Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA0167
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0167, 836 aa
1>>>pF1KSDA0167 836 - 836 aa - 836 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.4734+/-0.00108; mu= 2.1308+/- 0.066
mean_var=246.0195+/-49.319, 0's: 0 Z-trim(112.6): 94 B-trim: 800 in 2/51
Lambda= 0.081769
statistics sampled from 13245 (13339) to 13245 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.735), E-opt: 0.2 (0.41), width: 16
Scan time: 4.090
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS8951.1 AGAP2 gene_id:116986|Hs108|chr12 ( 836) 5455 657.3 3.1e-188
CCDS44932.1 AGAP2 gene_id:116986|Hs108|chr12 (1192) 3011 369.1 2.6e-101
CCDS2514.1 AGAP1 gene_id:116987|Hs108|chr2 ( 804) 1382 176.8 1.3e-43
CCDS33408.1 AGAP1 gene_id:116987|Hs108|chr2 ( 857) 1360 174.2 8.4e-43
CCDS43681.1 AGAP3 gene_id:116988|Hs108|chr7 ( 911) 1312 168.6 4.5e-41
CCDS64802.1 AGAP3 gene_id:116988|Hs108|chr7 ( 580) 1259 162.2 2.4e-39
CCDS58756.1 AGAP1 gene_id:116987|Hs108|chr2 ( 405) 1194 154.4 3.7e-37
CCDS7215.1 AGAP4 gene_id:119016|Hs108|chr10 ( 663) 1157 150.2 1.1e-35
CCDS44397.1 AGAP6 gene_id:414189|Hs108|chr10 ( 686) 1156 150.1 1.2e-35
CCDS44439.1 AGAP5 gene_id:729092|Hs108|chr10 ( 686) 1142 148.4 3.9e-35
CCDS55185.1 AGAP3 gene_id:116988|Hs108|chr7 ( 396) 1085 141.5 2.7e-33
CCDS78287.1 AGAP3 gene_id:116988|Hs108|chr7 ( 576) 992 130.7 7.3e-30
CCDS83243.1 AGAP3 gene_id:116988|Hs108|chr7 ( 343) 938 124.1 4e-28
CCDS73125.1 AGAP9 gene_id:642517|Hs108|chr10 ( 658) 940 124.6 5.6e-28
>>CCDS8951.1 AGAP2 gene_id:116986|Hs108|chr12 (836 aa)
initn: 5455 init1: 5455 opt: 5455 Z-score: 3492.8 bits: 657.3 E(32554): 3.1e-188
Smith-Waterman score: 5455; 100.0% identity (100.0% similar) in 836 aa overlap (1-836:1-836)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MHAQRQFVVAAVRAEVRRHEVAKQALNRLRKLAERVDDPELQDSIQASLDSIREAVINSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 MHAQRQFVVAAVRAEVRRHEVAKQALNRLRKLAERVDDPELQDSIQASLDSIREAVINSQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD EWTLSRSIPELRLGVLGDARSGKSSLIHRFLTGSYQVLEKTESEQYKKEMLVDGQTHLVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 EWTLSRSIPELRLGVLGDARSGKSSLIHRFLTGSYQVLEKTESEQYKKEMLVDGQTHLVL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD IREEAGAPDAKFSGWADAVIFVFSLEDENSFQAVSRLHGQLSSLRGEGRGGLALALVGTQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 IREEAGAPDAKFSGWADAVIFVFSLEDENSFQAVSRLHGQLSSLRGEGRGGLALALVGTQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD DRISASSPRVVGDARARALCADMKRCSYYETCATYGLNVDRVFQEVAQKVVTLRKQQQLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 DRISASSPRVVGDARARALCADMKRCSYYETCATYGLNVDRVFQEVAQKVVTLRKQQQLL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD AACKSLPSSPSHSAASTPVAGQASNGGHTSDYSSSLPSSPNVGHRELRAEAAAVAGLSTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 AACKSLPSSPSHSAASTPVAGQASNGGHTSDYSSSLPSSPNVGHRELRAEAAAVAGLSTP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD GSLHRAAKRRTSLFANRRGSDSEKRSLDSRGETTGSGRAIPIKQSFLLKRSGNSLNKEWK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 GSLHRAAKRRTSLFANRRGSDSEKRSLDSRGETTGSGRAIPIKQSFLLKRSGNSLNKEWK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD KKYVTLSSNGFLLYHPSINDYIHSTHGKEMDLLRTTVKVPGKRPPRAISAFGPSASINGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 KKYVTLSSNGFLLYHPSINDYIHSTHGKEMDLLRTTVKVPGKRPPRAISAFGPSASINGL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD VKDMSTVQMGEGLEATTPMPSPSPSPSSLQPPPDQTSKHLLKPDRNLARALSTDCTPSGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 VKDMSTVQMGEGLEATTPMPSPSPSPSSLQPPPDQTSKHLLKPDRNLARALSTDCTPSGD
