FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0224, 1227 aa
1>>>pF1KSDA0224 1227 - 1227 aa - 1227 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.3861+/-0.0012; mu= 9.1217+/- 0.072
mean_var=228.9592+/-45.450, 0's: 0 Z-trim(108.5): 109 B-trim: 6 in 1/51
Lambda= 0.084761
statistics sampled from 10156 (10257) to 10156 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.651), E-opt: 0.2 (0.315), width: 16
Scan time: 5.180
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS10907.1 DHX38 gene_id:9785|Hs108|chr16 (1227) 8205 1018.0 0
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CCDS77040.1 DHX8 gene_id:1659|Hs108|chr17 (1181) 2374 304.9 7.8e-82
CCDS4685.1 DHX16 gene_id:8449|Hs108|chr6 (1041) 2331 299.6 2.7e-80
CCDS33966.1 DHX15 gene_id:1665|Hs108|chr4 ( 795) 1856 241.4 6.9e-63
CCDS54463.1 DHX35 gene_id:60625|Hs108|chr20 ( 672) 1324 176.3 2.3e-43
CCDS13310.1 DHX35 gene_id:60625|Hs108|chr20 ( 703) 1324 176.3 2.4e-43
CCDS11072.1 DHX33 gene_id:56919|Hs108|chr17 ( 707) 1257 168.1 7.1e-41
CCDS12700.1 DHX34 gene_id:9704|Hs108|chr19 (1143) 1155 155.8 5.7e-37
CCDS7652.1 DHX32 gene_id:55760|Hs108|chr10 ( 743) 1100 148.9 4.4e-35
CCDS1949.2 DQX1 gene_id:165545|Hs108|chr2 ( 717) 1066 144.7 7.7e-34
CCDS54150.1 DHX40 gene_id:79665|Hs108|chr17 ( 702) 847 118.0 8.7e-26
CCDS11617.1 DHX40 gene_id:79665|Hs108|chr17 ( 779) 847 118.0 9.4e-26
CCDS3171.1 DHX36 gene_id:170506|Hs108|chr3 (1008) 615 89.7 3.9e-17
CCDS41444.1 DHX9 gene_id:1660|Hs108|chr1 (1270) 568 84.1 2.5e-15
CCDS1800.1 DHX57 gene_id:90957|Hs108|chr2 (1386) 543 81.1 2.2e-14
CCDS54657.1 DHX36 gene_id:170506|Hs108|chr3 ( 994) 536 80.1 3.1e-14
CCDS4113.1 YTHDC2 gene_id:64848|Hs108|chr5 (1430) 507 76.7 4.7e-13
CCDS2759.1 DHX30 gene_id:22907|Hs108|chr3 (1194) 496 75.3 1.1e-12
CCDS9261.1 DHX37 gene_id:57647|Hs108|chr12 (1157) 452 69.9 4.3e-11
>>CCDS10907.1 DHX38 gene_id:9785|Hs108|chr16 (1227 aa)
initn: 8205 init1: 8205 opt: 8205 Z-score: 5436.1 bits: 1018.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 8205; 99.9% identity (100.0% similar) in 1227 aa overlap (1-1227:1-1227)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MGDTSEDASIHRLEGTDLDCQVGGLICKSKSAASEQHVFKAPAPRPSLLGLDLLASLKRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MGDTSEDASIHRLEGTDLDCQVGGLICKSKSAASEQHVFKAPAPRPSLLGLDLLASLKRR
10 20 30 40 50 60
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pF1KSD EREEKDDGEDKKKSKVSSYKDWEESKDDQKDAEEEGGDQAGQNIRKDRHYRSARVETPSH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 EREEKDDGEDKKKSKVSSYKDWEESKDDQKDAEEEGGDQAGQNIRKDRHYRSARVETPSH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD PGGVSEEFWERSRQRERERREHGVYASSKEEKDWKKEKSRDRDYDRKRDRDERDRSRHSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 PGGVSEEFWERSRQRERERREHGVYASSKEEKDWKKEKSRDRDYDRKRDRDERDRSRHSS
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190 200 210 220 230 240
pF1KSD RSERDGGSERSSRRNEPESPRHRPKDAATPSRSTWEEEDSGYGSSRRSQWESPSPTPSYR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 RSERDGGSERSSRRNEPESPRHRPKDAATPSRSTWEEEDSGYGSSRRSQWESPSPTPSYR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD DSERSHRLSTRDRDRSVRGKYSDDTPLPTPSYKYNEWADDRRHLGSTPRLSRGRGRREEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 DSERSHRLSTRDRDRSVRGKYSDDTPLPTPSYKYNEWADDRRHLGSTPRLSRGRGRREEG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD EEGISFDTEEERQQWEDDQRQADRDWYMMDEGYDEFHNPLAYSSEDYVRRREQHLHKQKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 EEGISFDTEEERQQWEDDQRQADRDWYMMDEGYDEFHNPLAYSSEDYVRRREQHLHKQKQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD KRISAQRRQINEDNERWETNRMLTSGVVHRLEVDEDFEEDNAAKVHLMVHNLVPPFLDGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KRISAQRRQINEDNERWETNRMLTSGVVHRLEVDEDFEEDNAAKVHLMVHNLVPPFLDGR
370 380 390 400 410 420
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pF1KSD IVFTKQPEPVIPVKDATSDLAIIARKGSQTVRKHREQKERKKAQHKHWELAGTKLGDIMG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 IVFTKQPEPVIPVKDATSDLAIIARKGSQTVRKHREQKERKKAQHKHWELAGTKLGDIMG
430 440 450 460 470 480
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pF1KSD VKKEEEPDKAVTEDGKVDYRTEQKFADHMKRKSEASSEFAKKKSILEQRQYLPIFAVQQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 VKKEEEPDKAVTEDGKVDYRTEQKFADHMKRKSEASSEFAKKKSILEQRQYLPIFAVQQE
