Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA0416
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0416, 516 aa
1>>>pF1KSDA0416 516 - 516 aa - 516 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4769+/-0.00116; mu= 17.3769+/- 0.069
mean_var=90.7093+/-18.709, 0's: 0 Z-trim(104.9): 220 B-trim: 330 in 2/49
Lambda= 0.134663
statistics sampled from 7884 (8134) to 7884 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.613), E-opt: 0.2 (0.25), width: 16
Scan time: 2.400
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS47272.1 LRRTM2 gene_id:26045|Hs108|chr5 ( 516) 3504 691.6 5.6e-199
CCDS1966.1 LRRTM1 gene_id:347730|Hs108|chr2 ( 522) 1667 334.7 1.5e-91
CCDS7270.1 LRRTM3 gene_id:347731|Hs108|chr10 ( 581) 1509 304.0 2.9e-82
CCDS46347.1 LRRTM4 gene_id:80059|Hs108|chr2 ( 518) 1472 296.8 3.9e-80
CCDS46346.1 LRRTM4 gene_id:80059|Hs108|chr2 ( 590) 1468 296.1 7.3e-80
CCDS74530.1 LRRTM4 gene_id:80059|Hs108|chr2 ( 519) 1467 295.8 7.6e-80
CCDS82475.1 LRRTM4 gene_id:80059|Hs108|chr2 ( 591) 1463 295.1 1.4e-79
CCDS33920.1 CPN2 gene_id:1370|Hs108|chr3 ( 545) 478 103.7 5.5e-22
CCDS75573.1 TRIL gene_id:9865|Hs108|chr7 ( 811) 442 96.9 9.4e-20
CCDS30971.1 LGR6 gene_id:59352|Hs108|chr1 ( 967) 441 96.7 1.2e-19
CCDS46984.1 LRRC15 gene_id:131578|Hs108|chr3 ( 587) 425 93.5 7.3e-19
CCDS46715.1 CHADL gene_id:150356|Hs108|chr22 ( 762) 420 92.6 1.7e-18
CCDS3306.1 LRRC15 gene_id:131578|Hs108|chr3 ( 581) 418 92.1 1.9e-18
CCDS61194.1 LGR5 gene_id:8549|Hs108|chr12 ( 883) 414 91.5 4.3e-18
CCDS73766.1 LINGO1 gene_id:84894|Hs108|chr15 ( 614) 412 90.9 4.3e-18
CCDS45313.1 LINGO1 gene_id:84894|Hs108|chr15 ( 620) 412 90.9 4.4e-18
CCDS9000.1 LGR5 gene_id:8549|Hs108|chr12 ( 907) 412 91.1 5.8e-18
CCDS44933.1 LRIG3 gene_id:121227|Hs108|chr12 (1059) 401 89.0 2.9e-17
CCDS8960.1 LRIG3 gene_id:121227|Hs108|chr12 (1119) 401 89.0 3e-17
CCDS31449.1 LGR4 gene_id:55366|Hs108|chr11 ( 951) 399 88.6 3.4e-17
CCDS10514.1 VASN gene_id:114990|Hs108|chr16 ( 673) 394 87.5 5.2e-17
CCDS10446.1 IGFALS gene_id:3483|Hs108|chr16 ( 605) 393 87.2 5.5e-17
CCDS53982.1 IGFALS gene_id:3483|Hs108|chr16 ( 643) 393 87.3 5.8e-17
CCDS47218.1 LRRC70 gene_id:100130733|Hs108|chr5 ( 622) 391 86.9 7.4e-17
CCDS30808.1 LRIG2 gene_id:9860|Hs108|chr1 (1065) 384 85.7 2.8e-16
CCDS4369.1 SLIT3 gene_id:6586|Hs108|chr5 (1523) 384 85.8 3.7e-16
CCDS64311.1 SLIT3 gene_id:6586|Hs108|chr5 (1530) 384 85.8 3.7e-16
CCDS9342.1 RXFP2 gene_id:122042|Hs108|chr13 ( 754) 378 84.4 4.9e-16
CCDS1424.1 LGR6 gene_id:59352|Hs108|chr1 ( 915) 371 83.1 1.5e-15
CCDS7957.1 RTN4RL2 gene_id:349667|Hs108|chr11 ( 420) 366 81.9 1.6e-15
CCDS14721.1 BGN gene_id:633|Hs108|chrX ( 368) 362 81.0 2.5e-15
CCDS9038.1 LUM gene_id:4060|Hs108|chr12 ( 338) 359 80.4 3.5e-15
CCDS3307.1 GP5 gene_id:2814|Hs108|chr3 ( 560) 358 80.4 5.8e-15
CCDS31464.1 LRRC4C gene_id:57689|Hs108|chr11 ( 640) 351 79.1 1.7e-14
CCDS9039.1 DCN gene_id:1634|Hs108|chr12 ( 359) 347 78.1 1.8e-14
CCDS33783.1 LRIG1 gene_id:26018|Hs108|chr3 (1093) 348 78.7 3.7e-14
