Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA0636
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0636, 537 aa
1>>>pF1KSDA0636 537 - 537 aa - 537 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1415+/-0.000941; mu= 13.1792+/- 0.056
mean_var=69.5592+/-14.051, 0's: 0 Z-trim(103.8): 65 B-trim: 84 in 2/49
Lambda= 0.153779
statistics sampled from 7531 (7596) to 7531 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.599), E-opt: 0.2 (0.233), width: 16
Scan time: 3.010
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS6243.1 CPNE3 gene_id:8895|Hs108|chr8 ( 537) 3621 812.9 0
CCDS13260.1 CPNE1 gene_id:8904|Hs108|chr20 ( 537) 2510 566.4 2.9e-161
CCDS46595.1 CPNE1 gene_id:8904|Hs108|chr20 ( 542) 2510 566.4 2.9e-161
CCDS10774.1 CPNE2 gene_id:221184|Hs108|chr16 ( 548) 2446 552.2 5.5e-157
CCDS3072.1 CPNE4 gene_id:131034|Hs108|chr3 ( 557) 2035 461.1 1.6e-129
CCDS75010.1 CPNE4 gene_id:131034|Hs108|chr3 ( 575) 2035 461.1 1.6e-129
CCDS10981.1 CPNE7 gene_id:27132|Hs108|chr16 ( 558) 2027 459.3 5.4e-129
CCDS9607.1 CPNE6 gene_id:9362|Hs108|chr14 ( 557) 1935 438.9 7.5e-123
CCDS61413.1 CPNE6 gene_id:9362|Hs108|chr14 ( 612) 1935 438.9 8.2e-123
CCDS8733.1 CPNE8 gene_id:144402|Hs108|chr12 ( 564) 1848 419.6 4.9e-117
CCDS2574.2 CPNE9 gene_id:151835|Hs108|chr3 ( 553) 1735 394.5 1.7e-109
CCDS10980.1 CPNE7 gene_id:27132|Hs108|chr16 ( 633) 1696 385.9 7.7e-107
CCDS77695.1 CPNE9 gene_id:151835|Hs108|chr3 ( 503) 1634 372.1 8.6e-103
CCDS4825.1 CPNE5 gene_id:57699|Hs108|chr6 ( 593) 1453 331.9 1.2e-90
CCDS83078.1 CPNE5 gene_id:57699|Hs108|chr6 ( 301) 995 230.3 2.5e-60
>>CCDS6243.1 CPNE3 gene_id:8895|Hs108|chr8 (537 aa)
initn: 3621 init1: 3621 opt: 3621 Z-score: 4340.9 bits: 812.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3621; 100.0% identity (100.0% similar) in 537 aa overlap (1-537:1-537)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MAAQCVTKVALNVSCANLLDKDIGSKSDPLCVLFLNTSGQQWYEVERTERIKNCLNPQFS
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CCDS62 MAAQCVTKVALNVSCANLLDKDIGSKSDPLCVLFLNTSGQQWYEVERTERIKNCLNPQFS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD KTFIIDYYFEVVQKLKFGVYDIDNKTIELSDDDFLGECECTLGQIVSSKKLTRPLVMKTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 KTFIIDYYFEVVQKLKFGVYDIDNKTIELSDDDFLGECECTLGQIVSSKKLTRPLVMKTG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD RPAGKGSITISAEEIKDNRVVLFEMEARKLDNKDLFGKSDPYLEFHKQTSDGNWLMVHRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 RPAGKGSITISAEEIKDNRVVLFEMEARKLDNKDLFGKSDPYLEFHKQTSDGNWLMVHRT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD EVVKNNLNPVWRPFKISLNSLCYGDMDKTIKVECYDYDNDGSHDLIGTFQTTMTKLKEAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 EVVKNNLNPVWRPFKISLNSLCYGDMDKTIKVECYDYDNDGSHDLIGTFQTTMTKLKEAS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD RSSPVEFECINEKKRQKKKSYKNSGVISVKQCEITVECTFLDYIMGGCQLNFTVGVDFTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 RSSPVEFECINEKKRQKKKSYKNSGVISVKQCEITVECTFLDYIMGGCQLNFTVGVDFTG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD SNGDPRSPDSLHYISPNGVNEYLTALWSVGLVIQDYDADKMFPAFGFGAQIPPQWQVSHE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 SNGDPRSPDSLHYISPNGVNEYLTALWSVGLVIQDYDADKMFPAFGFGAQIPPQWQVSHE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD FPMNFNPSNPYCNGIQGIVEAYRSCLPQIKLYGPTNFSPIINHVARFAAAATQQQTASQY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 FPMNFNPSNPYCNGIQGIVEAYRSCLPQIKLYGPTNFSPIINHVARFAAAATQQQTASQY
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD FVLLIITDGVITDLDETRQAIVNASRLPMSIIIVGVGGADFSAMEFLDGDGGSLRSPLGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 FVLLIITDGVITDLDETRQAIVNASRLPMSIIIVGVGGADFSAMEFLDGDGGSLRSPLGE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530
pF1KSD VAIRDIVQFVPFRQFQNAPKEALAQCVLAEIPQQVVGYFNTYKLLPPKNPATKQQKQ
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CCDS62 VAIRDIVQFVPFRQFQNAPKEALAQCVLAEIPQQVVGYFNTYKLLPPKNPATKQQKQ
