Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA0290
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0290, 889 aa
1>>>pF1KSDA0290 889 - 889 aa - 889 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.1939+/-0.00113; mu= -8.2188+/- 0.068
mean_var=446.7694+/-91.084, 0's: 0 Z-trim(114.9): 17 B-trim: 0 in 0/55
Lambda= 0.060678
statistics sampled from 15414 (15429) to 15414 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.773), E-opt: 0.2 (0.474), width: 16
Scan time: 4.080
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS32955.1 FCHO1 gene_id:23149|Hs108|chr19 ( 889) 5953 536.1 1.1e-151
CCDS59365.1 FCHO1 gene_id:23149|Hs108|chr19 ( 891) 5904 531.8 2.1e-150
CCDS59366.1 FCHO1 gene_id:23149|Hs108|chr19 ( 839) 5616 506.6 7.8e-143
CCDS47230.1 FCHO2 gene_id:115548|Hs108|chr5 ( 810) 1450 141.9 4.6e-33
CCDS76171.1 SGIP1 gene_id:84251|Hs108|chr1 ( 631) 1307 129.3 2.2e-29
CCDS30744.1 SGIP1 gene_id:84251|Hs108|chr1 ( 828) 1059 107.7 9.4e-23
CCDS54868.1 FCHO2 gene_id:115548|Hs108|chr5 ( 777) 840 88.5 5.3e-17
>>CCDS32955.1 FCHO1 gene_id:23149|Hs108|chr19 (889 aa)
initn: 5953 init1: 5953 opt: 5953 Z-score: 2836.9 bits: 536.1 E(32554): 1.1e-151
Smith-Waterman score: 5953; 100.0% identity (100.0% similar) in 889 aa overlap (1-889:1-889)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MSYFGEHFWGEKNHGFEVLYHSVKQGPISTKELADFIRERATIEETYSKAMAKLSKLASN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MSYFGEHFWGEKNHGFEVLYHSVKQGPISTKELADFIRERATIEETYSKAMAKLSKLASN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD GTPMGTFAPLWEVFRVSSDKLALCHLELTRKLQDLIKDVLRYGEEQLKTHKKCKEEVVST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GTPMGTFAPLWEVFRVSSDKLALCHLELTRKLQDLIKDVLRYGEEQLKTHKKCKEEVVST
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD LDAVQVLSGVSQLLPKSRENYLNRCMDQERLRRESTSQKEMDKAETKTKKAAESLRRSVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LDAVQVLSGVSQLLPKSRENYLNRCMDQERLRRESTSQKEMDKAETKTKKAAESLRRSVE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD KYNSARADFEQKMLDSALRFQAMEETHLRHMKALLGSYAHSVEDTHVQIGQVHEEFKQNI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KYNSARADFEQKMLDSALRFQAMEETHLRHMKALLGSYAHSVEDTHVQIGQVHEEFKQNI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD ENVSVEMLLRKFAESKGTGREKPGPLDFEAYSAAALQEAMKRLRGAKAFRLPGLSRRERE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ENVSVEMLLRKFAESKGTGREKPGPLDFEAYSAAALQEAMKRLRGAKAFRLPGLSRRERE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD PEPPAAVDFLEPDSGTCPEVDEEGFTVRPDVTQNSTAEPSRFSSSDSDFDDEEPRKFYVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PEPPAAVDFLEPDSGTCPEVDEEGFTVRPDVTQNSTAEPSRFSSSDSDFDDEEPRKFYVH
