Result of FASTA (omim) for
pF1KSDA0316
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0316, 1322 aa
1>>>pF1KSDA0316 1322 - 1322 aa - 1322 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.7908+/-0.000444; mu= 5.1139+/- 0.027
mean_var=174.7525+/-35.876, 0's: 0 Z-trim(115.5): 70 B-trim: 243 in 1/54
Lambda= 0.097020
statistics sampled from 25942 (26004) to 25942 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.655), E-opt: 0.2 (0.305), width: 16
Scan time: 15.940
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_055543 (OMIM: 300830,300838,300983) FERM and PD (1322) 8685 1229.4 0
XP_011543915 (OMIM: 300830,300838,300983) PREDICTE (1762) 8680 1228.7 0
XP_016885475 (OMIM: 300830,300838,300983) PREDICTE (1319) 8607 1218.5 0
XP_016885474 (OMIM: 300830,300838,300983) PREDICTE (1346) 8602 1217.8 0
XP_016885472 (OMIM: 300830,300838,300983) PREDICTE (1759) 8602 1217.8 0
XP_005274689 (OMIM: 300830,300838,300983) PREDICTE (1786) 8597 1217.1 0
XP_016885473 (OMIM: 300830,300838,300983) PREDICTE (1756) 5875 836.1 0
XP_011516105 (OMIM: 616919) PREDICTED: FERM and PD (1578) 1516 226.0 1.7e-57
XP_011516106 (OMIM: 616919) PREDICTED: FERM and PD (1578) 1516 226.0 1.7e-57
XP_016869969 (OMIM: 616919) PREDICTED: FERM and PD (1578) 1516 226.0 1.7e-57
NP_055722 (OMIM: 616919) FERM and PDZ domain-conta (1578) 1516 226.0 1.7e-57
XP_011516108 (OMIM: 616919) PREDICTED: FERM and PD (1452) 1322 198.8 2.4e-49
XP_016869971 (OMIM: 616919) PREDICTED: FERM and PD (1453) 1322 198.8 2.4e-49
XP_011516107 (OMIM: 616919) PREDICTED: FERM and PD (1453) 1322 198.8 2.4e-49
XP_016869970 (OMIM: 616919) PREDICTED: FERM and PD (1469) 1322 198.8 2.4e-49
>>NP_055543 (OMIM: 300830,300838,300983) FERM and PDZ do (1322 aa)
initn: 8685 init1: 8685 opt: 8685 Z-score: 6577.5 bits: 1229.4 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 8685; 99.9% identity (100.0% similar) in 1322 aa overlap (1-1322:1-1322)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MDVFSFVKIAKLSSHRTKSSGWPPPSGTWGLSQVPPYGWEMTANRDGRDYFINHMTQAIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 MDVFSFVKIAKLSSHRTKSSGWPPPSGTWGLSQVPPYGWEMTANRDGRDYFINHMTQAIP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD FDDPRLESCQIIPPAPRKVEMRRDPVLGFGFVAGSEKPVVVRSVTPGGPSEGKLIPGDQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 FDDPRLESCQIIPPAPRKVEMRRDPVLGFGFVAGSEKPVVVRSVTPGGPSEGKLIPGDQI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD VMINDEPVSTAPRERVIDLVRSCKESILLTVIQPYPSPKSAFISAAKKARLKSNPVKVRF
:::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 VMINDEPVSAAPRERVIDLVRSCKESILLTVIQPYPSPKSAFISAAKKARLKSNPVKVRF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD SEEVIINGQVSETVKDNSLLFMPNVLKVYLENGQTKSFRFDCSTSIKDVILTLQEKLSIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 SEEVIINGQVSETVKDNSLLFMPNVLKVYLENGQTKSFRFDCSTSIKDVILTLQEKLSIK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD GIEHFSLMLEQRTEGAGTKLLLLHEQETLTQVTQRPSSHKMRCLFRISFVPKDPIDLLRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 GIEHFSLMLEQRTEGAGTKLLLLHEQETLTQVTQRPSSHKMRCLFRISFVPKDPIDLLRR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD DPVAFEYLYVQSCNDVVQERFGPELKYDIALRLAALQMYIATVTTKQTQKISLKYIEKEW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 DPVAFEYLYVQSCNDVVQERFGPELKYDIALRLAALQMYIATVTTKQTQKISLKYIEKEW
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD GLETFLPSAVLQSMKEKNIKKALSHLVKANQNLVPPGKKLSALQAKVHYLKFLSDLRLYG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 GLETFLPSAVLQSMKEKNIKKALSHLVKANQNLVPPGKKLSALQAKVHYLKFLSDLRLYG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD GRVFKATLVQAEKRSEVTLLVGPRYGISHVINTKTNLVALLADFSHVNRIEMFSEEESLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 GRVFKATLVQAEKRSEVTLLVGPRYGISHVINTKTNLVALLADFSHVNRIEMFSEEESLV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD RVELHVLDVKPITLLMESSDAMNLACLTAGYYRLLVDSRRSIFNMANKKNTATQETGPEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 RVELHVLDVKPITLLMESSDAMNLACLTAGYYRLLVDSRRSIFNMANKKNTATQETGPEN
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD KGKHNLLGPDWNCIPQMTTFIGEGEQEAQITYIDSKQKTVEITDSTMCPKEHRHLYIDNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 KGKHNLLGPDWNCIPQMTTFIGEGEQEAQITYIDSKQKTVEITDSTMCPKEHRHLYIDNA
