FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0132, 624 aa
1>>>pF1KSDA0132 624 - 624 aa - 624 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5208+/-0.00105; mu= 17.8549+/- 0.062
mean_var=72.6672+/-15.081, 0's: 0 Z-trim(103.2): 161 B-trim: 273 in 1/50
Lambda= 0.150454
statistics sampled from 7111 (7283) to 7111 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.584), E-opt: 0.2 (0.224), width: 16
Scan time: 2.850
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS12239.1 KEAP1 gene_id:9817|Hs108|chr19 ( 624) 4314 946.4 0
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CCDS33975.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4 ( 709) 1262 283.9 4.8e-76
CCDS33974.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4 ( 755) 1262 284.0 5.1e-76
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CCDS1429.1 KLHL12 gene_id:59349|Hs108|chr1 ( 568) 1247 280.6 3.8e-75
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CCDS14456.1 KLHL4 gene_id:56062|Hs108|chrX ( 720) 1160 261.8 2.3e-69
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CCDS3246.1 KLHL24 gene_id:54800|Hs108|chr3 ( 600) 800 183.6 6.5e-46
CCDS75163.1 KLHL8 gene_id:57563|Hs108|chr4 ( 437) 695 160.7 3.6e-39
CCDS30575.1 KLHL21 gene_id:9903|Hs108|chr1 ( 597) 690 159.7 1e-38
CCDS76675.1 KLHL28 gene_id:54813|Hs108|chr14 ( 585) 669 155.2 2.3e-37
CCDS9680.1 KLHL28 gene_id:54813|Hs108|chr14 ( 571) 668 154.9 2.6e-37
CCDS46555.2 KLHL30 gene_id:377007|Hs108|chr2 ( 578) 645 150.0 8.5e-36
CCDS10935.1 GAN gene_id:8139|Hs108|chr16 ( 597) 636 148.0 3.4e-35
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CCDS1368.1 IVNS1ABP gene_id:10625|Hs108|chr1 ( 642) 590 138.0 3.6e-32
CCDS44685.2 KLHL35 gene_id:283212|Hs108|chr11 ( 583) 589 137.8 3.9e-32
CCDS53882.1 KLHL33 gene_id:123103|Hs108|chr14 ( 533) 573 134.3 4e-31
CCDS10339.1 KLHL25 gene_id:64410|Hs108|chr15 ( 589) 563 132.2 2e-30
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CCDS2906.2 KBTBD8 gene_id:84541|Hs108|chr3 ( 601) 532 125.4 2.1e-28
CCDS4021.1 ENC1 gene_id:8507|Hs108|chr5 ( 589) 530 125.0 2.8e-28
CCDS44132.1 IPP gene_id:3652|Hs108|chr1 ( 582) 527 124.3 4.4e-28
CCDS30702.1 IPP gene_id:3652|Hs108|chr1 ( 584) 527 124.3 4.4e-28
CCDS82975.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4 ( 427) 495 117.3 4.2e-26
CCDS82974.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4 ( 496) 495 117.4 4.7e-26
CCDS35217.1 KLHL15 gene_id:80311|Hs108|chrX ( 604) 496 117.6 4.8e-26
CCDS54816.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4 ( 505) 495 117.4 4.8e-26
CCDS58969.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5 ( 505) 494 117.2 5.6e-26
CCDS2236.1 KLHL23 gene_id:151230|Hs108|chr2 ( 558) 494 117.2 6e-26
CCDS34614.1 KBTBD2 gene_id:25948|Hs108|chr7 ( 623) 488 115.9 1.6e-25
CCDS33848.2 KBTBD12 gene_id:166348|Hs108|chr3 ( 623) 474 112.9 1.3e-24
>>CCDS12239.1 KEAP1 gene_id:9817|Hs108|chr19 (624 aa)
