Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA0142
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0142, 646 aa
1>>>pF1KSDA0142 646 - 646 aa - 646 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.3894+/-0.0012; mu= -1.9328+/- 0.072
mean_var=339.4403+/-71.017, 0's: 0 Z-trim(111.5): 97 B-trim: 320 in 1/53
Lambda= 0.069613
statistics sampled from 12368 (12453) to 12368 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.716), E-opt: 0.2 (0.383), width: 16
Scan time: 2.850
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS9521.1 ARHGEF7 gene_id:8874|Hs108|chr13 ( 646) 4257 441.9 1.3e-123
CCDS45069.1 ARHGEF7 gene_id:8874|Hs108|chr13 ( 753) 3688 384.8 2.3e-106
CCDS32009.1 ARHGEF7 gene_id:8874|Hs108|chr13 ( 782) 3688 384.8 2.4e-106
CCDS45068.1 ARHGEF7 gene_id:8874|Hs108|chr13 ( 803) 3688 384.8 2.4e-106
CCDS81781.1 ARHGEF7 gene_id:8874|Hs108|chr13 ( 547) 3044 320.0 5.5e-87
CCDS78509.1 ARHGEF6 gene_id:9459|Hs108|chrX ( 622) 1867 201.8 2.3e-51
CCDS14660.1 ARHGEF6 gene_id:9459|Hs108|chrX ( 776) 1867 201.9 2.7e-51
>>CCDS9521.1 ARHGEF7 gene_id:8874|Hs108|chr13 (646 aa)
initn: 4257 init1: 4257 opt: 4257 Z-score: 2332.6 bits: 441.9 E(32554): 1.3e-123
Smith-Waterman score: 4257; 100.0% identity (100.0% similar) in 646 aa overlap (1-646:1-646)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MTDNSNNQLVVRAKFNFQQTNEDELSFSKGDVIHVTRVEEGGWWEGTLNGRTGWFPSNYV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS95 MTDNSNNQLVVRAKFNFQQTNEDELSFSKGDVIHVTRVEEGGWWEGTLNGRTGWFPSNYV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD REVKASEKPVSPKSGTLKSPPKGFDTTAINKSYYNVVLQNILETENEYSKELQTVLSTYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS95 REVKASEKPVSPKSGTLKSPPKGFDTTAINKSYYNVVLQNILETENEYSKELQTVLSTYL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD RPLQTSEKLSSANISYLMGNLEEICSFQQMLVQSLEECTKLPEAQQRVGGCFLNLMPQMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS95 RPLQTSEKLSSANISYLMGNLEEICSFQQMLVQSLEECTKLPEAQQRVGGCFLNLMPQMK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD TLYLTYCANHPSAVNVLTEHSEELGEFMETKGASSPGILVLTTGLSKPFMRLDKYPTLLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS95 TLYLTYCANHPSAVNVLTEHSEELGEFMETKGASSPGILVLTTGLSKPFMRLDKYPTLLK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD ELERHMEDYHTDRQDIQKSMAAFKNLSAQCQEVRKRKELELQILTEAIRNWEGDDIKTLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS95 ELERHMEDYHTDRQDIQKSMAAFKNLSAQCQEVRKRKELELQILTEAIRNWEGDDIKTLG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD NVTYMSQVLIQCAGSEEKNERYLLLFPNVLLMLSASPRMSGFIYQGKLPTTGMTITKLED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS95 NVTYMSQVLIQCAGSEEKNERYLLLFPNVLLMLSASPRMSGFIYQGKLPTTGMTITKLED