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD YSSDGLNQQLSQPGEAPCEADYRSLAQRSLLTLSGPETLKKAQESPRGAKVSFIFGDFAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 YSSDGLNQQLSQPGEAPCEADYRSLAQRSLLTLSGPETLKKAQESPRGAKVSFIFGDFAL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD DDGISPPTLGYETLLDEGPEMLEKQRNLYIGSANDMKGLDLTPEAEGIQFVENSVYANIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 DDGISPPTLGYETLLDEGPEMLEKQRNLYIGSANDMKGLDLTPEAEGIQFVENSVYANIG
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD DVKSFQAAEGIEEPLLHDICYAENTDDAEDEDEVSCEEDLVVGEMNQPAILNLSGSSDDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 DVKSFQAAEGIEEPLLHDICYAENTDDAEDEDEVSCEEDLVVGEMNQPAILNLSGSSDDI
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD IDLTSLPPPEGDDNEDDFLLRSLNMAIAAPPPGFRDSSDEEDSQSQAASFPEDKEKGSSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 IDLTSLPPPEGDDNEDDFLLRSLNMAIAAPPPGFRDSSDEEDSQSQAASFPEDKEKGSSL
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD QNDEIPVSLIDAVPTSAEGKCEKGLDNAVVSTLGALEALSVSEEQQTSDNSGVAILRAYS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 QNDEIPVSLIDAVPTSAEGKCEKGLDNAVVSTLGALEALSVSEEQQTSDNSGVAILRAYS
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD PESSSDSGNETNSSEMTESSELATAQKQSENLSRMFLATHEGYHPLAEEQTEFPASKTPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 PESSSDSGNETNSSEMTESSELATAQKQSENLSRMFLATHEGYHPLAEEQTEFPASKTPA
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD GGLPPKSSHALAARPATDLPPKVVPSKQLLHSDHMEMEPETMETKSVTDYFSKLHMGSVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 GGLPPKSSHALAARPATDLPPKVVPSKQLLHSDHMEMEPETMETKSVTDYFSKLHMGSVA
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD YSCTSKRKSKLADGEGKAPPNGNTTGKKQQGTKTAEMEEEASGKFGTVSSRDSQHLSTFN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 YSCTSKRKSKLADGEGKAPPNGNTTGKKQQGTKTAEMEEEASGKFGTVSSRDSQHLSTFN
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD LERTAFRKDSQRWYVATEGGMAEKSGLEAATGKTFPRASGLGAREAEGKEEGAPDGETSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 LERTAFRKDSQRWYVATEGGMAEKSGLEAATGKTFPRASGLGAREAEGKEEGAPDGETSD
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD GSGLGQGDRFLTDVTCASSAKDLDNPEDADSSTCDHPSKLPEADESVARLCDYHLAKRMS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 GSGLGQGDRFLTDVTCASSAKDLDNPEDADSSTCDHPSKLPEADESVARLCDYHLAKRMS
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KSD SLQSEGHFSLQSSQGSSVDAGCGTGSSGSACATPVESPLCPSLGKHLIPDASGKGVNYIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 SLQSEGHFSLQSSQGSSVDAGCGTGSSGSACATPVESPLCPSLGKHLIPDASGKGVNYIP
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KSD SEERAPGLPNHGATFKELHPQTEGMCPRMTVPALHTAINTEPLFGTLRDGCHRLPKIKET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 SEERAPGLPNHGATFKELHPQTEGMCPRMTVPALHTAINTEPLFGTLRDGCHRLPKIKET
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KSD TV
::
NP_055 TV
>>XP_011543915 (OMIM: 300830,300838,300983) PREDICTED: F (1762 aa)
initn: 8680 init1: 8680 opt: 8680 Z-score: 6571.8 bits: 1228.7 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 8680; 99.9% identity (100.0% similar) in 1321 aa overlap (1-1321:1-1321)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MDVFSFVKIAKLSSHRTKSSGWPPPSGTWGLSQVPPYGWEMTANRDGRDYFINHMTQAIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MDVFSFVKIAKLSSHRTKSSGWPPPSGTWGLSQVPPYGWEMTANRDGRDYFINHMTQAIP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD FDDPRLESCQIIPPAPRKVEMRRDPVLGFGFVAGSEKPVVVRSVTPGGPSEGKLIPGDQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FDDPRLESCQIIPPAPRKVEMRRDPVLGFGFVAGSEKPVVVRSVTPGGPSEGKLIPGDQI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD VMINDEPVSTAPRERVIDLVRSCKESILLTVIQPYPSPKSAFISAAKKARLKSNPVKVRF
:::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VMINDEPVSAAPRERVIDLVRSCKESILLTVIQPYPSPKSAFISAAKKARLKSNPVKVRF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD SEEVIINGQVSETVKDNSLLFMPNVLKVYLENGQTKSFRFDCSTSIKDVILTLQEKLSIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SEEVIINGQVSETVKDNSLLFMPNVLKVYLENGQTKSFRFDCSTSIKDVILTLQEKLSIK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD GIEHFSLMLEQRTEGAGTKLLLLHEQETLTQVTQRPSSHKMRCLFRISFVPKDPIDLLRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GIEHFSLMLEQRTEGAGTKLLLLHEQETLTQVTQRPSSHKMRCLFRISFVPKDPIDLLRR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD DPVAFEYLYVQSCNDVVQERFGPELKYDIALRLAALQMYIATVTTKQTQKISLKYIEKEW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DPVAFEYLYVQSCNDVVQERFGPELKYDIALRLAALQMYIATVTTKQTQKISLKYIEKEW