initn: 4314 init1: 4314 opt: 4314 Z-score: 5059.8 bits: 946.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4314; 100.0% identity (100.0% similar) in 624 aa overlap (1-624:1-624)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MQPDPRPSGAGACCRFLPLQSQCPEGAGDAVMYASTECKAEVTPSQHGNRTFSYTLEDHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MQPDPRPSGAGACCRFLPLQSQCPEGAGDAVMYASTECKAEVTPSQHGNRTFSYTLEDHT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD KQAFGIMNELRLSQQLCDVTLQVKYQDAPAAQFMAHKVVLASSSPVFKAMFTNGLREQGM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 KQAFGIMNELRLSQQLCDVTLQVKYQDAPAAQFMAHKVVLASSSPVFKAMFTNGLREQGM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD EVVSIEGIHPKVMERLIEFAYTASISMGEKCVLHVMNGAVMYQIDSVVRACSDFLVQQLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 EVVSIEGIHPKVMERLIEFAYTASISMGEKCVLHVMNGAVMYQIDSVVRACSDFLVQQLD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD PSNAIGIANFAEQIGCVELHQRAREYIYMHFGEVAKQEEFFNLSHCQLVTLISRDDLNVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 PSNAIGIANFAEQIGCVELHQRAREYIYMHFGEVAKQEEFFNLSHCQLVTLISRDDLNVR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD CESEVFHACINWVKYDCEQRRFYVQALLRAVRCHSLTPNFLQMQLQKCEILQSDSRCKDY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 CESEVFHACINWVKYDCEQRRFYVQALLRAVRCHSLTPNFLQMQLQKCEILQSDSRCKDY
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD LVKIFEELTLHKPTQVMPCRAPKVGRLIYTAGGYFRQSLSYLEAYNPSDGTWLRLADLQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LVKIFEELTLHKPTQVMPCRAPKVGRLIYTAGGYFRQSLSYLEAYNPSDGTWLRLADLQV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD PRSGLAGCVVGGLLYAVGGRNNSPDGNTDSSALDCYNPMTNQWSPCAPMSVPRNRIGVGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 PRSGLAGCVVGGLLYAVGGRNNSPDGNTDSSALDCYNPMTNQWSPCAPMSVPRNRIGVGV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD IDGHIYAVGGSHGCIHHNSVERYEPERDEWHLVAPMLTRRIGVGVAVLNRLLYAVGGFDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 IDGHIYAVGGSHGCIHHNSVERYEPERDEWHLVAPMLTRRIGVGVAVLNRLLYAVGGFDG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD TNRLNSAECYYPERNEWRMITAMNTIRSGAGVCVLHNCIYAAGGYDGQDQLNSVERYDVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 TNRLNSAECYYPERNEWRMITAMNTIRSGAGVCVLHNCIYAAGGYDGQDQLNSVERYDVE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD TETWTFVAPMKHRRSALGITVHQGRIYVLGGYDGHTFLDSVECYDPDTDTWSEVTRMTSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 TETWTFVAPMKHRRSALGITVHQGRIYVLGGYDGHTFLDSVECYDPDTDTWSEVTRMTSG
550 560 570 580 590 600
610 620
pF1KSD RSGVGVAVTMEPCRKQIDQQNCTC
::::::::::::::::::::::::
CCDS12 RSGVGVAVTMEPCRKQIDQQNCTC
610 620
>>CCDS1310.1 KLHL20 gene_id:27252|Hs108|chr1 (609 aa)
initn: 1599 init1: 609 opt: 1345 Z-score: 1577.0 bits: 301.9 E(32554): 1.6e-81
Smith-Waterman score: 1345; 39.6% identity (68.1% similar) in 573 aa overlap (54-617:45-608)
30 40 50 60 70 80
pF1KSD PEGAGDAVMYASTECKAEVTPSQHGNRTFSYTLEDHTKQAFGIMNELRLSQQLCDVTLQV
: . : .:.. ..: :: ..::::.: :
CCDS13 GETGMDVTSRCTLGDPNKLPEGVPQPARMPYISDKHPRQTLEVINLLRKHRELCDVVLVV
20 30 40 50 60 70
90 100 110 120 130 140
pF1KSD KYQDAPAAQFMAHKVVLASSSPVFKAMFTNGLREQGMEVVSIEGIHPKVMERLIEFAYTA
: ...::.:.:.. :: :.::::. : :. . : :. : ..:: ::.::::.
