FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0463, 1909 aa
1>>>pF1KSDA0463 1909 - 1909 aa - 1909 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2582+/-0.00127; mu= 19.5734+/- 0.076
mean_var=83.8741+/-16.391, 0's: 0 Z-trim(102.7): 61 B-trim: 45 in 1/48
Lambda= 0.140043
statistics sampled from 7026 (7080) to 7026 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.558), E-opt: 0.2 (0.217), width: 16
Scan time: 5.760
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31013.1 PLXNA2 gene_id:5362|Hs108|chr1 (1894) 12734 2584.1 0
CCDS43646.1 PLXNA4 gene_id:91584|Hs108|chr7 (1894) 8751 1779.4 0
CCDS33847.2 PLXNA1 gene_id:5361|Hs108|chr3 (1896) 8269 1682.0 0
CCDS14752.1 PLXNA3 gene_id:55558|Hs108|chrX (1871) 7671 1561.2 0
CCDS5826.1 PLXNA4 gene_id:91584|Hs108|chr7 ( 522) 1763 367.3 8.8e-101
CCDS43647.1 PLXNA4 gene_id:91584|Hs108|chr7 ( 492) 1718 358.2 4.6e-98
CCDS14729.1 PLXNB3 gene_id:5365|Hs108|chrX (1909) 1623 339.2 9e-92
CCDS55536.1 PLXNB3 gene_id:5365|Hs108|chrX (1932) 1623 339.2 9.1e-92
CCDS43035.1 PLXNB2 gene_id:23654|Hs108|chr22 (1838) 1128 239.2 1.1e-61
CCDS33854.1 PLXND1 gene_id:23129|Hs108|chr3 (1925) 1028 219.0 1.4e-55
CCDS2765.1 PLXNB1 gene_id:5364|Hs108|chr3 (2135) 902 193.6 7.1e-48
CCDS9049.1 PLXNC1 gene_id:10154|Hs108|chr12 (1568) 733 159.4 1e-37
CCDS43636.1 MET gene_id:4233|Hs108|chr7 (1390) 470 106.2 9.1e-22
CCDS47689.1 MET gene_id:4233|Hs108|chr7 (1408) 470 106.2 9.2e-22
CCDS58833.1 MST1R gene_id:4486|Hs108|chr3 (1351) 316 75.1 2.1e-12
CCDS2807.1 MST1R gene_id:4486|Hs108|chr3 (1400) 316 75.1 2.1e-12
CCDS82777.1 MST1R gene_id:4486|Hs108|chr3 (1294) 313 74.5 3e-12
>>CCDS31013.1 PLXNA2 gene_id:5362|Hs108|chr1 (1894 aa)
initn: 12734 init1: 12734 opt: 12734 Z-score: 13893.3 bits: 2584.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 12734; 99.9% identity (99.9% similar) in 1894 aa overlap (16-1909:1-1894)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MSTHRSRLLTAAPLSMEQRRPWPRALEVDSRSVVLLSVVWVLLAPPAAGMPQFSTFHSEN
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MEQRRPWPRALEVDSRSVVLLSVVWVLLAPPAAGMPQFSTFHSEN
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KSD RDWTFNHLTVHQGTGAVYVGAINRVYKLTGNLTIQVAHKTGPEEDNKSCYPPLIVQPCSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 RDWTFNHLTVHQGTGAVYVGAINRVYKLTGNLTIQVAHKTGPEEDNKSCYPPLIVQPCSE
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KSD VLTLTNNVNKLLIIDYSENRLLACGSLYQGVCKLLRLDDLFILVEPSHKKEHYLSSVNKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 VLTLTNNVNKLLIIDYSENRLLACGSLYQGVCKLLRLDDLFILVEPSHKKEHYLSSVNKT
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KSD GTMYGVIVRSEGEDGKLFIGTAVDGKQDYFPTLSSRKLPRDPESSAMLDYELHSDFVSSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 GTMYGVIVRSEGEDGKLFIGTAVDGKQDYFPTLSSRKLPRDPESSAMLDYELHSDFVSSL
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KSD IKIPSDTLALVSHFDIFYIYGFASGGFVYFLTVQPETPEGVAINSAGDLFYTSRIVRLCK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 IKIPSDTLALVSHFDIFYIYGFASGGFVYFLTVQPETPEGVAINSAGDLFYTSRIVRLCK
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KSD DDPKFHSYVSLPFGCTRAGVEYRLLQAAYLAKPGDSLAQAFNITSQDDVLFAIFSKGQKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 DDPKFHSYVSLPFGCTRAGVEYRLLQAAYLAKPGDSLAQAFNITSQDDVLFAIFSKGQKQ
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KSD YHHPPDDSALCAFPIRAINLQIKGRLQSCYQGEGNLELNWLLGKDVQCTKAPVPIDDNFC
::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 YHHPPDDSALCAFPIRAINLQIKERLQSCYQGEGNLELNWLLGKDVQCTKAPVPIDDNFC
350 360 370 380 390 400
430 440 450 460 470 480
pF1KSD GLDINQPLGGSTPVEGLTLYTTSRDRMTSVASYVYNGYSVVFVGTKSGKLKKIRADGPPH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 GLDINQPLGGSTPVEGLTLYTTSRDRMTSVASYVYNGYSVVFVGTKSGKLKKIRADGPPH
410 420 430 440 450 460
490 500 510 520 530 540
pF1KSD GGVQYEMVSVLKDGSPILRDMAFSIDQRYLYVMSERQVTRVPVESCEQYTTCGECLSSGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 GGVQYEMVSVLKDGSPILRDMAFSIDQRYLYVMSERQVTRVPVESCEQYTTCGECLSSGD
470 480 490 500 510 520
550 560 570 580 590 600
pF1KSD PHCGWCALHNMCSRRDKCQQAWEPNRFAASISQCVSLAVHPSSISVSEHSRLLSLVVSDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 PHCGWCALHNMCSRRDKCQQAWEPNRFAASISQCVSLAVHPSSISVSEHSRLLSLVVSDA
530 540 550 560 570 580
610 620 630 640 650 660
pF1KSD PDLSAGIACAFGNLTEVEGQVSGSQVICISPGPKDVPVIPLDQDWFGLELQLRSKETGKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 PDLSAGIACAFGNLTEVEGQVSGSQVICISPGPKDVPVIPLDQDWFGLELQLRSKETGKI
590 600 610 620 630 640
670 680 690 700 710 720
pF1KSD FVSTEFKFYNCSAHQLCLSCVNSAFRCHWCKYRNLCTHDPTTCSFQEGRINISEDCPQLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 FVSTEFKFYNCSAHQLCLSCVNSAFRCHWCKYRNLCTHDPTTCSFQEGRINISEDCPQLV
650 660 670 680 690 700
730 740 750 760 770 780
pF1KSD PTEEILIPVGEVKPITLKARNLPQPQSGQRGYECVLNIQGAIHRVPALRFNSSSVQCQNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 PTEEILIPVGEVKPITLKARNLPQPQSGQRGYECVLNIQGAIHRVPALRFNSSSVQCQNS
710 720 730 740 750 760
790 800 810 820 830 840
pF1KSD SYQYDGMDISNLAVDFAVVWNGNFIIDNPQDLKVHLYKCAAQRESCGLCLKADRKFECGW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SYQYDGMDISNLAVDFAVVWNGNFIIDNPQDLKVHLYKCAAQRESCGLCLKADRKFECGW
770 780 790 800 810 820
850 860 870 880 890 900
pF1KSD CSGERRCTLHQHCTSPSSPWLDWSSHNVKCSNPQITEILTVSGPPEGGTRVTIHGVNLGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 CSGERRCTLHQHCTSPSSPWLDWSSHNVKCSNPQITEILTVSGPPEGGTRVTIHGVNLGL
830 840 850 860 870 880
910 920 930 940 950 960
pF1KSD DFSEIAHHVQVAGVPCTPLPGEYIIAEQIVCEMGHALVGTTSGPVRLCIGECKPEFMTKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 DFSEIAHHVQVAGVPCTPLPGEYIIAEQIVCEMGHALVGTTSGPVRLCIGECKPEFMTKS
890 900 910 920 930 940
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD HQQYTFVNPSVLSLNPIRGPESGGTMVTITGHYLGAGSSVAVYLGNQTCEFYGRSMSEIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 HQQYTFVNPSVLSLNPIRGPESGGTMVTITGHYLGAGSSVAVYLGNQTCEFYGRSMSEIV
950 960 970 980 990 1000
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD CVSPPSSNGLGPVPVSVSVDRAHVDSNLQFEYIDDPRVQRIEPEWSIASGHTPLTITGFN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 CVSPPSSNGLGPVPVSVSVDRAHVDSNLQFEYIDDPRVQRIEPEWSIASGHTPLTITGFN
1010 1020 1030 1040 1050 1060
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD LDVIQEPRIRVKFNGKESVNVCKVVNTTTLTCLAPSLTTDYRPGLDTVERPDEFGFVFNN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LDVIQEPRIRVKFNGKESVNVCKVVNTTTLTCLAPSLTTDYRPGLDTVERPDEFGFVFNN
1070 1080 1090 1100 1110 1120
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD VQSLLIYNDTKFIYYPNPTFELLSPTGVLDQKPGSPIILKGKNLCPPASGGAKLNYTVLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 VQSLLIYNDTKFIYYPNPTFELLSPTGVLDQKPGSPIILKGKNLCPPASGGAKLNYTVLI
1130 1140 1150 1160 1170 1180
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KSD GETPCAVTVSETQLLCEPPNLTGQHKVMVHVGGMVFSPGSVSVISDSLLTLPAIVSIAAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 GETPCAVTVSETQLLCEPPNLTGQHKVMVHVGGMVFSPGSVSVISDSLLTLPAIVSIAAG
1190 1200 1210 1220 1230 1240
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KSD GSLLLIIVIIVLIAYKRKSRENDLTLKRLQMQMDNLESRVALECKEAFAELQTDINELTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 GSLLLIIVIIVLIAYKRKSRENDLTLKRLQMQMDNLESRVALECKEAFAELQTDINELTS
1250 1260 1270 1280 1290 1300
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KSD DLDRSGIPYLDYRTYAMRVLFPGIEDHPVLRELEVQGNGQQHVEKALKLFAQLINNKVFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 DLDRSGIPYLDYRTYAMRVLFPGIEDHPVLRELEVQGNGQQHVEKALKLFAQLINNKVFL
1310 1320 1330 1340 1350 1360
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KSD LTFIRTLELQRSFSMRDRGNVASLIMTGLQGRLEYATDVLKQLLSDLIDKNLENKNHPKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LTFIRTLELQRSFSMRDRGNVASLIMTGLQGRLEYATDVLKQLLSDLIDKNLENKNHPKL
1370 1380 1390 1400 1410 1420
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KSD LLRRTESVAEKMLTNWFAFLLHKFLKECAGEPLFMLYCAIKQQMEKGPIDAITGEARYSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LLRRTESVAEKMLTNWFAFLLHKFLKECAGEPLFMLYCAIKQQMEKGPIDAITGEARYSL
1430 1440 1450 1460 1470 1480
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KSD SEDKLIRQQIEYKTLILNCVNPDNENSPEIPVKVLNCDTITQVKEKILDAVYKNVPYSQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SEDKLIRQQIEYKTLILNCVNPDNENSPEIPVKVLNCDTITQVKEKILDAVYKNVPYSQR
1490 1500 1510 1520 1530 1540
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KSD PRAVDMDLEWRQGRIARVVLQDEDITTKIEGDWKRLNTLMHYQVSDRSVVALVPKQTSSY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 PRAVDMDLEWRQGRIARVVLQDEDITTKIEGDWKRLNTLMHYQVSDRSVVALVPKQTSSY
1550 1560 1570 1580 1590 1600
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KSD NIPASASISRTSISRYDSSFRYTGSPDSLRSRAPMITPDLESGVKVWHLVKNHDHGDQKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 NIPASASISRTSISRYDSSFRYTGSPDSLRSRAPMITPDLESGVKVWHLVKNHDHGDQKE
1610 1620 1630 1640 1650 1660
1690 1700 1710 1720 1730 1740
pF1KSD GDRGSKMVSEIYLTRLLATKGTLQKFVDDLFETLFSTVHRGSALPLAIKYMFDFLDEQAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 GDRGSKMVSEIYLTRLLATKGTLQKFVDDLFETLFSTVHRGSALPLAIKYMFDFLDEQAD
1670 1680 1690 1700 1710 1720
1750 1760 1770 1780 1790 1800
pF1KSD RHSIHDTDVRHTWKSNCLPLRFWVNVIKNPQFVFDIHKGSITDACLSVVAQTFMDSCSTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 RHSIHDTDVRHTWKSNCLPLRFWVNVIKNPQFVFDIHKGSITDACLSVVAQTFMDSCSTS
1730 1740 1750 1760 1770 1780
1810 1820 1830 1840 1850 1860
pF1KSD EHRLGKDSPSNKLLYAKDIPSYKSWVERYYADIAKLPAISDQDMNAYLAEQSRLHAVEFN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 EHRLGKDSPSNKLLYAKDIPSYKSWVERYYADIAKLPAISDQDMNAYLAEQSRLHAVEFN
1790 1800 1810 1820 1830 1840
1870 1880 1890 1900
pF1KSD MLSALNEIYSYVSKYSEELIGALEQDEQARRQRLAYKVEQLINAMSIES
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MLSALNEIYSYVSKYSEELIGALEQDEQARRQRLAYKVEQLINAMSIES
1850 1860 1870 1880 1890
>>CCDS43646.1 PLXNA4 gene_id:91584|Hs108|chr7 (1894 aa)
initn: 7867 init1: 6103 opt: 8751 Z-score: 9544.2 bits: 1779.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 8751; 67.9% identity (87.4% similar) in 1870 aa overlap (44-1909:31-1894)
20 30 40 50 60 70
pF1KSD LSMEQRRPWPRALEVDSRSVVLLSVVWVLLAPPAAGMPQFSTFHSENRDWTFNHLTVHQG
:: . . .: ::..: . ::::.: .
CCDS43 MKAMPWNWTCLLSHLLMVGMGSSTLLTRQPAPLSQKQRSFVTFRGEPAE-GFNHLVVDER
10 20 30 40 50
80 90 100 110 120 130
pF1KSD TGAVYVGAINRVYKLTGNLTIQVAHKTGPEEDNKSCYPPLIVQPCSEVLTLTNNVNKLLI
:: .:.::.::.:::...: . :.:.:::.::: .:::: ::: :.: :: ::::::.:.
CCDS43 TGHIYLGAVNRIYKLSSDLKVLVTHETGPDEDNPKCYPPRIVQTCNEPLTTTNNVNKMLL
60 70 80 90 100 110
140 150 160 170 180 190
pF1KSD IDYSENRLLACGSLYQGVCKLLRLDDLFILVEPSHKKEHYLSSVNKTGTMYGVIVRSEGE
:::.::::.::::::::.::::::.::: : :: ::::::::.::..:...:::: .
CCDS43 IDYKENRLIACGSLYQGICKLLRLEDLFKLGEPYHKKEHYLSGVNESGSVFGVIVSYSNL
120 130 140 150 160 170
200 210 220 230 240 250
pF1KSD DGKLFIGTAVDGKQDYFPTLSSRKLPRDPESSAMLDYELHSDFVSSLIKIPSDTLALVSH
: ::::.:::::: .::::.::::: .. :...:. : .:..::.:.:::::::....
CCDS43 DDKLFIATAVDGKPEYFPTISSRKLTKNSEADGMFAYVFHDEFVASMIKIPSDTFTIIPD
180 190 200 210 220 230
260 270 280 290 300 310
pF1KSD FDIFYIYGFASGGFVYFLTVQPE--TPEGVAINSAGDLFYTSRIVRLCKDDPKFHSYVSL
:::.:.:::.::.::::::.::: .: : ... . :::..:::::.: :.::: .