490 500 510 520 530
>>CCDS13260.1 CPNE1 gene_id:8904|Hs108|chr20 (537 aa)
initn: 2495 init1: 1470 opt: 2510 Z-score: 3008.8 bits: 566.4 E(32554): 2.9e-161
Smith-Waterman score: 2510; 65.9% identity (86.9% similar) in 540 aa overlap (3-535:2-536)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MAAQCVTKVALNVSCANLLDKDIGSKSDPLCVLFLNTSGQQWYEVERTERIKNCLNPQFS
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CCDS13 MAHCVTLVQLSISCDHLIDKDIGSKSDPLCVLLQDVGGGSWAELGRTERVRNCSSPEFS
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KSD KTFIIDYYFEVVQKLKFGVYDIDNKTIELSDDDFLGECECTLGQIVSSKKLTRPLVMKTG
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CCDS13 KTLQLEYRFETVQKLRFGIYDIDNKTPELRDDDFLGGAECSLGQIVSSQVLTLPLMLKPG
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KSD RPAGKGSITISAEEIKDNRVVLFEMEARKLDNKDLFGKSDPYLEFHKQTSDGNWLMVHRT
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CCDS13 KPAGRGTITVSAQELKDNRVVTMEVEARNLDKKDFLGKSDPFLEFFRQ-GDGKWHLVYRS
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KSD EVVKNNLNPVWRPFKISLNSLCYGDMDKTIKVECYDYDNDGSHDLIGTFQTTMTKLKEAS
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CCDS13 EVIKNNLNPTWKRFSVPVQHFCGGNPSTPIQVQCSDYDSDGSHDLIGTFHTSLAQLQ---
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KSD RSSPVEFECINEKKRQKKKSYKNSGVISVKQCEITVECTFLDYIMGGCQLNFTVGVDFTG
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CCDS13 -AVPAEFECIHPEKQQKKKSYKNSGTIRVKICRVETEYSFLDYVMGGCQINFTVGVDFTG
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KSD SNGDPRSPDSLHYISPNGVNEYLTALWSVGLVIQDYDADKMFPAFGFGAQIPPQWQVSHE
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CCDS13 SNGDPSSPDSLHYLSPTGVNEYLMALWSVGSVVQDYDSDKLFPAFGFGAQVPPDWQVSHE
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KSD FPMNFNPSNPYCNGIQGIVEAYRSCLPQIKLYGPTNFSPIINHVARFAAAATQQQTASQY
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CCDS13 FALNFNPSNPYCAGIQGIVDAYRQALPQVRLYGPTNFAPIINHVARFAAQAAHQGTASQY
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KSD FVLLIITDGVITDLDETRQAIVNASRLPMSIIIVGVGGADFSAMEFLDGDGGSLRSPLGE
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CCDS13 FMLLLLTDGAVTDVEATREAVVRASNLPMSVIIVGVGGADFEAMEQLDADGGPLHTRSGQ
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530
pF1KSD VAIRDIVQFVPFRQFQNAPKEALAQCVLAEIPQQVVGYFNTY-----KLLPP--KNPATK
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CCDS13 AAARDIVQFVPYRRFQNAPREALAQTVLAEVPTQLVSYFRAQGWAPLKPLPPSAKDPAQA
480 490 500 510 520 530
pF1KSD QQKQ
:
CCDS13 PQA
>>CCDS46595.1 CPNE1 gene_id:8904|Hs108|chr20 (542 aa)
initn: 2495 init1: 1470 opt: 2510 Z-score: 3008.7 bits: 566.4 E(32554): 2.9e-161
Smith-Waterman score: 2510; 65.9% identity (86.9% similar) in 540 aa overlap (3-535:7-541)
10 20 30 40 50
pF1KSD MAAQCVTKVALNVSCANLLDKDIGSKSDPLCVLFLNTSGQQWYEVERTERIKNCLN
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CCDS46 MKMMHMAHCVTLVQLSISCDHLIDKDIGSKSDPLCVLLQDVGGGSWAELGRTERVRNCSS
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KSD PQFSKTFIIDYYFEVVQKLKFGVYDIDNKTIELSDDDFLGECECTLGQIVSSKKLTRPLV
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CCDS46 PEFSKTLQLEYRFETVQKLRFGIYDIDNKTPELRDDDFLGGAECSLGQIVSSQVLTLPLM
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KSD MKTGRPAGKGSITISAEEIKDNRVVLFEMEARKLDNKDLFGKSDPYLEFHKQTSDGNWLM
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CCDS46 LKPGKPAGRGTITVSAQELKDNRVVTMEVEARNLDKKDFLGKSDPFLEFFRQ-GDGKWHL
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KSD VHRTEVVKNNLNPVWRPFKISLNSLCYGDMDKTIKVECYDYDNDGSHDLIGTFQTTMTKL
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CCDS46 VYRSEVIKNNLNPTWKRFSVPVQHFCGGNPSTPIQVQCSDYDSDGSHDLIGTFHTSLAQL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KSD KEASRSSPVEFECINEKKRQKKKSYKNSGVISVKQCEITVECTFLDYIMGGCQLNFTVGV
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CCDS46 Q----AVPAEFECIHPEKQQKKKSYKNSGTIRVKICRVETEYSFLDYVMGGCQINFTVGV
