Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA0552
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0552, 673 aa
1>>>pF1KSDA0552 673 - 673 aa - 673 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.0299+/-0.000981; mu= -4.6520+/- 0.059
mean_var=361.6578+/-74.154, 0's: 0 Z-trim(115.6): 17 B-trim: 123 in 2/53
Lambda= 0.067441
statistics sampled from 16130 (16143) to 16130 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.778), E-opt: 0.2 (0.496), width: 16
Scan time: 4.400
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS63218.1 LZTS3 gene_id:9762|Hs108|chr20 ( 627) 2415 249.0 1.5e-65
CCDS7507.1 LZTS2 gene_id:84445|Hs108|chr10 ( 669) 994 110.8 6.4e-24
CCDS6015.1 LZTS1 gene_id:11178|Hs108|chr8 ( 596) 562 68.7 2.7e-11
>>CCDS63218.1 LZTS3 gene_id:9762|Hs108|chr20 (627 aa)
initn: 2455 init1: 2375 opt: 2415 Z-score: 1290.5 bits: 249.0 E(32554): 1.5e-65
Smith-Waterman score: 4035; 93.2% identity (93.2% similar) in 673 aa overlap (1-673:1-627)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MAKLETLPVRADPGRDPLLAFAPRPSELGPPDPRLAMGSVGSGVAHAQEFAMKSVGTRTG
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CCDS63 MAKLETLPVRADPGRDPLLAFAPRPSELGPPDPRLAMGSVGSGVAHAQEFAMKSVGTRTG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD GGGSQGSFPGPRGSGSGASRERPGRYPSEDKGLANSLYLNGELRGSDHTDVCGNVVGSSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 GGGSQGSFPGPRGSGSGASRERPGRYPSEDKGLANSLYLNGELRGSDHTDVCGNVVGSSG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD GSSSSGGSDKAPPQYREPSHPPKLLATSGKLDQCSEPLVRPSAFKPVVPKNFHSMQNLCP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 GSSSSGGSDKAPPQYREPSHPPKLLATSGKLDQCSEPLVRPSAFKPVVPKNFHSMQNLCP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD PQTNGTPEGRQGPGGLKGGLDKSRTMTPAGGSGSGLSDSGRNSLTSLPTYSSSYSQHLAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 PQTNGTPEGRQGPGGLKGGLDKSRTMTPAGGSGSGLSDSGRNSLTSLPTYSSSYSQHLAP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD LSASTSHINRIGTASYGSGSGGSSGGGSGYQDLGTSDSGRASSKSGSSSSMGRPGHLGSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 LSASTSHINRIGTASYGSGSGGSSGGGSGYQDLGTSDSGRASSKSGSSSSMGRPGHLGSG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD EGGGGGLPFAACSPPSPSALIQELEERLWEKEQEVAALRRSLEQSEAAVAQVLEERQKAW
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 EGGGGGLPFAACSPPSPSALIQELEERLWEKEQEVAALRRSLEQSEAAVAQ---------
310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KSD ERELAELRQGCSGKLQQVARRAQRAQQGLQLQVLRLQQDKKQLQEEAARLMRQREELEDK
:::::::::::::::::::::::
CCDS63 -------------------------------------QDKKQLQEEAARLMRQREELEDK
360 370
430 440 450 460 470 480
pF1KSD VAACQKEQADFLPRIEETKWEVCQKAGEISLLKQQLKDSQADVSQKLSEIVGLRSQLREG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 VAACQKEQADFLPRIEETKWEVCQKAGEISLLKQQLKDSQADVSQKLSEIVGLRSQLREG
380 390 400 410 420 430
490 500 510 520 530 540
pF1KSD RASLREKEEQLLSLRDSFSSKQASLELGEGELPAACLKPALTPVDPAEPQDALATCESDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 RASLREKEEQLLSLRDSFSSKQASLELGEGELPAACLKPALTPVDPAEPQDALATCESDE
440 450 460 470 480 490
550 560 570 580 590 600
pF1KSD AKMRRQAGVAAAASLVSVDGEAEAGGESGTRALRREVGRLQAELAAERRARERQGASFAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 AKMRRQAGVAAAASLVSVDGEAEAGGESGTRALRREVGRLQAELAAERRARERQGASFAE
500 510 520 530 540 550
610 620 630 640 650 660
pF1KSD ERRVWLEEKEKVIEYQKQLQLSYVEMYQRNQQLERRLRERGAAGGASTPTPQHGEEKKAW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 ERRVWLEEKEKVIEYQKQLQLSYVEMYQRNQQLERRLRERGAAGGASTPTPQHGEEKKAW
560 570 580 590 600 610
670
pF1KSD TPSRLERIESTEI
:::::::::::::
CCDS63 TPSRLERIESTEI
620
>>CCDS7507.1 LZTS2 gene_id:84445|Hs108|chr10 (669 aa)
initn: 847 init1: 537 opt: 994 Z-score: 542.9 bits: 110.8 E(32554): 6.4e-24
Smith-Waterman score: 1114; 38.9% identity (59.5% similar) in 696 aa overlap (1-639:1-637)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MAKLETLPVRADPGRDPLLAFAPRPSELGPPDPRLAMGSVGSGVAHAQEFAMKSVGTRTG
:: ..:::: .:. : : ::. .: .::::.: .. :
CCDS75 MAIVQTLPVPLEPA--PEAATAPQ----AP-----VMGSVSSLIS----------GRPCP
10 20 30
70 80 90 100 110
pF1KSD GGGSQGSFPGPRG-----SGSGASRERPGRYPSEDKGLANSLYLNGELRGSDHTDVCGNV
:: . :: : . .: : : : ... : .. . .. : . .