CCDS43 FDIYYVYGFSSGNFVYFLTLQPEMVSPPG---STTKEQVYTSKLVRLCKEDTAFNSYVEV
240 250 260 270 280 290
320 330 340 350 360 370
pF1KSD PFGCTRAGVEYRLLQAAYLAKPGDSLAQAFNITSQDDVLFAIFSKGQKQYHHPPDDSALC
:.:: :.::::::::::::.: : :...... .::.::..::::::. . :.::::
CCDS43 PIGCERSGVEYRLLQAAYLSKAGAVLGRTLGVHPDDDLLFTVFSKGQKRKMKSLDESALC
300 310 320 330 340 350
380 390 400 410 420 430
pF1KSD AFPIRAINLQIKGRLQSCYQGEGNLELNWLLGKDVQCTKAPVPIDDNFCGLDINQPLGGS
: .. :: .:: ::::::.:::.:.: :: ::. :..: . :::::::::.: ::: :
CCDS43 IFILKQINDRIKERLQSCYRGEGTLDLAWLKVKDIPCSSALLTIDDNFCGLDMNAPLGVS
360 370 380 390 400 410
440 450 460 470 480 490
pF1KSD TPVEGLTLYTTSRDRMTSVASYVYNGYSVVFVGTKSGKLKKIRADGPPHGGVQYEMVSVL
:.:. ..: .::::::: .:::...:..:::::::::::::.::: ...::: :.:.
CCDS43 DMVRGIPVFTEDRDRMTSVIAYVYKNHSLAFVGTKSGKLKKIRVDGPRGNALQYETVQVV
420 430 440 450 460 470
500 510 520 530 540 550
pF1KSD KDGSPILRDMAFSIDQRYLYVMSERQVTRVPVESCEQYTTCGECLSSGDPHCGWCALHNM
: :.::::::: :.. ::.:::::.:::::::: :: .:::::.:::::::::.:::
CCDS43 DPG-PVLRDMAFSKDHEQLYIMSERQLTRVPVESCGQYQSCGECLGSGDPHCGWCVLHNT
480 490 500 510 520 530
560 570 580 590 600 610
pF1KSD CSRRDKCQQAWEPNRFAASISQCVSLAVHPSSISVSEHSRLLSLVVSDAPDLSAGIACAF
:.:...:... :: :::. ..::: :.:::..::::... :: : . ..:.::::. :.:
CCDS43 CTRKERCERSKEPRRFASEMKQCVRLTVHPNNISVSQYNVLLVLETYNVPELSAGVNCTF
540 550 560 570 580 590
620 630 640 650 660 670
pF1KSD GNLTEVEGQVSGSQVICISPGPKDVP-VIPLDQDWFGLELQLRSKETGKIFVSTEFKFYN
.:.:..: : :.:. : ::. :.:: .: . : ..:::.::::: :.:: : :::
CCDS43 EDLSEMDGLVVGNQIQCYSPAAKEVPRIITENGDHHVVQLQLKSKETGMTFASTSFVFYN
600 610 620 630 640 650
680 690 700 710 720 730
pF1KSD CSAHQLCLSCVNSAFRCHWCKYRNLCTHDPTTCSFQEGRINISEDCPQLVPTEEILIPVG
::.:. :::::.: .::::::::..::::: ::::::::... ::::::. ...::.::
CCDS43 CSVHNSCLSCVESPYRCHWCKYRHVCTHDPKTCSFQEGRVKLPEDCPQLLRVDKILVPVE
660 670 680 690 700 710
740 750 760 770 780 790
pF1KSD EVKPITLKARNLPQPQSGQRGYECVLNIQGAIHRVPALRFNSSSVQCQNSSYQYDGMDIS
.:::::::.::::::::::::::.:::::. .::::::::::::::::.::.:.::.:.
CCDS43 VIKPITLKAKNLPQPQSGQRGYECILNIQGSEQRVPALRFNSSSVQCQNTSYSYEGMEIN
720 730 740 750 760 770
800 810 820 830 840 850
pF1KSD NLAVDFAVVWNGNFIIDNPQDLKVHLYKCAAQRESCGLCLKADRKFECGWCSGERRCTLH
:: :...:::::.: :::: . :::::::.:.::::::::::: : ::::.: .:::.
CCDS43 NLPVELTVVWNGHFNIDNPAQNKVHLYKCGAMRESCGLCLKADPDFACGWCQGPGQCTLR
780 790 800 810 820 830
860 870 880 890 900 910
pF1KSD QHCTSPSSPWLDWSSHNVKCSNPQITEILTVSGPPEGGTRVTIHGVNLGLDFSEIAHHVQ
::: . : ::. :. . ::.::.::::. :.:: ::::.:::.: ::::.: .:: ::.
CCDS43 QHCPAQESQWLELSGAKSKCTNPRITEIIPVTGPREGGTKVTIRGENLGLEFRDIASHVK
840 850 860 870 880 890
920 930 940 950 960 970
pF1KSD VAGVPCTPLPGEYIIAEQIVCEMGHALVGTTSGPVRLCIGECKPEFMTKSHQQYTFVNPS
:::: :.:: :: :::::::::.: . .: :..:.. :.::::..: : : :.. .
CCDS43 VAGVECSPLVDGYIPAEQIVCEMGEAKPSQHAGFVEICVAVCRPEFMARSSQLYYFMTLT
900 910 920 930 940 950
980 990 1000 1010 1020 1030
pF1KSD VLSLNPIRGPESGGTMVTITGHYLGAGSSVAVYLGNQTCEFYGRSMSEIVCVSPPSSNGL
. .:.: ::: ::::.::::: :.:::.:.:..:.: : :. :: : ::: . ::. .
CCDS43 LSDLKPSRGPMSGGTQVTITGTNLNAGSNVVVMFGKQPCLFHRRSPSYIVC-NTTSSDEV
960 970 980 990 1000 1010
1040 1050 1060 1070 1080 1090
pF1KSD GPVPVSVSVDRAHVDSNLQFEYIDDPRVQRIEPEWSIASGHTPLTITGFNLDVIQEPRIR
. :::.::::.. ..: :.:..:: . ::::::::.::.::... : .::.::.:.::
CCDS43 LEMKVSVQVDRAKIHQDLVFQYVEDPTIVRIEPEWSIVSGNTPIAVWGTHLDLIQNPQIR
1020 1030 1040 1050 1060 1070
1100 1110 1120 1130 1140 1150
pF1KSD VKFNGKESVNVCKVVNTTTLTCLAPSLTTDYRPGLDTVERPDEFGFVFNNVQSLLIYNDT
.: .::: .:.:.:.:.: .:: ::.:. : .:::.::::...::::::: : :
CCDS43 AKHGGKEHINICEVLNATEMTCQAPALALGPDHQSDLTERPEEFGFILDNVQSLLILNKT
1080 1090 1100 1110 1120 1130
1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD KFIYYPNPTFELLSPTGVLDQKPGSPIILKGKNLCPPASGG-AKLNYTVLIGETPCAVTV
.: :::::.:: ..:.:.:. :::.::::::::: ::..:: .:::::::.:: ::.:::
CCDS43 NFTYYPNPVFEAFGPSGILELKPGTPIILKGKNLIPPVAGGNVKLNYTVLVGEKPCTVTV
1140 1150 1160 1170 1180 1190
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KSD SETQLLCEPPNLTGQHKVMVHVGGMVFSPGSVSVISDSLLTLPAIVSIAAGGSLLLIIVI
:..::::: ::: :.::::..:::: .::: : . :: :.::::::::..:.::.:...
CCDS43 SDVQLLCESPNLIGRHKVMARVGGMEYSPGMVYIAPDSPLSLPAIVSIAVAGGLLIIFIV
1200 1210 1220 1230 1240 1250
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KSD IVLIAYKRKSRENDLTLKRLQMQMDNLESRVALECKEAFAELQTDINELTSDLDRSGIPY
:::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::: .:::.
CCDS43 AVLIAYKRKSRESDLTLKRLQMQMDNLESRVALECKEAFAELQTDIHELTSDLDGAGIPF
1260 1270 1280 1290 1300 1310
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KSD LDYRTYAMRVLFPGIEDHPVLRELEVQGNGQQHVEKALKLFAQLINNKVFLLTFIRTLEL
::::::.:::::::::::::::.::: : :..:::.:::::::::::::::.::::::
CCDS43 LDYRTYTMRVLFPGIEDHPVLRDLEVPGYRQERVEKGLKLFAQLINNKVFLLSFIRTLES
1320 1330 1340 1350 1360 1370
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KSD QRSFSMRDRGNVASLIMTGLQGRLEYATDVLKQLLSDLIDKNLENKNHPKLLLRRTESVA
:::::::::::::::::: ::..::::::::::::.::::::::.:::::::::::::::
CCDS43 QRSFSMRDRGNVASLIMTVLQSKLEYATDVLKQLLADLIDKNLESKNHPKLLLRRTESVA
1380 1390 1400 1410 1420 1430
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KSD EKMLTNWFAFLLHKFLKECAGEPLFMLYCAIKQQMEKGPIDAITGEARYSLSEDKLIRQQ
::::::::.:::.:::::::::::: :.::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 EKMLTNWFTFLLYKFLKECAGEPLFSLFCAIKQQMEKGPIDAITGEARYSLSEDKLIRQQ
1440 1450 1460 1470 1480 1490
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KSD IEYKTLILNCVNPDNENSPEIPVKVLNCDTITQVKEKILDAVYKNVPYSQRPRAVDMDLE
:.::::.:.::.::: ::::.:::.::::::::::::::::..:::: :.::.:.:::::
CCDS43 IDYKTLVLSCVSPDNANSPEVPVKILNCDTITQVKEKILDAIFKNVPCSHRPKAADMDLE
1500 1510 1520 1530 1540 1550
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KSD WRQGRIARVVLQDEDITTKIEGDWKRLNTLMHYQVSDRSVVALVPKQTSSYNIPASASIS
:::: ::..:::::::::::.:::::::: :::: : :::::: ::...:: ....:
CCDS43 WRQGSGARMILQDEDITTKIENDWKRLNTLAHYQVPDGSVVALVSKQVTAYNAVNNSTVS
1560 1570 1580 1590 1600 1610
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KSD RTSISRYDSSFRYTGSPDSLRSRAPMITPDLESGVKVWHLVKNHDHGDQKEGDRGSKMVS
::: :.:.. .::::::::::::.::::::::::::.:::::::.:::::::::::::::
CCDS43 RTSASKYENMIRYTGSPDSLRSRTPMITPDLESGVKMWHLVKNHEHGDQKEGDRGSKMVS
1620 1630 1640 1650 1660 1670
1690 1700 1710 1720 1730 1740
pF1KSD EIYLTRLLATKGTLQKFVDDLFETLFSTVHRGSALPLAIKYMFDFLDEQADRHSIHDTDV
::::::::::::::::::::::::.:::.::::::::::::::::::::::.:.::: :
CCDS43 EIYLTRLLATKGTLQKFVDDLFETIFSTAHRGSALPLAIKYMFDFLDEQADKHGIHDPHV
1680 1690 1700 1710 1720 1730
1750 1760 1770 1780 1790 1800
pF1KSD RHTWKSNCLPLRFWVNVIKNPQFVFDIHKGSITDACLSVVAQTFMDSCSTSEHRLGKDSP
::::::::::::::::.::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 RHTWKSNCLPLRFWVNMIKNPQFVFDIHKNSITDACLSVVAQTFMDSCSTSEHRLGKDSP
1740 1750 1760 1770 1780 1790
1810 1820 1830 1840 1850 1860
pF1KSD SNKLLYAKDIPSYKSWVERYYADIAKLPAISDQDMNAYLAEQSRLHAVEFNMLSALNEIY
::::::::::::::.::::::.::.:.:::::::::::::::::.: ::: .:::.::.
CCDS43 SNKLLYAKDIPSYKNWVERYYSDIGKMPAISDQDMNAYLAEQSRMHMNEFNTMSALSEIF
1800 1810 1820 1830 1840 1850
1870 1880 1890 1900
pF1KSD SYVSKYSEELIGALEQDEQARRQRLAYKVEQLINAMSIES
:::.:::::..: :..:.: .:.::::.::.:. ::..:
CCDS43 SYVGKYSEEILGPLDHDDQCGKQKLAYKLEQVITLMSLDS
1860 1870 1880 1890
>>CCDS33847.2 PLXNA1 gene_id:5361|Hs108|chr3 (1896 aa)
initn: 7066 init1: 1613 opt: 8269 Z-score: 9017.9 bits: 1682.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 8273; 63.6% identity (85.0% similar) in 1903 aa overlap (23-1909:5-1896)
10 20 30 40 50
pF1KSD MSTHRSRLLTAAPLSMEQRRPWPRALEVDSRSVVLLSVV---WVLLAPPAAG---MPQFS
::.:.: ..:: .. :. . : :: .: :
CCDS33 MPLPPRSLQVLLLLLLLLLLLPGMWAEAGLPRAGGGSQPPFR
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KSD TFHSENRDWTFNHLTVHQGTGAVYVGAINRVYKLTGNLTIQVAHKTGPEEDNKSCYPPLI
:: . :: ..::.::. :: :::::.::.:::.::::. :: ::: :::..::::
CCDS33 TFSAS--DWGLTHLVVHEQTGEVYVGAVNRIYKLSGNLTLLRAHVTGPVEDNEKCYPPPS
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KSD VQPCSEVLTLTNNVNKLLIIDYSENRLLACGSLYQGVCKLLRLDDLFILVEPSHKKEHYL
:: : . : :.::::::..::. :::::::: ::.:..::::::: : :: :.:::::
CCDS33 VQSCPHGLGSTDNVNKLLLLDYAANRLLACGSASQGICQFLRLDDLFKLGEPHHRKEHYL
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KSD SSVNKTGTMYGVIVRSEGEDG--KLFIGTAVDGKQDYFPTLSSRKLPRDPESSAMLDYEL
:::...:.: ::.. . .: :::.:: .:::..::::::::.: . :.. :. .
CCDS33 SSVQEAGSMAGVLIAGPPGQGQAKLFVGTPIDGKSEYFPTLSSRRLMANEEDADMFGFVY
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KSD HSDFVSSLIKIPSDTLALVSHFDIFYIYGFASGGFVYFLTVQPETPEGVAINSAGDLFYT
...:::: .:::::::. :::.:.:.: : :::.::.: .: . .. ..::. :.:
CCDS33 QDEFVSSQLKIPSDTLSKFPAFDIYYVYSFRSEQFVYYLTLQLDT-QLTSPDAAGEHFFT
230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KSD SRIVRLCKDDPKFHSYVSLPFGCTRAGVEYRLLQAAYLAKPGDSLAQAFNITSQDDVLFA
:.::::: :::::.::: .:.:: .:::::::.: :::..:: .::. .... ..::::.
CCDS33 SKIVRLCVDDPKFYSYVEFPIGCEQAGVEYRLVQDAYLSRPGRALAHQLGLAEDEDVLFT
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KSD IFSKGQKQYHHPPDDSALCAFPIRAINLQIKGRLQSCYQGEGNLELNWLLGKDVQCTKAP
.:..:::. .:: .:::: : .:::. .:: :.::::.:::.: : :::.:.. : ..:
CCDS33 VFAQGQKNRVKPPKESALCLFTLRAIKEKIKERIQSCYRGEGKLSLPWLLNKELGCINSP
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KSD VPIDDNFCGLDINQPLGGSTPVEGLTLYTTSRDRMTSVASYVYNGYSVVFVGTKSGKLKK
. :::.::: :.::::::.. .:: :.. . : .:.::.: : : .:::.::.::...:
CCDS33 LQIDDDFCGQDFNQPLGGTVTIEGTPLFVDKDDGLTAVAAYDYRGRTVVFAGTRSGRIRK
400 410 420 430 440 450
480 490 500 510 520
pF1KSD IRADGPPHGG---VQYEMVSVLKDGSPILRDMAFSIDQRYLYVMSERQVTRVPVESCEQY
: .: :: . :: : : ..:::::::...: ...:::.:.:.:::::::::: ::
CCDS33 ILVDLSNPGGRPALAYESV-VAQEGSPILRDLVLSPNHQYLYAMTEKQVTRVPVESCVQY
460 470 480 490 500 510
530 540 550 560 570 580
pF1KSD TTCGECLSSGDPHCGWCALHNMCSRRDKCQQAWEPNRFAASISQCVSLAVHPSSISVSEH
:.: ::.: :::::::.::..::::: :..: ::.::::.. :::.:.:.: ..::.
