FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KSDA0642, 1320 aa 1>>>pF1KSDA0642 1320 - 1320 aa - 1320 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 15.1106+/-0.000533; mu= -21.8313+/- 0.033 mean_var=740.1173+/-153.058, 0's: 0 Z-trim(123.5): 171 B-trim: 651 in 1/56 Lambda= 0.047144 statistics sampled from 43153 (43371) to 43153 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.777), E-opt: 0.2 (0.509), width: 16 Scan time: 19.740 The best scores are: opt bits E(85289) NP_001096617 (OMIM: 607688,612003) PERQ amino acid (1320) 8875 620.3 2.8e-176 NP_001096616 (OMIM: 607688,612003) PERQ amino acid (1299) 7501 526.8 3.8e-148 NP_056390 (OMIM: 607688,612003) PERQ amino acid-ri (1299) 7501 526.8 3.8e-148 NP_001096618 (OMIM: 607688,612003) PERQ amino acid (1293) 7436 522.4 8.1e-147 XP_016868020 (OMIM: 612064) PREDICTED: PERQ amino ( 974) 1045 87.6 4.7e-16 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pF1KSD Y : NP_056 Y >>NP_001096618 (OMIM: 607688,612003) PERQ amino acid-ric (1293 aa) initn: 7383 init1: 6178 opt: 7436 Z-score: 2756.8 bits: 522.4 E(85289): 8.1e-147 Smith-Waterman score: 8580; 97.8% identity (97.8% similar) in 1321 aa overlap (1-1320:1-1293) 10 20 30 40 50 60 pF1KSD MAAETQTLNFGPEWLRALSSGGSITSPPLSPALPKYKLADYRYGREEMLALFLKDNKIPS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 MAAETQTLNFGPEWLRALSSGGSITSPPLSPALPKYKLADYRYGREEMLALFLKDNKIPS 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KSD DLLDKEFLPILQEEPLPPLALVPFTEEEQRNFSMSVNSAAVLRLTGRGGGGTVVGAPRGR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 DLLDKEFLPILQEEPLPPLALVPFTEEEQRNFSMSVNSAAVLRLTGRGGGGTVVGAPRGR 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KSD SSSRGRGRGRGECGFYQRSFDEVEGVFGRGGGREMHRSQSWEERGDRRFEKPGRKDVGKK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 SSSRGRGRGRGECGFYQRSFDEVEGVFGRGGGREMHRSQSWEERGDRRFEKPGRKDVG-- 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 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(106-1299:2-917) 80 90 100 110 120 130 pF1KSD LPPLALVPFTEEEQRNFSMSVNSAAVLRLTGRGGGGTVVGAPRGRSSSRGRGRGRGECGF :.:.: ..:. :::.:.:.::::::. : XP_016 MGKGAGPPLAGTSRGRGSTRSRGRGRGDSCF 10 20 30 140 150 160 170 180 190 pF1KSD YQRSFDEVEGVFGRGGGREMHRSQSWEERGDRRFEKPGRKDVGKKNGYYCMYSPVLLLGQ ::::..: .:.:::. ::..:::::..::.::::: .:.: : : XP_016 YQRSIEEGDGAFGRSP-REIQRSQSWDDRGERRFEKSARRD-----GARC---------- 40 50 60 70 200 210 220 230 240 250 pF1KSD PLCQGRPNFEEGGPTSVGRKHEFIRSESENWRIFREEQNGEDEDGGWRL-AGSRRDGERW .::::: .: ..: ::.::::: .::::. :.:.:.::: :: ::::.:: XP_016 -------GFEEGG---AGPRKEHARSDSENWRSLREEQE-EEEEGSWRLGAGPRRDGDRW 80 90 100 110 120 260 270 280 290 300 pF1KSD RPHSPDG-PRSAGWREHMERRRRFEFDFR-DR-----DDERG------YRRVRSGSGSID : :::: ::::::::: ::::.::::.: :: .. :: :: :. : .. XP_016 RSASPDGGPRSAGWREHGERRRKFEFDLRGDRGGCGEEEGRGGGGSSHLRRCRAPEG-FE 130 140 150 160 170 180 310 320 330 340 350 360 pF1KSD DDRDSLPEWCLEDAEEEMGTFDSSGAFLSLKKVQKEPIPEEQEMDFRPVDEGEECSDSEG .:.:.::::::.: .:::::::.::::: ::: :::::::::.::. ..: :: ::: XP_016 EDKDGLPEWCLDDEDEEMGTFDASGAFLPLKKGPKEPIPEEQELDFQGLEEEEE--PSEG 190 200 210 220 230 240 370 380 390 400 410 420 pF1KSD SHNEEAKEPDKTNKKEGEKTDRVGVASEETPQTSSSSARPGTPSDHQSQEASQFERKDEP . :: :..... : :....: