Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA0378
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0378, 957 aa
1>>>pF1KSDA0378 957 - 957 aa - 957 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 13.9478+/-0.00152; mu= -18.3364+/- 0.090
mean_var=548.7594+/-119.600, 0's: 0 Z-trim(109.9): 209 B-trim: 112 in 1/51
Lambda= 0.054750
statistics sampled from 11019 (11185) to 11019 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.65), E-opt: 0.2 (0.344), width: 16
Scan time: 4.530
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS46851.1 ERC2 gene_id:26059|Hs108|chr3 ( 957) 6046 493.6 7.6e-139
CCDS53732.1 ERC1 gene_id:23085|Hs108|chr12 (1088) 3755 312.7 2.5e-84
CCDS76504.1 ERC1 gene_id:23085|Hs108|chr12 (1086) 2242 193.2 2.3e-48
CCDS8508.1 ERC1 gene_id:23085|Hs108|chr12 (1116) 2242 193.2 2.4e-48
>>CCDS46851.1 ERC2 gene_id:26059|Hs108|chr3 (957 aa)
initn: 6046 init1: 6046 opt: 6046 Z-score: 2606.2 bits: 493.6 E(32554): 7.6e-139
Smith-Waterman score: 6046; 100.0% identity (100.0% similar) in 957 aa overlap (1-957:1-957)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MYGSARTITNLEGSPSRSPRLPRSPRLGHRRTSSGGGGGTGKTLSMENIQSLNAAYATSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MYGSARTITNLEGSPSRSPRLPRSPRLGHRRTSSGGGGGTGKTLSMENIQSLNAAYATSG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD PMYLSDHEGVASTTYPKGTMTLGRATNRAVYGGRVTAMGSSPNIASAGLSHTDVLSYTDQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 PMYLSDHEGVASTTYPKGTMTLGRATNRAVYGGRVTAMGSSPNIASAGLSHTDVLSYTDQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD HGGLTGSSHHHHHQVPSMLRQVRDSTMLDLQAQLKELQRENDLLRKELDIKDSKLGSSMN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 HGGLTGSSHHHHHQVPSMLRQVRDSTMLDLQAQLKELQRENDLLRKELDIKDSKLGSSMN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD SIKTFWSPELKKERVLRKEEAARMSVLKEQMRVSHEENQHLQLTIQALQDELRTQRDLNH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SIKTFWSPELKKERVLRKEEAARMSVLKEQMRVSHEENQHLQLTIQALQDELRTQRDLNH
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD LLQQESGNRGAEHFTIELTEENFRRLQAEHDRQAKELFLLRKTLEEMELRIETQKQTLNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LLQQESGNRGAEHFTIELTEENFRRLQAEHDRQAKELFLLRKTLEEMELRIETQKQTLNA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD RDESIKKLLEMLQSKGLPSKSLEDDNERTRRMAEAESQVSHLEVILDQKEKENIHLREEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 RDESIKKLLEMLQSKGLPSKSLEDDNERTRRMAEAESQVSHLEVILDQKEKENIHLREEL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD HRRSQLQPEPAKTKALQTVIEMKDTKIASLERNIRDLEDEIQMLKANGVLNTEDREEEIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 HRRSQLQPEPAKTKALQTVIEMKDTKIASLERNIRDLEDEIQMLKANGVLNTEDREEEIK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD QIEVYKSHSKFMKTKIDQLKQELSKKESELLALQTKLETLSNQNSDCKQHIEVLKESLTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 QIEVYKSHSKFMKTKIDQLKQELSKKESELLALQTKLETLSNQNSDCKQHIEVLKESLTA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD KEQRAAILQTEVDALRLRLEEKESFLNKKTKQLQDLTEEKGTLAGEIRDMKDMLEVKERK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 KEQRAAILQTEVDALRLRLEEKESFLNKKTKQLQDLTEEKGTLAGEIRDMKDMLEVKERK