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pF1KSD LLTIIRDNSIVIVVGETGSGKTTQLTQYLHEDGYTDYGMIGCTQPRRVAAMSVAKRVSEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LLTIIRDNSIVIVVGETGSGKTTQLTQYLHEDGYTDYGMIGCTQPRRVAAMSVAKRVSEE
550 560 570 580 590 600
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pF1KSD MGGNLGEEVGYAIRFEDCTSENTLIKYMTDGILLRESLREADLDHYSAIIMDEAHERSLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MGGNLGEEVGYAIRFEDCTSENTLIKYMTDGILLRESLREADLDHYSAIIMDEAHERSLN
610 620 630 640 650 660
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pF1KSD TDVLFGLLREVVARRSDLKLIVTSATMDAEKFAAFFGNVPIFHIPGRTFPVDILFSKTPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 TDVLFGLLREVVARRSDLKLIVTSATMDAEKFAAFFGNVPIFHIPGRTFPVDILFSKTPQ
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD EDYVEAAVKQSLQVHLSGAPGDILIFMPGQEDIEVTSDQIVEHLEELENAPALAVLPIYS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 EDYVEAAVKQSLQVHLSGAPGDILIFMPGQEDIEVTSDQIVEHLEELENAPALAVLPIYS
730 740 750 760 770 780
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pF1KSD QLPSDLQAKIFQKAPDGVRKCIVATNIAETSLTVDGIMFVIDSGYCKLKVFNPRIGMDAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 QLPSDLQAKIFQKAPDGVRKCIVATNIAETSLTVDGIMFVIDSGYCKLKVFNPRIGMDAL
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD QIYPISQANANQRSGRAGRTGPGQCFRLYTQSAYKNELLTTTVPEIQRTNLANVVLLLKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 QIYPISQANANQRSGRAGRTGPGQCFRLYTQSAYKNELLTTTVPEIQRTNLANVVLLLKS
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pF1KSD LGVQDLLQFHFMDPPPEDNMLNSMYQLWILGALDNTGGLTSTGRLMVEFPLDPALSKMLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LGVQDLLQFHFMDPPPEDNMLNSMYQLWILGALDNTGGLTSTGRLMVEFPLDPALSKMLI
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pF1KSD VSCDMGCSSEILLIVSMLSVPAIFYRPKGREEESDQIREKFAVPESDHLTYLNVYLQWKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 VSCDMGCSSEILLIVSMLSVPAIFYRPKGREEESDQIREKFAVPESDHLTYLNVYLQWKN
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD NNYSTIWCNDHFIHAKAMRKVREVRAQLKDIMVQQRMSLASCGTDWDIVRKCICAAYFHQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 NNYSTIWCNDHFIHAKAMRKVREVRAQLKDIMVQQRMSLASCGTDWDIVRKCICAAYFHQ
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD AAKLKGIGEYVNIRTGMPCHLHPTSSLFGMGYTPDYIVYHELVMTTKEYMQCVTAVDGEW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 AAKLKGIGEYVNIRTGMPCHLHPTSSLFGMGYTPDYIVYHELVMTTKEYMQCVTAVDGEW
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD LAELGPMFYSVKQAGKSRQENRRRAKEEASAMEEEMALAEEQLRARRQEQEKRSPLGSVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LAELGPMFYSVKQAGKSRQENRRRAKEEASAMEEEMALAEEQLRARRQEQEKRSPLGSVR
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220
pF1KSD STKIYTPGRKEQGEPMAPRRTPARFGL
::::::::::::::::.::::::::::
CCDS10 STKIYTPGRKEQGEPMTPRRTPARFGL
1210 1220
>>CCDS11464.1 DHX8 gene_id:1659|Hs108|chr17 (1220 aa)
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Smith-Waterman score: 2617; 41.4% identity (69.5% similar) in 1084 aa overlap (133-1177:161-1210)
110 120 130 140 150 160
pF1KSD NIRKDRHYRSARVETPSHPGGVSEEFWERSRQRERERREHGVYASSKEEKDWKKEKSRDR
.::. :.:.. ..:.... .....:::
CCDS11 RTMLDEDDVKVAVDVLKELEALMPSAAGQEKQRDAEHRDR----TKKKKRSRSRDRNRDR
140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KSD DYDRKRDRDERDRSRHSSRSERDGGSERSSRRNEPESPRHRPKDAATPSRSTWEEEDSGY
: ::.:.::. . :: :::. . :. .::. .: :.: .. . . ...:. :
CCDS11 DRDRERNRDRDHKRRHRSRSR---SRSRTRERNKVKS-RYRSRSRSQSPPKDRKDRDK-Y
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270
pF1KSD GSSRRSQW-----ESPSPT-PSYRDSERSHRLSTRDRDRSVRGKYSDDTPLPTPSYKYNE
: ..: . : : :. : .. : . : . . : .
CCDS11 GERNLDRWRDKHVDRPPPEEPTIGDIYNGKVTSIMQF-----GCFVQLEGLRKRWEGLVH
250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KSD WADDRRHLGSTPRLSR--GRGRREEGEEGISFDTEEERQQWED-DQRQADRDWYMMDEGY
.. ::. : . .. ..:.: . . .:: . . .: ::. .. : .
CCDS11 ISELRRE-GRVANVADVVSKGQRVKVKV-LSFTGTKTSLSMKDVDQETGE------DLNP
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340 350 360 370 380
pF1KSD DEFHNPLAYSSEDYVRR---REQHLHKQKQKRI---SAQRRQINE--DNERWETNRMLTS
.. .: .. ..:. : : :: . .. : .:..... : :.:: ..:...
