Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA0149
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0149, 830 aa
1>>>pF1KSDA0149 830 - 830 aa - 830 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.6472+/-0.00111; mu= 8.9212+/- 0.067
mean_var=341.4895+/-64.303, 0's: 0 Z-trim(115.1): 193 B-trim: 0 in 0/53
Lambda= 0.069404
statistics sampled from 15492 (15693) to 15492 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.782), E-opt: 0.2 (0.482), width: 16
Scan time: 4.950
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS11007.1 SCARF1 gene_id:8578|Hs108|chr17 ( 830) 6252 640.6 3.3e-183
CCDS45564.1 SCARF1 gene_id:8578|Hs108|chr17 ( 569) 4021 417.0 4.6e-116
CCDS13779.2 SCARF2 gene_id:91179|Hs108|chr22 ( 871) 2271 242.0 3.4e-63
CCDS46666.1 SCARF2 gene_id:91179|Hs108|chr22 ( 866) 2245 239.4 2e-62
CCDS10213.2 MEGF11 gene_id:84465|Hs108|chr15 (1044) 1025 117.3 1.3e-25
CCDS30892.1 PEAR1 gene_id:375033|Hs108|chr1 (1037) 980 112.8 3.1e-24
CCDS4142.1 MEGF10 gene_id:84466|Hs108|chr5 (1140) 950 109.9 2.6e-23
CCDS41237.1 MEGF6 gene_id:1953|Hs108|chr1 (1541) 776 92.6 5.5e-18
CCDS78055.1 MEGF10 gene_id:84466|Hs108|chr5 ( 567) 669 81.3 5e-15
>>CCDS11007.1 SCARF1 gene_id:8578|Hs108|chr17 (830 aa)
initn: 6252 init1: 6252 opt: 6252 Z-score: 3402.6 bits: 640.6 E(32554): 3.3e-183
Smith-Waterman score: 6252; 99.5% identity (99.9% similar) in 830 aa overlap (1-830:1-830)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MGLGLLLPLLLLWTRGTQGSELDPKGQHVCVASSPSAELQCCAGWRQKDQECTIPICEGP
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CCDS11 MGLGLLLPLLLLWTRGTQGSELDPKGQHVCVASSPSAELQCCAGWRQKDQECTIPICEGP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD DACQKDEVCVKPGLCRCKPGFFGAHCSSRCPGQYWGPDCRESCPCHPHGQCEPATGACQC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 DACQKDEVCVKPGLCRCKPGFFGAHCSSRCPGQYWGPDCRESCPCHPHGQCEPATGACQC
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD QADRWGARCEFPCACGPHGRCDPATGVCHCEPGWWSSTCRRPCQCNTAAARCEQATGACV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 QADRWGARCEFPCACGPHGRCDPATGVCHCEPGWWSSTCRRPCQCNTAAARCEQATGACV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD CKPGWWGRRCSFRCNCHGSPCEQDSGRCACRPGWWGPECQQQCECVRGRCSAASGECTCP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 CKPGWWGRRCSFRCNCHGSPCEQDSGRCACRPGWWGPECQQQCECVRGRCSAASGECTCP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD PGFRGARCELPCPAGSHGVQCAHSCGRCKHNEPCSPDTGSCESCEPGWNGTQCQQPCLPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 PGFRGARCELPCPAGSHGVQCAHSCGRCKHNEPCSPDTGSCESCEPGWNGTQCQQPCLPG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD TFGESCEQQCPHCRHGEACEPDTGHCQRCDPGWLGPRCEDPCPTGTFGEDCGSTCPTCVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 TFGESCEQQCPHCRHGEACEPDTGHCQRCDPGWLGPRCEDPCPTGTFGEDCGSTCPTCVQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD GSCDTVTGDCVCSAGYWGPSCNASCPAGFHGNNCSVPCECPEGLCHPVSGSCQPGSGSRD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GSCDTVTGDCVCSAGYWGPSCNASCPAGFHGNNCSVPCECPEGLCHPVSGSCQPGSGSRD
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD TALIVGSLVPLLLLFLGLACCACCCWAPRSDLKDRPARDGATVSRMKLQVWGTLTSLGST
::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 TALIAGSLVPLLLLFLGLACCACCCWAPRSDLKDRPARDGATVSRMKLQVWGTLTSLGST
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD LPCRSLSSHKLPWVTVSHHDPEVPFNHSFIEPPSAGWATDDSFSSDPESGEADEVPAYCV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LPCRSLSSHKLPWVTVSHHDPEVPFNHSFIEPPSAGWATDDSFSSDPESGEADEVPAYCV
