Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA0319
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0319, 1072 aa
1>>>pF1KSDA0319 1072 - 1072 aa - 1072 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.0694+/-0.00111; mu= -1.4060+/- 0.066
mean_var=190.2287+/-39.198, 0's: 0 Z-trim(108.9): 22 B-trim: 74 in 1/51
Lambda= 0.092990
statistics sampled from 10527 (10541) to 10527 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.663), E-opt: 0.2 (0.324), width: 16
Scan time: 4.310
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS34348.1 KIAA0319 gene_id:9856|Hs108|chr6 (1072) 7106 966.7 0
CCDS54970.1 KIAA0319 gene_id:9856|Hs108|chr6 (1063) 6993 951.5 0
CCDS54969.1 KIAA0319 gene_id:9856|Hs108|chr6 (1027) 6821 928.4 0
CCDS54971.1 KIAA0319 gene_id:9856|Hs108|chr6 (1011) 6294 857.7 0
CCDS75409.1 KIAA0319 gene_id:9856|Hs108|chr6 ( 483) 3195 441.9 1.6e-123
CCDS390.1 KIAA0319L gene_id:79932|Hs108|chr1 (1049) 2959 410.3 1.1e-113
>>CCDS34348.1 KIAA0319 gene_id:9856|Hs108|chr6 (1072 aa)
initn: 7106 init1: 7106 opt: 7106 Z-score: 5161.0 bits: 966.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 7106; 99.8% identity (99.9% similar) in 1072 aa overlap (1-1072:1-1072)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MAPPTGVLSSLLLLVTIAGCARKQCSEGRTYSNAVISPNLETTRIMRVSHTFPVVDCTAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MAPPTGVLSSLLLLVTIAGCARKQCSEGRTYSNAVISPNLETTRIMRVSHTFPVVDCTAA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD CCDLSSCDLAWWFEGRCYLVSCPHKENCEPKKMGPIRSYLTFVLRPVQRPAQLLDYGDMM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 CCDLSSCDLAWWFEGRCYLVSCPHKENCEPKKMGPIRSYLTFVLRPVQRPAQLLDYGDMM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD LNRGSPSGIWGDSPEDIRKDLPFLGKDWGLEEMSEYADDYRELEKDLLQPSGKQEPRGSA
::::::::::::::::::::: ::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::
CCDS34 LNRGSPSGIWGDSPEDIRKDLTFLGKDWGLEEMSEYSDDYRELEKDLLQPSGKQEPRGSA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD EYTDWGLLPGSEGAFNSSVGDSPAVPAETQQDPELHYLNESASTPAPKLPERSVLLPLPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 EYTDWGLLPGSEGAFNSSVGDSPAVPAETQQDPELHYLNESASTPAPKLPERSVLLPLPT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD TPSSGEVLEKEKASQLQEQSSNSSGKEVLMPSHSLPPASLELSSVTVEKSPVLTVTPGST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 TPSSGEVLEKEKASQLQEQSSNSSGKEVLMPSHSLPPASLELSSVTVEKSPVLTVTPGST
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD EHSIPTPPTSAAPSESTPSELPISPTTAPRTVKELTVSAGDNLIITLPDNEVELKAFVAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 EHSIPTPPTSAAPSESTPSELPISPTTAPRTVKELTVSAGDNLIITLPDNEVELKAFVAP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD APPVETTYNYEWNLISHPTDYQGEIKQGHKQTLNLSQLSVGLYVFKVTVSSENAFGEGFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 APPVETTYNYEWNLISHPTDYQGEIKQGHKQTLNLSQLSVGLYVFKVTVSSENAFGEGFV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD NVTVKPARRVNLPPVAVVSPQLQELTLPLTSALIDGSQSTDDTEIVSYHWEEINGPFIEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 NVTVKPARRVNLPPVAVVSPQLQELTLPLTSALIDGSQSTDDTEIVSYHWEEINGPFIEE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD KTSVDSPVLRLSNLDPGNYSFRLTVTDSDGATNSTTAALIVNNAVDYPPVANAGPNHTIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 KTSVDSPVLRLSNLDPGNYSFRLTVTDSDGATNSTTAALIVNNAVDYPPVANAGPNHTIT
