDASLGVINRVEKIGGASS
90 100 110 120 130 140
90 100 110 120 130
pF1KSD R--DMFQLHISCKDSKVVR-CHFSTFKQCQEWLSRLSRATARPAKPEDLFAFAYHAWCLG
: . . :. ::: . .: : . . . : . . .. :::: :.
CCDS83 RGENSYGLETVCKDIRNLRFAHKPEGRTRRSIFENLMKYAFPVSNNLPLFAFEYKE----
150 160 170 180 190
140 150 160 170 180 190
pF1KSD LTEEDQHTHLCQPGEHIRCRQEAELARMGFDVQNVWRVSHINSNYKLCPSYPQKLLVPVW
. .. .: .: . : :.:. .. ::...:: :.:: .:: :.::.
CCDS83 -VFPENGWKLYDPLLEYR--------RQGIPNES-WRITKINERYELCDTYPALLVVPAN
200 210 220 230 240
200 210 220 230 240 250
pF1KSD ITDKELENVASFRSWKRIPVVVYRHLRNGAAIARCSQPEISWWGWRNADDEYLVTSIAKA
: :.::. :::::: ::::. . : .. :.:.::::: .. : :. .:: . .:
CCDS83 IPDEELKRVASFRSRGRIPVLSWIHPESQATITRCSQPMVGVSGKRSKEDEKYLQAI---
250 260 270 280 290 300
260 270 280 290 300 310
pF1KSD CALDPGTRATGGSLSTGNNDTSEACDADFDSSLTACSGVESTAAPQKLLILDARSYTAAV
..:.: .:..:.::: . ::
CCDS83 --------------------------------------MDSNAQSHKIFIFDARPSVNAV
310 320
320 330 340 350 360 370
pF1KSD ANRAKGGGCECEEYYPNCEVVFMGMANIHAIRNSFQYLRAVCSQMPDPSNWLSALESTKW
::.::::: : :. : : :.::. . :::..:.:.. :. . . ..::: ::::.:
CCDS83 ANKAKGGGYESEDAYQNAELVFLDIHNIHVMRESLRKLKEIVYPNIEETHWLSNLESTHW
330 340 350 360 370 380
380 390 400 410 420 430
pF1KSD LQHLSVMLKAAVLVANTVDREGRPVLVHCSDGWDRTPQIVALAKILLDPYYRTLEGFQVL
:.:....: .:. .:. :. :.:::::::::: :...:: ..:: ::::..::.::
CCDS83 LEHIKLILAGALRIADKVESGKTSVVVHCSDGWDRTAQLTSLAMLMLDGYYRTIRGFEVL
390 400 410 420 430 440
440 450 460 470 480 490
pF1KSD VESDWLDFGHKFGDRCGHQENVEDQNEQCPVFLQWLDSVHQLLKQFPCLFEFNEAFLVKL
::..::.:::.: : :: .. . . .. :::::..: : :. .::: ::::: ::. .
CCDS83 VEKEWLSFGHRFQLRVGHGDKNHADADRSPVFLQFIDCVWQMTRQFPTAFEFNEYFLITI
450 460 470 480 490 500
500 510 520 530 540 550
pF1KSD VQHTYSCLYGTFLANNPCEREKRNIYKRTCSVWALLRAGNKNFHNFLYTPSSDMVLHPVC
..: ::::.:::: :. .: :.:. ::: :.:. . . ..: : :: :. ::.::
CCDS83 LDHLYSCLFGTFLCNSEQQRGKENLPKRTVSLWSYINSQLEDFTNPLYGSYSNHVLYPVA
510 520 530 540 550 560
560 570 580 590 600 610
pF1KSD HVRALHLWTAVYLPASSPCTLGEENMDLYLSPVAQSQEFSGRSLDRLPKTRSMDDLLSAC
.: :.::.. :. . : . : .:. :.. .....: . : . :.