CCDS11 NRRRNLVGETNEETSMRNPDRPTHLSLVSAPEVEDDSLERKRLTRISDPEKWEIKQMIAA
350 360 370 380 390 400
390 400 410 420 430
pF1KSD GVVHRLEV---DE--------DFEEDNAAKVHLMVHNLVPPFLDGRIVFTKQPEPVIPVK
.:. . : :: : :::. ...:. .. :::: :. . . :. ::
CCDS11 NVLSKEEFPDFDEETGILPKVDDEEDEDLEIELVEEE--PPFLRGHTKQSMDMSPIKIVK
410 420 430 440 450 460
440 450 460 470 480
pF1KSD DATSDLAIIARKGSQTVRKHREQKE-RKKAQ--------HKHWELAGTKLGDIMGVKKEE
. ..:. : : ....:: :. ...:. .::: : : : .
CCDS11 NPDGSLSQAAMMQSALAKERRELKQAQREAEMDSIPMGLNKHWV---DPLPDAEGRQIAA
470 480 490 500 510 520
490 500 510 520 530 540
pF1KSD EPDKAVTEDGKVDYRTEQKFADHMKRKSEASSEFAKKKSILEQRQYLPIFAVQQELLTII
. . . .. :. . .:: . ::::::. :::. ....:. .
CCDS11 NMRGIGMMPNDIPEWKKHAFGGN-----KASYGKKTQMSILEQRESLPIYKLKEQLVQAV
530 540 550 560 570
550 560 570 580 590 600
pF1KSD RDNSIVIVVGETGSGKTTQLTQYLHEDGYTDYGMIGCTQPRRVAAMSVAKRVSEEMGGNL
.::.:.::.::::::::::.:::: : :::. : :::::::::::::::::::::.: :
CCDS11 HDNQILIVIGETGSGKTTQITQYLAEAGYTSRGKIGCTQPRRVAAMSVAKRVSEEFGCCL
580 590 600 610 620 630
610 620 630 640 650 660
pF1KSD GEEVGYAIRFEDCTSENTLIKYMTDGILLRESLREADLDHYSAIIMDEAHERSLNTDVLF
:.::::.:::::::: .:.:::::::.:::: : . :: .:. :..::::::...:::::
CCDS11 GQEVGYTIRFEDCTSPETVIKYMTDGMLLRECLIDPDLTQYAIIMLDEAHERTIHTDVLF
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670 680 690 700 710 720
pF1KSD GLLREVVARRSDLKLIVTSATMDAEKFAAFFGNVPIFHIPGRTFPVDILFSKTPQEDYVE
:::...: .:.:.::::::::.:: ::. .: ..::: :::::.::.::..: :. ::..
CCDS11 GLLKKTVQKRQDMKLIVTSATLDAVKFSQYFYEAPIFTIPGRTYPVEILYTKEPETDYLD
700 710 720 730 740 750
730 740 750 760 770 780
pF1KSD AAVKQSLQVHLSGAPGDILIFMPGQEDIEVTSDQIVEHLEEL-ENAPALAVLPIYSQLPS
:.. .:.::. :::::.:. :::.:... . . :... : ..: : .::.:: :::
CCDS11 ASLITVMQIHLTEPPGDILVFLTGQEEIDTACEILYERMKSLGPDVPELIILPVYSALPS
760 770 780 790 800 810
790 800 810 820 830 840
pF1KSD DLQAKIFQKAPDGVRKCIVATNIAETSLTVDGIMFVIDSGYCKLKVFNPRIGMDALQIYP
..:..::. :: : :: ..::::::::::.:::..:.: :. : ::.: . :.: : . :
CCDS11 EMQTRIFDPAPPGSRKVVIATNIAETSLTIDGIYYVVDPGFVKQKVYNSKTGIDQLVVTP
820 830 840 850 860 870
850 860 870 880 890 900
pF1KSD ISQANANQRSGRAGRTGPGQCFRLYTQSAYKNELLTTTVPEIQRTNLANVVLLLKSLGVQ
::::.:.::.:::::::::.:.::::. ::..:.:::.::::::::::..:: ::..:..
CCDS11 ISQAQAKQRAGRAGRTGPGKCYRLYTERAYRDEMLTTNVPEIQRTNLASTVLSLKAMGIN
880 890 900 910 920 930
910 920 930 940 950 960
pF1KSD DLLQFHFMDPPPEDNMLNSMYQLWILGALDNTGGLTSTGRLMVEFPLDPALSKMLIVSCD
:::.: ::: :: ......: ::. :::::. : :: :: :.::::.: : ::::.:
CCDS11 DLLSFDFMDAPPMETLITAMEQLYTLGALDDEGLLTRLGRRMAEFPLEPMLCKMLIMSVH
940 950 960 970 980 990
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD MGCSSEILLIVSMLSVPAIFYRPKGREEESDQIREKFAVPESDHLTYLNVYLQWKNNNYS
.::: :.: ::::::: .::::: .. .:: . :: :.:::: : :: .::::..:
CCDS11 LGCSEEMLTIVSMLSVQNVFYRPKDKQALADQKKAKFHQTEGDHLTLLAVYNSWKNNKFS
1000 1010 1020 1030 1040 1050
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD TIWCNDHFIHAKAMRKVREVRAQLKDIMVQQRMSLASCGTDWDIVRKCICAAYFHQAAKL
. :: ..::.:...:.....: :. :: .......::: . :.: ::...:..:::
CCDS11 NPWCYENFIQARSLRRAQDIRKQMLGIMDRHKLDVVSCGKSTVRVQKAICSGFFRNAAKK
1060 1070 1080 1090 1100 1110
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD KGIGEYVNIRTGMPCHLHPTSSLFGMGYTPDYIVYHELVMTTKEYMQCVTAVDGEWLAEL
: .. . ..::.:.::. :...::::::.::::::. ::..: .::.:.