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD GLETFLPSAVLQSMKEKNIKKALSHLVKANQNLVPPGKKLSALQAKVHYLKFLSDLRLYG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GLETFLPSAVLQSMKEKNIKKALSHLVKANQNLVPPGKKLSALQAKVHYLKFLSDLRLYG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD GRVFKATLVQAEKRSEVTLLVGPRYGISHVINTKTNLVALLADFSHVNRIEMFSEEESLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GRVFKATLVQAEKRSEVTLLVGPRYGISHVINTKTNLVALLADFSHVNRIEMFSEEESLV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD RVELHVLDVKPITLLMESSDAMNLACLTAGYYRLLVDSRRSIFNMANKKNTATQETGPEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RVELHVLDVKPITLLMESSDAMNLACLTAGYYRLLVDSRRSIFNMANKKNTATQETGPEN
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD KGKHNLLGPDWNCIPQMTTFIGEGEQEAQITYIDSKQKTVEITDSTMCPKEHRHLYIDNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KGKHNLLGPDWNCIPQMTTFIGEGEQEAQITYIDSKQKTVEITDSTMCPKEHRHLYIDNA
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD YSSDGLNQQLSQPGEAPCEADYRSLAQRSLLTLSGPETLKKAQESPRGAKVSFIFGDFAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 YSSDGLNQQLSQPGEAPCEADYRSLAQRSLLTLSGPETLKKAQESPRGAKVSFIFGDFAL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD DDGISPPTLGYETLLDEGPEMLEKQRNLYIGSANDMKGLDLTPEAEGIQFVENSVYANIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DDGISPPTLGYETLLDEGPEMLEKQRNLYIGSANDMKGLDLTPEAEGIQFVENSVYANIG
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD DVKSFQAAEGIEEPLLHDICYAENTDDAEDEDEVSCEEDLVVGEMNQPAILNLSGSSDDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DVKSFQAAEGIEEPLLHDICYAENTDDAEDEDEVSCEEDLVVGEMNQPAILNLSGSSDDI
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD IDLTSLPPPEGDDNEDDFLLRSLNMAIAAPPPGFRDSSDEEDSQSQAASFPEDKEKGSSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 IDLTSLPPPEGDDNEDDFLLRSLNMAIAAPPPGFRDSSDEEDSQSQAASFPEDKEKGSSL
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD QNDEIPVSLIDAVPTSAEGKCEKGLDNAVVSTLGALEALSVSEEQQTSDNSGVAILRAYS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QNDEIPVSLIDAVPTSAEGKCEKGLDNAVVSTLGALEALSVSEEQQTSDNSGVAILRAYS
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD PESSSDSGNETNSSEMTESSELATAQKQSENLSRMFLATHEGYHPLAEEQTEFPASKTPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PESSSDSGNETNSSEMTESSELATAQKQSENLSRMFLATHEGYHPLAEEQTEFPASKTPA
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD GGLPPKSSHALAARPATDLPPKVVPSKQLLHSDHMEMEPETMETKSVTDYFSKLHMGSVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GGLPPKSSHALAARPATDLPPKVVPSKQLLHSDHMEMEPETMETKSVTDYFSKLHMGSVA
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD YSCTSKRKSKLADGEGKAPPNGNTTGKKQQGTKTAEMEEEASGKFGTVSSRDSQHLSTFN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 YSCTSKRKSKLADGEGKAPPNGNTTGKKQQGTKTAEMEEEASGKFGTVSSRDSQHLSTFN
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD LERTAFRKDSQRWYVATEGGMAEKSGLEAATGKTFPRASGLGAREAEGKEEGAPDGETSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LERTAFRKDSQRWYVATEGGMAEKSGLEAATGKTFPRASGLGAREAEGKEEGAPDGETSD
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD GSGLGQGDRFLTDVTCASSAKDLDNPEDADSSTCDHPSKLPEADESVARLCDYHLAKRMS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GSGLGQGDRFLTDVTCASSAKDLDNPEDADSSTCDHPSKLPEADESVARLCDYHLAKRMS
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KSD SLQSEGHFSLQSSQGSSVDAGCGTGSSGSACATPVESPLCPSLGKHLIPDASGKGVNYIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SLQSEGHFSLQSSQGSSVDAGCGTGSSGSACATPVESPLCPSLGKHLIPDASGKGVNYIP
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KSD SEERAPGLPNHGATFKELHPQTEGMCPRMTVPALHTAINTEPLFGTLRDGCHRLPKIKET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SEERAPGLPNHGATFKELHPQTEGMCPRMTVPALHTAINTEPLFGTLRDGCHRLPKIKET
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KSD TV
:
XP_011 TALTEPGKERRGGMPSAWSQHPEADPILLPSNIHSESKVPIPNQDPNDFSQANQAYGEAV
1330 1340 1350 1360 1370 1380
