Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA0171
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0171, 625 aa
1>>>pF1KSDA0171 625 - 625 aa - 625 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.3340+/-0.00105; mu= 0.5814+/- 0.063
mean_var=190.7881+/-39.129, 0's: 0 Z-trim(110.0): 40 B-trim: 158 in 1/51
Lambda= 0.092854
statistics sampled from 11289 (11313) to 11289 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.695), E-opt: 0.2 (0.348), width: 16
Scan time: 3.820
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS47330.1 CLINT1 gene_id:9685|Hs108|chr5 ( 625) 4140 567.4 2e-161
CCDS56389.1 CLINT1 gene_id:9685|Hs108|chr5 ( 643) 3123 431.2 2.1e-120
CCDS56388.1 CLINT1 gene_id:9685|Hs108|chr5 ( 625) 3007 415.6 9.8e-116
CCDS46199.1 EPN1 gene_id:29924|Hs108|chr19 ( 576) 625 96.5 1e-19
CCDS11570.1 EPN3 gene_id:55040|Hs108|chr17 ( 632) 616 95.3 2.6e-19
CCDS11204.1 EPN2 gene_id:22905|Hs108|chr17 ( 584) 611 94.6 3.8e-19
CCDS46200.1 EPN1 gene_id:29924|Hs108|chr19 ( 550) 572 89.4 1.4e-17
CCDS46198.1 EPN1 gene_id:29924|Hs108|chr19 ( 662) 559 87.7 5.4e-17
CCDS11203.1 EPN2 gene_id:22905|Hs108|chr17 ( 641) 557 87.4 6.3e-17
CCDS13998.1 ENTHD1 gene_id:150350|Hs108|chr22 ( 607) 459 74.3 5.4e-13
>>CCDS47330.1 CLINT1 gene_id:9685|Hs108|chr5 (625 aa)
initn: 4140 init1: 4140 opt: 4140 Z-score: 3011.6 bits: 567.4 E(32554): 2e-161
Smith-Waterman score: 4140; 100.0% identity (100.0% similar) in 625 aa overlap (1-625:1-625)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MLNMWKVRELVDKATNVVMNYSEIESKVREATNDDPWGPSGQLMGEIAKATFMYEQFPEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MLNMWKVRELVDKATNVVMNYSEIESKVREATNDDPWGPSGQLMGEIAKATFMYEQFPEL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD MNMLWSRMLKDNKKNWRRVYKSLLLLAYLIRNGSERVVTSAREHIYDLRSLENYHFVDEH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MNMLWSRMLKDNKKNWRRVYKSLLLLAYLIRNGSERVVTSAREHIYDLRSLENYHFVDEH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD GKDQGINIRQKVKELVEFAQDDDRLREERKKAKKNKDKYVGVSSDSVGGFRYSERYDPEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 GKDQGINIRQKVKELVEFAQDDDRLREERKKAKKNKDKYVGVSSDSVGGFRYSERYDPEP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD KSKWDEEWDKNKSAFPFSDKLGELSDKIGSTIDDTISKFRRKDREDSPERCSDSDEEKKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 KSKWDEEWDKNKSAFPFSDKLGELSDKIGSTIDDTISKFRRKDREDSPERCSDSDEEKKA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD RRGRSPKGEFKDEEETVTTKHIHITQATETTTTRHKRTANPSKTIDLGAAAHYTGDKASP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 RRGRSPKGEFKDEEETVTTKHIHITQATETTTTRHKRTANPSKTIDLGAAAHYTGDKASP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD DQNASTHTPQSSVKTSVPSSKSSGDLVDLFDGTSQSTGGSADLFGGFADFGSAAASGSFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 DQNASTHTPQSSVKTSVPSSKSSGDLVDLFDGTSQSTGGSADLFGGFADFGSAAASGSFP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD SQVTATSGNGDFGDWSAFNQAPSGPVASSGEFFGSASQPAVELVSGSQSALGPPPAASNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SQVTATSGNGDFGDWSAFNQAPSGPVASSGEFFGSASQPAVELVSGSQSALGPPPAASNS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD SDLFDLMGSSQATMTSSQSMNFSMMSTNTVGLGLPMSRSQNTDMVQKSVSKTLPSTWSDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SDLFDLMGSSQATMTSSQSMNFSMMSTNTVGLGLPMSRSQNTDMVQKSVSKTLPSTWSDP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD SVNISLDNLLPGMQPSKPQQPSLNTMIQQQNMQQPMNVMTQSFGAVNLSSPSNMLPVRPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SVNISLDNLLPGMQPSKPQQPSLNTMIQQQNMQQPMNVMTQSFGAVNLSSPSNMLPVRPQ