CCDS33 TSCELCLGSRDPHCGWCVLHSICSRRDACERADEPQRFAADLLQCVQLTVQPRNVSVTMS
520 530 540 550 560 570
590 600 610 620 630 640
pF1KSD SRLLSLVVSDAPDLSAGIACAFGNLTEVEGQVSGSQVICISPGPKDV-PVIPLDQDWFGL
. : : . ..::::::. :.: ..:: :. . ... : ::. ..: :. . : .
CCDS33 QVPLVLQAWNVPDLSAGVNCSFEDFTESESVLEDGRIHCRSPSAREVAPITRGQGDQRVV
580 590 600 610 620 630
650 660 670 680 690 700
pF1KSD ELQLRSKETGKIFVSTEFKFYNCSAHQLCLSCVNSAFRCHWCKYRNLCTHDPTTCSFQEG
.: :.:::::: :.:..: :::::.:: ::::::..: :::::::..:::. . :.: ::
CCDS33 KLYLKSKETGKKFASVDFVFYNCSVHQSCLSCVNGSFPCHWCKYRHVCTHNVADCAFLEG
640 650 660 670 680 690
710 720 730 740 750 760
pF1KSD RINISEDCPQLVPTEEILIPVGEVKPITLKARNLPQPQSGQRGYECVLNIQGAIHRVPAL
:.:.::::::..:. .: .::: :::::: ::::::::::::::::...: :. :: ::
CCDS33 RVNVSEDCPQILPSTQIYVPVGVVKPITLAARNLPQPQSGQRGYECLFHIPGSPARVTAL
700 710 720 730 740 750
770 780 790 800 810 820
pF1KSD RFNSSSVQCQNSSYQYDGMDISNLAVDFAVVWNGNFIIDNPQDLKVHLYKCAAQRESCGL
::::::.:::::::.:.: :.:.: :...:::::::.:::::....::::: : ::::::
CCDS33 RFNSSSLQCQNSSYSYEGNDVSDLPVNLSVVWNGNFVIDNPQNIQAHLYKCPALRESCGL
760 770 780 790 800 810
830 840 850 860 870 880
pF1KSD CLKADRKFECGWCSGERRCTLHQHCT--SPSSPWLDWSSHNVKCSNPQITEILTVSGPPE
::::: .:::::: .::::.:..::. .:.: :. . .:..:.: .. .:: .
CCDS33 CLKADPRFECGWCVAERRCSLRHHCAADTPAS-WMHARHGSSRCTDPKILKLSPETGPRQ
820 830 840 850 860 870
890 900 910 920 930 940
pF1KSD GGTRVTIHGVNLGLDFSEIAHHVQVAGVPCTPLPGEYIIAEQIVCEMGHAL-VGTTSGPV
::::.:: : :::: : .. :.:. : :.:. .::: :::::::.: : : . .. :
CCDS33 GGTRLTITGENLGLRFEDVRLGVRVGKVLCSPVESEYISAEQIVCEIGDASSVRAHDALV
880 890 900 910 920 930
950 960 970 980 990 1000
pF1KSD RLCIGECKPEFMTKSHQQYTFVNPSVLSLNPIRGPESGGTMVTITGHYLGAGSSVAVYLG
..:. .:.:.. . : ...:::.:. ..: ::: :::: . : : .:.:::.::: .:
CCDS33 EVCVRDCSPHYRALSPKRFTFVTPTFYRVSPSRGPLSGGTWIGIEGSHLNAGSDVAVSVG
940 950 960 970 980 990
1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KSD NQTCEFYGRSMSEIVCVSPPSSNGLGPVPVSVSVDRAHV-DSNLQFEYIDDPRVQRIEPE
.. : : :. :: :..::... : .:. ....::.. . .....: .:: . ::.::
CCDS33 GRPCSFSWRNSREIRCLTPPGQSP-GSAPIIININRAQLTNPEVKYNYTEDPTILRIDPE
1000 1010 1020 1030 1040 1050
1070 1080 1090 1100 1110 1120
pF1KSD WSIASGHTPLTITGFNLDVIQEPRIRVKFNGKESVNVCKVVNTTTLTCLAPSLTTDYRPG
::: :: : ::.:: :: ...:::::.:..: : : : : : ::..: :::... :
CCDS33 WSINSGGTLLTVTGTNLATVREPRIRAKYGGIERENGCLVYNDTTMVCRAPSVANPVRSP
1060 1070 1080 1090 1100 1110
1130 1140 1150 1160 1170 1180
pF1KSD LDTVERPDEFGFVFNNVQSLLIYNDTKFIYYPNPTFELLSPTGVLDQKPGSPIILKGKNL
. :::::.:::..::.:::. :.:.:.:::.:..: :::::.:. ::.::.::::.::
CCDS33 PELGERPDELGFVMDNVRSLLVLNSTSFLYYPDPVLEPLSPTGLLELKPSSPLILKGRNL
1120 1130 1140 1150 1160 1170
1190 1200 1210 1220 1230 1240
pF1KSD CPPASGGAKLNYTVLIGETPCAVTVSETQLLCEPPNLTGQHKVMVHVGGMVFSPGSVSVI
::: :...:::::::: :::..:::::::::: ::::::::: :..::. ::::...:
CCDS33 LPPAPGNSRLNYTVLIGSTPCTLTVSETQLLCEAPNLTGQHKVTVRAGGFEFSPGTLQVY
1180 1190 1200 1210 1220 1230
1250 1260 1270 1280 1290 1300
pF1KSD SDSLLTLPAIVSIAAGGSLLLIIVIIVLIAYKRKSRENDLTLKRLQMQMDNLESRVALEC
:::::::::::.:..::.:::.... ::::::::::. : ::::::.:::::::::::::
CCDS33 SDSLLTLPAIVGIGGGGGLLLLVIVAVLIAYKRKSRDADRTLKRLQLQMDNLESRVALEC
1240 1250 1260 1270 1280 1290
1310 1320 1330 1340 1350 1360
pF1KSD KEAFAELQTDINELTSDLDRSGIPYLDYRTYAMRVLFPGIEDHPVLRELEVQGNGQQHVE
:::::::::::.:::.::: .:::.:::::::::::::::::::::.:.:::.: ::
CCDS33 KEAFAELQTDIHELTNDLDGAGIPFLDYRTYAMRVLFPGIEDHPVLKEMEVQAN----VE
1300 1310 1320 1330 1340 1350
1370 1380 1390 1400 1410 1420
pF1KSD KALKLFAQLINNKVFLLTFIRTLELQRSFSMRDRGNVASLIMTGLQGRLEYATDVLKQLL
:.: ::.::...: :::::::::: ::::::::::::::::::.:::..:::: ::::::
CCDS33 KSLTLFGQLLTKKHFLLTFIRTLEAQRSFSMRDRGNVASLIMTALQGEMEYATGVLKQLL
1360 1370 1380 1390 1400 1410
1430 1440 1450 1460 1470 1480
pF1KSD SDLIDKNLENKNHPKLLLRRTESVAEKMLTNWFAFLLHKFLKECAGEPLFMLYCAIKQQM
::::.::::.:::::::::::::::::::::::.:::.::::::::::::::::::::::
CCDS33 SDLIEKNLESKNHPKLLLRRTESVAEKMLTNWFTFLLYKFLKECAGEPLFMLYCAIKQQM
1420 1430 1440 1450 1460 1470
1490 1500 1510 1520 1530 1540
pF1KSD EKGPIDAITGEARYSLSEDKLIRQQIEYKTLILNCVNPDNENSPEIPVKVLNCDTITQVK
::::::::::::::::::::::::::.:::: ::::::.:::.::.::: :.:::.::.:
CCDS33 EKGPIDAITGEARYSLSEDKLIRQQIDYKTLTLNCVNPENENAPEVPVKGLDCDTVTQAK
1480 1490 1500 1510 1520 1530
1550 1560 1570 1580 1590 1600
pF1KSD EKILDAVYKNVPYSQRPRAVDMDLEWRQGRIARVVLQDEDITTKIEGDWKRLNTLMHYQV
::.:::.::.:::::::.:.::::::::::.::..:::::.::::..:::::::: ::::
CCDS33 EKLLDAAYKGVPYSQRPKAADMDLEWRQGRMARIILQDEDVTTKIDNDWKRLNTLAHYQV
1540 1550 1560 1570 1580 1590
1610 1620 1630 1640 1650 1660
pF1KSD SDRSVVALVPKQTSSYNIPASASISRTSISRYDSSFRYTGSPDSLRSRAPMITPDLESGV
.: : :::::::::.::: :..... :.:::.: .: ..::::::::.::::::::::.
CCDS33 TDGSSVALVPKQTSAYNISNSSTFTK-SLSRYESMLRTASSPDSLRSRTPMITPDLESGT
1600 1610 1620 1630 1640 1650
1670 1680 1690 1700 1710 1720
pF1KSD KVWHLVKNHDHGDQKEGDRGSKMVSEIYLTRLLATKGTLQKFVDDLFETLFSTVHRGSAL
:.::::::::: ::.::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.::::::
CCDS33 KLWHLVKNHDHLDQREGDRGSKMVSEIYLTRLLATKGTLQKFVDDLFETIFSTAHRGSAL
1660 1670 1680 1690 1700 1710
1730 1740 1750 1760 1770 1780
pF1KSD PLAIKYMFDFLDEQADRHSIHDTDVRHTWKSNCLPLRFWVNVIKNPQFVFDIHKGSITDA
::::::::::::::::.:.:::.:::::::::::::::::::::::::::::::.:::::
CCDS33 PLAIKYMFDFLDEQADKHQIHDADVRHTWKSNCLPLRFWVNVIKNPQFVFDIHKNSITDA
1720 1730 1740 1750 1760 1770
1790 1800 1810 1820 1830 1840
pF1KSD CLSVVAQTFMDSCSTSEHRLGKDSPSNKLLYAKDIPSYKSWVERYYADIAKLPAISDQDM
::::::::::::::::::.:::::::::::::::::.::::::::::::::.::::::::
CCDS33 CLSVVAQTFMDSCSTSEHKLGKDSPSNKLLYAKDIPNYKSWVERYYADIAKMPAISDQDM
1780 1790 1800 1810 1820 1830
1850 1860 1870 1880 1890 1900
pF1KSD NAYLAEQSRLHAVEFNMLSALNEIYSYVSKYSEELIGALEQDEQARRQRLAYKVEQLINA
.:::::::::: .:: .:::.:::::..::..:...:::.::::::::: :.::....
CCDS33 SAYLAEQSRLHLSQFNSMSALHEIYSYITKYKDEILAALEKDEQARRQRLRSKLEQVVDT
1840 1850 1860 1870 1880 1890
pF1KSD MSIES
:.. :
CCDS33 MALSS
>>CCDS14752.1 PLXNA3 gene_id:55558|Hs108|chrX (1871 aa)
initn: 6380 init1: 2695 opt: 7671 Z-score: 8365.1 bits: 1561.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 7671; 59.8% identity (82.8% similar) in 1882 aa overlap (32-1909:3-1871)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD STHRSRLLTAAPLSMEQRRPWPRALEVDSRSVVLLSVVWVLLAPPAAGMPQFSTFHSENR
:: :: ... : . : : : .:
CCDS14 MPSVCLLLLLF-LAVGGALGNRPFRAFVV--T
10 20
70 80 90 100 110 120
pF1KSD DWTFNHLTVHQGTGAVYVGAINRVYKLTGNLTIQVAHKTGPEEDNKSCYPPLIVQPCSEV
: :..::.::. :: :.:::.:::.::. ::: :: ::: ::: :::: .. :..
CCDS14 DTTLTHLAVHRVTGEVFVGAVNRVFKLAPNLTELRAHVTGPVEDNARCYPPPSMRVCAHR
30 40 50 60 70 80
130 140 150 160 170 180
pF1KSD LTLTNNVNKLLIIDYSENRLLACGSLYQGVCKLLRLDDLFILVEPSHKKEHYLSSVNKTG
:. ..:.::::.:::. ::.::::..::.:..::::::: : :: :.::::::....
CCDS14 LAPVDNINKLLLIDYAARRLVACGSIWQGICQFLRLDDLFKLGEPHHRKEHYLSGAQEPD
90 100 110 120 130 140
190 200 210 220 230 240
pF1KSD TMYGVIVRSEGEDGKLFIGTAVDGKQDYFPTLSSRKLPRDPESSAMLDYELHSDFVSSLI
.: ::::.. .:::.:::::::..:::::::::: : .:. :.. ...:::: :
CCDS14 SMAGVIVEQGQGPSKLFVGTAVDGKSEYFPTLSSRKLISDEDSADMFSLVYQDEFVSSQI
150 160 170 180 190 200
250 260 270 280 290 300
pF1KSD KIPSDTLALVSHFDIFYIYGFASGGFVYFLTVQPETPEGVAINSAGDLFYTSRIVRLCKD
:::::::.: :::.:::::.:..::::::.: .: . . ...::. :.::.:::.:
CCDS14 KIPSDTLSLYPAFDIYYIYGFVSASFVYFLTLQLDTQQTL-LDTAGEKFFTSKIVRMCAG
210 220 230 240 250 260
310 320 330 340 350 360
pF1KSD DPKFHSYVSLPFGCTRAGVEYRLLQAAYLAKPGDSLAQAFNITSQDDVLFAIFSKGQKQY
: .:.::: .:.::. ::::::.:.:.::::: ::::... ...::::.:::.:::.
CCDS14 DSEFYSYVEFPIGCSWRGVEYRLVQSAHLAKPGLLLAQALGVPADEDVLFTIFSQGQKNR
270 280 290 300 310 320
370 380 390 400 410 420
pF1KSD HHPPDDSALCAFPIRAINLQIKGRLQSCYQGEGNLELNWLLGKDVQCTKAPVPIDDNFCG
:: .. :: : . :: .:. :.::::.:::.: : :::.:.. : ..:. :. ::::
CCDS14 ASPPRQTILCLFTLSNINAHIRRRIQSCYRGEGTLALPWLLNKELPCINTPMQINGNFCG
330 340 350 360 370 380
430 440 450 460 470 480
pF1KSD LDINQPLGGSTPVEGLTLYTTSRDRMTSVASYVYNGYSVVFVGTKSGKLKKIRADGPPHG
: .:::::: .::: : . : : :.:::.:.: .::::.::.::.:::.:.:: .
