Result of FASTA (omim) for
pF1KSDA0307
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0307, 706 aa
1>>>pF1KSDA0307 706 - 706 aa - 706 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.4611+/-0.000432; mu= 1.3196+/- 0.027
mean_var=259.3883+/-54.683, 0's: 0 Z-trim(118.1): 148 B-trim: 0 in 0/56
Lambda= 0.079634
statistics sampled from 30485 (30657) to 30485 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.699), E-opt: 0.2 (0.359), width: 16
Scan time: 10.510
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_055677 (OMIM: 606036,615926) aryl hydrocarbon r ( 717) 4760 560.8 6.5e-159
XP_016856784 (OMIM: 126110) PREDICTED: aryl hydroc ( 747) 2858 342.3 4e-93
XP_016856782 (OMIM: 126110) PREDICTED: aryl hydroc ( 727) 2837 339.9 2.1e-92
XP_016856783 (OMIM: 126110) PREDICTED: aryl hydroc ( 751) 2830 339.1 3.7e-92
XP_016856785 (OMIM: 126110) PREDICTED: aryl hydroc ( 737) 2784 333.8 1.4e-90
XP_016856781 (OMIM: 126110) PREDICTED: aryl hydroc ( 743) 2777 333.0 2.5e-90
XP_005245214 (OMIM: 126110) PREDICTED: aryl hydroc ( 752) 2777 333.0 2.6e-90
XP_016856779 (OMIM: 126110) PREDICTED: aryl hydroc ( 765) 2156 261.7 7.8e-69
XP_011507847 (OMIM: 126110) PREDICTED: aryl hydroc ( 773) 2156 261.7 7.8e-69
NP_848514 (OMIM: 126110) aryl hydrocarbon receptor ( 774) 2156 261.7 7.8e-69
NP_001272965 (OMIM: 126110) aryl hydrocarbon recep ( 787) 2156 261.7 7.9e-69
XP_016856780 (OMIM: 126110) PREDICTED: aryl hydroc ( 764) 2154 261.5 9.1e-69
XP_011507849 (OMIM: 126110) PREDICTED: aryl hydroc ( 772) 2154 261.5 9.2e-69
NP_001184254 (OMIM: 126110) aryl hydrocarbon recep ( 773) 2154 261.5 9.2e-69
XP_011507848 (OMIM: 126110) PREDICTED: aryl hydroc ( 757) 2149 260.9 1.3e-68
XP_005245211 (OMIM: 126110) PREDICTED: aryl hydroc ( 780) 2149 260.9 1.4e-68
XP_011507846 (OMIM: 126110) PREDICTED: aryl hydroc ( 787) 2149 260.9 1.4e-68
XP_011507844 (OMIM: 126110) PREDICTED: aryl hydroc ( 788) 2149 260.9 1.4e-68
XP_011507845 (OMIM: 126110) PREDICTED: aryl hydroc ( 788) 2149 260.9 1.4e-68
NP_001659 (OMIM: 126110) aryl hydrocarbon receptor ( 789) 2149 260.9 1.4e-68
XP_016856777 (OMIM: 126110) PREDICTED: aryl hydroc ( 779) 2147 260.7 1.6e-68
XP_005245208 (OMIM: 126110) PREDICTED: aryl hydroc ( 788) 2147 260.7 1.6e-68
NP_001272964 (OMIM: 126110) aryl hydrocarbon recep ( 775) 2105 255.8 4.5e-67
XP_016856778 (OMIM: 126110) PREDICTED: aryl hydroc ( 775) 2105 255.8 4.5e-67
XP_005245210 (OMIM: 126110) PREDICTED: aryl hydroc ( 784) 2105 255.8 4.6e-67
XP_016873235 (OMIM: 602550) PREDICTED: aryl hydroc ( 583) 1095 139.7 3.1e-32
XP_016873236 (OMIM: 602550) PREDICTED: aryl hydroc ( 583) 1095 139.7 3.1e-32
NP_001284653 (OMIM: 602550) aryl hydrocarbon recep ( 583) 1095 139.7 3.1e-32
XP_011518414 (OMIM: 602550) PREDICTED: aryl hydroc ( 583) 1095 139.7 3.1e-32
NP_001284648 (OMIM: 602550) aryl hydrocarbon recep ( 626) 1095 139.7 3.3e-32
NP_001284651 (OMIM: 602550) aryl hydrocarbon recep ( 626) 1095 139.7 3.3e-32
XP_016873231 (OMIM: 602550) PREDICTED: aryl hydroc ( 626) 1095 139.7 3.3e-32
XP_016873228 (OMIM: 602550) PREDICTED: aryl hydroc ( 669) 1095 139.7 3.5e-32
NP_001025444 (OMIM: 602550) aryl hydrocarbon recep ( 582) 1081 138.1 9.5e-32
XP_011518415 (OMIM: 602550) PREDICTED: aryl hydroc ( 582) 1081 138.1 9.5e-32
XP_016873237 (OMIM: 602550) PREDICTED: aryl hydroc ( 582) 1081 138.1 9.5e-32
XP_011518412 (OMIM: 602550) PREDICTED: aryl hydroc ( 588) 1081 138.1 9.6e-32
XP_006718297 (OMIM: 602550) PREDICTED: aryl hydroc ( 588) 1081 138.1 9.6e-32
XP_011518413 (OMIM: 602550) PREDICTED: aryl hydroc ( 588) 1081 138.1 9.6e-32
NP_001169 (OMIM: 602550) aryl hydrocarbon receptor ( 625) 1081 138.1 1e-31
XP_016873232 (OMIM: 602550) PREDICTED: aryl hydroc ( 625) 1081 138.1 1e-31
NP_001025443 (OMIM: 602550) aryl hydrocarbon recep ( 625) 1081 138.1 1e-31
XP_011518410 (OMIM: 602550) PREDICTED: aryl hydroc ( 631) 1081 138.1 1e-31
XP_006718296 (OMIM: 602550) PREDICTED: aryl hydroc ( 631) 1081 138.1 1e-31
XP_011518411 (OMIM: 602550) PREDICTED: aryl hydroc ( 631) 1081 138.1 1e-31
XP_011518409 (OMIM: 602550) PREDICTED: aryl hydroc ( 668) 1081 138.1 1.1e-31
XP_016873227 (OMIM: 602550) PREDICTED: aryl hydroc ( 674) 1081 138.1 1.1e-31
XP_016873234 (OMIM: 602550) PREDICTED: aryl hydroc ( 587) 1074 137.3 1.7e-31
XP_016873233 (OMIM: 602550) PREDICTED: aryl hydroc ( 587) 1074 137.3 1.7e-31
XP_016873229 (OMIM: 602550) PREDICTED: aryl hydroc ( 630) 1074 137.3 1.8e-31
>>NP_055677 (OMIM: 606036,615926) aryl hydrocarbon recep (717 aa)
initn: 4760 init1: 4760 opt: 4760 Z-score: 2974.0 bits: 560.8 E(85289): 6.5e-159
Smith-Waterman score: 4760; 99.7% identity (100.0% similar) in 706 aa overlap (1-706:12-717)
10 20 30 40
pF1KSD MASDIPGSVTLPVAPMAATGQVRMAGAMPARGGKRRSGMDFDDEDGEGP
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 MATPAAVNPPEMASDIPGSVTLPVAPMAATGQVRMAGAMPARGGKRRSGMDFDDEDGEGP
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KSD SKFSRENHSEIERRKRNKMTQYITELSDMVPTCSALARKPDKLTILRMAVSHMKSMRGTG