>>XP_016885475 (OMIM: 300830,300838,300983) PREDICTED: F (1319 aa)
initn: 8607 init1: 8607 opt: 8607 Z-score: 6518.5 bits: 1218.5 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 8607; 99.9% identity (100.0% similar) in 1309 aa overlap (14-1322:11-1319)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MDVFSFVKIAKLSSHRTKSSGWPPPSGTWGLSQVPPYGWEMTANRDGRDYFINHMTQAIP
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MAATWSLLCLSHRTKSSGWPPPSGTWGLSQVPPYGWEMTANRDGRDYFINHMTQAIP
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KSD FDDPRLESCQIIPPAPRKVEMRRDPVLGFGFVAGSEKPVVVRSVTPGGPSEGKLIPGDQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FDDPRLESCQIIPPAPRKVEMRRDPVLGFGFVAGSEKPVVVRSVTPGGPSEGKLIPGDQI
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KSD VMINDEPVSTAPRERVIDLVRSCKESILLTVIQPYPSPKSAFISAAKKARLKSNPVKVRF
:::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VMINDEPVSAAPRERVIDLVRSCKESILLTVIQPYPSPKSAFISAAKKARLKSNPVKVRF
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KSD SEEVIINGQVSETVKDNSLLFMPNVLKVYLENGQTKSFRFDCSTSIKDVILTLQEKLSIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SEEVIINGQVSETVKDNSLLFMPNVLKVYLENGQTKSFRFDCSTSIKDVILTLQEKLSIK
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KSD GIEHFSLMLEQRTEGAGTKLLLLHEQETLTQVTQRPSSHKMRCLFRISFVPKDPIDLLRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GIEHFSLMLEQRTEGAGTKLLLLHEQETLTQVTQRPSSHKMRCLFRISFVPKDPIDLLRR
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KSD DPVAFEYLYVQSCNDVVQERFGPELKYDIALRLAALQMYIATVTTKQTQKISLKYIEKEW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DPVAFEYLYVQSCNDVVQERFGPELKYDIALRLAALQMYIATVTTKQTQKISLKYIEKEW
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pF1KSD GLETFLPSAVLQSMKEKNIKKALSHLVKANQNLVPPGKKLSALQAKVHYLKFLSDLRLYG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GLETFLPSAVLQSMKEKNIKKALSHLVKANQNLVPPGKKLSALQAKVHYLKFLSDLRLYG
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KSD GRVFKATLVQAEKRSEVTLLVGPRYGISHVINTKTNLVALLADFSHVNRIEMFSEEESLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GRVFKATLVQAEKRSEVTLLVGPRYGISHVINTKTNLVALLADFSHVNRIEMFSEEESLV
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pF1KSD RVELHVLDVKPITLLMESSDAMNLACLTAGYYRLLVDSRRSIFNMANKKNTATQETGPEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RVELHVLDVKPITLLMESSDAMNLACLTAGYYRLLVDSRRSIFNMANKKNTATQETGPEN
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pF1KSD KGKHNLLGPDWNCIPQMTTFIGEGEQEAQITYIDSKQKTVEITDSTMCPKEHRHLYIDNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KGKHNLLGPDWNCIPQMTTFIGEGEQEAQITYIDSKQKTVEITDSTMCPKEHRHLYIDNA
540 550 560 570 580 590
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pF1KSD YSSDGLNQQLSQPGEAPCEADYRSLAQRSLLTLSGPETLKKAQESPRGAKVSFIFGDFAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 YSSDGLNQQLSQPGEAPCEADYRSLAQRSLLTLSGPETLKKAQESPRGAKVSFIFGDFAL
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pF1KSD DDGISPPTLGYETLLDEGPEMLEKQRNLYIGSANDMKGLDLTPEAEGIQFVENSVYANIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DDGISPPTLGYETLLDEGPEMLEKQRNLYIGSANDMKGLDLTPEAEGIQFVENSVYANIG
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pF1KSD DVKSFQAAEGIEEPLLHDICYAENTDDAEDEDEVSCEEDLVVGEMNQPAILNLSGSSDDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DVKSFQAAEGIEEPLLHDICYAENTDDAEDEDEVSCEEDLVVGEMNQPAILNLSGSSDDI
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 IDLTSLPPPEGDDNEDDFLLRSLNMAIAAPPPGFRDSSDEEDSQSQAASFPEDKEKGSSL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QNDEIPVSLIDAVPTSAEGKCEKGLDNAVVSTLGALEALSVSEEQQTSDNSGVAILRAYS
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pF1KSD PESSSDSGNETNSSEMTESSELATAQKQSENLSRMFLATHEGYHPLAEEQTEFPASKTPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PESSSDSGNETNSSEMTESSELATAQKQSENLSRMFLATHEGYHPLAEEQTEFPASKTPA
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pF1KSD GGLPPKSSHALAARPATDLPPKVVPSKQLLHSDHMEMEPETMETKSVTDYFSKLHMGSVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GGLPPKSSHALAARPATDLPPKVVPSKQLLHSDHMEMEPETMETKSVTDYFSKLHMGSVA
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pF1KSD YSCTSKRKSKLADGEGKAPPNGNTTGKKQQGTKTAEMEEEASGKFGTVSSRDSQHLSTFN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 YSCTSKRKSKLADGEGKAPPNGNTTGKKQQGTKTAEMEEEASGKFGTVSSRDSQHLSTFN