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD PPQEGMVPVAQAGSSEASLAAGAFPPPEDASTPFAIPRTSSLARAKRPSVSFAEGTKFAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 PPQEGMVPVAQAGSSEASLAAGAFPPPEDASTPFAIPRTSSLARAKRPSVSFAEGTKFAP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD QSRRSSGELSSPLRKPKRLSRGAQSGPEGREAEESTGPDEAEAPESFPAAASPGDSATGH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::
CCDS11 QSRRSSGELSSPLRKPKRLSRGAQSGPEGREAEESTGPEEAEAPESFPAAASPGDSATGH
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD RWPPLGSRTVAEHVEAIEGSVQESSGPVTTIYMLAGKPRGSEGPVRSVFRHFGSFQKGQA
: ::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 RRPPLGGRTVAEHVEAIEGSVQESSGPVTTIYMLAGKPRGSEGPVRSVFRHFGSFQKGQA
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD EAKVKRAIPKPPRQALNRKKGSPGLASGSVGQSPNSAPKAGLPGATGPMAVRPEEAVRGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 EAKVKRAIPKPPRQALNRKKGSPGLASGSVGQSPNSAPKAGLPGATGPMAVRPEEAVRGL
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830
pF1KSD GAGTESSRRAQEPVSGCGSPEQDPQKQAEEERQEEPEYENVVPISRPPEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GAGTESSRRAQEPVSGCGSPEQDPQKQAEEERQEEPEYENVVPISRPPEP
790 800 810 820 830
>>CCDS45564.1 SCARF1 gene_id:8578|Hs108|chr17 (569 aa)
initn: 4607 init1: 4021 opt: 4021 Z-score: 2197.1 bits: 417.0 E(32554): 4.6e-116
Smith-Waterman score: 4021; 99.0% identity (99.4% similar) in 501 aa overlap (1-501:1-501)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MGLGLLLPLLLLWTRGTQGSELDPKGQHVCVASSPSAELQCCAGWRQKDQECTIPICEGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MGLGLLLPLLLLWTRGTQGSELDPKGQHVCVASSPSAELQCCAGWRQKDQECTIPICEGP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD DACQKDEVCVKPGLCRCKPGFFGAHCSSRCPGQYWGPDCRESCPCHPHGQCEPATGACQC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 DACQKDEVCVKPGLCRCKPGFFGAHCSSRCPGQYWGPDCRESCPCHPHGQCEPATGACQC
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD QADRWGARCEFPCACGPHGRCDPATGVCHCEPGWWSSTCRRPCQCNTAAARCEQATGACV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 QADRWGARCEFPCACGPHGRCDPATGVCHCEPGWWSSTCRRPCQCNTAAARCEQATGACV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD CKPGWWGRRCSFRCNCHGSPCEQDSGRCACRPGWWGPECQQQCECVRGRCSAASGECTCP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 CKPGWWGRRCSFRCNCHGSPCEQDSGRCACRPGWWGPECQQQCECVRGRCSAASGECTCP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD PGFRGARCELPCPAGSHGVQCAHSCGRCKHNEPCSPDTGSCESCEPGWNGTQCQQPCLPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 PGFRGARCELPCPAGSHGVQCAHSCGRCKHNEPCSPDTGSCESCEPGWNGTQCQQPCLPG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD TFGESCEQQCPHCRHGEACEPDTGHCQRCDPGWLGPRCEDPCPTGTFGEDCGSTCPTCVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 TFGESCEQQCPHCRHGEACEPDTGHCQRCDPGWLGPRCEDPCPTGTFGEDCGSTCPTCVQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD GSCDTVTGDCVCSAGYWGPSCNASCPAGFHGNNCSVPCECPEGLCHPVSGSCQPGSGSRD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GSCDTVTGDCVCSAGYWGPSCNASCPAGFHGNNCSVPCECPEGLCHPVSGSCQPGSGSRD
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD TALIVGSLVPLLLLFLGLACCACCCWAPRSDLKDRPARDGATVSRMKLQVWGTLTSLGST
::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 TALIAGSLVPLLLLFLGLACCACCCWAPRSDLKDRPARDGATVSRMKLQVWGTLTSLGST
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD LPCRSLSSHKLPWVTVSHHDPEVPFNHSFIEPPSAGWATDDSFSSDPESGEADEVPAYCV
:::::::::::::::.: :
CCDS45 LPCRSLSSHKLPWVTASSSRPLPAGPLMTPSHPILSLERQMRFLPTVCHPKKGWSLWPRQ
490 500 510 520 530 540
>>CCDS13779.2 SCARF2 gene_id:91179|Hs108|chr22 (871 aa)
initn: 1779 init1: 1221 opt: 2271 Z-score: 1248.1 bits: 242.0 E(32554): 3.4e-63
Smith-Waterman score: 2322; 40.3% identity (61.8% similar) in 856 aa overlap (6-828:28-852)
10 20 30
pF1KSD MGLGLLLPLLLLWT--RGTQGSELDPKGQHVCVASSPS
:: ::::: . .::.:.:..:: : :.