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KSD DFTGSNGDPRSPDSLHYISPNGVNEYLTALWSVGLVIQDYDADKMFPAFGFGAQIPPQWQ
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CCDS46 DFTGSNGDPSSPDSLHYLSPTGVNEYLMALWSVGSVVQDYDSDKLFPAFGFGAQVPPDWQ
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KSD VSHEFPMNFNPSNPYCNGIQGIVEAYRSCLPQIKLYGPTNFSPIINHVARFAAAATQQQT
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CCDS46 VSHEFALNFNPSNPYCAGIQGIVDAYRQALPQVRLYGPTNFAPIINHVARFAAQAAHQGT
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KSD ASQYFVLLIITDGVITDLDETRQAIVNASRLPMSIIIVGVGGADFSAMEFLDGDGGSLRS
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CCDS46 ASQYFMLLLLTDGAVTDVEATREAVVRASNLPMSVIIVGVGGADFEAMEQLDADGGPLHT
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520
pF1KSD PLGEVAIRDIVQFVPFRQFQNAPKEALAQCVLAEIPQQVVGYFNTY-----KLLPP--KN
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CCDS46 RSGQAAARDIVQFVPYRRFQNAPREALAQTVLAEVPTQLVSYFRAQGWAPLKPLPPSAKD
480 490 500 510 520 530
530
pF1KSD PATKQQKQ
:: :
CCDS46 PAQAPQA
540
>>CCDS10774.1 CPNE2 gene_id:221184|Hs108|chr16 (548 aa)
initn: 2513 init1: 2267 opt: 2446 Z-score: 2931.9 bits: 552.2 E(32554): 5.5e-157
Smith-Waterman score: 2446; 64.4% identity (87.3% similar) in 534 aa overlap (1-531:17-548)
10 20 30 40
pF1KSD MAAQ-CVTKVALNVSCANLLDKDIGSKSDPLCVLFLNTSGQQWY
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CCDS10 MAHIPSGGAPAAGAAPMGPQYCVCKVELSVSGQNLLDRDVTSKSDPFCVLFTENNGR-WI
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KSD EVERTERIKNCLNPQFSKTFIIDYYFEVVQKLKFGVYDIDNKTIELSDDDFLGECECTLG
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CCDS10 EYDRTETAINNLNPAFSKKFVLDYHFEEVQKLKFALFDQDKSSMRLDEHDFLGQFSCSLG
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KSD QIVSSKKLTRPLVMKTGRPAGKGSITISAEEIKDNRVVLFEMEARKLDNKDLFGKSDPYL
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CCDS10 TIVSSKKITRPLLLLNDKPAGKGLITIAAQELSDNRVITLSLAGRRLDKKDLFGKSDPFL
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KSD EFHKQTSDGNWLMVHRTEVVKNNLNPVWRPFKISLNSLCYGDMDKTIKVECYDYDNDGSH
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CCDS10 EFYKPGDDGKWMLVHRTEVIKYTLDPVWKPFTVPLVSLCDGDMEKPIQVMCYDYDNDGGH
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KSD DLIGTFQTTMTKLKEASRSSPVEFECINEKKRQKKKSYKNSGVISVKQCEITVECTFLDY
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CCDS10 DFIGEFQTSVSQMCEARDSVPLEFECINPKKQRKKKNYKNSGIIILRSCKINRDYSFLDY
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KSD IMGGCQLNFTVGVDFTGSNGDPRSPDSLHYISPNGVNEYLTALWSVGLVIQDYDADKMFP
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CCDS10 ILGGCQLMFTVGIDFTASNGNPLDPSSLHYINPMGTNEYLSAIWAVGQIIQDYDSDKMFP
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KSD AFGFGAQIPPQWQVSHEFPMNFNPSNPYCNGIQGIVEAYRSCLPQIKLYGPTNFSPIINH
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CCDS10 ALGFGAQLPPDWKVSHEFAINFNPTNPFCSGVDGIAQAYSACLPHIRFYGPTNFSPIVNH
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KSD VARFAAAATQQQTASQYFVLLIITDGVITDLDETRQAIVNASRLPMSIIIVGVGGADFSA
:::::: ::::.::.:::.:::::::::.:..:::.:.:.::.:::::::::::.:::.:
CCDS10 VARFAAQATQQRTATQYFILLIITDGVISDMEETRHAVVQASKLPMSIIIVGVGNADFAA
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KSD MEFLDGDGGSLRSPLGEVAIRDIVQFVPFRQFQNAPKEALAQCVLAEIPQQVVGYFNTYK
:::::::. ::: :: : ::::::::::.:.:: ::.::. ::::.::::: ::. .:
CCDS10 MEFLDGDSRMLRSHTGEEAARDIVQFVPFREFRNAAKETLAKAVLAELPQQVVQYFK-HK
480 490 500 510 520 530
530
pF1KSD LLPPKN--PATKQQKQ
::: : ::
CCDS10 NLPPTNSEPA
540
>>CCDS3072.1 CPNE4 gene_id:131034|Hs108|chr3 (557 aa)
initn: 2070 init1: 1897 opt: 2035 Z-score: 2439.0 bits: 461.1 E(32554): 1.6e-129
Smith-Waterman score: 2035; 57.1% identity (81.3% similar) in 525 aa overlap (5-528:22-543)
10 20 30 40
pF1KSD MAAQCVTKVALNVSCANLLDKDIGSKSDPLCVLFLNTSGQQWY
:.::: : :.: .. :.: :: :: ::.. : ::.