XP_016 LE-------------------------EEGPEAGGKELTPLPPQEEKS------------ 250 260 430 440 450 460 470 480 pF1KSD KTEQTEKAEEETRMENSLPAKVPSRGDEMVADVQQPLSQIPSDTASPLLILPPPVPNPSP : :. .:. : :: .: :: . . XP_016 ----------------SSPSPLPTLG---------PLWGTNGDGDETAEKEPPAAED--- 270 280 290 490 500 510 520 530 pF1KSD TLRPVETPVVGAPGMGSVSTEP---DDEEGLKHLEQQAEKMVAYLQDSALDDERLASKLQ .: .. .::.:: . : .:.::::::.:.:::.:: ::::.:..:.... .: XP_016 DIRGIQL----SPGVGSSAGPPGDLEDDEGLKHLQQEAEKLVASLQDSSLEEEQFTAAMQ 300 310 320 330 340 350 540 550 560 570 580 590 pF1KSD ----EHRAKGVSIPLMHEAMQKWYYKDPQGEIQGPFNNQEMAEWFQAGYFTMSLLVKRAC .: : ....:: : : .::.::::::::::::..::::::::::::.:::::::.: XP_016 TQGLRHSAAATALPLSHGAARKWFYKDPQGEIQGPFTTQEMAEWFQAGYFSMSLLVKRGC 360 370 380 390 400 410 600 610 620 630 640 650 pF1KSD DESFQPLGDIMKMWGRVPFSPGPAPPPHMGELDQERLTRQQELTA--LYQ-MQHLQYQQF ::.:::::...::::::::.:::.::: .:..::::: .::::.: ::: .:: :. :. XP_016 DEGFQPLGEVIKMWGRVPFAPGPSPPPLLGNMDQERLKKQQELAAAALYQQLQHQQFLQL 420 430 440 450 460 470 660 670 680 690 700 pF1KSD LIQQQYAQVLAQQQKAALSS----------QQQQQLALLLQQFQTLKM-RISDQNIIPSV . ..: : : ..::::.. ::::::. .:::.:.:: : .:::..:.. XP_016 VSSRQLPQC-ALREKAALGDLTPPPPPPPQQQQQQLTAFLQQLQALKPPRGGDQNLLPTM 480 490 500 510 520 530 710 720 730 740 750 760 pF1KSD TRSVSVPDTGSIWELQPTASQPTVWEGGSVWDLPLDTTTPGPALEQLQQLEKAKAAKLEQ .::.::::.: .:... .::. . :. :.::.:....: :: ::::: .: : XP_016 SRSLSVPDSGRLWDVHTSASSQSGGEA-SLWDIPINSSTQGPILEQLQLQHKF------Q 540 550 560 570 580 770 780 790 800 810 820 pF1KSD ERREAEMRAKREEEERKRQEELRRQQEEILRRQQEEERKRREEEELARRKQEEALRRQRE ::::.:.:::::::::::.:: :::: ::::...:.::::: :::. XP_016 ERREVELRAKREEEERKRREEKRRQQ------QQEEQKRRQEEEELFRRKHV-------- 590 600 610 620 630 830 840 850 860 870 880 pF1KSD QEIALRRQREEEERQQQEEALRRLEERRREEEERRKQEELLRKQEEEAAKWAREEEEAQR XP_016 ------------------------------------------------------------ 890 900 910 920 930 940 pF1KSD RLEENRLRMEEEAARLRHEEEERKRKELEVQRQKELMRQRQQQQEALRRLQQQQQQQQLA ::.::. :. ::::: XP_016 -------------------------------RQQELL---------LKLLQQQQA----- 640 950 960 970 980 990 1000 pF1KSD QMKLPSSSTWGQQSNTTACQSQATLSLAEIQKLEEERERQLREEQRRQQRELMKALQQQQ . .: . . : : XP_016 -VPVPPAPS-----------SPPPL----------------------------------- 650 1010 1020 1030 1040 1050 1060 pF1KSD QQQQQKLSGWGNVSKPSGTTKSLLEIQQEEARQMQKQQQQQQQHQQPNRARNNTHSNLHT :....: . . :.:::.: : ::..:: .. : ::. .: XP_016 ---------WAGLAKQGLSMKTLLELQLEGERQLHKQPPPRE----PARAQAPNHR---- 660 670 680 690 700 1070 1080 1090 1100 1110 pF1KSD SIGNSVWGSINTGPPNQWASDLVSSIWSNADTK---NSNMGFWDDAVKEVGP--RNSTNK :...:.: :::.:. .. .:.. : . .:..:.:.:. : : :. : XP_016 ----VQLGGLGTAPLNQWVSE-AGPLWGGPDKSGGGSSGLGLWEDTPKSGGSLVRGLGLK 710 720 730 740 750 1120 1130 1140 1150 1160 1170 pF1KSD N-KNNASLSKSVG-VSNRQ-NKKVEEEEKLLKLFQGVNKAQDGFTQWCEQMLHALNTANN : ... ::: : . .:.: ::.:::::::::.::. . :::::::::::::.:..... XP_016 NSRSSPSLSDSYSHLSGRPIRKKTEEEEKLLKLLQGIPRPQDGFTQWCEQMLHTLSATGS 760 770 780 790 800 810 1180 1190 1200 1210 1220 1230 pF1KSD LDVPTFVSFLKEVESPYEVHDYIRAYLGDTSEAKEFAKQFLERRAKQKANQQRQQQQLPQ :::: :..::::::::.::::::. :::: ::::::::::::::::::.::::::: XP_016 LDVPMAVAILKEVESPYDVHDYIRSCLGDTLEAKEFAKQFLERRAKQKASQQRQQQQ--- 820 830 840 850 860 870 1240 1250 1260 1270 