CCDS83 SMRHLELWVGYYIRWNPRMKPQEPIHNRYKELLAKRAELQ-KKVEELQREISNRSTSSSE
570 580 590 600 610 620
620 630 640 650 660 670
pF1KSD DTSSPLTRTSSDPNLNNHCQEVRVGLEPWHSNPEGSETSFVDSGVGGPQQTVGEVGLPPP
.:::
CCDS83 RASSPAQCVTPVQTVV
630 640
>>CCDS14694.1 MTM1 gene_id:4534|Hs108|chrX (603 aa)
initn: 1109 init1: 866 opt: 878 Z-score: 768.3 bits: 153.2 E(32554): 1.8e-36
Smith-Waterman score: 1105; 34.9% identity (59.0% similar) in 642 aa overlap (18-638:38-600)
10 20 30 40
pF1KSD MGEEGPPSLEYIQAKDLFPPKELVKEEENLQV-PFTVLQGEGVEFLG
.: . :. ..: . . ::. : . :
CCDS14 KYNSHSLENESIKRTSRDGVNRDLTEAVPRLPGETLITDKEVIYICPFN-----G-PIKG
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90
pF1KSD RAADALIAISNYRLHIKF--KDS--VINVPLRMIDSVE------SR--DMFQLHISCKDS
: . :.::::... :: ...::: .:. .: :: . . : :.:::
CCDS14 R-----VYITNYRLYLRSLETDSSLILDVPLGVISRIEKMGGATSRGENSYGLDITCKDM
70 80 90 100 110
100 110 120 130 140
pF1KSD KVVRCHFSTFKQCQEWLSR------LSRATARPAKPEDLFAFAYHAWCLGLTEEDQHTHL
. .: : :: :: :.: . :. :::: :.:: ..
CCDS14 RNLR-----FALKQEGHSRRDMFEILTRYAFPLAHSLPLFAF--------LNEEKFNVD-
120 130 140 150 160
150 160 170 180 190 200
pF1KSD CQPGEHIRCRQEAELARMGFDVQNVWRVSHINSNYKLCPSYPQKLLVPVWITDKELENVA
: . : : :.:. .. ::.. ::. :.:: .:: :.:: .: .:. ::
CCDS14 ---GWTVYNPVE-EYRRQGLPNHH-WRITFINKCYELCDTYPALLVVPYRASDDDLRRVA
170 180 190 200 210
210 220 230 240 250 260
pF1KSD SFRSWKRIPVVVYRHLRNGAAIARCSQPEISWWGWRNADDEYLVTSIAKACALDPGTRAT
.::: .::::. . : .: ..:.::::: .. : :: ::: . : : :
CCDS14 TFRSRNRIPVLSWIHPENKTVIVRCSQPLVGMSGKRNKDDEKYLDVI----------RET
220 230 240 250 260
270 280 290 300 310 320
pF1KSD GGSLSTGNNDTSEACDADFDSSLTACSGVESTAAPQKLLILDARSYTAAVANRAKGGGCE
. ..: :: : ::: . ::::.: ::: :
CCDS14 NKQIS-------------------------------KLTIYDARPSVNAVANKATGGGYE
270 280 290
330 340 350 360 370 380
pF1KSD CEEYYPNCEVVFMGMANIHAIRNSFQYLRAVCSQMPDPSNWLSALESTKWLQHLSVMLKA
.. : : :. :. . :::..:.:.. .. . . :.:::.::::.::.:....: .
CCDS14 SDDAYHNAELFFLDIHNIHVMRESLKKVKDIVYPNVEESHWLSSLESTHWLEHIKLVLTG
300 310 320 330 340 350
390 400 410 420 430 440
pF1KSD AVLVANTVDREGRPVLVHCSDGWDRTPQIVALAKILLDPYYRTLEGFQVLVESDWLDFGH
:. ::. :. :::::::::::: :...:: ..:: .::..:::..::...:..:::
CCDS14 AIQVADKVSSGKSSVLVHCSDGWDRTAQLTSLAMLMLDSFYRSIEGFEILVQKEWISFGH
360 370 380 390 400 410
450 460 470 480 490 500
pF1KSD KFGDRCGHQENVEDQNEQCPVFLQWLDSVHQLLKQFPCLFEFNEAFLVKLVQHTYSCLYG
::..: :: .. . . .. :.:::..: : :. :::: ::::: ::. ...: ::: .:
CCDS14 KFASRIGHGDKNHTDADRSPIFLQFIDCVWQMSKQFPTAFEFNEQFLIIILDHLYSCRFG
420 430 440 450 460 470
510 520 530 540 550 560
pF1KSD TFLANNPCEREKRNIYKRTCSVWALLRAGNKNFHNFLYTPSSDMVLHPVCHVRALHLWTA
::: : ::.... .:: :.:.:. .....:.: .:: . ::.:: .: :.::.
