Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA0238
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0238, 650 aa
1>>>pF1KSDA0238 650 - 650 aa - 650 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3740+/-0.000902; mu= 18.4869+/- 0.054
mean_var=61.2666+/-12.663, 0's: 0 Z-trim(104.4): 25 B-trim: 31 in 1/47
Lambda= 0.163856
statistics sampled from 7860 (7871) to 7860 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.606), E-opt: 0.2 (0.242), width: 16
Scan time: 2.630
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS13085.1 SLC23A2 gene_id:9962|Hs108|chr20 ( 650) 4319 1030.0 0
CCDS4212.1 SLC23A1 gene_id:9963|Hs108|chr5 ( 598) 2641 633.3 2.9e-181
CCDS4213.1 SLC23A1 gene_id:9963|Hs108|chr5 ( 602) 2623 629.0 5.6e-180
CCDS46517.1 SLC23A3 gene_id:151295|Hs108|chr2 ( 618) 699 174.2 4.7e-43
CCDS46518.1 SLC23A3 gene_id:151295|Hs108|chr2 ( 610) 591 148.7 2.3e-35
CCDS42819.1 SLC23A3 gene_id:151295|Hs108|chr2 ( 493) 329 86.7 8.3e-17
>>CCDS13085.1 SLC23A2 gene_id:9962|Hs108|chr20 (650 aa)
initn: 4319 init1: 4319 opt: 4319 Z-score: 5510.9 bits: 1030.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4319; 100.0% identity (100.0% similar) in 650 aa overlap (1-650:1-650)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MMGIGKNTTSKSMEAGSSTEGKYEDEAKHPAFFTLPVVINGGATSSGEQDNEDTELMAIY
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CCDS13 MMGIGKNTTSKSMEAGSSTEGKYEDEAKHPAFFTLPVVINGGATSSGEQDNEDTELMAIY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD TTENGIAEKSSLAETLDSTGSLDPQRSDMIYTIEDVPPWYLCIFLGLQHYLTCFSGTIAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 TTENGIAEKSSLAETLDSTGSLDPQRSDMIYTIEDVPPWYLCIFLGLQHYLTCFSGTIAV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD PFLLADAMCVGYDQWATSQLIGTIFFCVGITTLLQTTFGCRLPLFQASAFAFLAPARAIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 PFLLADAMCVGYDQWATSQLIGTIFFCVGITTLLQTTFGCRLPLFQASAFAFLAPARAIL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD SLDKWKCNTTDVSVANGTAELLHTEHIWYPRIREIQGAIIMSSLIEVVIGLLGLPGALLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SLDKWKCNTTDVSVANGTAELLHTEHIWYPRIREIQGAIIMSSLIEVVIGLLGLPGALLK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD YIGPLTITPTVALIGLSGFQAAGERAGKHWGIAMLTIFLVLLFSQYARNVKFPLPIYKSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 YIGPLTITPTVALIGLSGFQAAGERAGKHWGIAMLTIFLVLLFSQYARNVKFPLPIYKSK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD KGWTAYKLQLFKMFPIILAILVSWLLCFIFTVTDVFPPDSTKYGFYARTDARQGVLLVAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 KGWTAYKLQLFKMFPIILAILVSWLLCFIFTVTDVFPPDSTKYGFYARTDARQGVLLVAP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD WFKVPYPFQWGLPTVSAAGVIGMLSAVVASIIESIGDYYACARLSCAPPPPIHAINRGIF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 WFKVPYPFQWGLPTVSAAGVIGMLSAVVASIIESIGDYYACARLSCAPPPPIHAINRGIF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD VEGLSCVLDGIFGTGNGSTSSSPNIGVLGITKVGSRRVIQCGAALMLALGMIGKFSALFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 VEGLSCVLDGIFGTGNGSTSSSPNIGVLGITKVGSRRVIQCGAALMLALGMIGKFSALFA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD SLPDPVLGALFCTLFGMITAVGLSNLQFIDLNSSRNLFVLGFSIFFGLVLPSYLRQNPLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SLPDPVLGALFCTLFGMITAVGLSNLQFIDLNSSRNLFVLGFSIFFGLVLPSYLRQNPLV