1280 1290 pF1KSD QQQQQPPQQPPQQPQQQDSVWGMNHSTLHSVFQTNQSNNQQSNFEAVQSGKKKKKQKMVR .: .. ..:...::.:.:.. . ...: :.. :.. XP_016 ------------------EAW-LSSASLQTAFQANHSTKLGPG----EGSKAKRRALMLH 880 890 900 910 1300 1310 1320 pF1KSD ADPSLLGFSVNASSERLNMGEIETLDDY .:::.:: XP_016 SDPSILGELGWGRSGTSLAQGRRSPGESSDAASPRLQGTPCTDLLVRSRAWMTTDQPGPP 920 930 940 950 960 970 >>XP_005250589 (OMIM: 612064) PREDICTED: PERQ amino acid (1035 aa) initn: 2361 init1: 713 opt: 870 Z-score: 344.5 bits: 75.7 E(85289): 1.9e-12 Smith-Waterman score: 2973; 42.8% identity (61.8% similar) in 1363 aa overlap (1-1320:1-1035) 10 20 30 40 50 60 pF1KSD MAAETQTLNFGPEWLRALSSGGSITSPPLSPALPKYKLADYRYGREEMLALFLKDNKIPS ::::: ::::::::::::.:::..::: :::.::::::::::::::::::..:.::.: XP_005 MAAET--LNFGPEWLRALSGGGSVASPPPSPAMPKYKLADYRYGREEMLALYVKENKVPE 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KSD DLLDKEFLPILQEEPLPPLALVPFTEEEQRNFSMSVNSAAVLRLTGRGGGGTVVGAPRGR .: :::: .::.::: :::: :.:::::::::.::::.::::: :.:.: ..:. ::: XP_005 ELQDKEFAAVLQDEPLQPLALEPLTEEEQRNFSLSVNSVAVLRLMGKGAGPPLAGTSRGR 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KSD SSSRGRGRGRGECGFYQRSFDEVEGVFGRGGGREMHRSQSWEERGDRRFEKPGRKDVGKK .:.:.::::::. :::::..: .:.:::. ::..:::::..::.::::: .:.: XP_005 GSTRSRGRGRGDSCFYQRSIEEGDGAFGRSP-REIQRSQSWDDRGERRFEKSARRD---- 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KSD NGYYCMYSPVLLLGQPLCQGRPNFEEGGPTSVGRKHEFIRSESENWRIFREEQNGEDEDG : : .::::: .: ..: ::.::::: .::::. :.:.: XP_005 -GARC-----------------GFEEGG---AGPRKEHARSDSENWRSLREEQE-EEEEG 180 190 200 210 250 260 270 280 pF1KSD GWRL-AGSRRDGERWRPHSPDG-PRSAGWREHMERRRRFEFDFR-DR-----DDERG--- .::: :: ::::.::: :::: ::::::::: ::::.::::.: :: .. :: XP_005 SWRLGAGPRRDGDRWRSASPDGGPRSAGWREHGERRRKFEFDLRGDRGGCGEEEGRGGGG 220 230 240 250 260 270 290 300 310 320 330 340 pF1KSD ---YRRVRSGSGSIDDDRDSLPEWCLEDAEEEMGTFDSSGAFLSLKKVQKEPIPEEQEMD :: :. : ...:.:.::::::.: .:::::::.::::: ::: :::::::::.: XP_005 SSHLRRCRAPEG-FEEDKDGLPEWCLDDEDEEMGTFDASGAFLPLKKGPKEPIPEEQELD 280 290 300 310 320 330 350 360 370 380 390 400 pF1KSD FRPVDEGEECSDSEGSHNEEAKEPDKTNKKEGEKTDRVGVASEETPQTSSSSARPGTPSD :. ..: :: ::: . :: :..... : :.. XP_005 FQGLEEEEE--PSEGLE-------------------------EEGPEAGGKELTPLPPQE 340 350 360 410 420 430 440 450 460 pF1KSD HQSQEASQFERKDEPKTEQTEKAEEETRMENSLPAKVPSRGDEMVADVQQPLSQIPSDTA ..: : :. .:. : :: .: XP_005 EKS----------------------------SSPSPLPTLG---------PLWGTNGDGD 370 380 470 480 490 500 510 520 pF1KSD SPLLILPPPVPNPSPTLRPVETPVVGAPGMGSVSTEP---DDEEGLKHLEQQAEKMVAYL :: . . .: .. .::.:: . : .:.::::::.:.:::.:: : XP_005 ETAEKEPPAAEDD---IRGIQL----SPGVGSSAGPPGDLEDDEGLKHLQQEAEKLVASL 390 400 410 420 430 530 540 550 560 570 pF1KSD QDSALDDERLASKLQ----EHRAKGVSIPLMHEAMQKWYYKDPQGEIQGPFNNQEMAEWF :::.:..:.... .: .: : ....:: : : .::.::::::::::::..::::::: XP_005 QDSSLEEEQFTAAMQTQGLRHSAAATALPLSHGAARKWFYKDPQGEIQGPFTTQEMAEWF 440 450 460 470 480 490 580 590 600 610 620 630 pF1KSD QAGYFTMSLLVKRACDESFQPLGDIMKMWGRVPFSPGPAPPPHMGELDQERLTRQQELTA :::::.:::::::.:::.:::::...::::::::.:::.::: .:..::::: .::::.: XP_005 QAGYFSMSLLVKRGCDEGFQPLGEVIKMWGRVPFAPGPSPPPLLGNMDQERLKKQQELAA 500 510 520 530 540 550 640 650 660 670 680 pF1KSD --LYQ-MQHLQYQQFLIQQQYAQVLAQQQKAALSS----------QQQQQLALLLQQFQT ::: .:: :. :.. ..: : : ..::::.. ::::::. .:::.:. XP_005 AALYQQLQHQQFLQLVSSRQLPQC-ALREKAALGDLTPPPPPPPQQQQQQLTAFLQQLQA 560 570 580 590 600 610 690 700 710 720 730 740 pF1KSD LKM-RISDQNIIPSVTRSVSVPDTGSIWELQPTASQPTVWEGGSVWDLPLDTTTPGPALE :: : .:::..:...::.::::.: .:... .::. . :. :.::.:....: :: :: XP_005 LKPPRGGDQNLLPTMSRSLSVPDSGRLWDVHTSASSQSGGEA-SLWDIPINSSTQGPILE 620 630 640 650 660 670 750 760 770 780 790 800 pF1KSD QLQQLEKAKAAKLEQERREAEMRAKREEEERKRQEELRRQQEEILRRQQEEERKRREEEE ::: .: :::::.:.:::::::::::.:: :::: ::::...:.:::: XP_005 QLQLQHKF------QERREVELRAKREEEERKRREEKRRQQ------QQEEQKRRQEEEE 680 690 700 710 720 810 820 830 840 850 860 pF1KSD LARRKQEEALRRQREQEIALRRQREEEERQQQEEALRRLEERRREEEERRKQEELLRKQE : :::. XP_005 LFRRKHV----------------------------------------------------- 730 870 880 890 900 910 920 pF1KSD EEAAKWAREEEEAQRRLEENRLRMEEEAARLRHEEEERKRKELEVQRQKELMRQRQQQQE ::.::. XP_005 ----------------------------------------------RQQELL-------- 930 940 950 960 970 980 pF1KSD ALRRLQQQQQQQQLAQMKLPSSSTWGQQSNTTACQSQATLSLAEIQKLEEERERQLREEQ :. ::::: . .: . . : : XP_005 -LKLLQQQQA------VPVPPAPS-----------SPPPL-------------------- 740 750 760 990 1000 1010 1020 1030 1040 pF1KSD RRQQRELMKALQQQQQQQQQKLSGWGNVSKPSGTTKSLLEIQQEEARQMQKQQQQQQQHQ :....: . . :.:::.: : ::..:: .. XP_005 ------------------------WAGLAKQGLSMKTLLELQLEGERQLHKQPPPRE--- 770 780 790 1050 1060 1070 1080 1090 1100 pF1KSD QPNRARNNTHSNLHTSIGNSVWGSINTGPPNQWASDLVSSIWSNADTK---NSNMGFWDD : ::. .: .... :...:.: :::.:. .. .:.. : . .:..:.:.: XP_005 -PARAQAPNH---RVQL-----GGLGTAPLNQWVSE-AGPLWGGPDKSGGGSSGLGLWED 800 810 820 830 840 1110 1120 1130 1140 1150 pF1KSD AVKEVGP--RNSTNKN-KNNASLSKSVG-VSNRQ-NKKVEEEEKLLKLFQGVNKAQDGFT . : : :. :: ... ::: : . .:.: ::.:::::::::.::. . ::::: XP_005 TPKSGGSLVRGLGLKNSRSSPSLSDSYSHLSGRPIRKKTEEEEKLLKLLQGIPRPQDGFT 850 860 870 880 890 900 1160 1170 1180 1190 1200 1210 pF1KSD QWCEQMLHALNTANNLDVPTFVSFLKEVESPYEVHDYIRAYLGDTSEAKEFAKQFLERRA ::::::::.:.....:::: :..::::::::.::::::. :::: :::::::::::::: XP_005 QWCEQMLHTLSATGSLDVPMAVAILKEVESPYDVHDYIRSCLGDTLEAKEFAKQFLERRA 910 920 930 940 950 960 1220 1230 1240 1250 1260 1270 pF1KSD KQKANQQRQQQQLPQQQQQQPPQQPPQQPQQQDSVWGMNHSTLHSVFQTNQSNNQQSNFE ::::.::::::: .: .. ..:...::.:.: ... XP_005 KQKASQQRQQQQ---------------------EAW-LSSASLQTAFQANHS----TKLG 970 980 990 1280 1290 1300 1310 1320 pF1KSD AVQSGKKKKKQKMVRADPSLLGFSVNASSERLNMGEIETLDDY ...: :.. :...:::.::.:...:: ::::..::: XP_005 PGEGSKAKRRALMLHSDPSILGYSLHGSS-----GEIESVDDY 1000 1010 1020 1030 >>NP_072096 (OMIM: 612064) PERQ amino acid-rich with GYF (1035 aa) initn: 2361 init1: 713 opt: 870 Z-score: 344.5 bits: 75.7 E(85289): 1.9e-12 Smith-Waterman score: 2973; 42.8% identity (61.8% similar) in 1363 aa overlap (1-1320:1-1035) 10 20 30 40 50 60 pF1KSD MAAETQTLNFGPEWLRALSSGGSITSPPLSPALPKYKLADYRYGREEMLALFLKDNKIPS ::::: ::::::::::::.:::..::: :::.::::::::::::::::::..:.::.: NP_072 MAAET--LNFGPEWLRALSGGGSVASPPPSPAMPKYKLADYRYGREEMLALYVKENKVPE 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KSD DLLDKEFLPILQEEPLPPLALVPFTEEEQRNFSMSVNSAAVLRLTGRGGGGTVVGAPRGR .: :::: .::.::: :::: :.:::::::::.::::.::::: :.:.: ..:. ::: NP_072 ELQDKEFAAVLQDEPLQPLALEPLTEEEQRNFSLSVNSVAVLRLMGKGAGPPLAGTSRGR 