CCDS13 MEGAGPRGAGPARRRGAGGPPSPLLPSLLLLLLLWMLPDTVAPQELNPRGRNVCRA--PG
10 20 30 40 50
40 50 60 70 80 90
pF1KSD AELQ-CCAGWRQKDQECTIPICEGPDACQKDEVCVKPGLCRCKPGFFGAHCSSRCPGQYW
... :::::::. .:: : .::: ..:...::::.:: :::. :.:::.:...:: :.:
CCDS13 SQVPTCCAGWRQQGDECGIAVCEGNSTCSENEVCVRPGECRCRHGYFGANCDTKCPRQFW
60 70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KSD GPDCRESCPCHPHGQCEPATGACQCQADRWGARCEFPCACGPHGRCDPATGVCHCEPGWW
::::.: : :::::::: .:: : :.: ::::::: : : :: : : .:.:.::::::
CCDS13 GPDCKELCSCHPHGQCEDVTGQCTCHARRWGARCEHACQC-QHGTCHPRSGACRCEPGWW
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KSD SSTCRRPCQCNTAAARCEQATGACVCKPGWWGRRCSFRCNCHGSPCEQDSGRCACRPGWW
.. : : : .:..::. ::::.:. ::::: :. .: :..:::::.:::: :: .
CCDS13 GAQCASACYC-SATSRCDPQTGACLCHAGWWGRSCNNQCACNSSPCEQQSGRCQCRERTF
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KSD GPECQQQCECVRGRCSAASGECTCPPGFRGARCELPCPAGSHGVQCAHSCGRCKHNEPCS
: .:.. :.: :::: ..: :.: ::.:: :. ::::: .:. : . ::.:: ..::.
CCDS13 GARCDRYCQCFRGRCHPVDGTCACEPGYRGKYCREPCPAGFYGLGCRRRCGQCKGQQPCT
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KSD PDTGSCESCEPGWNGTQCQQPCLPGTFGESCEQQCPHCRHGEACEPDTGHCQRCDPGWLG
: : .::::::::.:.::: : .::.: ..:: :: :.::. ::.: ::. ::.:
CCDS13 VAEGRCLTCEPGWNGTKCDQPCATGFYGEGCSHRCPPCRDGHACNHVTGKCTRCNAGWIG
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KSD PRCEDPCPTGTFGEDCGSTCPTCVQGSCDTVTGDCVCSAGYWGPSCNASCPAGFHGNNCS
::: : .::.::::. .: : .: :: .: :.:: : :: ::..:: :.:: .:.
CCDS13 DRCETKCSNGTYGEDCAFVCADCGSGHCDFQSGRCLCSPGVHGPHCNVTCPPGLHGADCA
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KSD VPCECPEGLCHPVSGSCQPGSGSRDTALIVGSLVPLLL-LFLGLACCACCCWAPRSDLKD
: : : : ::.:.:. ...: .. .:.:. ::. :.:.: : : : . .
CCDS13 QACSCHEDTCDPVTGACHLETNQRKGVMGAGALLVLLVCLLLSLLGCCCACRGKDPTRRP
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490 500 510
pF1KSD RPARDGATVSRMKL--QVWGTLTSLGSTLPCRSLSSHKLPWVTVSHHDPEVPFNHSFIEP
:: :. ...: : .. : .. .. :: : .::: :.:.::: . .: ::.::
CCDS13 RPRRE-LSLGRKKAPHRLCGRFSRISMKLPRIPLRRQKLPKVVVAHHDLDNTLNCSFLEP
480 490 500 510 520 530
520 530 540 550 560
pF1KSD PSA------GWATDDSFSSDPESGEADEVPAYCVP----PQEGMVPVAQAGSSEASLAAG
::. .:.. :::: .:: :.:::: : :. : . . .:: : .