CCDS75111.1 SLIT2 gene_id:9353|Hs108|chr4 (1521) 343 77.9 9.2e-14
CCDS75110.1 SLIT2 gene_id:9353|Hs108|chr4 (1525) 343 77.9 9.2e-14
CCDS3426.1 SLIT2 gene_id:9353|Hs108|chr4 (1529) 343 77.9 9.2e-14
CCDS34969.1 LRRC24 gene_id:441381|Hs108|chr8 ( 513) 336 76.1 1.1e-13
CCDS7453.1 SLIT1 gene_id:6585|Hs108|chr10 (1534) 339 77.1 1.6e-13
CCDS12130.1 LRG1 gene_id:116844|Hs108|chr19 ( 347) 328 74.4 2.3e-13
CCDS58929.1 RXFP1 gene_id:59350|Hs108|chr4 ( 709) 330 75.1 3e-13
CCDS53862.1 RXFP2 gene_id:122042|Hs108|chr13 ( 730) 328 74.7 4e-13
CCDS33685.1 LRRN1 gene_id:57633|Hs108|chr3 ( 716) 325 74.1 5.9e-13
CCDS6524.1 LINGO2 gene_id:158038|Hs108|chr9 ( 606) 323 73.6 6.9e-13
CCDS81800.1 LRFN5 gene_id:145581|Hs108|chr14 ( 466) 319 72.8 9.7e-13
CCDS45569.1 RTN4RL1 gene_id:146760|Hs108|chr17 ( 441) 318 72.6 1.1e-12
CCDS31033.1 TLR5 gene_id:7100|Hs108|chr1 ( 858) 320 73.2 1.3e-12
CCDS9678.1 LRFN5 gene_id:145581|Hs108|chr14 ( 719) 319 72.9 1.3e-12
>>CCDS47272.1 LRRTM2 gene_id:26045|Hs108|chr5 (516 aa)
initn: 3504 init1: 3504 opt: 3504 Z-score: 3685.7 bits: 691.6 E(32554): 5.6e-199
Smith-Waterman score: 3504; 100.0% identity (100.0% similar) in 516 aa overlap (1-516:1-516)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MGLHFKWPLGAPMLAAIYAMSMVLKMLPALGMACPPKCRCEKLLFYCDSQGFHSVPNATD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MGLHFKWPLGAPMLAAIYAMSMVLKMLPALGMACPPKCRCEKLLFYCDSQGFHSVPNATD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD KGSLGLSLRHNHITELERDQFASFSQLTWLHLDHNQISTVKEDAFQGLYKLKELILSSNK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 KGSLGLSLRHNHITELERDQFASFSQLTWLHLDHNQISTVKEDAFQGLYKLKELILSSNK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD IFYLPNTTFTQLINLQNLDLSFNQLSSLHPELFYGLRKLQTLHLRSNSLRTIPVRLFWDC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 IFYLPNTTFTQLINLQNLDLSFNQLSSLHPELFYGLRKLQTLHLRSNSLRTIPVRLFWDC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD RSLEFLDLSTNRLRSLARNGFAGLIKLRELHLEHNQLTKINFAHFLRLSSLHTLFLQWNK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 RSLEFLDLSTNRLRSLARNGFAGLIKLRELHLEHNQLTKINFAHFLRLSSLHTLFLQWNK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD ISNLTCGMEWTWGTLEKLDLTGNEIKAIDLTVFETMPNLKILLMDNNKLNSLDSKILNSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 ISNLTCGMEWTWGTLEKLDLTGNEIKAIDLTVFETMPNLKILLMDNNKLNSLDSKILNSL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD RSLTTVGLSGNLWECSARICALASWLGSFQGRWEHSILCHSPDHTQGEDILDAVHGFQLC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 RSLTTVGLSGNLWECSARICALASWLGSFQGRWEHSILCHSPDHTQGEDILDAVHGFQLC
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD WNLSTTVTVMATTYRDPTTEYTKRISSSSYHVGDKEIPTTAGIAVTTEEHFPEPDNAIFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 WNLSTTVTVMATTYRDPTTEYTKRISSSSYHVGDKEIPTTAGIAVTTEEHFPEPDNAIFT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD QRVITGTMALLFSFFFIIFIVFISRKCCPPTLRRIRQCSMVQNHRQLRSQTRLHMSNMSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 QRVITGTMALLFSFFFIIFIVFISRKCCPPTLRRIRQCSMVQNHRQLRSQTRLHMSNMSD