CCDS14 LVLNQPLGGLHVIEGLPLLADSTDGMASVAAYTYRQHSVVFIGTRSGSLKKVRVDGFQDA
390 400 410 420 430 440
490 500 510 520 530 540
pF1KSD GVQYEMVSVLKDGSPILRDMAFSIDQRYLYVMSERQVTRVPVESCEQYTTCGECLSSGDP
. :: : :. ::::::::. :: :.:..:..::.::...:::.:::: .:. ::.::::
CCDS14 HL-YETVPVV-DGSPILRDLLFSPDHRHIYLLSEKQVSQLPVETCEQYQSCAACLGSGDP
450 460 470 480 490 500
550 560 570 580 590 600
pF1KSD HCGWCALHNMCSRRDKCQQAWEPNRFAASISQCVSLAVHPSSISVSEHSRLLSLVVSDAP
:::::.:.. : :. : : :. :: .:.::.. :.:...::. . :.... ..:
CCDS14 HCGWCVLRHRCCREGACLGASAPHGFAEELSKCVQVRVRPNNVSVTSPGVQLTVTLHNVP
510 520 530 540 550 560
610 620 630 640 650
pF1KSD DLSAGIACAFGNLTEVEGQVSGS-QVICISPGPKDVPVIPLDQDWF-GLELQLRSKETGK
:::::..::: .: :. . : ...: ::. ... .. . ..::: :::::
CCDS14 DLSAGVSCAFEAAAENEAVLLPSGELLCPSPSLQELRALTRGHGATRTVRLQLLSKETGV
570 580 590 600 610 620
660 670 680 690 700 710
pF1KSD IFVSTEFKFYNCSAHQLCLSCVNSAFRCHWCKYRNLCTHDPTTCSFQEGRINISEDCPQL
:....: :::::. : :.:::.: . :::::::. :: : :::::::.. : ::..
CCDS14 RFAGADFVFYNCSVLQSCMSCVGSPYPCHWCKYRHTCTSRPHECSFQEGRVHSPEGCPEI
630 640 650 660 670 680
720 730 740 750 760 770
pF1KSD VPTEEILIPVGEVKPITLKARNLPQPQSGQRGYECVLNIQGAIHRVPALRFNSSSVQCQN
.:. ..::::: ..:.::.:.:::::::::..::::. .:: .::::.:::::::::::
CCDS14 LPSGDLLIPVGVMQPLTLRAKNLPQPQSGQKNYECVVRVQGRQQRVPAVRFNSSSVQCQN
690 700 710 720 730 740
780 790 800 810 820 830
pF1KSD SSYQYDGMDISNLAVDFAVVWNGNFIIDNPQDLKVHLYKCAAQRESCGLCLKADRKFECG
.::.:.: . .. .::.:::.:.: ::.: .... :::: ::: ::::::::: .:.::
CCDS14 ASYSYEGDEHGDTELDFSVVWDGDFPIDKPPSFRALLYKCWAQRPSCGLCLKADPRFNCG
750 760 770 780 790 800
840 850 860 870 880 890
pF1KSD WCSGERRCTLHQHCTSPSSPWLDWSSHNVKCSNPQITEILTVSGPPEGGTRVTIHGVNLG
:: .:.:: :. :: .:.. :. :.....::.:.::.: . :: :::::::: : :::
CCDS14 WCISEHRCQLRTHCPAPKTNWMHLSQKGTRCSHPRITQIHPLVGPKEGGTRVTIVGENLG
810 820 830 840 850 860
900 910 920 930 940 950
pF1KSD LDFSEIAHHVQVAGVPCTPLPGEYIIAEQIVCEMGHALVGTTS-GPVRLCIGECKPEFMT
: :.. ..:::: :. .:.::: ::.::::: ..:: . :::.::.:.:. .: :
CCDS14 LLSREVG--LRVAGVRCNSIPAEYISAERIVCEMEESLVPSPPPGPVELCVGDCSADFRT
870 880 890 900 910 920
960 970 980 990 1000 1010
pF1KSD KSHQQYTFVNPSVLSLNPIRGPESGGTMVTITGHYLGAGSSVAVYLGNQTCEFYGRSMSE
.:.: :.::.:. ...: ::: :::: .::.: : ::: :.: . .. :.: :. .
CCDS14 QSEQVYSFVTPTFDQVSPSRGPASGGTRLTISGSSLDAGSRVTVTVRDSECQFVRRDAKA
930 940 950 960 970 980
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KSD IVCVSPPSSNGLGPVPVSVSVDRAHVDS-NLQFEYIDDPRVQRIEPEWSIASGHTPLTIT
:::.:: :. : . .:.....:::...: .: . : .:: : :.:: ::: .: : .:..
CCDS14 IVCISPLSTLGPSQAPITLAIDRANISSPGLIYTYTQDPTVTRLEPTWSIINGSTAITVS
990 1000 1010 1020 1030 1040
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KSD GFNLDVIQEPRIRVKFNGKESVNVCKVVNTTTLTCLAPSLTTDYRPGLDTVERPDEFGFV
: .: ..::::.:.:. : :..:.:.:.: :.. : ::.. :.::::::.
CCDS14 GTHLLTVQEPRVRAKYRGIETTNTCQVINDTAMLCKAPGIFLGRPQPRAQGEHPDEFGFL
1050 1060 1070 1080 1090 1100
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KSD FNNVQSLLIYNDTKFIYYPNPTFELLSPTGVLDQKPGSPIILKGKNLCPPASGGAKLNYT
...::. : ..: :::.:.:: :.:.:::: :::: ..:::::: : :.:...::::
CCDS14 LDHVQTARSLNRSSFTYYPDPSFEPLGPSGVLDVKPGSHVVLKGKNLIPAAAGSSRLNYT
1110 1120 1130 1140 1150 1160
1200 1210 1220 1230 1240 1250
pF1KSD VLIGETPCAVTVSETQLLCEPPNLTGQHKVMVHVGGMVFSPGSVSVISDSLLTLPAIVSI
:::: ::..:::.:::::. :. ::.. ::: :::. : :.. . .. :::::....
CCDS14 VLIGGQPCSLTVSDTQLLCDSPSQTGRQPVMVLVGGLEFWLGTLHISAERALTLPAMMGL
1170 1180 1190 1200 1210 1220
1260 1270 1280 1290 1300 1310
pF1KSD AAGGSLLLIIVIIVLIAYKRKSRENDLTLKRLQMQMDNLESRVALECKEAFAELQTDINE
::::.:::. . ::.:::::... : ::::::.::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 AAGGGLLLLAITAVLVAYKRKTQDADRTLKRLQLQMDNLESRVALECKEAFAELQTDINE
1230 1240 1250 1260 1270 1280
1320 1330 1340 1350 1360 1370
pF1KSD LTSDLDRSGIPYLDYRTYAMRVLFPGIEDHPVLRELEVQGNGQQHVEKALKLFAQLINNK
::. .:. ::.:::::::.:::::::: ::::.::.. : :::::.::.::....
CCDS14 LTNHMDEVQIPFLDYRTYAVRVLFPGIEAHPVLKELDTPPN----VEKALRLFGQLLHSR
1290 1300 1310 1320 1330 1340
1380 1390 1400 1410 1420 1430
pF1KSD VFLLTFIRTLELQRSFSMRDRGNVASLIMTGLQGRLEYATDVLKQLLSDLIDKNLENKNH
.:.::::.::: : ::::::::.:::: :..::.::.::: .:::::.:::.::::.:::
CCDS14 AFVLTFIHTLEAQSSFSMRDRGTVASLTMVALQSRLDYATGLLKQLLADLIEKNLESKNH
1350 1360 1370 1380 1390 1400
1440 1450 1460 1470 1480 1490
pF1KSD PKLLLRRTESVAEKMLTNWFAFLLHKFLKECAGEPLFMLYCAIKQQMEKGPIDAITGEAR
::::::::::::::::::::.::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::
CCDS14 PKLLLRRTESVAEKMLTNWFTFLLHKFLKECAGEPLFLLYCAIKQQMEKGPIDAITGEAR
1410 1420 1430 1440 1450 1460
1500 1510 1520 1530 1540 1550
pF1KSD YSLSEDKLIRQQIEYKTLILNCVNPDNENSPEIPVKVLNCDTITQVKEKILDAVYKNVPY
:::::::::::::.:::: :.:: :.::.: ..::::::::.:::.:.:.::.:::..::
CCDS14 YSLSEDKLIRQQIDYKTLTLHCVCPENEGSAQVPVKVLNCDSITQAKDKLLDTVYKGIPY
1470 1480 1490 1500 1510 1520
1560 1570 1580 1590 1600 1610
pF1KSD SQRPRAVDMDLEWRQGRIARVVLQDEDITTKIEGDWKRLNTLMHYQVSDRSVVALVPKQT
::::.: ::::::::::..:..:::::.::::: ::::::.: ::::.: :.:::::::.
CCDS14 SQRPKAEDMDLEWRQGRMTRIILQDEDVTTKIECDWKRLNSLAHYQVTDGSLVALVPKQV
1530 1540 1550 1560 1570 1580
1620 1630 1640 1650 1660 1670
pF1KSD SSYNIPASASISRTSISRYDSSFRYTGSPDSLRSRAPMITPDLESGVKVWHLVKNHDHGD
:.::. : ...: :.:::.: .: ..::::::::::::::: :.:.:.:::::::::.:
CCDS14 SAYNMANSFTFTR-SLSRYESLLRTASSPDSLRSRAPMITPDQETGTKLWHLVKNHDHAD
1590 1600 1610 1620 1630
1680 1690 1700 1710 1720 1730
pF1KSD QKEGDRGSKMVSEIYLTRLLATKGTLQKFVDDLFETLFSTVHRGSALPLAIKYMFDFLDE
..::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.:::::::::::::::::::
CCDS14 HREGDRGSKMVSEIYLTRLLATKGTLQKFVDDLFETVFSTAHRGSALPLAIKYMFDFLDE
1640 1650 1660 1670 1680 1690
1740 1750 1760 1770 1780 1790
pF1KSD QADRHSIHDTDVRHTWKSNCLPLRFWVNVIKNPQFVFDIHKGSITDACLSVVAQTFMDSC
:::...: : :::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::
CCDS14 QADQRQISDPDVRHTWKSNCLPLRFWVNVIKNPQFVFDIHKNSITDACLSVVAQTFMDSC
1700 1710 1720 1730 1740 1750
1800 1810 1820 1830 1840 1850
pF1KSD STSEHRLGKDSPSNKLLYAKDIPSYKSWVERYYADIAKLPAISDQDMNAYLAEQSRLHAV
:::::::::::::::::::::::.::::::::: ::::. .::::::.:::.:::::::
CCDS14 STSEHRLGKDSPSNKLLYAKDIPNYKSWVERYYRDIAKMASISDQDMDAYLVEQSRLHAS
1760 1770 1780 1790 1800 1810
1860 1870 1880 1890 1900
pF1KSD EFNMLSALNEIYSYVSKYSEELIGALEQDEQARRQRLAYKVEQLINAMSIES
.:..::::::.: ::.:: .:.. ::..: . :...: :.::.:. .: .:
CCDS14 DFSVLSALNELYFYVTKYRQEILTALDRDASCRKHKLRQKLEQIISLVSSDS
1820 1830 1840 1850 1860 1870
>>CCDS5826.1 PLXNA4 gene_id:91584|Hs108|chr7 (522 aa)
initn: 1717 init1: 971 opt: 1763 Z-score: 1922.8 bits: 367.3 E(32554): 8.8e-101
Smith-Waterman score: 1763; 55.0% identity (79.4% similar) in 491 aa overlap (44-526:31-513)
20 30 40 50 60 70
pF1KSD LSMEQRRPWPRALEVDSRSVVLLSVVWVLLAPPAAGMPQFSTFHSENRDWTFNHLTVHQG
:: . . .: ::..: . ::::.: .
CCDS58 MKAMPWNWTCLLSHLLMVGMGSSTLLTRQPAPLSQKQRSFVTFRGEPAE-GFNHLVVDER
10 20 30 40 50
80 90 100 110 120 130
pF1KSD TGAVYVGAINRVYKLTGNLTIQVAHKTGPEEDNKSCYPPLIVQPCSEVLTLTNNVNKLLI
:: .:.::.::.:::...: . :.:.:::.::: .:::: ::: :.: :: ::::::.:.
CCDS58 TGHIYLGAVNRIYKLSSDLKVLVTHETGPDEDNPKCYPPRIVQTCNEPLTTTNNVNKMLL
60 70 80 90 100 110
140 150 160 170 180 190
pF1KSD IDYSENRLLACGSLYQGVCKLLRLDDLFILVEPSHKKEHYLSSVNKTGTMYGVIVRSEGE
:::.::::.::::::::.::::::.::: : :: ::::::::.::..:...:::: .
CCDS58 IDYKENRLIACGSLYQGICKLLRLEDLFKLGEPYHKKEHYLSGVNESGSVFGVIVSYSNL
120 130 140 150 160 170
200 210 220 230 240 250
pF1KSD DGKLFIGTAVDGKQDYFPTLSSRKLPRDPESSAMLDYELHSDFVSSLIKIPSDTLALVSH
: ::::.:::::: .::::.::::: .. :...:. : .:..::.:.:::::::....
CCDS58 DDKLFIATAVDGKPEYFPTISSRKLTKNSEADGMFAYVFHDEFVASMIKIPSDTFTIIPD
180 190 200 210 220 230
260 270 280 290 300 310
pF1KSD FDIFYIYGFASGGFVYFLTVQPE--TPEGVAINSAGDLFYTSRIVRLCKDDPKFHSYVSL
:::.:.:::.::.::::::.::: .: : ... . :::..:::::.: :.::: .
CCDS58 FDIYYVYGFSSGNFVYFLTLQPEMVSPPG---STTKEQVYTSKLVRLCKEDTAFNSYVEV
240 250 260 270 280 290
320 330 340 350 360 370
pF1KSD PFGCTRAGVEYRLLQAAYLAKPGDSLAQAFNITSQDDVLFAIFSKGQKQYHHPPDDSALC
:.:: :.::::::::::::.: : :...... .::.::..::::::. . :.::::
CCDS58 PIGCERSGVEYRLLQAAYLSKAGAVLGRTLGVHPDDDLLFTVFSKGQKRKMKSLDESALC
300 310 320 330 340 350
380 390 400 410 420 430
pF1KSD AFPIRAINLQIKGRLQSCYQGEGNLELNWLLGKDVQCTKAPVPIDDNFCGLDINQPLGGS
: .. :: .:: ::::::.:::.:.: :: ::. :..: . :::::::::.: ::: :
CCDS58 IFILKQINDRIKERLQSCYRGEGTLDLAWLKVKDIPCSSALLTIDDNFCGLDMNAPLGVS
360 370 380 390 400 410
440 450 460 470 480 490
pF1KSD TPVEGLTLYTTSRDRMTSVASYVYNGYSVVFVGTKSGKLKKIRADGPPHGGVQYEMVSVL
:.:. ..: .::::::: .:::...:..::::::::::: . :: .::. : ..:
CCDS58 DMVRGIPVFTEDRDRMTSVIAYVYKNHSLAFVGTKSGKLKKSFGTGP-QGGITQEWIGV-
420 430 440 450 460 470
500 510 520 530 540
pF1KSD KDGSPILRDMAFSIDQR---YLYVMSERQVT--RV-PVESCEQYTTCGECLSSGDPHCGW
.:.: ..: : .: :: :.. .. :: :. :
CCDS58 -EGDPPGANIA-SQEQMLCVYLQCSSHKAISDQRVQPLLCCFLNVPGNSS
480 490 500 510 520
550 560 570 580 590 600
pF1KSD CALHNMCSRRDKCQQAWEPNRFAASISQCVSLAVHPSSISVSEHSRLLSLVVSDAPDLSA
>>CCDS43647.1 PLXNA4 gene_id:91584|Hs108|chr7 (492 aa)
initn: 1700 init1: 971 opt: 1718 Z-score: 1874.1 bits: 358.2 E(32554): 4.6e-98
Smith-Waterman score: 1718; 58.3% identity (82.9% similar) in 432 aa overlap (44-473:31-458)
20 30 40 50 60 70
pF1KSD LSMEQRRPWPRALEVDSRSVVLLSVVWVLLAPPAAGMPQFSTFHSENRDWTFNHLTVHQG
:: . . .: ::..: . ::::.: .
CCDS43 MKAMPWNWTCLLSHLLMVGMGSSTLLTRQPAPLSQKQRSFVTFRGEPAE-GFNHLVVDER
10 20 30 40 50
80 90 100 110 120 130
pF1KSD TGAVYVGAINRVYKLTGNLTIQVAHKTGPEEDNKSCYPPLIVQPCSEVLTLTNNVNKLLI
:: .:.::.::.:::...: . :.:.:::.::: .:::: ::: :.: :: ::::::.:.