CCDS14 TFLFNCESARERQKVTERTVSLWSLINSNKEKFKNPFYTKEINRVLYPVASMRHLELWVN
480 490 500 510 520 530
570 580 590 600 610 620
pF1KSD VYLPASSPCTLGEEN--MDLYLSPVAQSQEFSGRSLDRLPKTRSMDDLLSACDTSSPLTR
:. . . : . :. .: .:. : :..: .: .. :.: :
CCDS14 YYIRWNPRIKQQQPNPVEQRYMELLALRDEYIKR-LEEL-------QLANSAKLSDPPTS
540 550 560 570 580
630 640 650 660 670 680
pF1KSD TSSDPNLNNHCQEVRVGLEPWHSNPEGSETSFVDSGVGGPQQTVGEVGLPPPLPSSQKDY
:: .. : :
CCDS14 PSSPSQMMPHVQTHF
590 600
>>CCDS14695.1 MTMR1 gene_id:8776|Hs108|chrX (665 aa)
initn: 837 init1: 837 opt: 863 Z-score: 754.6 bits: 150.8 E(32554): 1e-35
Smith-Waterman score: 1038; 32.1% identity (60.9% similar) in 601 aa overlap (44-629:119-660)
20 30 40 50 60
pF1KSD AKDLFPPKELVKEEENLQVPFTVLQGEGVEFLGRAADALIAISNYRLHIK--FKDS--VI
:.: :... .......:..: .: ..
CCDS14 GNKLAQMEEAPLFPGESIKAIVKDVMYICPFMG-AVSGTLTVTDFKLYFKNVERDPHFIL
90 100 110 120 130 140
70 80 90 100 110 120
pF1KSD NVPLRMIDSVES-------RDMFQLHISCKDSKVVRCHFSTFKQCQEWLSRLSRATARP-
.::: .:. ::. . ..: ::: . .: .. .: . . . : :
CCDS14 DVPLGVISRVEKIGAQSHGDNSCGIEIVCKDMRNLRLAYKQEEQSKLGIFENLNKHAFPL
150 160 170 180 190 200
130 140 150 160 170 180
pF1KSD AKPEDLFAFAYHAWCLGLTEEDQHTHLCQPGEHIRCRQEAELARMGFDVQNVWRVSHINS
.. . ::::.:. .. : .. .: :.:. .. :..:.:::
CCDS14 SNGQALFAFSYKE------------KFPINGWKVY-DPVSEYKRQGLPNES-WKISKINS
210 220 230 240 250
190 200 210 220 230 240
pF1KSD NYKLCPSYPQKLLVPVWITDKELENVASFRSWKRIPVVVYRHLRNGAAIARCSQPEISWW
::..: .:: ..::. . : .: .::.::. :.::. . : .. :.:.::::: ..
CCDS14 NYEFCDTYPAIIVVPTSVKDDDLSKVAAFRAKGRVPVLSWIHPESQATITRCSQPLVGPN
260 270 280 290 300 310
250 260 270 280 290 300
pF1KSD GWRNADDEYLVTSIAKACALDPGTRATGGSLSTGNNDTSEACDADFDSSLTACSGVESTA
: .:: . .: ::. :
CCDS14 DKRCKEDEKYLQTIM---------------------------DAN--------------A
320 330
310 320 330 340 350 360
pF1KSD APQKLLILDARSYTAAVANRAKGGGCECEEYYPNCEVVFMGMANIHAIRNSFQYLRAVCS
.::.:.:::. ..: .:..:::: : : ::: :.::. . :::..:.:.. :. .
CCDS14 QSHKLIIFDARQNSVADTNKTKGGGYESESAYPNAELVFLEIHNIHVMRESLRKLKEIVY
340 350 360 370 380 390
370 380 390 400 410 420
pF1KSD QMPDPSNWLSALESTKWLQHLSVMLKAAVLVANTVDREGRPVLVHCSDGWDRTPQIVALA
: . ::: ...:.::... ..: .:: .:. .. :.:::::::::: :...::
CCDS14 PSIDEARWLSNVDGTHWLEYIRMLLAGAVRIADKIESGKTSVVVHCSDGWDRTAQLTSLA
400 410 420 430 440 450
430 440 450 460 470 480
pF1KSD KILLDPYYRTLEGFQVLVESDWLDFGHKFGDRCGHQENVEDQNEQCPVFLQWLDSVHQLL
..:: ::::..::..:::..:..:::.:. : :: .. . . .. :.:::..: : :.
