Result of FASTA (omim) for pF1KSDA0193
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KSDA0193, 414 aa
  1>>>pF1KSDA0193 414 - 414 aa - 414 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6578+/-0.000386; mu= 15.3599+/- 0.024
 mean_var=76.6238+/-15.344, 0's: 0 Z-trim(113.5): 20  B-trim: 1299 in 1/53
 Lambda= 0.146518
 statistics sampled from 22831 (22851) to 22831 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.644), E-opt: 0.2 (0.268), width:  16
 Scan time:  5.790

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_055581 (OMIM: 614965) secernin-1 isoform a [Hom ( 414) 2809 603.4 3.3e-172
NP_001138985 (OMIM: 614965) secernin-1 isoform a [ ( 414) 2809 603.4 3.3e-172
NP_001138986 (OMIM: 614965) secernin-1 isoform b [ ( 434) 2809 603.4 3.4e-172
NP_001138987 (OMIM: 614965) secernin-1 isoform c [ ( 346) 2347 505.7  7e-143
NP_612364 (OMIM: 614966) secernin-2 isoform 1 [Hom ( 425) 1463 318.9 1.5e-86
XP_005257833 (OMIM: 614966) PREDICTED: secernin-2  ( 425) 1463 318.9 1.5e-86
XP_016860398 (OMIM: 614967) PREDICTED: secernin-3  ( 424) 1417 309.2 1.2e-83
XP_005246913 (OMIM: 614967) PREDICTED: secernin-3  ( 424) 1417 309.2 1.2e-83
XP_005246912 (OMIM: 614967) PREDICTED: secernin-3  ( 424) 1417 309.2 1.2e-83
XP_005246914 (OMIM: 614967) PREDICTED: secernin-3  ( 424) 1417 309.2 1.2e-83
XP_005246911 (OMIM: 614967) PREDICTED: secernin-3  ( 424) 1417 309.2 1.2e-83
XP_016860399 (OMIM: 614967) PREDICTED: secernin-3  ( 424) 1417 309.2 1.2e-83
NP_078859 (OMIM: 614967) secernin-3 isoform 1 [Hom ( 424) 1417 309.2 1.2e-83
XP_005246910 (OMIM: 614967) PREDICTED: secernin-3  ( 444) 1417 309.2 1.3e-83
NP_001138495 (OMIM: 614966) secernin-2 isoform 2 [ ( 378) 1387 302.8 9.2e-82
NP_001180457 (OMIM: 614967) secernin-3 isoform 2 [ ( 417) 1356 296.3 9.4e-80
XP_016880775 (OMIM: 614966) PREDICTED: secernin-2  ( 403) 1316 287.8 3.2e-77
XP_011510141 (OMIM: 614967) PREDICTED: secernin-3  ( 344) 1103 242.8   1e-63


>>NP_055581 (OMIM: 614965) secernin-1 isoform a [Homo sa  (414 aa)
 initn: 2809 init1: 2809 opt: 2809  Z-score: 3212.8  bits: 603.4 E(85289): 3.3e-172
Smith-Waterman score: 2809; 100.0% identity (100.0% similar) in 414 aa overlap (1-414:1-414)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MAAAPPSYCFVAFPPRAKDGLVVFGKNSARPRDEVQEVVYFSAADHEPESKVECTYISID
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 MAAAPPSYCFVAFPPRAKDGLVVFGKNSARPRDEVQEVVYFSAADHEPESKVECTYISID
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD QVPRTYAIMISRPAWLWGAEMGANEHGVCIANEAINTREPAAEIEALLGMDLVRLGLERG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 QVPRTYAIMISRPAWLWGAEMGANEHGVCIANEAINTREPAAEIEALLGMDLVRLGLERG
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD ETAKEALDVIVSLLEEHGQGGNYFEDANSCHSFQSAYLIVDRDEAWVLETIGKYWAAEKV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 ETAKEALDVIVSLLEEHGQGGNYFEDANSCHSFQSAYLIVDRDEAWVLETIGKYWAAEKV
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD TEGVRCICSQLSLTTKMDAEHPELRSYAQSQGWWTGEGEFNFSEVFSPVEDHLDCGAGKD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 TEGVRCICSQLSLTTKMDAEHPELRSYAQSQGWWTGEGEFNFSEVFSPVEDHLDCGAGKD
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD SLEKQEESITVQTMMNTLRDKASGVCIDSEFFLTTASGVSVLPQNRSSPCIHYFTGTPDP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 SLEKQEESITVQTMMNTLRDKASGVCIDSEFFLTTASGVSVLPQNRSSPCIHYFTGTPDP
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD SRSIFKPFIFVDDVKLVPKTQSPCFGDDDPAKKEPRFQEKPDRRHELYKAHEWARAIIES
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 SRSIFKPFIFVDDVKLVPKTQSPCFGDDDPAKKEPRFQEKPDRRHELYKAHEWARAIIES
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410    
pF1KSD DQEQGRKLRSTMLELEKQGLEAMEEILTSSEPLDPAEVGDLFYDCVDTEIKFFK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 DQEQGRKLRSTMLELEKQGLEAMEEILTSSEPLDPAEVGDLFYDCVDTEIKFFK
              370       380       390       400       410    