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD IKPAPARAPACSPEAAAAQLRATAGSLILPPGPGGTMKRHSSRDAAGKPQRPRSAPRTSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 IKPAPARAPACSPEAAAAQLRATAGSLILPPGPGGTMKRHSSRDAAGKPQRPRSAPRTSS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD CAERLQSEEQVSKNLFGPPLESAFDHEDFTGSSSLGFTSSPSPFSSSSPENVEDSGLDSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 CAERLQSEEQVSKNLFGPPLESAFDHEDFTGSSSLGFTSSPSPFSSSSPENVEDSGLDSP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD SHAAPGPSPDSWVPRPGTPQSPPSCRAPPPEARGIRAPPLPDSPQPLASSPGPWGLEALA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SHAAPGPSPDSWVPRPGTPQSPPSCRAPPPEARGIRAPPLPDSPQPLASSPGPWGLEALA
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD GGDLMPAPADPTAREGLAAPPRRLRSRKVSCPLTRSNGDLSRSLSPSPLGSSAASTALER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GGDLMPAPADPTAREGLAAPPRRLRSRKVSCPLTRSNGDLSRSLSPSPLGSSAASTALER
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD PSFLSQTGHGVSRGPSPVVLGSQDALPIATAFTEYVHAYFRGHSPSCLARVTGELTMTFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PSFLSQTGHGVSRGPSPVVLGSQDALPIATAFTEYVHAYFRGHSPSCLARVTGELTMTFP
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD AGIVRVFSGTPPPPVLSFRLVHTTAIEHFQPNADLLFSDPSQSDPETKDFWLNMAALTEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 AGIVRVFSGTPPPPVLSFRLVHTTAIEHFQPNADLLFSDPSQSDPETKDFWLNMAALTEA
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD LQRQAEQNPTASYYNVVLLRYQFSRPGPQSVPLQLSAHWQCGATLTQVSVEYGYRPGATA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LQRQAEQNPTASYYNVVLLRYQFSRPGPQSVPLQLSAHWQCGATLTQVSVEYGYRPGATA
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD VPTPLTNVQILLPVGEPVTNVRLQPAATWNLEEKRLTWRLPDVSEAGGSGRLSASWEPLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VPTPLTNVQILLPVGEPVTNVRLQPAATWNLEEKRLTWRLPDVSEAGGSGRLSASWEPLS
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880
pF1KSD GPSTPSPVAAQFTSEGTTLSGVDLELVGSGYRMSLVKRRFATGMYLVSC
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GPSTPSPVAAQFTSEGTTLSGVDLELVGSGYRMSLVKRRFATGMYLVSC
850 860 870 880
>>CCDS59365.1 FCHO1 gene_id:23149|Hs108|chr19 (891 aa)
initn: 5902 init1: 5902 opt: 5904 Z-score: 2813.7 bits: 531.8 E(32554): 2.1e-150
Smith-Waterman score: 5904; 99.3% identity (99.6% similar) in 889 aa overlap (1-889:1-889)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MSYFGEHFWGEKNHGFEVLYHSVKQGPISTKELADFIRERATIEETYSKAMAKLSKLASN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 MSYFGEHFWGEKNHGFEVLYHSVKQGPISTKELADFIRERATIEETYSKAMAKLSKLASN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD GTPMGTFAPLWEVFRVSSDKLALCHLELTRKLQDLIKDVLRYGEEQLKTHKKCKEEVVST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 GTPMGTFAPLWEVFRVSSDKLALCHLELTRKLQDLIKDVLRYGEEQLKTHKKCKEEVVST
