FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0137, 766 aa
1>>>pF1KSDA0137 766 - 766 aa - 766 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.3594+/-0.00106; mu= 3.2549+/- 0.063
mean_var=375.4414+/-86.119, 0's: 0 Z-trim(112.0): 317 B-trim: 0 in 0/54
Lambda= 0.066192
statistics sampled from 12468 (12845) to 12468 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.723), E-opt: 0.2 (0.395), width: 16
Scan time: 3.220
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS2241.1 TLK1 gene_id:9874|Hs108|chr2 ( 766) 5105 502.6 9.7e-142
CCDS46447.1 TLK1 gene_id:9874|Hs108|chr2 ( 718) 4784 471.9 1.6e-132
CCDS46448.1 TLK1 gene_id:9874|Hs108|chr2 ( 670) 4392 434.4 2.8e-121
CCDS45753.1 TLK2 gene_id:11011|Hs108|chr17 ( 718) 2411 245.3 2.6e-64
CCDS62283.1 TLK2 gene_id:11011|Hs108|chr17 ( 772) 2298 234.5 4.8e-61
CCDS82182.1 TLK2 gene_id:11011|Hs108|chr17 ( 601) 2287 233.4 8.5e-61
CCDS11633.1 TLK2 gene_id:11011|Hs108|chr17 ( 750) 2287 233.5 9.8e-61
>>CCDS2241.1 TLK1 gene_id:9874|Hs108|chr2 (766 aa)
initn: 5105 init1: 5105 opt: 5105 Z-score: 2658.2 bits: 502.6 E(32554): 9.7e-142
Smith-Waterman score: 5105; 100.0% identity (100.0% similar) in 766 aa overlap (1-766:1-766)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MSVQSSSGSLEGPPSWSQLSTSPTPGSAAAARSLLNHTPPSGRPREGAMDELHSLDPRRQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 MSVQSSSGSLEGPPSWSQLSTSPTPGSAAAARSLLNHTPPSGRPREGAMDELHSLDPRRQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD ELLEARFTGVASGSTGSTGSCSVGAKASTNNESSNHSFGSLGSLSDKESETPEKKQSESS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 ELLEARFTGVASGSTGSTGSCSVGAKASTNNESSNHSFGSLGSLSDKESETPEKKQSESS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD RGRKRKAENQNESSQGKSIGGRGHKISDYFEYQGGNGSSPVRGIPPAIRSPQNSHSHSTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 RGRKRKAENQNESSQGKSIGGRGHKISDYFEYQGGNGSSPVRGIPPAIRSPQNSHSHSTP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD SSSVRPNSPSPTALAFGDHPIVQPKQLSFKIIQTDLTMLKLAALESNKIQDLEKKEGRID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 SSSVRPNSPSPTALAFGDHPIVQPKQLSFKIIQTDLTMLKLAALESNKIQDLEKKEGRID
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD DLLRANCDLRRQIDEQQKLLEKYKERLNKCISMSKKLLIEKSTQEKLSSREKSMQDRLRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 DLLRANCDLRRQIDEQQKLLEKYKERLNKCISMSKKLLIEKSTQEKLSSREKSMQDRLRL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD GHFTTVRHGASFTEQWTDGFAFQNLVKQQEWVNQQREDIERQRKLLAKRKPPTANNSQAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 GHFTTVRHGASFTEQWTDGFAFQNLVKQQEWVNQQREDIERQRKLLAKRKPPTANNSQAP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD STNSEPKQRKNKAVNGAENDPFVRPNLPQLLTLAEYHEQEEIFKLRLGHLKKEEAEIQAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 STNSEPKQRKNKAVNGAENDPFVRPNLPQLLTLAEYHEQEEIFKLRLGHLKKEEAEIQAE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD LERLERVRNLHIRELKRINNEDNSQFKDHPTLNERYLLLHLLGRGGFSEVYKAFDLYEQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 LERLERVRNLHIRELKRINNEDNSQFKDHPTLNERYLLLHLLGRGGFSEVYKAFDLYEQR