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD LSPLSREPPPSPMVKKQRRKKLTTPSKTEGSAGQAEEENFEFLIVSSTGQTWHFEAASFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 LSPLSREPPPSPMVKKQRRKKLTTPSKTEGSAGQAEEENFEFLIVSSTGQTWHFEAASFE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD ERDAWVQAIESQILASLQCCESSKVKLRTDSQSEAVAIQAIRNAKGNSICVDCGAPNPTW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 ERDAWVQAIESQILASLQCCESSKVKLRTDSQSEAVAIQAIRNAKGNSICVDCGAPNPTW
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD ASLNLGALICIECSGIHRNLGTHLSRVRSLDLDDWPRELTLVLTAIGNDTANRVWESDTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 ASLNLGALICIECSGIHRNLGTHLSRVRSLDLDDWPRELTLVLTAIGNDTANRVWESDTR
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD GRAKPSRDSSREERESWIRAKYEQLLFLAPLSTSEEPLGRQLWAAVQAQDVATVLLLLAH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 GRAKPSRDSSREERESWIRAKYEQLLFLAPLSTSEEPLGRQLWAAVQAQDVATVLLLLAH
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD ARHGPLDTSVEDPQLRSPLHLAAELAHVVITQLLLWYGADVAARDAQGRTALFYARQAGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 ARHGPLDTSVEDPQLRSPLHLAAELAHVVITQLLLWYGADVAARDAQGRTALFYARQAGS
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830
pF1KSD QLCADILLQHGCPGEGGSAATTPSAATTPSITATPSPRRRSSAASVGRADAPVALV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 QLCADILLQHGCPGEGGSAATTPSAATTPSITATPSPRRRSSAASVGRADAPVALV
790 800 810 820 830
>>CCDS44932.1 AGAP2 gene_id:116986|Hs108|chr12 (1192 aa)
initn: 5105 init1: 3009 opt: 3011 Z-score: 1932.5 bits: 369.1 E(32554): 2.6e-101
Smith-Waterman score: 5071; 96.8% identity (97.0% similar) in 810 aa overlap (47-836:383-1192)
20 30 40 50 60 70
pF1KSD RRHEVAKQALNRLRKLAERVDDPELQDSIQASLDSIREAVINSQEWTLSRSIPELRLGVL
: : . .::::::::::::::::::::::
CCDS44 TKSTGGPPGSGPLPGPPSLSSGSGSRELLGAELRASPKAVINSQEWTLSRSIPELRLGVL
360 370 380 390 400 410
80 90 100 110 120 130
pF1KSD GDARSGKSSLIHRFLTGSYQVLEKTESEQYKKEMLVDGQTHLVLIREEAGAPDAKFSGWA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 GDARSGKSSLIHRFLTGSYQVLEKTESEQYKKEMLVDGQTHLVLIREEAGAPDAKFSGWA
420 430 440 450 460 470
140 150 160 170 180 190
pF1KSD DAVIFVFSLEDENSFQAVSRLHGQLSSLRGEGRGGLALALVGTQDRISASSPRVVGDARA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 DAVIFVFSLEDENSFQAVSRLHGQLSSLRGEGRGGLALALVGTQDRISASSPRVVGDARA
480 490 500 510 520 530
200 210 220 230 240 250
pF1KSD RALCADMKRCSYYETCATYGLNVDRVFQEVAQKVVTLRKQQQLLAACKSLPSSPSHSAAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 RALCADMKRCSYYETCATYGLNVDRVFQEVAQKVVTLRKQQQLLAACKSLPSSPSHSAAS
540 550 560 570 580 590
260 270 280 290 300 310
pF1KSD TPVAGQASNGGHTSDYSSSLPSSPNVGHRELRAEAAAVAGLSTPGSLHRAAKRRTSLFAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 TPVAGQASNGGHTSDYSSSLPSSPNVGHRELRAEAAAVAGLSTPGSLHRAAKRRTSLFAN
600 610 620 630 640 650
320 330 340 350 360 370
pF1KSD RRGSDSEKRSLDSRGETTGSGRAIPIKQSFLLKRSGNSLNKEWKKKYVTLSSNGFLLYHP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 RRGSDSEKRSLDSRGETTGSGRAIPIKQSFLLKRSGNSLNKEWKKKYVTLSSNGFLLYHP
660 670 680 690 700 710
380 390 400 410 420 430
pF1KSD SINDYIHSTHGKEMDLLRTTVKVPGKRPPRAISAFGPSASINGLVKDMSTVQMGEGLEAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SINDYIHSTHGKEMDLLRTTVKVPGKRPPRAISAFGPSASINGLVKDMSTVQMGEGLEAT
720 730 740 750 760 770
440 450 460 470 480 490
pF1KSD TPMPSPSPSPSSLQPPPDQTSKHLLKPDRNLARALSTDCTPSGDLSPLSREPPPSPMVKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 TPMPSPSPSPSSLQPPPDQTSKHLLKPDRNLARALSTDCTPSGDLSPLSREPPPSPMVKK