::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 SKFSRENHSEIERRRRNKMTQYITELSDMVPTCSALARKPDKLTILRMAVSHMKSMRGTG
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KSD NKSTDGAYKPSFLTEQELKHLILEAADGFLFVVAAETGRVIYVSDSVTPVLNQPQSEWFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 NKSTDGAYKPSFLTEQELKHLILEAADGFLFVVAAETGRVIYVSDSVTPVLNQPQSEWFG
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KSD STLYEQVHPDDVEKLREQLCTSENSMTGRILDLKTGTVKKEGQQSSMRMCMGSRRSFICR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 STLYEQVHPDDVEKLREQLCTSENSMTGRILDLKTGTVKKEGQQSSMRMCMGSRRSFICR
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KSD MRCGNAPLDHLPLNRITTMRKRFRNGLGPVKEGEAQYAVVHCTGYIKAWPPAGMTIPEED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 MRCGNAPLDHLPLNRITTMRKRFRNGLGPVKEGEAQYAVVHCTGYIKAWPPAGMTIPEED
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KSD ADVGQGSKYCLVAIGRLQVTSSPVCMDMNGMSVPTEFLSRHNSDGIITFVDPRCISVIGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 ADVGQGSKYCLVAIGRLQVTSSPVCMDMNGMSVPTEFLSRHNSDGIITFVDPRCISVIGY
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KSD QPQDLLGKDILEFCHPEDQSHLRESFQQVVKLKGQVLSVMYRFRTKNREWMLIRTSSFTF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 QPQDLLGKDILEFCHPEDQSHLRESFQQVVKLKGQVLSVMYRFRTKNREWMLIRTSSFTF
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KSD QNPYSDEIEYIICTNTNVKQLQQQQAELEVHQRDGLSSYDLSQVPVPNLPAGVHEAGKSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 QNPYSDEIEYIICTNTNVKQLQQQQAELEVHQRDGLSSYDLSQVPVPNLPAGVHEAGKSV
430 440 450 460 470 480
470 480 490 500 510 520
pF1KSD EKADAIFSQERDPRFAEMFAGISASEKKMMSSASAAGTQQIYSQGSPFPSGHSGKAFSSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 EKADAIFSQERDPRFAEMFAGISASEKKMMSSASAAGTQQIYSQGSPFPSGHSGKAFSSS
490 500 510 520 530 540
530 540 550 560 570 580
pF1KSD VVHVPGVNDIQSSSSTGQNMSQISRQLNQSQVAWTGSRPPFPGQQIPSQSSKTQSSPFGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 VVHVPGVNDIQSSSSTGQNMSQISRQLNQSQVAWTGSRPPFPGQQIPSQSSKTQSSPFGI
550 560 570 580 590 600
590 600 610 620 630 640
pF1KSD GTSHTYPADPSSYSPLSSPATSSPSGNAYSSLANRTPGFAESGQSSGQFQGRPSEVWSQW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 GTSHTYPADPSSYSPLSSPATSSPSGNAYSSLANRTPGFAESGQSSGQFQGRPSEVWSQW
610 620 630 640 650 660
650 660 670 680 690 700
pF1KSD QSQHHGQQSGEQHSHQQPSQTEVFQDMLPMPGDPTQGTGNYNIEDFADLGMFPPFSE
::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 QSQHHGQQSGEQHSHQQPGQTEVFQDMLPMPGDPTQGTGNYNIEDFADLGMFPPFSE
670 680 690 700 710
>>XP_016856784 (OMIM: 126110) PREDICTED: aryl hydrocarbo (747 aa)
initn: 2424 init1: 1340 opt: 2858 Z-score: 1792.8 bits: 342.3 E(85289): 4e-93
Smith-Waterman score: 2906; 61.5% identity (79.7% similar) in 755 aa overlap (1-706:10-747)
10 20 30 40 50
pF1KSD MASDIPGSVTLPVAPMAATGQVRMAGAMPARGGKRRSGMDFDDEDGEGPSK
:.::.: :. .: . .. .::. :. ::: :.:::: :::: ::
XP_016 MAATTANPEMTSDVP-SLGPAIASGNSGPGIQGGGAIVQRAIKRRPGLDFDD-DGEGNSK
10 20 30 40 50
60 70 80
pF1KSD F------------------------------SRENHSEIERRKRNKMTQYITELSDMVPT
: .::::::::::.::::: :::::::::::
XP_016 FLRCDDDQMSNDKERFARSDDEQSSADKERLARENHSEIERRRRNKMTAYITELSDMVPT
60 70 80 90 100 110
90 100 110 120 130 140
pF1KSD CSALARKPDKLTILRMAVSHMKSMRGTGNKSTDGAYKPSFLTEQELKHLILEAADGFLFV
:::::::::::::::::::::::.::::: ::::.:::::::.::::::::::::::::.
XP_016 CSALARKPDKLTILRMAVSHMKSLRGTGNTSTDGSYKPSFLTDQELKHLILEAADGFLFI
120 130 140 150 160 170
150 160 170 180 190 200
pF1KSD VAAETGRVIYVSDSVTPVLNQPQSEWFGSTLYEQVHPDDVEKLREQLCTSENSMTGRILD
:. :::::.:::::::::::::::::::::::.:::::::.:::::: ::::..::::::
XP_016 VSCETGRVVYVSDSVTPVLNQPQSEWFGSTLYDQVHPDDVDKLREQLSTSENALTGRILD
180 190 200 210 220 230
210 220 230 240 250 260
pF1KSD LKTGTVKKEGQQSSMRMCMGSRRSFICRMRCGNAPLDHLPLNRITTMRKRFRNGLGPVKE
::::::::::::::::::::::::::::::::.. .: . .::.. .:.: ::::: ::.
XP_016 LKTGTVKKEGQQSSMRMCMGSRRSFICRMRCGSSSVDPVSVNRLSFVRNRCRNGLGSVKD
240 250 260 270 280 290
270 280 290 300 310 320
pF1KSD GEAQYAVVHCTGYIKAWPPAGMTIPEEDADVGQGSKYCLVAIGRLQVTSSPVCMDMNGMS
:: ...:::::::::::::: ..: ..:::::.:::::::::::::: : ::...
XP_016 GEPHFVVVHCTGYIKAWPPA-----DDDPEAGQGSKFCLVAIGRLQVTSSPNCTDMSNVC
300 310 320 330 340 350
330 340 350 360 370 380
pF1KSD VPTEFLSRHNSDGIITFVDPRCISVIGYQPQDLLGKDILEFCHPEDQSHLRESFQQVVKL
::::.:::: .::.:::: ::....:::::.::::.:.::::::::. ::.::::::::
XP_016 QPTEFISRHNIEGIFTFVDHRCVATVGYQPQELLGKNIVEFCHPEDQQLLRDSFQQVVKL
360 370 380 390 400 410
390 400 410 420 430 440
pF1KSD KGQVLSVMYRFRTKNREWMLIRTSSFTFQNPYSDEIEYIICTNTNVKQLQQQQAELE-VH
::::::::.:::.::.::. .::::::::::::::::::::::::::: ::::.::. :
XP_016 KGQVLSVMFRFRSKNQEWLWMRTSSFTFQNPYSDEIEYIICTNTNVKQ-QQQQTELDMVP
420 430 440 450 460 470
450 460 470 480 490 500
pF1KSD QRDGLSSYDLSQVPVPNLPAGVHEAGKSVEKADAIFSQERDPRFAEMFAGISASEKKMMS
::::.::. ::: : .: : .: .::.:..:.:.:::::.:.. .:.:...: .:
XP_016 GRDGLASYNHSQVVQPVTTTG-PEHSKPLEKSDGLFAQDRDPRFSEIYHNINADQSKGIS
480 490 500 510 520 530
510 520 530 540 550
pF1KSD SASAAGTQQIYSQGSPFP-SGHSGKAFSSSVVHVPGVNDIQSSSSTGQNMSQISRQLNQS
:... .:::..:::. :: . . .. : .: . .: :. .: :.:.:: ..::::. : .