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD LDAVQVLSGVSQLLPKSRENYLNRCMDQERLRRESTSQKEMDKAETKTKKAAESLRRSVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 LDAVQVLSGVSQLLPKSRENYLNRCMDQERLRRESTSQKEMDKAETKTKKAAESLRRSVE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD KYNSARADFEQKMLDSALRFQAMEETHLRHMKALLGSYAHSVEDTHVQIGQVHEEFKQNI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 KYNSARADFEQKMLDSALRFQAMEETHLRHMKALLGSYAHSVEDTHVQIGQVHEEFKQNI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD ENVSVEMLLRKFAESKGTGREKPGPLDFEAYSAAALQEAMKRLRGAKAFRLPGLSRRERE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 ENVSVEMLLRKFAESKGTGREKPGPLDFEAYSAAALQEAMKRLRGAKAFRLPGLSRRERE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD PEPPAAVDFLEPDSGTCPEVDEEGFTVRPDVTQNSTAEPSRFSSSDSDFDDEEPRKFYVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 PEPPAAVDFLEPDSGTCPEVDEEGFTVRPDVTQNSTAEPSRFSSSDSDFDDEEPRKFYVH
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD IKPAPARAPACSPEAAAAQLRATAGSLILPPGPGGTMKRHSSRDAAGKPQRPRSAPRTSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 IKPAPARAPACSPEAAAAQLRATAGSLILPPGPGGTMKRHSSRDAAGKPQRPRSAPRTSS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD CAERLQSEEQVSKNLFGPPLESAFDHEDFTGSSSLGFTSSPSPFSSSSPENVEDSGLDSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 CAERLQSEEQVSKNLFGPPLESAFDHEDFTGSSSLGFTSSPSPFSSSSPENVEDSGLDSP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD SHAAPGPSPDSWVPRPGTPQSPPSCRAPPPEARGIRAPPLPDSPQPLASSPGPWGLEALA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 SHAAPGPSPDSWVPRPGTPQSPPSCRAPPPEARGIRAPPLPDSPQPLASSPGPWGLEALA
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD GGDLMPAPADPTAREGLAAPPRRLRSRKVSCPLTRSNGDLSRSLSPSPLGSSAASTALER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 GGDLMPAPADPTAREGLAAPPRRLRSRKVSCPLTRSNGDLSRSLSPSPLGSSAASTALER
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD PSFLSQTGHGVSRGPSPVVLGSQDALPIATAFTEYVHAYFRGHSPSCLARVTGELTMTFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 PSFLSQTGHGVSRGPSPVVLGSQDALPIATAFTEYVHAYFRGHSPSCLARVTGELTMTFP
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD AGIVRVFSGTPPPPVLSFRLVHTTAIEHFQPNADLLFSDPSQSDPETKDFWLNMAALTEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 AGIVRVFSGTPPPPVLSFRLVHTTAIEHFQPNADLLFSDPSQSDPETKDFWLNMAALTEA
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD LQRQAEQNPTASYYNVVLLRYQFSRPGPQSVPLQLSAHWQCGATLTQVSVEYGYRPGATA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 LQRQAEQNPTASYYNVVLLRYQFSRPGPQSVPLQLSAHWQCGATLTQVSVEYGYRPGATA
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD VPTPLTNVQILLPVGEPVTNVRLQPAATWNLEEKRLTWRLPDVSEAGGSGRLSASWEPLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 VPTPLTNVQILLPVGEPVTNVRLQPAATWNLEEKRLTWRLPDVSEAGGSGRLSASWEPLS
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880
pF1KSD GPSTPSPVAAQFTSEGTTLSGVDLELVGSGYRMSLVKRRFATGMYLVSC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::. .:
CCDS59 GPSTPSPVAAQFTSEGTTLSGVDLELVGSGYRMSLVKRRFATAAPPQGCTW
850 860 870 880 890