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD SENHRNAFEISGSMIERILVSCNNQQDLQEWVEHLQKQTKVTSVGNPTIKPHSVPSHTLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS95 SENHRNAFEISGSMIERILVSCNNQQDLQEWVEHLQKQTKVTSVGNPTIKPHSVPSHTLP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD SHPVTPSSKHADSKPAPLTPAYHTLPHPSHHGTPHTTINWGPLEPPKTPKPWSLSCLRPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS95 SHPVTPSSKHADSKPAPLTPAYHTLPHPSHHGTPHTTINWGPLEPPKTPKPWSLSCLRPA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD PPLRPSAALCYKEDLSKSPKTMKKLLPKRKPERKPSDEEFASRKSTAALEEDAQILKVIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS95 PPLRPSAALCYKEDLSKSPKTMKKLLPKRKPERKPSDEEFASRKSTAALEEDAQILKVIE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD AYCTSAKTRQTLNSSSRKESAPQVLLPEEEKIIVEETKSNGQTVIEEKSLVDTVYALKDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS95 AYCTSAKTRQTLNSSSRKESAPQVLLPEEEKIIVEETKSNGQTVIEEKSLVDTVYALKDE
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640
pF1KSD VQELRQDNKKMKKSLEEEQRARKDLEKLVRKVLKNMNDPAWDETNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS95 VQELRQDNKKMKKSLEEEQRARKDLEKLVRKVLKNMNDPAWDETNL
610 620 630 640
>>CCDS45069.1 ARHGEF7 gene_id:8874|Hs108|chr13 (753 aa)
initn: 3730 init1: 3688 opt: 3688 Z-score: 2022.9 bits: 384.8 E(32554): 2.3e-106
Smith-Waterman score: 3688; 99.8% identity (100.0% similar) in 555 aa overlap (1-555:129-683)
10 20 30
pF1KSD MTDNSNNQLVVRAKFNFQQTNEDELSFSKG
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 HRIKSFDSLGSQSLHTRTSKLFQGQYRSLDMTDNSNNQLVVRAKFNFQQTNEDELSFSKG
100 110 120 130 140 150
40 50 60 70 80 90
pF1KSD DVIHVTRVEEGGWWEGTLNGRTGWFPSNYVREVKASEKPVSPKSGTLKSPPKGFDTTAIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 DVIHVTRVEEGGWWEGTLNGRTGWFPSNYVREVKASEKPVSPKSGTLKSPPKGFDTTAIN
160 170 180 190 200 210
100 110 120 130 140 150
pF1KSD KSYYNVVLQNILETENEYSKELQTVLSTYLRPLQTSEKLSSANISYLMGNLEEICSFQQM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KSYYNVVLQNILETENEYSKELQTVLSTYLRPLQTSEKLSSANISYLMGNLEEICSFQQM
220 230 240 250 260 270
160 170 180 190 200 210
pF1KSD LVQSLEECTKLPEAQQRVGGCFLNLMPQMKTLYLTYCANHPSAVNVLTEHSEELGEFMET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LVQSLEECTKLPEAQQRVGGCFLNLMPQMKTLYLTYCANHPSAVNVLTEHSEELGEFMET
280 290 300 310 320 330
220 230 240 250 260 270
pF1KSD KGASSPGILVLTTGLSKPFMRLDKYPTLLKELERHMEDYHTDRQDIQKSMAAFKNLSAQC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KGASSPGILVLTTGLSKPFMRLDKYPTLLKELERHMEDYHTDRQDIQKSMAAFKNLSAQC
340 350 360 370 380 390
280 290 300 310 320 330