CCDS14 MLMLDSYYRTIKGFETLVEKEWISFGHRFALRVGHGNDNHADADRSPIFLQFVDCVWQMT
460 470 480 490 500 510
490 500 510 520 530 540
pF1KSD KQFPCLFEFNEAFLVKLVQHTYSCLYGTFLANNPCEREKRNIYKRTCSVWALLRAGNKNF
.::: ::::: ::. ...: ::::.:::: : .: :...: .: :.:. . . .:
CCDS14 RQFPSAFEFNELFLITILDHLYSCLFGTFLCNCEQQRFKEDVYTKTISLWSYINSQLDEF
520 530 540 550 560 570
550 560 570 580 590
pF1KSD HNFLYTPSSDMVLHPVCHVRALHLWTAVYL---PASSPCTLGEENMDLYLSPVAQSQEFS
: ... . ::.:: . :.::. :. : : ..:. :. :. :.
CCDS14 SNPFFVNYENHVLYPVASLSHLELWVNYYVRWNPRMRPQMPIHQNLKELLAVRAELQKRV
580 590 600 610 620 630
600 610 620 630 640 650
pF1KSD GRSLDRLPKTRSMDDLLSACDTSSPLTRTSSDPNLNNHCQEVRVGLEPWHSNPEGSETSF
..:.: ::.... :. ::: ..:
CCDS14 -EGLQREVATRAVSS--SSERGSSPSHSATSVHTSV
640 650 660
660 670 680 690 700 710
pF1KSD VDSGVGGPQQTVGEVGLPPPLPSSQKDYLSNKPFKSHKSCSPSYKLLNTAVPREMKSNTS
>>CCDS78512.1 MTMR1 gene_id:8776|Hs108|chrX (673 aa)
initn: 837 init1: 837 opt: 863 Z-score: 754.6 bits: 150.8 E(32554): 1e-35
Smith-Waterman score: 1038; 32.1% identity (60.9% similar) in 601 aa overlap (44-629:127-668)
20 30 40 50 60
pF1KSD AKDLFPPKELVKEEENLQVPFTVLQGEGVEFLGRAADALIAISNYRLHIK--FKDS--VI
:.: :... .......:..: .: ..
CCDS78 GNKLAQMEEAPLFPGESIKAIVKDVMYICPFMG-AVSGTLTVTDFKLYFKNVERDPHFIL
100 110 120 130 140 150
70 80 90 100 110 120
pF1KSD NVPLRMIDSVES-------RDMFQLHISCKDSKVVRCHFSTFKQCQEWLSRLSRATARP-
.::: .:. ::. . ..: ::: . .: .. .: . . . : :
CCDS78 DVPLGVISRVEKIGAQSHGDNSCGIEIVCKDMRNLRLAYKQEEQSKLGIFENLNKHAFPL
160 170 180 190 200 210
130 140 150 160 170 180
pF1KSD AKPEDLFAFAYHAWCLGLTEEDQHTHLCQPGEHIRCRQEAELARMGFDVQNVWRVSHINS
.. . ::::.:. .. : .. .: :.:. .. :..:.:::
CCDS78 SNGQALFAFSYKE------------KFPINGWKVY-DPVSEYKRQGLPNES-WKISKINS
220 230 240 250 260
190 200 210 220 230 240
pF1KSD NYKLCPSYPQKLLVPVWITDKELENVASFRSWKRIPVVVYRHLRNGAAIARCSQPEISWW
::..: .:: ..::. . : .: .::.::. :.::. . : .. :.:.::::: ..
CCDS78 NYEFCDTYPAIIVVPTSVKDDDLSKVAAFRAKGRVPVLSWIHPESQATITRCSQPLVGPN
270 280 290 300 310 320
250 260 270 280 290 300
pF1KSD GWRNADDEYLVTSIAKACALDPGTRATGGSLSTGNNDTSEACDADFDSSLTACSGVESTA
: .:: . .: ::. :
CCDS78 DKRCKEDEKYLQTIM---------------------------DAN--------------A
330 340
310 320 330 340 350 360
pF1KSD APQKLLILDARSYTAAVANRAKGGGCECEEYYPNCEVVFMGMANIHAIRNSFQYLRAVCS
.::.:.:::. ..: .:..:::: : : ::: :.::. . :::..:.:.. :. .