>>CCDS59366.1 FCHO1 gene_id:23149|Hs108|chr19 (839 aa)
initn: 5616 init1: 5616 opt: 5616 Z-score: 2677.8 bits: 506.6 E(32554): 7.8e-143
Smith-Waterman score: 5616; 100.0% identity (100.0% similar) in 839 aa overlap (51-889:1-839)
30 40 50 60 70 80
pF1KSD HSVKQGPISTKELADFIRERATIEETYSKAMAKLSKLASNGTPMGTFAPLWEVFRVSSDK
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 MAKLSKLASNGTPMGTFAPLWEVFRVSSDK
10 20 30
90 100 110 120 130 140
pF1KSD LALCHLELTRKLQDLIKDVLRYGEEQLKTHKKCKEEVVSTLDAVQVLSGVSQLLPKSREN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 LALCHLELTRKLQDLIKDVLRYGEEQLKTHKKCKEEVVSTLDAVQVLSGVSQLLPKSREN
40 50 60 70 80 90
150 160 170 180 190 200
pF1KSD YLNRCMDQERLRRESTSQKEMDKAETKTKKAAESLRRSVEKYNSARADFEQKMLDSALRF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 YLNRCMDQERLRRESTSQKEMDKAETKTKKAAESLRRSVEKYNSARADFEQKMLDSALRF
100 110 120 130 140 150
210 220 230 240 250 260
pF1KSD QAMEETHLRHMKALLGSYAHSVEDTHVQIGQVHEEFKQNIENVSVEMLLRKFAESKGTGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 QAMEETHLRHMKALLGSYAHSVEDTHVQIGQVHEEFKQNIENVSVEMLLRKFAESKGTGR
160 170 180 190 200 210
270 280 290 300 310 320
pF1KSD EKPGPLDFEAYSAAALQEAMKRLRGAKAFRLPGLSRREREPEPPAAVDFLEPDSGTCPEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 EKPGPLDFEAYSAAALQEAMKRLRGAKAFRLPGLSRREREPEPPAAVDFLEPDSGTCPEV
220 230 240 250 260 270
330 340 350 360 370 380
pF1KSD DEEGFTVRPDVTQNSTAEPSRFSSSDSDFDDEEPRKFYVHIKPAPARAPACSPEAAAAQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 DEEGFTVRPDVTQNSTAEPSRFSSSDSDFDDEEPRKFYVHIKPAPARAPACSPEAAAAQL
280 290 300 310 320 330
390 400 410 420 430 440
pF1KSD RATAGSLILPPGPGGTMKRHSSRDAAGKPQRPRSAPRTSSCAERLQSEEQVSKNLFGPPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 RATAGSLILPPGPGGTMKRHSSRDAAGKPQRPRSAPRTSSCAERLQSEEQVSKNLFGPPL
340 350 360 370 380 390
450 460 470 480 490 500
pF1KSD ESAFDHEDFTGSSSLGFTSSPSPFSSSSPENVEDSGLDSPSHAAPGPSPDSWVPRPGTPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 ESAFDHEDFTGSSSLGFTSSPSPFSSSSPENVEDSGLDSPSHAAPGPSPDSWVPRPGTPQ
400 410 420 430 440 450
510 520 530 540 550 560
pF1KSD SPPSCRAPPPEARGIRAPPLPDSPQPLASSPGPWGLEALAGGDLMPAPADPTAREGLAAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 SPPSCRAPPPEARGIRAPPLPDSPQPLASSPGPWGLEALAGGDLMPAPADPTAREGLAAP
460 470 480 490 500 510
570 580 590 600 610 620
pF1KSD PRRLRSRKVSCPLTRSNGDLSRSLSPSPLGSSAASTALERPSFLSQTGHGVSRGPSPVVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 PRRLRSRKVSCPLTRSNGDLSRSLSPSPLGSSAASTALERPSFLSQTGHGVSRGPSPVVL
520 530 540 550 560 570
630 640 650 660 670 680
pF1KSD GSQDALPIATAFTEYVHAYFRGHSPSCLARVTGELTMTFPAGIVRVFSGTPPPPVLSFRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 GSQDALPIATAFTEYVHAYFRGHSPSCLARVTGELTMTFPAGIVRVFSGTPPPPVLSFRL
580 590 600 610 620 630
690 700 710 720 730 740