CCDS43 TGHIYLGAVNRIYKLSSDLKVLVTHETGPDEDNPKCYPPRIVQTCNEPLTTTNNVNKMLL
60 70 80 90 100 110
140 150 160 170 180 190
pF1KSD IDYSENRLLACGSLYQGVCKLLRLDDLFILVEPSHKKEHYLSSVNKTGTMYGVIVRSEGE
:::.::::.::::::::.::::::.::: : :: ::::::::.::..:...:::: .
CCDS43 IDYKENRLIACGSLYQGICKLLRLEDLFKLGEPYHKKEHYLSGVNESGSVFGVIVSYSNL
120 130 140 150 160 170
200 210 220 230 240 250
pF1KSD DGKLFIGTAVDGKQDYFPTLSSRKLPRDPESSAMLDYELHSDFVSSLIKIPSDTLALVSH
: ::::.:::::: .::::.::::: .. :...:. : .:..::.:.:::::::....
CCDS43 DDKLFIATAVDGKPEYFPTISSRKLTKNSEADGMFAYVFHDEFVASMIKIPSDTFTIIPD
180 190 200 210 220 230
260 270 280 290 300 310
pF1KSD FDIFYIYGFASGGFVYFLTVQPE--TPEGVAINSAGDLFYTSRIVRLCKDDPKFHSYVSL
:::.:.:::.::.::::::.::: .: : ... . :::..:::::.: :.::: .
CCDS43 FDIYYVYGFSSGNFVYFLTLQPEMVSPPG---STTKEQVYTSKLVRLCKEDTAFNSYVEV
240 250 260 270 280 290
320 330 340 350 360 370
pF1KSD PFGCTRAGVEYRLLQAAYLAKPGDSLAQAFNITSQDDVLFAIFSKGQKQYHHPPDDSALC
:.:: :.::::::::::::.: : :...... .::.::..::::::. . :.::::
CCDS43 PIGCERSGVEYRLLQAAYLSKAGAVLGRTLGVHPDDDLLFTVFSKGQKRKMKSLDESALC
300 310 320 330 340 350
380 390 400 410 420 430
pF1KSD AFPIRAINLQIKGRLQSCYQGEGNLELNWLLGKDVQCTKAPVPIDDNFCGLDINQPLGGS
: .. :: .:: ::::::.:::.:.: :: ::. :..: . :::::::::.: ::: :
CCDS43 IFILKQINDRIKERLQSCYRGEGTLDLAWLKVKDIPCSSALLTIDDNFCGLDMNAPLGVS
360 370 380 390 400 410
440 450 460 470 480 490
pF1KSD TPVEGLTLYTTSRDRMTSVASYVYNGYSVVFVGTKSGKLKKIRADGPPHGGVQYEMVSVL
:.:. ..: .::::::: .:::...:..:::::::::::.
CCDS43 DMVRGIPVFTEDRDRMTSVIAYVYKNHSLAFVGTKSGKLKKMPGTSLCPTLELQTGPRSH
420 430 440 450 460 470
500 510 520 530 540 550
pF1KSD KDGSPILRDMAFSIDQRYLYVMSERQVTRVPVESCEQYTTCGECLSSGDPHCGWCALHNM
CCDS43 RATVTLELLFSSCSSN
480 490
>>CCDS14729.1 PLXNB3 gene_id:5365|Hs108|chrX (1909 aa)
initn: 2266 init1: 605 opt: 1623 Z-score: 1761.1 bits: 339.2 E(32554): 9e-92
Smith-Waterman score: 3461; 34.3% identity (61.8% similar) in 1973 aa overlap (36-1901:27-1898)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD SRLLTAAPLSMEQRRPWPRALEVDSRSVVLLSVVWVLLAPPAAGMPQFSTFHSENRDWTF
: .. .::.:: . : . : :.
CCDS14 MCHAAQETPLLHHFMAPVMARWPPFGLCLLLLLLSPPPLPLTGAHRFSAPNT--TL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KSD NHLTVHQGTGAVYVGAINRVYKLTGNLTIQVAHKTGPEEDNKSCYPPLIVQPCSEVLTLT
:::.. : :..::::.::...:. .: .... ::: :. .: : : .. ::
CCDS14 NHLALAPGRGTLYVGAVNRLFQLSPELQLEAVAVTGPVIDSPDCVPFRDPAECPQA-QLT
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KSD NNVNKLLIIDYSENRLLACGSLYQGVCKLLRLDDLF-ILVEPSHKKEHYLSSVNKTGTM-
.:.:.::... ..:.:::.. ::::. :: :. .: . . . ..: :.
CCDS14 DNANQLLLVSSRAQELVACGQVRQGVCETRRLGDVAEVLYQAEDPGDGQFVAANTPGVAT
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KSD YGVIVRSEGEDGKLFIGTAVDGKQDY-FPTLSSRKLP-RDPESSAMLDYELHSDFVSSLI
:..: :.: :... .. :: . : :. :.: .: :: : . .::
CCDS14 VGLVVPLPGRD-LLLVARGLAGKLSAGVPPLAIRQLAGSQPFSSEGLGRLVVGDF-----
180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KSD KIPSDTLALVSHFDIFYIYGFASGGFVYFLTVQPETPEGVAINSAGDLFYTSRIVRLCKD
: .. :. .::.. .::. . .:. .. : : ..:.:
CCDS14 ----------SDYNNSYVGAFADARSAYFVFRR----RGARAQAE----YRSYVARVCLG
230 240 250 260
310 320 330 340 350 360
pF1KSD DPKFHSYVSLPFGCTRAGVEYRLLQAAYLAKPGDSLAQAFNITSQDDVLFAIFSKGQKQY
: ...::: .:..: : :.:::.:: :: .:...:. : .
CCDS14 DTNLYSYVEVPLACQGQG----LIQAAFLA-PG--------------TLLGVFAAGPRGT
270 280 290 300 310
370 380 390 400 410
pF1KSD HHPPDDSALCAFPIRAINLQIKGRLQSCYQG-----EGNLELNWLLGKDVQCTKAPVPID
. .::::::. .. ... . :: . : : . : .:. :.
CCDS14 Q-----AALCAFPMVELGASMEQARRLCYTAGGRGPSGAEEATVEYGVTSRCVTLPLDSP
320 330 340 350 360
420 430 440 450 460 470
pF1KSD DNF-CGLD-INQPLGGSTPVEGLTLYTTSRDRMTSVASYVYNGYSVVFVGTKSGKLKKIR
... :: . .:..: :.: : .. ...::. .:. ..:.: .:.: :.
CCDS14 ESYPCGDEHTPSPIAGRQPLEVQPLLKLGQP-VSAVAALQADGHMIAFLGDTQGQLYKVF
370 380 390 400 410 420
480 490 500 510 520 530
pF1KSD ADGPPHGGVQYEMVSVLKDGSPILRDMAFSIDQRYLYVMSERQVTRVPVESCEQYTTCGE
: .: : :. .: :: : :. .. . .:::.. .:: :.:: .: :. :.
CCDS14 LHGS-QGQV-YHSQQVGPPGSAISPDLLLDSSGSHLYVLTAHQVDRIPVAACPQFPDCAS
430 440 450 460 470 480
540 550 560 570 580 590
pF1KSD CLSSGDPHCGWCALHNMCSRRDKCQQAWEPNRFAASISQCVSLAVHPSSISVSEHSRL--
::.. :: ::::.:.. :.:. .: .: . :.. : . : .: .:. ..: :
CCDS14 CLQAQDPLCGWCVLQGRCTRKGQCGRAGQLNQWLWSYEED-SHCLHIQSLLPGHHPRQEQ
490 500 510 520 530 540
600 610 620 630 640
pF1KSD --LSLVVSDAPDLSAG--IACAFGNLTEVEGQVSGSQVICISPGPKD-VPVIPLDQDWFG
..: : : :.: . ::::. . ..: : .: :..: :.: ::. : :
CCDS14 GQVTLSVPRLPILDADEYFHCAFGDYDSL-AHVEGPHVACVTP-PQDQVPLNPPGTDHVT
550 560 570 580 590
650 660 670 680 690
pF1KSD LELQLRSKETGKIFVSTEFKFYNCSAHQL------CLSCVNSAFRCHWCKYRNLCT---H
. : : ... ..:.:.::.::: : : .::.: .::::: . :. :
CCDS14 VPLALMFEDV--TVAATNFSFYDCSAVQALEAAAPCRACVGSIWRCHWCPQSSHCVYGEH
600 610 620 630 640 650
700 710 720 730 740 750
pF1KSD DP----TTCSFQEGRINISED--CPQLVPTE-EILIPVGEVKPITLKARNLPQPQSGQRG
: : : :: :.. :::. :.::: . ..:..::: . .. .
CCDS14 CPEGERTIYSAQEVDIQVRGPGACPQVEGLAGPHLVPVGWESHLALRVRNLQHFRGLPAS
660 670 680 690 700 710
760 770 780 790 800
pF1KSD YECVLNIQGAIHRVPALRF----NSSSVQCQNSSYQYDGMDISNLAVDFAVVWNGNFIID
..: :.. : .. .:: .:. ..:: .. : .:. .: : . :. . .:
CCDS14 FHCWLELPGELRGLPATLEETAGDSGLIHCQAHQF-YPSMSQRELPVPIYVTQGEAQRLD
720 730 740 750 760 770
810 820 830 840 850 860
pF1KSD NPQDLKVHLYKCAAQRESCGLCLKADRKFECGWCS-GERRCTLHQHCTSPSSPWLDWSSH
: . : : :: :: . .:. : :.:.. : ::. :. : : . :
CCDS14 NTHALYVILYDCAMGHPDCSHCQAANRSLGCLWCADGQPACRYGPLCPPGAVELL-----
780 790 800 810 820 830
870 880 890 900 910 920
pF1KSD NVKCSNPQITEILTVSGPPEGGTRVTIHGVNLGLDFSEIAHHVQVAGVPCTPLPGEYIIA
: :.: . ..:::::: .:: : ::: :... . :.::. ::.: :. : .
CCDS14 ---CPAPSIDAVEPLTGPPEGGLALTILGSNLGRAFADVQYAVSVASRPCNPEPSLYRTS
840 850 860 870 880
930 940 950 960 970 980
pF1KSD EQIVCEMGHALVGTTSGPVRLCIGECKPEFMTKSHQQYTFVNPSVLSLNPIRGPESGGTM
.::: . : ::: ::::. : : . : :..:. .: .:::.: ::..:::.
CCDS14 ARIVCVTSPAPNGTT-GPVRVAIKSQPPGI---SSQHFTYQDPVLLSLSPRWGPQAGGTQ
890 900 910 920 930 940
990 1000 1010 1020 1030 1040
pF1KSD VTITGHYLGAGSSVAVYLGNQTCEFYGRSMSE-IVCVSPPSSNGLGPVPVSVSVDRAHVD
.:: :..: .:.......:.: : . : ::: . :.. .: ..: : .:..
CCDS14 LTIRGQHLQTGGNTSAFVGGQPCPILEPVCPEAIVCRTRPQA---APGEAAVLVVFGHAQ
950 960 970 980 990 1000
1050 1060 1070 1080 1090 1100
pF1KSD SNL---QFEYIDDPRVQRIEPEWSIASGHTPLTITGFNLDVIQEPRIRVKFNGKESVNVC
.: :.: .:.. :: :. .: . . : .:::.:.: . : ... :..
CCDS14 RTLLASPFRYTANPQLVAAEPSASFRGGGRLIRVRGTGLDVVQRPLLSVWLEADAEVQAS
1010 1020 1030 1040 1050 1060
1110 1120 1130
pF1KSD KVVNTTTL---TCLAP--------------------------SLTTDYRPGLDTVERPDE
.. .: :: :: :.. .:..
CCDS14 RAQPQDPQPRRSCGAPAADPQACIQLGGGLLQCSTVCSVNSSSLLLCRSPAVPDRAHPQR
1070 1080 1090 1100 1110 1120
1140 1150 1160 1170 1180
pF1KSD FGFVFNNVQSLLIYND--TKFIYYPNPTFELLS---PTGVLDQKPGSPIILKGKNLCPPA
:...::: . . :.: ::: . :: :. ::: . ..:..:
CCDS14 VFFTLDNVQVDFASASGGQGFLYQPNPRLAPLSREGPARPYRLKPGHVLDVEGEGL---N
1130 1140 1150 1160 1170
1190 1200 1210 1220 1230 1240
pF1KSD SGGAKLNYTVLIGETPCAV-TVSETQLLCEPP-------NLTGQHKVMVHVGGMVFSPGS
: .: . : ::. : : :...:.: :::: : .: . .:..:.. .. :
CCDS14 LGISKEEVRVHIGRGECLVKTLTRTHLYCEPPAHAPQPANGSGLPQFVVQMGNVQLALGP
1180 1190 1200 1210 1220 1230
1250 1260 1270 1280 1290
pF1KSD VSVISDSLLT-LP--AIVSIAAGGSLLLIIVIIVLIAYKRKSRENDLTLKRLQMQMDNLE
:. .. :. .: : .... :...:. :... . :..::.. ... .:...::
CCDS14 VQYEAEPPLSAFPVEAQAGVGMGAAVLIAAVLLLTLMYRHKSKQALRDYQKVLVQLESLE
1240 1250 1260 1270 1280 1290
1300 1310 1320 1330 1340 1350
pF1KSD SRVALECKEAFAELQTDINELTSDLDRSGIPYLDYRTYAMRVLFPGIEDHPVLRELEVQG
. :. .:.. :..:.:....:.:::. ::::.::::::: :..::: :. . : :
CCDS14 TGVGDQCRKEFTDLMTEMTDLSSDLEGSGIPFLDYRTYAERAFFPGHGGCPLQPKPEGPG
1300 1310 1320 1330 1340 1350
1360 1370 1380 1390 1400 1410
pF1KSD -NGQ-QHVEKALKLFAQLINNKVFLLTFIRTLELQRSFSMRDRGNVASLIMTGLQGRLEY
.:. :...: ...:.:.:.::::.:.::: : :::.::: .::::. .:.:.:::
CCDS14 EDGHCATVRQGLTQLSNLLNSKLFLLTLIHTLEEQPSFSQRDRCHVASLLSLALHGKLEY
1360 1370 1380 1390 1400 1410
1420 1430 1440 1450 1460 1470
pF1KSD ATDVLKQLLSDLIDKNLENKNHPKLLLRRTESVAEKMLTNWFAFLLHKFLKECAGEPLFM
::... ::.:: . . ..: :::.:::::...::.::::... :. ::.: :::::.:
CCDS14 LTDIMRTLLGDLAAHYV-HRN-PKLMLRRTETMVEKLLTNWLSICLYAFLREVAGEPLYM
1420 1430 1440 1450 1460 1470
1480 1490 1500 1510 1520
pF1KSD LYCAIKQQMEKGPIDAITGEARYSLSEDKLIRQQIEYKTLILNC-VNPDN---ENSPE--
:. ::. :..:::.::.::.:. .:....:.:...:.. : : :.: .: :
CCDS14 LFRAIQYQVDKGPVDAVTGKAKRTLNDSRLLREDVEFQPLTLMVLVGPGAGGAAGSSEMQ
1480 1490 1500 1510 1520 1530
1530 1540 1550 1560 1570 1580
pF1KSD -IPVKVLNCDTITQVKEKILDAVYKNVPYSQRPRAVDMDLEWRQGRIARVVLQDEDITTK
.:..::. :::::::::.:: :::..:.:::: . .:::::.: ....:.:::.:.