CCDS75 GGPAPPRHHGPPGPTFFRQQDGLLR---GGYEAQEP-LCPAVPPRKAVPVTSFTYINEDF
40 50 60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KSD VGSSGGSSSSGGSDKAPPQYREPSH----PPKLLATSGKLDQCSEP-LVRPSAFKPVVPK
: : :: : : : . .: ::::. .::::.. : :.::.:::::.::
CCDS75 RTESPPSPSSDVED-AREQRAHNAHLRGPPPKLIPVSGKLEKNMEKILIRPTAFKPVLPK
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210
pF1KSD --NFHSMQNLCPPQTNGTPEGRQGP-----GGLKGGLDKSRTMT----P------AGGSG
. :. .. :...: : :: :: .. ..: . . : :.:
CCDS75 PRGAPSLPSFMGPRATGLS-GSQGSLTQLFGGPASSSSSSSSSSAADKPLAFSGWASGCP
160 170 180 190 200 210
220 230 240 250 260 270
pF1KSD SG-LSDSGRNSLTSLPTYSSSYSQHLAPLSASTS-HINRIGTASYGSGSGGSSGGGSGYQ
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CCDS75 SGTLSDSGRNSLSSLPTYSTGGAE---PTTSSPGGHL-----PSHGSGRGALPGPARGVP
220 230 240 250 260
280 290 300 310 320
pF1KSD DLGT-SDSGRASSKSGSSSSMGR--PGHLGSGEGG-------GGGLPFAACSPPSPSALI
. :::::.::.....: :: : :::: . : : ::: ::.
CCDS75 TGPSHSDSGRSSSSKSTGSLGGRVAGGLLGSGTRASPDSSSCGERSPPPPPPPPSDEALL
270 280 290 300 310 320
330 340 350 360 370 380
pF1KSD QE-LEERLWEKEQEVAALRRSLEQSEAAVAQVLEERQKAWERELAELRQGCSGKLQQVAR
. :: .: ..: :. :: ::...::.. :. ::::. :.:: ::. :... :.
CCDS75 HCVLEGKLRDREAELQQLRDSLDENEATMCQAYEERQRHWQREREALREDCAAQ----AQ
330 340 350 360 370 380
390 400 410 420 430 440
pF1KSD RAQRAQQGLQLQVLRLQQDKKQLQEEAARLMRQREELEDKVAACQKEQADFLPRIEETKW
::::::: :::::..:::.:.:::.. :.:...::.:: . :. ..:: .. ::.:::::
CCDS75 RAQRAQQLLQLQVFQLQQEKRQLQDDFAQLLQEREQLERRCATLEREQRELGPRLEETKW
390 400 410 420 430 440
450 460 470 480 490 500
pF1KSD EVCQKAGEISLLKQQLKDSQADVSQKLSEIVGLRSQLREGRASLREKEEQLLSLRDSFSS
:::::.:::::::::::.:::.. :: ::.:.:: :::.::.:: .: . .:... .
CCDS75 EVCQKSGEISLLKQQLKESQAELVQKGSELVALRVALREARATLRVSEGRARGLQEAARA
450 460 470 480 490 500
510 520 530 540
pF1KSD KQASLE---------------LGE--GELPAACLKPALTPVDPAEPQDALATCESDEAKM
.. :: : : :.: : :: :: : . ::::::.
CCDS75 RELELEACSQELQRHRQEAEQLREKAGQLDAEAAGLREPPVPPATA-DPFLLAESDEAKV
510 520 530 540 550 560
550 560 570 580 590 600
pF1KSD RRQAGVAAAASLVSVDGEAEAGGESGTRALRREVGRLQAELAAERRARERQGASFAEERR
.: :::.. :: .:: .: ::..:: ::: :.: :: ::
CCDS75 QR-----AAAGV---------GG-----SLRAQVERLRVELQRERRRGEEQRDSFEGERL
570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD VWLEEKEKVIEYQKQLQLSYVEMYQRNQQLERRLRERGAAGGASTPTPQHGEEKKAWTPS
.: :::.::.:::::: .:..::.::.:::..:..