pF1KSD VHTTAIEHFQPNADLLFSDPSQSDPETKDFWLNMAALTEALQRQAEQNPTASYYNVVLLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 VHTTAIEHFQPNADLLFSDPSQSDPETKDFWLNMAALTEALQRQAEQNPTASYYNVVLLR
640 650 660 670 680 690
750 760 770 780 790 800
pF1KSD YQFSRPGPQSVPLQLSAHWQCGATLTQVSVEYGYRPGATAVPTPLTNVQILLPVGEPVTN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 YQFSRPGPQSVPLQLSAHWQCGATLTQVSVEYGYRPGATAVPTPLTNVQILLPVGEPVTN
700 710 720 730 740 750
810 820 830 840 850 860
pF1KSD VRLQPAATWNLEEKRLTWRLPDVSEAGGSGRLSASWEPLSGPSTPSPVAAQFTSEGTTLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 VRLQPAATWNLEEKRLTWRLPDVSEAGGSGRLSASWEPLSGPSTPSPVAAQFTSEGTTLS
760 770 780 790 800 810
870 880
pF1KSD GVDLELVGSGYRMSLVKRRFATGMYLVSC
:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 GVDLELVGSGYRMSLVKRRFATGMYLVSC
820 830
>>CCDS47230.1 FCHO2 gene_id:115548|Hs108|chr5 (810 aa)
initn: 2418 init1: 1123 opt: 1450 Z-score: 707.1 bits: 141.9 E(32554): 4.6e-33
Smith-Waterman score: 2474; 45.5% identity (72.3% similar) in 895 aa overlap (1-889:3-810)
10 20 30 40 50
pF1KSD MSYFGEHFWGEKNHGFEVLYHSVKQGPISTKELADFIRERATIEETYSKAMAKLSKLA
:.:: :.:::::: ::.::::..:.: :::::::::.::::::::.::..:.::.: :
CCDS47 MVMAYFVENFWGEKNSGFDVLYHNMKHGQISTKELADFVRERATIEEAYSRSMTKLAKSA
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KSD SNGTPMGTFAPLWEVFRVSSDKLALCHLELTRKLQDLIKDVLRYGEEQLKTHKKCKEEVV
:: . .:::::.:.::..:..::: :::.:.::::.:::.: .:::::.:.::: ::::.
CCDS47 SNYSQLGTFAPVWDVFKTSTEKLANCHLDLVRKLQELIKEVQKYGEEQVKSHKKTKEEVA
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KSD STLDAVQVLSGVSQLLPKSRENYLNRCMDQERLRRESTSQKEMDKAETKTKKAAESLRRS
.::.:::......: : ::.::: .:..::::..:...:.:..:: .:.:::... .
CCDS47 GTLEAVQTIQSITQALQKSKENYNAKCVEQERLKKEGATQREIEKAAVKSKKATDTYKLY
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KSD VEKYNSARADFEQKMLDSALRFQAMEETHLRHMKALLGSYAHSVEDTHVQIGQVHEEFKQ
:::: :.::::::: ..: .:: .::::: :.: ..:: ...... :.::::::::: .
CCDS47 VEKYALAKADFEQKMTETAQKFQDIEETHLIHIKEIIGSLSNAIKEIHLQIGQVHEEFIN
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KSD NIENVSVEMLLRKFAESKGTGREKPGPLDFEAYSAAALQEAMKRLRGAKAFRLPGLSRRE
:. :..:: :..:::::::::.:.:: ..:: ..:. :..: : :.: :::. ..:
CCDS47 NMANTTVESLIQKFAESKGTGKERPGLIEFEECDTASAVEGIKP-RKRKTFALPGIIKKE
250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KSD REPEPPAAVDFLEPDSGTCPEVDEEGFTVRPDVTQNSTAEPSRFSSSDSDFDDEEPRKFY
.. : .:. . :: . :.:::::....:...::.: : .:::::: .::::.:.
CCDS47 KDAE---SVECPDADSLNIPDVDEEGYSIKPETNQNDTKENHFYSSSDSDSEDEEPKKYR
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KSD VHIKPAPARAPACSPEAAAA--QLRATAGSLILPPGPGGTMKRHSSRDAAGKPQRPRSAP
..::: : : .. :. .:... :.. : :. ..::: : .
CCDS47 IEIKPMH---PNNSHHTMASLDELKVSIGNITLSPA----ISRHS----------PVQMN
360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KSD RTSSCAERLQSEEQVSKNLFGPPLESAFDHEDFTGSSSLGFTSSPSPFSSSSPENVEDSG
:. :..:: .... .:: :. :.:.: . .:. . : .. .:.