CCDS14 RVPARVLDTDTITQVKEKVLDQVYKGTPFSQRPSVHALDLEWRSGLAGHLTLSDEDLTSV
1540 1550 1560 1570 1580 1590
1590 1600 1610 1620 1630 1640
pF1KSD IEGDWKRLNTLMHYQVSDRSVVALVPKQTSSYNIPASASISRTSISRYDSSFRYTGSPDS
.. :::::::.::.: : ..:.:::. . ...::.. .: :
CCDS14 TQNHWKRLNTLQHYKVPDGATVGLVPQ------LHRGSTISQSLAQR---------CP--
1600 1610 1620 1630
1650 1660 1670 1680 1690
pF1KSD LRSRAPMITPDLESGVKVWHLVKNHDHGD----------QKEGDRGSKMVSEIYLTRLLA
: : . :.:: .::::: .. . ..: : .: . ::::::::.
CCDS14 LGENIPTLEDGEEGGVCLWHLVKATEEPEGAKVRCSSLREREPAR-AKAIPEIYLTRLLS
1640 1650 1660 1670 1680 1690
1700 1710 1720 1730 1740 1750
pF1KSD TKGTLQKFVDDLFETLFSTVHRGSALPLAIKYMFDFLDEQADRHSIHDTDVRHTWKSNCL
:::::::::: :....: :.: .:.:.::.::.::: :..:.:.: . : ::.: :
CCDS14 MKGTLQKFVDDTFQAILS-VNR--PIPIAVKYLFDLLDELAEKHGIEDPGTLHIWKTNSL
1700 1710 1720 1730 1740 1750
1760 1770 1780 1790 1800 1810
pF1KSD PLRFWVNVIKNPQFVFDIHKGSITDACLSVVAQTFMDSCSTSEHRLGKDSPSNKLLYAKD
::::::..::::..::.. .. .:: :.:.::::.:::.::::..:.::: ::::::..
CCDS14 LLRFWVNALKNPQLIFDVRVSDNVDAILAVIAQTFIDSCTTSEHKVGRDSPVNKLLYARE
1760 1770 1780 1790 1800 1810
1820 1830 1840 1850 1860 1870
pF1KSD IPSYKSWVERYYADIAKLPAISDQDMNAYLAEQSRLHAVEFNMLSALNEIYSYVSKYSEE
:: ::. :::::::: . : :.::. ::: : .. . : ::.:.:... .: ..
CCDS14 IPRYKQMVERYYADIRQSSPASYQEMNSALAELSGNYTSAPHCLEALQELYNHIHRYYDQ
1820 1830 1840 1850 1860 1870
1880 1890 1900
pF1KSD LIGALEQDEQARRQRLAYKVEQLINAMSIES
.:.:::.: ... .:: ...:.
CCDS14 IISALEEDPVGQKLQLACRLQQVAALVENKVTDL
1880 1890 1900
>>CCDS55536.1 PLXNB3 gene_id:5365|Hs108|chrX (1932 aa)
initn: 2266 init1: 605 opt: 1623 Z-score: 1761.0 bits: 339.2 E(32554): 9.1e-92
Smith-Waterman score: 3478; 34.3% identity (61.6% similar) in 1990 aa overlap (20-1901:33-1921)
10 20 30 40
pF1KSD MSTHRSRLLTAAPLSMEQRRPW-PRALEVDSRSVVLLSVVWVLLAPPAA
::: :.: . : .. .::.::
CCDS55 LTPASSLTCSLLSPRLPGSFPQLRRVPPCSRPWLPKAPVMARWPPFGLCLLLLLLSPPPL
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KSD GMPQFSTFHSENRDWTFNHLTVHQGTGAVYVGAINRVYKLTGNLTIQVAHKTGPEEDNKS
. : . : :.:::.. : :..::::.::...:. .: .... ::: :. .
CCDS55 PLTGAHRFSAPNT--TLNHLALAPGRGTLYVGAVNRLFQLSPELQLEAVAVTGPVIDSPD
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KSD CYPPLIVQPCSEVLTLTNNVNKLLIIDYSENRLLACGSLYQGVCKLLRLDDLF-ILVEPS
: : : .. ::.:.:.::... ..:.:::.. ::::. :: :. .: .
CCDS55 CVPFRDPAECPQA-QLTDNANQLLLVSSRAQELVACGQVRQGVCETRRLGDVAEVLYQAE
130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KSD HKKEHYLSSVNKTGTM-YGVIVRSEGEDGKLFIGTAVDGKQDY-FPTLSSRKLP-RDPES
. . ..: :. :..: :.: :... .. :: . : :. :.: .: :
CCDS55 DPGDGQFVAANTPGVATVGLVVPLPGRD-LLLVARGLAGKLSAGVPPLAIRQLAGSQPFS
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KSD SAMLDYELHSDFVSSLIKIPSDTLALVSHFDIFYIYGFASGGFVYFLTVQPETPEGVAIN
: : . .:: : .. :. .::.. .::. . .:. .
CCDS55 SEGLGRLVVGDF---------------SDYNNSYVGAFADARSAYFVFRR----RGARAQ
240 250 260 270
290 300 310 320 330 340
pF1KSD SAGDLFYTSRIVRLCKDDPKFHSYVSLPFGCTRAGVEYRLLQAAYLAKPGDSLAQAFNIT
. : : ..:.: : ...::: .:..: : :.:::.:: ::
CCDS55 AE----YRSYVARVCLGDTNLYSYVEVPLACQGQG----LIQAAFLA-PG----------
280 290 300 310 320
350 360 370 380 390
pF1KSD SQDDVLFAIFSKGQKQYHHPPDDSALCAFPIRAINLQIKGRLQSCYQG-----EGNLELN
.:...:. : . . .::::::. .. ... . :: . : : .
CCDS55 ----TLLGVFAAGPRGTQ-----AALCAFPMVELGASMEQARRLCYTAGGRGPSGAEEAT
330 340 350 360 370
400 410 420 430 440 450
pF1KSD WLLGKDVQCTKAPVPIDDNF-CGLD-INQPLGGSTPVEGLTLYTTSRDRMTSVASYVYNG
: .:. :. ... :: . .:..: :.: : .. ...::. .:
CCDS55 VEYGVTSRCVTLPLDSPESYPCGDEHTPSPIAGRQPLEVQPLLKLGQP-VSAVAALQADG
380 390 400 410 420 430
460 470 480 490 500 510
pF1KSD YSVVFVGTKSGKLKKIRADGPPHGGVQYEMVSVLKDGSPILRDMAFSIDQRYLYVMSERQ
. ..:.: .:.: :. : .: : :. .: :: : :. .. . .:::.. .:
CCDS55 HMIAFLGDTQGQLYKVFLHGS-QGQV-YHSQQVGPPGSAISPDLLLDSSGSHLYVLTAHQ
440 450 460 470 480
520 530 540 550 560 570
pF1KSD VTRVPVESCEQYTTCGECLSSGDPHCGWCALHNMCSRRDKCQQAWEPNRFAASISQCVSL
: :.:: .: :. :. ::.. :: ::::.:.. :.:. .: .: . :.. : . :
CCDS55 VDRIPVAACPQFPDCASCLQAQDPLCGWCVLQGRCTRKGQCGRAGQLNQWLWSYEED-SH
490 500 510 520 530 540
580 590 600 610 620 630
pF1KSD AVHPSSISVSEHSRL----LSLVVSDAPDLSAG--IACAFGNLTEVEGQVSGSQVICISP
.: .:. ..: : ..: : : :.: . ::::. . ..: : .: :..:
CCDS55 CLHIQSLLPGHHPRQEQGQVTLSVPRLPILDADEYFHCAFGDYDSL-AHVEGPHVACVTP
550 560 570 580 590 600
640 650 660 670 680
pF1KSD GPKD-VPVIPLDQDWFGLELQLRSKETGKIFVSTEFKFYNCSAHQL------CLSCVNSA
:.: ::. : : . : : ... ..:.:.::.::: : : .::.:
CCDS55 -PQDQVPLNPPGTDHVTVPLALMFEDV--TVAATNFSFYDCSAVQALEAAAPCRACVGSI
610 620 630 640 650 660
690 700 710 720 730
pF1KSD FRCHWCKYRNLCT---HDP----TTCSFQEGRINISED--CPQLVPTE-EILIPVGEVKP
.::::: . :. : : : : :: :.. :::. :.::: .
CCDS55 WRCHWCPQSSHCVYGEHCPEGERTIYSAQEVDIQVRGPGACPQVEGLAGPHLVPVGWESH
670 680 690 700 710 720
740 750 760 770 780 790
pF1KSD ITLKARNLPQPQSGQRGYECVLNIQGAIHRVPALRF----NSSSVQCQNSSYQYDGMDIS
..:..::: . .. ...: :.. : .. .:: .:. ..:: .. : .:.
CCDS55 LALRVRNLQHFRGLPASFHCWLELPGELRGLPATLEETAGDSGLIHCQAHQF-YPSMSQR
730 740 750 760 770 780
800 810 820 830 840
pF1KSD NLAVDFAVVWNGNFIIDNPQDLKVHLYKCAAQRESCGLCLKADRKFECGWCS-GERRCTL
.: : . :. . .:: . : : :: :: . .:. : :.:.. : ::. :. :
CCDS55 ELPVPIYVTQGEAQRLDNTHALYVILYDCAMGHPDCSHCQAANRSLGCLWCADGQPACRY
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD HQHCTSPSSPWLDWSSHNVKCSNPQITEILTVSGPPEGGTRVTIHGVNLGLDFSEIAHHV
: . : : :.: . ..:::::: .:: : ::: :... . :
CCDS55 GPLCPPGAVELL--------CPAPSIDAVEPLTGPPEGGLALTILGSNLGRAFADVQYAV
850 860 870 880 890
910 920 930 940 950 960
pF1KSD QVAGVPCTPLPGEYIIAEQIVCEMGHALVGTTSGPVRLCIGECKPEFMTKSHQQYTFVNP
.::. ::.: :. : . .::: . : ::: ::::. : : . : :..:. .:
CCDS55 SVASRPCNPEPSLYRTSARIVCVTSPAPNGTT-GPVRVAIKSQPPGI---SSQHFTYQDP
900 910 920 930 940 950
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD SVLSLNPIRGPESGGTMVTITGHYLGAGSSVAVYLGNQTCEFYGRSMSE-IVCVSPPSSN
.:::.: ::..:::..:: :..: .:.......:.: : . : ::: . :..
CCDS55 VLLSLSPRWGPQAGGTQLTIRGQHLQTGGNTSAFVGGQPCPILEPVCPEAIVCRTRPQA-
960 970 980 990 1000
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD GLGPVPVSVSVDRAHVDSNL---QFEYIDDPRVQRIEPEWSIASGHTPLTITGFNLDVIQ
.: ..: : .:.. .: :.: .:.. :: :. .: . . : .:::.:
CCDS55 --APGEAAVLVVFGHAQRTLLASPFRYTANPQLVAAEPSASFRGGGRLIRVRGTGLDVVQ
1010 1020 1030 1040 1050 1060
1090 1100 1110
pF1KSD EPRIRVKFNGKESVNVCKVVNTTTL---TCLAP--------------------------S
.: . : ... :.. .. .: :: :
CCDS55 RPLLSVWLEADAEVQASRAQPQDPQPRRSCGAPAADPQACIQLGGGLLQCSTVCSVNSSS
1070 1080 1090 1100 1110 1120
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KSD LTTDYRPGLDTVERPDEFGFVFNNVQSLLIYND--TKFIYYPNPTFELLS---PTGVLDQ
: :.. .:.. :...::: . . :.: ::: . :: :.
CCDS55 LLLCRSPAVPDRAHPQRVFFTLDNVQVDFASASGGQGFLYQPNPRLAPLSREGPARPYRL
1130 1140 1150 1160 1170 1180
1180 1190 1200 1210 1220
pF1KSD KPGSPIILKGKNLCPPASGGAKLNYTVLIGETPCAV-TVSETQLLCEPP-------NLTG
::: . ..:..: : .: . : ::. : : :...:.: :::: : .:
CCDS55 KPGHVLDVEGEGL---NLGISKEEVRVHIGRGECLVKTLTRTHLYCEPPAHAPQPANGSG
1190 1200 1210 1220 1230 1240
1230 1240 1250 1260 1270 1280
pF1KSD QHKVMVHVGGMVFSPGSVSVISDSLLT-LP--AIVSIAAGGSLLLIIVIIVLIAYKRKSR
. .:..:.. .. : :. .. :. .: : .... :...:. :... . :..::.
CCDS55 LPQFVVQMGNVQLALGPVQYEAEPPLSAFPVEAQAGVGMGAAVLIAAVLLLTLMYRHKSK
1250 1260 1270 1280 1290 1300
1290 1300 1310 1320 1330 1340
pF1KSD ENDLTLKRLQMQMDNLESRVALECKEAFAELQTDINELTSDLDRSGIPYLDYRTYAMRVL
. ... .:...::. :. .:.. :..:.:....:.:::. ::::.::::::: :..
CCDS55 QALRDYQKVLVQLESLETGVGDQCRKEFTDLMTEMTDLSSDLEGSGIPFLDYRTYAERAF
1310 1320 1330 1340 1350 1360
1350 1360 1370 1380 1390
pF1KSD FPGIEDHPVLRELEVQG-NGQ-QHVEKALKLFAQLINNKVFLLTFIRTLELQRSFSMRDR
::: :. . : : .:. :...: ...:.:.:.::::.:.::: : :::.:::
CCDS55 FPGHGGCPLQPKPEGPGEDGHCATVRQGLTQLSNLLNSKLFLLTLIHTLEEQPSFSQRDR
1370 1380 1390 1400 1410 1420
1400 1410 1420 1430 1440 1450
pF1KSD GNVASLIMTGLQGRLEYATDVLKQLLSDLIDKNLENKNHPKLLLRRTESVAEKMLTNWFA
.::::. .:.:.::: ::... ::.:: . . ..: :::.:::::...::.::::..
CCDS55 CHVASLLSLALHGKLEYLTDIMRTLLGDLAAHYV-HRN-PKLMLRRTETMVEKLLTNWLS
1430 1440 1450 1460 1470 1480
1460 1470 1480 1490 1500 1510
pF1KSD FLLHKFLKECAGEPLFMLYCAIKQQMEKGPIDAITGEARYSLSEDKLIRQQIEYKTLILN
. :. ::.: :::::.::. ::. :..:::.::.::.:. .:....:.:...:.. : :
CCDS55 ICLYAFLREVAGEPLYMLFRAIQYQVDKGPVDAVTGKAKRTLNDSRLLREDVEFQPLTLM
1490 1500 1510 1520 1530 1540
1520 1530 1540 1550 1560 1570
pF1KSD C-VNPDN---ENSPE---IPVKVLNCDTITQVKEKILDAVYKNVPYSQRPRAVDMDLEWR
:.: .: : .:..::. :::::::::.:: :::..:.:::: . .:::::
CCDS55 VLVGPGAGGAAGSSEMQRVPARVLDTDTITQVKEKVLDQVYKGTPFSQRPSVHALDLEWR
1550 1560 1570 1580 1590 1600
1580 1590 1600 1610 1620 1630
pF1KSD QGRIARVVLQDEDITTKIEGDWKRLNTLMHYQVSDRSVVALVPKQTSSYNIPASASISRT
.: ....:.:::.:. .. :::::::.::.: : ..:.:::. . ...::..
CCDS55 SGLAGHLTLSDEDLTSVTQNHWKRLNTLQHYKVPDGATVGLVPQ------LHRGSTISQS
1610 1620 1630 1640 1650
1640 1650 1660 1670 1680
pF1KSD SISRYDSSFRYTGSPDSLRSRAPMITPDLESGVKVWHLVKNHDHGD----------QKEG
.: : : : . :.:: .::::: .. . ..:
CCDS55 LAQR---------CP--LGENIPTLEDGEEGGVCLWHLVKATEEPEGAKVRCSSLREREP
1660 1670 1680 1690 1700
1690 1700 1710 1720 1730 1740
pF1KSD DRGSKMVSEIYLTRLLATKGTLQKFVDDLFETLFSTVHRGSALPLAIKYMFDFLDEQADR
: .: . ::::::::. :::::::::: :....: :.: .:.:.::.::.::: :..