XP_016 SSTVPATQQLFSQGNTFPPTPRPAENFRNSGL-APPVTIVQPSASAGQMLAQISRHSNPT
540 550 560 570 580 590
560 570 580 590 600 610
pF1KSD QVA---WTGS-RPPFPGQQIPSQSS-KTQSSPFGIGTSHTYPADPSSYSPLSSPA--TSS
: : :: . : : .::. .:.. ::..: ::.:. .: :::.: .: :. :.:
XP_016 QGATPTWTPTTRSGFSAQQVATQATAKTRTSQFGVGSFQT----PSSFSSMSLPGAPTAS
600 610 620 630 640
620 630 640 650 660
pF1KSD PSGNAYSSLANRTPGFA-ESGQSSGQFQGRPSE---VWSQWQSQ--HHGQQSGEQHSHQ-
:.. :: ::.:: .:: :.::..:::: : .: :: :::.: :: ..:.::: .:
XP_016 PGAAAYPSLTNRGSNFAPETGQTAGQFQTRTAEGVGVWPQWQGQQPHHRSSSSEQHVQQP
650 660 670 680 690 700
670 680 690 700
pF1KSD ---QPSQTEVFQDMLPMPGDPTQGTGNYNIEDFADLGMFPPFSE
::.: ::::.:: : :: .. .:: :.: :: :::::::
XP_016 PAQQPGQPEVFQEMLSMLGDQSN---SYNNEEFPDLTMFPPFSE
710 720 730 740
>>XP_016856782 (OMIM: 126110) PREDICTED: aryl hydrocarbo (727 aa)
initn: 2525 init1: 2228 opt: 2837 Z-score: 1780.0 bits: 339.9 E(85289): 2.1e-92
Smith-Waterman score: 2966; 62.8% identity (81.7% similar) in 739 aa overlap (1-706:1-727)
10 20 30 40 50
pF1KSD MASDIPGSVTLPVAPMAATGQVRMAGAMPARGGKRRSGMDFDDEDGEGPSKF--------
:.::.: :. .: . .. .::. :. ::: :.:::: :::: :::
XP_016 MTSDVP-SLGPAIASGNSGPGIQGGGAIVQRAIKRRPGLDFDD-DGEGNSKFLRCDDDQM
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100
pF1KSD -------SRENHSEIERRKRNKMTQYITELSDMVPTCSALARKPDKLTILRMAVSHMKSM
.::::::::::.::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::.
XP_016 SNDKERFARENHSEIERRRRNKMTAYITELSDMVPTCSALARKPDKLTILRMAVSHMKSL
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KSD RGTGNKSTDGAYKPSFLTEQELKHLILEAADGFLFVVAAETGRVIYVSDSVTPVLNQPQS
::::: ::::.:::::::.::::::::::::::::.:. :::::.:::::::::::::::
XP_016 RGTGNTSTDGSYKPSFLTDQELKHLILEAADGFLFIVSCETGRVVYVSDSVTPVLNQPQS
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KSD EWFGSTLYEQVHPDDVEKLREQLCTSENSMTGRILDLKTGTVKKEGQQSSMRMCMGSRRS
::::::::.:::::::.:::::: ::::..::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EWFGSTLYDQVHPDDVDKLREQLSTSENALTGRILDLKTGTVKKEGQQSSMRMCMGSRRS
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KSD FICRMRCGNAPLDHLPLNRITTMRKRFRNGLGPVKEGEAQYAVVHCTGYIKAWPPAGMTI
::::::::.. .: . .::.. .:.: ::::: ::.:: ...:::::::::::::::...
XP_016 FICRMRCGSSSVDPVSVNRLSFVRNRCRNGLGSVKDGEPHFVVVHCTGYIKAWPPAGVSL
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KSD PEEDADVGQGSKYCLVAIGRLQVTSSPVCMDMNGMSVPTEFLSRHNSDGIITFVDPRCIS
:..: ..:::::.:::::::::::::: : ::... ::::.:::: .::.:::: ::..
XP_016 PDDDPEAGQGSKFCLVAIGRLQVTSSPNCTDMSNVCQPTEFISRHNIEGIFTFVDHRCVA
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KSD VIGYQPQDLLGKDILEFCHPEDQSHLRESFQQVVKLKGQVLSVMYRFRTKNREWMLIRTS
..:::::.::::.:.::::::::. ::.::::::::::::::::.:::.::.::. .:::
XP_016 TVGYQPQELLGKNIVEFCHPEDQQLLRDSFQQVVKLKGQVLSVMFRFRSKNQEWLWMRTS
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KSD SFTFQNPYSDEIEYIICTNTNVKQLQQQQAELE-VHQRDGLSSYDLSQVPVPNLPAGVHE
:::::::::::::::::::::::: ::::.::. : ::::.::. ::: : .: :
XP_016 SFTFQNPYSDEIEYIICTNTNVKQ-QQQQTELDMVPGRDGLASYNHSQVVQPVTTTG-PE
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KSD AGKSVEKADAIFSQERDPRFAEMFAGISASEKKMMSSASAAGTQQIYSQGSPFP-SGHSG
.: .::.:..:.:.:::::.:.. .:.:...: .::... .:::..:::. :: . . .
XP_016 HSKPLEKSDGLFAQDRDPRFSEIYHNINADQSKGISSSTVPATQQLFSQGNTFPPTPRPA
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570
pF1KSD KAFSSSVVHVPGVNDIQSSSSTGQNMSQISRQLNQSQVA---WTGS-RPPFPGQQIPSQS
. : .: . .: :. .: :.:.:: ..::::. : .: : :: . : : .: . .
XP_016 ENFRNSGL-APPVTIVQPSASAGQMLAQISRHSNPTQGATPTWTPTTRSGFSAQVATQAT
540 550 560 570 580 590
580 590 600 610 620 630
pF1KSD SKTQSSPFGIGTSHTYPADPSSYSPLSSPA--TSSPSGNAYSSLANRTPGFA-ESGQSSG
.::..: ::.:. .: :::.: .: :. :.::.. :: ::.:: .:: :.::..:
XP_016 AKTRTSQFGVGSFQT----PSSFSSMSLPGAPTASPGAAAYPSLTNRGSNFAPETGQTAG
600 610 620 630 640 650
640 650 660 670 680
pF1KSD QFQGRPSE---VWSQWQSQ--HHGQQSGEQHSHQ----QPSQTEVFQDMLPMPGDPTQGT
::: : .: :: :::.: :: ..:.::: .: ::.: ::::.:: : :: ..
XP_016 QFQTRTAEGVGVWPQWQGQQPHHRSSSSEQHVQQPPAQQPGQPEVFQEMLSMLGDQSN--
660 670 680 690 700
690 700
pF1KSD GNYNIEDFADLGMFPPFSE
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XP_016 -SYNNEEFPDLTMFPPFSE
710 720
>>XP_016856783 (OMIM: 126110) PREDICTED: aryl hydrocarbo (751 aa)
initn: 2515 init1: 2218 opt: 2830 Z-score: 1775.4 bits: 339.1 E(85289): 3.7e-92
Smith-Waterman score: 2936; 61.5% identity (80.1% similar) in 754 aa overlap (1-706:10-751)
10 20 30 40 50
pF1KSD MASDIPGSVTLPVAPMAATGQVRMAGAMPARGGKRRSGMDFDDEDGEGPSK
:.::.: :. .: . .. .::. :. ::: :.:::: :::: ::
XP_016 MAATTANPEMTSDVP-SLGPAIASGNSGPGIQGGGAIVQRAIKRRPGLDFDD-DGEGNSK
10 20 30 40 50
60 70 80
pF1KSD F------------------------------SRENHSEIERRKRNKMTQYITELSDMVPT
: .::::::::::.::::: :::::::::::
XP_016 FLRCDDDQMSNDKERFARSDDEQSSADKERLARENHSEIERRRRNKMTAYITELSDMVPT
60 70 80 90 100 110
90 100 110 120 130 140
pF1KSD CSALARKPDKLTILRMAVSHMKSMRGTGNKSTDGAYKPSFLTEQELKHLILEAADGFLFV
:::::::::::::::::::::::.::::: ::::.:::::::.::::::::::::::::.