430 440 450 460 470 480
490 500 510
pF1KSD QGPYNEYEPTHEGPFIIINGYGQCKCQQLPYKECEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 QGPYNEYEPTHEGPFIIINGYGQCKCQQLPYKECEV
490 500 510
>>CCDS1966.1 LRRTM1 gene_id:347730|Hs108|chr2 (522 aa)
initn: 1795 init1: 776 opt: 1667 Z-score: 1756.9 bits: 334.7 E(32554): 1.5e-91
Smith-Waterman score: 1667; 47.6% identity (77.1% similar) in 525 aa overlap (1-516:6-522)
10 20 30 40 50
pF1KSD MGLHFKWPLGAPMLAAIYAMSMVLKMLPALGMACPPKCRCEKLLFYCDSQGFHSV
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CCDS19 MDFLLLGLCLYWLLRRPSGVVLCLLGACFQMLPAAPSGCPQLCRCEGRLLYCEALNLTEA
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KSD PNATDKGSLGLSLRHNHITELERDQFASFSQLTWLHLDHNQISTVKEDAFQGLYKLKELI
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CCDS19 PHNLS-GLLGLSLRYNSLSELRAGQFTGLMQLTWLYLDHNHICSVQGDAFQKLRRVKELT
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KSD LSSNKIFYLPNTTFTQLINLQNLDLSFNQLSSLHPELFYGLRKLQTLHLRSNSLRTIPVR
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CCDS19 LSSNQITQLPNTTFRPMPNLRSVDLSYNKLQALAPDLFHGLRKLTTLHMRANAIQFVPVR
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KSD LFWDCRSLEFLDLSTNRLRSLARNGFAGLIKLRELHLEHNQLTKINFAHFLRLSSLHTLF
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CCDS19 IFQDCRSLKFLDIGYNQLKSLARNSFAGLFKLTELHLEHNDLVKVNFAHFPRLISLHSLC
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KSD LQWNKISNLTCGMEWTWGTLEKLDLTGNEIKAIDLTVFETMPNLKILLMDNNKLNSLDSK
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CCDS19 LRRNKVAIVVSSLDWVWN-LEKMDLSGNEIEYMEPHVFETVPHLQSLQLDSNRLTYIEPR
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KSD ILNSLRSLTTVGLSGNLWECSARICALASWLGSFQGRWEHSILCHSPDHTQGEDILDAVH
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CCDS19 ILNSWKSLTSITLAGNLWDCGRNVCALASWLNNFQGRYDGNLQCASPEYAQGEDVLDAVY
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400
pF1KSD GFQLCWNLSTTVT---VMATTYRD----PTTEYTKRISSS-SYHVGDKEIPTTAGIAVTT
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CCDS19 AFHLCEDGAEPTSGHLLSAVTNRSDLGPPASSATTLADGGEGQHDGTFE-PAT--VALPG
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KSD EEHFPEPDNAIFTQRVITGTMALLFSFFFIIFIVFISRKCCPPTLRRIRQCSMVQNHRQL
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CCDS19 GEH---AENAVQIHKVVTGTMALIFSFLIVVLVLYVSWKCFPASLRQLRQCFVTQRRKQK
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510
pF1KSD RSQTRLHMSNMSDQGPYNEYEPTH-EGPFIIINGYGQCKCQQLPYKECEV
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CCDS19 QKQTMHQMAAMSAQEYYVDYKPNHIEGALVIINEYGSCTCHQQPARECEV
480 490 500 510 520
>>CCDS7270.1 LRRTM3 gene_id:347731|Hs108|chr10 (581 aa)
initn: 1318 init1: 1017 opt: 1509 Z-score: 1590.4 bits: 304.0 E(32554): 2.9e-82
Smith-Waterman score: 1509; 44.6% identity (73.9% similar) in 518 aa overlap (1-516:1-513)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MGLHFKWPLGAPMLAAIYAMSMVLKMLPALGMACPPKCRCEKLLFYCDSQGFHSVPNATD
::.. :.. .: . : ...: :: . .:: :::: . ::.:: .. .:.. .