CCDS11 DPQEGYRTLIDQQVVYIHPSSALFN--RQPEWVVYHELVLTTKEYMREVTTIDPRWLVEF
1120 1130 1140 1150 1160 1170
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD GPMFYSVKQAGK-SRQENRRRAKEEASAMEEEMALAEEQLRARRQEQEKRSPLGSVRSTK
.: :..:.. : :.:....: . . .:: :
CCDS11 APAFFKVSDPTKLSKQKKQQRLEPLYNRYEEPNAWRISRAFRRR
1180 1190 1200 1210 1220
1210 1220
pF1KSD IYTPGRKEQGEPMAPRRTPARFGL
>>CCDS77040.1 DHX8 gene_id:1659|Hs108|chr17 (1181 aa)
initn: 2437 init1: 1248 opt: 2374 Z-score: 1582.7 bits: 304.9 E(32554): 7.8e-82
Smith-Waterman score: 2446; 40.6% identity (68.3% similar) in 1052 aa overlap (133-1145:161-1177)
110 120 130 140 150 160
pF1KSD NIRKDRHYRSARVETPSHPGGVSEEFWERSRQRERERREHGVYASSKEEKDWKKEKSRDR
.::. :.:.. ..:.... .....:::
CCDS77 RTMLDEDDVKVAVDVLKELEALMPSAAGQEKQRDAEHRDR----TKKKKRSRSRDRNRDR
140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KSD DYDRKRDRDERDRSRHSSRSERDGGSERSSRRNEPESPRHRPKDAATPSRSTWEEEDSGY
: ::.:.::. . :: :::. . :. .::. .: :.: .. . . ...:. :
CCDS77 DRDRERNRDRDHKRRHRSRSR---SRSRTRERNKVKS-RYRSRSRSQSPPKDRKDRDK-Y
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270
pF1KSD GSSRRSQW-----ESPSPT-PSYRDSERSHRLSTRDRDRSVRGKYSDDTPLPTPSYKYNE
: ..: . : : :. : .. : . : . . : .
CCDS77 GERNLDRWRDKHVDRPPPEEPTIGDIYNGKVTSIMQF-----GCFVQLEGLRKRWEGLVH
250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KSD WADDRRHLGSTPRLSR--GRGRREEGEEGISFDTEEERQQWED-DQRQADRDWYMMDEGY
.. ::. : . .. ..:.: . . .:: . . .: ::. .. : .
CCDS77 ISELRRE-GRVANVADVVSKGQRVK-VKVLSFTGTKTSLSMKDVDQETGE------DLNP
300 310 320 330 340
340 350 360 370 380
pF1KSD DEFHNPLAYSSEDYVRR---REQHLHKQKQKRI---SAQRRQINE--DNERWETNRMLTS
.. .: .. ..:. : : :: . .. : .:..... : :.:: ..:...
CCDS77 NRRRNLVGETNEETSMRNPDRPTHLSLVSAPEVEDDSLERKRLTRISDPEKWEIKQMIAA
350 360 370 380 390 400
390 400 410 420 430
pF1KSD GVVHRLEV---DE--------DFEEDNAAKVHLMVHNLVPPFLDGRIVFTKQPEPVIPVK
.:. . : :: : :::. ...:. .. :::: :. . . :. ::
CCDS77 NVLSKEEFPDFDEETGILPKVDDEEDEDLEIELVEEE--PPFLRGHTKQSMDMSPIKIVK
410 420 430 440 450 460
440 450 460 470 480
pF1KSD DATSDLAIIARKGSQTVRKHREQKE-RKKAQ--------HKHWELAGTKLGDIMGVKKEE
. ..:. : : ....:: :. ...:. .::: : : : .
CCDS77 NPDGSLSQAAMMQSALAKERRELKQAQREAEMDSIPMGLNKHWV---DPLPDAEGRQIAA
470 480 490 500 510 520
490 500 510 520 530 540
pF1KSD EPDKAVTEDGKVDYRTEQKFADHMKRKSEASSEFAKKKSILEQRQYLPIFAVQQELLTII
. . . .. :. . .:: . ::::::. :::. ....:. .
CCDS77 NMRGIGMMPNDIPEWKKHAFGGN-----KASYGKKTQMSILEQRESLPIYKLKEQLVQAV
530 540 550 560 570
550 560 570 580 590 600
pF1KSD RDNSIVIVVGETGSGKTTQLTQYLHEDGYTDYGMIGCTQPRRVAAMSVAKRVSEEMGGNL
.::.:.::.::::::::::.:::: : :::. : :::::::::::::::::::::.: :
CCDS77 HDNQILIVIGETGSGKTTQITQYLAEAGYTSRGKIGCTQPRRVAAMSVAKRVSEEFGCCL
580 590 600 610 620 630
610 620 630 640 650 660
pF1KSD GEEVGYAIRFEDCTSENTLIKYMTDGILLRESLREADLDHYSAIIMDEAHERSLNTDVLF
:.::::.:::::::: .:.:::::::.:::: : . :: .:. :..::::::...:::::
CCDS77 GQEVGYTIRFEDCTSPETVIKYMTDGMLLRECLIDPDLTQYAIIMLDEAHERTIHTDVLF
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pF1KSD GLLREVVARRSDLKLIVTSATMDAEKFAAFFGNVPIFHIPGRTFPVDILFSKTPQEDYVE
:::...: .:.:.::::::::.:: ::. .: ..::: :::::.::.::..: :. ::..
CCDS77 GLLKKTVQKRQDMKLIVTSATLDAVKFSQYFYEAPIFTIPGRTYPVEILYTKEPETDYLD
700 710 720 730 740 750
730 740 750 760 770 780
pF1KSD AAVKQSLQVHLSGAPGDILIFMPGQEDIEVTSDQIVEHLEEL-ENAPALAVLPIYSQLPS
:.. .:.::. :::::.:. :::.:... . . :... : ..: : .::.:: :::
CCDS77 ASLITVMQIHLTEPPGDILVFLTGQEEIDTACEILYERMKSLGPDVPELIILPVYSALPS
760 770 780 790 800 810
790 800 810 820 830 840
pF1KSD DLQAKIFQKAPDGVRKCIVATNIAETSLTVDGIMFVIDSGYCKLKVFNPRIGMDALQIYP
..:..::. :: : :: ..::::::::::.:::..:.: :. : ::.: . :.: : . :
CCDS77 EMQTRIFDPAPPGSRKVVIATNIAETSLTIDGIYYVVDPGFVKQKVYNSKTGIDQLVVTP
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850 860 870 880 890 900
pF1KSD ISQANANQRSGRAGRTGPGQCFRLYTQSAYKNELLTTTVPEIQRTNLANVVLLLKSLGVQ
::::.:.::.:::::::::.:.::::. ::..:.:::.::::::::::..:: ::..:..