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD LPQNSITLNGNQSSDDHQIVLYEWSLGPGSEGKHVVMQGVQTPYLHLSAMQEGDYTFQLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LPQNSITLNGNQSSDDHQIVLYEWSLGPGSEGKHVVMQGVQTPYLHLSAMQEGDYTFQLK
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD VTDSSRQQSTAVVTVIVQPENNRPPVAVAGPDKELIFPVESATLDGSSSSDDHGIVFYHW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 VTDSSRQQSTAVVTVIVQPENNRPPVAVAGPDKELIFPVESATLDGSSSSDDHGIVFYHW
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD EHVRGPSAVEMENIDKAIATVTGLQVGTYHFRLTVKDQQGLSSTSTLTVAVKKENNSPPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 EHVRGPSAVEMENIDKAIATVTGLQVGTYHFRLTVKDQQGLSSTSTLTVAVKKENNSPPR
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD ARAGGRHVLVLPNNSITLDGSRSTDDQRIVSYLWIRDGQSPAAGDVIDGSDHSVALQLTN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ARAGGRHVLVLPNNSITLDGSRSTDDQRIVSYLWIRDGQSPAAGDVIDGSDHSVALQLTN
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD LVEGVYTFHLRVTDSQGASDTDTATVEVQPDPRKSGLVELTLQVGVGQLTEQRKDTLVRQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LVEGVYTFHLRVTDSQGASDTDTATVEVQPDPRKSGLVELTLQVGVGQLTEQRKDTLVRQ
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD LAVLLNVLDSDIKVQKIRAHSDLSTVIVFYVQSRPPFKVLKAAEVARNLHMRLSKEKADF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LAVLLNVLDSDIKVQKIRAHSDLSTVIVFYVQSRPPFKVLKAAEVARNLHMRLSKEKADF
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD LLFKVLRVDTAGCLLKCSGHGHCDPLTKRCICSHLWMENLIQRYIWDGESNCEWSIFYVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LLFKVLRVDTAGCLLKCSGHGHCDPLTKRCICSHLWMENLIQRYIWDGESNCEWSIFYVT
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD VLAFTLIVLTGGFTWLCICCCKRQKRTKIRKKTKYTILDNMDEQERMELRPKYGIKHRST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 VLAFTLIVLTGGFTWLCICCCKRQKRTKIRKKTKYTILDNMDEQERMELRPKYGIKHRST
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070
pF1KSD EHNSSLMVSESEFDSDQDTIFSREKMERGNPKVSMNGSIRNGASFSYCSKDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 EHNSSLMVSESEFDSDQDTIFSREKMERGNPKVSMNGSIRNGASFSYCSKDR
1030 1040 1050 1060 1070
>>CCDS54970.1 KIAA0319 gene_id:9856|Hs108|chr6 (1063 aa)
initn: 6993 init1: 6993 opt: 6993 Z-score: 5079.1 bits: 951.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6993; 99.8% identity (99.9% similar) in 1053 aa overlap (20-1072:11-1063)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MAPPTGVLSSLLLLVTIAGCARKQCSEGRTYSNAVISPNLETTRIMRVSHTFPVVDCTAA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MTRLGWPSPCCARKQCSEGRTYSNAVISPNLETTRIMRVSHTFPVVDCTAA