pF1KSD QEVRKRKELELQILTEAIRNWEGDDIKTLGNVTYMSQVLIQCAGSEEKNERYLLLFPNVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 QEVRKRKELELQILTEAIRNWEGDDIKTLGNVTYMSQVLIQCAGSEEKNERYLLLFPNVL
400 410 420 430 440 450
340 350 360 370 380 390
pF1KSD LMLSASPRMSGFIYQGKLPTTGMTITKLEDSENHRNAFEISGSMIERILVSCNNQQDLQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LMLSASPRMSGFIYQGKLPTTGMTITKLEDSENHRNAFEISGSMIERILVSCNNQQDLQE
460 470 480 490 500 510
400 410 420 430 440 450
pF1KSD WVEHLQKQTKVTSVGNPTIKPHSVPSHTLPSHPVTPSSKHADSKPAPLTPAYHTLPHPSH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 WVEHLQKQTKVTSVGNPTIKPHSVPSHTLPSHPVTPSSKHADSKPAPLTPAYHTLPHPSH
520 530 540 550 560 570
460 470 480 490 500 510
pF1KSD HGTPHTTINWGPLEPPKTPKPWSLSCLRPAPPLRPSAALCYKEDLSKSPKTMKKLLPKRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 HGTPHTTINWGPLEPPKTPKPWSLSCLRPAPPLRPSAALCYKEDLSKSPKTMKKLLPKRK
580 590 600 610 620 630
520 530 540 550 560 570
pF1KSD PERKPSDEEFASRKSTAALEEDAQILKVIEAYCTSAKTRQTLNSSSRKESAPQVLLPEEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS45 PERKPSDEEFASRKSTAALEEDAQILKVIEAYCTSAKTRQTLNSTWQGTDLMHNHVLADD
640 650 660 670 680 690
580 590 600 610 620 630
pF1KSD KIIVEETKSNGQTVIEEKSLVDTVYALKDEVQELRQDNKKMKKSLEEEQRARKDLEKLVR
CCDS45 DQPSLDSLGRRSSLSRLEPSDLSEDSDYDSIWTAHSYRMGSTSRKSCCSYISHQN
700 710 720 730 740 750
>>CCDS32009.1 ARHGEF7 gene_id:8874|Hs108|chr13 (782 aa)
initn: 3730 init1: 3688 opt: 3688 Z-score: 2022.7 bits: 384.8 E(32554): 2.4e-106
Smith-Waterman score: 3688; 99.8% identity (100.0% similar) in 555 aa overlap (1-555:158-712)
10 20 30
pF1KSD MTDNSNNQLVVRAKFNFQQTNEDELSFSKG
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 HRIKSFDSLGSQSLHTRTSKLFQGQYRSLDMTDNSNNQLVVRAKFNFQQTNEDELSFSKG
130 140 150 160 170 180
40 50 60 70 80 90
pF1KSD DVIHVTRVEEGGWWEGTLNGRTGWFPSNYVREVKASEKPVSPKSGTLKSPPKGFDTTAIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DVIHVTRVEEGGWWEGTLNGRTGWFPSNYVREVKASEKPVSPKSGTLKSPPKGFDTTAIN
190 200 210 220 230 240
100 110 120 130 140 150
pF1KSD KSYYNVVLQNILETENEYSKELQTVLSTYLRPLQTSEKLSSANISYLMGNLEEICSFQQM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KSYYNVVLQNILETENEYSKELQTVLSTYLRPLQTSEKLSSANISYLMGNLEEICSFQQM
250 260 270 280 290 300
160 170 180 190 200 210
pF1KSD LVQSLEECTKLPEAQQRVGGCFLNLMPQMKTLYLTYCANHPSAVNVLTEHSEELGEFMET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LVQSLEECTKLPEAQQRVGGCFLNLMPQMKTLYLTYCANHPSAVNVLTEHSEELGEFMET
310 320 330 340 350 360
220 230 240 250 260 270
pF1KSD KGASSPGILVLTTGLSKPFMRLDKYPTLLKELERHMEDYHTDRQDIQKSMAAFKNLSAQC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KGASSPGILVLTTGLSKPFMRLDKYPTLLKELERHMEDYHTDRQDIQKSMAAFKNLSAQC
370 380 390 400 410 420
280 290 300 310 320 330