CCDS77 ISQAQAKQRAGRAGRTGPGKCYRLYTERAYRDEMLTTNVPEIQRTNLASTVLSLKAMGIN
880 890 900 910 920 930
910 920 930 940 950 960
pF1KSD DLLQFHFMDPPPEDNMLNSMYQLWILGALDNTGGLTSTGRLMVEFPLDPALSKMLIVSCD
:::.: ::: :: ......: ::. :::::. : :: :: :.::::.: : ::::.:
CCDS77 DLLSFDFMDAPPMETLITAMEQLYTLGALDDEGLLTRLGRRMAEFPLEPMLCKMLIMSVH
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970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD MGCSSEILLIVSMLSVPAIFYRPKGREEESDQIREKFAVPESDHLTYLNVYLQWKNNNYS
.::: :.: ::::::: .::::: .. .:: . :: :.:::: : :: .::::..:
CCDS77 LGCSEEMLTIVSMLSVQNVFYRPKDKQALADQKKAKFHQTEGDHLTLLAVYNSWKNNKFS
1000 1010 1020 1030 1040 1050
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD TIWCNDHFIHAKAMRKVREVRAQLKDIMVQQRMSLASCGTDWDIVRKCICAAYFHQAAKL
. :: ..::.:...:.....: :. :: .......::: . :.: ::...:..:::
CCDS77 NPWCYENFIQARSLRRAQDIRKQMLGIMDRHKLDVVSCGKSTVRVQKAICSGFFRNAAKK
1060 1070 1080 1090 1100 1110
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD KGIGEYVNIRTGMPCHLHPTSSLFG-MGYTPDYIVYHELVMTTKEYMQCVTAVDGEWLAE
: .. . ..::.:.::. . : ... .: .. ::.. . . :
CCDS77 DPQEGYRTLIDQQVVYIHPSSALFNRQPECPKHFL--PVVAVAVSLEQCLSKFE-DLNKE
1120 1130 1140 1150 1160 1170
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD LGPMFYSVKQAGKSRQENRRRAKEEASAMEEEMALAEEQLRARRQEQEKRSPLGSVRSTK
::
CCDS77 LGLVTC
1180
>>CCDS4685.1 DHX16 gene_id:8449|Hs108|chr6 (1041 aa)
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pF1KSD EPESPRHRPKDAATPSRSTWEEEDSGYGSSRRSQWESPSPTPSYRDSERSHRLSTRDRDR
:.. :.:. : .:: : . ...:
CCDS46 EFVQRLRDTDTLDLSGPARDFALRLWNKVPRKAVVEKPA-----RAAEREAR-ALLEKNR
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pF1KSD SVR----GKYSDDTPLPTPSYKYNEWADDRRHLGSTPRLSRGRGRREEGEEGISFDTEE-
: : .. :.. . . . .. :.:: . . . . :.:.. . . ..
CCDS46 SYRLLEDSEESSEETVSRAGSSLQKKRKKRKHLRKKREEEEEEEASEKGKKKTGGSKQQT
100 110 120 130 140 150
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:. . ::. ....:. . : : : . . ..: .: : ... ... :::. .
CCDS46 EKPESEDEWERTERERLQDLEERDAFAERVRQRDKDRTRNVLERSDKKAYEEAQKRLKMA
160 170 180 190 200 210
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pF1KSD AQRRQINEDNERWETNRMLTSGVVHRLEVDEDFEEDNAAKVHLMVHNLVPPFLDGRIVFT
. :. . : .. : . .. : ::.: . : . :: : . ..
CCDS46 EEDRKAMVPELRKKSRREYLAK--REREKLEDLEAELADE----------EFLFGDVELS
220 230 240 250 260
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pF1KSD KQPEPVIPVKDATSDLAIIARK-GSQ-----TVRKHREQKERKKA---------------
.. . . : . ::: : : : : : : .. : .
CCDS46 RHERQELKYKRRVRDLAREYRAAGEQEKLEATNRYHMPKETRGQPARAVDLVEEESGAPG
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pF1KSD -QHKHWE-----LAGTKLGDIMGVKKEEEPDKAVTEDGKVDY-RTEQKFADHMKRKSEAS
....:: :. :.: ....: . . .. :. ... :. : .:. .:
CCDS46 EEQRRWEEARLGAASLKFGARDAASQEPKYQLVLEEEETIEFVRATQLQGDEEPSAPPTS
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.. .:.:: :. ::.: ..:::. : .....:. ::::::::::. ::: :.:::.
CCDS46 TQAQQKESIQAVRRSLPVFPFREELLAAIANHQVLIIEGETGSGKTTQIPQYLFEEGYTN
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pF1KSD YGM-IGCTQPRRVAAMSVAKRVSEEMGGNLGEEVGYAIRFEDCTSENTLIKYMTDGILLR
:: :.::::::::::::: ::..::: .::.::::.::::::::: :...:::::.:::
CCDS46 KGMKIACTQPRRVAAMSVAARVAREMGVKLGNEVGYSIRFEDCTSERTVLRYMTDGMLLR
450 460 470 480 490 500
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pF1KSD ESLREADLDHYSAIIMDEAHERSLNTDVLFGLLREVVARRSDLKLIVTSATMDAEKFAAF
: : : :: ::....::::::.:.::.::::...:. : .::..:.:::::. .:..:
CCDS46 EFLSEPDLASYSVVMVDEAHERTLHTDILFGLIKDVARFRPELKVLVASATMDTARFSTF
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: ..:.:.:::: :::::...:.:. ::.:: : . ::.:.. :::::.:. :::.::.