CCDS13 -----GAKKIYAHRVILSACSPYFRAMFTGELAESRQTEVVIRDIDERAMELLIDFAYTS
80 90 100 110 120
150 160 170 180 190 200
pF1KSD SISMGEKCVLHVMNGAVMYQIDSVVRACSDFLVQQLDPSNAIGIANFAEQIGCVELHQRA
.:.. : : .. .: . :. . .:: .:: .:::::: .:: ::. .: :: . :
CCDS13 QITVEEGNVQTLLPAACLLQLAEIQEACCEFLKRQLDPSNCLGIRAFADTHSCRELLRIA
130 140 150 160 170 180
210 220 230 240 250 260
pF1KSD REYIYMHFGEVAKQEEFFNLSHCQLVTLISRDDLNVRCESEVFHACINWVKYDCEQRRFY
.. .: :: ..:::. : ::. .:: :.:::: : .::.: . ::::. ..::
CCDS13 DKFTQHNFQEVMESEEFMLLPANQLIDIISSDELNVRSEEQVFNAVMAWVKYSIQERRPQ
190 200 210 220 230 240
270 280 290 300 310 320
pF1KSD VQALLRAVRCHSLTPNFLQMQLQKCEILQSDSRCKDYL--VKIFEELTLHKPTQVMPCRA
. .:. :: :.:.:: . . ...:: .:.: . .: . : ..: . :
CCDS13 LPQVLQHVRLPLLSPKFLVGTVGSDPLIKSDEECRDLVDEAKNYLLLPQERPLMQGPRTR
250 260 270 280 290 300
330 340 350 360 370
pF1KSD PK----VGRLIYTAGGYFR-QSLSYLEAYNPSDGTWLRLADLQVPRSGLAGCVVGGLLYA
:. :......::. ...: .: :.:. . : .:... : :.. :. ::::
CCDS13 PRKPIRCGEVLFAVGGWCSGDAISSVERYDPQTNEWRMVASMSKRRCGVGVSVLDDLLYA
310 320 330 340 350 360
380 390 400 410 420 430
pF1KSD VGGRNNSPDGNTDSSALDCYNPMTNQWSP-CAPMSVPRNRIGVGVIDGHIYAVGGSHGCI
:::. ::.. .... :.: ::::: :: :. :. .::.:. : .:::::. :
CCDS13 VGGH----DGSSYLNSVERYDPKTNQWSSDVAPTSTCRTSVGVAVLGGFLYAVGGQDGVS
370 380 390 400 410 420
440 450 460 470 480 490
pF1KSD HHNSVERYEPERDEWHLVAPMLTRRIGVGVAVLNRLLYAVGGFDGTNRLNSAECYYPERN
: ::::.:....: :: : :::.::.::::. .:::::: :::. ::..: : :..:
CCDS13 CLNIVERYDPKENKWTRVASMSTRRLGVAVAVLGGFLYAVGGSDGTSPLNTVERYNPQEN
430 440 450 460 470 480
500 510 520 530 540 550
pF1KSD EWRMITAMNTIRSGAGVCVLHNCIYAAGGYDGQDQLNSVERYDVETETWTFVAPMKHRRS
.:. :. :.: :. : : .. :::.:: : .:.:.:::. .:. :. :. : :::
CCDS13 RWHTIAPMGTRRKHLGCAVYQDMIYAVGGRDDTTELSSAERYNPRTNQWSPVVAMTSRRS
490 500 510 520 530 540
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pF1KSD ALGITVHQGRIYVLGGYDGHTFLDSVECYDPDTDTWSEVTRMTSGRSGVGVAVT-MEPCR
..:..: .:.....::.:: :.: ..: .:::..:: :. : : ::.: : :.
CCDS13 GVGLAVVNGQLMAVGGFDGTTYLKTIEVFDPDANTWRLYGGMNYRRLGGGVGVIKMTHCE
550 560 570 580 590 600
620
pF1KSD KQIDQQNCTC
..:
CCDS13 SHIW
>>CCDS30550.1 KLHL17 gene_id:339451|Hs108|chr1 (642 aa)
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Smith-Waterman score: 1281; 37.4% identity (64.8% similar) in 613 aa overlap (3-608:30-621)
10 20 30
pF1KSD MQPDPRPSGAGACCRFLPLQSQCPEGAGDAVMY
: :.: : : : :.. ::.
CCDS30 MQPRSERPAGRTQSPEHGSPGPGPEAPPPPPPQPP-APEAERTRPRQARPAAPMEGAVQL
10 20 30 40 50
40 50 60 70 80 90
pF1KSD ASTECKAEVTPSQHGNRTFSYTLEDHTKQAFGIMNELRLSQQLCDVTLQVKYQDAPAAQF
: : ... ... . : ..:: :...: :::..:.: : ..
CCDS30 LSRE-----------GHSVAHNSKRHYHDAFVAMSRMRQRGLLCDIVLHVA-----AKEI
60 70 80 90 100
100 110 120 130 140 150
pF1KSD MAHKVVLASSSPVFKAMFTNGLREQGMEVVSIEGIHPKVMERLIEFAYTASISMGEKCVL
:::::::: :: :.::::: . :. . :... : :.....:..::::: : .:: :
CCDS30 RAHKVVLASCSPYFHAMFTNEMSESRQTHVTLHDIDPQALDQLVQFAYTAEIVVGEGNVQ
110 120 130 140 150 160
160 170 180 190 200 210
pF1KSD HVMNGAVMYQIDSVVRACSDFLVQQLDPSNAIGIANFAEQIGCVELHQRAREYIYMHFGE
.. .: . :...: :: ::..:::::: .:: .::. .: .: . :..:. .:: .
