Result of FASTA (omim) for
pF1KSDA0463
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0463, 1909 aa
1>>>pF1KSDA0463 1909 - 1909 aa - 1909 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3842+/-0.000544; mu= 18.6033+/- 0.034
mean_var=95.8762+/-18.173, 0's: 0 Z-trim(109.6): 169 B-trim: 34 in 1/48
Lambda= 0.130984
statistics sampled from 17631 (17834) to 17631 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.545), E-opt: 0.2 (0.209), width: 16
Scan time: 15.490
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_079455 (OMIM: 601054) plexin-A2 precursor [Homo (1894) 12734 2418.6 0
XP_005273222 (OMIM: 601054) PREDICTED: plexin-A2 i (1823) 11449 2175.8 0
XP_005273221 (OMIM: 601054) PREDICTED: plexin-A2 i (1974) 11449 2175.8 0
XP_006716234 (OMIM: 604280) PREDICTED: plexin-A4 i (1894) 8751 1665.9 0
XP_005250743 (OMIM: 604280) PREDICTED: plexin-A4 i (1894) 8751 1665.9 0
NP_065962 (OMIM: 604280) plexin-A4 isoform 1 precu (1894) 8751 1665.9 0
NP_115618 (OMIM: 601055) plexin-A1 precursor [Homo (1896) 8269 1574.9 0
XP_011511210 (OMIM: 601055) PREDICTED: plexin-A1 i (1914) 8269 1574.9 0
XP_011511211 (OMIM: 601055) PREDICTED: plexin-A1 i (1914) 8269 1574.9 0
NP_059984 (OMIM: 300022) plexin-A3 precursor [Homo (1871) 7671 1461.8 0
XP_005274763 (OMIM: 300022) PREDICTED: plexin-A3 i (1789) 7461 1422.2 0
XP_011529485 (OMIM: 300022) PREDICTED: plexin-A3 i (1684) 7030 1340.7 0
XP_011514978 (OMIM: 604280) PREDICTED: plexin-A4 i (1437) 5641 1078.2 0
XP_016868268 (OMIM: 604280) PREDICTED: plexin-A4 i (1827) 5588 1068.2 0
XP_006724892 (OMIM: 300022) PREDICTED: plexin-A3 i (1841) 4725 905.1 0
XP_005274762 (OMIM: 300022) PREDICTED: plexin-A3 i (1853) 3507 675.0 2e-192
NP_861440 (OMIM: 604280) plexin-A4 isoform 2 precu ( 522) 1763 345.1 1.1e-93
NP_001099013 (OMIM: 604280) plexin-A4 isoform 3 pr ( 492) 1718 336.6 3.8e-91
NP_005384 (OMIM: 300214) plexin-B3 isoform 1 precu (1909) 1623 319.0 3e-85
NP_001156729 (OMIM: 300214) plexin-B3 isoform 2 [H (1932) 1623 319.0 3e-85
XP_016884192 (OMIM: 604293) PREDICTED: plexin-B2 i (1838) 1128 225.4 4.2e-57
XP_005261968 (OMIM: 604293) PREDICTED: plexin-B2 i (1838) 1128 225.4 4.2e-57
XP_016884193 (OMIM: 604293) PREDICTED: plexin-B2 i (1838) 1128 225.4 4.2e-57
XP_005261967 (OMIM: 604293) PREDICTED: plexin-B2 i (1838) 1128 225.4 4.2e-57
XP_005261966 (OMIM: 604293) PREDICTED: plexin-B2 i (1838) 1128 225.4 4.2e-57
XP_006724476 (OMIM: 604293) PREDICTED: plexin-B2 i (1838) 1128 225.4 4.2e-57
NP_036533 (OMIM: 604293) plexin-B2 precursor [Homo (1838) 1128 225.4 4.2e-57
XP_011528984 (OMIM: 604293) PREDICTED: plexin-B2 i (1901) 1128 225.4 4.3e-57
XP_011510892 (OMIM: 604282) PREDICTED: plexin-D1 i (1467) 1093 218.7 3.4e-55
XP_011510891 (OMIM: 604282) PREDICTED: plexin-D1 i (1795) 1066 213.7 1.4e-53
XP_011510894 (OMIM: 604282) PREDICTED: plexin-D1 i ( 981) 1029 206.6 1.1e-51
NP_055918 (OMIM: 604282) plexin-D1 precursor [Homo (1925) 1027 206.3 2.4e-51
XP_011510890 (OMIM: 604282) PREDICTED: plexin-D1 i (1894) 957 193.1 2.3e-47
NP_001123554 (OMIM: 601053) plexin-B1 precursor [H (2135) 902 182.7 3.4e-44
XP_016862120 (OMIM: 601053) PREDICTED: plexin-B1 i (2135) 902 182.7 3.4e-44
NP_002664 (OMIM: 601053) plexin-B1 precursor [Homo (2135) 902 182.7 3.4e-44