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD INVLQKKIENLQEQLRDKDKQLTNLKDRVKSLQTDSSNTDTALATLEEALSEKERIIERL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 INVLQKKIENLQEQLRDKDKQLTNLKDRVKSLQTDSSNTDTALATLEEALSEKERIIERL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD KEQRERDDRERLEEIESFRKENKDLKEKVNALQAELTEKESSLIDLKEHASSLASAGLKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 KEQRERDDRERLEEIESFRKENKDLKEKVNALQAELTEKESSLIDLKEHASSLASAGLKR
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD DSKLKSLEIAIEQKKEECSKLEAQLKKAHNIEDDSRMNPEFADQIKQLDKEASYYRDECG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 DSKLKSLEIAIEQKKEECSKLEAQLKKAHNIEDDSRMNPEFADQIKQLDKEASYYRDECG
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD KAQAEVDRLLEILKEVENEKNDKDKKIAELESLTLRHMKDQNKKVANLKHNQQLEKKKNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 KAQAEVDRLLEILKEVENEKNDKDKKIAELESLTLRHMKDQNKKVANLKHNQQLEKKKNA
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD QLLEEVRRREDSMADNSQHLQIEELMNALEKTRQELDATKARLASTQQSLAEKEAHLANL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 QLLEEVRRREDSMADNSQHLQIEELMNALEKTRQELDATKARLASTQQSLAEKEAHLANL
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD RIERRKQLEEILEMKQEALLAAISEKDANIALLELSASKKKKTQEEVMALKREKDRLVHQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 RIERRKQLEEILEMKQEALLAAISEKDANIALLELSASKKKKTQEEVMALKREKDRLVHQ
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950
pF1KSD LKQQTQNRMKLMADNYDDDHHHYHHHHHHHHHRSPGRSQHSNHRPSPDQDDEEGIWA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LKQQTQNRMKLMADNYDDDHHHYHHHHHHHHHRSPGRSQHSNHRPSPDQDDEEGIWA
910 920 930 940 950
>>CCDS53732.1 ERC1 gene_id:23085|Hs108|chr12 (1088 aa)
initn: 3867 init1: 2973 opt: 3755 Z-score: 1627.5 bits: 312.7 E(32554): 2.5e-84
Smith-Waterman score: 4224; 69.1% identity (86.3% similar) in 1003 aa overlap (1-949:1-980)
10 20 30 40 50
pF1KSD MYGSARTITNLEGS---PSRSPRLPRSPRLGHRRT-SSGG------GGGTGKTLSMENIQ
::::::.. ..: : :.:::::::::::::::: :.:: :::.::::::::::
CCDS53 MYGSARSVGKVEPSSQSPGRSPRLPRSPRLGHRRTNSTGGSSGSSVGGGSGKTLSMENIQ
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KSD SLNAAYATSGPMYLSDHEGVASTTYPKGTMTLGRATNRAVYGGRVTAMGSSPNIASAGLS
::::::::::::::::::.:.: : ::.::::::. .: :: :.:::::::::::.:..
CCDS53 SLNAAYATSGPMYLSDHENVGSET-PKSTMTLGRSGGRLPYGVRMTAMGSSPNIASSGVA
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KSD HTDVLSYTDQHGGLTGSSHHHHHQVPSMLRQVRDSTMLDLQAQLKELQRENDLLRKELDI
.:.... ..: : : :: :::.::.:..:::.::::. ::::::::....