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD YAAVKIHQLNKSWRDEKKENYHKHACREYRIHKELDHPRIVKLYDYFSLDTDTFCTVLEY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 YAAVKIHQLNKSWRDEKKENYHKHACREYRIHKELDHPRIVKLYDYFSLDTDTFCTVLEY
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD CEGNDLDFYLKQHKLMSEKEARSIVMQIVNALRYLNEIKPPIIHYDLKPGNILLVDGTAC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 CEGNDLDFYLKQHKLMSEKEARSIVMQIVNALRYLNEIKPPIIHYDLKPGNILLVDGTAC
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD GEIKITDFGLSKIMDDDSYGVDGMDLTSQGAGTYWYLPPECFVVGKEPPKISNKVDVWSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 GEIKITDFGLSKIMDDDSYGVDGMDLTSQGAGTYWYLPPECFVVGKEPPKISNKVDVWSV
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD GVIFFQCLYGRKPFGHNQSQQDILQENTILKATEVQFPVKPVVSSEAKAFIRRCLAYRKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 GVIFFQCLYGRKPFGHNQSQQDILQENTILKATEVQFPVKPVVSSEAKAFIRRCLAYRKE
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760
pF1KSD DRFDVHQLANDPYLLPHMRRSNSSGNLHMAGLTASPTPPSSSIITY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 DRFDVHQLANDPYLLPHMRRSNSSGNLHMAGLTASPTPPSSSIITY
730 740 750 760
>>CCDS46447.1 TLK1 gene_id:9874|Hs108|chr2 (718 aa)
initn: 4784 init1: 4784 opt: 4784 Z-score: 2492.8 bits: 471.9 E(32554): 1.6e-132
Smith-Waterman score: 4784; 100.0% identity (100.0% similar) in 718 aa overlap (49-766:1-718)
20 30 40 50 60 70
pF1KSD LSTSPTPGSAAAARSLLNHTPPSGRPREGAMDELHSLDPRRQELLEARFTGVASGSTGST
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MDELHSLDPRRQELLEARFTGVASGSTGST
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KSD GSCSVGAKASTNNESSNHSFGSLGSLSDKESETPEKKQSESSRGRKRKAENQNESSQGKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 GSCSVGAKASTNNESSNHSFGSLGSLSDKESETPEKKQSESSRGRKRKAENQNESSQGKS
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
pF1KSD IGGRGHKISDYFEYQGGNGSSPVRGIPPAIRSPQNSHSHSTPSSSVRPNSPSPTALAFGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 IGGRGHKISDYFEYQGGNGSSPVRGIPPAIRSPQNSHSHSTPSSSVRPNSPSPTALAFGD
100 110 120 130 140 150
200 210 220 230 240 250
pF1KSD HPIVQPKQLSFKIIQTDLTMLKLAALESNKIQDLEKKEGRIDDLLRANCDLRRQIDEQQK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 HPIVQPKQLSFKIIQTDLTMLKLAALESNKIQDLEKKEGRIDDLLRANCDLRRQIDEQQK
160 170 180 190 200 210
260 270 280 290 300 310
pF1KSD LLEKYKERLNKCISMSKKLLIEKSTQEKLSSREKSMQDRLRLGHFTTVRHGASFTEQWTD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LLEKYKERLNKCISMSKKLLIEKSTQEKLSSREKSMQDRLRLGHFTTVRHGASFTEQWTD