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KSD CCDLSSCDLAWWFEGRCYLVSCPHKENCEPKKMGPIRSYLTFVLRPVQRPAQLLDYGDMM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 CCDLSSCDLAWWFEGRCYLVSCPHKENCEPKKMGPIRSYLTFVLRPVQRPAQLLDYGDMM
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KSD LNRGSPSGIWGDSPEDIRKDLPFLGKDWGLEEMSEYADDYRELEKDLLQPSGKQEPRGSA
::::::::::::::::::::: ::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::
CCDS54 LNRGSPSGIWGDSPEDIRKDLTFLGKDWGLEEMSEYSDDYRELEKDLLQPSGKQEPRGSA
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KSD EYTDWGLLPGSEGAFNSSVGDSPAVPAETQQDPELHYLNESASTPAPKLPERSVLLPLPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 EYTDWGLLPGSEGAFNSSVGDSPAVPAETQQDPELHYLNESASTPAPKLPERSVLLPLPT
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KSD TPSSGEVLEKEKASQLQEQSSNSSGKEVLMPSHSLPPASLELSSVTVEKSPVLTVTPGST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 TPSSGEVLEKEKASQLQEQSSNSSGKEVLMPSHSLPPASLELSSVTVEKSPVLTVTPGST
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KSD EHSIPTPPTSAAPSESTPSELPISPTTAPRTVKELTVSAGDNLIITLPDNEVELKAFVAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 EHSIPTPPTSAAPSESTPSELPISPTTAPRTVKELTVSAGDNLIITLPDNEVELKAFVAP
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KSD APPVETTYNYEWNLISHPTDYQGEIKQGHKQTLNLSQLSVGLYVFKVTVSSENAFGEGFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 APPVETTYNYEWNLISHPTDYQGEIKQGHKQTLNLSQLSVGLYVFKVTVSSENAFGEGFV
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KSD NVTVKPARRVNLPPVAVVSPQLQELTLPLTSALIDGSQSTDDTEIVSYHWEEINGPFIEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 NVTVKPARRVNLPPVAVVSPQLQELTLPLTSALIDGSQSTDDTEIVSYHWEEINGPFIEE
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KSD KTSVDSPVLRLSNLDPGNYSFRLTVTDSDGATNSTTAALIVNNAVDYPPVANAGPNHTIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 KTSVDSPVLRLSNLDPGNYSFRLTVTDSDGATNSTTAALIVNNAVDYPPVANAGPNHTIT
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590 600
pF1KSD LPQNSITLNGNQSSDDHQIVLYEWSLGPGSEGKHVVMQGVQTPYLHLSAMQEGDYTFQLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LPQNSITLNGNQSSDDHQIVLYEWSLGPGSEGKHVVMQGVQTPYLHLSAMQEGDYTFQLK
540 550 560 570 580 590
610 620 630 640 650 660
pF1KSD VTDSSRQQSTAVVTVIVQPENNRPPVAVAGPDKELIFPVESATLDGSSSSDDHGIVFYHW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VTDSSRQQSTAVVTVIVQPENNRPPVAVAGPDKELIFPVESATLDGSSSSDDHGIVFYHW
600 610 620 630 640 650
670 680 690 700 710 720
pF1KSD EHVRGPSAVEMENIDKAIATVTGLQVGTYHFRLTVKDQQGLSSTSTLTVAVKKENNSPPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 EHVRGPSAVEMENIDKAIATVTGLQVGTYHFRLTVKDQQGLSSTSTLTVAVKKENNSPPR
660 670 680 690 700 710
730 740 750 760 770 780
pF1KSD ARAGGRHVLVLPNNSITLDGSRSTDDQRIVSYLWIRDGQSPAAGDVIDGSDHSVALQLTN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ARAGGRHVLVLPNNSITLDGSRSTDDQRIVSYLWIRDGQSPAAGDVIDGSDHSVALQLTN
720 730 740 750 760 770
790 800 810 820 830 840
pF1KSD LVEGVYTFHLRVTDSQGASDTDTATVEVQPDPRKSGLVELTLQVGVGQLTEQRKDTLVRQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LVEGVYTFHLRVTDSQGASDTDTATVEVQPDPRKSGLVELTLQVGVGQLTEQRKDTLVRQ