1020 1030 1040 1050 1060 1070
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pF1KSD LERTAFRKDSQRWYVATEGGMAEKSGLEAATGKTFPRASGLGAREAEGKEEGAPDGETSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LERTAFRKDSQRWYVATEGGMAEKSGLEAATGKTFPRASGLGAREAEGKEEGAPDGETSD
1080 1090 1100 1110 1120 1130
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pF1KSD GSGLGQGDRFLTDVTCASSAKDLDNPEDADSSTCDHPSKLPEADESVARLCDYHLAKRMS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GSGLGQGDRFLTDVTCASSAKDLDNPEDADSSTCDHPSKLPEADESVARLCDYHLAKRMS
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pF1KSD SLQSEGHFSLQSSQGSSVDAGCGTGSSGSACATPVESPLCPSLGKHLIPDASGKGVNYIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SLQSEGHFSLQSSQGSSVDAGCGTGSSGSACATPVESPLCPSLGKHLIPDASGKGVNYIP
1200 1210 1220 1230 1240 1250
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pF1KSD SEERAPGLPNHGATFKELHPQTEGMCPRMTVPALHTAINTEPLFGTLRDGCHRLPKIKET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SEERAPGLPNHGATFKELHPQTEGMCPRMTVPALHTAINTEPLFGTLRDGCHRLPKIKET
1260 1270 1280 1290 1300 1310
pF1KSD TV
::
XP_016 TV
>>XP_016885474 (OMIM: 300830,300838,300983) PREDICTED: F (1346 aa)
initn: 8602 init1: 8602 opt: 8602 Z-score: 6514.6 bits: 1217.8 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 8602; 99.9% identity (100.0% similar) in 1308 aa overlap (15-1322:39-1346)
10 20 30 40
pF1KSD MDVFSFVKIAKLSSHRTKSSGWPPPSGTWGLSQVPPYGWEMTAN
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TSELQELSRPCLSPVEMDTVHPGSHSWDFCHRTKSSGWPPPSGTWGLSQVPPYGWEMTAN
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KSD RDGRDYFINHMTQAIPFDDPRLESCQIIPPAPRKVEMRRDPVLGFGFVAGSEKPVVVRSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RDGRDYFINHMTQAIPFDDPRLESCQIIPPAPRKVEMRRDPVLGFGFVAGSEKPVVVRSV
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KSD TPGGPSEGKLIPGDQIVMINDEPVSTAPRERVIDLVRSCKESILLTVIQPYPSPKSAFIS
:::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TPGGPSEGKLIPGDQIVMINDEPVSAAPRERVIDLVRSCKESILLTVIQPYPSPKSAFIS
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KSD AAKKARLKSNPVKVRFSEEVIINGQVSETVKDNSLLFMPNVLKVYLENGQTKSFRFDCST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 AAKKARLKSNPVKVRFSEEVIINGQVSETVKDNSLLFMPNVLKVYLENGQTKSFRFDCST
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KSD SIKDVILTLQEKLSIKGIEHFSLMLEQRTEGAGTKLLLLHEQETLTQVTQRPSSHKMRCL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SIKDVILTLQEKLSIKGIEHFSLMLEQRTEGAGTKLLLLHEQETLTQVTQRPSSHKMRCL
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KSD FRISFVPKDPIDLLRRDPVAFEYLYVQSCNDVVQERFGPELKYDIALRLAALQMYIATVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FRISFVPKDPIDLLRRDPVAFEYLYVQSCNDVVQERFGPELKYDIALRLAALQMYIATVT
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KSD TKQTQKISLKYIEKEWGLETFLPSAVLQSMKEKNIKKALSHLVKANQNLVPPGKKLSALQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TKQTQKISLKYIEKEWGLETFLPSAVLQSMKEKNIKKALSHLVKANQNLVPPGKKLSALQ
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KSD AKVHYLKFLSDLRLYGGRVFKATLVQAEKRSEVTLLVGPRYGISHVINTKTNLVALLADF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 AKVHYLKFLSDLRLYGGRVFKATLVQAEKRSEVTLLVGPRYGISHVINTKTNLVALLADF
430 440 450 460 470 480
470 480 490 500 510 520
pF1KSD SHVNRIEMFSEEESLVRVELHVLDVKPITLLMESSDAMNLACLTAGYYRLLVDSRRSIFN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SHVNRIEMFSEEESLVRVELHVLDVKPITLLMESSDAMNLACLTAGYYRLLVDSRRSIFN
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pF1KSD MANKKNTATQETGPENKGKHNLLGPDWNCIPQMTTFIGEGEQEAQITYIDSKQKTVEITD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MANKKNTATQETGPENKGKHNLLGPDWNCIPQMTTFIGEGEQEAQITYIDSKQKTVEITD
550 560 570 580 590 600
590 600 610 620 630 640
pF1KSD STMCPKEHRHLYIDNAYSSDGLNQQLSQPGEAPCEADYRSLAQRSLLTLSGPETLKKAQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 STMCPKEHRHLYIDNAYSSDGLNQQLSQPGEAPCEADYRSLAQRSLLTLSGPETLKKAQE
610 620 630 640 650 660
650 660 670 680 690 700
pF1KSD SPRGAKVSFIFGDFALDDGISPPTLGYETLLDEGPEMLEKQRNLYIGSANDMKGLDLTPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SPRGAKVSFIFGDFALDDGISPPTLGYETLLDEGPEMLEKQRNLYIGSANDMKGLDLTPE
670 680 690 700 710 720