XP_011532139 (OMIM: 601053) PREDICTED: plexin-B1 i (2136) 894 181.2 9.7e-44
XP_011532136 (OMIM: 601053) PREDICTED: plexin-B1 i (2136) 894 181.2 9.7e-44
XP_011532135 (OMIM: 601053) PREDICTED: plexin-B1 i (2136) 894 181.2 9.7e-44
XP_016862119 (OMIM: 601053) PREDICTED: plexin-B1 i (2136) 894 181.2 9.7e-44
XP_011532138 (OMIM: 601053) PREDICTED: plexin-B1 i (2136) 894 181.2 9.7e-44
XP_011532137 (OMIM: 601053) PREDICTED: plexin-B1 i (2136) 894 181.2 9.7e-44
XP_006719249 (OMIM: 604259) PREDICTED: plexin-C1 i (1555) 733 150.7 1.1e-34
NP_005752 (OMIM: 604259) plexin-C1 precursor [Homo (1568) 733 150.7 1.1e-34
XP_016874161 (OMIM: 604259) PREDICTED: plexin-C1 i (1315) 711 146.5 1.7e-33
XP_016874160 (OMIM: 604259) PREDICTED: plexin-C1 i (1323) 701 144.6 6.2e-33
XP_011536032 (OMIM: 604259) PREDICTED: plexin-C1 i (1322) 692 142.9 2e-32
NP_001311330 (OMIM: 114550,164860,605074,607278,61 ( 934) 470 100.9 6.4e-20
NP_000236 (OMIM: 114550,164860,605074,607278,61670 (1390) 470 101.0 8.9e-20
NP_001120972 (OMIM: 114550,164860,605074,607278,61 (1408) 470 101.0 9e-20
>>NP_079455 (OMIM: 601054) plexin-A2 precursor [Homo sap (1894 aa)
initn: 12734 init1: 12734 opt: 12734 Z-score: 12999.0 bits: 2418.6 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 12734; 99.9% identity (99.9% similar) in 1894 aa overlap (16-1909:1-1894)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MSTHRSRLLTAAPLSMEQRRPWPRALEVDSRSVVLLSVVWVLLAPPAAGMPQFSTFHSEN
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_079 MEQRRPWPRALEVDSRSVVLLSVVWVLLAPPAAGMPQFSTFHSEN
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KSD RDWTFNHLTVHQGTGAVYVGAINRVYKLTGNLTIQVAHKTGPEEDNKSCYPPLIVQPCSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_079 RDWTFNHLTVHQGTGAVYVGAINRVYKLTGNLTIQVAHKTGPEEDNKSCYPPLIVQPCSE
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KSD VLTLTNNVNKLLIIDYSENRLLACGSLYQGVCKLLRLDDLFILVEPSHKKEHYLSSVNKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_079 VLTLTNNVNKLLIIDYSENRLLACGSLYQGVCKLLRLDDLFILVEPSHKKEHYLSSVNKT
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KSD GTMYGVIVRSEGEDGKLFIGTAVDGKQDYFPTLSSRKLPRDPESSAMLDYELHSDFVSSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_079 GTMYGVIVRSEGEDGKLFIGTAVDGKQDYFPTLSSRKLPRDPESSAMLDYELHSDFVSSL
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KSD IKIPSDTLALVSHFDIFYIYGFASGGFVYFLTVQPETPEGVAINSAGDLFYTSRIVRLCK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_079 IKIPSDTLALVSHFDIFYIYGFASGGFVYFLTVQPETPEGVAINSAGDLFYTSRIVRLCK
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KSD DDPKFHSYVSLPFGCTRAGVEYRLLQAAYLAKPGDSLAQAFNITSQDDVLFAIFSKGQKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_079 DDPKFHSYVSLPFGCTRAGVEYRLLQAAYLAKPGDSLAQAFNITSQDDVLFAIFSKGQKQ
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KSD YHHPPDDSALCAFPIRAINLQIKGRLQSCYQGEGNLELNWLLGKDVQCTKAPVPIDDNFC
::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_079 YHHPPDDSALCAFPIRAINLQIKERLQSCYQGEGNLELNWLLGKDVQCTKAPVPIDDNFC
350 360 370 380 390 400
430 440 450 460 470 480
pF1KSD GLDINQPLGGSTPVEGLTLYTTSRDRMTSVASYVYNGYSVVFVGTKSGKLKKIRADGPPH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_079 GLDINQPLGGSTPVEGLTLYTTSRDRMTSVASYVYNGYSVVFVGTKSGKLKKIRADGPPH