780 790 800 810 820 830
500 510 520 530
pF1KSD QRRKKLTTPSKTEGSAGQAE--------------------EENFEFLIVSSTGQTWHFEA
:::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::
CCDS44 QRRKKLTTPSKTEGSAGQAEAKRKMWKLKSFGSLRNIYKAEENFEFLIVSSTGQTWHFEA
840 850 860 870 880 890
540 550 560 570 580 590
pF1KSD ASFEERDAWVQAIESQILASLQCCESSKVKLRTDSQSEAVAIQAIRNAKGNSICVDCGAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 ASFEERDAWVQAIESQILASLQCCESSKVKLRTDSQSEAVAIQAIRNAKGNSICVDCGAP
900 910 920 930 940 950
600 610 620 630 640 650
pF1KSD NPTWASLNLGALICIECSGIHRNLGTHLSRVRSLDLDDWPRELTLVLTAIGNDTANRVWE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 NPTWASLNLGALICIECSGIHRNLGTHLSRVRSLDLDDWPRELTLVLTAIGNDTANRVWE
960 970 980 990 1000 1010
660 670 680 690 700 710
pF1KSD SDTRGRAKPSRDSSREERESWIRAKYEQLLFLAPLSTSEEPLGRQLWAAVQAQDVATVLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SDTRGRAKPSRDSSREERESWIRAKYEQLLFLAPLSTSEEPLGRQLWAAVQAQDVATVLL
1020 1030 1040 1050 1060 1070
720 730 740 750 760 770
pF1KSD LLAHARHGPLDTSVEDPQLRSPLHLAAELAHVVITQLLLWYGADVAARDAQGRTALFYAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LLAHARHGPLDTSVEDPQLRSPLHLAAELAHVVITQLLLWYGADVAARDAQGRTALFYAR
1080 1090 1100 1110 1120 1130
780 790 800 810 820 830
pF1KSD QAGSQLCADILLQHGCPGEGGSAATTPSAATTPSITATPSPRRRSSAASVGRADAPVALV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 QAGSQLCADILLQHGCPGEGGSAATTPSAATTPSITATPSPRRRSSAASVGRADAPVALV
1140 1150 1160 1170 1180 1190
>>CCDS2514.1 AGAP1 gene_id:116987|Hs108|chr2 (804 aa)
initn: 2506 init1: 1260 opt: 1382 Z-score: 896.3 bits: 176.8 E(32554): 1.3e-43
Smith-Waterman score: 2889; 56.0% identity (79.5% similar) in 820 aa overlap (1-804:1-785)
10 20 30 40 50
pF1KSD MHAQRQFV-VAAVRAEVRRHEVAKQALNRLRKLAERVDDPELQDSIQASLDSIREAVINS
:. :.:.. ::.:::..: : .. . . .: :::..: ::..:. . .:..: .::
CCDS25 MNYQQQLANSAAIRAEIQRFESVHPNIYSIYELLERVEEPVLQNQIREHVIAIEDAFVNS
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KSD QEWTLSRSIPELRLGVLGDARSGKSSLIHRFLTGSYQVLEKTESEQYKKEMLVDGQTHLV
::::::::.:::..:..:. ::::.:.::.:::.: :. :. ..:::..::::..:.
CCDS25 QEWTLSRSVPELKVGIVGNLASGKSALVHRYLTGTYVQEESPEGGRFKKEIVVDGQSYLL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KSD LIREEAGAPDAKFSGWADAVIFVFSLEDENSFQAVSRLHGQLSSLRGEGRGGLALALVGT
:::.:.: :.:.:. :.:::::::::::: :::.: . ...... :. .. . :.::::
CCDS25 LIRDEGGPPEAQFAMWVDAVIFVFSLEDEISFQTVYHYYSRMANYRNTSE--IPLVLVGT
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KSD QDRISASSPRVVGDARARALCADMKRCSYYETCATYGLNVDRVFQEVAQKVVTLRKQQQL
:: ::...:::. ::::: : :.:::.::::::::::::.::::.::::.:. ::.:::
CCDS25 QDAISSANPRVIDDARARKLSNDLKRCTYYETCATYGLNVERVFQDVAQKIVATRKKQQL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KSD -LAACKSLPSSPSHSAA-STPVAG----QASNGGHT-SDYSSSLPSSPNVGHRELRAEAA
.. :::::.:::::.. :. :.. :.:::: . ::::::.::.:.....::: ..
CCDS25 SIGPCKSLPNSPSHSSVCSAQVSAVHISQTSNGGGSLSDYSSSVPSTPSTSQKELRIDVP
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KSD AVAGLSTPGSLHRAAKRRTSLFANRRGSD--SEKRSLDSRGETTGSGRAIPIKQSFLLKR
.: .:: ... .:::..::..:.::: .::..:.::... ::::::::::..::::
CCDS25 PTA--NTPTPVRKQSKRRSNLFTSRKGSDPDKEKKGLESRADSIGSGRAIPIKQGMLLKR
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KSD SGNSLNKEWKKKYVTLSSNGFLLYHPSINDYIHSTHGKEMDLLRTTVKVPGKRPPRAISA
::.::::::::::::: .:: : ::::..::....::::.::::::::::::::::: ::
CCDS25 SGKSLNKEWKKKYVTLCDNGVLTYHPSLHDYMQNVHGKEIDLLRTTVKVPGKRPPRATSA
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460
pF1KSD FGP--SASINGLVKDMSTVQMGEGLEATTPMPSPSPSPSSLQPPPDQTSKHLLKPDRNLA
.: : . ::: ::::.... ::.: : .:.