pF1KSD QEVRKRKELELQILTEAIRNWEGDDIKTLGNVTYMSQVLIQCAGSEEKNERYLLLFPNVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 QEVRKRKELELQILTEAIRNWEGDDIKTLGNVTYMSQVLIQCAGSEEKNERYLLLFPNVL
430 440 450 460 470 480
340 350 360 370 380 390
pF1KSD LMLSASPRMSGFIYQGKLPTTGMTITKLEDSENHRNAFEISGSMIERILVSCNNQQDLQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LMLSASPRMSGFIYQGKLPTTGMTITKLEDSENHRNAFEISGSMIERILVSCNNQQDLQE
490 500 510 520 530 540
400 410 420 430 440 450
pF1KSD WVEHLQKQTKVTSVGNPTIKPHSVPSHTLPSHPVTPSSKHADSKPAPLTPAYHTLPHPSH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 WVEHLQKQTKVTSVGNPTIKPHSVPSHTLPSHPVTPSSKHADSKPAPLTPAYHTLPHPSH
550 560 570 580 590 600
460 470 480 490 500 510
pF1KSD HGTPHTTINWGPLEPPKTPKPWSLSCLRPAPPLRPSAALCYKEDLSKSPKTMKKLLPKRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 HGTPHTTINWGPLEPPKTPKPWSLSCLRPAPPLRPSAALCYKEDLSKSPKTMKKLLPKRK
610 620 630 640 650 660
520 530 540 550 560 570
pF1KSD PERKPSDEEFASRKSTAALEEDAQILKVIEAYCTSAKTRQTLNSSSRKESAPQVLLPEEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS32 PERKPSDEEFASRKSTAALEEDAQILKVIEAYCTSAKTRQTLNSTWQGTDLMHNHVLADD
670 680 690 700 710 720
580 590 600 610 620 630
pF1KSD KIIVEETKSNGQTVIEEKSLVDTVYALKDEVQELRQDNKKMKKSLEEEQRARKDLEKLVR
CCDS32 DQPSLDSLGRRSSLSRLEPSDLSEDSDYDSIWTAHSYRMGSTSRKSCCSYISHQN
730 740 750 760 770 780
>>CCDS45068.1 ARHGEF7 gene_id:8874|Hs108|chr13 (803 aa)
initn: 3730 init1: 3688 opt: 3688 Z-score: 2022.6 bits: 384.8 E(32554): 2.4e-106
Smith-Waterman score: 3688; 99.8% identity (100.0% similar) in 555 aa overlap (1-555:179-733)
10 20 30
pF1KSD MTDNSNNQLVVRAKFNFQQTNEDELSFSKG
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 HRIKSFDSLGSQSLHTRTSKLFQGQYRSLDMTDNSNNQLVVRAKFNFQQTNEDELSFSKG
150 160 170 180 190 200
40 50 60 70 80 90
pF1KSD DVIHVTRVEEGGWWEGTLNGRTGWFPSNYVREVKASEKPVSPKSGTLKSPPKGFDTTAIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 DVIHVTRVEEGGWWEGTLNGRTGWFPSNYVREVKASEKPVSPKSGTLKSPPKGFDTTAIN
210 220 230 240 250 260
100 110 120 130 140 150
pF1KSD KSYYNVVLQNILETENEYSKELQTVLSTYLRPLQTSEKLSSANISYLMGNLEEICSFQQM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KSYYNVVLQNILETENEYSKELQTVLSTYLRPLQTSEKLSSANISYLMGNLEEICSFQQM
270 280 290 300 310 320
160 170 180 190 200 210
pF1KSD LVQSLEECTKLPEAQQRVGGCFLNLMPQMKTLYLTYCANHPSAVNVLTEHSEELGEFMET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LVQSLEECTKLPEAQQRVGGCFLNLMPQMKTLYLTYCANHPSAVNVLTEHSEELGEFMET
330 340 350 360 370 380
220 230 240 250 260 270
pF1KSD KGASSPGILVLTTGLSKPFMRLDKYPTLLKELERHMEDYHTDRQDIQKSMAAFKNLSAQC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KGASSPGILVLTTGLSKPFMRLDKYPTLLKELERHMEDYHTDRQDIQKSMAAFKNLSAQC