CCDS13 PSGLEQPSPSWSSRASFSS---FDTTDEGPVYCVPHEEAPAESRDPEVPTVPAEAP-APS
540 550 560 570 580 590
570 580 590 600 610 620
pF1KSD AFPPPEDASTPFAIPRTSSLARAKRPSVSFAEGTKFAPQSRRSSGELSSPLRKPKRLSRG
: ::. ::: .: . ..: :.: .:: : .: . : . : : : :
CCDS13 PVPLTTPASAEEAIPLPAS-SDSER-SASSVEGPGGALYARVARRE-ARPARA--RGEIG
600 610 620 630 640
630 640 650 660 670 680
pF1KSD AQSGPEGREAEESTGPDEAEAPESFPAAASPGDSATGH--RWPPLGSRTVAEHVEAIEGS
. : . : .. :: : :. .. . .:.:. :: ::... . .
CCDS13 GLSLSPSPERRKPPPPDPATKPKVSWIHGKHSAAAAGRAPSPPPPGSEAAPSPSKRKRTP
650 660 670 680 690 700
690 700 710 720 730 740
pF1KSD VQESSGPVTTIYMLAGKPRGSEGPVRSVFRHFGSFQKGQAEAKVKRAIPKPPRQALNRKK
..:. : :.:: . : : : . : :.::: : : .
CCDS13 SDKSAHTVEH-----GSPRTRDPTPRP---------PGLPEEATALAAPSPPR-ARARGR
710 720 730 740 750
750 760 770 780
pF1KSD GSPGLASGS-VGQSPNSAPKAG------LPGATGPMAVRPEEAVRGLG-----AGTESSR
: ::: . .: : :::.:. : : : .. : : :. . : : ....
CCDS13 G-PGLLEPTDAGGPPRSAPEAASMLAAELRGKTRSLG-RAEVALGAQGPREKPAPPQKAK
760 770 780 790 800
790 800 810 820 830
pF1KSD RAQEPVSGCGSPEQDPQKQAEEERQEEPEYENV---VPISRPPEP
:. :.: .: :. . : :. .::..::
CCDS13 RSVPPASPARAPPATETPGPEKAATDLPAPETPRKKTPIQKPPRKKSREAAGELGRAGAP
810 820 830 840 850 860
CCDS13 TL
870
>>CCDS46666.1 SCARF2 gene_id:91179|Hs108|chr22 (866 aa)
initn: 1891 init1: 1221 opt: 2245 Z-score: 1234.1 bits: 239.4 E(32554): 2e-62
Smith-Waterman score: 2312; 40.6% identity (62.1% similar) in 855 aa overlap (6-828:28-847)
10 20 30
pF1KSD MGLGLLLPLLLLWT--RGTQGSELDPKGQHVCVASSPS
:: ::::: . .::.:.:..:: : :.
CCDS46 MEGAGPRGAGPARRRGAGGPPSPLLPSLLLLLLLWMLPDTVAPQELNPRGRNVCRA--PG
10 20 30 40 50
40 50 60 70 80 90
pF1KSD AELQ-CCAGWRQKDQECTIPICEGPDACQKDEVCVKPGLCRCKPGFFGAHCSSRCPGQYW
... :::::::. .:: : .::: ..:...::::.:: :::. :.:::.:...:: :.:
CCDS46 SQVPTCCAGWRQQGDECGIAVCEGNSTCSENEVCVRPGECRCRHGYFGANCDTKCPRQFW
60 70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KSD GPDCRESCPCHPHGQCEPATGACQCQADRWGARCEFPCACGPHGRCDPATGVCHCEPGWW
::::.: : :::::::: .:: : :.: ::::::: : : :: : : .:.:.::::::
CCDS46 GPDCKELCSCHPHGQCEDVTGQCTCHARRWGARCEHACQC-QHGTCHPRSGACRCEPGWW
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KSD SSTCRRPCQCNTAAARCEQATGACVCKPGWWGRRCSFRCNCHGSPCEQDSGRCACRPGWW
.. : : : .:..::. ::::.:. ::::: :. .: :..:::::.:::: :: .
CCDS46 GAQCASACYC-SATSRCDPQTGACLCHAGWWGRSCNNQCACNSSPCEQQSGRCQCRERTF
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KSD GPECQQQCECVRGRCSAASGECTCPPGFRGARCELPCPAGSHGVQCAHSCGRCKHNEPCS
: .:.. :.: :::: ..: :.: ::.:: :. ::::: .:. : . ::.:: ..::.