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pF1KSD AEGIQFVENSVYANIGDVKSFQAAEGIEEPLLHDICYAENTDDAEDEDEVSCEEDLVVGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 AEGIQFVENSVYANIGDVKSFQAAEGIEEPLLHDICYAENTDDAEDEDEVSCEEDLVVGE
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pF1KSD MNQPAILNLSGSSDDIIDLTSLPPPEGDDNEDDFLLRSLNMAIAAPPPGFRDSSDEEDSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MNQPAILNLSGSSDDIIDLTSLPPPEGDDNEDDFLLRSLNMAIAAPPPGFRDSSDEEDSQ
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830 840 850 860 870 880
pF1KSD SQAASFPEDKEKGSSLQNDEIPVSLIDAVPTSAEGKCEKGLDNAVVSTLGALEALSVSEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SQAASFPEDKEKGSSLQNDEIPVSLIDAVPTSAEGKCEKGLDNAVVSTLGALEALSVSEE
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890 900 910 920 930 940
pF1KSD QQTSDNSGVAILRAYSPESSSDSGNETNSSEMTESSELATAQKQSENLSRMFLATHEGYH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QQTSDNSGVAILRAYSPESSSDSGNETNSSEMTESSELATAQKQSENLSRMFLATHEGYH
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950 960 970 980 990 1000
pF1KSD PLAEEQTEFPASKTPAGGLPPKSSHALAARPATDLPPKVVPSKQLLHSDHMEMEPETMET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PLAEEQTEFPASKTPAGGLPPKSSHALAARPATDLPPKVVPSKQLLHSDHMEMEPETMET
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1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KSD KSVTDYFSKLHMGSVAYSCTSKRKSKLADGEGKAPPNGNTTGKKQQGTKTAEMEEEASGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KSVTDYFSKLHMGSVAYSCTSKRKSKLADGEGKAPPNGNTTGKKQQGTKTAEMEEEASGK
1030 1040 1050 1060 1070 1080
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pF1KSD FGTVSSRDSQHLSTFNLERTAFRKDSQRWYVATEGGMAEKSGLEAATGKTFPRASGLGAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FGTVSSRDSQHLSTFNLERTAFRKDSQRWYVATEGGMAEKSGLEAATGKTFPRASGLGAR
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1130 1140 1150 1160 1170 1180
pF1KSD EAEGKEEGAPDGETSDGSGLGQGDRFLTDVTCASSAKDLDNPEDADSSTCDHPSKLPEAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EAEGKEEGAPDGETSDGSGLGQGDRFLTDVTCASSAKDLDNPEDADSSTCDHPSKLPEAD
1150 1160 1170 1180 1190 1200
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pF1KSD ESVARLCDYHLAKRMSSLQSEGHFSLQSSQGSSVDAGCGTGSSGSACATPVESPLCPSLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ESVARLCDYHLAKRMSSLQSEGHFSLQSSQGSSVDAGCGTGSSGSACATPVESPLCPSLG
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1250 1260 1270 1280 1290 1300
pF1KSD KHLIPDASGKGVNYIPSEERAPGLPNHGATFKELHPQTEGMCPRMTVPALHTAINTEPLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KHLIPDASGKGVNYIPSEERAPGLPNHGATFKELHPQTEGMCPRMTVPALHTAINTEPLF
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1310 1320
pF1KSD GTLRDGCHRLPKIKETTV
::::::::::::::::::
XP_016 GTLRDGCHRLPKIKETTV
1330 1340
>>XP_016885472 (OMIM: 300830,300838,300983) PREDICTED: F (1759 aa)
initn: 8602 init1: 8602 opt: 8602 Z-score: 6512.8 bits: 1217.8 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 8602; 99.9% identity (100.0% similar) in 1308 aa overlap (14-1321:11-1318)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MDVFSFVKIAKLSSHRTKSSGWPPPSGTWGLSQVPPYGWEMTANRDGRDYFINHMTQAIP
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MAATWSLLCLSHRTKSSGWPPPSGTWGLSQVPPYGWEMTANRDGRDYFINHMTQAIP
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KSD FDDPRLESCQIIPPAPRKVEMRRDPVLGFGFVAGSEKPVVVRSVTPGGPSEGKLIPGDQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FDDPRLESCQIIPPAPRKVEMRRDPVLGFGFVAGSEKPVVVRSVTPGGPSEGKLIPGDQI
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KSD VMINDEPVSTAPRERVIDLVRSCKESILLTVIQPYPSPKSAFISAAKKARLKSNPVKVRF
:::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VMINDEPVSAAPRERVIDLVRSCKESILLTVIQPYPSPKSAFISAAKKARLKSNPVKVRF
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KSD SEEVIINGQVSETVKDNSLLFMPNVLKVYLENGQTKSFRFDCSTSIKDVILTLQEKLSIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SEEVIINGQVSETVKDNSLLFMPNVLKVYLENGQTKSFRFDCSTSIKDVILTLQEKLSIK
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KSD GIEHFSLMLEQRTEGAGTKLLLLHEQETLTQVTQRPSSHKMRCLFRISFVPKDPIDLLRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GIEHFSLMLEQRTEGAGTKLLLLHEQETLTQVTQRPSSHKMRCLFRISFVPKDPIDLLRR