CCDS47 RN------LSNEELTKSKPSAPPNEK--------GTSDL---LAWDPLFGPSLDSSSSSS
400 410 420 430 440
480 490 500 510 520 530
pF1KSD LDSPSHAAPGPSPDSWVPRPGTPQSPPSCRAPPPEARGIRAPPLPDSPQPLASSPGPWGL
: : : : :: :: : . : :: : : :.:.
CCDS47 LTSSSSA-----------RPTTPLSVGT----------IVPPPRPASRPKLTSGK-----
450 460 470
540 550 560 570 580 590
pF1KSD EALAGGDLMPAPADPTAREGLAAPPRRLRSRKVSCPLTRSNGDLSRSLSPSPLGSSAAST
:.: . .: : .: . . . :: . ::.:.. : : ..:::. .
CCDS47 --LSGINEIPRPFSPPVTSNTSPPP--------AAPLARAE-------SSSSISSSASLS
480 490 500 510
600 610 620 630 640 650
pF1KSD ALERPSFLSQTGHGVSRGPSPVVLGSQDALPIATAFTEYVHAYFRGHSPS-CLARVTGEL
: . :. ::::::::: ::.::.::.:.:.:: :.:::.: .:. :....::..
CCDS47 AANTPTV------GVSRGPSPVSLGNQDTLPVAVALTESVNAYFKGADPTKCIVKITGDM
520 530 540 550 560 570
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pF1KSD TMTFPAGIVRVFSGTPPPPVLSFRLVHTTAIEHFQPNADLLFSDPSQSDPETKDFWLNMA
::.::.::..::...: : :: ::. . . .:.. :::.:.:::::: : .:::::.::
CCDS47 TMSFPSGIIKVFTSNPTPAVLCFRVKNISRLEQILPNAQLVFSDPSQCDSNTKDFWMNMQ
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pF1KSD ALTEALQRQAEQNPTASYYNVVLLRYQFSRPGPQSVPLQLSAHWQCGATLTQVSVEYGYR
:.: :.. .::::.:::::: .:.:: : : ::.::.:...:.:.:. :.. :.: :
CCDS47 AVTVYLKKLSEQNPAASYYNVDVLKYQVSSNGIQSTPLNLATYWKCSASTTDLRVDYKYN
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pF1KSD PGATAVPTPLTNVQILLPVGEPVTNVRLQPAATWNLEEKRLTWRLPDVSEA---GGSGRL
: : ..:. :.:.:...:: :::.. : : :: :. . :.: ..:: :::: :
CCDS47 PEAMVAPSVLSNIQVVVPVDGGVTNMQSLPPAIWNAEQMKAFWKLSSISEKSENGGSGSL
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:... ::: :. .:.:: :::.::::::.::::.:::.::.:.::::: ::..:
CCDS47 RAKFDLSEGPSKPTTLAVQFLSEGSTLSGVDFELVGTGYRLSLIKKRFATGRYLADC
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:::...::. .:: .:::.:. ..: .:: ..::: .. . :.. .:.
CCDS76 EEGYSIRPE-EPGSTKGKHFYSSSESEEEEESHKKFNIKIKPLQSK-DILKNAATVDELK
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pF1KSD ATAGSLILPPGPGGTMKRHSSRDAAGKPQRPRSAPRTSSCAERLQSEEQVSKNLFGPPLE
:. :.. : :.: :..::. : . ...:. ::.: ... .. . :::::::
CCDS76 ASIGNIALSPSPVGAIKRNLSSEEVARPR--RSTPTPELISKKPPDDTTALAPLFGPPLE
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::::.. .. . ..: ..:..: : ...::. . : :. : :. ..:
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.:: .: . : .: : .: : :. : : : : .: :
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:: . :: : :. :. . :.:. : : ..:. . .: :. .:.