>>NP_001138985 (OMIM: 614965) secernin-1 isoform a [Homo  (414 aa)
 initn: 2809 init1: 2809 opt: 2809  Z-score: 3212.8  bits: 603.4 E(85289): 3.3e-172
Smith-Waterman score: 2809; 100.0% identity (100.0% similar) in 414 aa overlap (1-414:1-414)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MAAAPPSYCFVAFPPRAKDGLVVFGKNSARPRDEVQEVVYFSAADHEPESKVECTYISID
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MAAAPPSYCFVAFPPRAKDGLVVFGKNSARPRDEVQEVVYFSAADHEPESKVECTYISID
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD QVPRTYAIMISRPAWLWGAEMGANEHGVCIANEAINTREPAAEIEALLGMDLVRLGLERG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QVPRTYAIMISRPAWLWGAEMGANEHGVCIANEAINTREPAAEIEALLGMDLVRLGLERG
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD ETAKEALDVIVSLLEEHGQGGNYFEDANSCHSFQSAYLIVDRDEAWVLETIGKYWAAEKV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ETAKEALDVIVSLLEEHGQGGNYFEDANSCHSFQSAYLIVDRDEAWVLETIGKYWAAEKV
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD TEGVRCICSQLSLTTKMDAEHPELRSYAQSQGWWTGEGEFNFSEVFSPVEDHLDCGAGKD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TEGVRCICSQLSLTTKMDAEHPELRSYAQSQGWWTGEGEFNFSEVFSPVEDHLDCGAGKD
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD SLEKQEESITVQTMMNTLRDKASGVCIDSEFFLTTASGVSVLPQNRSSPCIHYFTGTPDP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SLEKQEESITVQTMMNTLRDKASGVCIDSEFFLTTASGVSVLPQNRSSPCIHYFTGTPDP
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD SRSIFKPFIFVDDVKLVPKTQSPCFGDDDPAKKEPRFQEKPDRRHELYKAHEWARAIIES
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SRSIFKPFIFVDDVKLVPKTQSPCFGDDDPAKKEPRFQEKPDRRHELYKAHEWARAIIES
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410    
pF1KSD DQEQGRKLRSTMLELEKQGLEAMEEILTSSEPLDPAEVGDLFYDCVDTEIKFFK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DQEQGRKLRSTMLELEKQGLEAMEEILTSSEPLDPAEVGDLFYDCVDTEIKFFK
              370       380       390       400       410    

>>NP_001138986 (OMIM: 614965) secernin-1 isoform b [Homo  (434 aa)
 initn: 2809 init1: 2809 opt: 2809  Z-score: 3212.5  bits: 603.4 E(85289): 3.4e-172
Smith-Waterman score: 2809; 100.0% identity (100.0% similar) in 414 aa overlap (1-414:21-434)

                                   10        20        30        40
pF1KSD                     MAAAPPSYCFVAFPPRAKDGLVVFGKNSARPRDEVQEVVY
                           ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MVQDGTFKTRDSTWTCESTRMAAAPPSYCFVAFPPRAKDGLVVFGKNSARPRDEVQEVVY
               10        20        30        40        50        60