CCDS72 MGFNVIRLLSGSAVALVIAPTVLLTMLSSAERGCPKGCRCEGKMVYCESQKLQEIPSSIS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD KGSLGLSLRHNHITELERDQFASFSQLTWLHLDHNQISTVKEDAFQGLYKLKELILSSNK
: ::::::.: . .:. .:: ...:::::.::::.::.. :.::.:. .:::::::::.
CCDS72 AGCLGLSLRYNSLQKLKYNQFKGLNQLTWLYLDHNHISNIDENAFNGIRRLKELILSSNR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD IFYLPNTTFTQLINLQNLDLSFNQLSSLHPELFYGLRKLQTLHLRSNSLRTIPVRLFWDC
: :. :.:: . ::.:::::.::: :: : : ::::: .::::::::::::::.: ::
CCDS72 ISYFLNNTFRPVTNLRNLDLSYNQLHSLGSEQFRGLRKLLSLHLRSNSLRTIPVRIFQDC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD RSLEFLDLSTNRLRSLARNGFAGLIKLRELHLEHNQLTKINFAHFLRLSSLHTLFLQWNK
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CCDS72 RNLELLDLGYNRIRSLARNVFAGMIRLKELHLEHNQFSKLNLALFPRLVSLQNLYLQWNK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KSD ISNLTCGMEWTWGTLEKLDLTGNEIKAIDL-TVFETMPNLKILLMDNNKLNSLDSKILNS
:: . : :::..:..:::.::::.:.. .::. .:::. : .:.:::. . ..::.:
CCDS72 ISVIGQTMSWTWSSLQRLDLSGNEIEAFSGPSVFQCVPNLQRLNLDSNKLTFIGQEILDS
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KSD LRSLTTVGLSGNLWECSARICALASWLGSFQGRWEHSILCHSPDHTQGEDILDAVHGFQL
::. ..:.::.:::: ::.:..:: ::.: :..:.: :: . :: ...:::.....
CCDS72 WISLNDISLAGNIWECSRNICSLVNWLKSFKGLRENTIICASPKELQGVNVIDAVKNYSI
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KSD CWNLSTTVTVMATTYRDPTTEYTKRISSSSYHVGDKEIPTTAGIAVTTEEHFPEPDNAIF
: . .: .: . :: . .. . : . .: :.: . : . .. :
CCDS72 CGKSTTERFDLARALPKPT--FKPKLPRPK-HESKPPLPPTVGATEPGPETDADAEHISF
370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KSD TQRVITGTMALLFSFFFIIFIVFISRKCCPPTLRRIRQCSMVQNHRQLRSQTRLHMSNMS
...:.:..::..: . :......: : : ......: :... ::. . :. .:. :
CCDS72 -HKIIAGSVALFLSVLVILLVIYVSWKRYPASMKQLQQRSLMRRHRKKKRQSLKQMTP-S
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510
pF1KSD DQGPYNEYEPTH-EGPFIIINGYGQCKCQQLPYKECEV
: : .:.::. : ...:: : : .. .:::.