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KSD SSSRGRGRGRGECGFYQRSFDEVEGVFGRGGGREMHRSQSWEERGDRRFEKPGRKDVGKK .:.:.::::::. :::::..: .:.:::. ::..:::::..::.::::: .:.: NP_072 GSTRSRGRGRGDSCFYQRSIEEGDGAFGRSP-REIQRSQSWDDRGERRFEKSARRD---- 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KSD NGYYCMYSPVLLLGQPLCQGRPNFEEGGPTSVGRKHEFIRSESENWRIFREEQNGEDEDG : : .::::: .: ..: ::.::::: .::::. :.:.: NP_072 -GARC-----------------GFEEGG---AGPRKEHARSDSENWRSLREEQE-EEEEG 180 190 200 210 250 260 270 280 pF1KSD GWRL-AGSRRDGERWRPHSPDG-PRSAGWREHMERRRRFEFDFR-DR-----DDERG--- .::: :: ::::.::: :::: ::::::::: ::::.::::.: :: .. :: NP_072 SWRLGAGPRRDGDRWRSASPDGGPRSAGWREHGERRRKFEFDLRGDRGGCGEEEGRGGGG 220 230 240 250 260 270 290 300 310 320 330 340 pF1KSD ---YRRVRSGSGSIDDDRDSLPEWCLEDAEEEMGTFDSSGAFLSLKKVQKEPIPEEQEMD :: :. : ...:.:.::::::.: .:::::::.::::: ::: :::::::::.: NP_072 SSHLRRCRAPEG-FEEDKDGLPEWCLDDEDEEMGTFDASGAFLPLKKGPKEPIPEEQELD 280 290 300 310 320 330 350 360 370 380 390 400 pF1KSD FRPVDEGEECSDSEGSHNEEAKEPDKTNKKEGEKTDRVGVASEETPQTSSSSARPGTPSD :. ..: :: ::: . :: :..... : :.. NP_072 FQGLEEEEE--PSEGLE-------------------------EEGPEAGGKELTPLPPQE 340 350 360 410 420 430 440 450 460 pF1KSD HQSQEASQFERKDEPKTEQTEKAEEETRMENSLPAKVPSRGDEMVADVQQPLSQIPSDTA ..: : :. .:. : :: .: NP_072 EKS----------------------------SSPSPLPTLG---------PLWGTNGDGD 370 380 470 480 490 500 510 520 pF1KSD SPLLILPPPVPNPSPTLRPVETPVVGAPGMGSVSTEP---DDEEGLKHLEQQAEKMVAYL :: . . .: .. .::.:: . : .:.::::::.:.:::.:: : NP_072 ETAEKEPPAAEDD---IRGIQL----SPGVGSSAGPPGDLEDDEGLKHLQQEAEKLVASL 390 400 410 420 430 530 540 550 560 570 pF1KSD QDSALDDERLASKLQ----EHRAKGVSIPLMHEAMQKWYYKDPQGEIQGPFNNQEMAEWF :::.:..:.... .: .: : ....:: : : .::.::::::::::::..::::::: NP_072 QDSSLEEEQFTAAMQTQGLRHSAAATALPLSHGAARKWFYKDPQGEIQGPFTTQEMAEWF 440 450 460 470 480 490 580 590 600 610 620 630 pF1KSD QAGYFTMSLLVKRACDESFQPLGDIMKMWGRVPFSPGPAPPPHMGELDQERLTRQQELTA :::::.:::::::.:::.:::::...::::::::.:::.::: .:..::::: .::::.: NP_072 QAGYFSMSLLVKRGCDEGFQPLGEVIKMWGRVPFAPGPSPPPLLGNMDQERLKKQQELAA 500 510 520 530 540 550 640 650 660 670 680 pF1KSD --LYQ-MQHLQYQQFLIQQQYAQVLAQQQKAALSS----------QQQQQLALLLQQFQT ::: .:: :. :.. ..: : : ..::::.. ::::::. .:::.:. NP_072 AALYQQLQHQQFLQLVSSRQLPQC-ALREKAALGDLTPPPPPPPQQQQQQLTAFLQQLQA 560 570 580 590 600 610 690 700 710 720 730 740 pF1KSD LKM-RISDQNIIPSVTRSVSVPDTGSIWELQPTASQPTVWEGGSVWDLPLDTTTPGPALE :: : .:::..:...::.::::.: .:... .::. . :. :.::.:....: :: :: NP_072 LKPPRGGDQNLLPTMSRSLSVPDSGRLWDVHTSASSQSGGEA-SLWDIPINSSTQGPILE 620 630 640 650 660 670 750 760 770 780 790 800 pF1KSD QLQQLEKAKAAKLEQERREAEMRAKREEEERKRQEELRRQQEEILRRQQEEERKRREEEE ::: .: :::::.:.:::::::::::.:: :::: ::::...:.:::: NP_072 QLQLQHKF------QERREVELRAKREEEERKRREEKRRQQ------QQEEQKRRQEEEE 680 690 700 710 720 810 820 830 840 850 860 pF1KSD LARRKQEEALRRQREQEIALRRQREEEERQQQEEALRRLEERRREEEERRKQEELLRKQE : :::. NP_072 LFRRKHV----------------------------------------------------- 730 870 880 890 900 910 920 pF1KSD EEAAKWAREEEEAQRRLEENRLRMEEEAARLRHEEEERKRKELEVQRQKELMRQRQQQQE ::.::. NP_072 ----------------------------------------------RQQELL-------- 930 940 950 960 970 980 pF1KSD ALRRLQQQQQQQQLAQMKLPSSSTWGQQSNTTACQSQATLSLAEIQKLEEERERQLREEQ :. ::::: . .: . . : : NP_072 -LKLLQQQQA------VPVPPAPS-----------SPPPL-------------------- 740 750 760 990 1000 1010 1020 1030 1040 pF1KSD RRQQRELMKALQQQQQQQQQKLSGWGNVSKPSGTTKSLLEIQQEEARQMQKQQQQQQQHQ :....: . . :.:::.: : ::..:: .. NP_072 ------------------------WAGLAKQGLSMKTLLELQLEGERQLHKQPPPRE--- 770 780 790 1050 1060 1070 1080 1090 1100 pF1KSD QPNRARNNTHSNLHTSIGNSVWGSINTGPPNQWASDLVSSIWSNADTK---NSNMGFWDD : ::. .: .... :...:.: :::.:. .. .:.. : . .:..:.:.: NP_072 -PARAQAPNH---RVQL-----GGLGTAPLNQWVSE-AGPLWGGPDKSGGGSSGLGLWED 800 810 820 830 840 1110 1120 1130 1140 1150 pF1KSD AVKEVGP--RNSTNKN-KNNASLSKSVG-VSNRQ-NKKVEEEEKLLKLFQGVNKAQDGFT . : : :. :: ... ::: : . .:.: ::.:::::::::.::. . ::::: NP_072 TPKSGGSLVRGLGLKNSRSSPSLSDSYSHLSGRPIRKKTEEEEKLLKLLQGIPRPQDGFT 850 860 870 880 890 900 1160 1170 1180 1190 1200 1210 pF1KSD QWCEQMLHALNTANNLDVPTFVSFLKEVESPYEVHDYIRAYLGDTSEAKEFAKQFLERRA ::::::::.:.....:::: :..::::::::.::::::. :::: :::::::::::::: NP_072 QWCEQMLHTLSATGSLDVPMAVAILKEVESPYDVHDYIRSCLGDTLEAKEFAKQFLERRA 910 920 930 940 950 960 1220 1230 1240 1250 1260 1270 pF1KSD KQKANQQRQQQQLPQQQQQQPPQQPPQQPQQQDSVWGMNHSTLHSVFQTNQSNNQQSNFE ::::.::::::: .: .. ..:...::.:.: ... NP_072 KQKASQQRQQQQ---------------------EAW-LSSASLQTAFQANHS----TKLG 970 980 990 1280 1290 1300 1310 1320 pF1KSD AVQSGKKKKKQKMVRADPSLLGFSVNASSERLNMGEIETLDDY ...: :.. :...:::.::.:...:: ::::..::: NP_072 PGEGSKAKRRALMLHSDPSILGYSLHGSS-----GEIESVDDY 1000 1010 1020 1030 >>XP_011514779 (OMIM: 612064) PREDICTED: PERQ amino acid (1050 aa) initn: 2659 init1: 713 opt: 870 Z-score: 344.5 bits: 75.7 E(85289): 1.9e-12 Smith-Waterman score: 2920; 42.8% identity (61.3% similar) in 1341 aa overlap (1-1298:1-1017) 10 20 30 40 50 60 pF1KSD MAAETQTLNFGPEWLRALSSGGSITSPPLSPALPKYKLADYRYGREEMLALFLKDNKIPS ::::: ::::::::::::.:::..::: :::.::::::::::::::::::..:.::.: XP_011 MAAET--LNFGPEWLRALSGGGSVASPPPSPAMPKYKLADYRYGREEMLALYVKENKVPE 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KSD DLLDKEFLPILQEEPLPPLALVPFTEEEQRNFSMSVNSAAVLRLTGRGGGGTVVGAPRGR .: :::: .::.::: :::: :.:::::::::.::::.::::: :.:.: ..:. ::: XP_011 ELQDKEFAAVLQDEPLQPLALEPLTEEEQRNFSLSVNSVAVLRLMGKGAGPPLAGTSRGR 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KSD SSSRGRGRGRGECGFYQRSFDEVEGVFGRGGGREMHRSQSWEERGDRRFEKPGRKDVGKK .:.:.::::::. :::::..: .:.:::. ::..:::::..::.::::: .:.: XP_011 GSTRSRGRGRGDSCFYQRSIEEGDGAFGRSP-REIQRSQSWDDRGERRFEKSARRD---- 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KSD NGYYCMYSPVLLLGQPLCQGRPNFEEGGPTSVGRKHEFIRSESENWRIFREEQNGEDEDG : : .::::: .: ..: ::.::::: .::::. :.:.: XP_011 -GARC-----------------GFEEGG---AGPRKEHARSDSENWRSLREEQE-EEEEG 180 190 200 210 250 260 270 280 pF1KSD GWRL-AGSRRDGERWRPHSPDG-PRSAGWREHMERRRRFEFDFR-DR-----DDERG--- .::: :: ::::.::: :::: ::::::::: ::::.::::.: :: .. :: XP_011 SWRLGAGPRRDGDRWRSASPDGGPRSAGWREHGERRRKFEFDLRGDRGGCGEEEGRGGGG 220 230 240 250 260 270 290 300 310 320 330 340 pF1KSD ---YRRVRSGSGSIDDDRDSLPEWCLEDAEEEMGTFDSSGAFLSLKKVQKEPIPEEQEMD :: :. : ...:.:.::::::.: .:::::::.::::: ::: :::::::::.: XP_011 SSHLRRCRAPEG-FEEDKDGLPEWCLDDEDEEMGTFDASGAFLPLKKGPKEPIPEEQELD 280 290 300 310 320 330 350 360 370 380 390 400 pF1KSD FRPVDEGEECSDSEGSHNEEAKEPDKTNKKEGEKTDRVGVASEETPQTSSSSARPGTPSD :. ..: :: ::: . :: :..... : :.. 