CCDS76 -PPGKPGVGDVSRPFSPPIHSSSPPPIAPLARAESTSSISSTNSLSAATTPTVVSEDDVF
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: : ::::::...:.::.::.:.:::: :.:::.: .:: :....::
CCDS76 YDKLPSFERRCETPAGSSRGPSPLTMGAQDTLPVAAAFTETVNAYFKGADPSKCIVKITG
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pF1KSD ELTMTFPAGIVRVFSGTPPPPVLSFRLVHTTAIEHFQPNADLLFSDPSQSDPETKDFWLN
:....:::::.: :...: : .:.::... . .:: :: .:: : .:.: .::.::.:
CCDS76 EMVLSFPAGITRHFANNPSPAALTFRVINFSRLEHVLPNPQLLCCDNTQNDANTKEFWVN
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pF1KSD MAALTEALQRQAEQNPTASYYNVVLLRYQFSRPGPQSVPLQLSAHWQCGATLTQVSVEYG
: : :.. .::.: :.:::: .:.:: : : ::.::.:...:.: . :.. ..:
CCDS76 MPNLMTHLKKVSEQKPQATYYNVDMLKYQVSAQGIQSTPLNLAVNWRCEPSSTDLRIDYK
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pF1KSD YRPGATAVPTPLTNVQILLPVGEPVTNVR-LQPAATWNLEEKRLTWRLPDVS---EAGGS
: : .. . :.:::.:.:. ::... . : :.:: :..:. :..::.: : ::
CCDS76 YNTDAMTTAVALNNVQFLVPIDGGVTKLQAVLPPAVWNAEQQRILWKIPDISQKSENGGV
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pF1KSD GRLSASWEPLSGPSTPSPVAAQFTSEGTTLSGVDLELVGSGYRMSLVKRRFATGMYLVSC
: : : .. ::: :::...::::::.:::: :.::::.:::.::.:.:::.: ::
CCDS76 GSLLARFQLSEGPSKPSPLVVQFTSEGSTLSGCDIELVGAGYRFSLIKKRFAAGKYLADN
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CCDS30 VKIEKLPSINDLDSIFGPVLSPKSVAVNAEEKWVHFSDTSPEHV-TPELTPREKVVSPPA
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: . :.:: . . : : ::. .: . ... .:. :. . :
CCDS30 TPDNPADSPAPG-PLGPPGPTGPPGPPGPPRNVLSPLNLEEVQKKVAEQTFIKDDY---L
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:. . .:: .:: ..: : : . . ..::. .. :::. : . :. :
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. . :: .: : :...:: . .:. . . . . ..: .: : .: ::::
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::...:.::.::.:.:::: :.:::.: .:: :....:::....:::::.: :...: :
CCDS30 SPLTMGAQDTLPVAAAFTETVNAYFKGADPSKCIVKITGEMVLSFPAGITRHFANNPSPA
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pF1KSD VLSFRLVHTTAIEHFQPNADLLFSDPSQSDPETKDFWLNMAALTEALQRQAEQNPTASYY
.:.::... . .:: :: .:: : .:.: .::.::.:: : :.. .::.: :.::
CCDS30 ALTFRVINFSRLEHVLPNPQLLCCDNTQNDANTKEFWVNMPNLMTHLKKVSEQKPQATYY
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:: .:.:: : : ::.::.:...:.: . :.. ..: : : .. . :.:::.:.:.
CCDS30 NVDMLKYQVSAQGIQSTPLNLAVNWRCEPSSTDLRIDYKYNTDAMTTAVALNNVQFLVPI
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pF1KSD GEPVTNVR-LQPAATWNLEEKRLTWRLPDVS---EAGGSGRLSASWEPLSGPSTPSPVAA
::... . : :.:: :..:. :..::.: : :: : : : .. ::: :::...
CCDS30 DGGVTKLQAVLPPAVWNAEQQRILWKIPDISQKSENGGVGSLLARFQLSEGPSKPSPLVV
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CCDS30 QFTSEGSTLSGCDIELVGAGYRFSLIKKRFAAGKYLADN
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10 20 30 40 50
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CCDS54 MVMAYFVENFWGEKNSGFDVLYHNMKHGQISTKELADFVRERATIEEAYSRSMTKLAKSA
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pF1KSD SNGTPMGTFAPLWEVFRVSSDKLALCHLELTRKLQDLIKDVLRYGEEQLKTHKKCKEEVV
:: . .:::::.:.::..:..::: :::.:.::::.:::.: .:::::.:.::: ::::.