390 400 410 420 430 440
280 290 300 310 320 330
pF1KSD QEVRKRKELELQILTEAIRNWEGDDIKTLGNVTYMSQVLIQCAGSEEKNERYLLLFPNVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 QEVRKRKELELQILTEAIRNWEGDDIKTLGNVTYMSQVLIQCAGSEEKNERYLLLFPNVL
450 460 470 480 490 500
340 350 360 370 380 390
pF1KSD LMLSASPRMSGFIYQGKLPTTGMTITKLEDSENHRNAFEISGSMIERILVSCNNQQDLQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LMLSASPRMSGFIYQGKLPTTGMTITKLEDSENHRNAFEISGSMIERILVSCNNQQDLQE
510 520 530 540 550 560
400 410 420 430 440 450
pF1KSD WVEHLQKQTKVTSVGNPTIKPHSVPSHTLPSHPVTPSSKHADSKPAPLTPAYHTLPHPSH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 WVEHLQKQTKVTSVGNPTIKPHSVPSHTLPSHPVTPSSKHADSKPAPLTPAYHTLPHPSH
570 580 590 600 610 620
460 470 480 490 500 510
pF1KSD HGTPHTTINWGPLEPPKTPKPWSLSCLRPAPPLRPSAALCYKEDLSKSPKTMKKLLPKRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 HGTPHTTINWGPLEPPKTPKPWSLSCLRPAPPLRPSAALCYKEDLSKSPKTMKKLLPKRK
630 640 650 660 670 680
520 530 540 550 560 570
pF1KSD PERKPSDEEFASRKSTAALEEDAQILKVIEAYCTSAKTRQTLNSSSRKESAPQVLLPEEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS45 PERKPSDEEFASRKSTAALEEDAQILKVIEAYCTSAKTRQTLNSTWQGTDLMHNHVLADD
690 700 710 720 730 740
580 590 600 610 620 630
pF1KSD KIIVEETKSNGQTVIEEKSLVDTVYALKDEVQELRQDNKKMKKSLEEEQRARKDLEKLVR
CCDS45 DQPSLDSLGRRSSLSRLEPSDLSEDSDYDSIWTAHSYRMGSTSRKSCCSYISHQN
750 760 770 780 790 800
>>CCDS81781.1 ARHGEF7 gene_id:8874|Hs108|chr13 (547 aa)
initn: 3086 init1: 3044 opt: 3044 Z-score: 1675.2 bits: 320.0 E(32554): 5.5e-87
Smith-Waterman score: 3044; 99.8% identity (100.0% similar) in 460 aa overlap (96-555:18-477)
70 80 90 100 110 120
pF1KSD SEKPVSPKSGTLKSPPKGFDTTAINKSYYNVVLQNILETENEYSKELQTVLSTYLRPLQT
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 MGSCSSQSVQKTRRGRKVVLQNILETENEYSKELQTVLSTYLRPLQT
10 20 30 40
130 140 150 160 170 180
pF1KSD SEKLSSANISYLMGNLEEICSFQQMLVQSLEECTKLPEAQQRVGGCFLNLMPQMKTLYLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 SEKLSSANISYLMGNLEEICSFQQMLVQSLEECTKLPEAQQRVGGCFLNLMPQMKTLYLT
50 60 70 80 90 100
190 200 210 220 230 240
pF1KSD YCANHPSAVNVLTEHSEELGEFMETKGASSPGILVLTTGLSKPFMRLDKYPTLLKELERH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 YCANHPSAVNVLTEHSEELGEFMETKGASSPGILVLTTGLSKPFMRLDKYPTLLKELERH
110 120 130 140 150 160
250 260 270 280 290 300
pF1KSD MEDYHTDRQDIQKSMAAFKNLSAQCQEVRKRKELELQILTEAIRNWEGDDIKTLGNVTYM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 MEDYHTDRQDIQKSMAAFKNLSAQCQEVRKRKELELQILTEAIRNWEGDDIKTLGNVTYM
170 180 190 200 210 220
310 320 330 340 350 360
pF1KSD SQVLIQCAGSEEKNERYLLLFPNVLLMLSASPRMSGFIYQGKLPTTGMTITKLEDSENHR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 SQVLIQCAGSEEKNERYLLLFPNVLLMLSASPRMSGFIYQGKLPTTGMTITKLEDSENHR