XP_016 CSALARKPDKLTILRMAVSHMKSLRGTGNTSTDGSYKPSFLTDQELKHLILEAADGFLFI
120 130 140 150 160 170
150 160 170 180 190 200
pF1KSD VAAETGRVIYVSDSVTPVLNQPQSEWFGSTLYEQVHPDDVEKLREQLCTSENSMTGRILD
:. :::::.:::::::::::::::::::::::.:::::::.:::::: ::::..::::::
XP_016 VSCETGRVVYVSDSVTPVLNQPQSEWFGSTLYDQVHPDDVDKLREQLSTSENALTGRILD
180 190 200 210 220 230
210 220 230 240 250 260
pF1KSD LKTGTVKKEGQQSSMRMCMGSRRSFICRMRCGNAPLDHLPLNRITTMRKRFRNGLGPVKE
::::::::::::::::::::::::::::::::.. .: . .::.. .:.: ::::: ::.
XP_016 LKTGTVKKEGQQSSMRMCMGSRRSFICRMRCGSSSVDPVSVNRLSFVRNRCRNGLGSVKD
240 250 260 270 280 290
270 280 290 300 310 320
pF1KSD GEAQYAVVHCTGYIKAWPPAGMTIPEEDADVGQGSKYCLVAIGRLQVTSSPVCMDMNGMS
:: ...:::::::::::::::...:..: ..:::::.:::::::::::::: : ::...
XP_016 GEPHFVVVHCTGYIKAWPPAGVSLPDDDPEAGQGSKFCLVAIGRLQVTSSPNCTDMSNVC
300 310 320 330 340 350
330 340 350 360 370 380
pF1KSD VPTEFLSRHNSDGIITFVDPRCISVIGYQPQDLLGKDILEFCHPEDQSHLRESFQQVVKL
::::.:::: .::.:::: ::....:::::.::::.:.::::::::. ::.::::::::
XP_016 QPTEFISRHNIEGIFTFVDHRCVATVGYQPQELLGKNIVEFCHPEDQQLLRDSFQQVVKL
360 370 380 390 400 410
390 400 410 420 430 440
pF1KSD KGQVLSVMYRFRTKNREWMLIRTSSFTFQNPYSDEIEYIICTNTNVKQLQQQQAELE-VH
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XP_016 KGQVLSVMFRFRSKNQEWLWMRTSSFTFQNPYSDEIEYIICTNTNVKQ-QQQQTELDMVP
420 430 440 450 460 470
450 460 470 480 490 500
pF1KSD QRDGLSSYDLSQVPVPNLPAGVHEAGKSVEKADAIFSQERDPRFAEMFAGISASEKKMMS
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XP_016 GRDGLASYNHSQVVQPVTTTG-PEHSKPLEKSDGLFAQDRDPRFSEIYHNINADQSKGIS
480 490 500 510 520 530
510 520 530 540 550
pF1KSD SASAAGTQQIYSQGSPFP-SGHSGKAFSSSVVHVPGVNDIQSSSSTGQNMSQISRQLNQS
:... .:::..:::. :: . . .. : .: . .: :. .: :.:.:: ..::::. : .
XP_016 SSTVPATQQLFSQGNTFPPTPRPAENFRNSGL-APPVTIVQPSASAGQMLAQISRHSNPT
540 550 560 570 580 590
560 570 580 590 600 610
pF1KSD QVA---WTGS-RPPFPGQQIPSQSSKTQSSPFGIGTSHTYPADPSSYSPLSSPA--TSSP
: : :: . : : .: . ..::..: ::.:. .: :::.: .: :. :.::
XP_016 QGATPTWTPTTRSGFSAQVATQATAKTRTSQFGVGSFQT----PSSFSSMSLPGAPTASP
600 610 620 630 640 650
620 630 640 650 660
pF1KSD SGNAYSSLANRTPGFA-ESGQSSGQFQGRPSE---VWSQWQSQ--HHGQQSGEQHSHQ--
.. :: ::.:: .:: :.::..:::: : .: :: :::.: :: ..:.::: .:
XP_016 GAAAYPSLTNRGSNFAPETGQTAGQFQTRTAEGVGVWPQWQGQQPHHRSSSSEQHVQQPP
660 670 680 690 700 710
670 680 690 700
pF1KSD --QPSQTEVFQDMLPMPGDPTQGTGNYNIEDFADLGMFPPFSE
::.: ::::.:: : :: .. .:: :.: :: :::::::
XP_016 AQQPGQPEVFQEMLSMLGDQSN---SYNNEEFPDLTMFPPFSE
720 730 740 750
>>XP_016856785 (OMIM: 126110) PREDICTED: aryl hydrocarbo (737 aa)
initn: 2525 init1: 2228 opt: 2784 Z-score: 1747.0 bits: 333.8 E(85289): 1.4e-90
Smith-Waterman score: 2979; 63.0% identity (82.0% similar) in 740 aa overlap (1-706:10-737)
10 20 30 40 50
pF1KSD MASDIPGSVTLPVAPMAATGQVRMAGAMPARGGKRRSGMDFDDEDGEGPSK
:.::.: :. .: . .. .::. :. ::: :.:::: :::: ::
XP_016 MAATTANPEMTSDVP-SLGPAIASGNSGPGIQGGGAIVQRAIKRRPGLDFDD-DGEGNSK
10 20 30 40 50
60 70 80 90
pF1KSD F---------------SRENHSEIERRKRNKMTQYITELSDMVPTCSALARKPDKLTILR
: .::::::::::.::::: ::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FLRCDDDQMSNDKERFARENHSEIERRRRNKMTAYITELSDMVPTCSALARKPDKLTILR
60 70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KSD MAVSHMKSMRGTGNKSTDGAYKPSFLTEQELKHLILEAADGFLFVVAAETGRVIYVSDSV
::::::::.::::: ::::.:::::::.::::::::::::::::.:. :::::.::::::
XP_016 MAVSHMKSLRGTGNTSTDGSYKPSFLTDQELKHLILEAADGFLFIVSCETGRVVYVSDSV
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KSD TPVLNQPQSEWFGSTLYEQVHPDDVEKLREQLCTSENSMTGRILDLKTGTVKKEGQQSSM
:::::::::::::::::.:::::::.:::::: ::::..:::::::::::::::::::::
XP_016 TPVLNQPQSEWFGSTLYDQVHPDDVDKLREQLSTSENALTGRILDLKTGTVKKEGQQSSM
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KSD RMCMGSRRSFICRMRCGNAPLDHLPLNRITTMRKRFRNGLGPVKEGEAQYAVVHCTGYIK
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XP_016 RMCMGSRRSFICRMRCGSSSVDPVSVNRLSFVRNRCRNGLGSVKDGEPHFVVVHCTGYIK
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KSD AWPPAGMTIPEEDADVGQGSKYCLVAIGRLQVTSSPVCMDMNGMSVPTEFLSRHNSDGII
::::::...:..: ..:::::.:::::::::::::: : ::... ::::.:::: .::.
XP_016 AWPPAGVSLPDDDPEAGQGSKFCLVAIGRLQVTSSPNCTDMSNVCQPTEFISRHNIEGIF
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KSD TFVDPRCISVIGYQPQDLLGKDILEFCHPEDQSHLRESFQQVVKLKGQVLSVMYRFRTKN
:::: ::....:::::.::::.:.::::::::. ::.::::::::::::::::.:::.::
XP_016 TFVDHRCVATVGYQPQELLGKNIVEFCHPEDQQLLRDSFQQVVKLKGQVLSVMFRFRSKN
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KSD REWMLIRTSSFTFQNPYSDEIEYIICTNTNVKQLQQQQAELE-VHQRDGLSSYDLSQVPV
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XP_016 QEWLWMRTSSFTFQNPYSDEIEYIICTNTNVKQ-QQQQTELDMVPGRDGLASYNHSQVVQ
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490 500 510
pF1KSD PNLPAGVHEAGKSVEKADAIFSQERDPRFAEMFAGISASEKKMMSSASAAGTQQIYSQGS
: .: : .: .::.:..:.:.:::::.:.. .:.:...: .::... .:::..:::.