CCDS25 CAPISSPKTNGLSKDMSSLHI---------------SPNS---------------DTGLG
420 430 440
470 480 490 500 510 520
pF1KSD RALSTDCTPSGDLSPLSREPPPSPMV--KKQRRKKLTTPSKTEGSAGQAEE--ENFEFLI
.. .. . :. :: . .::::: . ::.:::: :. :..: .: ::: :::::.:
CCDS25 DSVCSSPSISSTTSP-KLDPPPSPHANRKKHRRKKSTSNFKADGLSGTAEEQEENFEFII
450 460 470 480 490 500
530 540 550 560 570 580
pF1KSD VSSTGQTWHFEAASFEERDAWVQAIESQILASLQCCESSKVKLRTDSQSEAVAIQAIRNA
:: :::::::::...::::::::::::::::::: ::::: : : :::::.:.:.:::
CCDS25 VSLTGQTWHFEATTYEERDAWVQAIESQILASLQSCESSKNKSRLTSQSEAMALQSIRNM
510 520 530 540 550 560
590 600 610 620 630 640
pF1KSD KGNSICVDCGAPNPTWASLNLGALICIECSGIHRNLGTHLSRVRSLDLDDWPRELTLVLT
.::: :::: . ::.:::::::::.::::::::::::::::::::::::::: :: :..
CCDS25 RGNSHCVDCETQNPNWASLNLGALMCIECSGIHRNLGTHLSRVRSLDLDDWPVELIKVMS
570 580 590 600 610 620
650 660 670 680 690 700
pF1KSD AIGNDTANRVWESDTRGRAKPSRDSSREERESWIRAKYEQLLFLAPLSTSEEPLGRQLWA
.:::. :: ::: ...::.::: ::.:::.: :::::::: :::::: .: ::..:
CCDS25 SIGNELANSVWEESSQGRTKPSVDSTREEKERWIRAKYEQKLFLAPLPCTELSLGQHLLR
630 640 650 660 670 680
710 720 730 740 750 760
pF1KSD AVQAQDVATVLLLLAHARHGPLDTSVEDPQLRSPLHLAAELAHVVITQLLLWYGADVAAR
:. .:. :..:::::. . .. . . . :. :::: . ..::..:::.:::.::.::
CCDS25 ATADEDLRTAILLLAHGSRDEVNETCGEGDGRTALHLACRKGNVVLAQLLIWYGVDVTAR
690 700 710 720 730 740
770 780 790 800 810 820
pF1KSD DAQGRTALFYARQAGSQLCADILLQHGCPGEGGSAATTPSAATTPSITATPSPRRRSSAA
::.: ::: :::::.:: : :.:::.::: : .::.
CCDS25 DAHGNTALAYARQASSQECIDVLLQYGCPDERFVLMATPNLSRRNNNRNNSSGRVPTII
750 760 770 780 790 800
830
pF1KSD SVGRADAPVALV
>>CCDS33408.1 AGAP1 gene_id:116987|Hs108|chr2 (857 aa)
initn: 2655 init1: 1260 opt: 1360 Z-score: 881.9 bits: 174.2 E(32554): 8.4e-43
Smith-Waterman score: 2901; 55.7% identity (79.3% similar) in 840 aa overlap (4-804:4-838)
10 20 30 40 50
pF1KSD MHAQRQFV-VAAVRAEVRRHEVAKQALNRLRKLAERVDDPELQDSIQASLDSIREAVINS
:.:.. ::.:::..: : .. . . .: :::..: ::..:. . .:..: .::
CCDS33 MNYQQQLANSAAIRAEIQRFESVHPNIYSIYELLERVEEPVLQNQIREHVIAIEDAFVNS
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KSD QEWTLSRSIPELRLGVLGDARSGKSSLIHRFLTGSYQVLEKTESEQYKKEMLVDGQTHLV
::::::::.:::..:..:. ::::.:.::.:::.: :. :. ..:::..::::..:.
CCDS33 QEWTLSRSVPELKVGIVGNLASGKSALVHRYLTGTYVQEESPEGGRFKKEIVVDGQSYLL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KSD LIREEAGAPDAKFSGWADAVIFVFSLEDENSFQAVSRLHGQLSSLRGEGRGGLALALVGT
:::.:.: :.:.:. :.:::::::::::: :::.: . ...... :. .. . :.::::
CCDS33 LIRDEGGPPEAQFAMWVDAVIFVFSLEDEISFQTVYHYYSRMANYRNTSE--IPLVLVGT
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KSD QDRISASSPRVVGDARARALCADMKRCSYYETCATYGLNVDRVFQEVAQKVVTLRKQQQL
:: ::...:::. ::::: : :.:::.::::::::::::.::::.::::.:. ::.:::
CCDS33 QDAISSANPRVIDDARARKLSNDLKRCTYYETCATYGLNVERVFQDVAQKIVATRKKQQL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KSD -LAACKSLPSSPSHSAA-STPVAG----QASNGGHT-SDYSSSLPSSPNVGHRELRAEAA
.. :::::.:::::.. :. :.. :.:::: . ::::::.::.:.....::: ..
CCDS33 SIGPCKSLPNSPSHSSVCSAQVSAVHISQTSNGGGSLSDYSSSVPSTPSTSQKELRIDVP
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KSD AVAGLSTPGSLHRAAKRRTSLFANRRGSD--SEKRSLDSRGETTGSGRAIPIKQSFLLKR
.:. :: ... .:::..::..:.::: .::..:.::... ::::::::::..::::
CCDS33 PTANTPTP--VRKQSKRRSNLFTSRKGSDPDKEKKGLESRADSIGSGRAIPIKQGMLLKR
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KSD SGNSLNKEWKKKYVTLSSNGFLLYHPSINDYIHSTHGKEMDLLRTTVKVPGKRPPRAISA
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CCDS33 SGKSLNKEWKKKYVTLCDNGVLTYHPSLHDYMQNVHGKEIDLLRTTVKVPGKRPPRATSA
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460
pF1KSD FGP--SASINGLVKDMSTVQM----GEGLEATTPMPSPSPSPSSLQPPPD---QTSKHLL
.: : . ::: ::::.... :. :. . . . : :.. :: : : .
CCDS33 CAPISSPKTNGLSKDMSSLHISPNSGNVTSASGSQMASGISLVSFNSRPDGMHQRSYSVS
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500
pF1KSD KPDR-----NLAR-ALSTD-------CT-PS--GDLSPLSREPPPSPMV--KKQRRKKLT
. :. .: :.:.: :. :: . :: . .::::: . ::.:::: :
CCDS33 SADQWSEATVIANSAISSDTGLGDSVCSSPSISSTTSP-KLDPPPSPHANRKKHRRKKST
480 490 500 510 520 530
510 520 530 540 550 560
pF1KSD TPSKTEGSAGQAEE--ENFEFLIVSSTGQTWHFEAASFEERDAWVQAIESQILASLQCCE
. :..: .: ::: :::::.::: :::::::::...::::::::::::::::::: ::
CCDS33 SNFKADGLSGTAEEQEENFEFIIVSLTGQTWHFEATTYEERDAWVQAIESQILASLQSCE
540 550 560 570 580 590
570 580 590 600 610 620
pF1KSD SSKVKLRTDSQSEAVAIQAIRNAKGNSICVDCGAPNPTWASLNLGALICIECSGIHRNLG
::: : : :::::.:.:.::: .::: :::: . ::.:::::::::.::::::::::::
CCDS33 SSKNKSRLTSQSEAMALQSIRNMRGNSHCVDCETQNPNWASLNLGALMCIECSGIHRNLG
600 610 620 630 640 650
630 640 650 660 670 680
pF1KSD THLSRVRSLDLDDWPRELTLVLTAIGNDTANRVWESDTRGRAKPSRDSSREERESWIRAK
::::::::::::::: :: :...:::. :: ::: ...::.::: ::.:::.: :::::
CCDS33 THLSRVRSLDLDDWPVELIKVMSSIGNELANSVWEESSQGRTKPSVDSTREEKERWIRAK
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690 700 710 720 730 740
pF1KSD YEQLLFLAPLSTSEEPLGRQLWAAVQAQDVATVLLLLAHARHGPLDTSVEDPQLRSPLHL
::: :::::: .: ::..: :. .:. :..:::::. . .. . . . :. :::
CCDS33 YEQKLFLAPLPCTELSLGQHLLRATADEDLRTAILLLAHGSRDEVNETCGEGDGRTALHL
720 730 740 750 760 770
750 760 770 780 790 800
pF1KSD AAELAHVVITQLLLWYGADVAARDAQGRTALFYARQAGSQLCADILLQHGCPGEGGSAAT
: . ..::..:::.:::.::.::::.: ::: :::::.:: : :.:::.::: : .
CCDS33 ACRKGNVVLAQLLIWYGVDVTARDAHGNTALAYARQASSQECIDVLLQYGCPDERFVLMA
780 790 800 810 820 830
810 820 830
pF1KSD TPSAATTPSITATPSPRRRSSAASVGRADAPVALV
::.
CCDS33 TPNLSRRNNNRNNSSGRVPTII
840 850
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10 20 30
pF1KSD MHAQRQFVV---AAVRAEVRRHEVAKQALNRLRK
.::.. ::.:::..: : .. . .