CCDS46 GARCDRYCQCFRGRCHPVDGTCACEPGYRGKYCREPCPAGFYGLGCRRRCGQCKGQQPCT
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KSD PDTGSCESCEPGWNGTQCQQPCLPGTFGESCEQQCPHCRHGEACEPDTGHCQRCDPGWLG
: : .::::::::.:.::: : .::.: ..:: :: :.::. ::.: ::. ::.:
CCDS46 VAEGRCLTCEPGWNGTKCDQPCATGFYGEGCSHRCPPCRDGHACNHVTGKCTRCNAGWIG
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KSD PRCEDPCPTGTFGEDCGSTCPTCVQGSCDTVTGDCVCSAGYWGPSCNASCPAGFHGNNCS
::: : .::.::::. .: : .: :: .: :.:: : :: ::..:: :.:: .:.
CCDS46 DRCETKCSNGTYGEDCAFVCADCGSGHCDFQSGRCLCSPGVHGPHCNVTCPPGLHGADCA
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KSD VPCECPEGLCHPVSGSCQPGSGSRDTALIVGSLVPLLLLFLGLACCACCCWAPRSDLKDR
: : : : ::.:.:. ...: .. .:.:. ::. .: :. .::: : :. ::
CCDS46 QACSCHEDTCDPVTGACHLETNQRKGVMGAGALLVLLVCLL-LSLLGCCC-ACRG--KD-
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490 500 510
pF1KSD PARDGATVSRMKL--QVWGTLTSLGSTLPCRSLSSHKLPWVTVSHHDPEVPFNHSFIEPP
:.: ...: : .. : .. .. :: : .::: :.:.::: . .: ::.:::
CCDS46 PTRRELSLGRKKAPHRLCGRFSRISMKLPRIPLRRQKLPKVVVAHHDLDNTLNCSFLEPP
480 490 500 510 520 530
520 530 540 550 560
pF1KSD SA------GWATDDSFSSDPESGEADEVPAYCVP----PQEGMVPVAQAGSSEASLAAGA
:. .:.. :::: .:: :.:::: : :. : . . .:: : .
CCDS46 SGLEQPSPSWSSRASFSS---FDTTDEGPVYCVPHEEAPAESRDPEVPTVPAEAP-APSP
540 550 560 570 580
570 580 590 600 610 620
pF1KSD FPPPEDASTPFAIPRTSSLARAKRPSVSFAEGTKFAPQSRRSSGELSSPLRKPKRLSRGA
: ::. ::: .: . ..: :.: .:: : .: . : . : : : :.
CCDS46 VPLTTPASAEEAIPLPAS-SDSER-SASSVEGPGGALYARVARRE-ARPARA--RGEIGG
590 600 610 620 630 640
630 640 650 660 670 680
pF1KSD QSGPEGREAEESTGPDEAEAPESFPAAASPGDSATGH--RWPPLGSRTVAEHVEAIEGSV
: . : .. :: : :. .. . .:.:. :: ::... . .
CCDS46 LSLSPSPERRKPPPPDPATKPKVSWIHGKHSAAAAGRAPSPPPPGSEAAPSPSKRKRTPS
650 660 670 680 690 700
690 700 710 720 730 740
pF1KSD QESSGPVTTIYMLAGKPRGSEGPVRSVFRHFGSFQKGQAEAKVKRAIPKPPRQALNRKKG
..:. : :.:: . : : : . : :.::: : : .:
CCDS46 DKSAHTVEH-----GSPRTRDPTPRP---------PGLPEEATALAAPSPPR-ARARGRG
710 720 730 740
750 760 770 780
pF1KSD SPGLASGS-VGQSPNSAPKAG------LPGATGPMAVRPEEAVRGLG-----AGTESSRR
::: . .: : :::.:. : : : .. : : :. . : : ....:
CCDS46 -PGLLEPTDAGGPPRSAPEAASMLAAELRGKTRSLG-RAEVALGAQGPREKPAPPQKAKR
750 760 770 780 790 800
790 800 810 820 830
pF1KSD AQEPVSGCGSPEQDPQKQAEEERQEEPEYENV---VPISRPPEP
. :.: .: :. . : :. .::..::
CCDS46 SVPPASPARAPPATETPGPEKAATDLPAPETPRKKTPIQKPPRKKSREAAGELGRAGAPT
810 820 830 840 850 860
CCDS46 L
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.:. ::. :. .:. . .. : : :
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.. .: . : : ::. .: . : : : ::. :: :.. :: .: .: ..:
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::: :::. .:: :.: : : ::. : :. : :.:.:.::.:.:
CCDS10 PCHHGGQCDHVTGQCHCTAGYMGDRCQEECPFGSFGFQCSQHCDCHNGGQCSPTTGACEC
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160 170 180 190
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:::. . :.. :: :.. . :. .::::.:.::: :..:.