410 420 430 440 450 460
490 500 510 520 530 540
pF1KSD GGVQYEMVSVLKDGSPILRDMAFSIDQRYLYVMSERQVTRVPVESCEQYTTCGECLSSGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_079 GGVQYEMVSVLKDGSPILRDMAFSIDQRYLYVMSERQVTRVPVESCEQYTTCGECLSSGD
470 480 490 500 510 520
550 560 570 580 590 600
pF1KSD PHCGWCALHNMCSRRDKCQQAWEPNRFAASISQCVSLAVHPSSISVSEHSRLLSLVVSDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_079 PHCGWCALHNMCSRRDKCQQAWEPNRFAASISQCVSLAVHPSSISVSEHSRLLSLVVSDA
530 540 550 560 570 580
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pF1KSD PDLSAGIACAFGNLTEVEGQVSGSQVICISPGPKDVPVIPLDQDWFGLELQLRSKETGKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_079 PDLSAGIACAFGNLTEVEGQVSGSQVICISPGPKDVPVIPLDQDWFGLELQLRSKETGKI
590 600 610 620 630 640
670 680 690 700 710 720
pF1KSD FVSTEFKFYNCSAHQLCLSCVNSAFRCHWCKYRNLCTHDPTTCSFQEGRINISEDCPQLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_079 FVSTEFKFYNCSAHQLCLSCVNSAFRCHWCKYRNLCTHDPTTCSFQEGRINISEDCPQLV
650 660 670 680 690 700
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pF1KSD PTEEILIPVGEVKPITLKARNLPQPQSGQRGYECVLNIQGAIHRVPALRFNSSSVQCQNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_079 PTEEILIPVGEVKPITLKARNLPQPQSGQRGYECVLNIQGAIHRVPALRFNSSSVQCQNS
710 720 730 740 750 760
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pF1KSD SYQYDGMDISNLAVDFAVVWNGNFIIDNPQDLKVHLYKCAAQRESCGLCLKADRKFECGW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_079 SYQYDGMDISNLAVDFAVVWNGNFIIDNPQDLKVHLYKCAAQRESCGLCLKADRKFECGW
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pF1KSD CSGERRCTLHQHCTSPSSPWLDWSSHNVKCSNPQITEILTVSGPPEGGTRVTIHGVNLGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_079 CSGERRCTLHQHCTSPSSPWLDWSSHNVKCSNPQITEILTVSGPPEGGTRVTIHGVNLGL
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910 920 930 940 950 960
pF1KSD DFSEIAHHVQVAGVPCTPLPGEYIIAEQIVCEMGHALVGTTSGPVRLCIGECKPEFMTKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_079 DFSEIAHHVQVAGVPCTPLPGEYIIAEQIVCEMGHALVGTTSGPVRLCIGECKPEFMTKS
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pF1KSD HQQYTFVNPSVLSLNPIRGPESGGTMVTITGHYLGAGSSVAVYLGNQTCEFYGRSMSEIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_079 HQQYTFVNPSVLSLNPIRGPESGGTMVTITGHYLGAGSSVAVYLGNQTCEFYGRSMSEIV
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pF1KSD CVSPPSSNGLGPVPVSVSVDRAHVDSNLQFEYIDDPRVQRIEPEWSIASGHTPLTITGFN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_079 CVSPPSSNGLGPVPVSVSVDRAHVDSNLQFEYIDDPRVQRIEPEWSIASGHTPLTITGFN
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pF1KSD LDVIQEPRIRVKFNGKESVNVCKVVNTTTLTCLAPSLTTDYRPGLDTVERPDEFGFVFNN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_079 LDVIQEPRIRVKFNGKESVNVCKVVNTTTLTCLAPSLTTDYRPGLDTVERPDEFGFVFNN
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pF1KSD VQSLLIYNDTKFIYYPNPTFELLSPTGVLDQKPGSPIILKGKNLCPPASGGAKLNYTVLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_079 VQSLLIYNDTKFIYYPNPTFELLSPTGVLDQKPGSPIILKGKNLCPPASGGAKLNYTVLI
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pF1KSD GETPCAVTVSETQLLCEPPNLTGQHKVMVHVGGMVFSPGSVSVISDSLLTLPAIVSIAAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_079 GETPCAVTVSETQLLCEPPNLTGQHKVMVHVGGMVFSPGSVSVISDSLLTLPAIVSIAAG