220 230 240 250 260 270
320 330 340 350 360 370
pF1KSD GFAFQNLVKQQEWVNQQREDIERQRKLLAKRKPPTANNSQAPSTNSEPKQRKNKAVNGAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 GFAFQNLVKQQEWVNQQREDIERQRKLLAKRKPPTANNSQAPSTNSEPKQRKNKAVNGAE
280 290 300 310 320 330
380 390 400 410 420 430
pF1KSD NDPFVRPNLPQLLTLAEYHEQEEIFKLRLGHLKKEEAEIQAELERLERVRNLHIRELKRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 NDPFVRPNLPQLLTLAEYHEQEEIFKLRLGHLKKEEAEIQAELERLERVRNLHIRELKRI
340 350 360 370 380 390
440 450 460 470 480 490
pF1KSD NNEDNSQFKDHPTLNERYLLLHLLGRGGFSEVYKAFDLYEQRYAAVKIHQLNKSWRDEKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 NNEDNSQFKDHPTLNERYLLLHLLGRGGFSEVYKAFDLYEQRYAAVKIHQLNKSWRDEKK
400 410 420 430 440 450
500 510 520 530 540 550
pF1KSD ENYHKHACREYRIHKELDHPRIVKLYDYFSLDTDTFCTVLEYCEGNDLDFYLKQHKLMSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 ENYHKHACREYRIHKELDHPRIVKLYDYFSLDTDTFCTVLEYCEGNDLDFYLKQHKLMSE
460 470 480 490 500 510
560 570 580 590 600 610
pF1KSD KEARSIVMQIVNALRYLNEIKPPIIHYDLKPGNILLVDGTACGEIKITDFGLSKIMDDDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 KEARSIVMQIVNALRYLNEIKPPIIHYDLKPGNILLVDGTACGEIKITDFGLSKIMDDDS
520 530 540 550 560 570
620 630 640 650 660 670
pF1KSD YGVDGMDLTSQGAGTYWYLPPECFVVGKEPPKISNKVDVWSVGVIFFQCLYGRKPFGHNQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 YGVDGMDLTSQGAGTYWYLPPECFVVGKEPPKISNKVDVWSVGVIFFQCLYGRKPFGHNQ
580 590 600 610 620 630
680 690 700 710 720 730
pF1KSD SQQDILQENTILKATEVQFPVKPVVSSEAKAFIRRCLAYRKEDRFDVHQLANDPYLLPHM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SQQDILQENTILKATEVQFPVKPVVSSEAKAFIRRCLAYRKEDRFDVHQLANDPYLLPHM
640 650 660 670 680 690
740 750 760
pF1KSD RRSNSSGNLHMAGLTASPTPPSSSIITY
::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 RRSNSSGNLHMAGLTASPTPPSSSIITY
700 710
>>CCDS46448.1 TLK1 gene_id:9874|Hs108|chr2 (670 aa)
initn: 4392 init1: 4392 opt: 4392 Z-score: 2290.8 bits: 434.4 E(32554): 2.8e-121
Smith-Waterman score: 4392; 99.8% identity (100.0% similar) in 657 aa overlap (110-766:14-670)
80 90 100 110 120 130
pF1KSD SCSVGAKASTNNESSNHSFGSLGSLSDKESETPEKKQSESSRGRKRKAENQNESSQGKSI
.:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MAVLFLYDLKTTGKTPEKKQSESSRGRKRKAENQNESSQGKSI
10 20 30 40
140 150 160 170 180 190
pF1KSD GGRGHKISDYFEYQGGNGSSPVRGIPPAIRSPQNSHSHSTPSSSVRPNSPSPTALAFGDH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 GGRGHKISDYFEYQGGNGSSPVRGIPPAIRSPQNSHSHSTPSSSVRPNSPSPTALAFGDH
50 60 70 80 90 100
200 210 220 230 240 250
pF1KSD PIVQPKQLSFKIIQTDLTMLKLAALESNKIQDLEKKEGRIDDLLRANCDLRRQIDEQQKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 PIVQPKQLSFKIIQTDLTMLKLAALESNKIQDLEKKEGRIDDLLRANCDLRRQIDEQQKL
110 120 130 140 150 160