XP_016 PVTTTG-PEHSKPLEKSDGLFAQDRDPRFSEIYHNINADQSKGISSSTVPATQQLFSQGN
480 490 500 510 520 530
520 530 540 550 560 570
pF1KSD PFP-SGHSGKAFSSSVVHVPGVNDIQSSSSTGQNMSQISRQLNQSQVA---WTGS-RPPF
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XP_016 TFPPTPRPAENFRNSGL-APPVTIVQPSASAGQMLAQISRHSNPTQGATPTWTPTTRSGF
540 550 560 570 580 590
580 590 600 610 620
pF1KSD PGQQIPSQSS-KTQSSPFGIGTSHTYPADPSSYSPLSSPA--TSSPSGNAYSSLANRTPG
.::. .:.. ::..: ::.:. .: :::.: .: :. :.::.. :: ::.:: .
XP_016 SAQQVATQATAKTRTSQFGVGSFQT----PSSFSSMSLPGAPTASPGAAAYPSLTNRGSN
600 610 620 630 640 650
630 640 650 660 670
pF1KSD FA-ESGQSSGQFQGRPSE---VWSQWQSQ--HHGQQSGEQHSHQ----QPSQTEVFQDML
:: :.::..:::: : .: :: :::.: :: ..:.::: .: ::.: ::::.::
XP_016 FAPETGQTAGQFQTRTAEGVGVWPQWQGQQPHHRSSSSEQHVQQPPAQQPGQPEVFQEML
660 670 680 690 700 710
680 690 700
pF1KSD PMPGDPTQGTGNYNIEDFADLGMFPPFSE
: :: .. .:: :.: :: :::::::
XP_016 SMLGDQSN---SYNNEEFPDLTMFPPFSE
720 730
>>XP_016856781 (OMIM: 126110) PREDICTED: aryl hydrocarbo (743 aa)
initn: 2515 init1: 2218 opt: 2777 Z-score: 1742.6 bits: 333.0 E(85289): 2.5e-90
Smith-Waterman score: 2949; 61.7% identity (80.4% similar) in 755 aa overlap (1-706:1-743)
10 20 30 40 50
pF1KSD MASDIPGSVTLPVAPMAATGQVRMAGAMPARGGKRRSGMDFDDEDGEGPSKF--------
:.::.: :. .: . .. .::. :. ::: :.:::: :::: :::
XP_016 MTSDVP-SLGPAIASGNSGPGIQGGGAIVQRAIKRRPGLDFDD-DGEGNSKFLRCDDDQM
10 20 30 40 50
60 70 80 90
pF1KSD ----------------------SRENHSEIERRKRNKMTQYITELSDMVPTCSALARKPD
.::::::::::.::::: ::::::::::::::::::::
XP_016 SNDKERFARSDDEQSSADKERLARENHSEIERRRRNKMTAYITELSDMVPTCSALARKPD
60 70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KSD KLTILRMAVSHMKSMRGTGNKSTDGAYKPSFLTEQELKHLILEAADGFLFVVAAETGRVI
::::::::::::::.::::: ::::.:::::::.::::::::::::::::.:. :::::.
XP_016 KLTILRMAVSHMKSLRGTGNTSTDGSYKPSFLTDQELKHLILEAADGFLFIVSCETGRVV
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KSD YVSDSVTPVLNQPQSEWFGSTLYEQVHPDDVEKLREQLCTSENSMTGRILDLKTGTVKKE
:::::::::::::::::::::::.:::::::.:::::: ::::..:::::::::::::::
XP_016 YVSDSVTPVLNQPQSEWFGSTLYDQVHPDDVDKLREQLSTSENALTGRILDLKTGTVKKE
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KSD GQQSSMRMCMGSRRSFICRMRCGNAPLDHLPLNRITTMRKRFRNGLGPVKEGEAQYAVVH
:::::::::::::::::::::::.. .: . .::.. .:.: ::::: ::.:: ...:::
XP_016 GQQSSMRMCMGSRRSFICRMRCGSSSVDPVSVNRLSFVRNRCRNGLGSVKDGEPHFVVVH
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KSD CTGYIKAWPPAGMTIPEEDADVGQGSKYCLVAIGRLQVTSSPVCMDMNGMSVPTEFLSRH
::::::::::::...:..: ..:::::.:::::::::::::: : ::... ::::.:::
XP_016 CTGYIKAWPPAGVSLPDDDPEAGQGSKFCLVAIGRLQVTSSPNCTDMSNVCQPTEFISRH
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KSD NSDGIITFVDPRCISVIGYQPQDLLGKDILEFCHPEDQSHLRESFQQVVKLKGQVLSVMY
: .::.:::: ::....:::::.::::.:.::::::::. ::.::::::::::::::::.
XP_016 NIEGIFTFVDHRCVATVGYQPQELLGKNIVEFCHPEDQQLLRDSFQQVVKLKGQVLSVMF
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440
pF1KSD RFRTKNREWMLIRTSSFTFQNPYSDEIEYIICTNTNVKQLQQQQAELE-VHQRDGLSSYD
:::.::.::. .::::::::::::::::::::::::::: ::::.::. : ::::.::.
XP_016 RFRSKNQEWLWMRTSSFTFQNPYSDEIEYIICTNTNVKQ-QQQQTELDMVPGRDGLASYN
420 430 440 450 460 470
450 460 470 480 490 500
pF1KSD LSQVPVPNLPAGVHEAGKSVEKADAIFSQERDPRFAEMFAGISASEKKMMSSASAAGTQQ
::: : .: : .: .::.:..:.:.:::::.:.. .:.:...: .::... .:::
XP_016 HSQVVQPVTTTG-PEHSKPLEKSDGLFAQDRDPRFSEIYHNINADQSKGISSSTVPATQQ
480 490 500 510 520 530
510 520 530 540 550 560
pF1KSD IYSQGSPFP-SGHSGKAFSSSVVHVPGVNDIQSSSSTGQNMSQISRQLNQSQVA---WTG
..:::. :: . . .. : .: . .: :. .: :.:.:: ..::::. : .: : ::
XP_016 LFSQGNTFPPTPRPAENFRNSGL-APPVTIVQPSASAGQMLAQISRHSNPTQGATPTWTP
540 550 560 570 580 590
570 580 590 600 610 620
pF1KSD S-RPPFPGQQIPSQSS-KTQSSPFGIGTSHTYPADPSSYSPLSSPA--TSSPSGNAYSSL
. : : .::. .:.. ::..: ::.:. .: :::.: .: :. :.::.. :: ::
XP_016 TTRSGFSAQQVATQATAKTRTSQFGVGSFQT----PSSFSSMSLPGAPTASPGAAAYPSL
600 610 620 630 640 650
630 640 650 660 670
pF1KSD ANRTPGFA-ESGQSSGQFQGRPSE---VWSQWQSQ--HHGQQSGEQHSHQ----QPSQTE
.:: .:: :.::..:::: : .: :: :::.: :: ..:.::: .: ::.: :
XP_016 TNRGSNFAPETGQTAGQFQTRTAEGVGVWPQWQGQQPHHRSSSSEQHVQQPPAQQPGQPE
660 670 680 690 700 710
680 690 700
pF1KSD VFQDMLPMPGDPTQGTGNYNIEDFADLGMFPPFSE
:::.:: : :: .. .:: :.: :: :::::::
XP_016 VFQEMLSMLGDQSN---SYNNEEFPDLTMFPPFSE
720 730 740
>>XP_005245214 (OMIM: 126110) PREDICTED: aryl hydrocarbo (752 aa)
initn: 2515 init1: 2218 opt: 2777 Z-score: 1742.5 bits: 333.0 E(85289): 2.6e-90
Smith-Waterman score: 2949; 61.7% identity (80.4% similar) in 755 aa overlap (1-706:10-752)
10 20 30 40 50
pF1KSD MASDIPGSVTLPVAPMAATGQVRMAGAMPARGGKRRSGMDFDDEDGEGPSK
:.::.: :. .: . .. .::. :. ::: :.:::: :::: ::
XP_005 MAATTANPEMTSDVP-SLGPAIASGNSGPGIQGGGAIVQRAIKRRPGLDFDD-DGEGNSK
10 20 30 40 50
60 70 80
pF1KSD F------------------------------SRENHSEIERRKRNKMTQYITELSDMVPT
: .::::::::::.::::: :::::::::::
XP_005 FLRCDDDQMSNDKERFARSDDEQSSADKERLARENHSEIERRRRNKMTAYITELSDMVPT
60 70 80 90 100 110
90 100 110 120 130 140
pF1KSD CSALARKPDKLTILRMAVSHMKSMRGTGNKSTDGAYKPSFLTEQELKHLILEAADGFLFV
:::::::::::::::::::::::.::::: ::::.:::::::.::::::::::::::::.