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XP_011 AALYQQLQHQQFLQLVSSRQLPQC-ALREKAALGDLTPPPPPPPQQQQQQLTAFLQQLQA 560 570 580 590 600 610 690 700 710 720 730 740 pF1KSD LKM-RISDQNIIPSVTRSVSVPDTGSIWELQPTASQPTVWEGGSVWDLPLDTTTPGPALE :: : .:::..:...::.::::.: .:... .::. . :. :.::.:....: :: :: XP_011 LKPPRGGDQNLLPTMSRSLSVPDSGRLWDVHTSASSQSGGEA-SLWDIPINSSTQGPILE 620 630 640 650 660 670 750 760 770 780 790 800 pF1KSD QLQQLEKAKAAKLEQERREAEMRAKREEEERKRQEELRRQQEEILRRQQEEERKRREEEE ::: .: :::::.:.:::::::::::.:: :::: ::::...:.:::: XP_011 QLQLQHKF------QERREVELRAKREEEERKRREEKRRQQ------QQEEQKRRQEEEE 680 690 700 710 720 810 820 830 840 850 860 pF1KSD LARRKQEEALRRQREQEIALRRQREEEERQQQEEALRRLEERRREEEERRKQEELLRKQE : :::. XP_011 LFRRKHV----------------------------------------------------- 730 870 880 890 900 910 920 pF1KSD EEAAKWAREEEEAQRRLEENRLRMEEEAARLRHEEEERKRKELEVQRQKELMRQRQQQQE ::.::. 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XP_011 ------------------------WAGLAKQGLSMKTLLELQLEGERQLHKQPPP----R 770 780 790 1050 1060 1070 1080 1090 1100 pF1KSD QPNRARNNTHSNLHTSIGNSVWGSINTGPPNQWASDLVSSIWSNADTK---NSNMGFWDD .: ::. .: : :...:.: :::.:. .. .:.. : . .:..:.:.: XP_011 EPARAQAPNHR---------VLGGLGTAPLNQWVSE-AGPLWGGPDKSGGGSSGLGLWED 800 810 820 830 840 1110 1120 1130 1140 1150 pF1KSD AVKEVGP--RNSTNKN-KNNASLSKSVG-VSNRQ-NKKVEEEEKLLKLFQGVNKAQDGFT . : : :. :: ... ::: : . .:.: ::.:::::::::.::. . ::::: XP_011 TPKSGGSLVRGLGLKNSRSSPSLSDSYSHLSGRPIRKKTEEEEKLLKLLQGIPRPQDGFT 850 860 870 880 890 900 1160 1170 1180 1190 1200 1210 pF1KSD QWCEQMLHALNTANNLDVPTFVSFLKEVESPYEVHDYIRAYLGDTSEAKEFAKQFLERRA ::::::::.:.....:::: :..::::::::.::::::. :::: :::::::::::::: XP_011 QWCEQMLHTLSATGSLDVPMAVAILKEVESPYDVHDYIRSCLGDTLEAKEFAKQFLERRA 910 920 930 940 950 960 1220 1230 1240 1250 1260 1270 pF1KSD KQKANQQRQQQQLPQQQQQQPPQQPPQQPQQQDSVWGMNHSTLHSVFQTNQSNNQQSNFE ::::.::::::: .: .. ..:...::.:.: ... XP_011 KQKASQQRQQQQ---------------------EAW-LSSASLQTAFQANHS----TKLG 970 980 990 1280 1290 1300 1310 1320 pF1KSD AVQSGKKKKKQKMVRADPSLLGFSVNASSERLNMGEIETLDDY ...: :.. :...:::.: XP_011 PGEGSKAKRRALMLHSDPSILASPRLQGTPCTDLLVRSRAWMTTDQPGPPAPGL 1000 1010 1020 1030 1040 1050 >>XP_011514774 (OMIM: 612064) PREDICTED: PERQ amino acid (1051 aa) initn: 2361 init1: 713 opt: 870 Z-score: 344.4 bits: 75.7 E(85289): 1.9e-12 Smith-Waterman score: 2912; 42.7% identity (61.2% similar) in 1341 aa overlap (1-1298:1-1018) 10 20 30 40 50 60 pF1KSD MAAETQTLNFGPEWLRALSSGGSITSPPLSPALPKYKLADYRYGREEMLALFLKDNKIPS ::::: ::::::::::::.:::..::: :::.::::::::::::::::::..:.::.: XP_011 MAAET--LNFGPEWLRALSGGGSVASPPPSPAMPKYKLADYRYGREEMLALYVKENKVPE 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KSD DLLDKEFLPILQEEPLPPLALVPFTEEEQRNFSMSVNSAAVLRLTGRGGGGTVVGAPRGR .: :::: .::.::: :::: :.:::::::::.::::.::::: :.:.: ..:. ::: XP_011 ELQDKEFAAVLQDEPLQPLALEPLTEEEQRNFSLSVNSVAVLRLMGKGAGPPLAGTSRGR 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KSD SSSRGRGRGRGECGFYQRSFDEVEGVFGRGGGREMHRSQSWEERGDRRFEKPGRKDVGKK .:.:.::::::. :::::..: .:.:::. ::..:::::..::.::::: .:.: XP_011 GSTRSRGRGRGDSCFYQRSIEEGDGAFGRSP-REIQRSQSWDDRGERRFEKSARRD---- 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KSD