CCDS43 QLVCGGQFGGAGPGAGGGGGPSQQLAGGPPQQFALSNSAAIRAEIQRFESVHPNIYAIYD
30 40 50 60 70 80
40 50 60 70 80 90
pF1KSD LAERVDDPELQDSIQASLDSIREAVINSQEWTLSRSIPELRLGVLGDARSGKSSLIHRFL
: ::..: ::..:. . ::... .::::::::::.:::..:..:. ::::.:.::.:
CCDS43 LIERIEDLALQNQIREHVISIEDSFVNSQEWTLSRSVPELKVGIVGNLSSGKSALVHRYL
90 100 110 120 130 140
100 110 120 130 140 150
pF1KSD TGSYQVLEKTESEQYKKEMLVDGQTHLVLIREEAGAPDAKFSGWADAVIFVFSLEDENSF
::.: :. :. ..:::..::::..:.:::.:.: :. .:..:.:::.:::::::: ::
CCDS43 TGTYVQEESPEGGRFKKEIVVDGQSYLLLIRDEGGPPELQFAAWVDAVVFVFSLEDEISF
150 160 170 180 190 200
160 170 180 190 200 210
pF1KSD QAVSRLHGQLSSLRGEGRGGLALALVGTQDRISASSPRVVGDARARALCADMKRCSYYET
:.: .: :.:. .. . ..:::::: :::..:::. :.::: : .:.:::.::::
CCDS43 QTVYNYFLRLCSFRNASE--VPMVLVGTQDAISAANPRVIDDSRARKLSTDLKRCTYYET
210 220 230 240 250 260
220 230 240 250 260
pF1KSD CATYGLNVDRVFQEVAQKVVTLRKQQQL-LAACKSLPSSPSHSA---ASTPVA--GQASN
::::::::.::::.::::::.:::.::: .. :::::.:::::: :: :.. .::.:
CCDS43 CATYGLNVERVFQDVAQKVVALRKKQQLAIGPCKSLPNSPSHSAVSAASIPAVHINQATN
270 280 290 300 310 320
270 280 290 300 310 320
pF1KSD GGHT--SDYSSSLPSSPNVGHRELRAEAAAVAGLSTPGSLHRAAKRRTSLFANRRGSD--
:: . ::::::.::.:....:::: :. .:. ::: ... .:::...:..:.:.:
CCDS43 GGGSAFSDYSSSVPSTPSISQRELRIET--IAASSTPTPIRKQSKRRSNIFTSRKGADLD
330 340 350 360 370 380
330 340 350 360 370 380
pF1KSD SEKRSLDSRGETTGSGRAIPIKQSFLLKRSGNSLNKEWKKKYVTLSSNGFLLYHPSINDY
::.. . . .. ::::::::::..::::::.::::::::::::: .::.: ::::..::
CCDS43 REKKAAECKVDSIGSGRAIPIKQGILLKRSGKSLNKEWKKKYVTLCDNGLLTYHPSLHDY
390 400 410 420 430 440
390 400 410 420 430
pF1KSD IHSTHGKEMDLLRTTVKVPGKRPPRAISAFGPSAS--INGLVKDMSTVQMGEGLEA----
... ::::.::::::::::::: ::: : .:..: ::: . :..:.: : :
CCDS43 MQNIHGKEIDLLRTTVKVPGKRLPRATPATAPGTSPRANGLSVERSNTQLGGGTGAPHSA
450 460 470 480 490 500
440 450 460 470 480
pF1KSD -TTPMPSPSPSPSSLQPPPDQTSKHLLKPDRNLARALS--TDCTPSGDLSPLSR------
.. . : : :: : . : . . . : : : : : : :
CCDS43 SSASLHSERPLSSSAWAGPRPEGLHQRSCSVSSADQWSEATTSLPPGMQHPASGPAEVLS
510 520 530 540 550 560
490 500 510 520 530
pF1KSD -----EPPPSPMV--KKQRRKKLTTPSKTEG--SAGQAEEENFEFLIVSSTGQTWHFEAA
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CCDS43 SSPKLDPPPSPHSNRKKHRRKKSTGTPRPDGPSSATEEAEESFEFVVVSLTGQTWHFEAS
570 580 590 600 610 620
540 550 560 570 580 590
pF1KSD SFEERDAWVQAIESQILASLQCCESSKVKLRTDSQSEAVAIQAIRNAKGNSICVDCGAPN
. :::. :::....::::::: :.:.: : : .:. :.:.::.:...:::.:.:: :::
CCDS43 TAEERELWVQSVQAQILASLQGCRSAKDKTRLGNQNAALAVQAVRTVRGNSFCIDCDAPN
630 640 650 660 670 680
600 610 620 630 640 650
pF1KSD PTWASLNLGALICIECSGIHRNLGTHLSRVRSLDLDDWPRELTLVLTAIGNDTANRVWES
: :::::::::.:::::::::.::.:::::::::::::: :: :.::.:: :: :::.
CCDS43 PDWASLNLGALMCIECSGIHRHLGAHLSRVRSLDLDDWPPELLAVMTAMGNALANSVWEG
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660 670 680 690 700 710
pF1KSD DTRGRAKPSRDSSREERESWIRAKYEQLLFLAPLSTSEEPLGRQLWAAVQAQDVATVLLL
: .::. :. :::.: :::::::: :::::: .:. :::.:: :: .:. ...:
CCDS43 ALGGYSKPGPDACREEKERWIRAKYEQKLFLAPLPSSDVPLGQQLLRAVVEDDLRLLVML
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pF1KSD LAHARHGPLDTSVEDPQLRSPLHLAAELAHVVITQLLLWYGADVAARDAQGRTALFYARQ
:::. . .. . : . :. :::.. .:.::.::::.:::.:: .:::.: : : :::.
CCDS43 LAHGSKEEVNETYGDGDGRTALHLSSAMANVVFTQLLIWYGVDVRSRDARGLTPLAYARR
810 820 830 840 850 860
780 790 800 810 820 830
pF1KSD AGSQLCADILLQHGCPGEGGSAATTPS----AATTPSITATPSPRRRSSAASVGRADAPV
:::: :::::.:::::::: . : ::. .:.:: ::
CCDS43 AGSQECADILIQHGCPGEGCGLAPTPNREPANGTNPSAELHRSPSLL
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pF1KSD ALV
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pF1KSD SLEDENSFQAVSRLHGQLSSLRGEGRGGLALALVGTQDRISASSPRVVGDARARALCADM
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CCDS64 MVLVGTQDAISAANPRVIDDSRARKLSTDL
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210 220 230 240 250
pF1KSD KRCSYYETCATYGLNVDRVFQEVAQKVVTLRKQQQL-LAACKSLPSSPSHSA---ASTPV
:::.::::::::::::.::::.::::::.:::.::: .. :::::.:::::: :: :.