780 790 800 810 820 830
850 860 870 880 890 900
pF1KSD LAVLLNVLDSDIKVQKIRAHSDLSTVIVFYVQSRPPFKVLKAAEVARNLHMRLSKEKADF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LAVLLNVLDSDIKVQKIRAHSDLSTVIVFYVQSRPPFKVLKAAEVARNLHMRLSKEKADF
840 850 860 870 880 890
910 920 930 940 950 960
pF1KSD LLFKVLRVDTAGCLLKCSGHGHCDPLTKRCICSHLWMENLIQRYIWDGESNCEWSIFYVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LLFKVLRVDTAGCLLKCSGHGHCDPLTKRCICSHLWMENLIQRYIWDGESNCEWSIFYVT
900 910 920 930 940 950
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD VLAFTLIVLTGGFTWLCICCCKRQKRTKIRKKTKYTILDNMDEQERMELRPKYGIKHRST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VLAFTLIVLTGGFTWLCICCCKRQKRTKIRKKTKYTILDNMDEQERMELRPKYGIKHRST
960 970 980 990 1000 1010
1030 1040 1050 1060 1070
pF1KSD EHNSSLMVSESEFDSDQDTIFSREKMERGNPKVSMNGSIRNGASFSYCSKDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 EHNSSLMVSESEFDSDQDTIFSREKMERGNPKVSMNGSIRNGASFSYCSKDR
1020 1030 1040 1050 1060
>>CCDS54969.1 KIAA0319 gene_id:9856|Hs108|chr6 (1027 aa)
initn: 6821 init1: 6821 opt: 6821 Z-score: 4954.7 bits: 928.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6821; 99.8% identity (99.9% similar) in 1027 aa overlap (46-1072:1-1027)
20 30 40 50 60 70
pF1KSD TIAGCARKQCSEGRTYSNAVISPNLETTRIMRVSHTFPVVDCTAACCDLSSCDLAWWFEG
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MRVSHTFPVVDCTAACCDLSSCDLAWWFEG
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KSD RCYLVSCPHKENCEPKKMGPIRSYLTFVLRPVQRPAQLLDYGDMMLNRGSPSGIWGDSPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 RCYLVSCPHKENCEPKKMGPIRSYLTFVLRPVQRPAQLLDYGDMMLNRGSPSGIWGDSPE
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
pF1KSD DIRKDLPFLGKDWGLEEMSEYADDYRELEKDLLQPSGKQEPRGSAEYTDWGLLPGSEGAF
:::::: ::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 DIRKDLTFLGKDWGLEEMSEYSDDYRELEKDLLQPSGKQEPRGSAEYTDWGLLPGSEGAF
100 110 120 130 140 150
200 210 220 230 240 250
pF1KSD NSSVGDSPAVPAETQQDPELHYLNESASTPAPKLPERSVLLPLPTTPSSGEVLEKEKASQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 NSSVGDSPAVPAETQQDPELHYLNESASTPAPKLPERSVLLPLPTTPSSGEVLEKEKASQ
160 170 180 190 200 210
260 270 280 290 300 310
pF1KSD LQEQSSNSSGKEVLMPSHSLPPASLELSSVTVEKSPVLTVTPGSTEHSIPTPPTSAAPSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LQEQSSNSSGKEVLMPSHSLPPASLELSSVTVEKSPVLTVTPGSTEHSIPTPPTSAAPSE
220 230 240 250 260 270
320 330 340 350 360 370
pF1KSD STPSELPISPTTAPRTVKELTVSAGDNLIITLPDNEVELKAFVAPAPPVETTYNYEWNLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 STPSELPISPTTAPRTVKELTVSAGDNLIITLPDNEVELKAFVAPAPPVETTYNYEWNLI
280 290 300 310 320 330
380 390 400 410 420 430
pF1KSD SHPTDYQGEIKQGHKQTLNLSQLSVGLYVFKVTVSSENAFGEGFVNVTVKPARRVNLPPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SHPTDYQGEIKQGHKQTLNLSQLSVGLYVFKVTVSSENAFGEGFVNVTVKPARRVNLPPV
340 350 360 370 380 390
440 450 460 470 480 490