CCDS30 TLLPAASLLQLNGVRDACCKFLLSQLDPSNCLGIRGFADAHSCSDLLKAAHRYVLQHFVD
170 180 190 200 210 220
220 230 240 250 260 270
pF1KSD VAKQEEFFNLSHCQLVTLISRDDLNVRCESEVFHACINWVKYDCEQRRFYVQALLRAVRC
::: :::. : :.. :.: :.::: : ::..: ..:::.: . :: .: :.. ::
CCDS30 VAKTEEFMLLPLKQVLELVSSDSLNVPSEEEVYRAVLSWVKHDVDARRQHVPRLMKCVRL
230 240 250 260 270 280
280 290 300 310 320
pF1KSD HSLTPNFLQMQLQKCEILQSDSRCKDYLVKIFEELTLHKPTQVM------PCRAPKVGRL
:. .:: ... ... ::: :.. .. : . :. : : .: .
CCDS30 PLLSRDFLLGHVDAESLVRHHPDCKDLLIEALKFHLLPEQRGVLGTSRTRPRRCEGAGPV
290 300 310 320 330 340
330 340 350 360 370 380
pF1KSD IYTAGGYFRQSL-SYLEAYNPSDGTWLRLADLQVPRSGLAGCVVGGLLYAVGGRNNSPDG
....:: .. . :::. : .:.... :. .. .::. :::::: ::
CCDS30 LFAVGGGSLFAIHGDCEAYDTRTDRWHVVASMSTRRARVGVAAVGNRLYAVGGY----DG
350 360 370 380 390
390 400 410 420 430 440
pF1KSD NTDSSALDCYNPMTNQWSPCAPMSVPRNRIGVGVIDGHIYAVGGSHGCIHHNSVERYEPE
..: .... :.:.:: :.: . :.. :. .::... : .:..:: : ::.:::.:
CCDS30 TSDLATVESYDPVTNTWQPEVSMGTRRSCLGVAALHGLLYSAGGYDGASCLNSAERYDPL
400 410 420 430 440 450
450 460 470 480 490 500
pF1KSD RDEWHLVAPMLTRRIGVGVAVLNRLLYAVGGFDGTNRLNSAECYYPERNEWRMITAMNTI
: :: : ::: : ::.:. ::::::.:....: ..: : :. : : ...: .
CCDS30 TGTWTSVAAMSTRRRYVRVATLDGNLYAVGGYDSSSHLATVEKYEPQVNVWSPVASMLSR
460 470 480 490 500 510
510 520 530 540 550 560
pF1KSD RSGAGVCVLHNCIYAAGGYDGQDQLNSVERYDVETETWTFVAPMKHRRSALGITVHQGRI
::.::: ::.. .:.::: :: . :::::::. .. .: ::::. :::. ... .: .
CCDS30 RSSAGVAVLEGALYVAGGNDGTSCLNSVERYSPKAGAWESVAPMNIRRSTHDLVAMDGWL
520 530 540 550 560 570
570 580 590 600 610 620
pF1KSD YVLGGYDGHTFLDSVECYDPDTDTWSEVTRMTSGRSGVGVAVTMEPCRKQIDQQNCTC
:..:: :: . :.:.: :.: :. : .. : . ::.:::::
CCDS30 YAVGGNDGSSSLNSIEKYNPRTNKWVAASCMFTRRSSVGVAVLELLNFPPPSSPTLSVSS
580 590 600 610 620 630
CCDS30 TSL
640
>>CCDS54756.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4 (568 aa)
initn: 1539 init1: 820 opt: 1262 Z-score: 1480.1 bits: 283.9 E(32554): 4e-76
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30 40 50 60 70 80
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CCDS54 QHFADVVLSEEFLNLGIEQVCSLISSDKLTISSEEKVFEAVIAWVNHDKDVRQEFMARLM
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CCDS54 N----GSLRVRTVDSYDPVKDQWTSVANMRDRRSTLGAAVLNGLLYAVGGFDGSTGLSSV
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CCDS54 EAYNIKSNEWFHVAPMNTRRSSVGVGVVGGLLYAVGGYDGASRQCLSTVECYNATTNEWT
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]