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD TNALIGGPMPMSMPNVMTGTMGMAPLGNTPMMNQSMMGMNMNIGMSAAGMGLTGTMGMGM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 TNALIGGPMPMSMPNVMTGTMGMAPLGNTPMMNQSMMGMNMNIGMSAAGMGLTGTMGMGM
550 560 570 580 590 600
610 620
pF1KSD PNIAMTSGTVQPKQDAFANFANFSK
:::::::::::::::::::::::::
CCDS47 PNIAMTSGTVQPKQDAFANFANFSK
610 620
>>CCDS56389.1 CLINT1 gene_id:9685|Hs108|chr5 (643 aa)
initn: 3061 init1: 3032 opt: 3123 Z-score: 2275.1 bits: 431.2 E(32554): 2.1e-120
Smith-Waterman score: 4094; 97.2% identity (97.2% similar) in 643 aa overlap (1-625:1-643)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MLNMWKVRELVDKATNVVMNYSEIESKVREATNDDPWGPSGQLMGEIAKATFMYEQFPEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 MLNMWKVRELVDKATNVVMNYSEIESKVREATNDDPWGPSGQLMGEIAKATFMYEQFPEL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD MNMLWSRMLKDNKKNWRRVYKSLLLLAYLIRNGSERVVTSAREHIYDLRSLENYHFVDEH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 MNMLWSRMLKDNKKNWRRVYKSLLLLAYLIRNGSERVVTSAREHIYDLRSLENYHFVDEH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD GKDQGINIRQKVKELVEFAQDDDRLREERKKAKKNKDKYVGVSSDSVGGFRYSERYDPEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 GKDQGINIRQKVKELVEFAQDDDRLREERKKAKKNKDKYVGVSSDSVGGFRYSERYDPEP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD KSKWDEEWDKNKSAFPFSDKLGELSDKIGSTIDDTISKFRRKDREDSPERCSDSDEEKKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 KSKWDEEWDKNKSAFPFSDKLGELSDKIGSTIDDTISKFRRKDREDSPERCSDSDEEKKA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD RRGRSPKGEFKDEEETVTTKHIHITQATETTTTRHKRTANPSKTIDLGAAAHYTGDKASP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 RRGRSPKGEFKDEEETVTTKHIHITQATETTTTRHKRTANPSKTIDLGAAAHYTGDKASP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD DQNASTHTPQSSVKTSVPSSKSSGDLVDLFDGTSQSTGGSADLFGGFADFGSAAASGSFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 DQNASTHTPQSSVKTSVPSSKSSGDLVDLFDGTSQSTGGSADLFGGFADFGSAAASGSFP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD SQVTATSGNGDFGDWSAFNQAPSGPVASSGEFFGSASQPAVELVSGSQSALGPPPAASNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 SQVTATSGNGDFGDWSAFNQAPSGPVASSGEFFGSASQPAVELVSGSQSALGPPPAASNS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460
pF1KSD SDLFDLMGSSQATMTSSQSMNFSMMSTNTVGLGLPMSRSQ------------------NT
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::
CCDS56 SDLFDLMGSSQATMTSSQSMNFSMMSTNTVGLGLPMSRSQPLQNVSTVLQKPNPLYNQNT
430 440 450 460 470 480
470 480 490 500 510 520
pF1KSD DMVQKSVSKTLPSTWSDPSVNISLDNLLPGMQPSKPQQPSLNTMIQQQNMQQPMNVMTQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 DMVQKSVSKTLPSTWSDPSVNISLDNLLPGMQPSKPQQPSLNTMIQQQNMQQPMNVMTQS
490 500 510 520 530 540
530 540 550 560 570 580
pF1KSD FGAVNLSSPSNMLPVRPQTNALIGGPMPMSMPNVMTGTMGMAPLGNTPMMNQSMMGMNMN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 FGAVNLSSPSNMLPVRPQTNALIGGPMPMSMPNVMTGTMGMAPLGNTPMMNQSMMGMNMN
550 560 570 580 590 600
590 600 610 620