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pF1KSD GSLLLIIVIIVLIAYKRKSRENDLTLKRLQMQMDNLESRVALECKEAFAELQTDINELTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_079 GSLLLIIVIIVLIAYKRKSRENDLTLKRLQMQMDNLESRVALECKEAFAELQTDINELTS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_079 DLDRSGIPYLDYRTYAMRVLFPGIEDHPVLRELEVQGNGQQHVEKALKLFAQLINNKVFL
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pF1KSD LTFIRTLELQRSFSMRDRGNVASLIMTGLQGRLEYATDVLKQLLSDLIDKNLENKNHPKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_079 LTFIRTLELQRSFSMRDRGNVASLIMTGLQGRLEYATDVLKQLLSDLIDKNLENKNHPKL
1370 1380 1390 1400 1410 1420
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pF1KSD LLRRTESVAEKMLTNWFAFLLHKFLKECAGEPLFMLYCAIKQQMEKGPIDAITGEARYSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_079 LLRRTESVAEKMLTNWFAFLLHKFLKECAGEPLFMLYCAIKQQMEKGPIDAITGEARYSL
1430 1440 1450 1460 1470 1480
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pF1KSD SEDKLIRQQIEYKTLILNCVNPDNENSPEIPVKVLNCDTITQVKEKILDAVYKNVPYSQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_079 SEDKLIRQQIEYKTLILNCVNPDNENSPEIPVKVLNCDTITQVKEKILDAVYKNVPYSQR
1490 1500 1510 1520 1530 1540
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pF1KSD PRAVDMDLEWRQGRIARVVLQDEDITTKIEGDWKRLNTLMHYQVSDRSVVALVPKQTSSY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_079 PRAVDMDLEWRQGRIARVVLQDEDITTKIEGDWKRLNTLMHYQVSDRSVVALVPKQTSSY
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pF1KSD NIPASASISRTSISRYDSSFRYTGSPDSLRSRAPMITPDLESGVKVWHLVKNHDHGDQKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_079 NIPASASISRTSISRYDSSFRYTGSPDSLRSRAPMITPDLESGVKVWHLVKNHDHGDQKE
1610 1620 1630 1640 1650 1660
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pF1KSD GDRGSKMVSEIYLTRLLATKGTLQKFVDDLFETLFSTVHRGSALPLAIKYMFDFLDEQAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_079 GDRGSKMVSEIYLTRLLATKGTLQKFVDDLFETLFSTVHRGSALPLAIKYMFDFLDEQAD
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pF1KSD RHSIHDTDVRHTWKSNCLPLRFWVNVIKNPQFVFDIHKGSITDACLSVVAQTFMDSCSTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_079 RHSIHDTDVRHTWKSNCLPLRFWVNVIKNPQFVFDIHKGSITDACLSVVAQTFMDSCSTS
1730 1740 1750 1760 1770 1780
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pF1KSD EHRLGKDSPSNKLLYAKDIPSYKSWVERYYADIAKLPAISDQDMNAYLAEQSRLHAVEFN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_079 EHRLGKDSPSNKLLYAKDIPSYKSWVERYYADIAKLPAISDQDMNAYLAEQSRLHAVEFN
1790 1800 1810 1820 1830 1840
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pF1KSD MLSALNEIYSYVSKYSEELIGALEQDEQARRQRLAYKVEQLINAMSIES
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_079 MLSALNEIYSYVSKYSEELIGALEQDEQARRQRLAYKVEQLINAMSIES
1850 1860 1870 1880 1890
>>XP_005273222 (OMIM: 601054) PREDICTED: plexin-A2 isofo (1823 aa)
initn: 11449 init1: 11449 opt: 11449 Z-score: 11686.9 bits: 2175.8 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 11686; 96.4% identity (96.4% similar) in 1821 aa overlap (1-1756:1-1821)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MSTHRSRLLTAAPLSMEQRRPWPRALEVDSRSVVLLSVVWVLLAPPAAGMPQFSTFHSEN
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. .:.: ::: ::::.::::: :.:::.:.:..:.: : :. :: : ::: . ::. .