pF1KSD AVVSPQLQELTLPLTSALIDGSQSTDDTEIVSYHWEEINGPFIEEKTSVDSPVLRLSNLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 AVVSPQLQELTLPLTSALIDGSQSTDDTEIVSYHWEEINGPFIEEKTSVDSPVLRLSNLD
400 410 420 430 440 450
500 510 520 530 540 550
pF1KSD PGNYSFRLTVTDSDGATNSTTAALIVNNAVDYPPVANAGPNHTITLPQNSITLNGNQSSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 PGNYSFRLTVTDSDGATNSTTAALIVNNAVDYPPVANAGPNHTITLPQNSITLNGNQSSD
460 470 480 490 500 510
560 570 580 590 600 610
pF1KSD DHQIVLYEWSLGPGSEGKHVVMQGVQTPYLHLSAMQEGDYTFQLKVTDSSRQQSTAVVTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 DHQIVLYEWSLGPGSEGKHVVMQGVQTPYLHLSAMQEGDYTFQLKVTDSSRQQSTAVVTV
520 530 540 550 560 570
620 630 640 650 660 670
pF1KSD IVQPENNRPPVAVAGPDKELIFPVESATLDGSSSSDDHGIVFYHWEHVRGPSAVEMENID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 IVQPENNRPPVAVAGPDKELIFPVESATLDGSSSSDDHGIVFYHWEHVRGPSAVEMENID
580 590 600 610 620 630
680 690 700 710 720 730
pF1KSD KAIATVTGLQVGTYHFRLTVKDQQGLSSTSTLTVAVKKENNSPPRARAGGRHVLVLPNNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 KAIATVTGLQVGTYHFRLTVKDQQGLSSTSTLTVAVKKENNSPPRARAGGRHVLVLPNNS
640 650 660 670 680 690
740 750 760 770 780 790
pF1KSD ITLDGSRSTDDQRIVSYLWIRDGQSPAAGDVIDGSDHSVALQLTNLVEGVYTFHLRVTDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ITLDGSRSTDDQRIVSYLWIRDGQSPAAGDVIDGSDHSVALQLTNLVEGVYTFHLRVTDS
700 710 720 730 740 750
800 810 820 830 840 850
pF1KSD QGASDTDTATVEVQPDPRKSGLVELTLQVGVGQLTEQRKDTLVRQLAVLLNVLDSDIKVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 QGASDTDTATVEVQPDPRKSGLVELTLQVGVGQLTEQRKDTLVRQLAVLLNVLDSDIKVQ
760 770 780 790 800 810
860 870 880 890 900 910
pF1KSD KIRAHSDLSTVIVFYVQSRPPFKVLKAAEVARNLHMRLSKEKADFLLFKVLRVDTAGCLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 KIRAHSDLSTVIVFYVQSRPPFKVLKAAEVARNLHMRLSKEKADFLLFKVLRVDTAGCLL
820 830 840 850 860 870
920 930 940 950 960 970
pF1KSD KCSGHGHCDPLTKRCICSHLWMENLIQRYIWDGESNCEWSIFYVTVLAFTLIVLTGGFTW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 KCSGHGHCDPLTKRCICSHLWMENLIQRYIWDGESNCEWSIFYVTVLAFTLIVLTGGFTW
880 890 900 910 920 930
980 990 1000 1010 1020 1030
pF1KSD LCICCCKRQKRTKIRKKTKYTILDNMDEQERMELRPKYGIKHRSTEHNSSLMVSESEFDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LCICCCKRQKRTKIRKKTKYTILDNMDEQERMELRPKYGIKHRSTEHNSSLMVSESEFDS
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 DQDTIFSREKMERGNPKVSMNGSIRNGASFSYCSKDR
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MAPPTGVLSSLLLLVTIAGCARKQCSEGRTYSNAVISPNLETTRIMRVSHTFPVVDCTAA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 CCDLSSCDLAWWFEGRCYLVSCPHKENCEPKKMGPIRSYLTFVLRPVQRPAQLLDYGDMM
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CCDS54 LNRGSPSGIWGDSPEDIRKDLTFLGKDWGLEEMSEYSDDYRELEKDLLQPSGKQEPRGSA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 EYTDWGLLPGSEGAFNSSVGDSPAVPAETQQDPELHYLNESASTPAPKLPERSVLLPLPT
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CCDS54 TPSSGEVLEKEKASQLQEQSSNSSGKEVLMPSHSLPPASLELSSVTVEKSPVLTVTPGST