pF1KSD IGMSAAGMGLTGTMGMGMPNIAMTSGTVQPKQDAFANFANFSK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 IGMSAAGMGLTGTMGMGMPNIAMTSGTVQPKQDAFANFANFSK
610 620 630 640
>>CCDS56388.1 CLINT1 gene_id:9685|Hs108|chr5 (625 aa)
initn: 2945 init1: 2916 opt: 3007 Z-score: 2191.3 bits: 415.6 E(32554): 9.8e-116
Smith-Waterman score: 3978; 97.1% identity (97.1% similar) in 625 aa overlap (19-625:1-625)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MLNMWKVRELVDKATNVVMNYSEIESKVREATNDDPWGPSGQLMGEIAKATFMYEQFPEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 MNYSEIESKVREATNDDPWGPSGQLMGEIAKATFMYEQFPEL
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KSD MNMLWSRMLKDNKKNWRRVYKSLLLLAYLIRNGSERVVTSAREHIYDLRSLENYHFVDEH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 MNMLWSRMLKDNKKNWRRVYKSLLLLAYLIRNGSERVVTSAREHIYDLRSLENYHFVDEH
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KSD GKDQGINIRQKVKELVEFAQDDDRLREERKKAKKNKDKYVGVSSDSVGGFRYSERYDPEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 GKDQGINIRQKVKELVEFAQDDDRLREERKKAKKNKDKYVGVSSDSVGGFRYSERYDPEP
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KSD KSKWDEEWDKNKSAFPFSDKLGELSDKIGSTIDDTISKFRRKDREDSPERCSDSDEEKKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 KSKWDEEWDKNKSAFPFSDKLGELSDKIGSTIDDTISKFRRKDREDSPERCSDSDEEKKA
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KSD RRGRSPKGEFKDEEETVTTKHIHITQATETTTTRHKRTANPSKTIDLGAAAHYTGDKASP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 RRGRSPKGEFKDEEETVTTKHIHITQATETTTTRHKRTANPSKTIDLGAAAHYTGDKASP
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KSD DQNASTHTPQSSVKTSVPSSKSSGDLVDLFDGTSQSTGGSADLFGGFADFGSAAASGSFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 DQNASTHTPQSSVKTSVPSSKSSGDLVDLFDGTSQSTGGSADLFGGFADFGSAAASGSFP
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KSD SQVTATSGNGDFGDWSAFNQAPSGPVASSGEFFGSASQPAVELVSGSQSALGPPPAASNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 SQVTATSGNGDFGDWSAFNQAPSGPVASSGEFFGSASQPAVELVSGSQSALGPPPAASNS
350 360 370 380 390 400
430 440 450 460
pF1KSD SDLFDLMGSSQATMTSSQSMNFSMMSTNTVGLGLPMSRSQ------------------NT
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::
CCDS56 SDLFDLMGSSQATMTSSQSMNFSMMSTNTVGLGLPMSRSQPLQNVSTVLQKPNPLYNQNT
410 420 430 440 450 460
470 480 490 500 510 520
pF1KSD DMVQKSVSKTLPSTWSDPSVNISLDNLLPGMQPSKPQQPSLNTMIQQQNMQQPMNVMTQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 DMVQKSVSKTLPSTWSDPSVNISLDNLLPGMQPSKPQQPSLNTMIQQQNMQQPMNVMTQS
470 480 490 500 510 520
530 540 550 560 570 580
pF1KSD FGAVNLSSPSNMLPVRPQTNALIGGPMPMSMPNVMTGTMGMAPLGNTPMMNQSMMGMNMN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 FGAVNLSSPSNMLPVRPQTNALIGGPMPMSMPNVMTGTMGMAPLGNTPMMNQSMMGMNMN
530 540 550 560 570 580
590 600 610 620
pF1KSD IGMSAAGMGLTGTMGMGMPNIAMTSGTVQPKQDAFANFANFSK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 IGMSAAGMGLTGTMGMGMPNIAMTSGTVQPKQDAFANFANFSK
590 600 610 620
>>CCDS46199.1 EPN1 gene_id:29924|Hs108|chr19 (576 aa)
initn: 369 init1: 340 opt: 625 Z-score: 467.4 bits: 96.5 E(32554): 1e-19
Smith-Waterman score: 661; 30.8% identity (55.9% similar) in 569 aa overlap (16-554:12-563)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MLNMWKVRELVDKATNVVMNYSEIESKVREATNDDPWGPSGQLMGEIAKATFMYEQFPEL
:.: :::: : ::::::..::::::..::.::: :. : :.