               50        60        70        80        90       100
pF1KSD FSAADHEPESKVECTYISIDQVPRTYAIMISRPAWLWGAEMGANEHGVCIANEAINTREP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FSAADHEPESKVECTYISIDQVPRTYAIMISRPAWLWGAEMGANEHGVCIANEAINTREP
               70        80        90       100       110       120

              110       120       130       140       150       160
pF1KSD AAEIEALLGMDLVRLGLERGETAKEALDVIVSLLEEHGQGGNYFEDANSCHSFQSAYLIV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AAEIEALLGMDLVRLGLERGETAKEALDVIVSLLEEHGQGGNYFEDANSCHSFQSAYLIV
              130       140       150       160       170       180

              170       180       190       200       210       220
pF1KSD DRDEAWVLETIGKYWAAEKVTEGVRCICSQLSLTTKMDAEHPELRSYAQSQGWWTGEGEF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DRDEAWVLETIGKYWAAEKVTEGVRCICSQLSLTTKMDAEHPELRSYAQSQGWWTGEGEF
              190       200       210       220       230       240

              230       240       250       260       270       280
pF1KSD NFSEVFSPVEDHLDCGAGKDSLEKQEESITVQTMMNTLRDKASGVCIDSEFFLTTASGVS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NFSEVFSPVEDHLDCGAGKDSLEKQEESITVQTMMNTLRDKASGVCIDSEFFLTTASGVS
              250       260       270       280       290       300

              290       300       310       320       330       340
pF1KSD VLPQNRSSPCIHYFTGTPDPSRSIFKPFIFVDDVKLVPKTQSPCFGDDDPAKKEPRFQEK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VLPQNRSSPCIHYFTGTPDPSRSIFKPFIFVDDVKLVPKTQSPCFGDDDPAKKEPRFQEK
              310       320       330       340       350       360

              350       360       370       380       390       400
pF1KSD PDRRHELYKAHEWARAIIESDQEQGRKLRSTMLELEKQGLEAMEEILTSSEPLDPAEVGD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PDRRHELYKAHEWARAIIESDQEQGRKLRSTMLELEKQGLEAMEEILTSSEPLDPAEVGD
              370       380       390       400       410       420

              410    
pF1KSD LFYDCVDTEIKFFK
       ::::::::::::::
NP_001 LFYDCVDTEIKFFK
              430    

>>NP_001138987 (OMIM: 614965) secernin-1 isoform c [Homo  (346 aa)
 initn: 2347 init1: 2347 opt: 2347  Z-score: 2686.1  bits: 505.7 E(85289): 7e-143
Smith-Waterman score: 2347; 100.0% identity (100.0% similar) in 346 aa overlap (69-414:1-346)

       40        50        60        70        80        90        
pF1KSD VYFSAADHEPESKVECTYISIDQVPRTYAIMISRPAWLWGAEMGANEHGVCIANEAINTR
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001                               MISRPAWLWGAEMGANEHGVCIANEAINTR
                                             10        20        30

      100       110       120       130       140       150        
pF1KSD EPAAEIEALLGMDLVRLGLERGETAKEALDVIVSLLEEHGQGGNYFEDANSCHSFQSAYL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EPAAEIEALLGMDLVRLGLERGETAKEALDVIVSLLEEHGQGGNYFEDANSCHSFQSAYL
               40        50        60        70        80        90

      160       170       180       190       200       210        
pF1KSD IVDRDEAWVLETIGKYWAAEKVTEGVRCICSQLSLTTKMDAEHPELRSYAQSQGWWTGEG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IVDRDEAWVLETIGKYWAAEKVTEGVRCICSQLSLTTKMDAEHPELRSYAQSQGWWTGEG
              100       110       120       130       140       150

      220       230       240       250       260       270        
pF1KSD EFNFSEVFSPVEDHLDCGAGKDSLEKQEESITVQTMMNTLRDKASGVCIDSEFFLTTASG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EFNFSEVFSPVEDHLDCGAGKDSLEKQEESITVQTMMNTLRDKASGVCIDSEFFLTTASG
              160       170       180       190       200       210

      280       290       300       310       320       330        
pF1KSD VSVLPQNRSSPCIHYFTGTPDPSRSIFKPFIFVDDVKLVPKTQSPCFGDDDPAKKEPRFQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VSVLPQNRSSPCIHYFTGTPDPSRSIFKPFIFVDDVKLVPKTQSPCFGDDDPAKKEPRFQ
              220       230       240       250       260       270