NGYYCMYSPVLLLGQPLCQGRPNFEEGGPTSVGRKHEFIRSESENWRIFREEQNGEDEDG : : .::::: .: ..: ::.::::: .::::. :.:.: XP_011 -GARC-----------------GFEEGG---AGPRKEHARSDSENWRSLREEQE-EEEEG 180 190 200 210 250 260 270 280 pF1KSD GWRL-AGSRRDGERWRPHSPDG-PRSAGWREHMERRRRFEFDFR-DR-----DDERG--- .::: :: ::::.::: :::: ::::::::: ::::.::::.: :: .. :: XP_011 SWRLGAGPRRDGDRWRSASPDGGPRSAGWREHGERRRKFEFDLRGDRGGCGEEEGRGGGG 220 230 240 250 260 270 290 300 310 320 330 340 pF1KSD ---YRRVRSGSGSIDDDRDSLPEWCLEDAEEEMGTFDSSGAFLSLKKVQKEPIPEEQEMD :: :. : ...:.:.::::::.: .:::::::.::::: ::: :::::::::.: XP_011 SSHLRRCRAPEG-FEEDKDGLPEWCLDDEDEEMGTFDASGAFLPLKKGPKEPIPEEQELD 280 290 300 310 320 330 350 360 370 380 390 400 pF1KSD FRPVDEGEECSDSEGSHNEEAKEPDKTNKKEGEKTDRVGVASEETPQTSSSSARPGTPSD :. ..: :: ::: . :: :..... : :.. XP_011 FQGLEEEEE--PSEGLE-------------------------EEGPEAGGKELTPLPPQE 340 350 360 410 420 430 440 450 460 pF1KSD HQSQEASQFERKDEPKTEQTEKAEEETRMENSLPAKVPSRGDEMVADVQQPLSQIPSDTA ..: : :. .:. : :: .: XP_011 EKS----------------------------SSPSPLPTLG---------PLWGTNGDGD 370 380 470 480 490 500 510 520 pF1KSD SPLLILPPPVPNPSPTLRPVETPVVGAPGMGSVSTEP---DDEEGLKHLEQQAEKMVAYL :: . . .: .. .::.:: . : .:.::::::.:.:::.:: : XP_011 ETAEKEPPAAEDD---IRGIQL----SPGVGSSAGPPGDLEDDEGLKHLQQEAEKLVASL 390 400 410 420 430 530 540 550 560 570 pF1KSD QDSALDDERLASKLQ----EHRAKGVSIPLMHEAMQKWYYKDPQGEIQGPFNNQEMAEWF :::.:..:.... .: .: : ....:: : : .::.::::::::::::..::::::: XP_011 QDSSLEEEQFTAAMQTQGLRHSAAATALPLSHGAARKWFYKDPQGEIQGPFTTQEMAEWF 440 450 460 470 480 490 580 590 600 610 620 630 pF1KSD QAGYFTMSLLVKRACDESFQPLGDIMKMWGRVPFSPGPAPPPHMGELDQERLTRQQELTA :::::.:::::::.:::.:::::...::::::::.:::.::: .:..::::: .::::.: XP_011 QAGYFSMSLLVKRGCDEGFQPLGEVIKMWGRVPFAPGPSPPPLLGNMDQERLKKQQELAA 500 510 520 530 540 550 640 650 660 670 680 pF1KSD --LYQ-MQHLQYQQFLIQQQYAQVLAQQQKAALSS----------QQQQQLALLLQQFQT ::: .:: :. :.. ..: : : ..::::.. ::::::. .:::.:. XP_011 AALYQQLQHQQFLQLVSSRQLPQC-ALREKAALGDLTPPPPPPPQQQQQQLTAFLQQLQA 560 570 580 590 600 610 690 700 710 720 730 740 pF1KSD LKM-RISDQNIIPSVTRSVSVPDTGSIWELQPTASQPTVWEGGSVWDLPLDTTTPGPALE :: : .:::..:...::.::::.: .:... .::. . :. :.::.:....: :: :: XP_011 LKPPRGGDQNLLPTMSRSLSVPDSGRLWDVHTSASSQSGGEA-SLWDIPINSSTQGPILE 620 630 640 650 660 670 750 760 770 780 790 800 pF1KSD QLQQLEKAKAAKLEQERREAEMRAKREEEERKRQEELRRQQEEILRRQQEEERKRREEEE ::: .: :::::.:.:::::::::::.:: :::: ::::...:.:::: XP_011 QLQLQHKF------QERREVELRAKREEEERKRREEKRRQQ------QQEEQKRRQEEEE 680 690 700 710 720 810 820 830 840 850 860 pF1KSD LARRKQEEALRRQREQEIALRRQREEEERQQQEEALRRLEERRREEEERRKQEELLRKQE : :::. XP_011 LFRRKHV----------------------------------------------------- 730 870 880 890 900 910 920 pF1KSD EEAAKWAREEEEAQRRLEENRLRMEEEAARLRHEEEERKRKELEVQRQKELMRQRQQQQE ::.::. XP_011 ----------------------------------------------RQQELL-------- 930 940 950 960 970 980 pF1KSD ALRRLQQQQQQQQLAQMKLPSSSTWGQQSNTTACQSQATLSLAEIQKLEEERERQLREEQ :. ::::: . .: . . : : XP_011 -LKLLQQQQA------VPVPPAPS-----------SPPPL-------------------- 740 750 760 990 1000 1010 1020 1030 1040 pF1KSD RRQQRELMKALQQQQQQQQQKLSGWGNVSKPSGTTKSLLEIQQEEARQMQKQQQQQQQHQ :....: . . :.:::.: : ::..:: . 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