CCDS46 MSTSSLRRQMKNIVHNYSEAEIKVREATSNDPWGPSSSLMSEIADLTYNVVAFSEI
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KSD MNMLWSRMLKDNKKNWRRVYKSLLLLAYLIRNGSERVVTSAREHIYDLRSLENYHFVDEH
:.:.:.: :.:. ::::.:::.. :. :::..::::: . .:..: ...:.....::.
CCDS46 MSMIWKR-LNDHGKNWRHVYKAMTLMEYLIKTGSERVSQQCKENMYAVQTLKDFQYVDRD
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KSD GKDQGINIRQKVKELVEFAQDDDRLREERKKAKKNKDKYVGV---SSDSVGGFRYSERYD
:::::.:.:.:.:.:: . .:.::::::: .: :.:.: . . :: .::. : .
CCDS46 GKDQGVNVREKAKQLVALLRDEDRLREERAHALKTKEKLAQTATASSAAVGSGPPPEAEQ
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KSD PEPKSKWDEEWDKNKSAFPFSDKLGELSDKIGSTIDDTISKFRRKDRE--DSPERCSDSD
:.:. .:: . . :. .: . .. . : : .. .:: :. :: .:
CCDS46 AWPQSSGEEEL-QLQLALAMSKEEADQPPSCGPEDDAQLQLALSLSREEHDKEERIRRGD
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KSD EEKKARRGRSPKGEFKDEEET--VTTKHIHITQATETTTTRHKRTANPSKTIDLGAAAHY
. . . : : .::. . . . : :: : . .. .: .
CCDS46 DLRLQMAIEESKRETGGKEESSLMDLADVFTAPAPAPTTDPWGGPAPMAAAVPTAAPTSD
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340
pF1KSD T-GDKASPDQNASTHTPQSSVKTSVP--SSKSSGDLVDLFDGTSQSTGG---SADLFGGF
: : : . .. : . .: :: . :: ..: . : .:.
CCDS46 PWGGPPVPPAADPWGGPAPTPASGDPWRPAAPAGPSVDPWGGTPAPAAGEGPTPDPWGS-
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KSD ADFGSAAASGSFPSQVTATSGNGDFGD-WSAFNQAPS--GPVASSGEFFGSASQPAVELV
.: :.. .:: :: . :.: :.. :: : .:..: : . .: :.
CCDS46 SD-GGVPVSG--PSASDPWTPAPAFSDPWGGSPAKPSTNGTTAAGG--FDT--EPD-EFS
360 370 380 390 400
410 420 430 440 450 460
pF1KSD SGSQSALGPPPAASNSSDLFDLMGSSQATMTSSQSMNFSMMS-TNTVGLGLPMSRSQNTD
. .. . : ..:....: : : : .. .:. : ...:: : . :
CCDS46 DFDRLRTALPTSGSSAGELELLAGEVPARSPGAFDMSGVRGSLAEAVGSPPPAATPTPTP
410 420 430 440 450 460
470 480 490 500 510
pF1KSD MVQKSVSKTLPSTWSDPSVN-ISLDNLL-------PGMQPSKPQQPSLN--TMIQQQNMQ
..:. : .. :.. ..::.:. :: . :.: :. . : . :
CCDS46 PTRKT-----PESFLGPNAALVDLDSLVSRPGPTPPGAKASNPFLPGGGPATGPSVTNPF
470 480 490 500 510 520
520 530 540 550 560 570
pF1KSD QPMNVMTQSFGAVNLSSPSNMLPVRPQT--NALIGGP-MPMSMPNVMTGTMGMAPLGNTP
:: : ... . :: : .: : : . : ::: .: ::
CCDS46 QPAPPATLTLNQLRLS-PVPPVPGAPPTYISPLGGGPGLPPMMPPGPPAPNTNPFLL
530 540 550 560 570
580 590 600 610 620
pF1KSD MMNQSMMGMNMNIGMSAAGMGLTGTMGMGMPNIAMTSGTVQPKQDAFANFANFSK
>>CCDS11570.1 EPN3 gene_id:55040|Hs108|chr17 (632 aa)
initn: 398 init1: 332 opt: 616 Z-score: 460.2 bits: 95.3 E(32554): 2.6e-19
Smith-Waterman score: 646; 28.3% identity (58.3% similar) in 635 aa overlap (13-612:9-593)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MLNMWKVRELVDKATNVVMNYSEIESKVREATNDDPWGPSGQLMGEIAKATFMYEQFPEL
.. :.: :::: : ::::::..::::: ..::.::: :: : :.