CCDS72 TQEFYVDYKPTNTETSEMLLNGTGPCTYNKSGSRECEIPLSMNVSTFLAYDQPTISYCGV
480 490 500 510 520 530
CCDS72 HHELLSHKSFETNAQEDTMETHLETELDLSTITTAGRISDHKQQLA
540 550 560 570 580
>>CCDS46347.1 LRRTM4 gene_id:80059|Hs108|chr2 (518 aa)
initn: 1581 init1: 1325 opt: 1472 Z-score: 1552.2 bits: 296.8 E(32554): 3.9e-80
Smith-Waterman score: 1472; 43.5% identity (72.4% similar) in 522 aa overlap (1-516:1-518)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MGLHFKWPLGAPMLAAIYAMSMVLKMLPALGMACPPKCRCEKLLFYCDSQGFHSVPNATD
::.:. : . .. . ...: :: . ::: .:::. . ::.:..: ..:. .
CCDS46 MGFHLITQLKGMSVVLVLLPTLLLVMLTGAQRACPKNCRCDGKIVYCESHAFADIPENIS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD KGSLGLSLRHNHITELERDQFASFSQLTWLHLDHNQISTVKEDAFQGLYKLKELILSSNK
:: ::::: : : .:. .:::...:: ::.:::: ::.: ::::::. .::::::::::
CCDS46 GGSQGLSLRFNSIQKLKSNQFAGLNQLIWLYLDHNYISSVDEDAFQGIRRLKELILSSNK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD IFYLPNTTFTQLINLQNLDLSFNQLSSLHPELFYGLRKLQTLHLRSNSLRTIPVRLFWDC
: :: : :: . ::.:::::.:.:..:. : : ::::: ::::::::.:.:.:.: ::
CCDS46 ITYLHNKTFHPVPNLRNLDLSYNKLQTLQSEQFKGLRKLIILHLRSNSLKTVPIRVFQDC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD RSLEFLDLSTNRLRSLARNGFAGLIKLRELHLEHNQLTKINFAHFLRLSSLHTLFLQWNK
:.:.::::. ::::::.::.::::.::.::::::::..::::::: :: .:....::::.
CCDS46 RNLDFLDLGYNRLRSLSRNAFAGLLKLKELHLEHNQFSKINFAHFPRLFNLRSIYLQWNR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD ISNLTCGMEWTWGTLEKLDLTGNEIKAIDLTVFETMPNLKILLMDNNKLNSLDSKILNSL
: ... :. :::..:..:::.::.:..:. .:. .:::. : .:.:::...... .:.
CCDS46 IRSISQGLTWTWSSLHNLDLSGNDIQGIEPGTFKCLPNLQKLNLDSNKLTNISQETVNAW
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD RSLTTVGLSGNLWECSARICALASWLGSFQGRWEHSILCHSPDHTQGEDILDAVHGFQLC
:: .. ::::.:::: :: : :: .:.: : ...: .: : ::: . :::. ...:
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..... : .. : . : : . . . : :. . :. . :. : .
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.. : ...:.:..::..: .:......: : : ......: :... .:. ... .:
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: : : .:.::. : : .:: : : .::::
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: ... :. :::..:..:::.::.:..:. .:. .:::. : .:.:::...... .:.
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:: .. ::::.:::: :: : :: .:.: : ...: .: : ::: . :::. ...:
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..... : .. : . : : . . . : :. . :. . :. : .
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.. : ...:.:..::..: .:......: : : ......: :... .:. ... .:
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: : : .:.::. : : .:: : : .:::.
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:.:.: :::.:.::::. ::::::.::.::::.::.::::::::..::::::: :: .:.
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...::::.: ... :. :::..:..:::.::.:..:. .:. .:::. : .:.:::...
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CCDS74 ARESERQM-NSPLQEYYVDYKPTNSETMDISVNGSGPCTYTISGSRECEV
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CCDS82 ADIPENISGGSQGLSLRFNSIQKLKSNQFAGLNQLIWLYLDHNYISSVDEDAFQGIRRLK
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pF1KSD ELILSSNKIFYLPNTTFTQLINLQNLDLSFNQLSSLHPELFYGLRKLQTLHLRSNSLRTI
::::::::: :: : :: . ::.:::::.:.:..:. : : ::::: ::::::::.:.