CCDS64 KRCTYYETCATYGLNVERVFQDVAQKVVALRKKQQLAIGPCKSLPNSPSHSAVSAASIPA
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pF1KSD A--GQASNGGHT--SDYSSSLPSSPNVGHRELRAEAAAVAGLSTPGSLHRAAKRRTSLFA
. .::.::: . ::::::.::.:....:::: :. .:. ::: ... .:::...:.
CCDS64 VHINQATNGGGSAFSDYSSSVPSTPSISQRELRIET--IAASSTPTPIRKQSKRRSNIFT
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pF1KSD NRRGSD--SEKRSLDSRGETTGSGRAIPIKQSFLLKRSGNSLNKEWKKKYVTLSSNGFLL
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CCDS64 SRKGADLDREKKAAECKVDSIGSGRAIPIKQGILLKRSGKSLNKEWKKKYVTLCDNGLLT
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pF1KSD YHPSINDYIHSTHGKEMDLLRTTVKVPGKRPPRAISAFGPSAS--INGLVKDMSTVQMGE
::::..::... ::::.::::::::::::: ::: : .:..: ::: . :..:.:
CCDS64 YHPSLHDYMQNIHGKEIDLLRTTVKVPGKRLPRATPATAPGTSPRANGLSVERSNTQLGG
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pF1KSD GLEATTPMPSPSPSPSSLQPPPDQTSKHLLKPDRNLARALSTDCTPSGDLSPLSREPPPS
: ::
CCDS64 GTEA--------------------------------------------------------
270
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pF1KSD PMVKKQRRKKLTTPSKTEGSAGQAEEENFEFLIVSSTGQTWHFEAASFEERDAWVQAIES
::.:::..:: :::::::::.. :::. :::....
CCDS64 -------------------------EESFEFVVVSLTGQTWHFEASTAEERELWVQSVQA
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pF1KSD QILASLQCCESSKVKLRTDSQSEAVAIQAIRNAKGNSICVDCGAPNPTWASLNLGALICI
::::::: :.:.: : : .:. :.:.::.:...:::.:.:: :::: :::::::::.::
CCDS64 QILASLQGCRSAKDKTRLGNQNAALAVQAVRTVRGNSFCIDCDAPNPDWASLNLGALMCI
310 320 330 340 350 360
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pF1KSD ECSGIHRNLGTHLSRVRSLDLDDWPRELTLVLTAIGNDTANRVWESDTRGRAKPSRDSSR
:::::::.::.:::::::::::::: :: :.::.:: :: :::. : .::. :. :
CCDS64 ECSGIHRHLGAHLSRVRSLDLDDWPPELLAVMTAMGNALANSVWEGALGGYSKPGPDACR
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pF1KSD EERESWIRAKYEQLLFLAPLSTSEEPLGRQLWAAVQAQDVATVLLLLAHARHGPLDTSVE
::.: :::::::: :::::: .:. :::.:: :: .:. ...::::. . .. .
CCDS64 EEKERWIRAKYEQKLFLAPLPSSDVPLGQQLLRAVVEDDLRLLVMLLAHGSKEEVNETYG
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pF1KSD DPQLRSPLHLAAELAHVVITQLLLWYGADVAARDAQGRTALFYARQAGSQLCADILLQHG
: . :. :::.. .:.::.::::.:::.:: .:::.: : : :::.:::: :::::.:::
CCDS64 DGDGRTALHLSSAMANVVFTQLLIWYGVDVRSRDARGLTPLAYARRAGSQECADILIQHG
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pF1KSD CPGEGGSAATTPS----AATTPSITATPSPRRRSSAASVGRADAPVALV
::::: . : ::. .:.:: ::
CCDS64 CPGEGCGLAPTPNREPANGTNPSAELHRSPSLL
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pF1KSD MHAQRQFV-VAAVRAEVRRHEVAKQALNRLRKLAERVDDPELQDSIQASLDSIREAVINS
:. :.:.. ::.:::..: : .. . . .: :::..: ::..:. . .:..: .::
CCDS58 MNYQQQLANSAAIRAEIQRFESVHPNIYSIYELLERVEEPVLQNQIREHVIAIEDAFVNS
10 20 30 40 50 60
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pF1KSD QEWTLSRSIPELRLGVLGDARSGKSSLIHRFLTGSYQVLEKTESEQYKKEMLVDGQTHLV
::::::::.:::..:..:. ::::.:.::.:::.: :. :. ..:::..::::..:.