CCDS53 -SDTIAFGEHH--LPPVSMA--STVPHSLRQARDNTIMDLQTQLKEVLRENDLLRKDVEV
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KSD KDSKLGSSMNSIKTFWSPELKKERVLRKEEAARMSVLKEQMRVSHEENQHLQLTIQALQD
:.:::.::::::::::::::::::.:::.::..... :::.:: .:::::.:.:::::::
CCDS53 KESKLSSSMNSIKTFWSPELKKERALRKDEASKITIWKEQYRVVQEENQHMQMTIQALQD
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KSD ELRTQRDLNHLLQQESGNRGAEHFTIELTEENFRRLQAEHDRQAKELFLLRKTLEEMELR
::: :::::.:.::.:..: .: . :::::::.::.:::.:::::::::::::::::::
CCDS53 ELRIQRDLNQLFQQDSSSRTGEPCVAELTEENFQRLHAEHERQAKELFLLRKTLEEMELR
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KSD IETQKQTLNARDESIKKLLEMLQSKGLPSKSLEDDNERTRRMAEAESQVSHLEVILDQKE
::::::::::::::::::::::::::: .:. :.:.:::::.:::: .: ::: .:.:::
CCDS53 IETQKQTLNARDESIKKLLEMLQSKGLSAKATEEDHERTRRLAEAEMHVHHLESLLEQKE
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KSD KENIHLREELHRRSQLQPEPAKTKALQTVIEMKDTKIASLERNIRDLEDEIQMLKANGVL
::: ::::.::: . :. ::::::::::::::.::.:.::..::::.::::::.::.:
CCDS53 KENSMLREEMHRRFENAPDSAKTKALQTVIEMKDSKISSMERGLRDLEEEIQMLKSNGAL
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KSD NTEDREEEIKQIEVYKSHSKFMKTKIDQLKQELSKKESELLALQTKLETLSNQNSDCKQH
.::.::::.::.:::.:::::::.:: :.:::::.:..::::::::::::.:: :: :::
CCDS53 STEEREEEMKQMEVYRSHSKFMKNKIGQVKQELSRKDTELLALQTKLETLTNQFSDSKQH
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KSD IEVLKESLTAKEQRAAILQTEVDALRLRLEEKESFLNKKTKQLQDLTEEKGTLAGEIRDM
:::::::::::::::::::::::::::::::::..:::::::.::..::::: ::::.:.
CCDS53 IEVLKESLTAKEQRAAILQTEVDALRLRLEEKETMLNKKTKQIQDMAEEKGTQAGEIHDL
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KSD KDMLEVKERKINVLQKKIENLQEQLRDKDKQLTNLKDRVKSLQTDSSNTDTALATLEEAL
::::.:::::.:::::::::::::::::.::...::.::::::.:..::::::.::::::
CCDS53 KDMLDVKERKVNVLQKKIENLQEQLRDKEKQMSSLKERVKSLQADTTNTDTALTTLEEAL
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KSD SEKERIIERLKEQRERDDRERLEEIESFRKENKDLKEKVNALQAELTEKESSLIDLKEHA
.:::: ::::::::.::.::. :::....:. :::::::. ::..:.:::.::.::::::
CCDS53 AEKERTIERLKEQRDRDEREKQEEIDNYKKDLKDLKEKVSLLQGDLSEKEASLLDLKEHA
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KSD SSLASAGLKRDSKLKSLEIAIEQKKEECSKLEAQLKKAHNIEDDSRMNPEFADQIKQLDK
:::::.:::.::.::.::::.::::::: :.:.::::::. ..: .::..:.:..:..
CCDS53 SSLASSGLKKDSRLKTLEIALEQKKEECLKMESQLKKAHEAALEARASPEMSDRIQHLER
660 670 680 690 700 710
720 730 740 750 760 770
pF1KSD EASYYRDECGKAQAEVDRLLEILKEVENEKNDKDKKIAELESLTLRHMKDQNKKVANLKH
: . :.:: .::::::::::::::::::::::::::::::: :..::::::::::::
CCDS53 EITRYKDESSKAQAEVDRLLEILKEVENEKNDKDKKIAELE----RQVKDQNKKVANLKH
720 730 740 750 760 770
780 790 800
pF1KSD NQQLEKKKNAQLLEEVRRREDSMADNSQHLQ-----------------------------
..:.::::.::.:::.:::::.. :.::.::
CCDS53 KEQVEKKKSAQMLEEARRREDNLNDSSQQLQDSLRKKDDRIEELEEALRESVQITAEREM
780 790 800 810 820 830
810 820 830 840
pF1KSD ---------------IEELMNALEKTRQELDATKARLASTQQSLAEKEAHLANLRIERRK
.:::. :.::..:::.. ::.:.::::::::::.::.::: ::::
CCDS53 VLAQEESARTNAEKQVEELLMAMEKVKQELESMKAKLSSTQQSLAEKETHLTNLRAERRK
840 850 860 870 880 890
850 860 870 880 890 900