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD TGITGIDQVLNVLLTTAMFVGGCVAFILDNTIPGTPEERGIRKWKKGVGKGNKSLDGMES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 TGITGIDQVLNVLLTTAMFVGGCVAFILDNTIPGTPEERGIRKWKKGVGKGNKSLDGMES
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650
pF1KSD YNLPFGMNIIKKYRCFSYLPISPTFVGYTWKGLRKSDNSRSSDEDSQATG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 YNLPFGMNIIKKYRCFSYLPISPTFVGYTWKGLRKSDNSRSSDEDSQATG
610 620 630 640 650
>>CCDS4212.1 SLC23A1 gene_id:9963|Hs108|chr5 (598 aa)
initn: 2645 init1: 1746 opt: 2641 Z-score: 3367.6 bits: 633.3 E(32554): 2.9e-181
Smith-Waterman score: 2641; 67.4% identity (87.5% similar) in 558 aa overlap (75-629:16-572)
50 60 70 80 90 100
pF1KSD SSGEQDNEDTELMAIYTTENGIAEKSSLAETLDSTGSLDPQ-RSDMIYTIEDVPPWYLCI
: : . : . . ::.: :::::::::::
CCDS42 MRAQEDLEGRTQHETTRDPSTPLPTEPKFDMLYKIEDVPPWYLCI
10 20 30 40
110 120 130 140 150 160
pF1KSD FLGLQHYLTCFSGTIAVPFLLADAMCVGYDQWATSQLIGTIFFCVGITTLLQTTFGCRLP
.::.::::::::::::::::::.:.:::.:: .:::::::: :::::::.::: : :::
CCDS42 LLGFQHYLTCFSGTIAVPFLLAEALCVGHDQHMVSQLIGTIFTCVGITTLIQTTVGIRLP
50 60 70 80 90 100
170 180 190 200 210 220
pF1KSD LFQASAFAFLAPARAILSLDKWKCNTTDVSVANGTAELLHTEHIWYPRIREIQGAIIMSS
::::::::::.::.:::.:..::: . .: . : .: :::.:::::.::::..::
CCDS42 LFQASAFAFLVPAKAILALERWKCPPEEEIYGNWSLPL-NTSHIWHPRIREVQGAIMVSS
110 120 130 140 150 160
230 240 250 260 270 280
pF1KSD LIEVVIGLLGLPGALLKYIGPLTITPTVALIGLSGFQAAGERAGKHWGIAMLTIFLVLLF
..::::::::::::::.::::::.::::.::::: :::::.:::.::::. .:.:..::
CCDS42 VVEVVIGLLGLPGALLNYIGPLTVTPTVSLIGLSVFQAAGDRAGSHWGISACSILLIILF
170 180 190 200 210 220
290 300 310 320 330 340
pF1KSD SQYARNVKFPLPIYKSKKGWTAYKLQLFKMFPIILAILVSWLLCFIFTVTDVFPPDSTKY
::: ::. : ::.:. :: : ..:.::::::.:::.. ::::...:.:::.: : :
CCDS42 SQYLRNLTFLLPVYRWGKGLTLLRIQIFKMFPIMLAIMTVWLLCYVLTLTDVLPTDPKAY
230 240 250 260 270 280
350 360 370 380 390 400
pF1KSD GFYARTDARQGVLLVAPWFKVPYPFQWGLPTVSAAGVIGMLSAVVASIIESIGDYYACAR
:: :::::: .. .:::...::: :::::::.::.:.::.::..:.:::::::::::::
CCDS42 GFQARTDARGDIMAIAPWIRIPYPCQWGLPTVTAAAVLGMFSATLAGIIESIGDYYACAR
290 300 310 320 330 340
410 420 430 440 450 460
pF1KSD LSCAPPPPIHAINRGIFVEGLSCVLDGIFGTGNGSTSSSPNIGVLGITKVGSRRVIQCGA
:. :::::.::::::::.::. :.. :..::::::::::::::::::::::::::.: ::
CCDS42 LAGAPPPPVHAINRGIFTEGICCIIAGLLGTGNGSTSSSPNIGVLGITKVGSRRVVQYGA
350 360 370 380 390 400
470 480 490 500 510 520
pF1KSD ALMLALGMIGKFSALFASLPDPVLGALFCTLFGMITAVGLSNLQFIDLNSSRNLFVLGFS
:.::.:: ::::.:::::::::.::..::::::::::::::::::.:.::::::::::::
CCDS42 AIMLVLGTIGKFTALFASLPDPILGGMFCTLFGMITAVGLSNLQFVDMNSSRNLFVLGFS
410 420 430 440 450 460
530 540 550 560 570 580
pF1KSD IFFGLVLPSYLRQNP--LVTGITGIDQVLNVLLTTAMFVGGCVAFILDNTIPGTPEERGI
.::::.::.::..:: . ::: .::.: ::::: ::::::.:::::::.::.:::::.