230 240 250 260 270 280
370 380 390 400 410 420
pF1KSD NAFEISGSMIERILVSCNNQQDLQEWVEHLQKQTKVTSVGNPTIKPHSVPSHTLPSHPVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 NAFEISGSMIERILVSCNNQQDLQEWVEHLQKQTKVTSVGNPTIKPHSVPSHTLPSHPVT
290 300 310 320 330 340
430 440 450 460 470 480
pF1KSD PSSKHADSKPAPLTPAYHTLPHPSHHGTPHTTINWGPLEPPKTPKPWSLSCLRPAPPLRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 PSSKHADSKPAPLTPAYHTLPHPSHHGTPHTTINWGPLEPPKTPKPWSLSCLRPAPPLRP
350 360 370 380 390 400
490 500 510 520 530 540
pF1KSD SAALCYKEDLSKSPKTMKKLLPKRKPERKPSDEEFASRKSTAALEEDAQILKVIEAYCTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 SAALCYKEDLSKSPKTMKKLLPKRKPERKPSDEEFASRKSTAALEEDAQILKVIEAYCTS
410 420 430 440 450 460
550 560 570 580 590 600
pF1KSD AKTRQTLNSSSRKESAPQVLLPEEEKIIVEETKSNGQTVIEEKSLVDTVYALKDEVQELR
:::::::::.
CCDS81 AKTRQTLNSTWQGTDLMHNHVLADDDQPSLDSLGRRSSLSRLEPSDLSEDSDYDSIWTAH
470 480 490 500 510 520
>>CCDS78509.1 ARHGEF6 gene_id:9459|Hs108|chrX (622 aa)
initn: 2736 init1: 1452 opt: 1867 Z-score: 1035.6 bits: 201.8 E(32554): 2.3e-51
Smith-Waterman score: 2669; 62.9% identity (84.3% similar) in 645 aa overlap (1-638:1-608)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MTDNSNNQLVVRAKFNFQQTNEDELSFSKGDVIHVTRVEEGGWWEGTLNGRTGWFPSNYV
::.:...::.:.:.:::.:::::::: :::.:.::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 MTENGSHQLIVKARFNFKQTNEDELSVCKGDIIYVTRVEEGGWWEGTLNGRTGWFPSNYV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD REVKASEKPVSPKSGTLKSPPKGFDTTAINKSYYNVVLQNILETENEYSKELQTVLSTYL
::.:.::.:.:::. :::.:. ..:.::.:::::::.::.::.::::..: :::
CCDS78 REIKSSERPLSPKA------VKGFETAPLTKNYYTVVLQNILDTEKEYAKELQSLLVTYL
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KSD RPLQTSEKLSSANISYLMGNLEEICSFQQMLVQSLEECTKLPEAQQRVGGCFLNLMPQMK
::::....::..... :.::.::.:.::: : :.::::.:.:: :..::::.:.:::..:
CCDS78 RPLQSNNNLSTVEVTSLLGNFEEVCTFQQTLCQALEECSKFPENQHKVGGCLLSLMPHFK
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KSD TLYLTYCANHPSAVNVLTEHSEELGEFMETKGASSPGILVLTTGLSKPFMRLDKYPTLLK
..::.:::::::::::::.::.:: .:::..::::::::.:::.::::::::.:: :::.
CCDS78 SMYLAYCANHPSAVNVLTQHSDELEQFMENQGASSPGILILTTNLSKPFMRLEKYVTLLQ
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KSD ELERHMEDYHTDRQDIQKSMAAFKNLSAQCQEVRKRKELELQILTEAIRNWEGDDIKTLG
:::::::: : :.::: :...:::.: .:::..::::.::::::.: :. :::.:::.::
CCDS78 ELERHMEDTHPDHQDILKAIVAFKTLMGQCQDLRKRKQLELQILSEPIQAWEGEDIKNLG
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KSD NVTYMSQVLIQCAGSEEKNERYLLLFPNVLLMLSASPRMSGFIYQGKLPTTGMTITKLED
:: .::::..: .. :::.::::.:: :::.::::::::::::::::.: .: ..:.:..