XP_005 CSALARKPDKLTILRMAVSHMKSLRGTGNTSTDGSYKPSFLTDQELKHLILEAADGFLFI
120 130 140 150 160 170
150 160 170 180 190 200
pF1KSD VAAETGRVIYVSDSVTPVLNQPQSEWFGSTLYEQVHPDDVEKLREQLCTSENSMTGRILD
:. :::::.:::::::::::::::::::::::.:::::::.:::::: ::::..::::::
XP_005 VSCETGRVVYVSDSVTPVLNQPQSEWFGSTLYDQVHPDDVDKLREQLSTSENALTGRILD
180 190 200 210 220 230
210 220 230 240 250 260
pF1KSD LKTGTVKKEGQQSSMRMCMGSRRSFICRMRCGNAPLDHLPLNRITTMRKRFRNGLGPVKE
::::::::::::::::::::::::::::::::.. .: . .::.. .:.: ::::: ::.
XP_005 LKTGTVKKEGQQSSMRMCMGSRRSFICRMRCGSSSVDPVSVNRLSFVRNRCRNGLGSVKD
240 250 260 270 280 290
270 280 290 300 310 320
pF1KSD GEAQYAVVHCTGYIKAWPPAGMTIPEEDADVGQGSKYCLVAIGRLQVTSSPVCMDMNGMS
:: ...:::::::::::::::...:..: ..:::::.:::::::::::::: : ::...
XP_005 GEPHFVVVHCTGYIKAWPPAGVSLPDDDPEAGQGSKFCLVAIGRLQVTSSPNCTDMSNVC
300 310 320 330 340 350
330 340 350 360 370 380
pF1KSD VPTEFLSRHNSDGIITFVDPRCISVIGYQPQDLLGKDILEFCHPEDQSHLRESFQQVVKL
::::.:::: .::.:::: ::....:::::.::::.:.::::::::. ::.::::::::
XP_005 QPTEFISRHNIEGIFTFVDHRCVATVGYQPQELLGKNIVEFCHPEDQQLLRDSFQQVVKL
360 370 380 390 400 410
390 400 410 420 430 440
pF1KSD KGQVLSVMYRFRTKNREWMLIRTSSFTFQNPYSDEIEYIICTNTNVKQLQQQQAELE-VH
::::::::.:::.::.::. .::::::::::::::::::::::::::: ::::.::. :
XP_005 KGQVLSVMFRFRSKNQEWLWMRTSSFTFQNPYSDEIEYIICTNTNVKQ-QQQQTELDMVP
420 430 440 450 460 470
450 460 470 480 490 500
pF1KSD QRDGLSSYDLSQVPVPNLPAGVHEAGKSVEKADAIFSQERDPRFAEMFAGISASEKKMMS
::::.::. ::: : .: : .: .::.:..:.:.:::::.:.. .:.:...: .:
XP_005 GRDGLASYNHSQVVQPVTTTG-PEHSKPLEKSDGLFAQDRDPRFSEIYHNINADQSKGIS
480 490 500 510 520 530
510 520 530 540 550
pF1KSD SASAAGTQQIYSQGSPFP-SGHSGKAFSSSVVHVPGVNDIQSSSSTGQNMSQISRQLNQS
:... .:::..:::. :: . . .. : .: . .: :. .: :.:.:: ..::::. : .
XP_005 SSTVPATQQLFSQGNTFPPTPRPAENFRNSGL-APPVTIVQPSASAGQMLAQISRHSNPT
540 550 560 570 580 590
560 570 580 590 600 610
pF1KSD QVA---WTGS-RPPFPGQQIPSQSS-KTQSSPFGIGTSHTYPADPSSYSPLSSPA--TSS
: : :: . : : .::. .:.. ::..: ::.:. .: :::.: .: :. :.:
XP_005 QGATPTWTPTTRSGFSAQQVATQATAKTRTSQFGVGSFQT----PSSFSSMSLPGAPTAS
600 610 620 630 640 650
620 630 640 650 660
pF1KSD PSGNAYSSLANRTPGFA-ESGQSSGQFQGRPSE---VWSQWQSQ--HHGQQSGEQHSHQ-
:.. :: ::.:: .:: :.::..:::: : .: :: :::.: :: ..:.::: .:
XP_005 PGAAAYPSLTNRGSNFAPETGQTAGQFQTRTAEGVGVWPQWQGQQPHHRSSSSEQHVQQP
660 670 680 690 700 710
670 680 690 700
pF1KSD ---QPSQTEVFQDMLPMPGDPTQGTGNYNIEDFADLGMFPPFSE
::.: ::::.:: : :: .. .:: :.: :: :::::::
XP_005 PAQQPGQPEVFQEMLSMLGDQSN---SYNNEEFPDLTMFPPFSE
720 730 740 750
>>XP_016856779 (OMIM: 126110) PREDICTED: aryl hydrocarbo (765 aa)
initn: 2396 init1: 2153 opt: 2156 Z-score: 1356.8 bits: 261.7 E(85289): 7.8e-69
Smith-Waterman score: 2832; 59.8% identity (78.5% similar) in 763 aa overlap (1-689:1-751)
10 20 30 40 50
pF1KSD MASDIPGSVTLPVAPMAATGQ----VRMAGAMPARGGKRRSGMDFDDEDGEGPSKF----
:.::.:. ..: :.:. .. .::. :. ::: :.:::: :::: :::
XP_016 MTSDVPS-----LGPAIASGNSGPGIQGGGAIVQRAIKRRPGLDFDD-DGEGNSKFLRCD
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100
pF1KSD -----------SRENHSEIERRKRNKMTQYITELSDMVPTCSALARKPDKLTILRMAVSH
.::::::::::.::::: :::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DDQMSNDKERFARENHSEIERRRRNKMTAYITELSDMVPTCSALARKPDKLTILRMAVSH
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KSD MKSMRGTGNKSTDGAYKPSFLTEQELKHLILEAADGFLFVVAAETGRVIYVSDSVTPVLN
:::.::::: ::::.:::::::.::::::::::::::::.:. :::::.:::::::::::
XP_016 MKSLRGTGNTSTDGSYKPSFLTDQELKHLILEAADGFLFIVSCETGRVVYVSDSVTPVLN
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KSD QPQSEWFGSTLYEQVHPDDVEKLREQLCTSENSMTGRILDLKTGTVKKEGQQSSMRMCMG
::::::::::::.:::::::.:::::: ::::..::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QPQSEWFGSTLYDQVHPDDVDKLREQLSTSENALTGRILDLKTGTVKKEGQQSSMRMCMG
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KSD SRRSFICRMRCGNAPLDHLPLNRITTMRKRFRNGLGPVKEGEAQYAVVHCTGYIKAWPPA
::::::::::::.. .: . .::.. .:.: ::::: ::.:: ...::::::::::::::
XP_016 SRRSFICRMRCGSSSVDPVSVNRLSFVRNRCRNGLGSVKDGEPHFVVVHCTGYIKAWPPA
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KSD GMTIPEEDADVGQGSKYCLVAIGRLQVTSSPVCMDMNGMSVPTEFLSRHNSDGIITFVDP
:...:..: ..:::::.:::::::::::::: : ::... ::::.:::: .::.::::
XP_016 GVSLPDDDPEAGQGSKFCLVAIGRLQVTSSPNCTDMSNVCQPTEFISRHNIEGIFTFVDH
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KSD RCISVIGYQPQDLLGKDILEFCHPEDQSHLRESFQQVVKLKGQVLSVMYRFRTKNREWML
::....:::::.::::.:.::::::::. ::.::::::::::::::::.:::.::.::.