CCDS55 AR-AKAIPEIYLTRLLSMKGTLQKFVDDTFQAILS-VNR--PIPIAVKYLFDLLDELAEK
1710 1720 1730 1740 1750 1760
1750 1760 1770 1780 1790 1800
pF1KSD HSIHDTDVRHTWKSNCLPLRFWVNVIKNPQFVFDIHKGSITDACLSVVAQTFMDSCSTSE
:.:.: . : ::.: : ::::::..::::..::.. .. .:: :.:.::::.:::.:::
CCDS55 HGIEDPGTLHIWKTNSLLLRFWVNALKNPQLIFDVRVSDNVDAILAVIAQTFIDSCTTSE
1770 1780 1790 1800 1810 1820
1810 1820 1830 1840 1850 1860
pF1KSD HRLGKDSPSNKLLYAKDIPSYKSWVERYYADIAKLPAISDQDMNAYLAEQSRLHAVEFNM
:..:.::: ::::::..:: ::. :::::::: . : :.::. ::: : .. .
CCDS55 HKVGRDSPVNKLLYAREIPRYKQMVERYYADIRQSSPASYQEMNSALAELSGNYTSAPHC
1830 1840 1850 1860 1870 1880
1870 1880 1890 1900
pF1KSD LSALNEIYSYVSKYSEELIGALEQDEQARRQRLAYKVEQLINAMSIES
: ::.:.:... .: ...:.:::.: ... .:: ...:.
CCDS55 LEALQELYNHIHRYYDQIISALEEDPVGQKLQLACRLQQVAALVENKVTDL
1890 1900 1910 1920 1930
>>CCDS43035.1 PLXNB2 gene_id:23654|Hs108|chr22 (1838 aa)
initn: 2251 init1: 718 opt: 1128 Z-score: 1220.8 bits: 239.2 E(32554): 1.1e-61
Smith-Waterman score: 3321; 33.5% identity (62.9% similar) in 1946 aa overlap (42-1905:13-1831)
20 30 40 50 60 70
pF1KSD APLSMEQRRPWPRALEVDSRSVVLLSVVWVLLAPPAAGMP-QFSTFHSENRDWTFNHLTV
::. :. : ... :.::.. .:::.:
CCDS43 MALQLWALTLLGLLGAGASLRPRKLDFFRSEKE---LNHLAV
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KSD HQGTGAVYVGAINRVYKLTGNLTIQVAHKTGPEEDNKSCYPPLIVQPCSEVLTLTNNVNK
...:.::.::.: .:.: ..: .. ::: :::.: ::. .. : :. .:.:::.
CCDS43 DEASGVVYLGAVNALYQLDAKLQLEQQVATGPALDNKKCTPPIEASQCHEA-EMTDNVNQ
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170 180
pF1KSD LLIIDYSENRLLACGSLYQGVCKLLRLDD--LFILVEPSHKKEHYLSSVNKTGTMYGVIV
::..: ..::. ::::..:.: : :.. : .. : . .. ...: : :. .:
CCDS43 LLLLDPPRKRLVECGSLFKGICALRALSNISLRLFYEDGSGEKSFVAS-NDEGVATVGLV
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KSD RSEGEDGK--LFIGTAVDGKQDYFPTLSSRKLPRDPESSAMLDYELHSDFVSSLIKIPSD
: : : ::.: . .: .: .:.: : : :. : :. . .. .. ..
CCDS43 SSTGPGGDRVLFVGKG-NGPHDNGIIVSTRLLDRTDSREAFEAYTDHATYKAGYLS--TN
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KSD TLALVSHFDIFYIYGFASGGFVYFLTVQPETPEGVAINSAGDLFYTSRIVRLCKDDPKFH
: .:. :. .: .:.:. : . . : : . ..:.:..::...
CCDS43 TQQFVAAFE--------DGPYVFFVFNQQD--KHPARNR-------TLLARMCREDPNYY
220 230 240 250
310 320 330 340 350 360
pF1KSD SYVSLPFGCTRAGVEYRLLQAAYLAKPGDSLAQAFNITSQDDVLFAIFSKGQKQYHHPPD
::. . . : .. ::. : :: . .. ::.:.::. ... :
CCDS43 SYLEMDLQCRDPDIH----AAAF----GTCLAASVAAPGSGRVLYAVFSRDSRSSGGP--
260 270 280 290 300
370 380 390 400 410 420
pF1KSD DSALCAFPIRAINLQIKGRLQSCYQG--EGNLELNWLLGKDVQCT-KAPVPIDDNFCGLD
..:: ::. .. .... ..:: : :. . . :.:: .:: . :: .
CCDS43 GAGLCLFPLDKVHAKMEANRNACYTGTREARDIFYKPFHGDIQCGGHAPGSSKSFPCGSE
310 320 330 340 350 360
430 440 450 460 470 480
pF1KSD -INQPLGGSTPVEGLTLYTTSRDRMTSVASYVYNGYSVVFVGTKSGKLKKIRADGPPHGG
. :::. ..: .. . .:.:. . :...:.:.::..:.. :. : :
CCDS43 HLPYPLGSRDGLRGTAVLQRGGLNLTAVTVAAENNHTVAFLGTSDGRILKVYL--TPDG-
370 380 390 400 410 420
490 500 510 520 530 540
pF1KSD VQYEMVSVLKD-GSPILRDMAFSIDQRYLYVMSERQVTRVPVESCEQYTTCGECLSSGDP
.. :. :.: . .. . ::...: : ::.:.. .: :.::. : .: :: .: .: ::
CCDS43 TSSEYDSILVEINKRVKRDLVLSGDLGSLYAMTQDKVFRLPVQECLSYPTCTQCRDSQDP
430 440 450 460 470 480
550 560 570 580 590
pF1KSD HCGWCALHNMCSRRDKCQQAWEPNRFAASISQ-CVSL-AVHPSSISVSEHSRLLSLVVSD
.::::.... :.:. .: .: : ... : :. ::.. ...:...: .... .:.::
CCDS43 YCGWCVVEGRCTRKAECPRAEEASHWLWSRSKSCVAVTSAQPQNMSRRAQGEV-QLTVSP
490 500 510 520 530 540
600 610 620 630 640 650
pF1KSD APDLSAG--IACAFGNLTEVEGQVSGSQVICISPGPKDVPVIPLDQDWFGLELQLRSKET
: :: . : ::. ..: : ::: :: ...:: : :: .. .:: ..
CCDS43 LPALSEEDELLCLFGESPPHPARVEGEAVICNSP--SSIPVTPPGQDHVAVTIQLLLRR-
550 560 570 580 590 600
660 670 680 690 700
pF1KSD GKIFVST-EFKFYNC-SAHQL-----CLSCVNSAFRCHWCKYRNLCTH-DPTTCSFQEG-
:.::... .. ::.: .: .: :.:::.. . :.: . : . .:. ..:
CCDS43 GNIFLTSYQYPFYDCRQAMSLEENLPCISCVSNRWTCQWDLRYHECREASPNP---EDGI
610 620 630 640 650
710 720 730 740 750 760
pF1KSD -RINISEDCPQLVPTEEILIPVGEVKPITLKARNLPQPQSGQRGYECVLNIQGAIHRV--
: .. ..:::.. ..::... ......:: .... :.. . . .
CCDS43 VRAHMEDSCPQFLGPSPLVIPMNHETDVNFQGKNLDTVKGSS------LHVGSDLLKFME
660 670 680 690 700 710
770 780 790 800 810 820
pF1KSD PALRFNSSSVQCQNSSYQYDGMDISNLAVDFAVVWNGNFIIDNPQDLKVHLYKCAAQRES
:. .:.. .. . ..:. . .: . . : :. ::. :.: ::.:. : .
CCDS43 PVTMQESGTFAFRTPKLSHDANE--TLPLHLYVKSYGK-NIDS--KLHVTLYNCSFGRSD
720 730 740 750 760
830 840 850 860 870 880
pF1KSD CGLCLKADRKFECGWCSGERRCTLHQHCTSPSSPWLDWSSHNVKCSNPQITEILTVSGPP
:.:: :. ..:.::.:. ::. . :.. : .: : ::.: .::
CCDS43 CSLCRAANPDYRCAWCGGQSRCVYEALCNTTS-----------ECPPPVITRIQPETGPL
770 780 790 800 810
890 900 910 920 930 940
pF1KSD EGGTRVTIHGVNLGLDFSEIAHHVQVAGVPCTPLPGEYIIAEQIVCEMGHALVGTTSG--
:: :.:: : :::.. ..: ....::: :. : .: .. .::: . : . :.:
CCDS43 GGGIRITILGSNLGVQAGDI-QRISVAGRNCSFQPERYSVSTRIVCVIEAAETPFTGGVE
820 830 840 850 860 870
950 960 970 980 990 1000
pF1KSD -PVRLCIGECKPEFMTKSHQQYTFVNPSVLSLNPIRGPESGGTMVTITGHYLGAGSS--V
: .:. :. :.:: .:. ::..: .::..::: .:: : .: .::. :
CCDS43 VDVFGKLGRSPPNV------QFTFQQPKPLSVEPQQGPQAGGTTLTIHGTHLDTGSQEDV
880 890 900 910 920
1010 1020 1030 1040 1050
pF1KSD AVYLGNQTCEFYGRSMSEIVCVSPPSSNGLGPVPVSVSVDRAHV-DSNLQFEYIDDPRVQ
: :.. :. . ... ::. :... : . . :: . : . .. : : ..: ..
CCDS43 RVTLNGVPCKVT-KFGAQLQCVTGPQATR-GQMLLEVSYGGSPVPNPGIFFTYRENPVLR
930 940 950 960 970 980
1060 1070 1080 1090 1100
pF1KSD RIEPEWSIASGHTPLTITG--------FNLDVIQEPRIRVKFNGK-ESVNVCKVV-----
.:: :.::: ...:: : . :: :: . . ::.. ::
CCDS43 AFEPLRSFASGGRSINVTGQGFSLIQRFAMVVIAEPLQSWQPPREAESLQPMTVVGTDYV
990 1000 1010 1020 1030 1040
1110 1120 1130 1140 1150
pF1KSD --NTTTLTCLAPSLTTDYRPGLDTVERPDEFGFV----FNNVQSLLIYNDTKFIYYPNPT
: : .. :.:.. : :.:. .... ... ..:: . : : :.::
CCDS43 FHNDTKVVFLSPAV-----P-----EEPEAYNLTVLIEMDGHRALLRTEAGAFEYVPDPT
1050 1060 1070 1080 1090
1160 1170 1180 1190 1200 1210
pF1KSD FELLSPTGVLDQKPGSPIILKGKNLCPPASGGAKLNYTVLIGETPCAV-TVSETQLLCEP
:: . :: . .. .. : .: :: . . ...: :.. :..::.: :::
CCDS43 FE--NFTGGVKKQVNKLIHARGTNLNKAMT---LQEAEAFVGAERCTMKTLTETDLYCEP
1100 1110 1120 1130 1140 1150
1220 1230 1240 1250 1260
pF1KSD PNLTGQHK-------------VMVHVGGMVFSPGSV---SVISDSLLTLPAIVSIAAGGS
:.. : .:. :. . : : . .:: :.: . :.
CCDS43 PEVQPPPKRRQKRDTTHNLPEFIVKFGSREWVLGRVEYDTRVSDVPLSLILPLVIVP---
1160 1170 1180 1190 1200
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KSD LLLIIVIIVLIAYKRKSRENDLTLKRLQMQMDNLESRVALECKEAFAELQTDINELTSDL
..... . . : :::.. . .... :...:: : .::. :..:. .... :.:.
CCDS43 -MVVVIAVSVYCYWRKSQQAEREYEKIKSQLEGLEESVRDRCKKEFTDLMIEMEDQTNDV
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1330 1340 1350 1360 1370
pF1KSD DRSGIPYLDYRTYAMRVLF-P---GIEDHPVLRELEVQGNGQQHVEKALKLFAQLINNKV
..::: :::.::. ::.: : : .: . .:.. . ::.:: :..:.:.:
CCDS43 HEAGIPVLDYKTYTDRVFFLPSKDGDKDVMITGKLDIPEPRRPVVEQALYQFSNLLNSKS
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1380 1390 1400 1410 1420 1430
pF1KSD FLLTFIRTLELQRSFSMRDRGNVASLIMTGLQGRLEYATDVLKQLLSDLIDKNLENKNHP
::..::.::: :: :: : . :::. ..:.:.::: ::... :. .:... . :: :
CCDS43 FLINFIHTLENQREFSARAKVYFASLLTVALHGKLEYYTDIMHTLFLELLEQYVVAKN-P
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1440 1450 1460 1470 1480 1490
pF1KSD KLLLRRTESVAEKMLTNWFAFLLHKFLKECAGEPLFMLYCAIKQQMEKGPIDAITGEARY
::.:::.:.:.:.::.::... :...::. :::::. :. :::.:.::::.::. .:.:
CCDS43 KLMLRRSETVVERMLSNWMSICLYQYLKDSAGEPLYKLFKAIKHQVEKGPVDAVQKKAKY
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1500 1510 1520 1530 1540 1550
pF1KSD SLSEDKLIRQQIEYKTLILNCVNPDNENSPEIPVKVLNCDTITQVKEKILDAVYKNVPYS
.:.. :. ...:: : .. . : :. :::::::::::.::::::.: ::.. : :
CCDS43 TLNDTGLLGDDVEYAPLTVSVIVQD-EGVDAIPVKVLNCDTISQVKEKIIDQVYRGQPCS
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1560 1570 1580 1590 1600 1610
pF1KSD QRPRAVDMDLEWRQGRIARVVLQDEDITTKIEGDWKRLNTLMHYQVSDRSVVALVPKQTS
:: .. :::: : :.. :.: :.:.. :: :::.::::::.: : ... :
CCDS43 CWPRPDSVVLEWRPGSTAQI-LSDLDLTSQREGRWKRVNTLMHYNVRDGATLIL------
1510 1520 1530 1540 1550
1620 1630 1640 1650 1660 1670
pF1KSD SYNIPASASISRTSISRY--DSSFRYTGSPDSLRSRAPMITPDLESGVKVWHLVKNHDHG
:....:. ::. : .: :: .:::::. :.
CCDS43 ----------SKVGVSQQPEDSQQDLPGERHAL----------LEEENRVWHLVRPTDEV
1560 1570 1580 1590
1680 1690 1700 1710 1720
pF1KSD DQKEGDRGS-------KMVSEIYLTRLLATKGTLQKFVDDLFETLFSTVHRGSALPLAIK
:. .. ::: : ..::::::::..:::::.:::..:..... : :.: :.:
CCDS43 DEGKSKRGSVKEKERTKAITEIYLTRLLSVKGTLQQFVDNFFQSVLAP---GHAVPPAVK
1600 1610 1620 1630 1640 1650
1730 1740 1750 1760 1770 1780
pF1KSD YMFDFLDEQADRHSIHDTDVRHTWKSNCLPLRFWVNVIKNPQFVFDIHKGSITDACLSVV
:.::::::::..:.:.: :. : ::.: ::::::::..:::.:.::.: ..:: :::.
CCDS43 YFFDFLDEQAEKHNIQDEDTIHIWKTNSLPLRFWVNILKNPHFIFDVHVHEVVDASLSVI
1660 1670 1680 1690 1700 1710
1790 1800 1810 1820 1830 1840
pF1KSD AQTFMDSCSTSEHRLGKDSPSNKLLYAKDIPSYKSWVERYYADIAKLPAISDQDMNAYLA
::::::.:. .::.:..:::::::::::.: .::. :: :: : .. .::::::..::
CCDS43 AQTFMDACTRTEHKLSRDSPSNKLLYAKEISTYKKMVEDYYKGIRQMVQVSDQDMNTHLA
1720 1730 1740 1750 1760 1770
1850 1860 1870 1880 1890 1900
pF1KSD EQSRLHAVEFNMLSALNEIYSYVSKYSEELIGALEQDEQARRQRLAYKVEQLINAMSIES
: :: :. .: : ::...:.:..:: .:.:.:::.: :....::....:. :.