CCDS54 SNYSQLGTFAPVWDVFKTSTEKLANCHLDLVRKLQELIKEVQKYGEEQVKSHKKTKEEVA
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pF1KSD STLDAVQVLSGVSQLLPKSRENYLNRCMDQERLRRESTSQKEMDKAETKTKKAAESLRRS
.::.:::......: : ::.::: .:..::::..:...:.:..:: .:.:::... .
CCDS54 GTLEAVQTIQSITQALQKSKENYNAKCVEQERLKKEGATQREIEKAAVKSKKATDTYKLY
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pF1KSD VEKYNSARADFEQKMLDSALRFQAMEETHLRHMKALLGSYAHSVEDTHVQIGQVHEEFKQ
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CCDS54 VEKYALAKADFEQKMTETA---------------------------------QVHEEFIN
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pF1KSD NIENVSVEMLLRKFAESKGTGREKPGPLDFEAYSAAALQEAMKRLRGAKAFRLPGLSRRE
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CCDS54 NMANTTVESLIQKFAESKGTGKERPGLIEFEECDTASAVEGIKP-RKRKTFALPGIIKKE
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pF1KSD REPEPPAAVDFLEPDSGTCPEVDEEGFTVRPDVTQNSTAEPSRFSSSDSDFDDEEPRKFY
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CCDS54 KDAE---SVECPDADSLNIPDVDEEGYSIKPETNQNDTKENHFYSSSDSDSEDEEPKKYR
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pF1KSD VHIKPAPARAPACSPEAAAA--QLRATAGSLILPPGPGGTMKRHSSRDAAGKPQRPRSAP
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CCDS54 IEIKPMH---PNNSHHTMASLDELKVSIGNITLSPA----ISRHS----------PVQMN
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CCDS54 RN------LSNEELTKSKPSAPPNEK--------GTSDL---LAWDPLFGPSLDSSSSSS
370 380 390 400
480 490 500 510 520 530
pF1KSD LDSPSHAAPGPSPDSWVPRPGTPQSPPSCRAPPPEARGIRAPPLPDSPQPLASSPGPWGL
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CCDS54 LTSSSSA-----------RPTTPLSVGT----------IVPPPRPASRPKLTSGK-----
410 420 430 440
540 550 560 570 580 590
pF1KSD EALAGGDLMPAPADPTAREGLAAPPRRLRSRKVSCPLTRSNGDLSRSLSPSPLGSSAAST
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CCDS54 --LSGINEIPRPFSPPVTSNTSPPP--------AAPLARAE-------SSSSISSSASLS
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CCDS54 TMSFPSGIIKVFTSNPTPAVLCFRVKNISRLEQILPNAQLVFSDPSQCDSNTKDFWMNMQ
550 560 570 580 590 600
720 730 740 750 760 770
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pF1KSD PGATAVPTPLTNVQILLPVGEPVTNVRLQPAATWNLEEKRLTWRLPDVSEA---GGSGRL
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CCDS54 PEAMVAPSVLSNIQVVVPVDGGVTNMQSLPPAIWNAEQMKAFWKLSSISEKSENGGSGSL
670 680 690 700 710 720
840 850 860 870 880
pF1KSD SASWEPLSGPSTPSPVAAQFTSEGTTLSGVDLELVGSGYRMSLVKRRFATGMYLVSC
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CCDS54 RAKFDLSEGPSKPTTLAVQFLSEGSTLSGVDFELVGTGYRLSLIKKRFATGRYLADC
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889 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 01:10:15 2016 done: Thu Nov 3 01:10:16 2016
Total Scan time: 4.080 Total Display time: 0.180
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]