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 EHSIPTPPTSAAPSESTPSELPISPTTAPRTVKELTVSAGDNLIITLPDNEVELKAFVAP
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 APPVETTYNYEWNLISHPTDYQGEIKQGHKQTLNLSQLSVGLYVFKVTVSSENAFGEGFV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 NVTVKPARRVNLPPVAVVSPQLQELTLPLTSALIDGSQSTDDTEIVSYHWEEINGPFIEE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 KTSVDSPVLRLSNLDPGNYSFRLTVTDSDGATNSTTAALIVNNAVDYPPVANAGPNHTIT
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CCDS54 LPQNSITLNGNQSSDDHQIVLYEWSLGPGSEGKHVVMQGVQTPYLHLSAMQEGDYTFQLK
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CCDS54 VTDSSRQQSTAVVTVIVQPENNRPPVAVAGPDKELIFPVESATLDGSSSSDDHGIVFYHW
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 EHVRGPSAVEMENIDKAIATVTGLQVGTYHFRLTVKDQQGLSSTSTLTVAVKKENNSPPR
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ARAGGRHVLVLPNNSITLDGSRSTDDQRIVSYLWIRDGQSPAAGDVIDGSDHSVALQLTN
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LVEGVYTFHLRVTDSQGASDTDTATVEVQPDPRKSGLVELTLQVGVGQLTEQRKDTLVRQ
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LAVLLNVLDSDIKVQKIRAHSDLSTVIVFYVQSRPPFKVLKAAEVARNLHMRLSKEKADF
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LLFKVLRVDTAGCLLKCSGHGHCDPLTKRCICSHLWMENLIQRYIWDGESNC--------
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CCDS54 -----------------------------------------------------GIKHRST
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 EHNSSLMVSESEFDSDQDTIFSREKMERGNPKVSMNGSIRNGASFSYCSKDR
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pF1KSD ENNRPPVAVAGPDKELIFPVESATLDGSSSSDDHGIVFYHWEHVRGPSAVEMENIDKAIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 ENNRPPVAVAGPDKELIFPVESATLDGSSSSDDHGIVFYHWEHVRGPSAVEMENIDKAIA
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pF1KSD TVTGLQVGTYHFRLTVKDQQGLSSTSTLTVAVKKENNSPPRARAGGRHVLVLPNNSITLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 TVTGLQVGTYHFRLTVKDQQGLSSTSTLTVAVKKENNSPPRARAGGRHVLVLPNNSITLD
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 GSRSTDDQRIVSYLWIRDGQSPAAGDVIDGSDHSVALQLTNLVEGVYTFHLRVTDSQGAS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 DTDTATVEVQPDPRKSGLVELTLQVGVGQLTEQRKDTLVRQLAVLLNVLDSDIKVQKIRA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 HSDLSTVIVFYVQSRPPFKVLKAAEVARNLHMRLSKEKADFLLFKVLRVDTAGCLLKCSG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 HGHCDPLTKRCICSHLWMENLIQRYIWDGESNCEWSIFYVTVLAFTLIVLTGGFTWLCIC
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pF1KSD CCKRQKRTKIRKKTKYTILDNMDEQERMELRPKYGIKHRSTEHNSSLMVSESEFDSDQDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 CCKRQKRTKIRKKTKYTILDNMDEQERMELRPKYGIKHRSTEHNSSLMVSESEFDSDQDT
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pF1KSD IFSREKMERGNPKVSMNGSIRNGASFSYCSKDR
:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 IFSREKMERGNPKVSMNGSIRNGASFSYCSKDR
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10 20 30
pF1KSD MAPPTGVLSSLLLLVTIAGCARKQCSEGRTYSNAVISPN
:.: : : :. .: :..:.: .. . .