CCDS78 NVIFMSQVMVQYGACEEKEERYLMLFSNVLIMLSASPRMSGFIYQGKIPIAGTVVTRLDE
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KSD SENHRNAFEISGSMIERILVSCNNQQDLQEWVEHLQKQTKVTSVGNPTIKPHSVPSHTLP
:.. .:::.:. .:::.: :::.::.:::.:.:.. . :
CCDS78 IEGNDCTFEITGNTVERIVVHCNNNQDFQEWLEQLNRLIR----G---------------
360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KSD SHPVTPSSKHADSKPAPLTPAYHTLPHPSHHGTPHTTINWGPLEPPKTPKPWSLSCLRPA
:.: . :: . . . :. : : :. ::::::. :::::::::::
CCDS78 -----PASCSSLSKTSSSSCSAHS--SFSSTGQPR-----GPLEPPQIIKPWSLSCLRPA
400 410 420 430 440
490 500 510 520 530
pF1KSD PPLRPSAALCYKEDLS-------KSPKTMKKLLPKRKPERKPSDEEFASRKSTAALEEDA
::::::::: ::: .: ::::::::.: ::: :::::.::.. :::::::::::
CCDS78 PPLRPSAALGYKERMSYILKESSKSPKTMKKFLHKRKTERKPSEEEYVIRKSTAALEEDA
450 460 470 480 490 500
540 550 560 570 580 590
pF1KSD QILKVIEAYCTSAKTRQTLNSSSRKESAPQVLLPEEEKIIVEETKSNGQTVIEEKSLVDT
:::::::::::::. .: .::.::.: ::::::::::.:.:::.:::::..::::::::
CCDS78 QILKVIEAYCTSANFQQGHGSSTRKDSIPQVLLPEEEKLIIEETRSNGQTIMEEKSLVDT
510 520 530 540 550 560
600 610 620 630 640
pF1KSD VYALKDEVQELRQDNKKMKKSLEEEQRARKDLEKLVRKVLKNMNDPAWDETNL
::::::::.::.:.::.::. :::: ..:.:::::::..::. ..
CCDS78 VYALKDEVRELKQENKRMKQCLEEELKSRRDLEKLVRRLLKQTDECIRGESSSKTSILP
570 580 590 600 610 620
>>CCDS14660.1 ARHGEF6 gene_id:9459|Hs108|chrX (776 aa)
initn: 2736 init1: 1452 opt: 1867 Z-score: 1034.4 bits: 201.9 E(32554): 2.7e-51
Smith-Waterman score: 2669; 62.9% identity (84.3% similar) in 645 aa overlap (1-638:155-762)
10 20 30
pF1KSD MTDNSNNQLVVRAKFNFQQTNEDELSFSKG
::.:...::.:.:.:::.:::::::: ::
CCDS14 LSAANTSQTNPQGAVSSTVSGLQRQSKTVEMTENGSHQLIVKARFNFKQTNEDELSVCKG
130 140 150 160 170 180
40 50 60 70 80 90
pF1KSD DVIHVTRVEEGGWWEGTLNGRTGWFPSNYVREVKASEKPVSPKSGTLKSPPKGFDTTAIN
:.:.::::::::::::::::::::::::::::.:.::.:.:::. :::.:. ..
CCDS14 DIIYVTRVEEGGWWEGTLNGRTGWFPSNYVREIKSSERPLSPKA------VKGFETAPLT
190 200 210 220 230
100 110 120 130 140 150
pF1KSD KSYYNVVLQNILETENEYSKELQTVLSTYLRPLQTSEKLSSANISYLMGNLEEICSFQQM
:.::.:::::::.::.::.::::..: :::::::....::..... :.::.::.:.:::
CCDS14 KNYYTVVLQNILDTEKEYAKELQSLLVTYLRPLQSNNNLSTVEVTSLLGNFEEVCTFQQT
240 250 260 270 280 290
160 170 180 190 200 210
pF1KSD LVQSLEECTKLPEAQQRVGGCFLNLMPQMKTLYLTYCANHPSAVNVLTEHSEELGEFMET
: :.::::.:.:: :..::::.:.:::..:..::.:::::::::::::.::.:: .:::.