CCDS42 MFFGLTLPNYLESNPGAINTGILEVDQILIVLLTTEMFVGGCLAFILDNTVPGSPEERGL
470 480 490 500 510 520
590 600 610 620 630 640
pF1KSD RKWKKGVGKGNKSLDGMESYNLPFGMNIIKKYRCFSYLPISPTFVGYTWKGLRKSDNSRS
.:: :. .. ....::..:.::.:.:. ..:.:: :.: :..
CCDS42 IQWKAGAHANSDMSSSLKSYDFPIGMGIVKRITFLKYIPICPVFKGFSSSSKDQIAIPED
530 540 550 560 570 580
650
pF1KSD SDEDSQATG
CCDS42 TPENTETASVCTKV
590
>>CCDS4213.1 SLC23A1 gene_id:9963|Hs108|chr5 (602 aa)
initn: 2568 init1: 1669 opt: 2623 Z-score: 3344.6 bits: 629.0 E(32554): 5.6e-180
Smith-Waterman score: 2623; 66.9% identity (86.8% similar) in 562 aa overlap (75-629:16-576)
50 60 70 80 90 100
pF1KSD SSGEQDNEDTELMAIYTTENGIAEKSSLAETLDSTGSLDPQ-RSDMIYTIEDVPPWYLCI
: : . : . . ::.: :::::::::::
CCDS42 MRAQEDLEGRTQHETTRDPSTPLPTEPKFDMLYKIEDVPPWYLCI
10 20 30 40
110 120 130 140 150 160
pF1KSD FLGLQHYLTCFSGTIAVPFLLADAMCVGYDQWATSQLIGTIFFCVGITTLLQTTFGCRLP
.::.::::::::::::::::::.:.:::.:: .:::::::: :::::::.::: : :::
CCDS42 LLGFQHYLTCFSGTIAVPFLLAEALCVGHDQHMVSQLIGTIFTCVGITTLIQTTVGIRLP
50 60 70 80 90 100
170 180 190 200 210
pF1KSD LFQASAFAFLAPARAILSLDKWKCNTTDVSVANGTAELLHTEHIWYPRIREI----QGAI
::::::::::.::.:::.:..::: . .: . : .: :::.:::::. ::::
CCDS42 LFQASAFAFLVPAKAILALERWKCPPEEEIYGNWSLPL-NTSHIWHPRIREVGLHVQGAI
110 120 130 140 150 160
220 230 240 250 260 270
pF1KSD IMSSLIEVVIGLLGLPGALLKYIGPLTITPTVALIGLSGFQAAGERAGKHWGIAMLTIFL
..::..::::::::::::::.::::::.::::.::::: :::::.:::.::::. .:.:
CCDS42 MVSSVVEVVIGLLGLPGALLNYIGPLTVTPTVSLIGLSVFQAAGDRAGSHWGISACSILL
170 180 190 200 210 220
280 290 300 310 320 330
pF1KSD VLLFSQYARNVKFPLPIYKSKKGWTAYKLQLFKMFPIILAILVSWLLCFIFTVTDVFPPD
..::::: ::. : ::.:. :: : ..:.::::::.:::.. ::::...:.:::.: :
CCDS42 IILFSQYLRNLTFLLPVYRWGKGLTLLRIQIFKMFPIMLAIMTVWLLCYVLTLTDVLPTD
230 240 250 260 270 280
340 350 360 370 380 390
pF1KSD STKYGFYARTDARQGVLLVAPWFKVPYPFQWGLPTVSAAGVIGMLSAVVASIIESIGDYY
::: :::::: .. .:::...::: :::::::.::.:.::.::..:.:::::::::
CCDS42 PKAYGFQARTDARGDIMAIAPWIRIPYPCQWGLPTVTAAAVLGMFSATLAGIIESIGDYY
290 300 310 320 330 340
400 410 420 430 440 450
pF1KSD ACARLSCAPPPPIHAINRGIFVEGLSCVLDGIFGTGNGSTSSSPNIGVLGITKVGSRRVI
:::::. :::::.::::::::.::. :.. :..::::::::::::::::::::::::::.