CCDS78 QSHKLIIFDARQNSVADTNKTKGGGYESESAYPNAELVFLEIHNIHVMRESLRKLKEIVY
350 360 370 380 390 400
370 380 390 400 410 420
pF1KSD QMPDPSNWLSALESTKWLQHLSVMLKAAVLVANTVDREGRPVLVHCSDGWDRTPQIVALA
: . ::: ...:.::... ..: .:: .:. .. :.:::::::::: :...::
CCDS78 PSIDEARWLSNVDGTHWLEYIRMLLAGAVRIADKIESGKTSVVVHCSDGWDRTAQLTSLA
410 420 430 440 450 460
430 440 450 460 470 480
pF1KSD KILLDPYYRTLEGFQVLVESDWLDFGHKFGDRCGHQENVEDQNEQCPVFLQWLDSVHQLL
..:: ::::..::..:::..:..:::.:. : :: .. . . .. :.:::..: : :.
CCDS78 MLMLDSYYRTIKGFETLVEKEWISFGHRFALRVGHGNDNHADADRSPIFLQFVDCVWQMT
470 480 490 500 510 520
490 500 510 520 530 540
pF1KSD KQFPCLFEFNEAFLVKLVQHTYSCLYGTFLANNPCEREKRNIYKRTCSVWALLRAGNKNF
.::: ::::: ::. ...: ::::.:::: : .: :...: .: :.:. . . .:
CCDS78 RQFPSAFEFNELFLITILDHLYSCLFGTFLCNCEQQRFKEDVYTKTISLWSYINSQLDEF
530 540 550 560 570 580
550 560 570 580 590
pF1KSD HNFLYTPSSDMVLHPVCHVRALHLWTAVYL---PASSPCTLGEENMDLYLSPVAQSQEFS
: ... . ::.:: . :.::. :. : : ..:. :. :. :.
CCDS78 SNPFFVNYENHVLYPVASLSHLELWVNYYVRWNPRMRPQMPIHQNLKELLAVRAELQKRV
590 600 610 620 630 640
600 610 620 630 640 650
pF1KSD GRSLDRLPKTRSMDDLLSACDTSSPLTRTSSDPNLNNHCQEVRVGLEPWHSNPEGSETSF
..:.: ::.... :. ::: ..:
CCDS78 -EGLQREVATRAVSS--SSERGSSPSHSATSVHTSV
650 660 670
660 670 680 690 700 710
pF1KSD VDSGVGGPQQTVGEVGLPPPLPSSQKDYLSNKPFKSHKSCSPSYKLLNTAVPREMKSNTS
>>CCDS14379.1 MTMR8 gene_id:55613|Hs108|chrX (704 aa)
initn: 1011 init1: 378 opt: 817 Z-score: 714.3 bits: 143.4 E(32554): 1.8e-33
Smith-Waterman score: 1030; 32.1% identity (59.9% similar) in 636 aa overlap (71-698:50-612)
50 60 70 80 90
pF1KSD GVEFLGRAADALIAISNYRLHIKFKDSVINVPLRMIDSVESRDMFQLH----ISCKDSKV
. :. : .::. . .: . ::. .:
CCDS14 SKKPANGILYLTATHLIYVEASGAARKETWIALHHIATVEKLPITSLGCPLTLRCKNFRV
20 30 40 50 60 70
100 110 120 130 140 150
pF1KSD VRCHFSTFKQCQEWLSRLSRATARPAKPEDLFAFAYHAWCLGLTEEDQHTHLCQPGEHIR
.. ... :.: : . . .:: ::::.::.:. .:. .: .:
CCDS14 AHFVLDSDLVCHEVYISLLKLS-QPALPEDLYAFSYNPKSSKEMRESGW-KLIDPI----
80 90 100 110 120 130
160 170 180 190 200 210
pF1KSD CRQEAELARMGFDVQNVWRVSHINSNYKLCPSYPQKLLVPVWITDKELENVASFRSWKRI
....:::. .: : .. : ::..: .:: ...:: .: . . ..::: .:.