CCDS39 PASWILSGYYWQTSAKWLRSLYLFYTCFCFSVLWLSTDASESR--CQQGKTQFGVGLRSG
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40 50 60 70 80 90
pF1KSD LETTRIMRVSHTFPVVDCTAACCDLSSCDLAWWFEGRCYLVSCPHKENCEPKKMGPIRSY
:. .. . : . .: ::::. :.: . ::.:: : ..: . ..:. . :.
CCDS39 GEN-HLWLLEGTPSLQSCWAACCQDSACHVFWWLEGMCIQADCSRPQSCRAFRTHSSNSM
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KSD LTFVLRPVQRPAQLLDYGDMMLNRGSPSGIWGDSPEDIRKDLPFLGKDWGLEEMSEYADD
:.: :. : .: : ::: : :: .:. ..:
CCDS39 LVF-LKKFQTADDL-----------------GFLPEDDVPHLLGLGWNWASWRQSPPRAA
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160 170 180 190 200 210
pF1KSD YRELEKDLLQPS--GKQEPRGSAEYTDWGLLPGSEGAFNSSVGDSPAVPAETQQDPELHY
: .. : : : . ::: .: . : .:.:.:: ::
CCDS39 LRPAVSSSDQQSLIRKLQKRGSP--SDV-VTPIVTQ--HSKVNDSN----------ELGG
170 180 190 200 210
220 230 240 250 260 270
pF1KSD LNESASTPAPKLPERSVLLPLPTTPSSGEVLEKEKASQLQEQSSNSSGKEVLMPSHSLPP
:. :.:. . : .. :: :: ..:. : ..: . : : : . :
CCDS39 LTTSGSAEVHK--AITISSPL-TTDLTAELSGGPKNVSVQPEIS-----EGLATT----P
220 230 240 250 260
280 290 300 310 320 330
pF1KSD ASLELSSVTVEKSPVLTVTPGSTEHSIPTPPTSAAPSESTPSELPISPTTAPRTVKELTV
.. ...: ::. . . : . .: :: : : .:: . :. .:::.:
CCDS39 STQQVKS--SEKTQIAVPQPVAPSYSYATP-TPQASFQSTSAPYPV--------IKELVV
270 280 290 300 310
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pF1KSD SAGDNLIITLPDNEVELKAFVAPAPPVETTYNYEWNLISHPTDYQGEIKQGHKQTLNLSQ
:::... :::: :::.:.:.: :: ::.:.:.::.:: ::.::.. :.: :.::.
CCDS39 SAGESVQITLPKNEVQLNAYVLQEPPKGETYTYDWQLITHPRDYSGEMEGKHSQILKLSK
320 330 340 350 360 370
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pF1KSD LSVGLYVFKVTVSSENAFGEGFVNVTVKPARRVNLPPVAVVSPQLQELTLPLTSALIDGS
:. ::: ::: : ..:: :::.::::::: : : ::.:.::::.::..:: ::..::::
CCDS39 LTPGLYEFKVIVEGQNAHGEGYVNVTVKPEPRKNRPPIAIVSPQFQEISLPTTSTVIDGS
380 390 400 410 420 430
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pF1KSD QSTDDTEIVSYHWEEINGPFIEEKTSVDSPVLRLSNLDPGNYSFRLTVTDSDGATNSTTA
::::: .::.:::::..::. ::: : :. .:.::.: ::::.: :::.:::::::::::
CCDS39 QSTDDDKIVQYHWEELKGPLREEKISEDTAILKLSKLVPGNYTFSLTVVDSDGATNSTTA
440 450 460 470 480 490
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pF1KSD ALIVNNAVDYPPVANAGPNHTITLPQNSITLNGNQSSDDHQIVLYEWSLGPGSEGKHVVM
: ::.:::::::::::::..:::::::::: ::::.::: :. :::::.:.:.:: : :
CCDS39 NLTVNKAVDYPPVANAGPNQVITLPQNSITLFGNQSTDDHGITSYEWSLSPSSKGKVVEM
500 510 520 530 540 550
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pF1KSD QGVQTPYLHLSAMQEGDYTFQLKVTDSSRQQSTAVVTVIVQPENNRPPVAVAGPDKELIF
:::.:: :.::::::::::.:: :::. ::.:: ::::::::::.:: : ::::::: .