CCDS30 MKKMSNIYESAANTLGIFNSPCLTKVELRVACKGISDRDALSKPDP-CVILKMQSHGQWF
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KSD EVERTERIKNCLNPQFSKTFIIDYYFEVVQKLKFGVYDIDNKTIELSDDDFLGECECTLG
::.::: :..:.:: .:: : .:.::: ::.:.: :.::... :.. :::: :::::
CCDS30 EVDRTEVIRTCINPVYSKLFTVDFYFEEVQRLRFEVHDISSNHNGLKEADFLGGMECTLG
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KSD QIVSSKKLTRPLVMKTGRPAGKGSITISAEEIKDNR-VVLFEMEARKLDNKDLFGKSDPY
::::..::.. : .: : :::.:::. :::.. : : . ..:::::.::.:.::::.
CCDS30 QIVSQRKLSKSL-LKHGNTAGKSSITVIAEELSGNDDYVELAFNARKLDDKDFFSKSDPF
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KSD LEFHKQTSDGNWLMVHRTEVVKNNLNPVWRPFKISLNSLCYGDMDKTIKVECYDYDNDGS
::. ....:.. .::::::: :::.:.:. ::.:.:::: :: :. .: .:.:..:.
CCDS30 LEIFRMNDDATQQLVHRTEVVMNNLSPAWKSFKVSVNSLCSGDPDRRLKCIVWDWDSNGK
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KSD HDLIGTFQTTMTKLKEASRSSPVEFECINEKKRQKKKSYKNSGVISVKQCEITVECTFLD
::.:: : .:. ... : ... :..:::: : . :::.:::::.. .. :.: .:::
CCDS30 HDFIGEFTSTFKEMRGAMEGKQVQWECINPKYKAKKKNYKNSGTVILNLCKIHKMHSFLD
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KSD YIMGGCQLNFTVGVDFTGSNGDPRSPDSLHYISPNGVNEYLTALWSVGLVIQDYDADKMF
:::::::..:::..:::.::::::. ::::: : :::: :: .:: . ::::.::::
CCDS30 YIMGGCQIQFTVAIDFTASNGDPRNSCSLHYIHPYQPNEYLKALVAVGEICQDYDSDKMF
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KSD PAFGFGAQIPPQWQVSHEFPMNFNPSNPYCNGIQGIVEAYRSCLPQIKLYGPTNFSPIIN
:::::::.:::.. :::.: .::: .:: : ::::.::::.::::...::::::..:::.
CCDS30 PAFGFGARIPPEYTVSHDFAINFNEDNPECAGIQGVVEAYQSCLPKLQLYGPTNIAPIIQ
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KSD HVARFAAAATQQQTASQYFVLLIITDGVITDLDETRQAIVNASRLPMSIIIVGVGGADFS
.::. :. :. . :::::.:::.:::::::. .::.:::.::.::::.::::::.::::
CCDS30 KVAKSASEETNTKEASQYFILLILTDGVITDMADTREAIVHASHLPMSVIIVGVGNADFS
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KSD AMEFLDGDGGSLRSPLGEVAIRDIVQFVPFRQFQNAPKEALAQCVLAEIPQQVVGYFNTY
:..:::: : :::: :: ..::::::::::.:..: :::. ::::.:.::: :.:
CCDS30 DMQMLDGDDGILRSPKGEPVLRDIVQFVPFRNFKHASPAALAKSVLAEVPNQVVDYYNG-
480 490 500 510 520 530
530
pF1KSD KLLPPKNPATKQQKQ
: . ::
CCDS30 KGIKPKCSSEMYESSRTLAP
540 550
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10 20 30
pF1KSD MAAQCVTKVALNVSCANLLDKDIGSKSDPLCVLF
:.::: : :.: .. :.: :: :: ::..