260 270 280 290 300 310
pF1KSD LEKYKERLNKCISMSKKLLIEKSTQEKLSSREKSMQDRLRLGHFTTVRHGASFTEQWTDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LEKYKERLNKCISMSKKLLIEKSTQEKLSSREKSMQDRLRLGHFTTVRHGASFTEQWTDG
170 180 190 200 210 220
320 330 340 350 360 370
pF1KSD FAFQNLVKQQEWVNQQREDIERQRKLLAKRKPPTANNSQAPSTNSEPKQRKNKAVNGAEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 FAFQNLVKQQEWVNQQREDIERQRKLLAKRKPPTANNSQAPSTNSEPKQRKNKAVNGAEN
230 240 250 260 270 280
380 390 400 410 420 430
pF1KSD DPFVRPNLPQLLTLAEYHEQEEIFKLRLGHLKKEEAEIQAELERLERVRNLHIRELKRIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 DPFVRPNLPQLLTLAEYHEQEEIFKLRLGHLKKEEAEIQAELERLERVRNLHIRELKRIN
290 300 310 320 330 340
440 450 460 470 480 490
pF1KSD NEDNSQFKDHPTLNERYLLLHLLGRGGFSEVYKAFDLYEQRYAAVKIHQLNKSWRDEKKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 NEDNSQFKDHPTLNERYLLLHLLGRGGFSEVYKAFDLYEQRYAAVKIHQLNKSWRDEKKE
350 360 370 380 390 400
500 510 520 530 540 550
pF1KSD NYHKHACREYRIHKELDHPRIVKLYDYFSLDTDTFCTVLEYCEGNDLDFYLKQHKLMSEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 NYHKHACREYRIHKELDHPRIVKLYDYFSLDTDTFCTVLEYCEGNDLDFYLKQHKLMSEK
410 420 430 440 450 460
560 570 580 590 600 610
pF1KSD EARSIVMQIVNALRYLNEIKPPIIHYDLKPGNILLVDGTACGEIKITDFGLSKIMDDDSY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 EARSIVMQIVNALRYLNEIKPPIIHYDLKPGNILLVDGTACGEIKITDFGLSKIMDDDSY
470 480 490 500 510 520
620 630 640 650 660 670
pF1KSD GVDGMDLTSQGAGTYWYLPPECFVVGKEPPKISNKVDVWSVGVIFFQCLYGRKPFGHNQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 GVDGMDLTSQGAGTYWYLPPECFVVGKEPPKISNKVDVWSVGVIFFQCLYGRKPFGHNQS
530 540 550 560 570 580
680 690 700 710 720 730
pF1KSD QQDILQENTILKATEVQFPVKPVVSSEAKAFIRRCLAYRKEDRFDVHQLANDPYLLPHMR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 QQDILQENTILKATEVQFPVKPVVSSEAKAFIRRCLAYRKEDRFDVHQLANDPYLLPHMR
590 600 610 620 630 640
740 750 760
pF1KSD RSNSSGNLHMAGLTASPTPPSSSIITY
:::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 RSNSSGNLHMAGLTASPTPPSSSIITY
650 660 670
>>CCDS45753.1 TLK2 gene_id:11011|Hs108|chr17 (718 aa)
initn: 3333 init1: 1488 opt: 2411 Z-score: 1268.1 bits: 245.3 E(32554): 2.6e-64
Smith-Waterman score: 3423; 73.4% identity (85.3% similar) in 741 aa overlap (49-762:2-715)
20 30 40 50 60 70
pF1KSD LSTSPTPGSAAAARSLLNHTPPSGRPREGAMDELHSLDPRRQELLEARFTGVASGSTGST
:.::::::::::::::::::::.
CCDS45 MMEELHSLDPRRQELLEARFTGVGV------
10 20
80 90 100 110 120 130
pF1KSD GSCSVGAKASTNNESSNHSFGSLGSLSDKESETPEKKQSESSRGRKRKAENQNESSQGKS
.:. :.::::.:. :.::::::: :::::::... :.:::::: :.::::.
CCDS45 ------SKGPLNSESSNQSLCSVGSLSDKEVETPEKKQNDQ-RNRKRKAE-PYETSQGKG
30 40 50 60 70
140 150 160 170
pF1KSD IGGRGHKISDYFEYQ------GGNGSSPVRG------IP---------PAIRSPQNSHSH
:::::::::: . : .::. .. .: : . . : ..