CCDS14 LCQALEECSKFPENQHKVGGCLLSLMPHFKSMYLAYCANHPSAVNVLTQHSDELEQFMEN
300 310 320 330 340 350
220 230 240 250 260 270
pF1KSD KGASSPGILVLTTGLSKPFMRLDKYPTLLKELERHMEDYHTDRQDIQKSMAAFKNLSAQC
.::::::::.:::.::::::::.:: :::.:::::::: : :.::: :...:::.: .::
CCDS14 QGASSPGILILTTNLSKPFMRLEKYVTLLQELERHMEDTHPDHQDILKAIVAFKTLMGQC
360 370 380 390 400 410
280 290 300 310 320 330
pF1KSD QEVRKRKELELQILTEAIRNWEGDDIKTLGNVTYMSQVLIQCAGSEEKNERYLLLFPNVL
:..::::.::::::.: :. :::.:::.:::: .::::..: .. :::.::::.:: :::
CCDS14 QDLRKRKQLELQILSEPIQAWEGEDIKNLGNVIFMSQVMVQYGACEEKEERYLMLFSNVL
420 430 440 450 460 470
340 350 360 370 380 390
pF1KSD LMLSASPRMSGFIYQGKLPTTGMTITKLEDSENHRNAFEISGSMIERILVSCNNQQDLQE
.::::::::::::::::.: .: ..:.:.. :.. .:::.:. .:::.: :::.::.::
CCDS14 IMLSASPRMSGFIYQGKIPIAGTVVTRLDEIEGNDCTFEITGNTVERIVVHCNNNQDFQE
480 490 500 510 520 530
400 410 420 430 440 450
pF1KSD WVEHLQKQTKVTSVGNPTIKPHSVPSHTLPSHPVTPSSKHADSKPAPLTPAYHTLPHPSH
:.:.:.. . : :.: . :: . . . :. :
CCDS14 WLEQLNRLIR----G--------------------PASCSSLSKTSSSSCSAHS--SFSS
540 550 560 570
460 470 480 490 500
pF1KSD HGTPHTTINWGPLEPPKTPKPWSLSCLRPAPPLRPSAALCYKEDLS-------KSPKTMK
: :. ::::::. :::::::::::::::::::: ::: .: :::::::
CCDS14 TGQPR-----GPLEPPQIIKPWSLSCLRPAPPLRPSAALGYKERMSYILKESSKSPKTMK
580 590 600 610 620
510 520 530 540 550 560
pF1KSD KLLPKRKPERKPSDEEFASRKSTAALEEDAQILKVIEAYCTSAKTRQTLNSSSRKESAPQ
:.: ::: :::::.::.. ::::::::::::::::::::::::. .: .::.::.: ::
CCDS14 KFLHKRKTERKPSEEEYVIRKSTAALEEDAQILKVIEAYCTSANFQQGHGSSTRKDSIPQ
630 640 650 660 670 680
570 580 590 600 610 620
pF1KSD VLLPEEEKIIVEETKSNGQTVIEEKSLVDTVYALKDEVQELRQDNKKMKKSLEEEQRARK
::::::::.:.:::.:::::..::::::::::::::::.::.:.::.::. :::: ..:.
CCDS14 VLLPEEEKLIIEETRSNGQTIMEEKSLVDTVYALKDEVRELKQENKRMKQCLEEELKSRR
690 700 710 720 730 740
630 640
pF1KSD DLEKLVRKVLKNMNDPAWDETNL
:::::::..::. ..
CCDS14 DLEKLVRRLLKQTDECIRGESSSKTSILP
750 760 770
646 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 00:13:43 2016 done: Thu Nov 3 00:13:43 2016
Total Scan time: 2.850 Total Display time: 0.080
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]