      340       350       360       370       380       390        
pF1KSD EKPDRRHELYKAHEWARAIIESDQEQGRKLRSTMLELEKQGLEAMEEILTSSEPLDPAEV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EKPDRRHELYKAHEWARAIIESDQEQGRKLRSTMLELEKQGLEAMEEILTSSEPLDPAEV
              280       290       300       310       320       330

      400       410    
pF1KSD GDLFYDCVDTEIKFFK
       ::::::::::::::::
NP_001 GDLFYDCVDTEIKFFK
              340      

>>NP_612364 (OMIM: 614966) secernin-2 isoform 1 [Homo sa  (425 aa)
 initn: 1155 init1: 619 opt: 1463  Z-score: 1674.9  bits: 318.9 E(85289): 1.5e-86
Smith-Waterman score: 1463; 51.7% identity (78.2% similar) in 422 aa overlap (1-409:1-420)

                    10        20        30        40        50     
pF1KSD MAAAPPSY-----CFVAFPPRAKDGLVVFGKNSARPRDEVQEVVYFSAADHEPESKVECT
       ::.. :.      :::. :: .    :.:.::: ::::::::::.  :. : : :...::
NP_612 MASSSPDSPCSCDCFVSVPPASAIPAVIFAKNSDRPRDEVQEVVFVPAGTHTPGSRLQCT
               10        20        30        40        50        60

          60        70        80        90       100       110     
pF1KSD YISIDQVPRTYAIMISRPAWLWGAEMGANEHGVCIANEAINTREPAAEIEALLGMDLVRL
       :: ..:: .:.:...:::.::::::::::::::::.:::. :.::..: ::::::::.::
NP_612 YIEVEQVSKTHAVILSRPSWLWGAEMGANEHGVCIGNEAVWTKEPVGEGEALLGMDLLRL
               70        80        90       100       110       120

         120       130       140       150       160       170     
pF1KSD GLERGETAKEALDVIVSLLEEHGQGGNYFEDANSCHSFQSAYLIVDRDEAWVLETIGKYW
       .:::. .:.::: ::..:::..::::: .:::    :..:..:..:: ::::::: :. :
NP_612 ALERSSSAQEALHVITGLLEHYGQGGNCLEDAAP-FSYHSTFLLADRTEAWVLETAGRLW
              130       140       150        160       170         

         180       190       200       210       220           230 
pF1KSD AAEKVTEGVRCICSQLSLTTKMDAEHPELRSYAQSQGWWTGEGEFNFSEVFS----PVE-
       ::... ::.: : .:::. : ..:.:::::..::..::: :.: :.:...::    ::. 
NP_612 AAQRIQEGARNISNQLSIGTDISAQHPELRTHAQAKGWWDGQGAFDFAQIFSLTQQPVRM
     180       190       200       210       220       230         

                240       250       260       270       280        
pF1KSD --DHLDCGAGKDSLEKQEESITVQTMMNTLRDKASGVCIDSEFFLTTASGVSVLPQNRSS
          .    ::.. :.... .::...::. :::: ::.:.::  : :::: ::::::. ..
NP_612 EAAKARFQAGRELLRQRQGGITAEVMMGILRDKESGICMDSGGFRTTASMVSVLPQDPTQ
     240       250       260       270       280       290         

      290       300       310       320       330       340        
pF1KSD PCIHYFTGTPDPSRSIFKPFIFVDDVKLVPKTQSPCFGDDDPAKKEPRFQEKPDRRHELY
       ::.:..:.:::::::.::::::   :  .:.. :: :: .::..  :::: . :::: ::
NP_612 PCVHFLTATPDPSRSVFKPFIFGMGVAQAPQVLSPTFGAQDPVRTLPRFQTQVDRRHTLY
     300       310       320       330       340       350         

      350       360       370       380       390        400       
pF1KSD KAHEWARAIIESDQEQGRKLRSTMLELEKQGLEAMEEILTSSEPLDPA-EVGDLFYDCVD
       ..:. : ...: ::..:..:.. . .::..:::: . .: ..:   :  :.:.::   : 
NP_612 RGHQAALGLMERDQDRGQQLQQKQQDLEQEGLEATQGLL-AGEWAPPLWELGSLFQAFVK
     360       370       380       390        400       410        