CCDS45 TP-RGHKISDYFERRVEQPLYGLDGSAAKEATEEQSALPTLMSVMLAKPRLDTEQLAQRG
80 90 100 110 120 130
180 190 200 210 220 230
pF1KSD ST---PSSSVRPNSPSPTALAFGDHPIVQPKQLSF--KIIQTDLTMLKLAALESNKIQDL
. :.. :::: :. . .: . ::.:. . :.:::. :..:::..: .::
CCDS45 AGLCFTFVSAQQNSPSSTGSGNTEHSCSSQKQISIQHRQTQSDLTIEKISALENSKNSDL
140 150 160 170 180 190
240 250 260 270 280 290
pF1KSD EKKEGRIDDLLRANCDLRRQIDEQQKLLEKYKERLNKCISMSKKLLIEKSTQEKLSSREK
::::::::::::::::::::::::::.:::::::::.:..:::::::::: :::.. :.:
CCDS45 EKKEGRIDDLLRANCDLRRQIDEQQKMLEKYKERLNRCVTMSKKLLIEKSKQEKMACRDK
200 210 220 230 240 250
300 310 320 330 340 350
pF1KSD SMQDRLRLGHFTTVRHGASFTEQWTDGFAFQNLVKQQEWVNQQREDIERQRKLLAKRKPP
:::::::::::::::::::::::::::.:::::.:::: .:.:::.::::::.:::::::
CCDS45 SMQDRLRLGHFTTVRHGASFTEQWTDGYAFQNLIKQQERINSQREEIERQRKMLAKRKPP
260 270 280 290 300 310
360 370 380 390 400 410
pF1KSD TANNSQAPSTNSEPKQRKNKAVNGAENDPFVRPNLPQLLTLAEYHEQEEIFKLRLGHLKK
. . ::: ...: ::::.:. :::::. ::::::::::::::::::::::
CCDS45 AMG--QAPPATNEQKQRKSKT-NGAENET---------LTLAEYHEQEEIFKLRLGHLKK
320 330 340 350 360
420 430 440 450 460 470
pF1KSD EEAEIQAELERLERVRNLHIRELKRINNEDNSQFKDHPTLNERYLLLHLLGRGGFSEVYK
::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::.::::::::::::::::::
CCDS45 EEAEIQAELERLERVRNLHIRELKRIHNEDNSQFKDHPTLNDRYLLLHLLGRGGFSEVYK
370 380 390 400 410 420
480 490 500 510 520 530
pF1KSD AFDLYEQRYAAVKIHQLNKSWRDEKKENYHKHACREYRIHKELDHPRIVKLYDYFSLDTD
:::: ::::.:::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 AFDLTEQRYVAVKIHQLNKNWRDEKKENYHKHACREYRIHKELDHPRIVKLYDYFSLDTD
430 440 450 460 470 480
540 550 560 570 580 590
pF1KSD TFCTVLEYCEGNDLDFYLKQHKLMSEKEARSIVMQIVNALRYLNEIKPPIIHYDLKPGNI
.:::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::.:::::::::::::::::::
CCDS45 SFCTVLEYCEGNDLDFYLKQHKLMSEKEARSIIMQIVNALKYLNEIKPPIIHYDLKPGNI
490 500 510 520 530 540
600 610 620 630 640 650
pF1KSD LLVDGTACGEIKITDFGLSKIMDDDSYG-VDGMDLTSQGAGTYWYLPPECFVVGKEPPKI
:::.:::::::::::::::::::::::. ::::.::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LLVNGTACGEIKITDFGLSKIMDDDSYNSVDGMELTSQGAGTYWYLPPECFVVGKEPPKI
550 560 570 580 590 600
660 670 680 690 700 710
pF1KSD SNKVDVWSVGVIFFQCLYGRKPFGHNQSQQDILQENTILKATEVQFPVKPVVSSEAKAFI
:::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::. ::::::
CCDS45 SNKVDVWSVGVIFYQCLYGRKPFGHNQSQQDILQENTILKATEVQFPPKPVVTPEAKAFI
610 620 630 640 650 660
720 730 740 750 760
pF1KSD RRCLAYRKEDRFDVHQLANDPYLLPHMRRSNSSGNLHMAGLTASPTPPSSSIITY
:::::::::::.::.::: :::::::.:.: :... :..... ..:
CCDS45 RRCLAYRKEDRIDVQQLACDPYLLPHIRKSVSTSSPAGAAIASTSGASNNSSSN
670 680 690 700 710
>>CCDS62283.1 TLK2 gene_id:11011|Hs108|chr17 (772 aa)
initn: 3342 init1: 1487 opt: 2298 Z-score: 1209.4 bits: 234.5 E(32554): 4.8e-61
Smith-Waterman score: 3448; 70.7% identity (81.8% similar) in 786 aa overlap (49-762:2-769)
20 30 40 50 60 70
pF1KSD LSTSPTPGSAAAARSLLNHTPPSGRPREGAMDELHSLDPRRQELLEARFTGVASGSTGST
:.::::::::::::::::::::.
CCDS62 MMEELHSLDPRRQELLEARFTGVGV------
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.:. :.::::.:. :.::::::: :::::::... :.:::::: :.::::.