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::::::.:::::::::::::::.::: : :..:::.:::::::::::::::.::::::
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::: :.:.. .::::::::::::.::::::::::::.:::::::.:::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::.:::.::::::::::::::::::::::.:.::: :
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::::::::::::::.::::::.::.:.:::::::::::::::::.: ::: .:::.::.
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: .. :: .:: ::::::.:::.:.: :: ::. :..: . :::::::::.: ::: :
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NP_065 RHTWKSNCLPLRFWVNMIKNPQFVFDIHKNSITDACLSVVAQTFMDSCSTSEHRLGKDSP
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pF1KSD SNKLLYAKDIPSYKSWVERYYADIAKLPAISDQDMNAYLAEQSRLHAVEFNMLSALNEIY
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NP_065 SNKLLYAKDIPSYKNWVERYYSDIGKMPAISDQDMNAYLAEQSRMHMNEFNTMSALSEIF
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1870 1880 1890 1900
pF1KSD SYVSKYSEELIGALEQDEQARRQRLAYKVEQLINAMSIES
:::.:::::..: :..:.: .:.::::.::.:. ::..:
NP_065 SYVGKYSEEILGPLDHDDQCGKQKLAYKLEQVITLMSLDS
1860 1870 1880 1890
>>NP_115618 (OMIM: 601055) plexin-A1 precursor [Homo sap (1896 aa)
initn: 7066 init1: 1613 opt: 8269 Z-score: 8439.0 bits: 1574.9 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 8273; 63.6% identity (85.0% similar) in 1903 aa overlap (23-1909:5-1896)
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pF1KSD MSTHRSRLLTAAPLSMEQRRPWPRALEVDSRSVVLLSVV---WVLLAPPAAG---MPQFS
::.:.: ..:: .. :. . : :: .: :
NP_115 MPLPPRSLQVLLLLLLLLLLLPGMWAEAGLPRAGGGSQPPFR
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:: . :: ..::.::. :: :::::.::.:::.::::. :: ::: :::..::::
NP_115 TFSAS--DWGLTHLVVHEQTGEVYVGAVNRIYKLSGNLTLLRAHVTGPVEDNEKCYPPPS
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pF1KSD VQPCSEVLTLTNNVNKLLIIDYSENRLLACGSLYQGVCKLLRLDDLFILVEPSHKKEHYL
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NP_115 VQSCPHGLGSTDNVNKLLLLDYAANRLLACGSASQGICQFLRLDDLFKLGEPHHRKEHYL
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NP_115 SSVQEAGSMAGVLIAGPPGQGQAKLFVGTPIDGKSEYFPTLSSRRLMANEEDADMFGFVY
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NP_115 QDEFVSSQLKIPSDTLSKFPAFDIYYVYSFRSEQFVYYLTLQLDT-QLTSPDAAGEHFFT
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NP_115 SKIVRLCVDDPKFYSYVEFPIGCEQAGVEYRLVQDAYLSRPGRALAHQLGLAEDEDVLFT
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NP_115 VFAQGQKNRVKPPKESALCLFTLRAIKEKIKERIQSCYRGEGKLSLPWLLNKELGCINSP
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NP_115 LQIDDDFCGQDFNQPLGGTVTIEGTPLFVDKDDGLTAVAAYDYRGRTVVFAGTRSGRIRK
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NP_115 ILVDLSNPGGRPALAYESV-VAQEGSPILRDLVLSPNHQYLYAMTEKQVTRVPVESCVQY
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NP_115 TSCELCLGSRDPHCGWCVLHSICSRRDACERADEPQRFAADLLQCVQLTVQPRNVSVTMS
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NP_115 QVPLVLQAWNVPDLSAGVNCSFEDFTESESVLEDGRIHCRSPSAREVAPITRGQGDQRVV
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NP_115 KLYLKSKETGKKFASVDFVFYNCSVHQSCLSCVNGSFPCHWCKYRHVCTHNVADCAFLEG
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NP_115 RVNVSEDCPQILPSTQIYVPVGVVKPITLAARNLPQPQSGQRGYECLFHIPGSPARVTAL
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NP_115 CLKADPRFECGWCVAERRCSLRHHCAADTPAS-WMHARHGSSRCTDPKILKLSPETGPRQ
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NP_115 GGTRLTITGENLGLRFEDVRLGVRVGKVLCSPVESEYISAEQIVCEIGDASSVRAHDALV
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NP_115 EVCVRDCSPHYRALSPKRFTFVTPTFYRVSPSRGPLSGGTWIGIEGSHLNAGSDVAVSVG