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KSD DPVAFEYLYVQSCNDVVQERFGPELKYDIALRLAALQMYIATVTTKQTQKISLKYIEKEW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DPVAFEYLYVQSCNDVVQERFGPELKYDIALRLAALQMYIATVTTKQTQKISLKYIEKEW
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KSD GLETFLPSAVLQSMKEKNIKKALSHLVKANQNLVPPGKKLSALQAKVHYLKFLSDLRLYG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GLETFLPSAVLQSMKEKNIKKALSHLVKANQNLVPPGKKLSALQAKVHYLKFLSDLRLYG
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KSD GRVFKATLVQAEKRSEVTLLVGPRYGISHVINTKTNLVALLADFSHVNRIEMFSEEESLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GRVFKATLVQAEKRSEVTLLVGPRYGISHVINTKTNLVALLADFSHVNRIEMFSEEESLV
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KSD RVELHVLDVKPITLLMESSDAMNLACLTAGYYRLLVDSRRSIFNMANKKNTATQETGPEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RVELHVLDVKPITLLMESSDAMNLACLTAGYYRLLVDSRRSIFNMANKKNTATQETGPEN
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590 600
pF1KSD KGKHNLLGPDWNCIPQMTTFIGEGEQEAQITYIDSKQKTVEITDSTMCPKEHRHLYIDNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KGKHNLLGPDWNCIPQMTTFIGEGEQEAQITYIDSKQKTVEITDSTMCPKEHRHLYIDNA
540 550 560 570 580 590
610 620 630 640 650 660
pF1KSD YSSDGLNQQLSQPGEAPCEADYRSLAQRSLLTLSGPETLKKAQESPRGAKVSFIFGDFAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 YSSDGLNQQLSQPGEAPCEADYRSLAQRSLLTLSGPETLKKAQESPRGAKVSFIFGDFAL
600 610 620 630 640 650
670 680 690 700 710 720
pF1KSD DDGISPPTLGYETLLDEGPEMLEKQRNLYIGSANDMKGLDLTPEAEGIQFVENSVYANIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DDGISPPTLGYETLLDEGPEMLEKQRNLYIGSANDMKGLDLTPEAEGIQFVENSVYANIG
660 670 680 690 700 710
730 740 750 760 770 780
pF1KSD DVKSFQAAEGIEEPLLHDICYAENTDDAEDEDEVSCEEDLVVGEMNQPAILNLSGSSDDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DVKSFQAAEGIEEPLLHDICYAENTDDAEDEDEVSCEEDLVVGEMNQPAILNLSGSSDDI
720 730 740 750 760 770
790 800 810 820 830 840
pF1KSD IDLTSLPPPEGDDNEDDFLLRSLNMAIAAPPPGFRDSSDEEDSQSQAASFPEDKEKGSSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 IDLTSLPPPEGDDNEDDFLLRSLNMAIAAPPPGFRDSSDEEDSQSQAASFPEDKEKGSSL
780 790 800 810 820 830
850 860 870 880 890 900
pF1KSD QNDEIPVSLIDAVPTSAEGKCEKGLDNAVVSTLGALEALSVSEEQQTSDNSGVAILRAYS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QNDEIPVSLIDAVPTSAEGKCEKGLDNAVVSTLGALEALSVSEEQQTSDNSGVAILRAYS
840 850 860 870 880 890
910 920 930 940 950 960
pF1KSD PESSSDSGNETNSSEMTESSELATAQKQSENLSRMFLATHEGYHPLAEEQTEFPASKTPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PESSSDSGNETNSSEMTESSELATAQKQSENLSRMFLATHEGYHPLAEEQTEFPASKTPA
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XP_016 GGLPPKSSHALAARPATDLPPKVVPSKQLLHSDHMEMEPETMETKSVTDYFSKLHMGSVA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LERTAFRKDSQRWYVATEGGMAEKSGLEAATGKTFPRASGLGAREAEGKEEGAPDGETSD
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GSGLGQGDRFLTDVTCASSAKDLDNPEDADSSTCDHPSKLPEADESVARLCDYHLAKRMS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SEERAPGLPNHGATFKELHPQTEGMCPRMTVPALHTAINTEPLFGTLRDGCHRLPKIKET
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XP_016 TALTEPGKERRGGMPSAWSQHPEADPILLPSNIHSESKVPIPNQDPNDFSQANQAYGEAV
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10 20 30 40
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::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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230 240 250 260 270 280
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SQAASFPEDKEKGSSLQNDEIPVSLIDAVPTSAEGKCEKGLDNAVVSTLGALEALSVSEE
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pF1KSD QQTSDNSGVAILRAYSPESSSDSGNETNSSEMTESSELATAQKQSENLSRMFLATHEGYH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 QQTSDNSGVAILRAYSPESSSDSGNETNSSEMTESSELATAQKQSENLSRMFLATHEGYH
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 PLAEEQTEFPASKTPAGGLPPKSSHALAARPATDLPPKVVPSKQLLHSDHMEMEPETMET
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 ESVARLCDYHLAKRMSSLQSEGHFSLQSSQGSSVDAGCGTGSSGSACATPVESPLCPSLG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 KHLIPDASGKGVNYIPSEERAPGLPNHGATFKELHPQTEGMCPRMTVPALHTAINTEPLF
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1310 1320
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:::::::::::::::::
XP_005 GTLRDGCHRLPKIKETTALTEPGKERRGGMPSAWSQHPEADPILLPSNIHSESKVPIPNQ