CCDS11 MTTSALRRQVKNIVHNYSEAEIKVREATSNDPWGPPSSLMSEIADLTFNTVAFTEV
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KSD MNMLWSRMLKDNKKNWRRVYKSLLLLAYLIRNGSERVVTSAREHIYDLRSLENYHFVDEH
:.::: : :.:. ::::.:::.: :: ::...:::::. . ::..: ...:......:.
CCDS11 MGMLWRR-LNDSGKNWRHVYKALTLLDYLLKTGSERVAHQCRENLYTIQTLKDFQYIDRD
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KSD GKDQGINIRQKVKELVEFAQDDDRLREERKKAKKNKDKY----VGVSSDSVGGFRYSERY
:::::.:.:.:::... . .:..:::.:: .: :.:... .:..: ..: .:.::
CCDS11 GKDQGVNVREKVKQVMALLKDEERLRQERTHALKTKERMALEGIGIGSGQLG---FSRRY
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KSD DPEPKSKWDEEWDKNKSAFPFSDKLGELSDKIGSTIDDTISKFRRKDREDSPERCSDSDE
:........ : : . . : . : ... .. . . .:. . . .
CCDS11 G--------EDYSRSRGS-PSSYNSSSSSPRYTSDLEQ--ARPQTSGEEELQLQLALAMS
180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KSD EKKARRGRSPKGEFKDEEETVTTKHIHITQATETTTTRHKRTANPSKTIDLGAAAHYTGD
...:.. : . .::. . ..... . .: . . . ::..:. :
CCDS11 REEAEKP-VPPASHRDEDLQLQLA-LRLSRQEHEKEVRSWQGDGSPMANGAGAVVHHQRD
230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KSD KASPDQNASTHTPQSSVKTSVPSSKSSGDLVDLFDGT--SQSTGGSADLFGGFADFGSAA
. :... . . ..::: ..: ::.:.: . :: ::: . :.
CCDS11 RE-PEREERKE--EEKLKTS---QSSILDLADIFVPALAPPSTHCSADPW----DI----
280 290 300 310 320
360 370 380 390 400 410
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CCDS11 -PGFRPNTEASGSSWGPSADPWSPI---PSGTVLSR-------SQPWDLTPMLSSSEPWG
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CCDS11 RTPVLPAGPPTTDPWALNSPHHKLPSTGADPWGASLETSDTPGGASTFDPFAKPPESTET
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.... ..::: . :: . :: :. .::. : .: .:. : . . :: .