pF1KSD QLEEILEMKQEALLAAISEKDANIALLELSASKKKKTQEEVMALKREKDRLVHQLKQQTQ
.:::.:::::::::::::::::::::::::.:::: ::::: ::::::::::.:::::::
CCDS53 HLEEVLEMKQEALLAAISEKDANIALLELSSSKKK-TQEEVAALKREKDRLVQQLKQQTQ
900 910 920 930 940
910 920 930 940 950
pF1KSD NRMKLMADNYDDDHHHYHHHHHHHHHRSPGRSQHSNHRPSPDQDDEEGIWA
::::::::::.::: . : :...::.:::::
CCDS53 NRMKLMADNYEDDHFKSSH------------SNQTNHKPSPDQIIQPLLELDQNRSKLKL
950 960 970 980 990
CCDS53 YIGHLTTLCHDRDPLILRGLTPPASYNLDDDQAAWENELQKMTRGQLQDELEKGERDNAE
1000 1010 1020 1030 1040 1050
>>CCDS76504.1 ERC1 gene_id:23085|Hs108|chr12 (1086 aa)
initn: 2480 init1: 1586 opt: 2242 Z-score: 981.6 bits: 193.2 E(32554): 2.3e-48
Smith-Waterman score: 4124; 68.3% identity (85.1% similar) in 1002 aa overlap (1-920:1-991)
10 20 30 40 50
pF1KSD MYGSARTITNLEGS---PSRSPRLPRSPRLGHRRT-SSGG------GGGTGKTLSMENIQ
::::::.. ..: : :.:::::::::::::::: :.:: :::.::::::::::
CCDS76 MYGSARSVGKVEPSSQSPGRSPRLPRSPRLGHRRTNSTGGSSGSSVGGGSGKTLSMENIQ
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KSD SLNAAYATSGPMYLSDHEGVASTTYPKGTMTLGRATNRAVYGGRVTAMGSSPNIASAGLS
::::::::::::::::::.:.: : ::.::::::. .: :: :.:::::::::::.:..
CCDS76 SLNAAYATSGPMYLSDHENVGSET-PKSTMTLGRSGGRLPYGVRMTAMGSSPNIASSGVA
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KSD HTDVLSYTDQHGGLTGSSHHHHHQVPSMLRQVRDSTMLDLQAQLKELQRENDLLRKELDI
.:.... ..: : : :: :::.::.:..:::.::::. ::::::::....
CCDS76 -SDTIAFGEHH--LPPVSMA--STVPHSLRQARDNTIMDLQTQLKEVLRENDLLRKDVEV
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KSD KDSKLGSSMNSIKTFWSPELKKERVLRKEEAARMSVLKEQMRVSHEENQHLQLTIQALQD
:.:::.::::::::::::::::::.:::.::..... :::.:: .:::::.:.:::::::
CCDS76 KESKLSSSMNSIKTFWSPELKKERALRKDEASKITIWKEQYRVVQEENQHMQMTIQALQD
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KSD ELRTQRDLNHLLQQESGNRGAEHFTIELTEENFRRLQAEHDRQAKELFLLRKTLEEMELR
::: :::::.:.::.:..: .: . :::::::.::.:::.:::::::::::::::::::
CCDS76 ELRIQRDLNQLFQQDSSSRTGEPCVAELTEENFQRLHAEHERQAKELFLLRKTLEEMELR
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KSD IETQKQTLNARDESIKKLLEMLQSKGLPSKSLEDDNERTRRMAEAESQVSHLEVILDQKE
::::::::::::::::::::::::::: .:. :.:.:::::.:::: .: ::: .:.:::
CCDS76 IETQKQTLNARDESIKKLLEMLQSKGLSAKATEEDHERTRRLAEAEMHVHHLESLLEQKE
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KSD KENIHLREELHRRSQLQPEPAKTKALQTVIEMKDTKIASLERNIRDLEDEIQMLKANGVL
::: ::::.::: . :. ::::::::::::::.::.:.::..::::.::::::.::.:
CCDS76 KENSMLREEMHRRFENAPDSAKTKALQTVIEMKDSKISSMERGLRDLEEEIQMLKSNGAL
360 370 380 390 400 410
420 430 440
pF1KSD NTEDREEEIKQIEVYKSHSKFMKTKIDQLK----------------------------QE
.::.::::.::.:::.:::::::.:..::: ::
CCDS76 STEEREEEMKQMEVYRSHSKFMKNKVEQLKEELSSKEAQWEELKKKAAGLQAEIGQVKQE
420 430 440 450 460 470
450 460 470 480 490 500
pF1KSD LSKKESELLALQTKLETLSNQNSDCKQHIEVLKESLTAKEQRAAILQTEVDALRLRLEEK
::.:..::::::::::::.:: :: :::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 LSRKDTELLALQTKLETLTNQFSDSKQHIEVLKESLTAKEQRAAILQTEVDALRLRLEEK
480 490 500 510 520 530
510 520 530 540 550 560
pF1KSD ESFLNKKTKQLQDLTEEKGTLAGEIRDMKDMLEVKERKINVLQKKIENLQEQLRDKDKQL
:..:::::::.::..::::: ::::.:.::::.:::::.:::::::::::::::::.::.