CCDS10 EPGYKGPRCQERLCPEGLHGPGCTLPCPCDADNTISCHPVTGACTCQPGWSGHHCNESCP
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200 210 220
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. :.:. :. :.. .: :.: ::. .::.:.. : : :
CCDS10 VGYYGDGCQLPCTCQNGADCHSITGGCTCAPGFMGEVCAVSCAAGTYGPNCSSICSCNNG
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230 240 250 260 270 280
pF1KSD -RCSAASGECTCPPGFRGARCELPCPAGSHGVQCAHSCGRCKHNEPCSPDTGSCESCEPG
:: ..: ::: :..: : ::::.:. :..: .:: : .. ::: ::: :: ::
CCDS10 GTCSPVDGSCTCKEGWQGLDCTLPCPSGTWGLNCNESC-TCANGAACSPIDGSC-SCTPG
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pF1KSD WNGTQCQQPCLPGTFGESCEQQCPHCRHGEACEPDTGHCQRCDPGWLGPRCEDPCPTGTF
: : :. :: :::: .: ..: : :...:.: :::: : :: : ::.. :: : .
CCDS10 WLGDTCELPCPDGTFGLNCSEHCD-CSHADGCDPVTGHCC-CLAGWTGIRCDSTCPPGRW
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pF1KSD GEDCGSTCPTCVQGSCDTVTGDCVCSAGYWGPSCNASCPAGFHGNNCSVPCE-CPEGL--
: .:. .: :::. :.: :. :. :: :. :: ::.:..:. :: : ..
CCDS10 GPNCSVSCSCENGGSCSPEDGSCECAPGFRGPLCQRICPPGFYGHGCAQPCPLCVHSSRP
580 590 600 610 620 630
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pF1KSD CHPVSGSCQ--PG-SGSRDTALIVGSLVPLLLLFLGLAC---CACCCWAPRSDLKDRPAR
:: .:: :. :: ::. . . .:. ..: : :.:
CCDS10 CHHISGICECLPGFSGALCNQVCAGG-------YFGQDCAQLCSCANNGTCSPIDGSCQC
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460 470 480 490 500 510
pF1KSD DGATVSRMKLQVWGTLTSLGSTLPCRSLSSHKLPWVTVSHHDPEVPFNHSFIEPPSAGWA
CCDS10 FPGWIGKDCSQACPPGFWGPACFHACSCHNGASCSAEDGACHCTPGWTGLFCTQRCPAAF
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10 20 30 40
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.:. ::. : : : ..:: ...: :
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. .: . .::. : : : : : ::..:. :: :: . ::.: . :
CCDS30 -------TSGFFCPSTHSCQNGGVFQTPQGSCSCPPGWMGTICSLPCPEGFHGPNCSQEC
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:: : :. :: :.: : :: : : : :.: .:: ::.:.: :
CCDS30 RCHNGGLCDRFTGQCRCAPGYTGDRCREECPVGRFGQDCAETCDCAPDARCFPANGACLC
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pF1KSD E-------------P-GWWSSTCRRPCQCNTAAA-RCEQATGACVCKPGWWGRRCSFRC-
: : :... .:. :: :. . :. .: : : ::: : .:. :
CCDS30 EHGFTGDRCTDRLCPDGFYGLSCQAPCTCDREHSLSCHPMNGECSCLPGWAGLHCNESCP
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pF1KSD ----------NC---HGSPCEQDSGRCACRPGWWGPECQQ-------------QCECVRG
.: ::. :. :: : : ::. ::.: . .: : .
CCDS30 QDTHGPGCQEHCLCLHGGVCQATSGLCQCAPGYTGPHCASLCPPDTYGVNCSARCSCENA
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pF1KSD -RCSAASGECTCPPGFRGARCELPCPAGSHGVQCAHSCGRCKHNEPCSPDTGSCESCEPG
:: .:::.: :.. . : .::: :. : .: :: .: :. :::.::.: .: ::
CCDS30 IACSPIDGECVCKEGWQRGNCSVPCPPGTWGFSCNASC-QCAHEAVCSPQTGAC-TCTPG
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:.:..:: :: : :::.: ..: : :...:.: :.:: :. ::.: ::. :: : .