CCDS75 AWQAEKEQVIRYQKQLQHNYIQMYRRNRQLEQELQQLSLELEARELADLGLAEQAPCICL
610 620 630 640 650 660
670
pF1KSD RLERIESTEI
CCDS75 EEITATEI
>>CCDS6015.1 LZTS1 gene_id:11178|Hs108|chr8 (596 aa)
initn: 939 init1: 529 opt: 562 Z-score: 316.4 bits: 68.7 E(32554): 2.7e-11
Smith-Waterman score: 1028; 37.7% identity (62.4% similar) in 612 aa overlap (68-673:44-596)
40 50 60 70 80 90
pF1KSD GSVGSGVAHAQEFAMKSVGTRTGGGGSQGSFPGPRGSGSGASRERPGRYPSEDKGLANSL
: . :: : : . :. ::: .
CCDS60 HSKHCRASQYKLRKSSHLKKLNRYSDGLLRFGFSQDSGHGKSSSKMGK--SED---FFYI
20 30 40 50 60
100 110 120 130 140 150
pF1KSD YLNGELRGSDHTDVCGNVVGSSGGSSSSGGSDKAPPQYREPSHPPKLLATSGKLDQCSEP
.. . ::: : : . :. ::.. : : .:: ::::. :..:.. ::
CCDS60 KVSQKARGSHHPDYTALSSGDLGGQA---GVD------FDPSTPPKLMPFSNQLEMGSEK
70 80 90 100 110
160 170 180 190 200 210
pF1KSD -LVRPSAFKPVVPKN---FHSMQNLCPPQTNGTPEGRQGPGGLKGGLDKSRTMTPAGGSG
:::.:::::.:.. .:: . : . .: . :: :: ::
CCDS60 GAVRPTAFKPVLPRSGAILHSSPESASHQLHPAPPDKPKEQELKPGL----------CSG
120 130 140 150 160
220 230 240 250 260 270
pF1KSD SGLSDSGRNSLTSLPTYSSSYSQHLAPLSASTSHINRIGTASYGSGSGGSSGGGSGYQDL
. ::::::::..::::.:.: : .: :: . .. .:.: ::. . ..: .
CCDS60 A-LSDSGRNSMSSLPTHSTSSSYQLDPLVTPVGPTSRFG----GSAHNITQG-------I
170 180 190 200 210
280 290 300 310 320 330
pF1KSD GTSDSGRASSKSGSSSSMG-RPGHLGSGEGGGGGLPFAACSPPSPSAL-IQELEERLWEK
.::. : :. : :. : . :: .... : : . :: : . :::::..: :.
CCDS60 VLQDSNMMSLKALSFSDGGSKLGHSNKADKG----PSCVRSPISTDECSIQELEQKLLER
220 230 240 250 260 270
340 350 360 370 380 390
pF1KSD EQEVAALRRSLEQSEAAVAQVLEERQKAWERELAELRQGCSGKLQQVARRAQRAQQGLQL
: . :.::.:..: : . . ::: . . :: . ..::.:.....::::: :.:
CCDS60 EGALQKLQRSFEEKELASSLAYEERPRRCRDELEGPEPKGGNKLKQASQKSQRAQQVLHL
280 290 300 310 320 330
400 410 420 430 440 450
pF1KSD QVLRLQQDKKQLQEEAARLMRQREELEDKVAACQKEQADFLPRIEETKWEVCQKAGEISL
:::.:::.:.::..: ::.... :: :. . ..:...: : .:::.::::::.:::::
CCDS60 QVLQLQQEKRQLRQELESLMKEQDLLETKLRSYEREKTSFGPALEETQWEVCQKSGEISL
340 350 360 370 380 390
460 470 480 490 500 510
pF1KSD LKQQLKDSQADVSQKLSEIVGLRSQLREGRASLREKEEQLLSLRDSFSSKQASLELGEGE
::::::.::..:. : :::.::..::.. :..:. : . .:. .. .: ::. :.:
CCDS60 LKQQLKESQTEVNAKASEILGLKAQLKDTRGKLEGLELRTQDLEGALRTKGLELEVCENE
400 410 420 430 440 450
520 530 540 550 560 570
pF1KSD LPAACLKPALTPVDPAEPQDALATCESDEAKMRRQAGVAAAASLVSVDGEAEAGGESGTR
: . : .. . :.. ..: ::..: . . .. :
CCDS60 LQRKKNEAELL-------REKVNLLEQELQELRAQAALARDMGPPTFPEDVPA-------
460 470 480 490
580 590 600 610 620 630
pF1KSD ALRREVGRLQAELAAERRARERQGASFAEERRVWLEEKEKVIEYQKQLQLSYVEMYQRNQ
:.::. ::.::: ::.........: .:: :: :::::::.:::::: ::: ::::::
CCDS60 -LQRELERLRAELREERQGHDQMSSGFQHERLVWKEEKEKVIQYQKQLQQSYVAMYQRNQ
500 510 520 530 540 550
640 650 660 670
pF1KSD QLERRLRERGAAGGASTPTPQHGEEKKAWTPSRLERIESTEI
.::. :.. : : :. : . . . : : : : .:::
CCDS60 RLEKALQQ--LARGDSAGEPLEVDLEGADIP--YEDIIATEI
560 570 580 590
673 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 02:04:03 2016 done: Thu Nov 3 02:04:04 2016
Total Scan time: 4.400 Total Display time: 0.050
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]