CCDS76 ETMLNKKTKQIQDMAEEKGTQAGEIHDLKDMLDVKERKVNVLQKKIENLQEQLRDKEKQM
540 550 560 570 580 590
570 580 590 600 610 620
pF1KSD TNLKDRVKSLQTDSSNTDTALATLEEALSEKERIIERLKEQRERDDRERLEEIESFRKEN
..::.::::::.:..::::::.::::::.:::: ::::::::.::.::. :::....:.
CCDS76 SSLKERVKSLQADTTNTDTALTTLEEALAEKERTIERLKEQRDRDEREKQEEIDNYKKDL
600 610 620 630 640 650
630 640 650 660 670 680
pF1KSD KDLKEKVNALQAELTEKESSLIDLKEHASSLASAGLKRDSKLKSLEIAIEQKKEECSKLE
:::::::. ::..:.:::.::.:::::::::::.:::.::.::.::::.::::::: :.:
CCDS76 KDLKEKVSLLQGDLSEKEASLLDLKEHASSLASSGLKKDSRLKTLEIALEQKKEECLKME
660 670 680 690 700 710
690 700 710 720 730 740
pF1KSD AQLKKAHNIEDDSRMNPEFADQIKQLDKEASYYRDECGKAQAEVDRLLEILKEVENEKND
.::::::. ..: .::..:.:..:..: . :.:: .::::::::::::::::::::::
CCDS76 SQLKKAHEAALEARASPEMSDRIQHLEREITRYKDESSKAQAEVDRLLEILKEVENEKND
720 730 740 750 760 770
750 760 770 780 790 800
pF1KSD KDKKIAELESLTLRHMKDQNKKVANLKHNQQLEKKKNAQLLEEVRRREDSMADNSQHLQ-
::::::::: :..::::::::::::..:.::::.::.:::.:::::.. :.::.::
CCDS76 KDKKIAELE----RQVKDQNKKVANLKHKEQVEKKKSAQMLEEARRREDNLNDSSQQLQD
780 790 800 810 820 830
810
pF1KSD -------------------------------------------IEELMNALEKTRQELDA
.:::. :.::..:::..
CCDS76 SLRKKDDRIEELEEALRESVQITAEREMVLAQEESARTNAEKQVEELLMAMEKVKQELES
840 850 860 870 880 890
820 830 840 850 860 870
pF1KSD TKARLASTQQSLAEKEAHLANLRIERRKQLEEILEMKQEALLAAISEKDANIALLELSAS
::.:.::::::::::.::.::: ::::.:::.:::::::::::::::::::::::::.:
CCDS76 MKAKLSSTQQSLAEKETHLTNLRAERRKHLEEVLEMKQEALLAAISEKDANIALLELSSS
900 910 920 930 940 950
880 890 900 910 920 930
pF1KSD KKKKTQEEVMALKREKDRLVHQLKQQTQNRMKLMADNYDDDHHHYHHHHHHHHHRSPGRS
::: ::::: ::::::::::.:::::::::::::::::.:::
CCDS76 KKK-TQEEVAALKREKDRLVQQLKQQTQNRMKLMADNYEDDHFKSSHSNQTNHKPSPDQI
960 970 980 990 1000
940 950
pF1KSD QHSNHRPSPDQDDEEGIWA
CCDS76 IQPLLELDQNRSKLKLYIGHLTTLCHDRDPLILRGLTPPASYNLDDDQAAWENELQKMTR
1010 1020 1030 1040 1050 1060
>>CCDS8508.1 ERC1 gene_id:23085|Hs108|chr12 (1116 aa)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]