CCDS62 ------SKGPLNSESSNQSLCSVGSLSDKEVETPEKKQNDQ-RNRKRKAE-PYETSQGKG
30 40 50 60 70
140 150 160 170 180
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::::::::::. ::. :.:: :..::. :: ::.: :. : .:
CCDS62 TP-RGHKISDYFEFAGGSAPGTSPGRSVPPVARSSPQHSLSNPLPRRVEQPLYGLDGSAA
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190 200
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:::: :. . .:
CCDS62 KEATEEQSALPTLMSVMLAKPRLDTEQLAQRGAGLCFTFVSAQQNSPSSTGSGNTEHSCS
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. ::.:. . :.:::. :..:::..: .::::::::::::::::::::::::::::.:
CCDS62 SQKQISIQHRQTQSDLTIEKISALENSKNSDLEKKEGRIDDLLRANCDLRRQIDEQQKML
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::::::::.:..:::::::::: :::.. :.::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS62 EKYKERLNRCVTMSKKLLIEKSKQEKMACRDKSMQDRLRLGHFTTVRHGASFTEQWTDGY
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:::::.:::: .:.:::.::::::.:::::::. . ::: ...: ::::.:. :::::.
CCDS62 AFQNLIKQQERINSQREEIERQRKMLAKRKPPAMG--QAPPATNEQKQRKSKT-NGAENE
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: .. . : : :::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 TPSSGNTELKDTAPALGAHSLLRLTLAEYHEQEEIFKLRLGHLKKEEAEIQAELERLERV
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:::::::::::.::::::::::::::.:::::::::::::::::::::: ::::.:::::
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:::::::::::::::::.:::::::.::::::::::::::::::::::.:::::::::::
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CCDS62 FGLSKIMDDDSYNSVDGMELTSQGAGTYWYLPPECFVVGKEPPKISNKVDVWSVGVIFYQ
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CCDS62 CLYGRKPFGHNQSQQDILQENTILKATEVQFPPKPVVTPEAKAFIRRCLAYRKEDRIDVQ
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::: :::::::.:.: :... :..... ..:
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:.. :::: :. . .: . ::.:. .
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:.:::. :..:::..: .::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::.:
CCDS82 QTQSDLTIEKISALENSKNSDLEKKEGRIDDLLRANCDLRRQIDEQQKMLEKYKERLNRC
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.:.:::.::::::.:::::::. .::: ...: ::::.:. :::::.
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CCDS82 ALKYLNEIKPPIIHYDLKPGNILLVNGTACGEIKITDFGLSKIMDDDSYNSVDGMELTSQ
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CCDS82 GAGTYWYLPPECFVVGKEPPKISNKVDVWSVGVIFYQCLYGRKPFGHNQSQQDILQENTI
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pF1KSD AGLTASPTPPSSSIITY
:..... ..:
CCDS82 AAIASTSGASNNSSSN
590 600
>>CCDS11633.1 TLK2 gene_id:11011|Hs108|chr17 (750 aa)
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20 30 40 50 60 70
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CCDS11 MMEELHSLDPRRQELLEARFTGVGV------
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CCDS11 ------SKGPLNSESSNQSLCSVGSLSDKEVETPEKKQNDQ-RNRKRKAE-PYETSQGKG
30 40 50 60 70
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CCDS11 TP-RGHKISDYFEFAGGSAPGTSPGRSVPPVARSSPQHSLSNPLPRRVEQPLYGLDGSAA
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190 200
pF1KSD --------------------------------------------NSPSPTALAFGDHPIV
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CCDS11 KEATEEQSALPTLMSVMLAKPRLDTEQLAQRGAGLCFTFVSAQQNSPSSTGSGNTEHSCS
140 150 160 170 180 190
210 220 230 240 250 260
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CCDS11 SQKQISIQHRQTQSDLTIEKISALENSKNSDLEKKEGRIDDLLRANCDLRRQIDEQQKML
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CCDS11 EKYKERLNRCVTMSKKLLIEKSKQEKMACRDKSMQDRLRLGHFTTVRHGASFTEQWTDGY
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CCDS11 AFQNLIKQQERINSQREEIERQRKMLAKRKPPAMG--QAPPATNEQKQRKSKT-NGAENE
320 330 340 350 360 370
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CCDS11 KSVSTSSPAGAAIASTSGASNNSSSN
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]