CCDS43 EISRAHTDSLNTLVALHQLYQYTQKYYDEIINALEEDPAAQKMQLAFRLQQIAAALENKV
1780 1790 1800 1810 1820 1830
CCDS43 TDL
>>CCDS33854.1 PLXND1 gene_id:23129|Hs108|chr3 (1925 aa)
initn: 2275 init1: 711 opt: 1028 Z-score: 1111.3 bits: 219.0 E(32554): 1.4e-55
Smith-Waterman score: 3237; 33.2% identity (60.6% similar) in 2011 aa overlap (7-1905:4-1914)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MSTHRSRLLTAAPLSMEQRRPWPRALEVDSRSVVLLSVVWVLLAPPAAGMPQFSTFHSEN
: .:::: . : ... : : : .. .: : :... : : .
CCDS33 MAPRAAGGAPLSARAAAASPPPFQTPPRCPVPLLLLLLLGAARAGALEIQRRFPSPT
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KSD RDWTFNHLTVHQGTGAVYVGAINRVYKLTG-NLTIQVAHKTGPEEDNKSCYPPLIVQP-C
:.... ..:.::..:.::.:.:.: ::.... .:: :. :. : . : :
CCDS33 ---PTNNFALDGAAGTVYLAAVNRLYQLSGANLSLEAEAAVGPVPDSPLCHAPQLPQASC
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KSD SEVLTLTNNVNKLLIIDYSENRLLACGSLYQGVCKLLRLDDLFILV-------EPSHKKE
. ::.: ::.: .: ... ...:::.::: :.: : .. .. :..
CCDS33 EHPRRLTDNYNKILQLDPGQGLVVVCGSIYQGFCQLRRRGNISAVAVRFPPAAPPAEPVT
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220
pF1KSD HYLSSVN-----KTGTMYGVIVR-SEGEDG-KLFIGTAVDGK-QDYFP---TLSSRKLPR
. : .: ... :... . : : .:..:.. : ...:: .: ....
CCDS33 VFPSMLNVAANHPNASTVGLVLPPAAGAGGSRLLVGATYTGYGSSFFPRNRSLEDHRFEN
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270
pF1KSD DPESSAMLDYELHSDFVS--SLIKIPSDT--LALVSHFDIFYIYGFASGGFVYFLTVQP-
:: :. . . ..:... .. ::: : . . . ::.:. :.. :
CCDS33 TPEI-AIRSLDTRGDLAKLFTFDLNPSDDNILKIKQGAKEQHKLGFVSA-FLHPSDPPPG
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320
pF1KSD -ETPEGVAINS---AGDLFYTSR--IVRLC------KDDPKF-HSYVSLPFGCTRAGVEY
.. .:.:: ::: .: ..:.: : :. .::..: . : ::
CCDS33 AQSYAYLALNSEARAGDKESQARSLLARICLPHGAGGDAKKLTESYIQLGLQC--AGGAG
300 310 320 330 340 350
330 340 350 360 370 380
pF1KSD RLLQAAYLAKPGDSLAQAFNITSQDDVLFAIFSKGQKQYHHPPDDSALCAFPIRAINLQI
: :: .. .. . :::.: . : . .::::: . . :
CCDS33 R----------GDLYSRLVSVFPARERLFAVFERPQGSPAARAAPAALCAFRFADVRAAI
360 370 380 390 400
390 400 410 420 430
pF1KSD KGRLQSCYQGEGNLELNWLLGKDVQ-----CTKA------PVPIDDNFCGL-DINQPLGG
.. .:. : .. .: . :: : . : .: :: ...::.
CCDS33 RAARTACFV-EPAPDVVAVLDSVVQGTGPACERKLNIQLQPEQLD---CGAAHLQHPLSI
410 420 430 440 450
440 450 460 470 480 490
pF1KSD STPVEGLTLYTTSRDRMTSVASYVYNGYSVVFVGTKSGKLKKIRADGPPHGGVQYEMVSV
:... .. . .:::: :.:..::.:: .:.: :: . :. ..:.:
CCDS33 LQPLKATPVFRAPG--LTSVAVASVNNYTAVFLGTVNGRLLKINLN-ESMQVVSRRVVTV
460 470 480 490 500 510
500 510 520 530 540
pF1KSD LKDGSPILRDMAFS-IDQRYLYVMSERQVTRVPVESCEQYTTCGECLSSGDPHCGWCALH
: :. . : :. :. :::.:. .:..:: : .:. ..:::.:....: .::::::.
CCDS33 AY-GEPVHHVMQFDPADSGYLYLMTSHQMARVKVAACNVHSTCGDCVGAADAYCGWCALE
520 530 540 550 560 570
550 560 570 580 590 600
pF1KSD NMCSRRDKC-----QQAWEPNRFAASISQCVSLAVHPSSISV-SEHSRLLSLVVSDAPDL
. :. .. : :. : . . :.: ...: :: :.: .:. .. . .. :.:
CCDS33 TRCTLQQDCTNSSQQHFWTSA--SEGPSRCPAMTVLPSEIDVRQEYPGMILQISGSLPSL
580 590 600 610 620 630
610 620 630 640 650
pF1KSD SAG-IACAFGN----LTEVEGQVSGSQVICISPGPKD-VPVIPLDQDWFGLELQLRSKET
:. .:: .:: ...: : . : :. . :.: : .: .:: .:...: .
CCDS33 SGMEMACDYGNNIRTVARVPGPAFGHQIAYCNLLPRDQFPPFPPNQDHVTVEMSVRVN--
640 650 660 670 680
660 670 680 690 700 710
pF1KSD GKIFVSTEFKFYNCS------AHQLCLSCVNSAFRCHWCKYRNLCTHDPTTCSFQEGRIN
:. .:...: .:.:: : : ::... . : ::. .. :. . . : . . .
CCDS33 GRNIVKANFTIYDCSRTAQVYPHTACTSCLSAQWPCFWCSQQHSCVSNQSRCEASPNPTS
690 700 710 720 730 740
720 730 740 750 760 770
pF1KSD ISEDCPQLVPTEEILIPVGEVKPITLKARNLPQPQSGQRGYECVLNIQGAIHRVPALRFN
.:::. . . .:.: . : . : :.. . :: .... .. :. :
CCDS33 -PQDCPRTLLSPLAPVPTGGSQNILVPLANTAFFQGA--ALECSFGLEEIFE---AVWVN
750 760 770 780 790 800
780 790 800 810 820 830
pF1KSD SSSVQCQNSSYQYDGMDISNLAVDFAVVWNGNFIIDNPQDLKVHLYKCAAQRESCGLCL-
: :.: .. . . . ... . ..:.:. . : .:.:: .:. ::
CCDS33 ESVVRC-DQVVLHTTRKSQVFPLSLQLKGRPARFLDSPEPMTVMVYNCAMGSPDCSQCLG
810 820 830 840 850 860
840 850 860 870 880 890
pF1KSD KADRKFECGWCSGERRCTLHQHCTSPSSPWLDWSSHNVKCSNPQITEILTVSGPPEGGTR
. : : : .: : :. .: .: : :.: : .::: .:::
CCDS33 REDLGHLCMWSDG---CRLR----GPLQPMAG------TCPAPEIHAIEPLSGPLDGGTL
870 880 890 900
900 910 920 930 940 950
pF1KSD VTIHGVNLGLDFSEIAHHVQVAGVPCTPLPGEYIIAEQIVCEMGHALVGTTSGPVRLCIG
.::.: ::: .:..:: : ..:: : ::: .: ..:.::: : : : :: : ..
CCDS33 LTIRGRNLGRRLSDVAHGVWIGGVACEPLPDRYTVSEEIVCVTGPA-PGPLSGVVT--VN
910 920 930 940 950 960
960 970 980 990 1000
pF1KSD ECKPEFMTKSHQQYTFVNPSVLSLNPIRGPESGGTMVTITGHYLGAGSSVAVYLGN-QTC
: ::......: : : ::.: ::..::: .:: :. : .:: . : ... . :
CCDS33 ASKE---GKSRDRFSYVLPLVHSLEPTMGPKAGGTRITIHGNDLHVGSELQVLVNDTDPC
970 980 990 1000 1010 1020
1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KSD EFYGRSMSEIVCVSPPSSNGLGPVPVSVSVDR-AHVDSNLQFEYIDDPRVQRIEPEWSIA
:. . :.:. : .. .:::: : .: . : .:: : :...: . : :. : .
CCDS33 TELMRTDTSIACTMPEGALP-APVPVCVRFERRGCVHGNLTFWYMQNPVITAISPRRSPV
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1070 1080 1090 1100 1110 1120
pF1KSD SGHTPLTITGFNLDVIQEPRIRVKFNGKESVNVCKVVNTTTLTCLAPSLTTDYRPGLDTV
:: .:..: . ..:. . :. :.: . .:::.:.: .:: .:. .. .:
CCDS33 SGGRTITVAGERFHMVQNVSMAVHHIGREPT-LCKVLNSTLITCPSPGALSNASAPVDFF
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1130 1140 1150 1160 1170 1180
pF1KSD ----ERPDEFGFVFNNVQSLLIYNDTKFI--YYPNPTFELLSPTGVLDQKPGSPIILKGK
:: . . . .. ..: : ::: : . . ..:: :. : .
CCDS33 INGRAYADEVAVAEELLDPEEAQRGSRFRLDYLPNPQFSTAKREKWIKHHPGEPLTLVIH
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1190 1200 1210 1220 1230
pF1KSD NLCPPASGGAKLNYTVLIGETPCAVT-VSETQLLCEPPN----LTGQHKVMVHVGGMVFS
. . : . .: : ::.. : . ::. . : . .:: . ..::. :.
CCDS33 KE-QDSLGLQSHEYRVKIGQVSCDIQIVSDRIIHCSVNESLGAAVGQLPITIQVGN--FN
1210 1220 1230 1240 1250
1240 1250 1260 1270 1280 1290
pF1KSD PGSVSVISDSLLTLPAIVSIAAGGSLLLIIVIIVLIAYKRKSRENDLTLKRLQMQMDNLE
...... . ::::. :.::.. ...:... :::. . .. .::...:
CCDS33 Q-TIATLQLGGSETAIIVSIVIC-SVLLLLSVVALFVFCTKSRRAERYWQKTLLQMEEME
1260 1270 1280 1290 1300 1310
1300 1310 1320 1330 1340
pF1KSD SRVALECKEAFAELQTDINELTSDLDRS-GIPYLDYRTYAMRVLFP--------------
:.. : ...:::::::...::..:.:: :::.:.:. .. :..::
CCDS33 SQIREEIRKGFAELQTDMTDLTKELNRSQGIPFLEYKHFVTRTFFPKCSSLYEERYVLPS
1320 1330 1340 1350 1360 1370
1350 1360 1370 1380 1390
pF1KSD ----------GIEDHPVLRELEVQGNGQQHVEKALKLFAQLINNKVFLLTFIRTLELQRS
. : ::.: : .. . . ..:....::..:.::: ::..:...:: :..
CCDS33 QTLNSQGSSQAQETHPLLGEWKIPESCRPNMEEGISLFSSLLNNKHFLIVFVHALEQQKD
1380 1390 1400 1410 1420 1430
1400 1410 1420 1430 1440 1450
pF1KSD FSMRDRGNVASLIMTGLQGRLEYATDVLKQLLSDLIDKNLENKNHPKLLLRRTESVAEKM
:..::: ..:::. .:.:.::: :...:.:: :::: . :: :::.:::::::.:::
CCDS33 FAVRDRCSLASLLTIALHGKLEYYTSIMKELLVDLIDAS-AAKN-PKLMLRRTESVVEKM
1440 1450 1460 1470 1480 1490
1460 1470 1480 1490 1500 1510
pF1KSD LTNWFAFLLHKFLKECAGEPLFMLYCAIKQQMEKGPIDAITGEARYSLSEDKLIRQQIEY
::::... ... :.: .:::.:.: ::::::..:: ::::::.:::.:::. :.:..::
CCDS33 LTNWMSICMYSCLRETVGEPFFLLLCAIKQQINKGSIDAITGKARYTLSEEWLLRENIEA
1500 1510 1520 1530 1540 1550
1520 1530 1540 1550 1560 1570
pF1KSD KTLILNCVNPDNENSPEIPVKVLNCDTITQVKEKILDAVYKNVPYSQRPRAVDMDLEWRQ
: :: :. .. . . :.... ::.::::::::.: ::::::: ::: :.::::
CCDS33 KPRNLN-VSFQGCGMDSLSVRAMDTDTLTQVKEKILEAFCKNVPYSQWPRAEDVDLEWFA
1560 1570 1580 1590 1600 1610
1580 1590 1600 1610 1620 1630
pF1KSD GRIARVVLQDEDITTKIEGDWKRLNTLMHYQVSDRSVVALVPKQTSSYNIPASASISRTS
. .:.: : :. .: :.:::: ::. :: .::.. .
CCDS33 SSTQSYILRDLDDTSVVEDGRKKLNTLAHYK------------------IPEGASLAMSL
1620 1630 1640 1650
1640 1650 1660 1670 1680
pF1KSD ISRYDSSFRYTGSPDSLRSRAPMITPDLESGVKVWHLVKNHDH-GDQKEGDRGS---KMV
:.. :... : .: : : : .::: :. .. :.. : : :..
CCDS33 IDKKDNTL---GRVKDL---------DTE---KYFHLVLPTDELAEPKKSHRQSHRKKVL
1660 1670 1680 1690
1690 1700 1710 1720 1730 1740
pF1KSD SEIYLTRLLATKGTLQKFVDDLFETLFSTVHRGSALPLAIKYMFDFLDEQADRHSIHDTD
::::::::.::::::::.::::....: : . :::.::.::::.:::....: : :
CCDS33 PEIYLTRLLSTKGTLQKFLDDLFKAILSI--REDKPPLAVKYFFDFLEEQAEKRGISDPD
1700 1710 1720 1730 1740 1750
1750 1760 1770 1780 1790 1800
pF1KSD VRHTWKSNCLPLRFWVNVIKNPQFVFDIHKGSITDACLSVVAQTFMDSCSTSEHRLGKDS
. : ::.: ::::::::..::::::::: : . ::::::.::.:.:.:: :. .:::::
CCDS33 TLHIWKTNSLPLRFWVNILKNPQFVFDIDKTDHIDACLSVIAQAFIDACSISDLQLGKDS
1760 1770 1780 1790 1800 1810
1810 1820 1830 1840 1850 1860
pF1KSD PSNKLLYAKDIPSYKSWVERYYADIAKLPAISDQDMNAYLAEQSRLHAVEFNMLSALNEI
:.:::::::.:: :.. :.::: .: . .:.:.:::.:::.:: . ::: :. ::
CCDS33 PTNKLLYAKEIPEYRKIVQRYYKQIQDMTPLSEQEMNAHLAEESRKYQNEFNTNVAMAEI
1820 1830 1840 1850 1860 1870
1870 1880 1890 1900
pF1KSD YSYVSKYSEELIGALEQDEQARRQRLAYKVEQLINAMSIES
:.:...: ....::: . ::: .: .: ::.. :
CCDS33 YKYAKRYRPQIMAALEANPTARRTQLQHKFEQVVALMEDNIYECYSEA
1880 1890 1900 1910 1920
1909 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 01:48:30 2016 done: Thu Nov 3 01:48:31 2016
Total Scan time: 5.760 Total Display time: 1.390
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]