       410    
pF1KSD TEIKFFK
        :     
NP_612 RESQAYA
      420     

>>XP_005257833 (OMIM: 614966) PREDICTED: secernin-2 isof  (425 aa)
 initn: 1155 init1: 619 opt: 1463  Z-score: 1674.9  bits: 318.9 E(85289): 1.5e-86
Smith-Waterman score: 1463; 51.7% identity (78.2% similar) in 422 aa overlap (1-409:1-420)

                    10        20        30        40        50     
pF1KSD MAAAPPSY-----CFVAFPPRAKDGLVVFGKNSARPRDEVQEVVYFSAADHEPESKVECT
       ::.. :.      :::. :: .    :.:.::: ::::::::::.  :. : : :...::
XP_005 MASSSPDSPCSCDCFVSVPPASAIPAVIFAKNSDRPRDEVQEVVFVPAGTHTPGSRLQCT
               10        20        30        40        50        60

          60        70        80        90       100       110     
pF1KSD YISIDQVPRTYAIMISRPAWLWGAEMGANEHGVCIANEAINTREPAAEIEALLGMDLVRL
       :: ..:: .:.:...:::.::::::::::::::::.:::. :.::..: ::::::::.::
XP_005 YIEVEQVSKTHAVILSRPSWLWGAEMGANEHGVCIGNEAVWTKEPVGEGEALLGMDLLRL
               70        80        90       100       110       120

         120       130       140       150       160       170     
pF1KSD GLERGETAKEALDVIVSLLEEHGQGGNYFEDANSCHSFQSAYLIVDRDEAWVLETIGKYW
       .:::. .:.::: ::..:::..::::: .:::    :..:..:..:: ::::::: :. :
XP_005 ALERSSSAQEALHVITGLLEHYGQGGNCLEDAAP-FSYHSTFLLADRTEAWVLETAGRLW
              130       140       150        160       170         

         180       190       200       210       220           230 
pF1KSD AAEKVTEGVRCICSQLSLTTKMDAEHPELRSYAQSQGWWTGEGEFNFSEVFS----PVE-
       ::... ::.: : .:::. : ..:.:::::..::..::: :.: :.:...::    ::. 
XP_005 AAQRIQEGARNISNQLSIGTDISAQHPELRTHAQAKGWWDGQGAFDFAQIFSLTQQPVRM
     180       190       200       210       220       230         

                240       250       260       270       280        
pF1KSD --DHLDCGAGKDSLEKQEESITVQTMMNTLRDKASGVCIDSEFFLTTASGVSVLPQNRSS
          .    ::.. :.... .::...::. :::: ::.:.::  : :::: ::::::. ..
XP_005 EAAKARFQAGRELLRQRQGGITAEVMMGILRDKESGICMDSGGFRTTASMVSVLPQDPTQ
     240       250       260       270       280       290         

      290       300       310       320       330       340        
pF1KSD PCIHYFTGTPDPSRSIFKPFIFVDDVKLVPKTQSPCFGDDDPAKKEPRFQEKPDRRHELY
       ::.:..:.:::::::.::::::   :  .:.. :: :: .::..  :::: . :::: ::
XP_005 PCVHFLTATPDPSRSVFKPFIFGMGVAQAPQVLSPTFGAQDPVRTLPRFQTQVDRRHTLY
     300       310       320       330       340       350         

      350       360       370       380       390        400       
pF1KSD KAHEWARAIIESDQEQGRKLRSTMLELEKQGLEAMEEILTSSEPLDPA-EVGDLFYDCVD
       ..:. : ...: ::..:..:.. . .::..:::: . .: ..:   :  :.:.::   : 
XP_005 RGHQAALGLMERDQDRGQQLQQKQQDLEQEGLEATQGLL-AGEWAPPLWELGSLFQAFVK
     360       370       380       390        400       410        