CCDS30 WHGAHCQLPCPKGQFGEGCASRCD-CDHSDGCDPVHGRCQ-CQAGWMGARCHLSCPEGLW
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pF1KSD GEDCGSTCPTCVQG-SCDTVTGDCVCSAGYWGPSCNASCPAGFHGNNCSVPCECPE-GLC
: .:..:: :: .: .: .:.:::. :. ::::. :: : .:. : :::.: . ..:
CCDS30 GVNCSNTC-TCKNGGTCLPENGNCVCAPGFRGPSCQRSCQPGRYGKRC-VPCKCANHSFC
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pF1KSD HPVSGSCQPGSG--SRDTALIVGSLVPLLLLFLGLACCACC-CWAPRSDLKDRPARDGAT
:: .:.: .: . : . : : : : : . .: .::.
CCDS30 HPSNGTCYCLAGWTGPDCSQ------PCPPGHWGENCAQTCQC---HHGGTCHP-QDGSC
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pF1KSD VSRMKLQVWGTLTSLGSTLPCRSLSSHKLPWVTVSHHDPEVPFNHSFIEPPSAGWAT---
. . : : . : ..... . . : . . . ::. . :
CCDS30 ICPLG---WTGHHCLEGC-PLGTFGANCSQPCQCGPGEKCHPETGACVCPPGHSGAPCRI
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.. :. : . : . . : : . :: : :. . ::. :.
CCDS30 GIQEPFTVMPTTPVAYNSLGAVIGIAVLGSLVVALVALFIGYRHWQKGKEHHHLAV-AYS
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pF1KSD PPEDASTPFAIPRT--SSLARAKRPSV-SFAEGTKFAPQSRRSSGELSSPLRKPKRLSRG
. .. ...: . : . :: .... . : . : : . :..:.:
CCDS30 SGRLDGSEYVMPDVPPSYSHYYSNPSYHTLSQCSPNPPPPNKVPGPLFASLQNPER----
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pF1KSD AQSGPEGREAEESTGPDEAEAPESFPAAASPGDSATGHRW-------P-PLGSRTVAEHV
.: .:.. . . : . : :. . :.: . . : :. .. . .
CCDS30 -PGGAQGHDNHTTLPADWKHRREPPPGPLDRGSSRLDRSYSYSYSNGPGPFYNKGLISE-
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: . .:: : .: .:: : : :: : .:: : :. .: .:
CCDS30 EELGASVASLSSENPYATIRDLPSLPGGPRESSYMEMKGPPSGSPPRQPPQFWDSQ----
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pF1KSD VKRAIPKPPRQALNRKKGSPGLAS-GSVGQSPNSAPKAGLPGATGPMAVRPEEAVRGLGA
.: :.: :.. . .. :: . . :::..: : :::
CCDS30 -RRRQPQPQRDSGTYEQPSPLIHDRDSVGSQPPLPP--GLPPGHYDSPKNSHIPGHYDLP
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pF1KSD GTESSRRAQEPVSGCGSPEQDPQKQAEEERQEEPEYENVVPISRPPEP
CCDS30 PVRHPPSPPLRRQDR
1030
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CCDS41 AGERCEARLCPEGLYGIKCDKRCPCHLENTHSC---HPMSGECACKPGWSGLYCNETCS-
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CCDS41 AVCSPVDGSCTCKAGWHGVDCSIRCPSGTWGFGCNLTCQCLNGGACNTLDGTCTCAPGWR
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. :. ::: :. . : :. .:: : : ::: :: :
CCDS41 GEKCELPCQDGTYGLNCAERCDCSHADGCHPTTGHCRCLPGWSGVHCDSVCAEGRWGPNC
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CCDS41 SLPCYCKNGASCSPDDGICECAPGFRGTTCQRICSPGFYGHRCSQTCPQCVHSSGPCHHI
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CCDS41 TGLCDCLPGFTGALCNEVCPSGRFGKNCAGIC-TCTNNGTCNPIDRSCQ-CYPGWIGSDC
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.::: :. .: .: . : .:..: : :.: .: ::: : : . :: : .:.::.
CCDS41 SQPCPPAHWGPNCIHTC-NCHNGAFCSAYDGEC-KCTPGWTGLYCTQRCPLGFYGKDCAL
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pF1KSD TCPTCVQGS-CDTVTGDCVCSAGYWGPSCNASCPAGFHGNNCSVPCEC-PEGLCHPVSGS
: : .:. :: ..:.:.: .:. : :. .::.: .: .: :.: .. : ..:.