XP_016 RCVATVGYQPQELLGKNIVEFCHPEDQQLLRDSFQQVVKLKGQVLSVMFRFRSKNQEWLW
360 370 380 390 400 410
410 420 430
pF1KSD IRTSSFTFQNPYSDEIEYIICTNTNVK-----------------QL--------------
.:::::::::::::::::::::::::: ::
XP_016 MRTSSFTFQNPYSDEIEYIICTNTNVKNSSQEPRPTLSNTIQRPQLGPTANLPLEMGSGQ
420 430 440 450 460 470
440 450 460 470 480
pF1KSD -----QQQQAELE-VHQRDGLSSYDLSQVPVPNLPAGVHEAGKSVEKADAIFSQERDPRF
::::.::. : ::::.::. ::: : .: : .: .::.:..:.:.:::::
XP_016 LAPRQQQQQTELDMVPGRDGLASYNHSQVVQPVTTTG-PEHSKPLEKSDGLFAQDRDPRF
480 490 500 510 520 530
490 500 510 520 530 540
pF1KSD AEMFAGISASEKKMMSSASAAGTQQIYSQGSPFP-SGHSGKAFSSSVVHVPGVNDIQSSS
.:.. .:.:...: .::... .:::..:::. :: . . .. : .: . .: :. .: :.
XP_016 SEIYHNINADQSKGISSSTVPATQQLFSQGNTFPPTPRPAENFRNSGL-APPVTIVQPSA
540 550 560 570 580 590
550 560 570 580 590
pF1KSD STGQNMSQISRQLNQSQVA---WTGS-RPPFPGQQIPSQSS-KTQSSPFGIGTSHTYPAD
:.:: ..::::. : .: : :: . : : .::. .:.. ::..: ::.:. .:
XP_016 SAGQMLAQISRHSNPTQGATPTWTPTTRSGFSAQQVATQATAKTRTSQFGVGSFQT----
600 610 620 630 640
600 610 620 630 640 650
pF1KSD PSSYSPLSSPA--TSSPSGNAYSSLANRTPGFA-ESGQSSGQFQGRPSE---VWSQWQSQ
:::.: .: :. :.::.. :: ::.:: .:: :.::..:::: : .: :: :::.:
XP_016 PSSFSSMSLPGAPTASPGAAAYPSLTNRGSNFAPETGQTAGQFQTRTAEGVGVWPQWQGQ
650 660 670 680 690 700
660 670 680 690 700
pF1KSD --HHGQQSGEQHSHQ----QPSQTEVFQDMLPMPGDPTQGTGNYNIEDFADLGMFPPFSE
:: ..:.::: .: ::.: ::::.:: : :: ... .:
XP_016 QPHHRSSSSEQHVQQPPAQQPGQPEVFQEMLSMLGDQSNSYNNEEFPDLTMFPPFSE
710 720 730 740 750 760
>>XP_011507847 (OMIM: 126110) PREDICTED: aryl hydrocarbo (773 aa)
initn: 2396 init1: 2153 opt: 2156 Z-score: 1356.8 bits: 261.7 E(85289): 7.8e-69
Smith-Waterman score: 2769; 61.3% identity (79.5% similar) in 721 aa overlap (39-689:46-759)
10 20 30 40 50
pF1KSD VTLPVAPMAATGQVRMAGAMPARGGKRRSGMDFDDEDGEGPSKF---------------S
.:::: :::: ::: .
XP_011 LEFKVEEPLSRGLLSGDQAGLKYLLLAFLRLDFDD-DGEGNSKFLRCDDDQMSNDKERFA
20 30 40 50 60 70
60 70 80 90 100 110
pF1KSD RENHSEIERRKRNKMTQYITELSDMVPTCSALARKPDKLTILRMAVSHMKSMRGTGNKST
::::::::::.::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::: ::
XP_011 RENHSEIERRRRNKMTAYITELSDMVPTCSALARKPDKLTILRMAVSHMKSLRGTGNTST
80 90 100 110 120 130
120 130 140 150 160 170
pF1KSD DGAYKPSFLTEQELKHLILEAADGFLFVVAAETGRVIYVSDSVTPVLNQPQSEWFGSTLY
::.:::::::.::::::::::::::::.:. :::::.:::::::::::::::::::::::
XP_011 DGSYKPSFLTDQELKHLILEAADGFLFIVSCETGRVVYVSDSVTPVLNQPQSEWFGSTLY
140 150 160 170 180 190
180 190 200 210 220 230
pF1KSD EQVHPDDVEKLREQLCTSENSMTGRILDLKTGTVKKEGQQSSMRMCMGSRRSFICRMRCG
.:::::::.:::::: ::::..::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DQVHPDDVDKLREQLSTSENALTGRILDLKTGTVKKEGQQSSMRMCMGSRRSFICRMRCG
200 210 220 230 240 250
240 250 260 270 280 290
pF1KSD NAPLDHLPLNRITTMRKRFRNGLGPVKEGEAQYAVVHCTGYIKAWPPAGMTIPEEDADVG
.. .: . .::.. .:.: ::::: ::.:: ...:::::::::::::::...:..: ..:
XP_011 SSSVDPVSVNRLSFVRNRCRNGLGSVKDGEPHFVVVHCTGYIKAWPPAGVSLPDDDPEAG
260 270 280 290 300 310
300 310 320 330 340 350
pF1KSD QGSKYCLVAIGRLQVTSSPVCMDMNGMSVPTEFLSRHNSDGIITFVDPRCISVIGYQPQD
::::.:::::::::::::: : ::... ::::.:::: .::.:::: ::....:::::.
XP_011 QGSKFCLVAIGRLQVTSSPNCTDMSNVCQPTEFISRHNIEGIFTFVDHRCVATVGYQPQE
320 330 340 350 360 370
360 370 380 390 400 410
pF1KSD LLGKDILEFCHPEDQSHLRESFQQVVKLKGQVLSVMYRFRTKNREWMLIRTSSFTFQNPY
::::.:.::::::::. ::.::::::::::::::::.:::.::.::. .:::::::::::
XP_011 LLGKNIVEFCHPEDQQLLRDSFQQVVKLKGQVLSVMFRFRSKNQEWLWMRTSSFTFQNPY
380 390 400 410 420 430
420 430
pF1KSD SDEIEYIICTNTNVK-----------------QL-------------------QQQQAEL
::::::::::::::: :: ::::.::
XP_011 SDEIEYIICTNTNVKNSSQEPRPTLSNTIQRPQLGPTANLPLEMGSGQLAPRQQQQQTEL
440 450 460 470 480 490
440 450 460 470 480 490
pF1KSD E-VHQRDGLSSYDLSQVPVPNLPAGVHEAGKSVEKADAIFSQERDPRFAEMFAGISASEK
. : ::::.::. ::: : .: : .: .::.:..:.:.:::::.:.. .:.:...