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10 20 30 40
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::::::::::::::::::::::::::::::
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50 60 70 80 90 100
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RDGRDYFINHMTQAIPFDDPRLESCQIIPPAPRKVEMRRDPVLGFGFVAGSEKPVVVRSV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MNQPAILNLSGSSDDIIDLTSLPPPEGDDNEDDFLLRSLNMAIAAPPPGFRDSSDEEDSQ
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SQAASFPEDKEKGSSLQNDEIPVSLIDAVPTSAEGKCEKGLDNAVVSTLGALEALSVSEE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PLAEEQTEFPASKTPAGGLPPKSSHALAARPATDLPPKVVPSKQLLHSDHMEMEPETMET
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FGTVSSRDSQHLSTFNLERTAFRKDSQRWYVATEGGMAEKSGLEAATGKTFPRASGLGAR
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pF1KSD EAEGKEEGAPDGETSDGSGLGQGDRFLTDVTCASSAKDLDNPEDADSSTCDHPSKLPEAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EAEGKEEGAPDGETSDGSGLGQGDRFLTDVTCASSAKDLDNPEDADSSTCDHPSKLPEAD
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pF1KSD ESVARLCDYHLAKRMSSLQSEGHFSLQSSQGSSVDAGCGTGSSGSACATPVESPLCPSLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ESVARLCDYHLAKRMSSLQSEGHFSLQSSQGSSVDAGCGTGSSGSACATPVESPLCPSLG
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pF1KSD KHLIPDASGKGVNYIPSEERAPGLPNHGATFKELHPQTEGMCPRMTVPALHTAINTEPLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KHLIPDASGKGVNYIPSEERAPGLPNHGATFKELHPQTEGMCPRMTVPALHTAINTEPLF
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pF1KSD GTLRDGCHRLPKIKETTV
:::::::::::::::::
XP_016 GTLRDGCHRLPKIKETTALTEPGKERRGGMPSAWSQHPEADPILLPSNIHSESKVPIPNQ
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pF1KSD SQVPPYGWEMTANRDGRDYFINHMTQAIPFDDPRLESCQIIPPAPRKVEMRRDPVL-GFG
: : . : . :. . :.. .: .: .:
XP_011 TRKAHRIEQMVARWLRRSRDSSARAKVAAADGPARNPTQTLIPVRHTVKIDKDTLLQDYG
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pF1KSD FVAGSEKPVVVRSVTPGGPSEGKLIPGDQIVMINDEPVSTAPRERVIDLVRSCKESILLT
: . :..: .:: :: ..:::.:::::...:.::. ::..:..: ..:. .:
XP_011 FHISESLPLTVVAVTAGGSAHGKLFPGDQILQMNNEPAEDLSWERAVDILREAEDSLSIT
80 90 100 110 120 130
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pF1KSD VIQPYPS-PKSAFISAAKKARLKSNPVKVRFSEEVIINGQVSETVKDNSLLFMPNVLKVY
:.. . :::.:.. :.::::.:::::.:.:::.:.:. . :::: ::::::.:
XP_011 VVRCTSGVPKSSFLTEEKRARLKTNPVKVHFAEEVLISGHS----QGNSLLCMPNVLKLY
140 150 160 170 180
210 220 230 240 250 260
pF1KSD LENGQTKSFRFDCSTSIKDVILTLQEKLSIKGIEHFSLMLEQRTEGAGTKLLLLHEQETL
:::::::.:.:. .:..::.:::..:::::..::.:.: ::.. . ..: ::::.: .
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::..: :: .:::::. ::::::.:::..:::::::::.:::.::.::::. :.: .
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::::. : .: .:: : ...::..:..:. ::::.:.:::. ...: ..:::: .:::
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:.:::.: :... ::.:....:.:. : :.. :.... ::: .:::.::..: .::::
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.. .... : : . .. :. :. . :. : .. : .:: :.
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.: . :. . . ..:.. . .. ... .:. ::. .: ..:. : :.
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::: . . . .. .. . .. . .:: ... : . ......
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: .. : .:. . .. .. . .: . . . :: ... .: ::
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: ...... . ... .:: : :: : : : ..:::: :
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...: . .:. ..: . ..:: ... ::. .: :.. : .: .
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: ... . :.. . .:. : .: :. : :: : .. :::..
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: .: : . : : .:. . :: .:. : : :: :.: :.....
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::: . . . .. .. . .. . .:: ... : . ......
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pF1KSD MTVPALHTAINTEPLFGTLRDGCHRLPKIKETTV
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XP_011 PSLPEPLPCPQEDPHLETSNHCLLSEGKSDSSSICLSAEKSFLCFAPESHPEVSASLRVA
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XP_016 DRRLVKLAPCRSLIKEEQPPGNSPTPEVARR-----GPSTCGASSTTDSAESEASDSANT
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