CCDS11 KEGLEQALPS--GKPSSPVELD-LFGDPSPSSKQNGTKEPDALDLGILGEALTQPSKEAR
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530 540 550 560
pF1KSD -----QSFGAVNLSSPSNM--LPVRPQT----NALIGGPMPMSMPNVMTGTMGMAPLGNT
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CCDS11 ACRTPESFLGPSASSLVNLDSLVKAPQVAKTRNPFLTG---LSAPSP-TNPFGAGEPGR-
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CCDS11 PTLNQMRTGSPALGLAGGPVGAPLGSMTYSASLPLPLSSVPAGLTLPASVSVFPQAGAFA
550 560 570 580 590 600
CCDS11 PQPLLPTPSSAGPRPPPPQTGTNPFL
610 620 630
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CCDS11 MSMVWKR-LNDHGKNWRHVYKALTLLDYLIKTGSERVAQQCRENIFAIQTLKDFQYIDRD
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CCDS11 GKDQGINVREKSKQLVALLKDEERLKAERAQALKTKERMAQVAT-GMGSNQITFGRGSSQ
120 130 140 150 160 170
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:. : : . .:.. .. : : ...: .... . ... . . : :
CCDS11 PNLSTSHSEQEYGKAGGSPASYHGSTSPRVSSELEQARPQTSGEEELQLQLALAMSREVA
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pF1KSD --EKKARRGRSPKGEFKDEEETVTTKHIHITQATETTTTRHKRTANPSKTIDLGAAAHYT
:.. ::: . . .. :: : ..: . : : . . .:: : .
CCDS11 EQEERLRRGDDLRLQMALEESRRDT--VKIPKKKE-----HGSLPQQTTLLDLMDALPSS
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: : :.: :..:.. . : : . ....: . .:. .:.
CCDS11 GPAA---QKAEPWGPSASTNQTNPW------------GGPAAPASTSDPWPSFGTKPAAS
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pF1KSD ASG-SFPSQVTATSGNGDFGDWSAFNQAPSGPVASSGEFFGSASQPAVELVSGSQSALGP
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CCDS11 IDPWGVPTGATVQSVPKNSDPWAASQQPASSAGKRASDAWGAVSTTKPVSVSGS-FELFS
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pF1KSD PPAASNSSDL--FDLMGSSQATMTSSQSMNFSMMSTNTVGLGLPM-SRSQNTDMVQKSVS
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CCDS11 NLNGTIKDDFSEFDNLRTSKKTAESVTSLPSQNNGTTSPD---PFESQPLTVASSKPSSA
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pF1KSD KTLPSTWSDPSVN-ISLDNLLPGMQPSKPQQPSLNTMIQ-------------QQNMQQPM
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CCDS11 RKTPESFLGPNAALVNLDSLV--TRPAPPAQ-SLNPFLAPGAPATSAPVNPFQVNQPQPL
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pF1KSD NVMTQSFGAVNLSSPSNMLPVRPQTNALIGGPMPMSMPNVMTGTMG--MAPLGNTPMMNQ
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CCDS11 T-LNQLRGSPVLGTSTSFGP-GPGVESMAVASMTSAAPQPALGATGSSLTPLG--P----
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pF1KSD SMMGMNMNIGMSAAGMGLTGTMGMGMPNIAMTSGTVQPKQDAFANFANFSK
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CCDS11 AMMNMVGSVGIPPSAAQATGTTNPFLL
560 570 580
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CCDS46 MSMIWKR-LNDHGKNWRHVYKAMTLMEYLIKTGSERVSQQCKENMYAVQTLKDFQYVDRD
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: : . .. : . .: :: . :: ..: . : .:. .: :
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CCDS46 GVPVSG--PSASDPWTPAPAFSDPWGGSPAKPSTNGTTAG---GFDTEPD-EFSDFDRLR
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CCDS46 TALPTSGSSAGELELLAGEVPARSPGAFDMSGVRGSLAEAVGSPPPAATPTPTPPTRKT-
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: ... . :: : .: : : . : ::: .: ::
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: ...:.....::. :::::.:.:.:.:.:: . .:.::::::: .: :.:.: . .
CCDS46 YAVQTLKDFQYVDRDGKDQGVNVREKAKQLVALLRDEDRLREERAHALKTKEKLAQTATA
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:: .::. : :.. .. : .... .. .:. .: . : ..::
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: : . . ::.: . : : :.: . . . : :: : .
CCDS46 D----DLRLQMAIEESKRETG----G--KEESSLMDLADVFTAPAPAPTTDPWGGPAPMA
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.. .: . : : : . .. : . .: :: . :: ..:
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. : .:. .: :.. .:: :: . :.: :.. :: : .:..: :
CCDS46 EGPTPDPWGS-SD-GGVPVSG--PSASDPWTPAPAFSDPWGGSPAKPSTNGTTAAGG--F
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. .: :. . .. . : ..:....: : : : .. .:. : ...::
CCDS46 DT--EPD-EFSDFDRLRTALPTSGSSAGELELLAGEVPARSPGAFDMSGVRGSLAEAVGS
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: . : ..:. : .. :.. ..::.:. :: . :.: :. .