CCDS58 QEWTLSRSVPELKVGIVGNLASGKSALVHRYLTGTYVQEESPEGGRFKKEIVVDGQSYLL
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pF1KSD LIREEAGAPDAKFSGWADAVIFVFSLEDENSFQAVSRLHGQLSSLRGEGRGGLALALVGT
:::.:.: :.:.:. :.:::::::::::: :::.: . ...... :. .. . :.::::
CCDS58 LIRDEGGPPEAQFAMWVDAVIFVFSLEDEISFQTVYHYYSRMANYRNTSE--IPLVLVGT
130 140 150 160 170
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pF1KSD QDRISASSPRVVGDARARALCADMKRCSYYETCATYGLNVDRVFQEVAQKVVTLRKQQQL
:: ::...:::. ::::: : :.:::.::::::::::::.::::.::::.:. ::.:::
CCDS58 QDAISSANPRVIDDARARKLSNDLKRCTYYETCATYGLNVERVFQDVAQKIVATRKKQQL
180 190 200 210 220 230
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pF1KSD -LAACKSLPSSPSHSAA-STPVAG----QASNGGHT-SDYSSSLPSSPNVGHRELRAEAA
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CCDS58 SIGPCKSLPNSPSHSSVCSAQVSAVHISQTSNGGGSLSDYSSSVPSTPSTSQKELRIDVP
240 250 260 270 280 290
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pF1KSD AVAGLSTPGSLHRAAKRRTSLFANRRGSD--SEKRSLDSRGETTGSGRAIPIKQSFLLKR
.:. :: ... .:::..::..:.::: .::..:.::... ::::::::::..
CCDS58 PTANTPTP--VRKQSKRRSNLFTSRKGSDPDKEKKGLESRADSIGSGRAIPIKQGLPFFV
300 310 320 330 340 350
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pF1KSD SGNSLNKEWKKKYVTLSSNGFLLYHPSINDYIHSTHGKEMDLLRTTVKVPGKRPPRAISA
CCDS58 LALTASTYLRPAGARARQSSPWPGPRGGQTSPHCAEGPQSAQLSGAMMN
360 370 380 390 400
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pF1KSD YGLNVDRVFQEVAQKVVTLRKQQQLLAACKSLPSSPSHS-AAST-PVAGQASNGGHTSDY
:.:. :: :.:: . . ..:: ..:
CCDS72 AIQHYLTMTIISVTLEIPHHITQRDADRSLSIPDEQLHSFAVSTVHIMKKRNGGGSLNNY
140 150 160 170 180 190
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pF1KSD SSSLPSSPNVGHRELRAEAAAVAGLSTPGSLHRAAKRRTSLFANRRGSD--SEKRSLDSR
:::.::.:...... . . .: .:: . . . : ..::....::: .:... ...
CCDS72 SSSIPSTPSTSQEDPQFSVPPTA--NTPTPVCKRSMRWSNLFTSEKGSDPDKERKAPENH
200 210 220 230 240
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pF1KSD GETTGSGRAIPIKQSFLLKRSGNSLNKEWKKKYVTLSSNGFLLYHPSINDYIHSTHGKEM
..: ::::::::::..::::::. : : :::::::: ::: : :. :..::... : ::.
CCDS72 ADTIGSGRAIPIKQGMLLKRSGKWL-KTWKKKYVTLCSNGVLTYYSSLGDYMKNIHKKEI
250 260 270 280 290 300
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pF1KSD DLLRTTVKVPGKRPPRAISAFGP--SASINGLVKDMSTVQMGEGLEATTPMPSPSPSPSS
:: .:.::::: : : :: : ... ::: :::.: .:... ::: ::
CCDS72 DLQTSTIKVPGKWPSLATSACTPISTSKSNGLSKDMDT-GLGDSI-------CFSPSISS
310 320 330 340 350 360
450 460 470 480 490 500
pF1KSD LQPPPDQTSKHLLKPDRNLARALSTDCTPSGDLSPLSREPPPSPMVKKQRRKKLTTPSKT
: . .::::: ..:... : .:.
CCDS72 TTSP--------------------------------KLNPPPSPHANKKKHLK----KKS
370 380
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pF1KSD EGSAGQAEEENFEFLIVSSTGQTWHFEAASFEERDAWVQAIESQILASLQCCESSKVKLR
.. :.:::.:::::::::...::::::::::.:::::::: ::::: : .
CCDS72 TNN----------FMIVSATGQTWHFEATTYEERDAWVQAIQSQILASLQSCESSKSKSQ
390 400 410 420 430
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pF1KSD TDSQSEAVAIQAIRNAKGNSICVDCGAPNPTWASLNLGALICIECSGIHRNLGTHLSRVR
:::.:.:.:.:.: .::. :::: . :: :::::::.:.:::::::::.:::.:::::
CCDS72 LTSQSKAMALQSIQNMRGNAHCVDCETQNPKWASLNLGVLMCIECSGIHRSLGTRLSRVR
440 450 460 470 480 490
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pF1KSD SLDLDDWPRELTLVLTAIGNDTANRVWESDTRGRAKPSRDSSREERESWIRAKYEQLLFL
::.::::: :: :...:::: :: .::....:..:::. :.:::.: :::.:::. :::
CCDS72 SLELDDWPVELRKVMSSIGNDLANSIWEGSSQGQTKPSEKSTREEKERWIRSKYEEKLFL
500 510 520 530 540 550
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pF1KSD APLSTSEEPLGRQLWAAVQAQDVATVLLLLAHARHGPLDTSVEDPQLRSPLHLAAELAHV
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CCDS72 APLPCTELSLGQQLLRATADEDLQTAILLLAHGSREEVNETCGEGDGCTALHLACRKGNV
560 570 580 590 600 610
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pF1KSD VITQLLLWYGADVAARDAQGRTALFYARQAGSQLCADILLQHGCPGEGGSAATTPSAATT
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CCDS72 VLAQLLIWYGVDVMARDAHGNTALTYARQASSQECINVLLQYGCPDKCV
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18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]