CCDS14 ----SDFGRMGIPNRN-WTITDANRNYEICSTYPPEIVVPKSVTLGTVVGSSKFRSKERV
140 150 160 170 180
220 230 240 250 260 270
pF1KSD PVVVYRHLRNGAAIARCSQPEISWWGWRNADDEYLVTSIAKACALDPGTRATGGSLSTGN
::. : . .:.::: ::::: .: . : .::: :. .:... .::.
CCDS14 PVLSYLYKENNAAICRCSQP-LSGFYTRCVDDELLLEAISQT---NPGS-----------
190 200 210 220 230
280 290 300 310 320 330
pF1KSD NDTSEACDADFDSSLTACSGVESTAAPQKLLILDARSYTAAVANRAKGGGCECEEYYPNC
: . ..:.: :.:::: : : : :. : :
CCDS14 ---------------------------QFMYVVDTRPKLNAMANRAAGKGYENEDNYANI
240 250 260
340 350 360 370 380 390
pF1KSD EVVFMGMANIHAIRNSFQYLRAVCS-QMPDPSNWLSALESTKWLQHLSVMLKAAVLVANT
. :::. :::..:.:.: : :: . : :..::.:::. ::.:..... :.......
CCDS14 RFRFMGIENIHVMRSSLQKLLEVCELKTPTMSEFLSGLESSGWLRHIKAIMDAGIFITKA
270 280 290 300 310 320
400 410 420 430 440 450
pF1KSD VDREGRPVLVHCSDGWDRTPQIVALAKILLDPYYRTLEGFQVLVESDWLDFGHKFGDRCG
: : :::::::::::: :. ..:.:::::.:::..:...:.:..:...::::..:::
CCDS14 VKVEKASVLVHCSDGWDRTAQVCSVASILLDPFYRTFKGLMILIEKEWISMGHKFSQRCG
330 340 350 360 370 380
460 470 480 490 500 510
pF1KSD HQENVEDQNEQCPVFLQWLDSVHQLLKQFPCLFEFNEAFLVKLVQHTYSCLYGTFLANNP
: .. :..: :.: :.:: . ::..:::: ::::: ::... .:..:: .:.::.:
CCDS14 HLDG--DSKEVSPIFTQFLDCIWQLMEQFPCAFEFNENFLLEIHDHVFSCQFGNFLGNCQ
390 400 410 420 430 440
520 530 540 550 560 570
pF1KSD CEREKRNIYKRTCSVWALLRAGNKNFHNFLYTPSSDM-VLHPVCHVRALHLWTAVYLPAS
.:: .:..: ::: .: . .:.: :: . . ::.: ...: ..:
CCDS14 KDREDLRVYEKTHSVWPFLVQRKPDFRNPLYKGFTMYGVLNPSTVPYNIQFWCGMY----
450 460 470 480 490 500
580 590 600 610 620 630
pF1KSD SPCTLGEENMDLYLSPVAQSQEFSGRSLDRLPKTRSMDDLLSACDTSSPLTRTSSDPNLN
. .: :.: ::. .:: .. : :.: . .. . . : . :.
CCDS14 -------NRFDKGLQP-KQSML---ESLLEIKKQRAMLET-DVHELEKKLKVRDEPPEEI
510 520 530 540
640 650 660 670 680 690
pF1KSD NHCQEVRVGLEPWHSNPEGSETSFVDSGVGGPQQTVGEVGLPPPLPS--SQKDYLSNKPF
:... : ..: . .:. :..: .:. : : . .: : ....
CCDS14 CTCSQLGNILSQHLGSPLTNPLGFM--GINGDLNTLMENGTLSREGGLRAQMDQVKSQGA
550 560 570 580 590 600
700 710 720 730 740 750
pF1KSD KSHKSCSPSYKLLNTAVPREMKSNTSDPEIKVLEETKGPAPDPSAQDELGRTLDGIGEPP
:..:
CCDS14 DLHHNCCEIVGSLRAINISGDVGISEAMGISGDMCTFEATGFSKDLGICGAMDISEATGI
610 620 630 640 650 660
1195 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 18:36:02 2016 done: Thu Nov 3 18:36:03 2016
Total Scan time: 5.380 Total Display time: 0.420
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]