XP_011 DMVPGRDGLASYNHSQVVQPVTTTG-PEHSKPLEKSDGLFAQDRDPRFSEIYHNINADQS
500 510 520 530 540 550
500 510 520 530 540 550
pF1KSD KMMSSASAAGTQQIYSQGSPFP-SGHSGKAFSSSVVHVPGVNDIQSSSSTGQNMSQISRQ
: .::... .:::..:::. :: . . .. : .: . .: :. .: :.:.:: ..::::.
XP_011 KGISSSTVPATQQLFSQGNTFPPTPRPAENFRNSGL-APPVTIVQPSASAGQMLAQISRH
560 570 580 590 600 610
560 570 580 590 600
pF1KSD LNQSQVA---WTGS-RPPFPGQQIPSQSS-KTQSSPFGIGTSHTYPADPSSYSPLSSPA-
: .: : :: . : : .::. .:.. ::..: ::.:. .: :::.: .: :.
XP_011 SNPTQGATPTWTPTTRSGFSAQQVATQATAKTRTSQFGVGSFQT----PSSFSSMSLPGA
620 630 640 650 660
610 620 630 640 650 660
pF1KSD -TSSPSGNAYSSLANRTPGFA-ESGQSSGQFQGRPSE---VWSQWQSQ--HHGQQSGEQH
:.::.. :: ::.:: .:: :.::..:::: : .: :: :::.: :: ..:.:::
XP_011 PTASPGAAAYPSLTNRGSNFAPETGQTAGQFQTRTAEGVGVWPQWQGQQPHHRSSSSEQH
670 680 690 700 710 720
670 680 690 700
pF1KSD SHQ----QPSQTEVFQDMLPMPGDPTQGTGNYNIEDFADLGMFPPFSE
.: ::.: ::::.:: : :: ... .:
XP_011 VQQPPAQQPGQPEVFQEMLSMLGDQSNSYNNEEFPDLTMFPPFSE
730 740 750 760 770
>>NP_848514 (OMIM: 126110) aryl hydrocarbon receptor nuc (774 aa)
initn: 2396 init1: 2153 opt: 2156 Z-score: 1356.8 bits: 261.7 E(85289): 7.8e-69
Smith-Waterman score: 2832; 59.8% identity (78.5% similar) in 763 aa overlap (1-689:10-760)
10 20 30 40
pF1KSD MASDIPGSVTLPVAPMAATGQ----VRMAGAMPARGGKRRSGMDFDDEDGE
:.::.:. ..: :.:. .. .::. :. ::: :.:::: :::
NP_848 MAATTANPEMTSDVPS-----LGPAIASGNSGPGIQGGGAIVQRAIKRRPGLDFDD-DGE
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90
pF1KSD GPSKF---------------SRENHSEIERRKRNKMTQYITELSDMVPTCSALARKPDKL
: ::: .::::::::::.::::: ::::::::::::::::::::::
NP_848 GNSKFLRCDDDQMSNDKERFARENHSEIERRRRNKMTAYITELSDMVPTCSALARKPDKL
60 70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KSD TILRMAVSHMKSMRGTGNKSTDGAYKPSFLTEQELKHLILEAADGFLFVVAAETGRVIYV
::::::::::::.::::: ::::.:::::::.::::::::::::::::.:. :::::.::
NP_848 TILRMAVSHMKSLRGTGNTSTDGSYKPSFLTDQELKHLILEAADGFLFIVSCETGRVVYV
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KSD SDSVTPVLNQPQSEWFGSTLYEQVHPDDVEKLREQLCTSENSMTGRILDLKTGTVKKEGQ
:::::::::::::::::::::.:::::::.:::::: ::::..:::::::::::::::::
NP_848 SDSVTPVLNQPQSEWFGSTLYDQVHPDDVDKLREQLSTSENALTGRILDLKTGTVKKEGQ
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KSD QSSMRMCMGSRRSFICRMRCGNAPLDHLPLNRITTMRKRFRNGLGPVKEGEAQYAVVHCT
:::::::::::::::::::::.. .: . .::.. .:.: ::::: ::.:: ...:::::
NP_848 QSSMRMCMGSRRSFICRMRCGSSSVDPVSVNRLSFVRNRCRNGLGSVKDGEPHFVVVHCT
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KSD GYIKAWPPAGMTIPEEDADVGQGSKYCLVAIGRLQVTSSPVCMDMNGMSVPTEFLSRHNS
::::::::::...:..: ..:::::.:::::::::::::: : ::... ::::.::::
NP_848 GYIKAWPPAGVSLPDDDPEAGQGSKFCLVAIGRLQVTSSPNCTDMSNVCQPTEFISRHNI
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KSD DGIITFVDPRCISVIGYQPQDLLGKDILEFCHPEDQSHLRESFQQVVKLKGQVLSVMYRF
.::.:::: ::....:::::.::::.:.::::::::. ::.::::::::::::::::.::
NP_848 EGIFTFVDHRCVATVGYQPQELLGKNIVEFCHPEDQQLLRDSFQQVVKLKGQVLSVMFRF
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430
pF1KSD RTKNREWMLIRTSSFTFQNPYSDEIEYIICTNTNVK-----------------QL-----
:.::.::. .:::::::::::::::::::::::::: ::
NP_848 RSKNQEWLWMRTSSFTFQNPYSDEIEYIICTNTNVKNSSQEPRPTLSNTIQRPQLGPTAN
420 430 440 450 460 470
440 450 460 470
pF1KSD --------------QQQQAELE-VHQRDGLSSYDLSQVPVPNLPAGVHEAGKSVEKADAI
::::.::. : ::::.::. ::: : .: : .: .::.:..
NP_848 LPLEMGSGQLAPRQQQQQTELDMVPGRDGLASYNHSQVVQPVTTTG-PEHSKPLEKSDGL
480 490 500 510 520 530
480 490 500 510 520 530
pF1KSD FSQERDPRFAEMFAGISASEKKMMSSASAAGTQQIYSQGSPFP-SGHSGKAFSSSVVHVP
:.:.:::::.:.. .:.:...: .::... .:::..:::. :: . . .. : .: . .:
NP_848 FAQDRDPRFSEIYHNINADQSKGISSSTVPATQQLFSQGNTFPPTPRPAENFRNSGL-AP
540 550 560 570 580 590
540 550 560 570 580
pF1KSD GVNDIQSSSSTGQNMSQISRQLNQSQVA---WTGS-RPPFPGQQIPSQSS-KTQSSPFGI
:. .: :.:.:: ..::::. : .: : :: . : : .::. .:.. ::..: ::.
NP_848 PVTIVQPSASAGQMLAQISRHSNPTQGATPTWTPTTRSGFSAQQVATQATAKTRTSQFGV
600 610 620 630 640 650
590 600 610 620 630 640
pF1KSD GTSHTYPADPSSYSPLSSPA--TSSPSGNAYSSLANRTPGFA-ESGQSSGQFQGRPSE--
:. .: :::.: .: :. :.::.. :: ::.:: .:: :.::..:::: : .:
NP_848 GSFQT----PSSFSSMSLPGAPTASPGAAAYPSLTNRGSNFAPETGQTAGQFQTRTAEGV
660 670 680 690 700
650 660 670 680 690
pF1KSD -VWSQWQSQ--HHGQQSGEQHSHQ----QPSQTEVFQDMLPMPGDPTQGTGNYNIEDFAD
:: :::.: :: ..:.::: .: ::.: ::::.:: : :: ... .:
NP_848 GVWPQWQGQQPHHRSSSSEQHVQQPPAQQPGQPEVFQEMLSMLGDQSNSYNNEEFPDLTM
710 720 730 740 750 760
700
pF1KSD LGMFPPFSE
NP_848 FPPFSE
770
706 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 18:30:10 2016 done: Thu Nov 3 18:30:12 2016
Total Scan time: 10.510 Total Display time: 0.180
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]