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NP_115 GRPCSFSWRNSREIRCLTPPGQSP-GSAPIIININRAQLTNPEVKYNYTEDPTILRIDPE
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NP_115 WSINSGGTLLTVTGTNLATVREPRIRAKYGGIERENGCLVYNDTTMVCRAPSVANPVRSP
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NP_115 KEAFAELQTDIHELTNDLDGAGIPFLDYRTYAMRVLFPGIEDHPVLKEMEVQAN----VE
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NP_115 EKGPIDAITGEARYSLSEDKLIRQQIDYKTLTLNCVNPENENAPEVPVKGLDCDTVTQAK
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NP_115 EKLLDAAYKGVPYSQRPKAADMDLEWRQGRMARIILQDEDVTTKIDNDWKRLNTLAHYQV
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NP_115 TDGSSVALVPKQTSAYNISNSSTFTK-SLSRYESMLRTASSPDSLRSRTPMITPDLESGT
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NP_115 KLWHLVKNHDHLDQREGDRGSKMVSEIYLTRLLATKGTLQKFVDDLFETIFSTAHRGSAL
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::::::::::::::::.:.:::.:::::::::::::::::::::::::::::::.:::::
NP_115 PLAIKYMFDFLDEQADKHQIHDADVRHTWKSNCLPLRFWVNVIKNPQFVFDIHKNSITDA
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::::::::::::::::::.:::::::::::::::::.::::::::::::::.::::::::
NP_115 CLSVVAQTFMDSCSTSEHKLGKDSPSNKLLYAKDIPNYKSWVERYYADIAKMPAISDQDM
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pF1KSD NAYLAEQSRLHAVEFNMLSALNEIYSYVSKYSEELIGALEQDEQARRQRLAYKVEQLINA
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NP_115 SAYLAEQSRLHLSQFNSMSALHEIYSYITKYKDEILAALEKDEQARRQRLRSKLEQVVDT
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pF1KSD MSIES
:.. :
NP_115 MALSS
>>XP_011511210 (OMIM: 601055) PREDICTED: plexin-A1 isofo (1914 aa)
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:::...: :::::::::::.:..::.:::.... ::::::::::. : ::::::.:::::
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:::::::::::::::::::.:::.::: .:::.:::::::::::::::::::::.:.:::
XP_011 ESRVALECKEAFAELQTDIHELTNDLDGAGIPFLDYRTYAMRVLFPGIEDHPVLKEMEVQ
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.: :::.: ::.::...: :::::::::: ::::::::::::::::::.:::..:::
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: ::::::::::.::::.:::::::::::::::::::::::.:::.::::::::::::::
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::: ::::.: : :::::::::.::: :..... :.:::.: .: ..::::::::.:::
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:::::::.:.::::::::: ::.::::::::::::::::::::::::::::::::::.::
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1900
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XP_011 TAHRGSALPLAIKYMFDFLDEQADKHQIHDADVRHTWKSNCLPLRFWVNVIKNPQFVFDI
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1790 1800 1810 1820 1830 1840
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pF1KSD PAISDQDMNAYLAEQSRLHAVEFNMLSALNEIYSYVSKYSEELIGALEQDEQARRQRLAY
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XP_011 PAISDQDMSAYLAEQSRLHLSQFNSMSALHEIYSYITKYKDEILAALEKDEQARRQRLRS
1850 1860 1870 1880 1890 1900
1900
pF1KSD KVEQLINAMSIES
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XP_011 KLEQVVDTMALSS
1910
>>NP_059984 (OMIM: 300022) plexin-A3 precursor [Homo sap (1871 aa)
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NP_059 MPSVCLLLLLF-LAVGGALGNRPFRAFVV--T
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pF1KSD KIPSDTLALVSHFDIFYIYGFASGGFVYFLTVQPETPEGVAINSAGDLFYTSRIVRLCKD
:::::::.: :::.:::::.:..::::::.: .: . . ...::. :.::.:::.:
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NP_059 ASPPRQTILCLFTLSNINAHIRRRIQSCYRGEGTLALPWLLNKELPCINTPMQINGNFCG
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]