CCDS46 FDDAPVFRIPGRRFPVDIFYTKAPEADYLEACVVSVLQIHVTQPPGDILVFLTGQEEIEA
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pF1KSD TSDQIVEHLEEL-ENAPALAVLPIYSQLPSDLQAKIFQKAPDGVRKCIVATNIAETSLTV
. ... .. ..: . : :::::..::::.::.::: .: :.:: .:::::::::::.
CCDS46 ACEMLQDRCRRLGSKIRELLVLPIYANLPSDMQARIFQPTPPGARKVVVATNIAETSLTI
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pF1KSD DGIMFVIDSGYCKLKVFNPRIGMDALQIYPISQANANQRSGRAGRTGPGQCFRLYTQSAY
.::..:.: :.:: : .::: ::..: . : :.:.::::.:::::.. :.:::::: ::
CCDS46 EGIIYVLDPGFCKQKSYNPRTGMESLTVTPCSKASANQRAGRAGRVAAGKCFRLYTAWAY
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pF1KSD KNELLTTTVPEIQRTNLANVVLLLKSLGVQDLLQFHFMDPPPEDNMLNSMYQLWILGALD
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CCDS46 QHELEETTVPEIQRTSLGNVVLLLKSLGIHDLMHFDFLDPPPYETLLLALEQLYALGALN
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pF1KSD NTGGLTSTGRLMVEFPLDPALSKMLIVSCDMGCSSEILLIVSMLSVP-AIFYRPKGREEE
. : ::..:: :.:.:.:: ::::...: ..:: ::: ...:::: .:::::: . .
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pF1KSD SDQIREKFAVPESDHLTYLNVYLQWKNNNYSTIWCNDHFIHAKAMRKVREVRAQLKDIMV
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CCDS46 ADNARVNFFLPGGDHLVLLNVYTQWAESGYSSQWCYENFVQFRSMRRARDVREQLEGLLE
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pF1KSD QQRMSLASCGTDWDIVRKCICAAYFHQAAKLKGIGEYVNIRTGMPCHLHPTSSLFGMGYT
. ...:.:: :. ::: : :.::...:.: : : ... . .::.:::: .
CCDS46 RVEVGLSSCQGDYIRVRKAITAGYFYHTARLTRSG-YRTVKQQQTVFIHPNSSLFEQ--Q
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pF1KSD PDYIVYHELVMTTKEYMQCVTAVDGEWLAELGPMFYSVKQAGKSRQENRRRAKEEASAME
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CCDS46 PRWLLYHELVLTTKEFMRQVLEIESSWLLEVAPHYYKAKELEDPHAKKMPKKIGKTREEL
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pF1KSD EEMALAEEQLRARRQEQEKRSPLGSVRSTKIYTPGRKEQGEPMAPRRTPARFGL
CCDS46 G
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CCDS33 MSKRHRLDLGEDYPSGKKRAGTDGKDRDRDRDREDRSKDRDRERDRGDRERERE
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pF1KSD QHKHWELAGTKLGDIMGVKKEEEPDKAV-----TEDGKVDYRTEQKFADHMKRKSEAS--
..:. :: .. . : .. : :: :.... . :.. . : . ...:
CCDS33 KEKEKELRAST--NAMLISAGLPPLKASHSAHSTHSAHSTHSTHSAHSTHAGHAGHTSLP
60 70 80 90 100 110
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pF1KSD ---SEFA------KKKSILEQRQYLPIFAVQQELLTIIRDNSIVIVVGETGSGKTTQLTQ
. :. . .::..: ::.. .... :. .. ..:::::::::::. :
CCDS33 QCINPFTNLPHTPRYYDILKKRLQLPVWEYKDRFTDILVRHQSFVLVGETGSGKTTQIPQ
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. : . : ..:::::::::::::.::..:: ::.::::.::::::.: .:.
CCDS33 WCVEYMRSLPGPKRGVACTQPRRVAAMSVAQRVADEMDVMLGQEVGYSIRFEDCSSAKTI
180 190 200 210 220 230
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pF1KSD IKYMTDGILLRESLREADLDHYSAIIMDEAHERSLNTDVLFGLLREVVARRSDLKLIVTS
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CCDS33 LKYMTDGMLLREAMNDPLLERYGVIILDEAHERTLATDILMGVLKEVVRQRSDLKVIVMS
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pF1KSD ATMDAEKFAAFFGNVPIFHIPGRTFPVDILFSKTPQEDYVEAAVKQSLQVHLSGAP-GDI
::.:: :: .: : :.. ::::: ::.:... :..::.:::.. .:.:. ::.
CCDS33 ATLDAGKFQIYFDNCPLLTIPGRTHPVEIFYTPEPERDYLEAAIRTVIQIHMCEEEEGDL
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pF1KSD LIFMPGQEDIEVTSDQIVEHLEEL-ENAPALAVLPIYSQLPSDLQAKIFQKAP----DGV
:.:. :::.:. . .: .....: .. . ..:.:: :: . : .::. : .:.