CCDS75 SIKRRAGRRMKKMSNIYESAANTLGIFNSPCLTKVELRVACKGISDRDALSKPDP-CVIL
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KSD LNTSGQQWYEVERTERIKNCLNPQFSKTFIIDYYFEVVQKLKFGVYDIDNKTIELSDDDF
: ::.::.::: :..:.:: .:: : .:.::: ::.:.: :.::... :.. ::
CCDS75 KMQSHGQWFEVDRTEVIRTCINPVYSKLFTVDFYFEEVQRLRFEVHDISSNHNGLKEADF
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KSD LGECECTLGQIVSSKKLTRPLVMKTGRPAGKGSITISAEEIKDNR-VVLFEMEARKLDNK
:: :::::::::..::.. : .: : :::.:::. :::.. : : . ..:::::.:
CCDS75 LGGMECTLGQIVSQRKLSKSL-LKHGNTAGKSSITVIAEELSGNDDYVELAFNARKLDDK
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KSD DLFGKSDPYLEFHKQTSDGNWLMVHRTEVVKNNLNPVWRPFKISLNSLCYGDMDKTIKVE
:.:.::::.::. ....:.. .::::::: :::.:.:. ::.:.:::: :: :. .:
CCDS75 DFFSKSDPFLEIFRMNDDATQQLVHRTEVVMNNLSPAWKSFKVSVNSLCSGDPDRRLKCI
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KSD CYDYDNDGSHDLIGTFQTTMTKLKEASRSSPVEFECINEKKRQKKKSYKNSGVISVKQCE
.:.:..:.::.:: : .:. ... : ... :..:::: : . :::.:::::.. .. :.
CCDS75 VWDWDSNGKHDFIGEFTSTFKEMRGAMEGKQVQWECINPKYKAKKKNYKNSGTVILNLCK
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KSD ITVECTFLDYIMGGCQLNFTVGVDFTGSNGDPRSPDSLHYISPNGVNEYLTALWSVGLVI
: .::::::::::..:::..:::.::::::. ::::: : :::: :: .:: .
CCDS75 IHKMHSFLDYIMGGCQIQFTVAIDFTASNGDPRNSCSLHYIHPYQPNEYLKALVAVGEIC
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KSD QDYDADKMFPAFGFGAQIPPQWQVSHEFPMNFNPSNPYCNGIQGIVEAYRSCLPQIKLYG
::::.:::::::::::.:::.. :::.: .::: .:: : ::::.::::.::::...:::
CCDS75 QDYDSDKMFPAFGFGARIPPEYTVSHDFAINFNEDNPECAGIQGVVEAYQSCLPKLQLYG
370 380 390 400 410 420
400 410 420 430 440 450
pF1KSD PTNFSPIINHVARFAAAATQQQTASQYFVLLIITDGVITDLDETRQAIVNASRLPMSIII
:::..:::..::. :. :. . :::::.:::.:::::::. .::.:::.::.::::.::
CCDS75 PTNIAPIIQKVAKSASEETNTKEASQYFILLILTDGVITDMADTREAIVHASHLPMSVII
430 440 450 460 470 480
460 470 480 490 500 510
pF1KSD VGVGGADFSAMEFLDGDGGSLRSPLGEVAIRDIVQFVPFRQFQNAPKEALAQCVLAEIPQ
::::.:::: :..:::: : :::: :: ..::::::::::.:..: :::. ::::.:.
CCDS75 VGVGNADFSDMQMLDGDDGILRSPKGEPVLRDIVQFVPFRNFKHASPAALAKSVLAEVPN
490 500 510 520 530 540
520 530
pF1KSD QVVGYFNTYKLLPPKNPATKQQKQ
::: :.: : . ::
CCDS75 QVVDYYNG-KGIKPKCSSEMYESSRTLAP
550 560 570
>>CCDS10981.1 CPNE7 gene_id:27132|Hs108|chr16 (558 aa)
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10 20 30 40
pF1KSD MAAQCVTKVALNVSCANLLDKDIGSKSDPLCVLFLNTSGQQWYEV
. : :..:: : .:: .:::.: .:::: .:. ...:: : .:
CCDS10 MSAGSERGAAATPGGLPAPCASKVELRLSCRHLLDRDPLTKSDPSVALLQQAQGQ-WVQV
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KSD ERTERIKNCLNPQFSKTFIIDYYFEVVQKLKFGVYDIDNKT-IELSDDDFLGECECTLGQ
::: ... :.: :::.: .::::: ::.:.: ::: . . . ..::::: ::::::
CCDS10 GRTEVVRSSLHPVFSKVFTVDYYFEEVQRLRFEVYDTHGPSGFSCQEDDFLGGMECTLGQ
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KSD IVSSKKLTRPLVMKTGRPAGKGSITISAEEIK-DNRVVLFEMEARKLDNKDLFGKSDPYL
::..::.::::..: :: :::..::. ::.:. .: : . ..:::::.::::.::::.:
CCDS10 IVAQKKVTRPLLLKFGRNAGKSTITVIAEDISGNNGYVELSFRARKLDDKDLFSKSDPFL
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KSD EFHKQTSDGNWLMVHRTEVVKNNLNPVWRPFKISLNSLCYGDMDKTIKVECYDYDNDGSH
:... ..: . .:.:::::::::::::. ::.::.::: . . .: .:::. :.:
CCDS10 ELYRVNDDQGLQLVYRTEVVKNNLNPVWEAFKVSLSSLCSCEETRPLKCLVWDYDSRGKH
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KSD DLIGTFQTTMTKLKEASRSSPVEFECINEKKRQKKKSYKNSGVISVKQCEITVECTFLDY