       410    
pF1KSD TEIKFFK
        :     
XP_005 RESQAYA
      420     

>>XP_016860398 (OMIM: 614967) PREDICTED: secernin-3 isof  (424 aa)
 initn: 1122 init1: 465 opt: 1417  Z-score: 1622.4  bits: 309.2 E(85289): 1.2e-83
Smith-Waterman score: 1417; 52.4% identity (78.2% similar) in 418 aa overlap (6-414:3-415)

                 10        20        30        40        50        
pF1KSD MAAAPPSYC--FVAFPPRAKDGLVVFGKNSARPRDEVQEVVYFSAADHEPES-KVECTYI
            :  :  :::.:: . :. ..::::: :  ::::::::: :. :.  . ...::::
XP_016    MEPFSCDTFVALPPATVDNRIIFGKNSDRLYDEVQEVVYFPAVVHDNLGERLKCTYI
                  10        20        30        40        50       

        60        70        80        90       100       110       
pF1KSD SIDQVPRTYAIMISRPAWLWGAEMGANEHGVCIANEAINTREPAAEIEALLGMDLVRLGL
        :::::.:::...::::::::::::::::::::.:::.  :: . . :::::::::::::
XP_016 EIDQVPETYAVVLSRPAWLWGAEMGANEHGVCIGNEAVWGREEVCDEEALLGMDLVRLGL
        60        70        80        90       100       110       

       120       130       140       150       160       170       
pF1KSD ERGETAKEALDVIVSLLEEHGQGGNYFEDANSCHSFQSAYLIVDRDEAWVLETIGKYWAA
       ::..::..::.:::.:::..:::::  : .    :.....::.::.:::.::: ::::::
XP_016 ERADTAEKALNVIVDLLEKYGQGGNCTE-GRMVFSYHNSFLIADRNEAWILETAGKYWAA
       120       130       140        150       160       170      

       180       190       200       210       220       230       
pF1KSD EKVTEGVRCICSQLSLTTKMDAEHPELRSYAQSQGWWTGEGEFNFSEVFSPVED-HLDCG
       ::: :::: : .:::.:::.  :::..:.::. .::: :. ::.:. ..: ..  ..  .
XP_016 EKVQEGVRNISNQLSITTKIAREHPDMRNYAKRKGWWDGKKEFDFAAAYSYLDTAKMMTS
        180       190       200       210       220       230      

        240            250       260       270       280       290 
pF1KSD AGKDS-----LEKQEESITVQTMMNTLRDKASGVCIDSEFFLTTASGVSVLPQNRSSPCI
       .:.       :.:.. .:: .:::. :::: ::. ...:: ::::: ::.:::. : :::
XP_016 SGRYCEGYKLLNKHKGNITFETMMEILRDKPSGINMEGEF-LTTASMVSILPQDSSLPCI
        240       250       260       270        280       290     

             300       310       320       330       340       350 
pF1KSD HYFTGTPDPSRSIFKPFIFVDDVKLVPKTQSPCFGDDDPAKKEPRFQEKPDRRHELYKAH
       :.::::::: ::.:::::::  .. .  :.:: :  .: .::. .:  :::::: ::. :
XP_016 HFFTGTPDPERSVFKPFIFVPHISQLLDTSSPTFELEDLVKKKSHF--KPDRRHPLYQKH
         300       310       320       330       340         350   

             360       370       380       390       400       410 
pF1KSD EWARAIIESDQEQGRKLRSTMLELEKQGLEAMEEILTSSEPLDPAEVGDLFYDCVDTEIK
       . :  ......:... . ..: .:::. .. :: :: ... ::  .. .:: .:.  ::.
XP_016 QQALEVVNNNEEKAKIMLDNMRKLEKELFREMESIL-QNKHLDVEKIVNLFPQCTKDEIQ
           360       370       380        390       400       410  

                   
pF1KSD FFK         
       ...         
XP_016 IYQSNLSVKVSS
            420    

>>XP_005246913 (OMIM: 614967) PREDICTED: secernin-3 isof  (424 aa)
 initn: 1122 init1: 465 opt: 1417  Z-score: 1622.4  bits: 309.2 E(85289): 1.2e-83
Smith-Waterman score: 1417; 52.4% identity (78.2% similar) in 418 aa overlap (6-414:3-415)