CCDS33 LLFLTGQEEIDEACKRIKREVDDLGPEVGDIKIIPLYSTLPPQQQQRIFEPPPPKKQNGA
360 370 380 390 400 410
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pF1KSD --RKCIVATNIAETSLTVDGIMFVIDSGYCKLKVFNPRIGMDALQIYPISQANANQRSGR
:: .:.:::::::::.::..:::: :. : ::.:::: ...: . ::.:.:.::.::
CCDS33 IGRKVVVSTNIAETSLTIDGVVFVIDPGFAKQKVYNPRIRVESLLVTAISKASAQQRAGR
420 430 440 450 460 470
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pF1KSD AGRTGPGQCFRLYTQSAYKNELLTTTVPEIQRTNLANVVLLLKSLGVQDLLQFHFMDPPP
:::: ::.::::::..:::.:. .: ::: :.::..::: ::.::..::..: :::::
CCDS33 AGRTRPGKCFRLYTEKAYKTEMQDNTYPEILRSNLGSVVLQLKKLGIDDLVHFDFMDPPA
480 490 500 510 520 530
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pF1KSD EDNMLNSMYQLWILGALDNTGGLTSTGRLMVEFPLDPALSKMLIVSCDMGCSSEILLIVS
.... .. : :.::.. : :: : .:.:::::: :.::.:.:::..::.:.: :..
CCDS33 PETLMRALELLNYLAALNDDGDLTELGSMMAEFPLDPQLAKMVIASCDYNCSNEVLSITA
540 550 560 570 580 590
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pF1KSD MLSVPAIFYRPKGREEESDQIREKFAVPESDHLTYLNVYLQWKNNNYSTIWCNDHFIHAK
::::: : :: .. .:. . .:: ..:::: :::: .:.:. :. :: :.::. .
CCDS33 MLSVPQCFVRPTEAKKAADEAKMRFAHIDGDHLTLLNVYHAFKQNHESVQWCYDNFINYR
600 610 620 630 640 650
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pF1KSD AMRKVREVRAQLKDIMVQQRMSLASCGTDW---DI---VRKCICAAYFHQAAKLKGIGEY
.. .. .:: ::. :: .:..: .::. : .:: . ..:: :.:.:. :.:
CCDS33 SLMSADNVRQQLSRIM--DRFNLPRRSTDFTSRDYYINIRKALVTGYFMQVAHLERTGHY
660 670 680 690 700 710
1100 1110 1120 1130 1140 1150
pF1KSD VNIRTGMPCHLHPTSSLFGMGYTPDYIVYHELVMTTKEYMQCVTAVDGEWLAELGPMFYS
.... .. .:::.. : . :....:.:.:.:::.:.. : . :::....:..:.
CCDS33 LTVKDNQVVQLHPSTVL---DHKPEWVLYNEFVLTTKNYIRTCTDIKPEWLVKIAPQYYD
720 730 740 750 760
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pF1KSD VK---QAGKSRQENRRRAKEEASAMEEEMALAEEQLRARRQEQEKRSPLGSVRSTKIYTP
.. : .:: .: ::
CCDS33 MSNFPQCEAKRQLDRIIAKLQSKEYSQY
770 780 790
>>CCDS54463.1 DHX35 gene_id:60625|Hs108|chr20 (672 aa)
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510 520 530 540 550 560
pF1KSD QKFADHMKRKSEASSEFAKKKSILEQRQYLPIFAVQQELLTIIRDNSIVIVVGETGSGKT
: ....: .. .... ..: . .. .
CCDS54 MAAPVGPVKFWRPGTEGPGVSISEERQSLAENSGTTVVYNPYAALSI
10 20 30 40
570 580 590 600 610
pF1KSD TQLTQ------YLHEDGYTDYG-MIGCTQPRRVAAMSVAKRVSEEMGGNLGEEVGYAIRF
: : :: : :.: : ..: ::::::::..:: ::.:: :. ::.:::: :::
CCDS54 EQQRQKLPVFKYLAEAGWTAEGRVVGVTQPRRVAAVTVAGRVAEERGAVLGHEVGYCIRF
50 60 70 80 90 100
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pF1KSD EDCTSE-NTLIKYMTDGILLRESLREADLDHYSAIIMDEAHERSLNTDVLFGLLREVVAR
.:::.. : ::..:::.:.:: . . : .::.:..::::::.: ::. .:::... .
CCDS54 DDCTDQLATRIKFLTDGMLVREMMVDPLLTKYSVIMLDEAHERTLYTDIAIGLLKKIQKK
110 120 130 140 150 160
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pF1KSD RSDLKLIVTSATMDAEKFAAFFGNV----P------IFHIPGRTFPVDILFSKTPQEDYV
:.::.:::.:::.::.:: ::.. : :. . ::::::::.. ..: ::.
CCDS54 RGDLRLIVASATLDADKFRDFFNQNETSDPARDTCVILTVEGRTFPVDIFYLQSPVPDYI
170 180 190 200 210 220
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pF1KSD EAAVKQSLQVHLSGAPGDILIFMPGQEDIEVTSDQIVEHLEELENAPA---LAVLPIYSQ
...:. ...: . . ::.: :. :::..:.. ....:. . : . : :::.:.