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CCDS10 DFIGEFSTTFEEMQKAFEEGQAQWDCVNPKYKQKRRSYKNSGVVVLADLKFHRVYSFLDY
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KSD IMGGCQLNFTVGVDFTGSNGDPRSPDSLHYISPNGVNEYLTALWSVGLVIQDYDADKMFP
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CCDS10 IMGGCQIHFTVAIDFTASNGDPRNSCSLHYINPYQPNEYLKALVSVGEICQDYDSDKRFS
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KSD AFGFGAQIPPQWQVSHEFPMNFNPSNPYCNGIQGIVEAYRSCLPQIKLYGPTNFSPIINH
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CCDS10 ALGFGARIPPKYEVSHDFAINFNPEDDECEGIQGVVEAYQNCLPRVQLYGPTNVAPIISK
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KSD VARFAAAATQQQTASQYFVLLIITDGVITDLDETRQAIVNASRLPMSIIIVGVGGADFSA
::: ::: . ::::..:::.::::.::. .::.::: ::::::::::::::.:::.
CCDS10 VARVAAAEESTGKASQYYILLILTDGVVTDMADTREAIVRASRLPMSIIIVGVGNADFTD
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KSD MEFLDGDGGSLRSPLGEVAIRDIVQFVPFRQFQNAPKEALAQCVLAEIPQQVVGYFNTYK
:. :::: : :::: :: :.::::::::::...:: :::.:::::.:.::: :. ...
CCDS10 MQVLDGDDGVLRSPRGEPALRDIVQFVPFRELKNASPAALAKCVLAEVPKQVVEYY-SHR
480 490 500 510 520 530
530
pF1KSD LLPPKNPATKQQKQ
:::..
CCDS10 GLPPRSLGVPAGEASPGCTP
540 550
>>CCDS9607.1 CPNE6 gene_id:9362|Hs108|chr14 (557 aa)
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10 20 30 40
pF1KSD MAAQCVTKVALNVSCANLLDKDIGSKSDPLCVLFLNTSGQQWYEVER
..: : ::: .:::.: .: : :::. : .:: ::::
CCDS96 MSDPEMGWVPEPPTMTLGASRVELRVSCHGLLDRDTLTKPHP-CVLLKLYSDEQWVEVER
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KSD TERIKNCLNPQFSKTFIIDYYFEVVQKLKFGVYDIDNKTIELSDDDFLGECECTLGQIVS
:: ...: .: ::... ..:.:: : :.: :.: .. . .: ::: :::::::::
CCDS96 TEVLRSCSSPVFSRVLALEYFFEEKQPLQFHVFDAEDGATSPRNDTFLGSTECTLGQIVS
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KSD SKKLTRPLVMKTGRPAGKGSITISAEEIKD-NRVVLFEMEARKLDNKDLFGKSDPYLEFH
. :.:.::..:.:. :::..::: :::.. : : . ..: ::::::::.::::..:..
CCDS96 QTKVTKPLLLKNGKTAGKSTITIVAEEVSGTNDYVQLTFRAYKLDNKDLFSKSDPFMEIY
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KSD KQTSDGNWLMVHRTEVVKNNLNPVWRPFKISLNSLCYGDMDKTIKVECYDYDNDGSHDLI
: . : . .: ::::::::::: :.::..::.::: :. . .: ::::..:.::.:
CCDS96 KTNEDQSDQLVWRTEVVKNNLNPSWEPFRLSLHSLCSCDVHRPLKFLVYDYDSSGKHDFI
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KSD GTFQTTMTKLKE--ASRSSPVEFECINEKKRQKKKSYKNSGVISVKQCEITVECTFLDYI
: : .:. ...: :. .. ....::: : :.:::.::.::.. . :: . ::::::
CCDS96 GEFTSTFQEMQEGTANPGQEMQWDCINPKYRDKKKNYKSSGTVVLAQCTVEKVHTFLDYI
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KSD MGGCQLNFTVGVDFTGSNGDPRSPDSLHYISPNGVNEYLTALWSVGLVIQDYDADKMFPA
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CCDS96 MGGCQISFTVAIDFTASNGDPRSSQSLHCLSPRQPNHYLQALRAVGGICQDYDSDKRFPA
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KSD FGFGAQIPPQWQVSHEFPMNFNPSNPYCNGIQGIVEAYRSCLPQIKLYGPTNFSPIINHV
:::::.:::...:::.: .::.: :: :. :.:.. .:: :::::.:::::: .::::.:
CCDS96 FGFGARIPPNFEVSHDFAINFDPENPECEEISGVIASYRRCLPQIQLYGPTNVAPIINRV
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KSD ARFAAAATQQQTASQYFVLLIITDGVITDLDETRQAIVNASRLPMSIIIVGVGGADFSAM
:. : . :..: :::..::::..:. ::: ::: ::::::::::::::.:::: :
CCDS96 AEPAQREQSTGQATKYSVLLVLTDGVVSDMAETRTAIVRASRLPMSIIIVGVGNADFSDM
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KSD EFLDGDGGSLRSPLGEVAIRDIVQFVPFRQFQNAPKEALAQCVLAEIPQQVVGYFNTYKL
..:::: : :: : : : ::::::::::.:..: :::.:::::.:.::: :. . .