CCDS39 QGVRTPTLQLSAMQEGDYTYQLTVTDTIGQQATAQVTVIVQPENNKPPQADAGPDKELTL
560 570 580 590 600 610
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pF1KSD PVESATLDGSSSSDDHGIVFYHWEHVRGPSAVEMENIDKAIATVTGLQVGTYHFRLTVKD
::.:.:::::.::::. :. : ::...::..:..:: ....::::::::::: : :::::
CCDS39 PVDSTTLDGSKSSDDQKIISYLWEKTQGPDGVQLENANSSVATVTGLQVGTYVFTLTVKD
620 630 640 650 660 670
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pF1KSD QQGLSSTSTLTVAVKKENNSPPRARAGGRHVLVLPNNSITLDGSRSTDDQRIVSYLWIRD
...:.: :...: ::.: :.:: :. : :..::... ::::.:.::. :::::: ::
CCDS39 ERNLQSQSSVNVIVKEEINKPPIAKITGNVVITLPTSTAELDGSKSSDDKGIVSYLWTRD
680 690 700 710 720 730
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pF1KSD GQSPAAGDVIDGSDHSVALQLTNLVEGVYTFHLRVTDSQGASDTDTATVEVQPDPRKSGL
:::::.:.. ::: : :.:::::.:::::.:::..: :::: .::::.:::::..:
CCDS39 EGSPAAGEVLNHSDHHPILFLSNLVEGTYTFHLKVTDAKGESDTDRTTVEVKPDPRKNNL
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pF1KSD VELTLQVGVGQLTEQRKDTLVRQLAVLLNVLDSDIKVQKIRAHSDLSTVIVFYVQSRPPF
::. :...:.::::. : ..::..:::.:::::: ::::. ... :: .::.::..::
CCDS39 VEIILDINVSQLTERLKGMFIRQIGVLLGVLDSDIIVQKIQPYTEQSTKMVFFVQNEPPH
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pF1KSD KVLKAAEVARNLHMRLSKEKADFLLFKVLRVDTAGCLLKCSGHGHCDPLTKRCICSHLWM
...:. ::: :. .: :.:::::.:..:.:.:. : :.:: ::::: .::::::. .::
CCDS39 QIFKGHEVAAMLKSELRKQKADFLIFRALEVNTVTCQLNCSDHGHCDSFTKRCICDPFWM
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pF1KSD ENLIQRYIWDGESNCEWSIFYVTVLAFTLIVLTGGFTWLCICCCKRQKRTKIRKKTKYTI
::.:. . ::.::::::..:: . .:...: : ..: :::::::: : ..:.:: :
CCDS39 ENFIKVQLRDGDSNCEWSVLYVIIATFVIVVALGILSWTVICCCKRQK-GKPKRKSKYKI
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pF1KSD LDNMDEQERMELRP--KYGIKHRSTEHNSSLMVSESEFDSDQDTIFSREKMERGNPKVSM
:: : :: .::.: . :::... .:::: ::::.::: :.::. :.:. ..
CCDS39 LDATD-QESLELKPTSRAGIKQKGLLLSSSLMHSESELDSD-DAIFTWPDREKGKLLHGQ
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pF1KSD NGSIRNGASFSYCSKDR
:::. :: .
CCDS39 NGSVPNGQTPLKARSPREEIL
1030 1040
1072 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 01:15:54 2016 done: Thu Nov 3 01:15:54 2016
Total Scan time: 4.310 Total Display time: 0.240
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]