CCDS42 ACARLAGAPPPPVHAINRGIFTEGICCIIAGLLGTGNGSTSSSPNIGVLGITKVGSRRVV
350 360 370 380 390 400
460 470 480 490 500 510
pF1KSD QCGAALMLALGMIGKFSALFASLPDPVLGALFCTLFGMITAVGLSNLQFIDLNSSRNLFV
: :::.::.:: ::::.:::::::::.::..::::::::::::::::::.:.::::::::
CCDS42 QYGAAIMLVLGTIGKFTALFASLPDPILGGMFCTLFGMITAVGLSNLQFVDMNSSRNLFV
410 420 430 440 450 460
520 530 540 550 560 570
pF1KSD LGFSIFFGLVLPSYLRQNP--LVTGITGIDQVLNVLLTTAMFVGGCVAFILDNTIPGTPE
::::.::::.::.::..:: . ::: .::.: ::::: ::::::.:::::::.::.::
CCDS42 LGFSMFFGLTLPNYLESNPGAINTGILEVDQILIVLLTTEMFVGGCLAFILDNTVPGSPE
470 480 490 500 510 520
580 590 600 610 620 630
pF1KSD ERGIRKWKKGVGKGNKSLDGMESYNLPFGMNIIKKYRCFSYLPISPTFVGYTWKGLRKSD
:::. .:: :. .. ....::..:.::.:.:. ..:.:: :.: :..
CCDS42 ERGLIQWKAGAHANSDMSSSLKSYDFPIGMGIVKRITFLKYIPICPVFKGFSSSSKDQIA
530 540 550 560 570 580
640 650
pF1KSD NSRSSDEDSQATG
CCDS42 IPEDTPENTETASVCTKV
590 600
>>CCDS46517.1 SLC23A3 gene_id:151295|Hs108|chr2 (618 aa)
initn: 953 init1: 479 opt: 699 Z-score: 886.4 bits: 174.2 E(32554): 4.7e-43
Smith-Waterman score: 969; 30.4% identity (62.0% similar) in 589 aa overlap (62-623:16-582)
40 50 60 70 80 90
pF1KSD FFTLPVVINGGATSSGEQDNEDTELMAIYTTENGIAEKSSLAETLDSTGSLDPQRSDMIY
.....: : :: : :: ...
CCDS46 MSRSPLNPSQLRSVGSQDALAPLPPPAPQNPSTHSWDPLCGSL--
10 20 30 40
100 110 120 130 140 150
pF1KSD TIEDVPPWYLCIFLGLQHYLTCFSGTIAVPFLLADAMCVGYDQWATSQLIGTIFFCVGIT
:: : .:.::: :. : . .:: .. : ... :::... :: :..
CCDS46 ------PWGLSCLLALQHVLVMASLLCVSHLLLLCSLSPGGLSYSPSQLLASSFFSCGMS
50 60 70 80 90
160 170 180 190 200
pF1KSD TLLQTTFGCRLPLFQASAFAFLAPARAILSLDKWKCNTTDVSV---ANGTAELL------
:.::: .: :::: :: .. :: :: .. : . : . : . : :.
CCDS46 TILQTWMGSRLPLVQAPSLEFLIPALVLTSQKLPRAIQTPGNCEHRARARASLMLHLCRG
100 110 120 130 140 150
210 220 230 240 250
pF1KSD ---HTEHIWYPRIREIQGAIIMSSLIEVVIGLLGLPGALLKYIGPLTITPTVALIGLSGF
: : ..:..::...:.:.. ..:::: :: .. . :::...:.... :::.
CCDS46 PSCHGLGHWNTSLQEVSGAVVVSGLLQGMMGLLGSPGHVFPHCGPLVLAPSLVVAGLSAH
160 170 180 190 200 210
260 270 280 290 300 310
pF1KSD QAAGERAGKHWGIAMLTIFLVLLFSQYARNVKFPL-PIYKSKKGWTAYKLQLFKMFPIIL
. ... :::.:.:.:.:... ::. . .: . : ... . : : .:... ...
CCDS46 REVAQFCFTHWGLALLVILLMVVCSQHLGSCQFHVCPWRRASTSSTHTPLPVFRLLSVLI
220 230 240 250 260 270
320 330 340 350 360 370
pF1KSD AILVSWLLCFIFTVTDVFPPDSTKYGFYARTDARQGVLLVAPWFKVPYPFQWGLPTVSAA
. :.. :. .:.: . . : : : ::. .:.: .:. : ..
CCDS46 PVACVWIVS-AFVGFSVIPQELS-----APTKA--------PWIWLPHPGEWNWPLLTPR
280 290 300 310 320
380 390 400 410 420 430
pF1KSD GVIGMLSAVVASIIESIGDYYACARLSCAPPPPIHAINRGIFVEGLSCVLDGIFGTGNGS
.. . .: ..:. :.: : :.:: :::: :: .::. .:::. :: :..:. :.