CCDS96 RLLDGDDGPLRCPRGVPAARDIVQFVPFRDFKDAAPSALAKCVLAEVPRQVVEYYASQGI
480 490 500 510 520 530
530
pF1KSD LP--PKNPATKQQKQ
: :. : :
CCDS96 SPGAPR-PCTLATTPSPSP
540 550
>>CCDS61413.1 CPNE6 gene_id:9362|Hs108|chr14 (612 aa)
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Smith-Waterman score: 1935; 54.4% identity (77.6% similar) in 531 aa overlap (7-532:75-603)
10 20 30
pF1KSD MAAQCVTKVALNVSCANLLDKDIGSKSDPLCVLFLN
..: : ::: .:::.: .: : :::.
CCDS61 ERGAPDREPSDMSDPEMGWVPEPPTMTLGASRVELRVSCHGLLDRDTLTKPHP-CVLLKL
50 60 70 80 90 100
40 50 60 70 80 90
pF1KSD TSGQQWYEVERTERIKNCLNPQFSKTFIIDYYFEVVQKLKFGVYDIDNKTIELSDDDFLG
: .:: :::::: ...: .: ::... ..:.:: : :.: :.: .. . .: :::
CCDS61 YSDEQWVEVERTEVLRSCSSPVFSRVLALEYFFEEKQPLQFHVFDAEDGATSPRNDTFLG
110 120 130 140 150 160
100 110 120 130 140 150
pF1KSD ECECTLGQIVSSKKLTRPLVMKTGRPAGKGSITISAEEIKD-NRVVLFEMEARKLDNKDL
:::::::::. :.:.::..:.:. :::..::: :::.. : : . ..: :::::::
CCDS61 STECTLGQIVSQTKVTKPLLLKNGKTAGKSTITIVAEEVSGTNDYVQLTFRAYKLDNKDL
170 180 190 200 210 220
160 170 180 190 200 210
pF1KSD FGKSDPYLEFHKQTSDGNWLMVHRTEVVKNNLNPVWRPFKISLNSLCYGDMDKTIKVECY
:.::::..:..: . : . .: ::::::::::: :.::..::.::: :. . .: :
CCDS61 FSKSDPFMEIYKTNEDQSDQLVWRTEVVKNNLNPSWEPFRLSLHSLCSCDVHRPLKFLVY
230 240 250 260 270 280
220 230 240 250 260 270
pF1KSD DYDNDGSHDLIGTFQTTMTKLKE--ASRSSPVEFECINEKKRQKKKSYKNSGVISVKQCE
:::..:.::.:: : .:. ...: :. .. ....::: : :.:::.::.::.. . ::
CCDS61 DYDSSGKHDFIGEFTSTFQEMQEGTANPGQEMQWDCINPKYRDKKKNYKSSGTVVLAQCT
290 300 310 320 330 340
280 290 300 310 320 330
pF1KSD ITVECTFLDYIMGGCQLNFTVGVDFTGSNGDPRSPDSLHYISPNGVNEYLTALWSVGLVI
. :::::::::::..:::..:::.::::::: .::: .:: :.:: :: .:: .
CCDS61 VEKVHTFLDYIMGGCQISFTVAIDFTASNGDPRSSQSLHCLSPRQPNHYLQALRAVGGIC
350 360 370 380 390 400
340 350 360 370 380 390
pF1KSD QDYDADKMFPAFGFGAQIPPQWQVSHEFPMNFNPSNPYCNGIQGIVEAYRSCLPQIKLYG
::::.:: ::::::::.:::...:::.: .::.: :: :. :.:.. .:: :::::.:::
CCDS61 QDYDSDKRFPAFGFGARIPPNFEVSHDFAINFDPENPECEEISGVIASYRRCLPQIQLYG
410 420 430 440 450 460
400 410 420 430 440 450
pF1KSD PTNFSPIINHVARFAAAATQQQTASQYFVLLIITDGVITDLDETRQAIVNASRLPMSIII
::: .::::.::. : . :..: :::..::::..:. ::: ::: ::::::::::
CCDS61 PTNVAPIINRVAEPAQREQSTGQATKYSVLLVLTDGVVSDMAETRTAIVRASRLPMSIII
470 480 490 500 510 520
460 470 480 490 500 510
pF1KSD VGVGGADFSAMEFLDGDGGSLRSPLGEVAIRDIVQFVPFRQFQNAPKEALAQCVLAEIPQ
::::.:::: :..:::: : :: : : : ::::::::::.:..: :::.:::::.:.