CCDS41 ICQ-CQNGADCDHISGQCTCRTGFMGRHCEQKCPSGTYGYGCRQICDCLNNSTCDHITGT
760 770 780 790 800 810
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pF1KSD C--QPG-SGSR-DTA--LIVGSLVPLLLLFLGLACCACCCWAPRSDLKDRPARDGATVSR
: .:: .:.: : : .:::.: :
CCDS41 CYCSPGWKGARCDQAGVIIVGNLNSLSRTSTALPADSYQIGAIAGIIILVLVVLFLLALF
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>--
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CCDS41 ILNWFKCTRHRVSYRTAYRHGEKTMYRRKSQCCPGFYESGEMC-VPHCA--DKCVHGR-C
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70 80 90 100 110 120
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. :. :.:.::. :..::: : :..::: : :. :::. :: :
CCDS41 IAPNTCQCEPGWGGTNCSSACDGDHWGPHC---------------TSRCQCKN---GALC
120 130 140 150 160
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.: ::.::: :. :: :
CCDS41 ------------NPITGACHCAAGFR----------------------------GW---R
170
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pF1KSD CSFRCNCHGSPCEQDSGRCACRPGWWGPECQQQCECVRG-RCSAASGECTCPPGFRGARC
: :: :: : .: .:.:.:.: : :. ..::: ::::. :: :
CCDS41 CEDRC-------EQ---------GTYGNDCHQRCQCQNGATCDHVTGECRCPPGYTGAFC
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CCDS41 EDLCPPGKHGPQCEQRCP-CQNGGVCHHVTGEC-SCPSGWMGTVCGQPCPEGRFGKNCSQ
230 240 250 260 270
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CCDS41 EC-QCHNGGTCDAATGQCH-CSPGYTGERCQDECPVGTYGVLCAETCQ-CVNGGKCYHVS
280 290 300 310 320 330
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pF1KSD GDCVCSAGYWGPSCNAS-CPAGFHGNNCSVPCECPEGLCHPVSGSCQPGSGSRDTALIVG
: :.: ::. : :.: :: :..: .:. : :
CCDS41 GACLCEAGFAGERCEARLCPEGLYGIKCDKRCPCHLENTHSCHPMSGECACKPGWSGLYC
340 350 360 370 380 390
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pF1KSD SLVPLLLLFLGLACCACCCWAPRSDLKDRPARDGATVSRMKLQVWGTLTSLGSTLPCRSL
CCDS41 NETCSPGFYGEACQQICSCQNGADCDSVTGKCTCAPGFKGIDCSTPCPLGTYGINCSSRC
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CCDS41 GAPCHGVTGQCRCPPGRTGEDCEADCPEGRWGLGCQ--EICPACQHAARCDPETGACLCL
750 760 770 780 790 800
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pF1KSD AGW---RQKDQECTI----PICEGPDACQKDEVCVKP--GLCRCKPGFFGAHCSSRCPGQ
:. : .: : : :. .: .: : .: : : : ::. : :. :
CCDS41 PGFVGSRCQDV-CPAGWYGPSCQTRCSCANDGHC-HPATGHCSCAPGWTGFSCQRACDTG
810 820 830 840 850 860
100 110 120 130 140
pF1KSD YWGPDCRESCPCHP-HGQCEPATGACQCQADRWGARCEFPCA---CGP---------HGR
.::::: . : : ::.:. .: : :.: : ::: : :: ::
CCDS41 HWGPDCSHPCNCSAGHGSCDAISGLCLCEAGYVGPRCEQQCPQGHFGPGCEQRCQCQHGA
870 880 890 900 910 920
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pF1KSD -CDPATGVCHCEPGWWSSTCRRPCQ-----------CN-TAAARCEQATGACVCKPGWWG
:: ..:.: : :: .. :.. : :: ::.: :. ..:.:.: : :
CCDS41 ACDHVSGACTCPAGWRGTFCEHACPAGFFGLDCRSACNCTAGAACDAVNGSCLCPAGRRG
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pF1KSD RRCSFRC-------NC-------HGSPCEQDSGRCACRPGWWGPECQQQC-------ECV
::. : :: .:. :. :.: : ::: :: : : : .:
CCDS41 PRCAETCPAHTYGHNCSQACACFNGASCDPVHGQCHCAPGWMGPSCLQACPAGLYGDNCR
990 1000 1010 1020 1030 1040
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pF1KSD R-------GRCSAASGECTCPPGFRGARCELPCPAGSHGVQCAHSCGRCKHNEPCSPDTG
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CCDS41 HSCLCQNGGTCDPVSGHCACPEGWAGLACEKECLPRDVRAGCRHS-GGCLNGGLCDPHTG
1050 1060 1070 1080 1090 1100
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: : ::.: .::.::: : :::.: :.: : : ::. :: : :: ::. : ::
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]