CCDS82 ELILSSNKITYLHNKTFHPVPNLRNLDLSYNKLQTLQSEQFKGLRKLIILHLRSNSLKTV
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CCDS82 SQETVNAWISLISITLSGNMWECSRSICPLFYWLKNFKGNKESTMICAGPKHIQGEKVSD
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CCDS82 ARESERQM-NSPLQEYYVDYKPTNSETMDISVNGSGPCTYTISGSRECEMPHHMKPLPYY
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CCDS33 LLAQLPEELFHPLTSLQTLKLSNNALSGLPQGVFGKLGSLQELFLDSNNISELPPQVFSQ
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CCDS33 LFCLERLWLQRNAITHLPLSIFASLGNLTFLSLQWNMLRVLPAGLFAHTPCLVGLSLTHN
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pF1KSD QLTKINFAHFLRLSSLHTLFLQWNKISNLTCGMEWTWGTLEKLDLTGNEIKAIDLTVFET
:: . . : .::.:..:.:..: :..: :. : :: : .:.. :. ..:..
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. .:..: ...:.:..: :... .: ...: :: :.:. .. : .:: .. : .
CCDS33 LSKLELLSLSKNQLTTLPEGIFDTNYNLFNLALHGNPWQCDCHLAYLFNWLQQYTDRLLN
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CCDS33 IQTYCAGPAYLKGQ-VVPALNEKQLVCPVTRDHLGFQVTWPDESKAGGSWDLAVQERAAR
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.: .: .: : .::.: :..:.:: : ::: :.:
CCDS75 AVFAPLGNLLYLHLESNRIRFLGKNAFAQLGKLRFLNLSANELQPSLRHAATFAPLRSLS
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pF1KSD ---------EH-------------------NQLTKINFAHFLRLSSLHTLFLQWNKISNL
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CCDS75 SLILSANNLQHLGPRIFQHLPRLGLLSLRGNQLTHLAPEAFWGLEALRELRLEGNRLSQL
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pF1KSD TCGMEWTWGTLEKLDLTGNEIKAIDLTVFETMPNLKILLMDNNKLNSLDSKILNSLRSLT
.. .:: :::.:::..:. ..: . :. : . :: :..:.. :. . .:
CCDS75 PTALLEPLHSLEALDLSGNELSALHPATFGHLGRLRELSLRNNALSALSGDIFAASPALY
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. :.:: : :. :. .: :.:.. ::: . :. : .:. :: . ::
CCDS75 RLDLDGNGWTCDCRLRGLKRWMGDWHSQGRLLTVFVQCRHPPALRGK-YLDYLDDQQLQN
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pF1KSD --CWNLSTTVTVMATTYRDPTTEYTKRISSSSYHVGDKEIPTTAGIAVTTEEHFPEPDNA
: . : .... : :.: . ... :.. : ::.: :: :.:
CCDS75 GSCADPSPSASLTADRRRQP-------LPTAA---GEEMTPP-AGLA---EELPPQPQLQ
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420 430 440 450 460 470
pF1KSD IFTQRVITGTMALLFSFFFIIFIVFISRKCCPPTLRRIRQCSMVQNHRQLRSQTRLHMSN
CCDS75 QQGRFLAGVAWDGAARELVGNRSALRLSRRGPGLQQPSPSVAAAAGPAPQSLDLHKKPQR
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CCDS30 MPSPPGLRALWLCAALCASRRAGGAPQPGPGPTACPAPCHCQEDGIMLSADCSELGLSAV
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pF1KSD PNATDKGSLGLSLRHNHITELERDQFASFSQLTWLHLDHNQISTVKEDAFQGLYKLKELI
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CCDS30 PGDLDPLTAYLDLSMNNLTELQPGLFHHLRFLEELRLSGNHLSHIPGQAFSGLYSLKILM
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CCDS30 LQNNQLGGIPAEALWELPSLQSLRLDAN-LISLVPERSFEGLSSLRHLWLDDNALTEIPV
130 140 150 160 170
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pF1KSD RLFWDCRSLEFLDLSTNRLRSLARNGFAGLIKLRELHLEHNQLTKINFAHFLRLSSLHTL
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