CCDS61 VGVGNADFSDMRLLDGDDGPLRCPRGVPAARDIVQFVPFRDFKDAAPSALAKCVLAEVPR
530 540 550 560 570 580
520 530
pF1KSD QVVGYFNTYKLLP--PKNPATKQQKQ
::: :. . . : :. : :
CCDS61 QVVEYYASQGISPGAPR-PCTLATTPSPSP
590 600 610
>>CCDS8733.1 CPNE8 gene_id:144402|Hs108|chr12 (564 aa)
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Smith-Waterman score: 1848; 52.4% identity (78.0% similar) in 540 aa overlap (2-530:19-550)
10 20 30 40
pF1KSD MAAQCVTKVALNVSCANLLDKDIGSKSDPLCVLFLNTSG-QQW
:: .:.: ..::: ::::.: :::::.:::... : ..:
CCDS87 MDSRYNSTAGIGDLNQLSAAIPATRVEVSVSCRNLLDRDTFSKSDPICVLYVQGVGNKEW
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KSD YEVERTERIKNCLNPQFSKTFIIDYYFEVVQKLKFGVYDIDNKTIELSDDDFLGECECTL
: ::: : : :::.: . ::.::.:: ..:.: .::.:.:. .:: ::::. :::
CCDS87 REFGRTEVIDNTLNPDFVRKFILDYFFEERENLRFDLYDVDSKSPNLSKHDFLGQVFCTL
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150
pF1KSD GQIVSSK--KLTRPLVMKTGRPAGK-GSITISAEEIKDNR-VVLFEMEARKLDNKDLFGK
:.::.:. .: .:.: : :. : :.: ..:::.. : .::... : :::.::.:::
CCDS87 GEIVGSQGSRLEKPIV---GIPGKKCGTIILTAEELNCCRDAVLMQFCANKLDKKDFFGK
130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KSD SDPYLEFHKQTSDGNWLMVHRTEVVKNNLNPVWRPFKISLNSLCYGDMDKTIKVECYDYD
:::.: :.... ::.. . :.::::::.:::::. ::::. .:: ::.:.::::: ::.:
CCDS87 SDPFLVFYRSNEDGSFTICHKTEVVKNTLNPVWQAFKISVRALCNGDYDRTIKVEVYDWD
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KSD NDGSHDLIGTFQTTMTKLKEASRSSPVEFECINEKKRQKKKSYKNSGVISVKQCEITVEC
:::::.:: : :.. .:.... . : .: .: ::. :::.: :::.... . . .:
CCDS87 RDGSHDFIGEFTTSYRELSRGQSQFNV-YEVVNPKKKGKKKKYTNSGTVTLLSFLVETEV
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KSD TFLDYIMGGCQLNFTVGVDFTGSNGDPRSPDSLHYISPNGVNEYLTALWSVGLVIQDYDA
.::::: :: :.::::..:::.:::.: .: ::::..: .: : :: .:: ..::::.
CCDS87 SFLDYIKGGTQINFTVAIDFTASNGNPAQPTSLHYMNPYQLNAYGMALKAVGEIVQDYDS
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KSD DKMFPAFGFGAQIPPQWQVSHEFPMNFNPSNPYCNGIQGIVEAYRSCLPQIKLYGPTNFS
::::::.::::..::. ..:::: .: ::.::::.::.:..::: : ...:::::::.
CCDS87 DKMFPALGFGAKLPPDGRISHEFALNGNPQNPYCDGIEGVMEAYYRSLKSVQLYGPTNFA
360 370 380 390 400 410
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pF1KSD PIINHVARFAAAATQQQTASQYFVLLIITDGVITDLDETRQAIVNASRLPMSIIIVGVGG
:.::::::.:... . .::::::::.:::::.:. .:...:::::.:::::::::::
CCDS87 PVINHVARYASSV---KDGSQYFVLLIVTDGVISDMAQTKESIVNASKLPMSIIIVGVGP
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490 500 510
pF1KSD ADFSAMEFLDGDGGSLRSPLGEVAIRDIVQFVPFRQFQNAPKEA------LAQCVLAEIP
:.:.:: :::: . : :. : ::::::::::.. . . ::. ::::::
CCDS87 AEFDAMVELDGDDVRV-SSRGKYAERDIVQFVPFRDYIDRSGNHILSMARLAKDVLAEIP
480 490 500 510 520 530
520 530
pF1KSD QQVVGYFNTYKLLPPKNPATKQQKQ
.: ..:. . . : :
CCDS87 EQFLSYMRARGIKPSPAPPPYTPPTHVLQTQI
540 550 560
537 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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