CCDS46 PPPAATPTPTPPTRKT-----PESFLGPNAALVDLDSLVSRPGPTPPGAKASNPFLPGGG
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pF1KSD --TMIQQQNMQQPMNVMTQSFGAVNLSSPSNMLPVRPQT--NALIGGP-MPMSMPNVMTG
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CCDS46 PATGPSVTNPFQPAPPATLTLNQLRLS-PVPPVPGAPPTYISPLGGGPGLPPMMPPGPPA
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pF1KSD TMGMAPLGNTPMMNQSMMGMNMNIGMSAAGMGLTGTMGMGMPNIAMTSGTVQPKQDAFAN
CCDS46 PNTNPFLL
660
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CCDS11 MTTSSIRRQMKNIVNNYSEAEIKVREATSNDPWGPSSSLMTEIADLTYNVVAFSEI
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CCDS11 MSMVWKR-LNDHGKNWRHVYKALTLLDYLIKTGSERVAQQCRENIFAIQTLKDFQYIDRD
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CCDS11 GKDQGINVREKSKQLVALLKDEERLKAERAQALKTKERMAQVATGMGSNQITFGRGSSQP
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pF1KSD --------------GGFRYSERYDPE----PKSK------WDEEWDKNKSAFPFSDKLGE
:: : . .:: :. . .:: . .. :: .::
CCDS11 NLSTSHSEQEYGKAGGSPASYHGSPEASLCPQHRTGAPLGQSEELQPLSQRHPFLPHLGL
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CCDS11 ASRPNGDWSQPCLT-CDRAARATSPRVSSELEQARPQTSG---------EEELQLQLALA
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CCDS11 SGPAAQKAEPW-GPSASTN-QTNPWGGPA--APASTSDPWPSFGTKPAASID--PWGVPT
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CCDS11 GATVQSVPKNSDPWAASQQPASSAGKRASDAWGAVSTTKPVSVSGSFELFSNLNGTIKDD
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.. ... : ....: .:: . . .:. . : .. : .. :.
CCDS11 FSEFDNLRTSKKTAESV-TSLPSQNNGTTSPDPFESQPLTVASSKPSSARKTPESFLGPN
460 470 480 490 500 510
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pF1KSD VN-ISLDNLLPGMQPSKPQQPSLNTMIQ-------------QQNMQQPMNVMTQSFGAVN
. ..::.:. .:. : : ::: .. : :. ::.. ..: :.
CCDS11 AALVNLDSLV--TRPAPPAQ-SLNPFLAPGAPATSAPVNPFQVNQPQPLT-LNQLRGSPV
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CCDS11 LGTSTSFGP-GPGVESMAVASMTSAAPQPALGATGSSLTPLG--P----AMMNMVGSVGI
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pF1KSD SAAGMGLTGTMGMGMPNIAMTSGTVQPKQDAFANFANFSK
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CCDS11 PPSAAQATGTTNPFLL
630 640
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CCDS13 MAFRRQVKNFVKNYSDAEIKVREATSNDPWGPSSSLMLDISDLTFNTISLSEI
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pF1KSD MNMLWSRMLKDNKKNWRRVYKSLLLLAYLIRNGSERVVTSAREHIYDLRSLENYHFVDEH
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CCDS13 MNMLWHR-LNDHGKNWRHVYKSLTLMDYLIKNGSKKVIQHCREGFCNLQTLKDFQHIDEA
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::::: ::.: :... . .:. : .::. : .....
CCDS13 GKDQGYYIREKSKQVITLLMDEPLLCKEREVACRTRQRTSHSILFSKRQLGSSNSLTACT
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pF1KSD KSKWDEEWDKNKSAFPFSDKLGELSDKIGSTIDDTISKFRRKDREDSPERCSDSDEEKKA
CCDS13 SAPTPDISASEKKYKLPKFGRLHNKRNVCKAGLKQEHCQDVHLPTETMLSQETLPLKIHG
180 190 200 210 220 230
625 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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