                 10        20        30        40        50        
pF1KSD MAAAPPSYC--FVAFPPRAKDGLVVFGKNSARPRDEVQEVVYFSAADHEPES-KVECTYI
            :  :  :::.:: . :. ..::::: :  ::::::::: :. :.  . ...::::
XP_005    MEPFSCDTFVALPPATVDNRIIFGKNSDRLYDEVQEVVYFPAVVHDNLGERLKCTYI
                  10        20        30        40        50       

        60        70        80        90       100       110       
pF1KSD SIDQVPRTYAIMISRPAWLWGAEMGANEHGVCIANEAINTREPAAEIEALLGMDLVRLGL
        :::::.:::...::::::::::::::::::::.:::.  :: . . :::::::::::::
XP_005 EIDQVPETYAVVLSRPAWLWGAEMGANEHGVCIGNEAVWGREEVCDEEALLGMDLVRLGL
        60        70        80        90       100       110       

       120       130       140       150       160       170       
pF1KSD ERGETAKEALDVIVSLLEEHGQGGNYFEDANSCHSFQSAYLIVDRDEAWVLETIGKYWAA
       ::..::..::.:::.:::..:::::  : .    :.....::.::.:::.::: ::::::
XP_005 ERADTAEKALNVIVDLLEKYGQGGNCTE-GRMVFSYHNSFLIADRNEAWILETAGKYWAA
       120       130       140        150       160       170      

       180       190       200       210       220       230       
pF1KSD EKVTEGVRCICSQLSLTTKMDAEHPELRSYAQSQGWWTGEGEFNFSEVFSPVED-HLDCG
       ::: :::: : .:::.:::.  :::..:.::. .::: :. ::.:. ..: ..  ..  .
XP_005 EKVQEGVRNISNQLSITTKIAREHPDMRNYAKRKGWWDGKKEFDFAAAYSYLDTAKMMTS
        180       190       200       210       220       230      

        240            250       260       270       280       290 
pF1KSD AGKDS-----LEKQEESITVQTMMNTLRDKASGVCIDSEFFLTTASGVSVLPQNRSSPCI
       .:.       :.:.. .:: .:::. :::: ::. ...:: ::::: ::.:::. : :::
XP_005 SGRYCEGYKLLNKHKGNITFETMMEILRDKPSGINMEGEF-LTTASMVSILPQDSSLPCI
        240       250       260       270        280       290     

             300       310       320       330       340       350 
pF1KSD HYFTGTPDPSRSIFKPFIFVDDVKLVPKTQSPCFGDDDPAKKEPRFQEKPDRRHELYKAH
       :.::::::: ::.:::::::  .. .  :.:: :  .: .::. .:  :::::: ::. :
XP_005 HFFTGTPDPERSVFKPFIFVPHISQLLDTSSPTFELEDLVKKKSHF--KPDRRHPLYQKH
         300       310       320       330       340         350   

             360       370       380       390       400       410 
pF1KSD EWARAIIESDQEQGRKLRSTMLELEKQGLEAMEEILTSSEPLDPAEVGDLFYDCVDTEIK
       . :  ......:... . ..: .:::. .. :: :: ... ::  .. .:: .:.  ::.
XP_005 QQALEVVNNNEEKAKIMLDNMRKLEKELFREMESIL-QNKHLDVEKIVNLFPQCTKDEIQ
           360       370       380        390       400       410  

                   
pF1KSD FFK         
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            :  :  :::.:: . :. ..::::: :  ::::::::: :. :.  . ...::::
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        :::::.:::...::::::::::::::::::::.:::.  :: . . :::::::::::::
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       ::..::..::.:::.:::..:::::  : .    :.....::.::.:::.::: ::::::
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       ::: :::: : .:::.:::.  :::..:.::. .::: :. ::.:. ..: ..  ..  .
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       .:.       :.:.. .:: .:::. :::: ::. ...:: ::::: ::.:::. : :::
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       :.::::::: ::.:::::::  .. .  :.:: :  .: .::. .:  :::::: ::. :
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       . :  ......:... . ..: .:::. .. :: :: ... ::  .. .:: .:.  ::.
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XP_005 IYQSNLSVKVSS
            420    

>>XP_005246914 (OMIM: 614967) PREDICTED: secernin-3 isof  (424 aa)
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414 residues in 1 query   sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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