CCDS54 KSTVETVVKIHQTEGDGDVLAFLTGQEEVETVVSMLIEQARALARTGMKRHLRVLPMYAG
230 240 250 260 270 280
790 800 810 820 830 840
pF1KSD LPSDLQAKIFQKAPDGVRKCIVATNIAETSLTVDGIMFVIDSGYCKLKVFNPRIGMDALQ
::: : :.:... .::: :::::.::::.:..::..::: :. ::...::: ... :
CCDS54 LPSFEQMKVFERVSRSVRKVIVATNVAETSITISGIVYVIDCGFVKLRAYNPRTAIECLV
290 300 310 320 330 340
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pF1KSD IYPISQANANQRSGRAGRTGPGQCFRLYTQSAYKNELLTTTVPEIQRTNLANVVLLLKSL
. :.:::.::::.::.::. :.:.::::. :. ..: .::::.::.::: :.: ::.:
CCDS54 VVPVSQASANQRAGRGGRSRSGKCYRLYTEEAF-DKLPQSTVPEMQRSNLAPVILQLKAL
350 360 370 380 390 400
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CCDS54 AARFHSTGAYRTIRDDHELHIHPASVLYAEK-PPRWVIYNEVIQTSKYYMRDVTAIESAW
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CCDS54 LLELAPHFY---QQGTHLSLKAKRAKVQDP
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CCDS13 VGETGCGKSTQIPQYLAEAGWTAEGRVVGVTQPRRVAAVTVAGRVAEERGAVLGHEVGYC
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CCDS13 DYIKSTVETVVKIHQTEGDGDVLAFLTGQEEVETVVSMLIEQARALARTGMKRHLRVLPM
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CCDS13 YAGLPSFEQMKVFERVSRSVRKVIVATNVAETSITISGIVYVIDCGFVKLRAYNPRTAIE
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CCDS13 CLVVVPVSQASANQRAGRGGRSRSGKCYRLYTEEAF-DKLPQSTVPEMQRSNLAPVILQL
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CCDS13 KALGIDNVLRFHFMSPPPAQSMVQALELLYALGGLDKDCRLTEPLGMRIAEFPLNPMFAK
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CCDS13 MLLESGNFGCSQEILSIAAMMQIQNIFVVPPNQKSHAIRVHRKFAVEEGDHLTMLNIYEA
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CCDS13 FIKHNKDSKWCQEHFLNYKGLVRAATVREQLKKLLVKFQVPRKSSEGDPDLVLRCIVSGF
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CCDS13 FANAARFHSTGAYRTIRDDHELHIHPASVLYAEK-PPRWVIYNEVIQTSKYYMRDVTAIE
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CCDS13 SAWLLELAPHFY---QQGTHLSLKAKRAKVQDP
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CCDS11 GSGKTTQIPQYLYEGGISRQGIIAVTQPRRVAAISLATRVSDEKRTELGKLVGYTVRFDD
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CCDS11 VTSEDTRIKFLTDGMLLREAISDSLLRKYSCVILDEAHERTIHTDVLFGVVKAAQKRRKE
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CCDS11 LGKLPLKVIVMSATMDVDLFSQYFNGAPVLYLEGRQHPIQVFYTKQPQNDYLHAALVSVF
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CCDS11 QIH-QEAPSSQDILVFLTGQEEIEAMSKTCRDIAKHLP--DGCPAMLVLPLYASLPYAQQ
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CCDS11 LRVFQGAPKGYRKVIISTNIAETSITITGIKYVVDTGMVKAKKYNPDSGLEVLAVQRVSK
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CCDS11 TQAWQRTGRAGREDSGICYRLYTEDEFE-KFDKMTVPEIQRCNLASVMLQLLAMKVPNVL
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CCDS11 TFDFMSKPSPDHIQAAIAQLDLLGALEHKDDQLTLTPMGRKMAAFPLEPKFAKTILMSPK
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CCDS11 FHCTEEILTIVSLLSVDSVLHNPPSRREEVQGVRKKFISSEGDHMTLLNIYRTFKNLGGN
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CCDS11 KDWCKENFVNSKNMTLVAEVRAQLRDICLKMSMPIASSRGDVESVRRCLAHSLFMSTAEL
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CCDS11 QPDGTYATTDTHQPVAIHPSSVLFHC--KPACVVYTELLYTNKCYMRDLCVIDAQWLYEA
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CCDS11 APEYFRRKLRTARN
700
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CCDS12 QVVVVAGDTGCGKSTQVPQYLLAAGFSH---VACTQPRRIACISLAKRVGFESLSQYGSQ
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CCDS12 QRLLPTRPDLKVILMSATINISLFSSYFSNAPVVQVPGRLFPITVVYQ--PQEAEPTTSK
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CCDS12 LPLHSALSVADQDKVFDVAPPGVRKCILSTNIAETSVTIDGIRFVVDSGKVKEMSYDPQA
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CCDS12 LQMKSMSVGDPRTFPFIEPPPPASLETAILYLRDQGALDSSEALTPIGSLLAQLPVDVVI
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CCDS12 GKMLILGSMFSLVEPVLTIAAALSVQSPFTRSAQSSPECAAARRPLESDQGDPFTLFNVF
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CCDS12 NAWVQVKSERSRNSRKWCRRRGIEEHRLYEMANLRRQFKELLEDHGLLAGAQAAQVGDSY
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CCDS12 SRLQQRRERRALHQLKRQHEEGAGRRRKVLRLQEEQDGGSSDEDRAGPAPPGASDGVDIQ
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CCDS76 PESLDSSDGDEEEVLACEDLELNPFDGLPYSSRYYK---LLKEREDLPIWKEKYSFMENL
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CCDS76 LQNQIVIVSGDAKCGKSAQVPQWCAEYCLSIHYQHGGVICTQVHKQTVVQLALRVADEMD
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CCDS76 VNIGHEVGYVIPFENCCTNETILRYCTDDMLQREMMSNPFLGSYGVIILDDIHERSIATD
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CCDS76 VLLGLLKDVLLARPELKLIINSSPHLISKLNSYYGNVPVIEVKNK-HPVEVVYLSEAQKD
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CCDS76 SFESILRLIFEIHHSGEKGDIVVFLACEQDIEKVCETVYQGSNLNPDLGELVVVPLY---
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CCDS76 PKE-KCSLFKPLDETEKRCQVYQRRVVLTTSSGEFLIWSNSVRFVIDVGVERRKVYNPRI
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CCDS76 RANSLVMQPISQSQAEIRKQILGSSSSGKFFCLYTEEFASKDMTPLKPAEMQEANLTSMV
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CCDS76 LFMKRIDIAGLGHCDFMNRPAPESLMQALEDLDYLAALDNDGNLSEFGIIMSEFPLDPQL
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CCDS76 SKSILASCEFDCVDEVLTIAAMVTAPNCFSHVPHGAEEAALTCWKTFLHPEGDHFTLISI
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CCDS76 YKAYQDTTLNSSSEYCVEKWCRDYFLNCSALRMADVIRAELLEIIKRIELPYAEPAFGSK
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CCDS76 ENTLNIKKALLSGYFMQIARDVDGSGNYLMLTHKQVAQLHPLSGYSITKKMPEWVLFHKF
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