CCDS46 ALAAGISMALAASTSSLGCYALCGRLLHLPPPPPHACSRGLSLEGLGSVLAGLLGSPMGT
330 340 350 360 370 380
440 450 460 470 480 490
pF1KSD TSSSPNIGVLGITKVGSRRVIQCGAALMLALGMIGKFSALFASLPDPVLGALFCTLFGMI
.:: ::.: .:. ..::..: . . : ..::. ... :....: ::.:... . ...
CCDS46 ASSFPNVGKVGLIQAGSQQVAHLVGLLCVGLGLSPRLAQLLTTIPLPVVGGVLGVTQAVV
390 400 410 420 430 440
500 510 520 530 540 550
pF1KSD TAVGLSNLQFIDLNSSRNLFVLGFSIFFGLVLPSYLRQNPLV--TGITGIDQVLNVLLTT
..:.:.. . :..:.::.:..:::::..:.:: ..:. :.. :: . .: .:. :::
CCDS46 LSAGFSSFYLADIDSGRNIFIVGFSIFMALLLPRWFREAPVLFSTGWSPLDVLLHSLLTQ
450 460 470 480 490 500
560 570 580 590 600
pF1KSD AMFVGGCVAFILDNTIPGTPEERGIRKW-------KKGVGKGNKSLDGMESYNLPFGMN-
.:..: .:.:.:::::: :::. . ... . . . : ::: ..
CCDS46 PIFLAGLSGFLLENTIPGTQLERGLGQGLPSPFTAQEARMPQKPREKAAQVYRLPFPIQN
510 520 530 540 550 560
610 620 630 640 650
pF1KSD ----IIKKYRCFSYLPISPTFVGYTWKGLRKSDNSRSSDEDSQATG
: . .:. :: .:
CCDS46 LCPCIPQPLHCLCPLPEDPGDEEGGSSEPEEMADLLPGSGEPCPESSREGFRSQK
570 580 590 600 610
>>CCDS46518.1 SLC23A3 gene_id:151295|Hs108|chr2 (610 aa)
initn: 980 init1: 479 opt: 591 Z-score: 748.5 bits: 148.7 E(32554): 2.3e-35
Smith-Waterman score: 977; 30.6% identity (63.2% similar) in 585 aa overlap (62-623:16-574)
40 50 60 70 80 90
pF1KSD FFTLPVVINGGATSSGEQDNEDTELMAIYTTENGIAEKSSLAETLDSTGSLDPQRSDMIY
.....: : :: : :: ...
CCDS46 MSRSPLNPSQLRSVGSQDALAPLPPPAPQNPSTHSWDPLCGSL--
10 20 30 40
100 110 120 130 140 150
pF1KSD TIEDVPPWYLCIFLGLQHYLTCFSGTIAVPFLLADAMCVGYDQWATSQLIGTIFFCVGIT
:: : .:.::: :. : . .:: .. : ... :::... :: :..
CCDS46 ------PWGLSCLLALQHVLVMASLLCVSHLLLLCSLSPGGLSYSPSQLLASSFFSCGMS
50 60 70 80 90
160 170 180 190 200
pF1KSD TLLQTTFGCRLPLFQASAFAFLAPARAILSLDKWKCNTTDVSVANGTAELLH-----TEH
:.::: .: :::: :: .. :: :: : : . : . ... .... .:: . :
CCDS46 TILQTWMGSRLPLVQAPSLEFLIPA---LVLTSQKLPRA-IQTPGNSSLMLHLCRGPSCH
100 110 120 130 140 150
210 220 230 240 250 260
pF1KSD I---WYPRIREIQGAIIMSSLIEVVIGLLGLPGALLKYIGPLTITPTVALIGLSGFQAAG
: ..:..::...:.:.. ..:::: :: .. . :::...:.... :::. . ..
CCDS46 GLGHWNTSLQEVSGAVVVSGLLQGMMGLLGSPGHVFPHCGPLVLAPSLVVAGLSAHREVA
160 170 180 190 200 210
270 280 290 300 310 320
pF1KSD ERAGKHWGIAMLTIFLVLLFSQYARNVKFPL-PIYKSKKGWTAYKLQLFKMFPIILAILV
. :::.:.:.:.:... ::. . .: . : ... . : : .:... ... .
CCDS46 QFCFTHWGLALLVILLMVVCSQHLGSCQFHVCPWRRASTSSTHTPLPVFRLLSVLIPVAC
220 230 240 250 260 270
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pF1KSD SWLLCFIFTVTDVFPPDSTKYGFYARTDARQGVLLVAPWFKVPYPFQWGLPTVSAAGVIG
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]